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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-08-08 |
Development of a dynamic network biomarkers method and its application for detecting the tipping point of prior disease development
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.02.019
PMID:35317238
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综述 | 本文综述了动态网络生物标志物(DNB)方法的进展,该方法通过利用不同类型的转录组数据,能够识别与疾病进展关键时间点相关的表达特征的动态变化 | DNB方法能够识别癌症和其他疾病发展过程中潜在的生物标志物,这些标志物在正常和关键阶段之间表现出有限的分子谱变化 | NA | 探讨DNB方法在识别癌症和其他疾病发展过程中的应用,以及其在早期检测和干预中的潜力 | 癌症和其他疾病的发展过程 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | 动态网络生物标志物方法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 882 | 2024-08-08 |
Analysis of transcribed sequences from young and mature zebrafish thrombocytes
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0264776
PMID:35320267
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了年轻和成熟斑马鱼血小板的转录序列,并比较了这两种细胞类型的转录组差异 | 首次进行了年轻和成熟斑马鱼血小板的比较转录组学研究,揭示了血小板成熟过程中的基因表达模式差异 | NA | 研究斑马鱼血小板功能和发育的机制,特别是血小板成熟过程中的基因表达差异 | 年轻和成熟斑马鱼血小板 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和成熟斑马鱼血小板中共表达9143个基因,其中年轻血小板特异表达397个基因,成熟血小板特异表达2153个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 883 | 2024-08-08 |
A regulator of G protein signaling 5 marked subpopulation of vascular smooth muscle cells is lost during vascular disease
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0265132
PMID:35320283
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了健康动脉中血管平滑肌细胞的亚群及其在血管重塑中的作用 | 首次揭示了表达G蛋白信号调节因子5的血管平滑肌细胞亚群在健康动脉中的存在及其在血管稳态中的作用 | NA | 探究血管平滑肌细胞亚群在健康动脉中的存在及其在血管疾病中的变化 | 血管平滑肌细胞及其亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 884 | 2024-08-08 |
TIGIT Blockade Exerts Synergistic Effects on Microwave Ablation Against Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.832230
PMID:35320940
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研究论文 | 本文研究了TIGIT阻断与微波消融(MWA)联合治疗结直肠癌(CRC)肝转移的效果。 | 首次证明了TIGIT阻断与MWA联合治疗在结直肠癌肝转移中的协同作用,并重塑了肿瘤微环境(TME)。 | NA | 探索TIGIT阻断与MWA联合治疗在结直肠癌肝转移中的治疗效果。 | 结直肠癌肝转移的小鼠模型。 | NA | 结直肠癌 | 微波消融(MWA)、流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 885 | 2024-08-08 |
Inferring Cell-type-specific Genes of Lung Cancer Based on Deep Learning
2022, Current gene therapy
IF:3.8Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习的方法,用于推断肺腺癌中特定细胞类型的基因表达 | 本文融合了图卷积网络(GCN)和卷积神经网络(CNN)来构建模型,以推断肺腺癌中8种细胞类型的特定基因 | 由于单细胞测序技术的不足,只能检测到一小部分基因表达 | 旨在充分探索不同细胞类型中所有基因的表达 | 肺腺癌中的特定细胞类型基因 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞测序技术 | GCN和CNN | 基因表达数据 | 大量细胞类型特异性基因的已知样本 | NA | NA | NA | NA |
| 886 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of Refractory Celiac Disease Demonstrates Inter- and Intra-Patient Aberrant Cell Heterogeneity
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.03.005
PMID:35338007
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术探讨了难治性乳糜泻II型(RCDII)中异常细胞的异质性 | 采用高维单细胞技术揭示了RCDII中异常细胞的肿瘤间和肿瘤内异质性 | NA | 旨在通过单细胞技术表征RCDII中的固有和适应性免疫系统 | RCDII患者的肠道和血液样本 | 数字病理学 | 乳糜泻 | 单细胞质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名RCDII患者和6名健康对照者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 887 | 2024-08-08 |
Molecular Characteristics and Distribution of Adult Human Corneal Immune Cell Types
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.798346
PMID:35280984
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成人角膜缘免疫细胞的分子特征和分布 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了角膜缘免疫细胞的转录组图谱 | 仅使用了三名健康捐赠者的样本,可能限制了结果的普遍性 | 探究成人角膜缘免疫细胞的分子特征及其在免疫反应中的作用 | 成人角膜缘的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 804个从三名健康捐赠者角膜缘纯化的造血细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 888 | 2024-08-08 |
Identification of Distinct Immune Cell Subsets Associated With Asymptomatic Infection, Disease Severity, and Viral Persistence in COVID-19 Patients
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.812514
PMID:35281000
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研究论文 | 通过scRNA-seq技术结合深度分析独特的细胞表面标记物和差异表达基因,研究了COVID-19患者中与无症状感染、疾病严重程度和病毒持续性相关的76种不同细胞亚群 | 揭示了特定免疫细胞亚群与COVID-19不同临床表现之间的关系,并识别了与疾病严重程度和病毒持续性相关的细胞类型 | NA | 探究SARS-CoV-2感染中的细胞介导保护性和致病性免疫反应 | COVID-19患者的PBMC样本中的免疫细胞亚群 | NA | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 76种不同的细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 889 | 2024-08-08 |
Hemocyte Clusters Defined by scRNA-Seq in Bombyx mori: In Silico Analysis of Predicted Marker Genes and Implications for Potential Functional Roles
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.852702
PMID:35281044
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术分析了家蚕血细胞中的13个不同细胞簇,并讨论了这些细胞簇的标记基因及其潜在功能 | 采用scRNA-seq技术对家蚕血细胞进行高分辨率分析,揭示了血细胞亚型的分子复杂性和高度专业化功能 | 研究仅限于家蚕血细胞,尚未扩展到其他昆虫 | 通过scRNA-seq技术深入研究家蚕血细胞的亚型及其功能 | 家蚕血细胞及其亚型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 13个不同细胞簇的家蚕血细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 890 | 2024-08-08 |
A Systematic Evaluation of Supervised Machine Learning Algorithms for Cell Phenotype Classification Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.836798
PMID:35281805
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研究论文 | 本研究系统评估了13种流行的监督机器学习算法在不同大小的单细胞RNA测序数据集上进行细胞表型分类的性能 | 首次系统性地研究了不同大小的单细胞RNA测序数据集上监督机器学习算法的性能 | 集成算法并未显示出比单个机器学习方法显著的优势 | 评估监督机器学习算法在单细胞RNA测序数据上进行细胞表型分类的性能 | 13种流行的监督机器学习算法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | ElasticNet, NaiveBayes, XGBoost, 线性判别分析 | 单细胞RNA测序数据 | 多种不同大小的真实和模拟数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 891 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Novel Genes Regulated by Hypoxia in the Lung Vasculature
2022, Journal of vascular research
IF:1.8Q3
DOI:10.1159/000522340
PMID:35294950
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较了暴露于低氧环境28天的野生型小鼠与正常氧环境对照小鼠的肺部细胞,以及缺乏Notch3基因的小鼠的肺部细胞,揭示了低氧对肺血管基因表达和细胞表型的影响 | 研究发现低氧促进了肺部免疫和内皮细胞类型的细胞数量变化,激活了先天免疫途径,并在血管细胞中导致特定的基因表达变化 | 研究发现缺乏Notch3基因的小鼠与野生型对照小鼠在肺部细胞中的差异有限 | 研究低氧暴露对基因表达和细胞表型的影响 | 肺血管细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型小鼠和缺乏Notch3基因的小鼠的肺部细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 892 | 2024-08-08 |
FAT10 is a Prognostic Biomarker and Correlated With Immune Infiltrates in Skin Cutaneous Melanoma
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.805887
PMID:35300113
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研究论文 | 本研究探讨了FAT10在皮肤皮肤黑色素瘤(SKCM)中的表达及其与患者预后和肿瘤免疫浸润的关系 | 首次系统分析了FAT10在SKCM中的表达及其与肿瘤免疫浸润和患者预后的关联 | NA | 研究FAT10作为SKCM的预后生物标志物及其与免疫浸润的相关性 | FAT10在SKCM中的表达及其对患者预后和肿瘤免疫浸润的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Cancer Genome Atlas和Genotype-Tissue Expression数据进行泛癌分析,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 893 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Heterogeneity of Mouse Mammary Gland Fibroblasts With Distinct Functions, Estrogen Responses, Differentiation Processes, and Crosstalks With Epithelium
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.850568
PMID:35300413
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,鉴定了两种主要类型的小鼠乳腺成纤维细胞,并探讨了它们的功能特性、定位以及与雌激素的反应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了小鼠乳腺成纤维细胞的异质性及其与上皮细胞的相互作用 | 研究主要集中在小鼠乳腺成纤维细胞,未涉及其他细胞类型或更广泛的生物学背景 | 揭示小鼠乳腺成纤维细胞的异质性及其在乳腺组织中的功能和相互作用 | 小鼠乳腺成纤维细胞及其与上皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个小鼠乳腺成纤维细胞群体及公开数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 894 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Splicing Features of Adult Neural Stem Cells in the Subventricular Zone
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.822934
PMID:35300421
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了成年小鼠侧脑室下区神经干细胞的剪接特征 | 本研究发现单细胞RNA测序在揭示稀有剪接异构体方面优于群体水平的批量RNA测序,并揭示了静息干细胞、激活干细胞和神经母细胞中剪接变异体的高度异质性 | NA | 旨在深入理解神经发生区域重要细胞类型的单细胞剪接特征 | 成年小鼠侧脑室下区的神经干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 895 | 2024-08-08 |
Single-Cell Atlas of the Chinese Tongue Sole (Cynoglossus semilaevis) Ovary Reveals Transcriptional Programs of Oogenesis in Fish
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.828124
PMID:35300429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了中国舌鳎卵巢中不同卵泡细胞类别的分子特征,揭示了鱼类卵子发生的转录程序。 | 首次揭示了中国舌鳎卵巢中卵子发生的细胞类型特异性机制,并发现了鱼类卵泡壁的细胞组成及关键转录因子。 | NA | 探索鱼类卵子发生的分子机制及其在鱼类繁殖和脊椎动物生殖系统进化中的作用。 | 中国舌鳎卵巢中的卵泡细胞及其分子特征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 成年中国舌鳎卵巢中的多个卵泡细胞类别 | NA | NA | NA | NA |
| 896 | 2024-08-08 |
Abnormal Changes of Monocyte Subsets in Patients With Sjögren's Syndrome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.864920
PMID:35309355
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了干燥综合征患者与对照组单核细胞亚群的转录组变化,并探索了与疾病发展相关的主要功能通路 | 发现了一种新的单核细胞亚群,该亚群在干燥综合征患者中表达增加,并确定了TNFSF10高表达单核细胞作为干燥综合征发病机制中的潜在关键因素 | NA | 研究干燥综合征患者中单核细胞亚群的变化及其转录组变化 | 干燥综合征患者与对照组的单核细胞亚群 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 干燥综合征患者与对照组的单核细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 897 | 2024-08-08 |
Construction and Validation of a Ferroptosis-Related Prognostic Signature for Melanoma Based on Single-Cell RNA Sequencing
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.818457
PMID:35309911
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据,构建并验证了一个与铁死亡相关的黑色素瘤预后标志物 | 首次发现并验证了与铁死亡相关的基因标志物在黑色素瘤预后中的重要性 | NA | 探索铁死亡相关基因与黑色素瘤患者预后的关联 | 黑色素瘤患者及铁死亡相关基因 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | COX比例风险回归分析 | 基因表达数据 | 多个黑色素瘤细胞系和正常人表皮黑素细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 898 | 2024-08-08 |
Prognostic Significance and Therapeutic Target of CXC Chemokines in the Microenvironment of Lung Adenocarcinoma
2022, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S352511
PMID:35250303
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研究论文 | 研究分析了CXC趋化因子在肺腺癌微环境中的异常表达及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次明确了CXC趋化因子家族在肺腺癌中的差异表达模式、预后价值及具体机制 | NA | 探讨CXC趋化因子在肺腺癌中的表达模式及其对患者预后的影响 | CXC趋化因子在肺腺癌微环境中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 转录组表达谱数据分析 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TIMER和TCGA的数据,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 899 | 2024-08-08 |
The Dynamic Change of Immune Responses Between Acute and Recurrence Stages of Rodent Malaria Infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.844975
PMID:35250958
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research paper | 本研究使用单细胞RNA测序技术,探讨了啮齿动物疟疾感染急性期与复发期之间免疫反应的动态变化 | 首次揭示了急性期与复发期疟疾感染中免疫细胞类型和功能的差异,特别是适应性免疫反应与先天免疫反应在控制复发中的互补作用 | NA | 探讨疟疾感染急性期与复发期之间不同的免疫反应机制 | 啮齿动物疟疾感染中的免疫细胞及其功能 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 900 | 2024-08-08 |
Increased Expression of Tim-3 Is Associated With Depletion of NKT Cells In SARS-CoV-2 Infection
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.796682
PMID:35250975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了Tim-3在SARS-CoV-2感染中对NKT细胞消耗的影响及其机制 | 首次揭示了Tim-3表达上调在COVID-19进展阶段导致NKT细胞消耗和功能障碍的新机制 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染中NKT细胞消耗的机制及其与疾病严重程度和预后的关系 | COVID-19患者中的NKT细胞和Tim-3表达 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个大型COVID-19患者队列 | NA | NA | NA | NA |