单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
841	2024-08-08	Single-Cell RNA-Seq Reveals the Cellular Diversity and Developmental Characteristics of the Retinas of an Infant and a Young Child 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.803466 PMID:35386199	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了婴儿和幼儿捐赠者的194,967个细胞，揭示了视网膜细胞的多样性和发育特征	首次构建了婴儿和幼儿的视网膜细胞图谱，并识别了发育过程中的关键分子	NA	解析视网膜细胞的异质性，理解视觉发育的机制	婴儿和幼儿的视网膜细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞	194,967个细胞
842	2024-08-08	Characterization of Pyroptosis-Related Subtypes via RNA-Seq and ScRNA-Seq to Predict Chemo-Immunotherapy Response in Triple-Negative Breast Cancer 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.788670 PMID:35386285	研究论文	本研究通过RNA-Seq和scRNA-Seq技术，基于焦亡相关特征对三阴性乳腺癌患者进行亚型分类，并预测其对化疗-免疫治疗的反应	首次通过焦亡相关特征对三阴性乳腺癌进行亚型分类，并构建了Ps-score评分系统来预测患者的治疗反应和生存率	需要进一步的临床试验来验证Ps-score评分系统在实际治疗中的应用效果	筛选可靠的免疫治疗相关生物标志物，预测三阴性乳腺癌患者的治疗反应和生存率	三阴性乳腺癌患者及其对化疗-免疫治疗的反应	数字病理学	乳腺癌	RNA-Seq, scRNA-Seq	LASSO, COX回归分析	基因表达数据	119名三阴性乳腺癌患者
843	2024-08-08	Single-Cell Transcriptomics of Cultured Amniotic Fluid Cells Reveals Complex Gene Expression Alterations in Human Fetuses With Trisomy 18 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.825345 PMID:35392164	研究论文	本研究利用单细胞转录组学分析培养的羊水细胞，揭示了患有爱德华兹综合征（三体18）的人类胎儿中复杂的基因表达改变	本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了六个细胞群及其在主要组织发育中的功能，并发现了与三体18表型可能相关的新基因区域	NA	阐明三体18异常的复杂性	培养的羊水细胞	数字病理学	三体18	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	两个正常和三个三体18样本
844	2024-08-08	Construction of Bone Metastasis-Specific Regulation Network Based on Prognostic Stemness-Related Signatures in Prostate Cancer 2022, Disease markers DOI:10.1155/2022/8495923 PMID:35392496	研究论文	本研究旨在揭示前列腺癌中的癌症干细胞相关基因及其在前列腺癌转移中的潜在机制	通过RNA-seq数据和多种生物信息学分析方法，构建了前列腺癌骨转移特异性的调控网络，并探索了潜在的机制和治疗靶点	NA	揭示前列腺癌中的癌症干细胞相关基因及其在前列腺癌转移中的潜在机制	前列腺癌中的癌症干细胞相关基因及其在前列腺癌转移中的潜在机制	数字病理学	前列腺癌	RNA-seq, ChIP-seq, 单细胞测序	WGCNA, 一类别逻辑回归(OCLR)	mRNA	406名前列腺癌患者
845	2024-08-08	Identification of Neuronal Cells in Sciatic Nerves of Adult Rats 2022, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2 DOI:10.3389/fncel.2022.816814 PMID:35401123	研究论文	本文通过全装染色和光学成像技术，在成年大鼠的坐骨神经中发现了不规则分布的神经细胞，并通过免疫组化证据和单细胞测序技术，证实这些细胞中包含成熟的神经元和神经干细胞样细胞	首次在成年大鼠的坐骨神经中发现神经细胞的存在，并证实这些细胞中包含神经干细胞样细胞，这些细胞在坐骨神经中能够增殖	NA	探究成年大鼠坐骨神经中神经细胞的身份及其特性	成年大鼠的坐骨神经中的神经细胞	NA	NA	全装染色、光学成像、免疫组化、单细胞测序	NA	图像	成年大鼠的坐骨神经样本
846	2024-08-08	Using a Gene Network of Pyroptosis to Quantify the Responses to Immunotherapy and Prognosis for Neuroblastoma Patients 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.845757 PMID:35401536	研究论文	本研究通过整合四个神经母细胞瘤数据集，利用24个与细胞焦亡相关的基因的mRNA表达谱进行鲁棒聚类，构建了一种名为pyroscore的新评分方法，用于量化神经母细胞瘤中的细胞焦亡水平，并评估其对免疫检查点治疗反应的预测能力。	本研究首次构建了一种新的评分方法pyroscore，用于量化神经母细胞瘤中的细胞焦亡水平，并评估其对免疫检查点治疗反应的预测能力。	NA	研究细胞焦亡相关基因网络在神经母细胞瘤中的作用，以及其对免疫检查点阻断治疗反应和预后的量化能力。	神经母细胞瘤及其对免疫检查点阻断治疗的反应和预后。	数字病理学	神经母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	mRNA表达谱	四个神经母细胞瘤数据集
847	2024-08-08	Single-Cell Profiling Reveals Heterogeneity of Primary and Lymph Node Metastatic Tumors and Immune Cell Populations and Discovers Important Prognostic Significance of CCDC43 in Oral Squamous Cell Carcinoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.843322 PMID:35401551	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了口腔鳞状细胞癌（OSCC）原发和淋巴结转移肿瘤及其免疫细胞群体的异质性，并发现了CCDC43在OSCC中的重要预后意义	首次揭示了OSCC原发和转移部位的肿瘤免疫微环境（TIME）异质性，并发现了CCDC43作为独立预后因子的重要性	NA	探讨口腔鳞状细胞癌的免疫学研究，并为未来的药物发现提供重要资源	口腔鳞状细胞癌的原发和淋巴结转移肿瘤及其免疫细胞群体	数字病理学	口腔鳞状细胞癌	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	NA
848	2024-08-08	Proteomic and Single-Cell Transcriptomic Dissection of Human Plasmacytoid Dendritic Cell Response to Influenza Virus 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.814627 PMID:35401570	研究论文	本文通过LC-MS/MS和单细胞RNA测序技术，全面分析了人浆细胞样树突状细胞（pDCs）在未受刺激和流感病毒H1N1刺激下的蛋白质组和转录组变化	首次报道了pDCs在生理刺激下的全面无偏蛋白质组分析，并结合单细胞RNA测序技术揭示了pDCs在刺激后的高度特化功能	NA	研究pDCs在流感病毒刺激下的分子特征和功能变化	人浆细胞样树突状细胞（pDCs）及其在流感病毒刺激下的反应	数字病理学	NA	LC-MS/MS，单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	蛋白质组数据，转录组数据	NA
849	2024-08-08	Cellular Interaction Analysis Characterizing Immunosuppressive Microenvironment Functions in MM Tumorigenesis From Precursor Stages 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.844604 PMID:35401705	研究论文	研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了从健康状态到多发性骨髓瘤（MM）过程中骨髓免疫微环境的细胞间相互作用变化	首次详细描述了在MM发展过程中，免疫微环境中细胞间相互作用事件（CCEs）的失调及其对治疗反应和临床结果的影响	研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能需要更多实验验证来支持发现	揭示多发性骨髓瘤（MM）发展过程中免疫微环境的改变及其对治疗反应的影响	健康骨髓和三种疾病状态（MGUS、SMM、MM）的骨髓中的细胞间相互作用	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	包括健康状态的正常骨髓（NBM）和三种疾病状态（MGUS、SMM、MM）的样本
850	2024-08-08	Ferroptosis-associated molecular classification characterized by distinct tumor microenvironment profiles in colorectal cancer 2022, International journal of biological sciences IF:8.2Q1 DOI:10.7150/ijbs.69808 PMID:35342352	研究论文	本研究通过综合分析转录组学、基因组学和单细胞转录组数据，揭示了结直肠癌中与铁死亡相关的分子分类及其与肿瘤微环境的关系	首次识别出三种与铁死亡相关的簇（FAC1、FAC2和FAC3），并发现它们与不同的临床结果和生物学途径相关	NA	探讨铁死亡相关基因在免疫调节和肿瘤微环境形成中的潜在作用	结直肠癌中的铁死亡相关模式	数字病理学	结直肠癌	转录组学、基因组学、单细胞转录组分析	NA	转录组数据	1251个结直肠癌样本
851	2024-08-08	Antibody-Oligonucleotide Conjugation Using a SPAAC Copper-Free Method Compatible with 10× Genomics' Single-Cell RNA-Seq 2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-2160-8_6 PMID:35344168	研究论文	本文介绍了一种无铜点击化学方法用于生成抗体-寡核苷酸复合物，并展示了其在10×基因组学液滴法单细胞RNA测序工作流程中的应用	提出了一种无铜点击化学方法，用于高效且成本效益地结合蛋白质组学和转录组学分析	NA	开发一种新的方法，用于在单细胞分析中结合细胞表面蛋白质组数据和基因表达分析	抗体-寡核苷酸复合物及其在单细胞RNA测序中的应用	基因组学	NA	无铜点击化学	NA	RNA-seq	NA
852	2024-08-08	Methods to Analyze the Developmental Trajectory of Human Primary NK Cells Using Monocle and SCENIC Analyses 2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-2160-8_7 PMID:35344169	研究论文	本文描述了使用Monocle和SCENIC分析方法来分析人类原代NK细胞发育轨迹的单细胞RNA测序和生物信息学分析策略	开发了独特的方法来确定人类NK细胞的转录组特征，并提供了数据分析路线图	NA	旨在更好地理解人类NK细胞亚群的单细胞转录组及其在临床治疗中的应用	人类原代NK细胞及其在抗肿瘤和抗病毒效应功能中的作用	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	人类外周血中NK细胞占淋巴细胞总数的10-20%
853	2024-08-08	Methods for Isolating and Defining Single-Cell Transcriptomes of Tissue-Resident Human NK Cells 2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-2160-8_8 PMID:35344170	研究论文	本文提供了分离和分析组织驻留人NK细胞单细胞转录组的方法	使用单细胞RNA测序技术，提高了细胞异质性的分辨率，并更好地理解了细胞间的相互作用	目前对组织驻留NK细胞的发育、归巢和功能了解不足，限制了特定器官临床治疗的发展	定义组织驻留NK细胞的转录组特征和转录调控	组织驻留人NK细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	NA
854	2024-08-08	Bioinformatics Analysis Combined With Experiments Predicts PUDP as a Potential Prognostic Biomarker for Hepatocellular Carcinoma Through Its Interaction With Tumor Microenvironment 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.830174 PMID:35350563	研究论文	本研究通过生物信息学分析结合实验，预测PUDP作为肝细胞癌的潜在预后生物标志物，并通过其与肿瘤微环境的相互作用进行验证	首次揭示PUDP在肝细胞癌中的潜在致癌作用及其与免疫细胞浸润和免疫检查点表达的正相关性	研究主要基于生物信息学分析和有限的实验验证，需要进一步的临床试验验证	探索PUDP作为肝细胞癌预后生物标志物的潜在作用及其与肿瘤微环境的关系	PUDP在肝细胞癌中的表达及其与肿瘤微环境和免疫治疗反应的关系	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	15对肝细胞癌和正常邻近组织样本
855	2024-08-08	Upregulation of MTA1 in Colon Cancer Drives A CD8+ T Cell-Rich But Classical Macrophage-Lacking Immunosuppressive Tumor Microenvironment 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.825783 PMID:35350571	研究论文	本研究探讨了MTA1蛋白在结直肠癌中的上调如何影响肿瘤微环境，特别是肿瘤相关巨噬细胞和细胞毒性T淋巴细胞的作用	首次揭示了MTA1在结直肠癌中通过调节肿瘤相关巨噬细胞影响肿瘤微环境的机制	NA	阐明MTA1在结直肠癌肿瘤微环境中的调控作用及其对细胞毒性T淋巴细胞抗肿瘤效应的影响	MTA1蛋白、肿瘤相关巨噬细胞、细胞毒性T淋巴细胞	数字病理学	结直肠癌	免疫组化染色、流式细胞术、生物信息学分析	NA	组织、细胞	结直肠癌组织阵列、HCT116细胞、TCGA结直肠癌队列和单细胞RNA测序数据
856	2024-08-08	Metabolic Landscape of Bronchoalveolar Lavage Fluid in Coronavirus Disease 2019 at Single Cell Resolution 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.829760 PMID:35350779	研究论文	本文通过重新分析单细胞RNA测序数据中的代谢相关基因谱，描绘了冠状病毒病2019患者支气管肺泡灌洗液免疫细胞的代谢景观，并阐明了可能导致COVID-19进展和细胞因子风暴的代谢重塑机制	本文首次揭示了COVID-19患者免疫细胞中增强的糖酵解是最重要的共同代谢特征，并识别了CCL2 T细胞、高SPP1表达的2组巨噬细胞和髓样树突状细胞是感染肺组织产生细胞因子风暴的主要贡献者	NA	阐明COVID-19患者免疫细胞的代谢特征及其在疾病进展和细胞因子风暴中的作用	冠状病毒病2019患者的支气管肺泡灌洗液免疫细胞	数字病理学	冠状病毒病2019	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
857	2024-08-08	Molecular Characterization of Differentiated-Resistance MSC Subclones by Single-Cell Transcriptomes 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.699144 PMID:35356283	研究论文	本文通过单细胞转录组分析，研究了间充质干细胞（MSCs）中分化抵抗亚克隆的分子特征及其在肿瘤发生中的作用	首次在单细胞水平上揭示了分化抵抗的间充质干细胞（DR-MSCs）与肿瘤启动细胞的相似性，并探讨了YAP1信号通路在其中的作用	NA	探讨间充质干细胞中分化抵抗亚克隆的分子机制及其在肿瘤发生中的作用	间充质干细胞（MSCs）的分化抵抗亚克隆	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	56个临床队列
858	2024-08-08	Single-Cell RNA Sequencing Revealed a 3-Gene Panel Predicted the Diagnosis and Prognosis of Thyroid Papillary Carcinoma and Associated With Tumor Immune Microenvironment 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.862313 PMID:35359404	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）筛选甲状腺乳头状癌（PTC）的预后相关基因，并基于TCGA-THCA数据构建诊断和预后模型，评估肿瘤免疫微环境与预后模型的关联。	本研究首次通过scRNA-seq技术筛选出与PTC预后相关的三个基因（FN1, CLU, ANXA1），并构建了基于这些基因的诊断和预后模型，同时探讨了肿瘤免疫微环境与预后模型的关联。	本研究主要基于公共数据库和TCGA-THCA数据进行分析，需要进一步的临床验证来证实模型的准确性和实用性。	筛选甲状腺乳头状癌的预后相关基因，构建诊断和预后模型，并评估肿瘤免疫微环境与预后模型的关联。	甲状腺乳头状癌（PTC）及其免疫微环境。	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	20例肿瘤组织及相邻正常组织
859	2024-08-08	Chicken Peripheral Blood Mononuclear Cells Response to Avian Leukosis Virus Subgroup J Infection Assessed by Single-Cell RNA Sequencing 2022, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2022.800618 PMID:35359721	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了感染禽白血病病毒J亚群的鸡外周血单个核细胞的反应	首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了鸡外周血单个核细胞在禽白血病病毒J亚群感染后的细胞亚群及其分子和细胞特征	NA	旨在确定鸡外周血单个核细胞的亚群及其在禽白血病病毒J亚群感染后的特定分子和细胞特征	鸡外周血单个核细胞在禽白血病病毒J亚群感染后的反应	数字病理学	禽病	单细胞RNA测序	NA	RNA	感染和未感染禽白血病病毒J亚群的鸡的外周血单个核细胞
860	2024-08-08	Integrated Analysis Highlights the Immunosuppressive Role of TREM2+ Macrophages in Hepatocellular Carcinoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.848367 PMID:35359989	研究论文	本研究系统分析了人类肝细胞癌组织中的单细胞转录组，发现TREM2主要由肿瘤组织中富集的脂质相关巨噬细胞亚群表达，并探讨了其在肝细胞癌中的免疫抑制作用。	首次系统揭示了TREM2在肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫抑制作用，并阐明了其与不良临床预后的关联。	研究主要基于单细胞转录组分析和免疫组化，未来需更多体内外实验验证TREM2 LAM-like细胞的具体功能和机制。	探讨TREM2信号在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用及其对患者预后的影响。	肝细胞癌组织中的TREM2+巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的作用。	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	涉及多个肝细胞癌患者组织的单细胞转录组数据