本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2024-08-08 |
Multiscale Transcriptomic Integration Reveals B-Cell Depletion and T-Cell Mistrafficking in Nasopharyngeal Carcinoma Progression
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.857137
PMID:35433690
|
研究论文 | 本研究开发了一种新的计算框架,用于在鼻咽癌进展过程中进行多尺度转录组分析 | 提出了一个包含四个模块的计算框架,能够进行从单细胞、批量、微环境到队列尺度的转录组分析 | NA | 揭示鼻咽癌进展中的分子机制 | 鼻咽癌的转录组和免疫细胞变化 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 133个鼻咽癌或正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 842 | 2024-08-08 |
A scRNA-seq Approach to Identifying Changes in Spermatogonial Stem Cell Gene Expression Following in vitro Culture
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.782996
PMID:35433696
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,研究了体外培养对小鼠未分化精原干细胞基因表达的影响 | 首次描述了体外培养的精原干细胞中泛素化蛋白的显著积累 | NA | 探索体外培养对未分化精原干细胞基因表达的影响及其与再生能力下降的关系 | 小鼠的未分化精原干细胞 | 数字病理学 | 人类不育症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自成年小鼠睾丸的未分化精原干细胞与经过10周体外培养的细胞进行比较 | NA | NA | NA | NA |
| 843 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Immune Cells in Human Aortic Dissection Tissue Provides Insights Into Immune Cell Heterogeneity
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.791875
PMID:35433892
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类主动脉夹层组织中的免疫细胞异质性 | 首次全面描述了主动脉夹层组织中免疫细胞的异质性,特别是巨噬细胞和T细胞的作用 | NA | 揭示主动脉夹层中免疫细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 人类主动脉夹层组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 844 | 2024-08-08 |
Commentary: Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.868685
PMID:35444665
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 845 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Identifies the Heterogeneity of CD8+ T Cells and Novel Biomarker Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2022/8256314
PMID:35449866
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞亚群的异质性,并发现了新的生物标志物基因 | 本研究首次通过单细胞测序技术揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性,并发现了与生存和预后密切相关的四个差异基因 | NA | 揭示肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性,并发现新的生物标志物基因 | 肝细胞癌中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE149614数据集和来自TCGA数据库的TCGA-LIHC数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 846 | 2024-08-08 |
The Role of RNA-Binding Protein HuR in Lung Cancer by RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.813268
PMID:35450220
|
研究论文 | 本文通过RNA测序分析研究了RNA结合蛋白HuR在肺癌中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析了A549 HuR敲降细胞中的基因、蛋白质、mRNA和lncRNA变化,并评估了HuR在肺癌细胞增殖、迁移和侵袭中的作用 | 研究样本量较小,仅包括十名肺癌患者和十名良性肺疾病患者 | 探讨HuR在肺癌中的作用及其对肿瘤促进基因mRNA稳定性的影响 | 肺癌细胞A549中的HuR表达及其对细胞增殖、迁移和侵袭的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 20名患者(10名肺癌患者和10名良性肺疾病患者) | NA | NA | NA | NA |
| 847 | 2024-08-08 |
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Mesenchymal Stem/Stromal Cells Derived from Human Placenta
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.836887
PMID:35450295
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)技术,对从人类足月胎盘中提取的间充质干细胞/基质细胞(PMSCs)进行了综合分析 | 首次提供了PMSCs转录组和表观基因组特征的综合视图,揭示了免疫调节潜能和增殖相关基因的潜在调控元件 | NA | 深入理解PMSCs的细胞异质性,并为基于PMSC亚群的细胞治疗提供基础生物学见解 | 从人类足月胎盘提取的间充质干细胞/基质细胞(PMSCs) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) | NA | 转录组和表观基因组数据 | 从人类足月胎盘提取的PMSCs | NA | NA | NA | NA |
| 848 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Interaction of Injected ADSCs with Lung-Originated Cells in Mouse Pulmonary Fibrosis
2022, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2022/9483166
PMID:35450342
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了脂肪源性间充质干细胞(ADSCs)与小鼠肺纤维化模型中肺源性细胞的相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了ADSCs与肺源性细胞的相互作用及其对肺细胞转录组的影响 | NA | 阐明ADSCs在肺纤维化治疗中的作用机制 | ADSCs与肺源性细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用BLM诱导的小鼠肺纤维化模型和GFP标记的ADSCs进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 849 | 2024-08-08 |
Macrophages in the kidney in health, injury and repair
2022, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2022.01.005
PMID:35461656
|
研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在肾脏健康、损伤和修复中的作用 | 单细胞RNA测序揭示了先前未被重视的巨噬细胞表型谱,这些表型可能在损伤或修复中特异性地存在 | NA | 研究巨噬细胞在肾脏疾病中的作用及潜在的治疗策略 | 巨噬细胞在肾脏健康、损伤和修复中的角色 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 850 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and function of macrophages in the breast during homeostasis and cancer
2022, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2022.01.002
PMID:35461657
|
综述 | 本文综述了近年来利用命运图谱、成像和单细胞RNA测序技术对乳腺巨噬细胞在稳态及乳腺癌发展中的起源、异质性和功能的最新研究进展 | 利用新兴技术如命运图谱、成像和单细胞RNA测序技术,深入解析了乳腺巨噬细胞的异质性和功能 | NA | 旨在全面回顾研究乳腺健康组织和乳腺癌中巨噬细胞异质性的最新进展 | 乳腺巨噬细胞在稳态及乳腺癌发展中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 851 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of Nasal Polyps Reveals a More Pronounced Type 2 Transcriptomic Profile of Epithelial Cells and Mast Cells in Aspirin-Exacerbated Respiratory Disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.850494
PMID:35418991
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了鼻息肉中上皮细胞和肥大细胞的转录组特征,特别是在阿司匹林加重呼吸疾病患者中的表现 | 首次详细描述了阿司匹林不耐受患者鼻息肉中上皮细胞和肥大细胞的转录组差异,并揭示了这些细胞在疾病发病机制中的潜在作用 | 样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 探究鼻息肉中上皮细胞和肥大细胞在阿司匹林不耐受患者中的转录组特征及它们在疾病发病机制中的作用 | 鼻息肉中的上皮细胞和肥大细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名阿司匹林加重呼吸疾病患者和9名慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 | NA | NA | NA | NA |
| 852 | 2024-08-08 |
Discovery of Novel Circulating Immune Complexes in Lupus Nephritis Using Immunoproteomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.850015
PMID:35419005
|
研究论文 | 本研究通过免疫蛋白质组学方法,发现并验证了系统性红斑狼疮肾炎(LN)中的新型循环免疫复合物(ICx)作为潜在生物标志物。 | 本研究首次通过蛋白质A/G磁珠或C1q包被板捕获LN血清中的ICx,并利用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)和单细胞RNA测序(scRNA Seq)数据库筛选出潜在的ICx标志物。 | NA | 发现系统性红斑狼疮肾炎(LN)中的新型循环免疫复合物(ICx)作为潜在生物标志物。 | 系统性红斑狼疮肾炎(LN)患者的血清样本。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS),单细胞RNA测序(scRNA Seq) | NA | 蛋白质 | 验证队列包括62名LN患者和21名健康对照(HC)。 | NA | NA | NA | NA |
| 853 | 2024-08-08 |
Lipid Droplet-Related PLIN2 in CD68+ Tumor-Associated Macrophage of Oral Squamous Cell Carcinoma: Implications for Cancer Prognosis and Immunotherapy
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.824235
PMID:35372038
|
研究论文 | 本研究探讨了PLIN2在口腔鳞状细胞癌肿瘤相关巨噬细胞中的作用及其对癌症预后和免疫治疗的影响。 | 首次研究了PLIN2在肿瘤微环境中的异质性功能及其对免疫调节的影响。 | 本研究为回顾性研究,样本量有限,可能影响结果的普遍性。 | 研究PLIN2在口腔鳞状细胞癌中的表达及其对免疫微环境的影响。 | 口腔鳞状细胞癌样本中的PLIN2表达及其与免疫细胞的关系。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组化(IHC)、免疫荧光(IF)、单细胞测序 | NA | 组织样本 | 96个口腔鳞状细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 854 | 2024-08-08 |
Tenogenic Induction From Induced Pluripotent Stem Cells Unveils the Trajectory Towards Tenocyte Differentiation
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.780038
PMID:35372337
|
研究论文 | 本文开发了一种使用诱导多能干细胞(iPS细胞)的新型成纤维细胞诱导方法,并通过单细胞RNA测序揭示了成纤维细胞分化的轨迹 | 首次使用iPS细胞和单细胞RNA测序技术,揭示了成纤维细胞分化的详细过程和关键调控因子 | NA | 探索成纤维细胞的分化机制及其在肌肉骨骼系统中的作用 | 诱导多能干细胞(iPS细胞)和成纤维细胞的分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 11个不同的细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 855 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Cellular Diversity and Developmental Characteristics of the Retinas of an Infant and a Young Child
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.803466
PMID:35386199
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了婴儿和幼儿捐赠者的194,967个细胞,揭示了视网膜细胞的多样性和发育特征 | 首次构建了婴儿和幼儿的视网膜细胞图谱,并识别了发育过程中的关键分子 | NA | 解析视网膜细胞的异质性,理解视觉发育的机制 | 婴儿和幼儿的视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 194,967个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 856 | 2024-08-08 |
Characterization of Pyroptosis-Related Subtypes via RNA-Seq and ScRNA-Seq to Predict Chemo-Immunotherapy Response in Triple-Negative Breast Cancer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.788670
PMID:35386285
|
研究论文 | 本研究通过RNA-Seq和scRNA-Seq技术,基于焦亡相关特征对三阴性乳腺癌患者进行亚型分类,并预测其对化疗-免疫治疗的反应 | 首次通过焦亡相关特征对三阴性乳腺癌进行亚型分类,并构建了Ps-score评分系统来预测患者的治疗反应和生存率 | 需要进一步的临床试验来验证Ps-score评分系统在实际治疗中的应用效果 | 筛选可靠的免疫治疗相关生物标志物,预测三阴性乳腺癌患者的治疗反应和生存率 | 三阴性乳腺癌患者及其对化疗-免疫治疗的反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-Seq, scRNA-Seq | LASSO, COX回归分析 | 基因表达数据 | 119名三阴性乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 857 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Cultured Amniotic Fluid Cells Reveals Complex Gene Expression Alterations in Human Fetuses With Trisomy 18
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.825345
PMID:35392164
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析培养的羊水细胞,揭示了患有爱德华兹综合征(三体18)的人类胎儿中复杂的基因表达改变 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别了六个细胞群及其在主要组织发育中的功能,并发现了与三体18表型可能相关的新基因区域 | NA | 阐明三体18异常的复杂性 | 培养的羊水细胞 | 数字病理学 | 三体18 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个正常和三个三体18样本 | NA | NA | NA | NA |
| 858 | 2024-08-08 |
Construction of Bone Metastasis-Specific Regulation Network Based on Prognostic Stemness-Related Signatures in Prostate Cancer
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/8495923
PMID:35392496
|
研究论文 | 本研究旨在揭示前列腺癌中的癌症干细胞相关基因及其在前列腺癌转移中的潜在机制 | 通过RNA-seq数据和多种生物信息学分析方法,构建了前列腺癌骨转移特异性的调控网络,并探索了潜在的机制和治疗靶点 | NA | 揭示前列腺癌中的癌症干细胞相关基因及其在前列腺癌转移中的潜在机制 | 前列腺癌中的癌症干细胞相关基因及其在前列腺癌转移中的潜在机制 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, ChIP-seq, 单细胞测序 | WGCNA, 一类别逻辑回归(OCLR) | mRNA | 406名前列腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 859 | 2024-08-08 |
Identification of Neuronal Cells in Sciatic Nerves of Adult Rats
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.816814
PMID:35401123
|
研究论文 | 本文通过全装染色和光学成像技术,在成年大鼠的坐骨神经中发现了不规则分布的神经细胞,并通过免疫组化证据和单细胞测序技术,证实这些细胞中包含成熟的神经元和神经干细胞样细胞 | 首次在成年大鼠的坐骨神经中发现神经细胞的存在,并证实这些细胞中包含神经干细胞样细胞,这些细胞在坐骨神经中能够增殖 | NA | 探究成年大鼠坐骨神经中神经细胞的身份及其特性 | 成年大鼠的坐骨神经中的神经细胞 | NA | NA | 全装染色、光学成像、免疫组化、单细胞测序 | NA | 图像 | 成年大鼠的坐骨神经样本 | NA | NA | NA | NA |
| 860 | 2024-08-08 |
Using a Gene Network of Pyroptosis to Quantify the Responses to Immunotherapy and Prognosis for Neuroblastoma Patients
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.845757
PMID:35401536
|
研究论文 | 本研究通过整合四个神经母细胞瘤数据集,利用24个与细胞焦亡相关的基因的mRNA表达谱进行鲁棒聚类,构建了一种名为pyroscore的新评分方法,用于量化神经母细胞瘤中的细胞焦亡水平,并评估其对免疫检查点治疗反应的预测能力。 | 本研究首次构建了一种新的评分方法pyroscore,用于量化神经母细胞瘤中的细胞焦亡水平,并评估其对免疫检查点治疗反应的预测能力。 | NA | 研究细胞焦亡相关基因网络在神经母细胞瘤中的作用,以及其对免疫检查点阻断治疗反应和预后的量化能力。 | 神经母细胞瘤及其对免疫检查点阻断治疗的反应和预后。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达谱 | 四个神经母细胞瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |