单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2024-08-08 |
Subtyping of sarcomas based on pathway enrichment scores in bulk and single cell transcriptomes
2022-01-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03248-3
PMID:35093080
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研究论文 | 本文通过分析14条涉及免疫、间质、DNA损伤修复和致癌信号通路的富集分数，对肉瘤进行了基于批量和单细胞转录组的分层聚类分析 | 本文首次通过整合不同类型的通路对肉瘤进行分类，并构建了一个线性风险评分模型（ICMScore），用于预测肉瘤和其他癌症的不良预后 | NA | 探索肉瘤的分子亚型及其生物学和临床意义 | 肉瘤的分子亚型及其与免疫、间质、DNA损伤修复和致癌信号通路的关系 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 线性风险评分模型（ICMScore） | 转录组数据 | 涉及三个批量肿瘤转录组数据集和一个单细胞RNA测序数据集 |
| 962 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a novel cell state and switching genes during hepatic stellate cell activation in vitro
2022-01-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03263-4
PMID:35093101
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了体外肝星状细胞激活过程中的一种新型细胞状态及关键切换基因 | 发现了一种新型细胞状态及关键切换基因，这些基因可能在肝星状细胞向肌成纤维细胞转化中起关键作用，并可作为慢性肝病患者纤维化进展的预测标志物 | NA | 揭示肝星状细胞激活过程中的细胞状态变化及关键基因表达 | 肝星状细胞及其在肝纤维化中的转化过程 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 963 | 2024-08-08 |
Gene expression predicts dormant metastatic breast cancer cell phenotype
2022-01-29, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-022-01503-5
PMID:35093137
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研究论文 | 本文开发了一种高效系统，用于从骨等转移器官中分离和研究罕见的休眠乳腺癌细胞，并使用单细胞RNA测序技术分析其基因表达特征 | 首次识别出一组在休眠乳腺癌细胞中高度表达的基因，这些基因与人类乳腺癌患者的无病生存期相关 | 研究主要集中在小鼠模型和人类数据集的比较，未详细探讨这些基因在人体内的具体作用机制 | 揭示控制肿瘤细胞休眠的机制，预测患者复发风险 | 休眠的乳腺癌转移细胞及其基因表达特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括来自骨和肺的休眠及增殖性PyMT-Bo1乳腺癌细胞 |
| 964 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing to track novel perspectives in HSC heterogeneity
2022-01-29, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02718-1
PMID:35093185
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在研究造血干细胞异质性及其起源和谱系承诺中的应用 | 单细胞RNA测序技术为研究正常和病理状态下造血干细胞的异质性提供了新的机会 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在追踪造血干细胞起源和谱系承诺中的贡献 | 造血干细胞及其异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 965 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing and its applications in bladder cancer
2022-01-28, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2021.23
PMID:35086606
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用及其对诊断和治疗的潜在影响 | 单细胞测序技术能够识别肿瘤内的细胞亚群，解析肿瘤微环境，并表征细胞基因组突变，从而深入理解肿瘤生物学 | NA | 探讨单细胞测序技术在膀胱癌研究和临床实践中的应用 | 膀胱癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 966 | 2024-08-08 |
Characterizing cellular heterogeneity in fibrotic hypersensitivity pneumonitis by single-cell transcriptional analysis
2022-Jan-28, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-022-00831-x
PMID:35091537
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析方法，揭示了纤维化过敏性肺炎（FHP）中的细胞异质性 | 通过整合scRNA-seq、scTCR-seq和bulk RNA-seq分析，识别了FHP中的十种主要细胞类型和19种独特亚型，并揭示了这些细胞亚群在FHP发病机制中的关键作用 | NA | 全面解析FHP的细胞异质性，为开发针对FHP的通用基因治疗方案铺平道路 | 纤维化过敏性肺炎（FHP）中的细胞异质性 | 数字病理学 | 肺疾病 | scRNA-seq, scTCR-seq, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及FHP患者的多种细胞类型和亚型 |
| 967 | 2024-08-08 |
Microskeletal stiffness promotes aortic aneurysm by sustaining pathological vascular smooth muscle cell mechanosensation via Piezo1
2022-01-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27874-5
PMID:35082286
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研究论文 | 本文探讨了血管平滑肌细胞在腹主动脉瘤形成中的机械感应机制，特别是通过Piezo1通道的作用 | 首次揭示了Piezo1通道在腹主动脉瘤形成中的关键作用，并展示了通过抑制Piezo1来预防腹主动脉瘤的可能性 | NA | 研究腹主动脉瘤的病理机制及潜在的治疗策略 | 血管平滑肌细胞的机械感应行为及Piezo1通道的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 超声镊子基微机械系统和单细胞RNA测序技术 | 理论模型 | 单细胞RNA序列数据 | NA |
| 968 | 2024-08-08 |
A novel prognostic model based on single-cell RNA sequencing data for hepatocellular carcinoma
2022-Jan-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-022-02469-2
PMID:35078458
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据构建了一个新的肝细胞癌预后模型 | 开发了一个基于肿瘤免疫微环境异质性的3基因签名，用于预测生存结果和免疫治疗反应 | NA | 旨在全面理解肝细胞癌的肿瘤免疫微环境，并构建一个预后模型 | 肝细胞癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基因共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 基于GSE149614数据集定义了25个细胞集群 |
| 969 | 2024-08-08 |
Tracing PRX1+ cells during molar formation and periodontal ligament reconstruction
2022-01-25, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-021-00155-z
PMID:35078971
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研究论文 | 本研究评估了PRX1细胞在小鼠磨牙发育和牙周韧带形成过程中的细胞命运，并使用单细胞RNA测序分析了PRX1细胞在牙周韧带细胞中的分布。 | 首次探讨了PRX1细胞在牙齿发育和再生中的潜在功能，并发现PRX1细胞在牙周韧带重建中作为周细胞参与血管生成。 | NA | 研究PRX1细胞在牙齿和骨骼发育中的作用及其在牙周韧带重建中的功能。 | PRX1细胞在小鼠磨牙发育和牙周韧带形成中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠磨牙和牙周韧带细胞 |
| 970 | 2024-08-08 |
Single-cell ATAC-seq of fetal human retina and stem-cell-derived retinal organoids shows changing chromatin landscapes during cell fate acquisition
2022-01-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110294
PMID:35081356
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq），研究了人类胎儿视网膜发育及视网膜类器官中的染色质景观变化 | 首次将scATAC-seq与scRNA-seq结合，以高分辨率视角研究人类视网膜发育 | 视网膜类器官在Notch信号传导和无长突细胞基因调控方面与正常发育存在差异 | 探讨细胞命运获得过程中染色质景观的变化，并评估视网膜类器官在再生医学中的应用潜力 | 人类胎儿视网膜及干细胞衍生的视网膜类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 971 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of de novo β-cell regeneration reveals the contribution of hybrid β/δ-cells to diabetes recovery in zebrafish
2022-01-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199853
PMID:35088828
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在斑马鱼中绘制了糖尿病诱导和恢复期间的新生β细胞再生的图谱，并揭示了β/δ杂交细胞在糖尿病恢复中的作用 | 首次在斑马鱼中发现并描述了两种不同类型的生长激素释放抑制素产生的δ细胞（δ1和δ2细胞），并鉴定了一小群同时具有β细胞和δ1细胞激素及命运决定因子的葡萄糖反应性胰岛细胞 | NA | 探索再生能力强的物种通过恢复受损组织功能来逆转严重疾病进展的细胞动力学机制 | 斑马鱼中的β细胞再生过程 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 972 | 2024-08-08 |
[Application of single-cell transcriptome sequencing in mechanistic toxicology]
2022-Jan-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在机制毒理学研究中的发展、原理、方法、应用及局限性 | 单细胞RNA测序技术能够识别组织微环境中化学暴露下的异质细胞反应，有助于发现敏感反应细胞和关键分子事件 | 文章讨论了单细胞转录组测序技术在机制毒理学研究中的局限性 | 探索毒性机制和作用模式的新视角 | 单细胞转录组测序技术在毒理学研究中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 973 | 2024-08-08 |
Apelin Alleviates Meniscus Endothelial Cell Apoptosis in Osteoarthritis
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/3556372
PMID:35069930
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研究论文 | 本研究探讨了apelin在骨关节炎中对半月板内皮细胞凋亡的保护作用 | 利用单细胞RNA测序和流式细胞术，首次识别出半月板中表达HOXA13和RASGRF2的两个内皮细胞亚群，并证实apelin通过下调caspase 3和BID来抑制这些亚群的凋亡 | NA | 研究apelin在骨关节炎中对半月板内皮细胞的保护作用 | 骨关节炎中的半月板内皮细胞 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从患者中纯化的半月板内皮细胞 |
| 974 | 2024-08-08 |
Dynamic inference of cell developmental complex energy landscape from time series single-cell transcriptomic data
2022-01, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009821
PMID:35073331
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图的非线性Fokker-Planck方程模型GraphFP，用于从时间序列单细胞转录组数据中重建细胞状态转换的复杂势能景观 | GraphFP模型明确考虑了细胞间的非线性相互作用，并通过动态最优传输框架和伴随方法有效解决了模型推断问题 | NA | 旨在从时间序列单细胞转录组数据中重建细胞状态转换过程并揭示细胞间的非线性相互作用 | 时间序列单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非线性Fokker-Planck方程 | 转录组数据 | 小鼠胚胎大脑皮层发育的时间序列scRNA-seq数据集 |
| 975 | 2024-08-08 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
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研究论文 | 本研究旨在优化分离的人胰岛细胞的冷冻保存方法，并获得可用于单细胞转录组研究的功能性细胞，以探讨糖尿病的病理和治疗方法 | 本研究采用迭代分级冷冻方法，成功地在冷冻保存后维持了细胞的膜完整性、分子和功能表型 | NA | 优化分离的人胰岛细胞的冷冻保存方法，并获得功能性细胞用于糖尿病的病理和治疗研究 | 分离的人胰岛细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA | NA |
| 976 | 2024-08-08 |
Clinical challenges of tissue preparation for spatial transcriptome
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.669
PMID:35083877
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研究论文 | 本文研究了影响空间转录组学质量的潜在因素，特别是在肺癌、癌旁或正常组织中的应用 | 强调了样本处理时间及干燥条件对空间转录组学样本质量的关键影响 | 未发现组织学评分与RNA完整性数（RIN）和唯一分子标识符（UMI）之间的显著相关性 | 旨在定义影响空间转录组学质量的潜在因素 | 研究了肺癌、癌旁或正常组织的空间转录组学质量 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学测序 | NA | 组织样本 | 具体样本数量未提及 |
| 977 | 2024-08-08 |
Molecular mechanisms governing circulating immune cell heterogeneity across different species revealed by single-cell sequencing
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.689
PMID:35092700
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，比较了12个物种的免疫细胞单细胞转录组，揭示了循环免疫细胞在不同物种间的异质性和组成 | 首次提供了跨物种外周血单核细胞（PBMCs）的单细胞转录组图谱的综合分析 | NA | 深入理解外周血单核细胞的细胞分类学和基本功能，以及在进化生物学、发育生物学和免疫系统疾病中的应用 | 12个物种的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组 | 12个物种的免疫细胞 |
| 978 | 2024-08-08 |
Dissecting the heterogeneity of the microenvironment in primary and recurrent nasopharyngeal carcinomas using single-cell RNA sequencing
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2026583
PMID:35096485
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研究论文 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术分析了四例原发性鼻咽癌和两例复发性鼻咽癌的约60,000个细胞的转录组，以深入了解复发性鼻咽癌在放射治疗区域内的动态变化 | 首次对复发性鼻咽癌的免疫微环境进行单细胞RNA测序分析，揭示了免疫细胞和肿瘤细胞的异质性及其在复发性鼻咽癌中的变化 | 研究样本相对有限，可能影响结果的普遍性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入了解复发性鼻咽癌的免疫微环境，以促进针对性的免疫治疗 | 原发性鼻咽癌和复发性鼻咽癌的免疫细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约60,000个细胞，来自四例原发性鼻咽癌和两例复发性鼻咽癌病例 |
| 979 | 2024-08-08 |
Identification of a unique tumor cell subset employing myeloid transcriptional circuits to create an immunomodulatory microenvironment in glioblastoma
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2030020
PMID:35096487
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了一种计算方法来描绘胶质母细胞瘤的免疫特征并识别新的分子亚群，以用于免疫治疗 | 发现了新的胶质母细胞瘤细胞亚群TC-6，该亚群具有免疫入侵特征，并与肿瘤相关巨噬细胞相互作用，形成免疫抑制性微环境 | NA | 揭示胶质母细胞瘤免疫微环境的异质性，并为优化胶质母细胞瘤免疫治疗提供新见解 | 胶质母细胞瘤细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 980 | 2024-08-08 |
Neuronal identities derived by misexpression of the POU IV sensory determinant in a protovertebrate
2022-01-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2118817119
PMID:35042818
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研究论文 | 研究在原脊椎动物中通过错误表达POU IV感觉决定因子导致神经元身份的变化 | 发现错误表达POU IV感觉决定因子会导致表皮细胞转变为具有混合感觉细胞类型特性的细胞，这些细胞同时表达PSC和BTN的特性 | NA | 探讨通过靶向错误表达细胞决定因子来重编程细胞类型的机会和挑战 | 原脊椎动物中的感觉细胞类型及其转变 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |