单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
901	2024-08-08	Single-cell Transcriptomic Architecture Unraveling the Complexity of Tumor Heterogeneity in Distal Cholangiocarcinoma 2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.014 PMID:35219893	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术解析了远端胆管癌的细胞异质性和肿瘤微环境	首次通过单细胞转录组学揭示了远端胆管癌的细胞多样性和肿瘤微环境组成	NA	探索远端胆管癌的细胞多样性和肿瘤微环境，以揭示其进展机制	远端胆管癌及其邻近正常胆管样本	数字病理学	胆管癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	共测序了来自人类远端胆管癌及其邻近组织的49,717个单细胞
902	2024-08-08	Single-Cell RNA Sequencing Characterizes the Molecular Heterogeneity of the Larval Zebrafish Optic Tectum 2022, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fnmol.2022.818007 PMID:35221915	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了斑马鱼幼体视顶盖（OT）的转录组特征，识别了25种潜在的OT细胞群体	首次应用scRNA-seq技术深入探索斑马鱼幼体视顶盖的细胞异质性	NA	旨在通过单细胞RNA测序技术揭示斑马鱼幼体视顶盖的分子异质性	斑马鱼幼体视顶盖的细胞类型及其功能	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	13,320个细胞
903	2024-08-08	Single-Cell RNA Sequencing Identifies Intra-Graft Population Heterogeneity in Acute Heart Allograft Rejection in Mouse 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.832573 PMID:35222420	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠心脏移植模型中与急性排斥反应相关的移植物浸润细胞的细胞类型和状态	首次详细描述了移植物内细胞异质性，并鉴定了特定巨噬细胞和内皮细胞群体在排斥反应中的作用，以及提供了一个潜在的临床排斥反应预测生物标志物	NA	研究心脏移植排斥反应中移植物内细胞的异质性	小鼠心脏移植模型中的移植物浸润细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	21种不同的细胞群体
904	2024-08-08	Investigating the Intercellular Communication Network of Immune Cell in Acute Respiratory Distress Syndrome with Sepsis 2022, Computational and mathematical methods in medicine DOI:10.1155/2022/4586648 PMID:35222683	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据构建了急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中免疫细胞的细胞间通信网络，并分析了其在脓毒症诱导的ARDS中的作用	本研究首次揭示了脓毒症诱导的ARDS中与趋化因子-趋化因子受体相关的独特细胞间信号，并探讨了其在巨噬细胞M1/M2极化中的关键作用	本研究仅基于有限的样本（三名脓毒症诱导的ARDS患者和四名仅脓毒症患者）进行分析，可能需要更多样本以验证结果的普遍性	阐明ARDS中免疫系统的复杂动态反应过程，并识别关键的细胞间通信和转录因子	急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中的免疫细胞及其细胞间通信网络	数字病理学	急性呼吸窘迫综合征	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	三名脓毒症诱导的ARDS患者和四名仅脓毒症患者
905	2024-08-08	Single-Cell Sequencing Technologies in Precision Oncology 2022, Advances in experimental medicine and biology DOI:10.1007/978-3-030-91836-1_15 PMID:35230694	综述	本文综述了单细胞测序技术在精准肿瘤学中的应用现状和未来潜力	单细胞测序技术能够解析肿瘤内异质性和亚克隆细胞群体，实现靶向药物再利用，并进行多组学数据整合及单细胞分辨率的细胞信号评估	NA	探讨单细胞测序技术在精准肿瘤学中的应用	单细胞DNA和RNA测序技术及其数据分析工具	数字病理学	肿瘤学	单细胞测序	NA	DNA和RNA数据	NA
906	2024-08-08	Laser Capture Microdissection-Based mRNA Expression Microarrays and Single-Cell RNA Sequencing in Atherosclerosis Research 2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-1924-7_43 PMID:35237997	研究论文	本文描述了一种结合激光捕获显微切割（LCM）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的方法，以克服各自在动脉粥样硬化研究中的局限性	提出了一种结合LCM和scRNA-seq技术的方法，以充分利用两者的优势并避免各自的缺陷	scRNA-seq技术存在每个细胞转录本数量低和完全失去空间信息的局限性	旨在通过大规模基因表达分析方法，获取单个细胞在组织解剖结构中的转录特征信息	动脉粥样硬化斑块中的单细胞转录组	数字病理学	心血管疾病	激光捕获显微切割（LCM），单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	每个阵列/少量RNA覆盖10-16,000个基因
907	2024-08-08	Combined Single-Cell RNA and Single-Cell α/β T Cell Receptor Sequencing of the Arterial Wall in Atherosclerosis 2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-1924-7_44 PMID:35237998	研究论文	本文通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞α/β T细胞受体测序（scTCR-seq），研究了动脉粥样硬化中的T细胞免疫反应	首次在单细胞水平上同时分析了T细胞的转录组和TCR，为理解动脉粥样硬化中的T细胞免疫提供了新的视角	NA	探讨T细胞免疫在动脉粥样硬化进展中的作用，以及是否可以通过T细胞依赖的治疗策略来干预这一过程	动脉粥样硬化中的T细胞亚群及其免疫反应	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞α/β T细胞受体测序（scTCR-seq）	NA	RNA，TCR	涉及动脉粥样硬化中的三个重要组织的单细胞样本
908	2024-08-08	Single-Cell Antibody Sequencing in Atherosclerosis Research 2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-1924-7_46 PMID:35238000	研究论文	本文介绍了通过单细胞抗体测序（scAb-Seq）补充单细胞RNA测序（scRNA-seq）获得的转录组信息，特别是在免疫细胞中，这种方法的重要性在于mRNA与细胞表面表达之间的相关性很弱。	scAb-Seq技术利用商业化的抗体和抗体混合物，能够检测到多达200种抗体，通过三部分DNA序列同时检测抗体特异性DNA序列和cDNA的延伸。	NA	探讨单细胞抗体测序在动脉粥样硬化研究中的应用。	研究对象包括组织或血液细胞的表面蛋白表达。	数字病理学	心血管疾病	单细胞抗体测序（scAb-Seq）	NA	序列数据	涉及多达200种抗体
909	2024-08-08	Lysyl oxidase promotes anaplastic thyroid carcinoma cell proliferation and metastasis mediated via BMP1 2022-Jan, Gland surgery IF:1.5Q3 DOI:10.21037/gs-21-908 PMID:35242686	研究论文	本研究探讨了赖氨酰氧化酶（LOX）通过骨形态发生蛋白1（BMP1）促进间变性甲状腺癌（ATC）细胞增殖和转移的机制	本研究首次揭示了LOX和BMP1在ATC恶性进展中的作用，为ATC的治疗提供了新的潜在靶点	NA	研究LOX和BMP1在间变性甲状腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力	间变性甲状腺癌细胞及其增殖和转移机制	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序, 微阵列分析	NA	RNA序列数据	ATC组织和细胞系的数据
910	2024-08-08	Identification of Rat Testicular Leydig Precursor Cells by Single-Cell-RNA-Sequence Analysis 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.805249 PMID:35242757	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，识别了大鼠睾丸间质前体细胞，并探讨了其在成年睾丸中的特性与调控机制	研究揭示了间质细胞在成年睾丸中的再生机制，并提出了关于干细胞身份、增殖、分化及调控的新理论	NA	探讨大鼠睾丸间质干细胞在成年睾丸中的识别、特性及其调控机制	大鼠睾丸间质干细胞及其前体细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	涉及多个间质细胞群
911	2024-08-08	Single-Cell Sequencing Reveals an Intrinsic Heterogeneity of the Preovulatory Follicular Microenvironment 2022-01-29, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom12020231 PMID:35204732	研究论文	本研究通过单细胞测序技术，揭示了人类排卵前卵泡微环境的内在异质性	首次详细探索了排卵前卵泡中颗粒细胞和免疫细胞的功能及其转录组特征	NA	深入理解排卵前卵泡微环境的转录组景观，为卵子成熟和排卵过程的调控提供见解	人类排卵前卵泡中的颗粒细胞和免疫细胞	NA	NA	单细胞测序	NA	转录组	六个人类排卵前卵泡
912	2024-08-08	Relationship between Macrophage and Radiosensitivity in Human Primary and Recurrent Glioblastoma: In Silico Analysis with Publicly Available Datasets 2022-Jan-27, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines10020292 PMID:35203505	研究论文	研究了人原发性和复发性胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞与放射敏感性的关系，使用公开数据集进行计算分析	首次探讨了M1/M2巨噬细胞比例与胶质母细胞瘤放射敏感性之间的关系，并分析了其对患者生存率的影响	研究依赖于公开数据集，可能存在数据质量和代表性的限制	探讨胶质母细胞瘤中巨噬细胞与放射敏感性的关系及其对患者生存率的影响	人原发性和复发性胶质母细胞瘤中的巨噬细胞及放射敏感性	数字病理学	脑癌	CIBERSORTx算法	NA	基因表达数据	包括来自TCGA、CGGA、Ivy Glioblastoma Atlas Project、GSE84465、GLASS和GSE121810等多个数据集的样本
913	2024-08-08	Targets and Potential Mechanism of Scutellaria baicalensis in Treatment of Primary Hepatocellular Carcinoma Based on Bioinformatics Analysis 2022, Journal of oncology DOI:10.1155/2022/8762717 PMID:35190740	研究论文	本研究通过生物信息学分析，探讨了黄芩（Scutellaria baicalensis）在治疗原发性肝细胞癌（HCC）中的靶点和潜在机制	本研究首次通过基因表达模式聚类和差异分析，结合加权基因共表达网络分析（WGCNA）等方法，系统地分析了黄芩在HCC治疗中的作用机制	研究主要基于生物信息学分析，未进行体内外实验验证，因此其结果的临床应用还需进一步实验支持	旨在通过生物信息学手段分析黄芩在治疗肝细胞癌中的靶点和机制，为肝细胞癌的诊断、治疗和药物开发提供建议	研究对象为黄芩和肝细胞癌（HCC）	生物信息学	肝细胞癌	加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞测序技术	NA	基因表达数据	使用黄芩处理的HepG2细胞在不同时间点的基因表达数据
914	2024-08-08	T Cell Receptor Repertoire Analysis Reveals Signatures of T Cell Responses to Human Mycobacterium tuberculosis 2022, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2022.829694 PMID:35197957	研究论文	本文通过结合单细胞TCR测序、单细胞RNA测序和流式细胞术，分析了结核性胸腔积液中的T细胞受体库，揭示了T细胞对人类结核分枝杆菌的反应特征	本文首次鉴定了一种新的多功能CD4 T细胞亚群，具有CD1限制性、T1和细胞毒性特征，可能提供对结核分枝杆菌的保护性免疫	NA	研究T细胞受体库的特征，以理解T细胞适应性免疫在感染机制中的作用	结核性胸腔积液中的T细胞	免疫学	结核病	单细胞TCR测序、单细胞RNA测序	NA	细胞	41,718个CD3 T细胞，包括30,515个CD4 T细胞和11,203个CD8 T细胞
915	2024-08-08	Deep Immune Phenotyping and Single-Cell Transcriptomics Allow Identification of Circulating TRM-Like Cells Which Correlate With Liver-Stage Immunity and Vaccine-Induced Protection From Malaria 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.795463 PMID:35197971	研究论文	本文通过深度免疫表型分析和单细胞转录组学研究，识别出与肝脏阶段免疫和疫苗诱导的疟疾保护相关的循环TRM样细胞	本文首次发现循环中的TRM样细胞与肝脏阶段疟疾疫苗的保护效果相关，并提供了监测肝脏TRM细胞的蓝图	需要定期进行肝脏采样以评估免疫治疗反应，但在大规模人类试验中不可行	研究肝脏组织驻留记忆CD8+ T细胞及其循环对应物在疟疾疫苗保护中的作用	肝脏CD8+ TRM细胞及其循环对应物	免疫学	疟疾	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA序列	包括肝脏细针抽吸物和外周血样本
916	2024-08-08	Dimensionality Reduction and Louvain Agglomerative Hierarchical Clustering for Cluster-Specified Frequent Biomarker Discovery in Single-Cell Sequencing Data 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.828479 PMID:35198011	研究论文	本文介绍了一种利用降维和层次凝聚聚类Louvain的方法，用于在单细胞测序数据中发现特定聚类的频繁生物标志物。	本文提出了一种结合降维和层次凝聚聚类的框架，有效发现单细胞RNA测序数据中的特定聚类频繁生物标志物。	NA	旨在解决单细胞RNA测序数据中高维度聚类面临的挑战，并发现特定聚类的频繁生物标志物。	单细胞RNA测序数据中的特定聚类频繁生物标志物。	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	PCA	单细胞RNA测序数据	23,630个特征和1,872个样本（细胞）
917	2024-08-08	A multi-omics approach to identify molecular alterations in a mouse model of heart failure 2022, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.68232 PMID:35198060	研究论文	本研究通过多组学方法分析了压力超负荷诱导的心力衰竭小鼠模型中的分子改变	本研究首次综合分析了scRNA-seq、scATAC-seq、bulk ATAC-seq和miRNA-seq数据，揭示了心力衰竭发病机制中的基因表达改变和免疫细胞功能	NA	探究压力超负荷诱导的心力衰竭发病机制中的分子改变	心力衰竭小鼠模型	数字病理学	心血管疾病	scRNA-seq, scATAC-seq, bulk ATAC-seq, miRNA-seq	NA	基因表达数据	心力衰竭小鼠模型与对照组小鼠
918	2024-08-08	Analysis of unc-62 expression pattern in C. elegans embryonic AWC neurons 2022, microPublication biology DOI:10.17912/micropub.biology.000530 PMID:35198862	研究论文	本文分析了C. elegans胚胎AWC神经元中unc-62表达模式	使用了综合的fosmid拯救转基因技术来分析unc-62在AWC发育中的表达模式	结果表明unc-62在AWC神经元中的表达水平可能无法检测或稳定性较低	研究unc-62在C. elegans胚胎AWC神经元发育中的功能	C. elegans胚胎AWC神经元中的unc-62表达	NA	NA	fosmid拯救转基因技术	NA	单细胞RNA测序数据	NA
919	2024-08-08	Single Cell RNA Sequencing in NASH 2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-2128-8_15 PMID:35212995	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术研究非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中肝脏非实质细胞的异质性	采用微滴式单细胞RNA测序技术，能够识别和表征不同的肝细胞类型，特别是肝巨噬细胞	NA	探讨NASH中肝脏非实质细胞的异质性及其在疾病进展中的作用	小鼠肝脏中的髓系细胞群体	数字病理学	脂肪肝病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	来自健康和NASH肝脏的细胞样本
920	2024-08-08	Deciphering the Complex Molecular Pathogenesis of Myotonic Dystrophy Type 1 through Omics Studies 2022-Jan-27, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms23031441 PMID:35163365	研究论文	本文通过组学研究揭示了肌强直性营养不良1型（DM1）复杂的分子发病机制	采用了单细胞测序和人工智能等创新技术	NA	提高对肌强直性营养不良1型（DM1）的理解	肌强直性营养不良1型（DM1）的分子发病机制	NA	肌肉疾病	组学技术	NA	基因和微RNA表达、选择性剪接、3'多聚腺苷酸化、CpG甲基化和蛋白质水平等数据	使用来自患者和动物模型的组织样本和细胞系