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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Peripheral Immune Responses in Anti-Synthetase Syndrome-Associated Interstitial Lung Disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.804034
PMID:35250976
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,探讨了抗合成酶综合征相关间质性肺病的外周免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术描绘了抗合成酶综合征相关间质性肺病患者外周血单个核细胞的高分辨率细胞景观 | 样本量较小,仅包括5名患者和3名健康对照 | 旨在通过研究外周免疫反应,理解抗合成酶综合征相关间质性肺病的病理机制 | 抗合成酶综合征相关间质性肺病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名抗合成酶综合征相关间质性肺病患者和3名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 902 | 2024-08-08 |
Deciphering Cell-Type-Specific Gene Expression Signatures of Cardiac Diseases Through Reconstruction of Bulk Transcriptomes
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.792774
PMID:35252172
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研究论文 | 本研究通过计算重建大量转录组数据,揭示了心脏疾病中细胞类型特异性的基因表达特征 | 利用CIBERSORTx技术对大量转录组数据进行细胞类型特异性的计算重建,揭示了心脏疾病中细胞类型特异性的基因表达特征和信号通路 | 由于技术困难,心脏组织中进行单细胞RNA测序的研究仍然较少 | 揭示心脏疾病中细胞类型特异性的基因表达特征,促进对其病理生理机制的理解 | 心脏疾病中的细胞类型特异性基因表达和信号通路 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | CIBERSORTx | 转录组数据 | 110个样本来自12项研究,涵盖四种常见心脏疾病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 903 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Metabolic and Clinical Features of a Highly Malignant Cell Subpopulation in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.798165
PMID:35252177
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组技术探索了胰腺导管腺癌(PDAC)中高度恶性细胞亚群的代谢和临床特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据识别出PDAC中高度恶性的肿瘤细胞亚群,并揭示了其增强的糖酵解代谢特征 | NA | 揭示胰腺导管腺癌中高度恶性细胞亚群的代谢和临床特征 | 胰腺导管腺癌中的高度恶性细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 904 | 2024-08-08 |
Progress of Single-Cell RNA Sequencing Technology in Myocardial Infarction Research
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.768834
PMID:35252379
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在心肌梗死研究中的进展 | 利用单细胞转录组测序技术探索单细胞多样性,全面阐明心肌梗死的自然史和分子机制 | NA | 理解心肌梗死后心脏重塑和修复过程中细胞变化,发现新的潜在治疗靶点 | 心肌梗死后心脏中的心肌细胞、免疫细胞、成纤维细胞、内皮细胞等 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 905 | 2024-08-08 |
Identification of Significant Modules and Targets of Xian-Lian-Jie-Du Decoction Based on the Analysis of Transcriptomics, Proteomics and Single-Cell Transcriptomics in Colorectal Tumor
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S344861
PMID:35256851
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研究论文 | 本研究通过转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学分析,探讨了仙莲解毒汤在治疗溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的作用机制 | 首次通过多组学分析揭示了仙莲解毒汤在抑制结直肠肿瘤发生发展中的具体机制,并识别了关键的mRNA和蛋白质模块以及潜在的治疗靶点 | 研究主要基于AOM/DSS小鼠模型,未来需在临床试验中验证这些发现 | 探讨仙莲解毒汤在治疗溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的作用机制 | 仙莲解毒汤及其主要成分对AOM/DSS小鼠模型的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 高通量测序技术 | NA | 转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学数据 | 使用AOM/DSS小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 906 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Comparison of Bladder Cancer Reveals Its Ecosystem
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.818147
PMID:35265520
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了膀胱癌不同临床样本的转录组,揭示了肿瘤生态系统的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了膀胱癌不同阶段的肿瘤微环境特征,并发现了与疾病进展相关的生物标志物 | 研究样本数量有限,需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探索膀胱癌的生物学行为及其在不同临床状态下的肿瘤微环境 | 膀胱癌及其相关病理状态的单细胞转录组 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 26,792个细胞转录组来自三个患者的四个不同等级临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 907 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Nucleus Pulposus Reveals Chondrocyte Differentiation and Regulation in Intervertebral Disc Degeneration
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.824771
PMID:35265617
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了椎间盘退变过程中髓核细胞的发育路径和调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了髓核细胞在椎间盘退变过程中的三种细胞谱系家族和七种软骨细胞亚型,并定义了软骨细胞谱系家族的两个发育路径 | NA | 探索椎间盘退变过程中髓核细胞的发育和调控机制 | 髓核细胞在椎间盘退变中的发育路径和调控机制 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六个髓核样本,包括正常、轻度退变和重度退变 | NA | NA | NA | NA |
| 908 | 2024-08-08 |
IL-11 Is Elevated and Drives the Profibrotic Phenotype Transition of Orbital Fibroblasts in Thyroid-Associated Ophthalmopathy
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.846106
PMID:35273577
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-11(IL-11)在甲状腺相关眼病(TAO)中对眼眶成纤维细胞纤维化表型转变的作用 | 首次揭示了IL-11在TAO患者中的表达模式及其与病理纤维化的机制联系,并证明了IL-11通过诱导肌成纤维细胞分化标记物的表达介导纤维化表型转变 | NA | 研究IL-11在TAO中的表达及其与病理纤维化的关系 | TAO患者的血清和眼眶结缔组织中的IL-11水平及其与疾病活动的关系 | NA | 甲状腺相关眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | TAO患者的血清和眼眶结缔组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 909 | 2024-08-08 |
Spatially Annotated Single Cell Sequencing for Unraveling Intratumor Heterogeneity
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.829509
PMID:35273957
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于功能性单细胞测序(FUNseq)技术的新型空间注释单细胞测序方法,用于在单细胞分辨率下空间分析肿瘤细胞,揭示肿瘤内异质性。 | 该方法结合了单细胞RNA测序(scRNA-seq)的深度和空间转录组学方法的空间分布信息,实现了对肿瘤细胞的空间注释和深度特征分析。 | NA | 研究目的是通过空间注释单细胞测序技术揭示肿瘤内异质性的机制。 | 研究对象是肿瘤细胞及其在二维上皮细胞团中的空间分布和行为。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 研究中分析了位于2D上皮细胞团不同距离的细胞,具体样本数量未详细说明。 | NA | NA | NA | NA |
| 910 | 2024-08-08 |
Unbiased visualization of single-cell genomic data with SCUBI
2022-01-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100135
PMID:35224531
|
research paper | 本文介绍了一种名为SCUBI的无偏见方法,用于可视化单细胞基因组数据的低维表示 | SCUBI通过在非重叠方块内可视化细胞的聚合信息来解决第一个偏差,并通过可视化样本间细胞比例的差异来解决第二个偏差 | NA | 开发一种无偏见的方法来可视化单细胞基因组数据的低维表示 | 单细胞基因组数据的低维表示可视化 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | image | NA | NA | NA | NA | NA |
| 911 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomic Architecture Unraveling the Complexity of Tumor Heterogeneity in Distal Cholangiocarcinoma
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.014
PMID:35219893
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了远端胆管癌的细胞异质性和肿瘤微环境 | 首次通过单细胞转录组学揭示了远端胆管癌的细胞多样性和肿瘤微环境组成 | NA | 探索远端胆管癌的细胞多样性和肿瘤微环境,以揭示其进展机制 | 远端胆管癌及其邻近正常胆管样本 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共测序了来自人类远端胆管癌及其邻近组织的49,717个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 912 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Characterizes the Molecular Heterogeneity of the Larval Zebrafish Optic Tectum
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.818007
PMID:35221915
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)分析了斑马鱼幼体视顶盖(OT)的转录组特征,识别了25种潜在的OT细胞群体 | 首次应用scRNA-seq技术深入探索斑马鱼幼体视顶盖的细胞异质性 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示斑马鱼幼体视顶盖的分子异质性 | 斑马鱼幼体视顶盖的细胞类型及其功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 13,320个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 913 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Intra-Graft Population Heterogeneity in Acute Heart Allograft Rejection in Mouse
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.832573
PMID:35222420
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠心脏移植模型中与急性排斥反应相关的移植物浸润细胞的细胞类型和状态 | 首次详细描述了移植物内细胞异质性,并鉴定了特定巨噬细胞和内皮细胞群体在排斥反应中的作用,以及提供了一个潜在的临床排斥反应预测生物标志物 | NA | 研究心脏移植排斥反应中移植物内细胞的异质性 | 小鼠心脏移植模型中的移植物浸润细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 21种不同的细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 914 | 2024-08-08 |
Investigating the Intercellular Communication Network of Immune Cell in Acute Respiratory Distress Syndrome with Sepsis
2022, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2022/4586648
PMID:35222683
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建了急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中免疫细胞的细胞间通信网络,并分析了其在脓毒症诱导的ARDS中的作用 | 本研究首次揭示了脓毒症诱导的ARDS中与趋化因子-趋化因子受体相关的独特细胞间信号,并探讨了其在巨噬细胞M1/M2极化中的关键作用 | 本研究仅基于有限的样本(三名脓毒症诱导的ARDS患者和四名仅脓毒症患者)进行分析,可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 阐明ARDS中免疫系统的复杂动态反应过程,并识别关键的细胞间通信和转录因子 | 急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中的免疫细胞及其细胞间通信网络 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名脓毒症诱导的ARDS患者和四名仅脓毒症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 915 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Technologies in Precision Oncology
2022, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-91836-1_15
PMID:35230694
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在精准肿瘤学中的应用现状和未来潜力 | 单细胞测序技术能够解析肿瘤内异质性和亚克隆细胞群体,实现靶向药物再利用,并进行多组学数据整合及单细胞分辨率的细胞信号评估 | NA | 探讨单细胞测序技术在精准肿瘤学中的应用 | 单细胞DNA和RNA测序技术及其数据分析工具 | 数字病理学 | 肿瘤学 | 单细胞测序 | NA | DNA和RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 916 | 2024-08-08 |
Laser Capture Microdissection-Based mRNA Expression Microarrays and Single-Cell RNA Sequencing in Atherosclerosis Research
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1924-7_43
PMID:35237997
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研究论文 | 本文描述了一种结合激光捕获显微切割(LCM)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的方法,以克服各自在动脉粥样硬化研究中的局限性 | 提出了一种结合LCM和scRNA-seq技术的方法,以充分利用两者的优势并避免各自的缺陷 | scRNA-seq技术存在每个细胞转录本数量低和完全失去空间信息的局限性 | 旨在通过大规模基因表达分析方法,获取单个细胞在组织解剖结构中的转录特征信息 | 动脉粥样硬化斑块中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 激光捕获显微切割(LCM),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 每个阵列/少量RNA覆盖10-16,000个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 917 | 2024-08-08 |
Combined Single-Cell RNA and Single-Cell α/β T Cell Receptor Sequencing of the Arterial Wall in Atherosclerosis
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1924-7_44
PMID:35237998
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞α/β T细胞受体测序(scTCR-seq),研究了动脉粥样硬化中的T细胞免疫反应 | 首次在单细胞水平上同时分析了T细胞的转录组和TCR,为理解动脉粥样硬化中的T细胞免疫提供了新的视角 | NA | 探讨T细胞免疫在动脉粥样硬化进展中的作用,以及是否可以通过T细胞依赖的治疗策略来干预这一过程 | 动脉粥样硬化中的T细胞亚群及其免疫反应 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞α/β T细胞受体测序(scTCR-seq) | NA | RNA,TCR | 涉及动脉粥样硬化中的三个重要组织的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 918 | 2024-08-08 |
Single-Cell Antibody Sequencing in Atherosclerosis Research
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1924-7_46
PMID:35238000
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研究论文 | 本文介绍了通过单细胞抗体测序(scAb-Seq)补充单细胞RNA测序(scRNA-seq)获得的转录组信息,特别是在免疫细胞中,这种方法的重要性在于mRNA与细胞表面表达之间的相关性很弱。 | scAb-Seq技术利用商业化的抗体和抗体混合物,能够检测到多达200种抗体,通过三部分DNA序列同时检测抗体特异性DNA序列和cDNA的延伸。 | NA | 探讨单细胞抗体测序在动脉粥样硬化研究中的应用。 | 研究对象包括组织或血液细胞的表面蛋白表达。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞抗体测序(scAb-Seq) | NA | 序列数据 | 涉及多达200种抗体 | NA | NA | NA | NA |
| 919 | 2024-08-08 |
Identification of Rat Testicular Leydig Precursor Cells by Single-Cell-RNA-Sequence Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.805249
PMID:35242757
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,识别了大鼠睾丸间质前体细胞,并探讨了其在成年睾丸中的特性与调控机制 | 研究揭示了间质细胞在成年睾丸中的再生机制,并提出了关于干细胞身份、增殖、分化及调控的新理论 | NA | 探讨大鼠睾丸间质干细胞在成年睾丸中的识别、特性及其调控机制 | 大鼠睾丸间质干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个间质细胞群 | NA | NA | NA | NA |
| 920 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals an Intrinsic Heterogeneity of the Preovulatory Follicular Microenvironment
2022-01-29, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12020231
PMID:35204732
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,揭示了人类排卵前卵泡微环境的内在异质性 | 首次详细探索了排卵前卵泡中颗粒细胞和免疫细胞的功能及其转录组特征 | NA | 深入理解排卵前卵泡微环境的转录组景观,为卵子成熟和排卵过程的调控提供见解 | 人类排卵前卵泡中的颗粒细胞和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组 | 六个人类排卵前卵泡 | NA | NA | NA | NA |