单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Novel Genes Regulated by Hypoxia in the Lung Vasculature
2022, Journal of vascular research
IF:1.8Q3
DOI:10.1159/000522340
PMID:35294950
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，比较了暴露于低氧环境28天的野生型小鼠与正常氧环境对照小鼠的肺部细胞，以及缺乏Notch3基因的小鼠的肺部细胞，揭示了低氧对肺血管基因表达和细胞表型的影响 | 研究发现低氧促进了肺部免疫和内皮细胞类型的细胞数量变化，激活了先天免疫途径，并在血管细胞中导致特定的基因表达变化 | 研究发现缺乏Notch3基因的小鼠与野生型对照小鼠在肺部细胞中的差异有限 | 研究低氧暴露对基因表达和细胞表型的影响 | 肺血管细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型小鼠和缺乏Notch3基因的小鼠的肺部细胞 |
| 882 | 2024-08-08 |
FAT10 is a Prognostic Biomarker and Correlated With Immune Infiltrates in Skin Cutaneous Melanoma
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.805887
PMID:35300113
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研究论文 | 本研究探讨了FAT10在皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）中的表达及其与患者预后和肿瘤免疫浸润的关系 | 首次系统分析了FAT10在SKCM中的表达及其与肿瘤免疫浸润和患者预后的关联 | NA | 研究FAT10作为SKCM的预后生物标志物及其与免疫浸润的相关性 | FAT10在SKCM中的表达及其对患者预后和肿瘤免疫浸润的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Cancer Genome Atlas和Genotype-Tissue Expression数据进行泛癌分析，具体样本数量未详细说明 |
| 883 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Heterogeneity of Mouse Mammary Gland Fibroblasts With Distinct Functions, Estrogen Responses, Differentiation Processes, and Crosstalks With Epithelium
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.850568
PMID:35300413
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，鉴定了两种主要类型的小鼠乳腺成纤维细胞，并探讨了它们的功能特性、定位以及与雌激素的反应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了小鼠乳腺成纤维细胞的异质性及其与上皮细胞的相互作用 | 研究主要集中在小鼠乳腺成纤维细胞，未涉及其他细胞类型或更广泛的生物学背景 | 揭示小鼠乳腺成纤维细胞的异质性及其在乳腺组织中的功能和相互作用 | 小鼠乳腺成纤维细胞及其与上皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个小鼠乳腺成纤维细胞群体及公开数据集 |
| 884 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Splicing Features of Adult Neural Stem Cells in the Subventricular Zone
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.822934
PMID:35300421
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了成年小鼠侧脑室下区神经干细胞的剪接特征 | 本研究发现单细胞RNA测序在揭示稀有剪接异构体方面优于群体水平的批量RNA测序，并揭示了静息干细胞、激活干细胞和神经母细胞中剪接变异体的高度异质性 | NA | 旨在深入理解神经发生区域重要细胞类型的单细胞剪接特征 | 成年小鼠侧脑室下区的神经干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28个单细胞 |
| 885 | 2024-08-08 |
Single-Cell Atlas of the Chinese Tongue Sole (Cynoglossus semilaevis) Ovary Reveals Transcriptional Programs of Oogenesis in Fish
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.828124
PMID:35300429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了中国舌鳎卵巢中不同卵泡细胞类别的分子特征，揭示了鱼类卵子发生的转录程序。 | 首次揭示了中国舌鳎卵巢中卵子发生的细胞类型特异性机制，并发现了鱼类卵泡壁的细胞组成及关键转录因子。 | NA | 探索鱼类卵子发生的分子机制及其在鱼类繁殖和脊椎动物生殖系统进化中的作用。 | 中国舌鳎卵巢中的卵泡细胞及其分子特征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 成年中国舌鳎卵巢中的多个卵泡细胞类别 |
| 886 | 2024-08-08 |
Abnormal Changes of Monocyte Subsets in Patients With Sjögren's Syndrome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.864920
PMID:35309355
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了干燥综合征患者与对照组单核细胞亚群的转录组变化，并探索了与疾病发展相关的主要功能通路 | 发现了一种新的单核细胞亚群，该亚群在干燥综合征患者中表达增加，并确定了TNFSF10高表达单核细胞作为干燥综合征发病机制中的潜在关键因素 | NA | 研究干燥综合征患者中单核细胞亚群的变化及其转录组变化 | 干燥综合征患者与对照组的单核细胞亚群 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 干燥综合征患者与对照组的单核细胞亚群 |
| 887 | 2024-08-08 |
Construction and Validation of a Ferroptosis-Related Prognostic Signature for Melanoma Based on Single-Cell RNA Sequencing
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.818457
PMID:35309911
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，构建并验证了一个与铁死亡相关的黑色素瘤预后标志物 | 首次发现并验证了与铁死亡相关的基因标志物在黑色素瘤预后中的重要性 | NA | 探索铁死亡相关基因与黑色素瘤患者预后的关联 | 黑色素瘤患者及铁死亡相关基因 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | COX比例风险回归分析 | 基因表达数据 | 多个黑色素瘤细胞系和正常人表皮黑素细胞 |
| 888 | 2024-08-08 |
Prognostic Significance and Therapeutic Target of CXC Chemokines in the Microenvironment of Lung Adenocarcinoma
2022, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S352511
PMID:35250303
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研究论文 | 研究分析了CXC趋化因子在肺腺癌微环境中的异常表达及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次明确了CXC趋化因子家族在肺腺癌中的差异表达模式、预后价值及具体机制 | NA | 探讨CXC趋化因子在肺腺癌中的表达模式及其对患者预后的影响 | CXC趋化因子在肺腺癌微环境中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 转录组表达谱数据分析 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TIMER和TCGA的数据，具体样本数量未详细说明 |
| 889 | 2024-08-08 |
The Dynamic Change of Immune Responses Between Acute and Recurrence Stages of Rodent Malaria Infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.844975
PMID:35250958
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research paper | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了啮齿动物疟疾感染急性期与复发期之间免疫反应的动态变化 | 首次揭示了急性期与复发期疟疾感染中免疫细胞类型和功能的差异，特别是适应性免疫反应与先天免疫反应在控制复发中的互补作用 | NA | 探讨疟疾感染急性期与复发期之间不同的免疫反应机制 | 啮齿动物疟疾感染中的免疫细胞及其功能 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 未明确提及具体样本数量 |
| 890 | 2024-08-08 |
Increased Expression of Tim-3 Is Associated With Depletion of NKT Cells In SARS-CoV-2 Infection
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.796682
PMID:35250975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了Tim-3在SARS-CoV-2感染中对NKT细胞消耗的影响及其机制 | 首次揭示了Tim-3表达上调在COVID-19进展阶段导致NKT细胞消耗和功能障碍的新机制 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染中NKT细胞消耗的机制及其与疾病严重程度和预后的关系 | COVID-19患者中的NKT细胞和Tim-3表达 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个大型COVID-19患者队列 |
| 891 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Peripheral Immune Responses in Anti-Synthetase Syndrome-Associated Interstitial Lung Disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.804034
PMID:35250976
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了抗合成酶综合征相关间质性肺病的外周免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术描绘了抗合成酶综合征相关间质性肺病患者外周血单个核细胞的高分辨率细胞景观 | 样本量较小，仅包括5名患者和3名健康对照 | 旨在通过研究外周免疫反应，理解抗合成酶综合征相关间质性肺病的病理机制 | 抗合成酶综合征相关间质性肺病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名抗合成酶综合征相关间质性肺病患者和3名健康对照 |
| 892 | 2024-08-08 |
Deciphering Cell-Type-Specific Gene Expression Signatures of Cardiac Diseases Through Reconstruction of Bulk Transcriptomes
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.792774
PMID:35252172
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研究论文 | 本研究通过计算重建大量转录组数据，揭示了心脏疾病中细胞类型特异性的基因表达特征 | 利用CIBERSORTx技术对大量转录组数据进行细胞类型特异性的计算重建，揭示了心脏疾病中细胞类型特异性的基因表达特征和信号通路 | 由于技术困难，心脏组织中进行单细胞RNA测序的研究仍然较少 | 揭示心脏疾病中细胞类型特异性的基因表达特征，促进对其病理生理机制的理解 | 心脏疾病中的细胞类型特异性基因表达和信号通路 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CIBERSORTx | 转录组数据 | 110个样本来自12项研究，涵盖四种常见心脏疾病小鼠模型 |
| 893 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Metabolic and Clinical Features of a Highly Malignant Cell Subpopulation in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.798165
PMID:35252177
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组技术探索了胰腺导管腺癌（PDAC）中高度恶性细胞亚群的代谢和临床特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据识别出PDAC中高度恶性的肿瘤细胞亚群，并揭示了其增强的糖酵解代谢特征 | NA | 揭示胰腺导管腺癌中高度恶性细胞亚群的代谢和临床特征 | 胰腺导管腺癌中的高度恶性细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 894 | 2024-08-08 |
Progress of Single-Cell RNA Sequencing Technology in Myocardial Infarction Research
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.768834
PMID:35252379
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在心肌梗死研究中的进展 | 利用单细胞转录组测序技术探索单细胞多样性，全面阐明心肌梗死的自然史和分子机制 | NA | 理解心肌梗死后心脏重塑和修复过程中细胞变化，发现新的潜在治疗靶点 | 心肌梗死后心脏中的心肌细胞、免疫细胞、成纤维细胞、内皮细胞等 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 895 | 2024-08-08 |
Identification of Significant Modules and Targets of Xian-Lian-Jie-Du Decoction Based on the Analysis of Transcriptomics, Proteomics and Single-Cell Transcriptomics in Colorectal Tumor
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S344861
PMID:35256851
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研究论文 | 本研究通过转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学分析，探讨了仙莲解毒汤在治疗溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的作用机制 | 首次通过多组学分析揭示了仙莲解毒汤在抑制结直肠肿瘤发生发展中的具体机制，并识别了关键的mRNA和蛋白质模块以及潜在的治疗靶点 | 研究主要基于AOM/DSS小鼠模型，未来需在临床试验中验证这些发现 | 探讨仙莲解毒汤在治疗溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的作用机制 | 仙莲解毒汤及其主要成分对AOM/DSS小鼠模型的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 高通量测序技术 | NA | 转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学数据 | 使用AOM/DSS小鼠模型进行实验 |
| 896 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Comparison of Bladder Cancer Reveals Its Ecosystem
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.818147
PMID:35265520
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了膀胱癌不同临床样本的转录组，揭示了肿瘤生态系统的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了膀胱癌不同阶段的肿瘤微环境特征，并发现了与疾病进展相关的生物标志物 | 研究样本数量有限，需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探索膀胱癌的生物学行为及其在不同临床状态下的肿瘤微环境 | 膀胱癌及其相关病理状态的单细胞转录组 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 26,792个细胞转录组来自三个患者的四个不同等级临床样本 |
| 897 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Nucleus Pulposus Reveals Chondrocyte Differentiation and Regulation in Intervertebral Disc Degeneration
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.824771
PMID:35265617
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了椎间盘退变过程中髓核细胞的发育路径和调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了髓核细胞在椎间盘退变过程中的三种细胞谱系家族和七种软骨细胞亚型，并定义了软骨细胞谱系家族的两个发育路径 | NA | 探索椎间盘退变过程中髓核细胞的发育和调控机制 | 髓核细胞在椎间盘退变中的发育路径和调控机制 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六个髓核样本，包括正常、轻度退变和重度退变 |
| 898 | 2024-08-08 |
IL-11 Is Elevated and Drives the Profibrotic Phenotype Transition of Orbital Fibroblasts in Thyroid-Associated Ophthalmopathy
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.846106
PMID:35273577
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-11（IL-11）在甲状腺相关眼病（TAO）中对眼眶成纤维细胞纤维化表型转变的作用 | 首次揭示了IL-11在TAO患者中的表达模式及其与病理纤维化的机制联系，并证明了IL-11通过诱导肌成纤维细胞分化标记物的表达介导纤维化表型转变 | NA | 研究IL-11在TAO中的表达及其与病理纤维化的关系 | TAO患者的血清和眼眶结缔组织中的IL-11水平及其与疾病活动的关系 | NA | 甲状腺相关眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | TAO患者的血清和眼眶结缔组织样本 |
| 899 | 2024-08-08 |
Spatially Annotated Single Cell Sequencing for Unraveling Intratumor Heterogeneity
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.829509
PMID:35273957
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研究论文 | 本文介绍了一种基于功能性单细胞测序（FUNseq）技术的新型空间注释单细胞测序方法，用于在单细胞分辨率下空间分析肿瘤细胞，揭示肿瘤内异质性。 | 该方法结合了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的深度和空间转录组学方法的空间分布信息，实现了对肿瘤细胞的空间注释和深度特征分析。 | NA | 研究目的是通过空间注释单细胞测序技术揭示肿瘤内异质性的机制。 | 研究对象是肿瘤细胞及其在二维上皮细胞团中的空间分布和行为。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 研究中分析了位于2D上皮细胞团不同距离的细胞，具体样本数量未详细说明。 |
| 900 | 2024-08-08 |
Unbiased visualization of single-cell genomic data with SCUBI
2022-01-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100135
PMID:35224531
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research paper | 本文介绍了一种名为SCUBI的无偏见方法，用于可视化单细胞基因组数据的低维表示 | SCUBI通过在非重叠方块内可视化细胞的聚合信息来解决第一个偏差，并通过可视化样本间细胞比例的差异来解决第二个偏差 | NA | 开发一种无偏见的方法来可视化单细胞基因组数据的低维表示 | 单细胞基因组数据的低维表示可视化 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | image | NA |