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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2024-08-08 |
Relationship between Macrophage and Radiosensitivity in Human Primary and Recurrent Glioblastoma: In Silico Analysis with Publicly Available Datasets
2022-Jan-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines10020292
PMID:35203505
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研究论文 | 研究了人原发性和复发性胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞与放射敏感性的关系,使用公开数据集进行计算分析 | 首次探讨了M1/M2巨噬细胞比例与胶质母细胞瘤放射敏感性之间的关系,并分析了其对患者生存率的影响 | 研究依赖于公开数据集,可能存在数据质量和代表性的限制 | 探讨胶质母细胞瘤中巨噬细胞与放射敏感性的关系及其对患者生存率的影响 | 人原发性和复发性胶质母细胞瘤中的巨噬细胞及放射敏感性 | 数字病理学 | 脑癌 | CIBERSORTx算法 | NA | 基因表达数据 | 包括来自TCGA、CGGA、Ivy Glioblastoma Atlas Project、GSE84465、GLASS和GSE121810等多个数据集的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 922 | 2024-08-08 |
Targets and Potential Mechanism of Scutellaria baicalensis in Treatment of Primary Hepatocellular Carcinoma Based on Bioinformatics Analysis
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/8762717
PMID:35190740
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析,探讨了黄芩(Scutellaria baicalensis)在治疗原发性肝细胞癌(HCC)中的靶点和潜在机制 | 本研究首次通过基因表达模式聚类和差异分析,结合加权基因共表达网络分析(WGCNA)等方法,系统地分析了黄芩在HCC治疗中的作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,未进行体内外实验验证,因此其结果的临床应用还需进一步实验支持 | 旨在通过生物信息学手段分析黄芩在治疗肝细胞癌中的靶点和机制,为肝细胞癌的诊断、治疗和药物开发提供建议 | 研究对象为黄芩和肝细胞癌(HCC) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 使用黄芩处理的HepG2细胞在不同时间点的基因表达数据 | NA | NA | NA | NA |
| 923 | 2024-08-08 |
T Cell Receptor Repertoire Analysis Reveals Signatures of T Cell Responses to Human Mycobacterium tuberculosis
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.829694
PMID:35197957
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研究论文 | 本文通过结合单细胞TCR测序、单细胞RNA测序和流式细胞术,分析了结核性胸腔积液中的T细胞受体库,揭示了T细胞对人类结核分枝杆菌的反应特征 | 本文首次鉴定了一种新的多功能CD4 T细胞亚群,具有CD1限制性、T1和细胞毒性特征,可能提供对结核分枝杆菌的保护性免疫 | NA | 研究T细胞受体库的特征,以理解T细胞适应性免疫在感染机制中的作用 | 结核性胸腔积液中的T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞TCR测序、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 41,718个CD3 T细胞,包括30,515个CD4 T细胞和11,203个CD8 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 924 | 2024-08-08 |
Deep Immune Phenotyping and Single-Cell Transcriptomics Allow Identification of Circulating TRM-Like Cells Which Correlate With Liver-Stage Immunity and Vaccine-Induced Protection From Malaria
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.795463
PMID:35197971
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研究论文 | 本文通过深度免疫表型分析和单细胞转录组学研究,识别出与肝脏阶段免疫和疫苗诱导的疟疾保护相关的循环TRM样细胞 | 本文首次发现循环中的TRM样细胞与肝脏阶段疟疾疫苗的保护效果相关,并提供了监测肝脏TRM细胞的蓝图 | 需要定期进行肝脏采样以评估免疫治疗反应,但在大规模人类试验中不可行 | 研究肝脏组织驻留记忆CD8+ T细胞及其循环对应物在疟疾疫苗保护中的作用 | 肝脏CD8+ TRM细胞及其循环对应物 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA序列 | 包括肝脏细针抽吸物和外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 925 | 2024-08-08 |
Dimensionality Reduction and Louvain Agglomerative Hierarchical Clustering for Cluster-Specified Frequent Biomarker Discovery in Single-Cell Sequencing Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.828479
PMID:35198011
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研究论文 | 本文介绍了一种利用降维和层次凝聚聚类Louvain的方法,用于在单细胞测序数据中发现特定聚类的频繁生物标志物。 | 本文提出了一种结合降维和层次凝聚聚类的框架,有效发现单细胞RNA测序数据中的特定聚类频繁生物标志物。 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中高维度聚类面临的挑战,并发现特定聚类的频繁生物标志物。 | 单细胞RNA测序数据中的特定聚类频繁生物标志物。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA | 单细胞RNA测序数据 | 23,630个特征和1,872个样本(细胞) | NA | NA | NA | NA |
| 926 | 2024-08-08 |
A multi-omics approach to identify molecular alterations in a mouse model of heart failure
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.68232
PMID:35198060
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研究论文 | 本研究通过多组学方法分析了压力超负荷诱导的心力衰竭小鼠模型中的分子改变 | 本研究首次综合分析了scRNA-seq、scATAC-seq、bulk ATAC-seq和miRNA-seq数据,揭示了心力衰竭发病机制中的基因表达改变和免疫细胞功能 | NA | 探究压力超负荷诱导的心力衰竭发病机制中的分子改变 | 心力衰竭小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq, bulk ATAC-seq, miRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 心力衰竭小鼠模型与对照组小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 927 | 2024-08-08 |
Analysis of unc-62 expression pattern in C. elegans embryonic AWC neurons
2022, microPublication biology
DOI:10.17912/micropub.biology.000530
PMID:35198862
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研究论文 | 本文分析了C. elegans胚胎AWC神经元中unc-62表达模式 | 使用了综合的fosmid拯救转基因技术来分析unc-62在AWC发育中的表达模式 | 结果表明unc-62在AWC神经元中的表达水平可能无法检测或稳定性较低 | 研究unc-62在C. elegans胚胎AWC神经元发育中的功能 | C. elegans胚胎AWC神经元中的unc-62表达 | NA | NA | fosmid拯救转基因技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 928 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA Sequencing in NASH
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2128-8_15
PMID:35212995
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究非酒精性脂肪性肝炎(NASH)中肝脏非实质细胞的异质性 | 采用微滴式单细胞RNA测序技术,能够识别和表征不同的肝细胞类型,特别是肝巨噬细胞 | NA | 探讨NASH中肝脏非实质细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 小鼠肝脏中的髓系细胞群体 | 数字病理学 | 脂肪肝病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 来自健康和NASH肝脏的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 929 | 2024-08-08 |
Deciphering the Complex Molecular Pathogenesis of Myotonic Dystrophy Type 1 through Omics Studies
2022-Jan-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23031441
PMID:35163365
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研究论文 | 本文通过组学研究揭示了肌强直性营养不良1型(DM1)复杂的分子发病机制 | 采用了单细胞测序和人工智能等创新技术 | NA | 提高对肌强直性营养不良1型(DM1)的理解 | 肌强直性营养不良1型(DM1)的分子发病机制 | NA | 肌肉疾病 | 组学技术 | NA | 基因和微RNA表达、选择性剪接、3'多聚腺苷酸化、CpG甲基化和蛋白质水平等数据 | 使用来自患者和动物模型的组织样本和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 930 | 2024-08-08 |
Intersecting single-cell transcriptomics and genome-wide association studies identifies crucial cell populations and candidate genes for atherosclerosis
2022-Jan, European heart journal open
DOI:10.1093/ehjopen/oeab043
PMID:35174364
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研究论文 | 本文通过结合单细胞转录组学和全基因组关联研究,识别了与动脉粥样硬化相关的重要细胞群和候选基因 | 本文创新性地将遗传数据与单细胞RNA测序数据相结合,以识别特定细胞亚群中的动脉粥样硬化相关候选基因 | 研究主要集中在动脉粥样硬化斑块的细胞类型,可能忽略了其他组织中的相关细胞类型 | 旨在通过结合遗传学和转录组学数据,揭示动脉粥样硬化的生物学机制并识别潜在的药物靶点 | 动脉粥样硬化斑块中的细胞类型及其相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 46个与动脉粥样硬化和心血管疾病、风险因素及其他特征相关的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 931 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic and Epigenetic Analyses of Mouse Mammary Development Starting with the Embryo
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2193-6_3
PMID:35175591
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和ATAC-seq技术研究小鼠乳腺发育的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和ATAC-seq技术详细解析小鼠乳腺发育过程中的关键调控因子和信号传导途径 | NA | 揭示正常乳腺发育过程中的分子事件和信号传导途径 | 小鼠胚胎乳腺的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | RNA, DNA | 小鼠胚胎中的少量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 932 | 2024-08-08 |
Isolating and cryopreserving pig skin cells for single-cell RNA sequencing study
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263869
PMID:35176067
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研究论文 | 本文报道了一种从猪皮肤组织中分离和冷冻保存单细胞用于单细胞RNA测序的稳健方法 | 首次详细描述了使用单细胞RNA测序技术研究猪皮肤的方法,并展示了该方法的有效性 | NA | 开发一种有效的方法来分离和冷冻保存猪皮肤单细胞,以便进行单细胞RNA测序研究 | 猪皮肤单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞 | 未具体说明数量 | NA | NA | NA | NA |
| 933 | 2024-08-08 |
A Proximal-to-Distal Survey of Healthy Adult Human Small Intestine and Colon Epithelium by Single-Cell Transcriptomics
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.007
PMID:35176508
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术,对健康成人小肠和大肠上皮细胞进行了详细的组织功能分析 | 首次全面覆盖了十二指肠、空肠、回肠以及升结肠、横结肠和降结肠的单细胞转录组学研究,揭示了人与小鼠肠道上皮细胞的重要差异 | 研究样本仅来自3名器官捐赠者,可能影响结果的普遍性 | 探索健康成人小肠和大肠上皮细胞的组织功能和细胞特性 | 健康成人小肠和大肠的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 12,590个单个上皮细胞来自3名独立处理的器官捐赠者 | NA | NA | NA | NA |
| 934 | 2024-08-08 |
Contributions of Immune Cells and Stromal Cells to the Pathogenesis of Systemic Sclerosis: Recent Insights
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.826839
PMID:35185577
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综述 | 本文综述了系统性硬化症(SSc)中免疫细胞和间质细胞的作用,重点讨论了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术揭示的新亚型及其在SSc发病机制中的潜在角色 | 利用单细胞RNA测序技术深入研究了SSc中细胞亚群的转录组学和异质性 | NA | 总结当前关于SSc患者中免疫细胞和间质细胞的知识,并探讨其在SSc发病机制中的潜在作用 | 系统性硬化症(SSc)中的免疫细胞和间质细胞 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 935 | 2024-08-08 |
Calcium Signaling Is Impaired in PTEN-Deficient T Cell Acute Lymphoblastic Leukemia
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.797244
PMID:35185889
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研究论文 | 研究探讨了PTEN缺失的T细胞急性淋巴母细胞白血病中钙信号传导的功能性相互作用 | 通过单细胞RNA测序和生物信息学分析,揭示了PTEN缺失的胸腺细胞中钙信号通路活性的降低,并构建了数学模型来解释这一现象 | 研究仅限于PTEN缺失的胸腺细胞,未探讨其他可能影响钙信号传导的因素 | 研究PTEN缺失对T细胞急性淋巴母细胞白血病中钙信号传导的影响 | PTEN缺失和PTEN充足的胸腺细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | RNA | PTEN缺失和PTEN充足的胸腺细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 936 | 2024-08-08 |
S100A12 as Biomarker of Disease Severity and Prognosis in Patients With Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.810338
PMID:35185901
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研究论文 | 本研究探讨了S100A12作为特发性肺纤维化(IPF)患者疾病严重程度和预后标志物的潜在作用 | 首次在肺组织和支气管肺泡灌洗液中研究S100A12的表达与IPF的相关性,并使用单细胞RNA测序分析其作用 | 研究依赖于公开数据库的数据,可能存在样本选择偏倚 | 探究S100A12在IPF中的表达及其作为疾病严重程度和预后标志物的有效性 | 特发性肺纤维化患者 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 937 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Facilitates Elucidation of HIV Immunopathogenesis: A Review of Current Literature
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.828860
PMID:35185920
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示HIV免疫发病机制中的应用及其在HIV研究中的最新发现 | 单细胞测序技术被认为是探索HIV免疫发病机制的有用工具,能够揭示细胞形成和分化的关键过程、重要的造血途径以及预测免疫功能的调控基因网络 | NA | 旨在阐明HIV相关疾病的精确免疫发病机制,并识别可能的预防和治疗靶点 | HIV感染及其免疫发病机制 | NA | HIV | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 938 | 2024-08-08 |
CCR2+ Macrophages Promote Orthodontic Tooth Movement and Alveolar Bone Remodeling
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.835986
PMID:35185928
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术研究了正畸牙齿移动和牙槽骨重塑过程中巨噬细胞的转录组异质性 | 首次揭示了机械力诱导的巨噬细胞功能转变及其在牙槽骨重塑中的关键作用 | NA | 探讨巨噬细胞在正畸牙齿移动和牙槽骨重塑中的作用及其分子机制 | 巨噬细胞及其在牙槽骨重塑中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 939 | 2024-08-08 |
DecOT: Bulk Deconvolution With Optimal Transport Loss Using a Single-Cell Reference
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.825896
PMID:35186040
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研究论文 | 本研究提出了一种名为DecOT的批量去卷积方法,使用Wasserstein距离作为损失函数,并利用单细胞RNA测序数据作为参考,从批量组织RNA测序数据中表征细胞类型组成 | DecOT方法能够利用基因空间的额外信息,并通过集成框架整合来自多个个体参考的去卷积结果,以减轻个体/批次效应 | NA | 开发一种成本效益高的计算去卷积方法,以表征批量组织的细胞类型组成 | 批量组织RNA测序数据中的细胞类型组成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四个不同的单细胞数据集和真实的胰腺胰岛批量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 940 | 2024-08-08 |
Identification of Synovial Fibroblast-Associated Neuropeptide Genes and m6A Factors in Rheumatoid Arthritis Using Single-Cell Analysis and Machine Learning
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/5114697
PMID:35186167
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研究论文 | 本研究利用单细胞分析和机器学习技术,探讨了神经肽和m6A在类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞的致病过程中的作用 | 首次通过单细胞分析和机器学习技术,识别了与滑膜成纤维细胞相关的神经肽基因和m6A因子,揭示了它们在类风湿性关节炎中的重要调控功能 | NA | 探究神经肽和N6-甲基腺苷(m6A)在滑膜成纤维细胞致病过程中的作用 | 滑膜成纤维细胞及其在类风湿性关节炎中的作用 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |