单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-09-02 |
Theories, laws, and models in evo-devo
2022-01, Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution
DOI:10.1002/jez.b.23096
PMID:34570438
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综述 | 本文回顾了进化发育生物学（evo-devo）中的一些理论、模型和定律，包括历史上的重演理论、原型理论以及新的框架移位理论、发育工具箱、ABC模型等 | 文章提出了对von Baer定律的重新审视以及对时钟模型修正的可能性，并探讨了利用高通量测序数据发展新理论和模型的前景 | 文章指出evo-devo中所谓的“定律”实际上只是特定谱系趋势的概括，且“体计划”作为一种原型，其科学意义常被忽视 | 探讨和总结进化发育生物学中的理论、模型和定律，并展望未来的发展方向 | 进化发育生物学中的理论、模型和定律 | NA | NA | 高通量测序，单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-09-01 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Changes of Tumor Immune Microenvironment in Oral Squamous Cell Carcinoma After Chemotherapy
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.914120
PMID:35784460
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research paper | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了化疗后口腔鳞状细胞癌中肿瘤免疫微环境的变化 | 本研究首次在单细胞转录组水平揭示了化疗后口腔鳞状细胞癌中肿瘤微环境的特征 | NA | 研究化疗对口腔鳞状细胞癌中肿瘤细胞和肿瘤微环境的影响 | 口腔鳞状细胞癌化疗后的肿瘤微环境 | digital pathology | 口腔癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 83 | 2024-09-01 |
Applications and Achievements of Single-Cell Sequencing in Gastrointestinal Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.905571
PMID:35785171
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在胃肠癌研究中的应用及其最新进展 | 单细胞测序技术提供了比大规模测序技术更准确的数据，能够解析细胞和分子层面的单细胞分辨率特征 | NA | 探讨单细胞测序技术在胃肠癌研究中的应用 | 胃肠癌的来源、异质性、微环境信息以及诊断和治疗方法 | 数字病理学 | 胃肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和表观基因组数据 | NA |
| 84 | 2024-09-01 |
Progress and Prospect of Immunotherapy for Triple-Negative Breast Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.919072
PMID:35795050
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）免疫治疗的进展和前景 | 介绍了基于免疫分子疗法、溶瘤病毒疗法和过继免疫细胞转移疗法等多种新型免疫治疗方法 | 目前免疫治疗在乳腺癌患者中的总体反应不强，且存在一系列挑战和机遇 | 探讨三阴性乳腺癌免疫治疗的新发现、临床试验结果及未来发展方向 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其免疫治疗策略 | 肿瘤学 | 乳腺癌 | 免疫检查点抑制剂（ICIs）、单细胞测序、CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-31 |
Transcriptome Analysis and Single-Cell Sequencing Analysis Constructed the Ubiquitination-Related Signature in Glioma and Identified USP4 as a Novel Biomarker
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.915709
PMID:35774799
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞测序分析构建了胶质瘤中的泛素化相关特征，并鉴定了USP4作为新的生物标志物。 | 首次构建了胶质瘤中的泛素化相关特征，并发现了USP4作为潜在的胶质瘤生物标志物。 | 研究主要基于TCGA数据库的数据，需要进一步的临床验证和实验支持。 | 探讨泛素化基因在胶质瘤中的作用，并寻找新的胶质瘤生物标志物。 | 胶质瘤患者的泛素化基因及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据库中的胶质瘤患者数据，分为训练组和验证组。 |
| 86 | 2024-08-31 |
Somatic variant calling from single-cell DNA sequencing data
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.06.013
PMID:35782734
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综述 | 本文综述了单细胞DNA测序数据中体细胞变异识别的当前方法 | NA | NA | 帮助用户根据自身数据选择合适的工具 | 单细胞DNA测序数据中的体细胞变异识别方法 | 测序技术 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | DNA测序数据 | NA |
| 87 | 2024-08-31 |
Intestinal strictures in Crohn's disease: a 2021 update
2022, Therapeutic advances in gastroenterology
IF:3.9Q1
DOI:10.1177/17562848221104951
PMID:35757383
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综述 | 本文综述了2021年关于克罗恩病（CD）肠道狭窄的最新进展，重点讨论了纤维化机制、诊断和治疗的新技术 | 介绍了单细胞测序、多组学和人工智能等新技术在肠道狭窄研究中的应用 | 目前尚无特定的抗纤维化治疗方法，且肠道纤维化的评估方法不够可靠 | 旨在提供关于纤维化的及时信息，并为改善肠道狭窄的诊断、治疗和预后奠定基础 | 克罗恩病患者的肠道狭窄 | NA | 克罗恩病 | 单细胞测序、多组学、人工智能 | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-31 |
Emerging artificial intelligence applications in Spatial Transcriptomics analysis
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.056
PMID:35765645
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综述 | 本文综述了当前用于空间转录组学分析的人工智能方法 | 介绍了利用机器学习和深度学习技术处理空间转录组学数据分析的新型计算方法 | NA | 综述空间转录组学分析中的人工智能应用 | 空间转录组学数据分析 | 机器学习 | NA | 机器学习, 深度学习 | NA | 转录组数据 | NA |
| 89 | 2024-08-31 |
Detection of infiltrating fibroblasts by single-cell transcriptomics in human kidney allografts
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0267704
PMID:35657798
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析人肾移植活检样本，以揭示不同的细胞类型和状态，并深入了解同种异体免疫损伤的复杂异质性 | 通过单细胞转录组学技术，首次揭示了肾移植后不同时间点纤维化与非纤维化组织中成纤维细胞的来源差异，以及这些细胞在移植后免疫反应中的作用 | 研究未涉及T细胞介导的排斥反应 | 探索单细胞RNA测序技术在人肾移植活检中的应用，以揭示细胞类型和状态，并为移植受者的个性化护理提供新机制见解 | 来自三个个体的肾皮质活检样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 7217个高质量的单细胞转录组 |
| 90 | 2024-08-30 |
Glycan Profiling by Sequencing to Uncover Multicellular Communication: Launching Glycobiology in Single Cells and Microbiomes
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.919168
PMID:35712658
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGR-seq的新技术，用于在单细胞水平上同时分析糖类和RNA，并将其应用于异质细胞群和微生物群的表面糖类分析 | 首次开发了一种能够在单细胞水平上分析糖组的技术，通过使用DNA条形码凝集素将糖信息转化为基因信息，从而实现糖类和RNA的同时分析 | NA | 探索糖类在细胞间和细胞与微生物间通信中的功能，扩展糖生物学到单细胞和微生物群水平 | 单细胞和微生物群中的糖类 | 生物技术 | NA | scGR-seq | NA | 糖类和RNA | 异质细胞群和微生物群中的单个细胞 |
| 91 | 2024-08-30 |
Myocardial-Treg Crosstalk: How to Tame a Wolf
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.914033
PMID:35693830
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综述 | 本文综述了心肌梗死（MI）后心肌调节T细胞（Tregs）在组织修复和局部炎症控制中的核心作用 | 讨论了心肌微环境如何通过塑造肌球蛋白特异性T细胞向调节表型发展，从而控制潜在的自体攻击性局部免疫反应 | NA | 探讨心肌梗死后免疫系统如何通过Tregs协调组织修复和控制炎症反应 | 心肌调节T细胞（Tregs）及其在心肌梗死修复中的作用 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学和T细胞受体分析 | NA | 图像 | 使用转基因小鼠模型进行研究 |
| 92 | 2024-08-08 |
Identifying In Vitro Cultured Human Hepatocytes Markers with Machine Learning Methods Based on Single-Cell RNA-Seq Data
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.916309
PMID:35706505
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和机器学习方法，识别体外培养的人肝细胞在不同分化时期的标志物 | 本研究通过先进的计算分析方法，解决了肝细胞分化过程中的异质性问题，并挖掘了不同分化时期的生物标志物 | NA | 阐明肝细胞发育的过程和机制，为细胞移植相关的肝病治疗策略提供潜在目标 | 体外培养的人肝细胞及其分化过程中的标志物 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林、k-最近邻、决策树 | 转录组数据 | 一批压缩和有效的分类特征 |
| 93 | 2024-08-29 |
CCPE: cell cycle pseudotime estimation for single cell RNA-seq data
2022-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1236
PMID:34931240
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研究论文 | 本文开发了一种名为CCPE的新型细胞周期伪时间估计方法，用于从单细胞RNA测序数据中表征细胞周期时间和识别细胞周期阶段 | CCPE使用一种判别性螺旋来表征细胞周期的循环过程，并估计每个细胞沿细胞周期的伪时间 | NA | 开发一种有效的方法来预测细胞周期伪时间并识别细胞周期阶段 | 单细胞RNA测序数据中的细胞周期 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种模拟和真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 94 | 2024-08-29 |
Transcriptomic signatures associated with autoimmune thyroiditis in papillary thyroid carcinoma and cancer immunotherapy-induced thyroid dysfunction
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.019
PMID:35664236
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研究论文 | 本研究探讨了甲状腺乳头状癌（PTC）与桥本甲状腺炎（HT）共存现象及其转录组基础，以及免疫治疗相关甲状腺功能障碍的分子标志物 | 首次揭示了PTC患者中HT与复发之间的负相关性，并发现了HT患者中PD-1相关基因的高表达与CD8 T细胞激活的潜在关联 | 研究主要基于回顾性数据分析，未来需通过前瞻性研究进一步验证 | 探索PTC与HT共存的转录组基础及免疫治疗相关甲状腺功能障碍的分子机制 | 甲状腺乳头状癌患者及接受免疫治疗的患者的甲状腺功能障碍 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 转录组分析，单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据，单细胞数据 | 468名PTC患者，22,155名PTC患者（元分析），17,438个细胞（单细胞转录组分析），39,123名患者（甲状腺不良事件分析） |
| 95 | 2024-08-29 |
Comparative Toxicotranscriptomics of Single Cell RNA-Seq and Conventional RNA-Seq in TCDD-Exposed Testicular Tissue
2022, Frontiers in toxicology
IF:3.6Q2
DOI:10.3389/ftox.2022.821116
PMID:35615540
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研究论文 | 本报告比较了两种转录组学方法（常规RNA-seq和单细胞RNA测序）在暴露于TCDD的成年斑马鱼睾丸组织中的结果和局限性 | 单细胞RNA测序能够揭示异质组织中特定细胞类型的转录组动态 | 单细胞RNA测序中的细胞解离效应和转录组覆盖度降低可能影响毒理学研究 | 探讨单细胞RNA测序与常规RNA-seq在转录组学和毒理学上的差异 | 暴露于TCDD的成年斑马鱼睾丸组织 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 控制组和TCDD暴露组的配对样本 |
| 96 | 2024-08-28 |
Extrinsic KRAS Signaling Shapes the Pancreatic Microenvironment Through Fibroblast Reprogramming
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.016
PMID:35245687
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研究论文 | 研究了致癌KRAS信号如何通过重编程胰腺成纤维细胞来塑造胰腺肿瘤微环境 | 揭示了非细胞自主的致癌KRAS信号如何重编程胰腺成纤维细胞，激活炎症基因表达程序，从而影响肿瘤微环境 | NA | 探讨致癌KRAS在胰腺肿瘤微环境中的作用机制 | 胰腺肿瘤微环境和成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用遗传工程小鼠模型 |
| 97 | 2024-08-28 |
An Optimized Tissue Dissociation Protocol for Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Fresh and Cultured Human Skin Biopsies
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.872688
PMID:35573685
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的组织解离协议，用于从新鲜和培养的人类皮肤活检中制备高质量的皮肤细胞悬浮液，以便进行深入的单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析。 | 该协议能够从新鲜解离的小型皮肤活检中持续分离出大量高存活率的皮肤细胞，并成功识别了罕见的细胞群，如肥大细胞。 | NA | 旨在开发一种高效的组织解离协议，以促进对人类皮肤病理和皮肤移植实验的单细胞RNA测序发现。 | 新鲜和培养的人类皮肤活检。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 小型新鲜解离的皮肤活检和培养的皮肤活检碎片 |
| 98 | 2024-08-28 |
The Comprehensive Analysis Identified an Autophagy Signature for the Prognosis and the Immunotherapy Efficiency Prediction in Lung Adenocarcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.749241
PMID:35529878
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研究论文 | 本研究通过综合分析鉴定出一种自噬相关基因特征，用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗效率 | 本研究首次发现并验证了一种基于自噬相关基因的特征，能够预测肺腺癌患者的预后和免疫检查点治疗的效率 | NA | 鉴定一种新的自噬相关基因特征，用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗效率 | 肺腺癌患者的预后和免疫治疗效率 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 肿瘤样本2181个，正常样本419个，独立验证队列70个肺腺癌患者 |
| 99 | 2024-08-28 |
Foam Cells in Atherosclerosis: Novel Insights Into Its Origins, Consequences, and Molecular Mechanisms
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.845942
PMID:35498045
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综述 | 本文综述了泡沫细胞在动脉粥样硬化中的起源、后果及分子机制的新见解 | 采用谱系追踪和单细胞RNA测序（scRNA-seq）等新技术，揭示了来自单核细胞和血管平滑肌细胞（VSMC）的泡沫细胞亚型，并发现了核受体、非编码RNA和肠道微生物群等新机制 | 单核细胞的异质性和非编码RNA的复杂性为靶向泡沫细胞带来了挑战 | 总结泡沫细胞在动脉粥样硬化斑块中的起源、后果和分子机制的新见解 | 泡沫细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 100 | 2024-08-28 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Inter-Tumor Heterogeneity in Bilateral Papillary Thyroid Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.840811
PMID:35515000
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了双侧乳头状甲状腺癌中的肿瘤间异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了双侧乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境，揭示了其细胞组成和表型特征 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的甲状腺癌类型 | 探究双侧乳头状甲状腺癌肿瘤微环境中的细胞组成和表型特征 | 双侧乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 29,561个细胞来自3对双侧乳头状甲状腺癌和1个非肿瘤甲状腺样本 |