单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2024-08-08 |
Isolation of Murine Myeloid Progenitor Populations by CD34/CD150 Surface Markers
2022-01-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11030350
PMID:35159159
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研究论文 | 本研究通过使用CD34/CD150表面标记物，改进了小鼠骨髓中髓系祖细胞群的分离方法 | 提出使用CD150替代FcγR作为表面标记物，以实现更好的亚群分离 | NA | 改进髓系祖细胞群的分离方法，提高亚群分离的准确性和可重复性 | 小鼠骨髓中的髓系祖细胞 | NA | NA | 流式细胞术(FACS) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 942 | 2024-08-08 |
Untapped Neuroimaging Tools for Neuro-Oncology: Connectomics and Spatial Transcriptomics
2022-Jan-18, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14030464
PMID:35158732
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研究论文 | 本文探讨了神经影像学在神经肿瘤学中的应用，特别是通过连接组学和空间转录组学的方法 | 介绍了通过标准化分析将结构脑MRI转化为个体形态差异的平均脑，以及使用功能和结构模板进行连接组学分析和最近可用的空间转录组学模板 | 标准化分析在神经肿瘤学研究中使用不常见，且其广泛的应用潜力尚未充分探索 | 提供一个在肿瘤学中进行标准化分析的框架，并强调其局限性 | 神经影像学在神经肿瘤学中的应用，特别是连接组学和空间转录组学 | 神经影像学 | 神经肿瘤 | 磁共振成像（MRI） | NA | 图像 | 未具体说明样本数量 |
| 943 | 2024-08-08 |
SCANNER: a web platform for annotation, visualization and sharing of single cell RNA-seq data
2022-01-17, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baab086
PMID:35134150
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研究论文 | 开发了一个名为SCANNER的网络平台，用于单细胞RNA测序数据的注释、可视化和共享 | SCANNER平台无需特殊软件或大量编程技能，易于使用，并配备了实时数据库进行安全的数据管理 | NA | 为科学界提供一个公共网络资源，用于协作方式下的单细胞RNA测序数据共享和分析 | 单细胞RNA测序数据，包括19种癌症、COVID-19以及健康样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 数据库包含19种癌症、COVID-19以及健康样本，如吸烟者和非吸烟者的肺部样本、人脑细胞和外周血单核细胞(PBMC) |
| 944 | 2024-08-08 |
Integrative Multiomics Evaluation of IIDH1 Metabolic Enzyme as a Candidate Oncogene That is Correlated with Poor Prognosis and Immune Infiltration in Prostate Adenocarcinoma
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/9854788
PMID:35132321
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研究论文 | 本研究探讨了IDH1基因在前列腺腺癌中的表达及其与患者预后和免疫细胞浸润的关系 | 首次在前列腺腺癌中研究IDH1基因的临床相关性及其在免疫反应中的表达 | NA | 评估IDH1作为前列腺腺癌预后生物标志物的潜力 | IDH1基因在前列腺腺癌中的表达及其与患者生存和免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 前列腺腺癌组织与正常组织样本 |
| 945 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis revealed a suppressive tumor immune microenvironment in EGFR mutant lung adenocarcinoma
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003534
PMID:35140113
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和多重免疫组织化学技术，分析了EGFR突变型肺腺癌的肿瘤免疫微环境特征 | 首次全面描述了EGFR突变型肺腺癌的肿瘤微环境特征，从细胞组成和功能角度深入理解其免疫景观 | 研究样本量有限，仅包括九个未经治疗和三个经过免疫治疗的样本 | 旨在描述EGFR突变型肺腺癌的特定肿瘤微环境，以更好地理解其免疫景观 | EGFR突变型和野生型肺腺癌的免疫微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 九个未经治疗和三个经过免疫治疗的样本 |
| 946 | 2024-08-08 |
ATG16L1 is a Potential Prognostic Biomarker and Immune Signature for Osteosarcoma: A Study Based on Bulk RNA and Single-Cell RNA-Sequencing
2022, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S341879
PMID:35140506
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，探讨了自噬相关基因ATG16L1在骨肉瘤中的预后生物标志物和免疫特征的作用 | 首次通过批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了ATG16L1作为骨肉瘤的潜在预后生物标志物和免疫特征 | 研究仅基于GSE21257数据库和GSE152048数据集，可能需要更多样本和数据集来验证结果 | 探讨ATG16L1作为骨肉瘤预后生物标志物和免疫特征的潜力 | 骨肉瘤患者及其肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | LASSO回归分析和Cox回归分析 | RNA | 使用GSE21257数据库和GSE152048数据集进行分析 |
| 947 | 2024-08-08 |
Mapk14 is a Prognostic Biomarker and Correlates with the Clinicopathological Features and Immune Infiltration of Colorectal Cancer
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.817800
PMID:35141222
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研究论文 | 本研究探讨了Mapk14在结直肠癌中的表达及其与临床病理特征和免疫浸润的关系 | 发现Mapk14可作为结直肠癌的新型预后生物标志物，并与免疫浸润和药物治疗相关 | NA | 研究Mapk14在结直肠癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | Mapk14的表达、甲基化水平及其与结直肠癌临床病理特征和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者数据 |
| 948 | 2024-08-08 |
Development of an Inflammation-Related lncRNA-miRNA-mRNA Network Based on Competing Endogenous RNA in Breast Cancer at Single-Cell Resolution
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.839876
PMID:35145966
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研究论文 | 本研究旨在探讨炎症与长非编码RNA（lncRNA）之间的关系，并在乳腺癌中建立基于竞争性内源RNA（ceRNA）的炎症相关网络 | 首次在单细胞分辨率下构建了乳腺癌中的炎症相关ceRNA网络，并识别了潜在的关键lncRNA LRRC75A-AS1 | NA | 探索炎症与lncRNA在乳腺癌中的关系及机制 | 乳腺癌中的炎症相关lncRNA及其ceRNA网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 基于四项单细胞RNA测序研究的数据 |
| 949 | 2024-08-08 |
Integrated Analysis Reveals the Characteristics and Effects of SARS-CoV-2 Maternal-Fetal Transmission
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.813187
PMID:35154056
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研究论文 | 本文通过综合分析大规模转录组和单细胞测序数据，探讨了影响SARS-CoV-2母婴传播的关键因素及其特征和影响 | 研究揭示了胚胎发育阶段多个组织中ACE2和TMPRSS2的表达情况，以及这些因素在母婴传播中的潜在风险 | 研究主要集中在转录组和单细胞测序数据分析，未涉及临床病例的具体观察 | 探究SARS-CoV-2母婴传播的特征、影响及其分子机制 | SARS-CoV-2母婴传播的关键因素、特征和影响 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 950 | 2024-08-08 |
Characterization of Pipefish Immune Cell Populations Through Single-Cell Transcriptomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.820152
PMID:35154138
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术首次对海龙科鱼类的免疫细胞群进行了表征 | 首次利用单细胞RNA测序技术对海龙科鱼类的免疫细胞群进行表征，揭示了其独特的免疫细胞亚群 | NA | 探索海龙科鱼类在进化过程中免疫系统的变化及其对免疫细胞群动态的影响 | 海龙科鱼类的免疫细胞群 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 从血液和头肾提取的单个细胞 |
| 951 | 2024-08-08 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Data to Establish and Validate a Prognostic Model for Patients With Lung Adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.833797
PMID:35154287
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建并验证了肺腺癌的预后模型 | 利用单细胞RNA测序技术，能够检测肿瘤细胞中的精确细胞和分子变化，这是传统RNA测序无法做到的 | NA | 构建肺腺癌的预后模型 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 非负矩阵分解算法, Cox回归分析 | RNA测序数据 | 四个样本的单细胞RNA测序数据，以及来自TCGA和GEO数据库的批量RNA测序数据 |
| 952 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA landscape of the osteoimmunology microenvironment in periodontitis
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.65694
PMID:35154475
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术揭示了牙周炎中骨免疫微环境的分子成分和细胞组成的复杂性 | 首次在单细胞水平上全面揭示了牙周炎中骨免疫微环境的细胞类型和分子通路，特别是纤维母细胞和间充质干细胞在牙周炎中的变化 | NA | 探索牙周炎中骨免疫微环境的单细胞RNA图谱及其在牙周骨再生中的作用 | 健康对照组、严重慢性牙周炎患者及接受初步牙周治疗后的患者 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | UMAP | RNA | 共51248个单细胞，来自健康对照组（4例）、严重慢性牙周炎患者（5例）及初步牙周治疗后1个月内的患者（3例） |
| 953 | 2024-08-08 |
Inter-tissue convergence of gene expression during ageing suggests age-related loss of tissue and cellular identity
2022-01-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.68048
PMID:35098922
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研究论文 | 研究分析了小鼠大脑皮层、肺、肝和肌肉在发育和衰老过程中的基因表达变化，发现衰老过程中基因表达出现逆转现象，导致不同组织间的基因表达趋向一致 | 首次提出并验证了衰老过程中不同组织基因表达趋向一致的现象，即DiCo（divergence followed by convergence） | NA | 探讨衰老过程中基因表达的变化及其对组织和细胞身份的影响 | 小鼠的大脑皮层、肺、肝和肌肉组织 | 基因表达 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 16只小鼠 |
| 954 | 2024-08-08 |
A Rapid Adaptable Method for Isolation of Endothelial Cells from Human Adipose Tissue
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2059-5_18
PMID:35099741
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research paper | 本文介绍了一种从人类脂肪组织中快速分离内皮细胞的可靠且灵活的方法 | 该方法可以用于各种分析，包括单细胞RNA测序、体外培养和下游应用 | NA | 研究旨在开发一种有效的方法来分离和研究脂肪组织中的内皮细胞 | 人类脂肪组织中的内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 955 | 2024-08-08 |
Isolation of Cardiac Endothelial Cells for Transcriptomic Analysis of the Zebrafish and Mouse Heart
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2059-5_23
PMID:35099746
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研究论文 | 本文描述了一种使用酶解和机械解离以及荧光激活细胞分选（FACS）从斑马鱼和老鼠心脏中分离高质量心脏内皮细胞的协议 | 该方法能够获得高活性和纯度的心脏内皮细胞，适用于下游转录分析应用 | NA | 研究心脏内皮细胞的转录组分析 | 斑马鱼和老鼠的心脏内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及幼体和成体斑马鱼心脏以及健康和缺血成年老鼠心脏的内皮细胞 |
| 956 | 2024-08-08 |
CD73+ Epithelial Progenitor Cells That Contribute to Homeostasis and Renewal Are Depleted in Eosinophilic Esophagitis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.01.018
PMID:35108658
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研究论文 | 研究探讨了CD73+CD104+细胞在嗜酸性食管炎（EoE）中的作用及其对上皮更新和稳态的影响 | 首次研究了CD73+CD104+细胞在EoE中的生物学意义，并探讨了其在EoE上皮更新和稳态中的作用 | NA | 探讨CD73+CD104+细胞在EoE中的作用及其对上皮更新和稳态的影响 | CD73+CD104+细胞在EoE中的数量和功能 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 流式细胞术，免疫组织化学，定量逆转录聚合酶链反应，单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选 | NA | 细胞 | EoE和非EoE患者的食管活检样本，患者来源和永生化细胞系来源的食管类器官 |
| 957 | 2024-08-08 |
CD4+ T cells in classical Hodgkin lymphoma express exhaustion associated transcription factors TOX and TOX2: Characterizing CD4+ T cells in Hodgkin lymphoma
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2033433
PMID:35111387
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和T细胞受体可变基因片段使用分析，比较了经典霍奇金淋巴瘤（cHL）中CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞的特征 | 发现CD4+CD26- T细胞虽经历抗原暴露但未克隆扩增，表达与耗竭相关的转录因子TOX和TOX2，以及免疫检查点和趋化因子 | NA | 研究经典霍奇金淋巴瘤中CD4+ T细胞的特征及其与肿瘤细胞生存的关系 | 经典霍奇金淋巴瘤中的CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞 | 免疫学 | 霍奇金淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 来自cHL淋巴结细胞悬液的CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞 |
| 958 | 2024-08-08 |
Notch-Regulated c-Kit-Positive Liver Sinusoidal Endothelial Cells Contribute to Liver Zonation and Regeneration
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.01.019
PMID:35114417
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研究论文 | 本研究探讨了c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生过程中的作用及其机制 | 首次鉴定并研究了c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生中的具体作用及其通过Wnt2依赖性方式调节肝细胞再生的机制 | NA | 研究c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生中的作用及其机制 | c-kit阳性肝窦内皮细胞及其在肝再生中的作用 | NA | 肝病 | 定量逆转录聚合酶链反应, 免疫荧光染色, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用部分肝切除小鼠模型进行研究 |
| 959 | 2024-08-08 |
Functional New Transcription Factors (TFs) Associated with Cervical Cancer
2022, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2022/8381559
PMID:35126951
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研究论文 | 本研究旨在发现与宫颈癌发生相关的新转录因子（TFs） | 揭示了EMX2作为宫颈癌中的肿瘤抑制因子，并发现PDZRN3可能是EMX2在宫颈癌中的潜在靶点 | NA | 发现与宫颈癌发生相关的新转录因子 | 宫颈癌中的转录因子及其潜在靶点 | NA | 宫颈癌 | RNA-seq, 微阵列, 实时PCR | NA | 基因表达数据 | 10个宫颈癌数据集 |
| 960 | 2024-08-08 |
Allosteric inhibition reveals SHP2-mediated tumor immunosuppression in colon cancer by single-cell transcriptomics
2022-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2021.08.006
PMID:35127377
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术探讨了SHP2在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫抑制作用 | 首次揭示了SHP2通过调节STING-TBK1-IRF3介导的I型干扰素信号通路在肿瘤微环境中发挥免疫抑制作用 | 研究仅基于小鼠MC38异种移植模型，可能与人类结直肠癌存在差异 | 探讨SHP2在结直肠癌中的免疫抑制机制及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌中的SHP2及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠MC38异种移植模型中的肿瘤微环境细胞 |