单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2024-08-08 |
Dietary Fiber as a Counterbalance to Age-Related Microglial Cell Dysfunction
2022, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2022.835824
PMID:35360677
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研究论文 | 研究通过增加饮食纤维来预防或逆转与年龄相关的微胶质细胞功能障碍 | 首次探讨了饮食纤维中的菊粉对老年小鼠微胶质细胞功能的影响，并通过单细胞RNA测序和基因表达分析验证了其效果 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨饮食纤维对年龄相关微胶质细胞功能障碍的影响 | 成年和老年小鼠的微胶质细胞 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 成年和老年小鼠各若干只 |
| 862 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Integration Analysis Reveals the Correlation Between Mesenchymal Stromal Cells and Fibroblasts
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.798331
PMID:35360851
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了间充质干细胞与成纤维细胞之间的相关性 | 首次通过单细胞转录组测序数据整合分析，揭示了间充质干细胞与成纤维细胞之间的细胞亚群差异及其分子机制 | 研究仅限于人类脐带和包皮间充质干细胞以及骨髓和脂肪间充质干细胞的数据，可能需要更多样本类型以验证结果的普适性 | 探究间充质干细胞与成纤维细胞之间的细胞亚群差异及其分子机制 | 人类脐带和包皮间充质干细胞以及骨髓和脂肪间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 人类脐带和包皮间充质干细胞以及骨髓和脂肪间充质干细胞的单细胞转录组数据 |
| 863 | 2024-08-08 |
Cell Differentiation Trajectory in Liver Cirrhosis Predicts Hepatocellular Carcinoma Prognosis and Reveals Potential Biomarkers for Progression of Liver Cirrhosis to Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.858905
PMID:35360852
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研究论文 | 本研究利用单细胞分化轨迹分析探讨了肝硬化与肝细胞癌的相关性，并揭示了潜在的生物标志物。 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析肝硬化细胞分化轨迹，预测肝细胞癌的预后，并构建了基于CD34和RAMP3的预后风险评分签名。 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚和数据异质性。 | 探索肝硬化进展为肝细胞癌的分子机制，并寻找潜在的预后生物标志物。 | 肝硬化和肝细胞癌的单细胞RNA测序数据及临床数据。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）和The Cancer Genome Atlas（TCGA）的肝硬化和肝细胞癌样本数据。 |
| 864 | 2024-08-08 |
Single Cell Transcriptome Sequencing of Zebrafish Testis Revealed Novel Spermatogenesis Marker Genes and Stronger Leydig-Germ Cell Paracrine Interactions
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.851719
PMID:35360857
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了斑马鱼睾丸中的14,315个单细胞，揭示了新的精子发生标记基因及Leydig细胞与生殖细胞间的强旁分泌相互作用 | 首次在斑马鱼中应用单细胞RNA测序技术研究睾丸细胞组成及其基因调控，并发现了数千个细胞类型特异性新标记基因 | NA | 研究斑马鱼精子发生过程及其在人类不孕研究中的应用潜力 | 斑马鱼睾丸中的单细胞及其转录组 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 14,315个来自成年雄性斑马鱼睾丸的单细胞 |
| 865 | 2024-08-08 |
Identification of Prognosis Biomarkers for High-Grade Serous Ovarian Cancer Based on Stemness
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.861954
PMID:35360863
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA、UCSC Xena和GEO的批量RNA-Seq样本及单细胞RNA-Seq数据，识别高级别浆液性卵巢癌的干细胞标志物和生存相关标志物 | 采用新的分析流程结合批量RNA-Seq样本、mRNA表达型干细胞指数和单细胞数据，识别出171个关键基因和一种重要的癌症干细胞亚群 | NA | 探索卵巢癌中的干细胞群体并提供潜在的治疗建议 | 高级别浆液性卵巢癌 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 来自TCGA、UCSC Xena和GEO的癌症样本 |
| 866 | 2024-08-08 |
A Multi-Omics Pan-Cancer Analysis of 4EBP1 in Cancer Prognosis and Cancer-Associated Fibroblasts Infiltration
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.845751
PMID:35360872
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了4EBP1 mRNA、4EBP1蛋白及其磷酸化形式在泛癌中的预后价值及其与癌症相关成纤维细胞（CAFs）浸润的关系 | 首次系统分析了4EBP1及其磷酸化形式在泛癌中的表达与预后关系，并探讨了其与CAFs浸润的关联 | 研究主要基于TCGA数据库，可能存在样本选择偏倚；实验验证仅通过免疫组化染色进行，未进行更深入的功能验证 | 探究4EBP1在泛癌中的预后价值及其与CAFs浸润的关系 | 4EBP1 mRNA、4EBP1蛋白及其磷酸化形式在多种癌症中的表达与预后 | 数字病理学 | 泛癌 | 多组学分析、单细胞测序、免疫组化染色 | NA | mRNA、蛋白 | 基于TCGA项目的多种癌症样本 |
| 867 | 2024-08-08 |
Lactobacillus paracasei BD5115-Derived 2-Hydroxy-3-Methylbutyric Acid Promotes Intestinal Epithelial Cells Proliferation by Upregulating the MYC Signaling Pathway
2022, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2022.799053
PMID:35369066
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研究论文 | 本研究从人乳样本中分离出一株乳酸菌BD5115，并通过高脂饮食的小鼠模型证实其代谢物2-羟基-3-甲基丁酸促进肠道上皮细胞增殖，揭示了MAFF/MBP1相互作用介导的MYC信号通路调控机制。 | 本研究不仅筛选出一株能促进肠道上皮细胞增殖的菌株，还发现了一条新的信号通路，即MAFF/MBP1相互作用调控基因表达。 | 许多关于益生菌和益生元的研究仍局限于观察人体队列和动物表型，其分子机制有待进一步探索。 | 探索益生菌代谢物对健康的分子调控机制。 | 乳酸菌BD5115的代谢物及其对肠道上皮细胞增殖的影响。 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 868 | 2024-08-08 |
Pseudo-Temporal Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Reveals Trans-Differentiation Potential of Greater Epithelial Ridge Cells Into Hair Cells During Postnatal Development of Cochlea in Rats
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.832813
PMID:35370544
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了大鼠耳蜗基底膜在P1、P7和P14时期的基因表达图谱，揭示了耳蜗发育过程中大上皮嵴细胞向毛细胞的转分化潜力 | 首次通过单细胞轨迹分析揭示了大上皮嵴细胞的不同亚型在出生后能转分化为内毛细胞和外毛细胞 | NA | 阐明大上皮嵴细胞亚型向毛细胞转分化的关键调控基因和信号通路机制 | 大鼠耳蜗中的大上皮嵴细胞和毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠耳蜗基底膜在P1、P7和P14时期的细胞样本 |
| 869 | 2024-08-08 |
Comparison of Lung-Homing Receptor Expression and Activation Profiles on NK Cell and T Cell Subsets in COVID-19 and Influenza
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.834862
PMID:35371005
|
研究论文 | 本文比较了COVID-19和流感患者中NK细胞和T细胞亚群的肺归巢受体表达和激活特征 | 首次详细比较了COVID-19和流感患者中NK细胞和T细胞的肺归巢受体表达和激活特征 | NA | 研究COVID-19和流感患者中NK细胞和T细胞的肺归巢受体表达和激活特征 | COVID-19和流感患者的NK细胞和T细胞亚群 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 28色流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据，单细胞RNA测序数据 | NA |
| 870 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Pediatric Coeliac Disease Patients Suggests Potential Pre-Seroconversion Markers
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.843086
PMID:35371081
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了儿童乳糜泻患者外周血单个核细胞的基因表达，以寻找潜在的早期诊断标志物 | 首次利用单细胞RNA测序技术在乳糜泻患者中识别出疾病发生前和发生时的基因和通路变化，为早期诊断提供了新的潜在标志物 | 研究样本量较小，且仅限于儿童乳糜泻患者，结果的普遍性和适用性有待进一步验证 | 寻找乳糜泻的早期诊断标志物，以预防广泛的绒毛萎缩和严重症状及并发症 | 儿童乳糜泻患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11名儿童乳糜泻患者和10名匹配的对照个体的外周血单个核细胞样本 |
| 871 | 2024-08-08 |
Development of a dynamic network biomarkers method and its application for detecting the tipping point of prior disease development
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.02.019
PMID:35317238
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综述 | 本文综述了动态网络生物标志物（DNB）方法的进展，该方法通过利用不同类型的转录组数据，能够识别与疾病进展关键时间点相关的表达特征的动态变化 | DNB方法能够识别癌症和其他疾病发展过程中潜在的生物标志物，这些标志物在正常和关键阶段之间表现出有限的分子谱变化 | NA | 探讨DNB方法在识别癌症和其他疾病发展过程中的应用，以及其在早期检测和干预中的潜力 | 癌症和其他疾病的发展过程 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | 动态网络生物标志物方法 | 转录组数据 | NA |
| 872 | 2024-08-08 |
Analysis of transcribed sequences from young and mature zebrafish thrombocytes
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0264776
PMID:35320267
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了年轻和成熟斑马鱼血小板的转录序列，并比较了这两种细胞类型的转录组差异 | 首次进行了年轻和成熟斑马鱼血小板的比较转录组学研究，揭示了血小板成熟过程中的基因表达模式差异 | NA | 研究斑马鱼血小板功能和发育的机制，特别是血小板成熟过程中的基因表达差异 | 年轻和成熟斑马鱼血小板 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和成熟斑马鱼血小板中共表达9143个基因，其中年轻血小板特异表达397个基因，成熟血小板特异表达2153个基因 |
| 873 | 2024-08-08 |
A regulator of G protein signaling 5 marked subpopulation of vascular smooth muscle cells is lost during vascular disease
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0265132
PMID:35320283
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了健康动脉中血管平滑肌细胞的亚群及其在血管重塑中的作用 | 首次揭示了表达G蛋白信号调节因子5的血管平滑肌细胞亚群在健康动脉中的存在及其在血管稳态中的作用 | NA | 探究血管平滑肌细胞亚群在健康动脉中的存在及其在血管疾病中的变化 | 血管平滑肌细胞及其亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 874 | 2024-08-08 |
TIGIT Blockade Exerts Synergistic Effects on Microwave Ablation Against Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.832230
PMID:35320940
|
研究论文 | 本文研究了TIGIT阻断与微波消融（MWA）联合治疗结直肠癌（CRC）肝转移的效果。 | 首次证明了TIGIT阻断与MWA联合治疗在结直肠癌肝转移中的协同作用，并重塑了肿瘤微环境（TME）。 | NA | 探索TIGIT阻断与MWA联合治疗在结直肠癌肝转移中的治疗效果。 | 结直肠癌肝转移的小鼠模型。 | NA | 结直肠癌 | 微波消融（MWA）、流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
| 875 | 2024-08-08 |
Inferring Cell-type-specific Genes of Lung Cancer Based on Deep Learning
2022, Current gene therapy
IF:3.8Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习的方法，用于推断肺腺癌中特定细胞类型的基因表达 | 本文融合了图卷积网络（GCN）和卷积神经网络（CNN）来构建模型，以推断肺腺癌中8种细胞类型的特定基因 | 由于单细胞测序技术的不足，只能检测到一小部分基因表达 | 旨在充分探索不同细胞类型中所有基因的表达 | 肺腺癌中的特定细胞类型基因 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞测序技术 | GCN和CNN | 基因表达数据 | 大量细胞类型特异性基因的已知样本 |
| 876 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of Refractory Celiac Disease Demonstrates Inter- and Intra-Patient Aberrant Cell Heterogeneity
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.03.005
PMID:35338007
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术探讨了难治性乳糜泻II型（RCDII）中异常细胞的异质性 | 采用高维单细胞技术揭示了RCDII中异常细胞的肿瘤间和肿瘤内异质性 | NA | 旨在通过单细胞技术表征RCDII中的固有和适应性免疫系统 | RCDII患者的肠道和血液样本 | 数字病理学 | 乳糜泻 | 单细胞质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名RCDII患者和6名健康对照者的样本 |
| 877 | 2024-08-08 |
Molecular Characteristics and Distribution of Adult Human Corneal Immune Cell Types
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.798346
PMID:35280984
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成人角膜缘免疫细胞的分子特征和分布 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了角膜缘免疫细胞的转录组图谱 | 仅使用了三名健康捐赠者的样本，可能限制了结果的普遍性 | 探究成人角膜缘免疫细胞的分子特征及其在免疫反应中的作用 | 成人角膜缘的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 804个从三名健康捐赠者角膜缘纯化的造血细胞 |
| 878 | 2024-08-08 |
Identification of Distinct Immune Cell Subsets Associated With Asymptomatic Infection, Disease Severity, and Viral Persistence in COVID-19 Patients
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.812514
PMID:35281000
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研究论文 | 通过scRNA-seq技术结合深度分析独特的细胞表面标记物和差异表达基因，研究了COVID-19患者中与无症状感染、疾病严重程度和病毒持续性相关的76种不同细胞亚群 | 揭示了特定免疫细胞亚群与COVID-19不同临床表现之间的关系，并识别了与疾病严重程度和病毒持续性相关的细胞类型 | NA | 探究SARS-CoV-2感染中的细胞介导保护性和致病性免疫反应 | COVID-19患者的PBMC样本中的免疫细胞亚群 | NA | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 76种不同的细胞亚群 |
| 879 | 2024-08-08 |
Hemocyte Clusters Defined by scRNA-Seq in Bombyx mori: In Silico Analysis of Predicted Marker Genes and Implications for Potential Functional Roles
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.852702
PMID:35281044
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术分析了家蚕血细胞中的13个不同细胞簇，并讨论了这些细胞簇的标记基因及其潜在功能 | 采用scRNA-seq技术对家蚕血细胞进行高分辨率分析，揭示了血细胞亚型的分子复杂性和高度专业化功能 | 研究仅限于家蚕血细胞，尚未扩展到其他昆虫 | 通过scRNA-seq技术深入研究家蚕血细胞的亚型及其功能 | 家蚕血细胞及其亚型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 13个不同细胞簇的家蚕血细胞 |
| 880 | 2024-08-08 |
A Systematic Evaluation of Supervised Machine Learning Algorithms for Cell Phenotype Classification Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.836798
PMID:35281805
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研究论文 | 本研究系统评估了13种流行的监督机器学习算法在不同大小的单细胞RNA测序数据集上进行细胞表型分类的性能 | 首次系统性地研究了不同大小的单细胞RNA测序数据集上监督机器学习算法的性能 | 集成算法并未显示出比单个机器学习方法显著的优势 | 评估监督机器学习算法在单细胞RNA测序数据上进行细胞表型分类的性能 | 13种流行的监督机器学习算法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | ElasticNet, NaiveBayes, XGBoost, 线性判别分析 | 单细胞RNA测序数据 | 多种不同大小的真实和模拟数据集 |