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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2024-08-08 |
Large-Scale Single-Cell and Bulk Sequencing Analyses Reveal the Prognostic Value and Immune Aspects of CD147 in Pan-Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.810471
PMID:35464411
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研究论文 | 本研究系统分析了CD147在31种癌症类型中的预后价值和免疫特性 | 首次全面探讨了CD147在多种癌症类型中的表达及其与免疫浸润、免疫检查点分子和新生抗原水平的关系 | NA | 探讨CD147在肿瘤发生中的机制及其在多种癌症类型中的预后价值和免疫特性 | CD147在31种癌症类型中的表达水平、突变景观及其与免疫特征的关系 | 数字病理学 | 多种癌症类型 | 单细胞测序、批量测序、多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、免疫特征数据 | 31种癌症类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 822 | 2024-08-08 |
Natural Killer Cells in Multiple Sclerosis: Entering the Stage
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.869447
PMID:35464427
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综述 | 本文综述了自然杀伤细胞(NK细胞)在多发性硬化症(MS)中的作用及其在MS免疫病理学中的研究进展 | 利用现代无假设技术如单细胞转录组学揭示了NK细胞的异质性,模糊了适应性和先天免疫之间的界限 | NA | 探讨NK细胞在多发性硬化症中的作用及其作为预测工具和治疗目标的潜力 | 自然杀伤细胞在多发性硬化症中的作用 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 823 | 2024-08-08 |
Deconvolution of Adult T-Cell Leukemia/Lymphoma With Single-Cell RNA-Seq Using Frozen Archived Skin Tissue Reveals New Subset of Cancer-Associated Fibroblast
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.856363
PMID:35464471
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)的冷冻保存皮肤组织,揭示了癌症相关成纤维细胞的新亚型 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术在ATLL的肿瘤微环境中发现了一种新的癌症相关成纤维细胞亚型,该亚型富含表皮生长因子受体(EGFR)相关转录本 | 研究受限于临床环境中新鲜组织的获取难度 | 探索成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)在单细胞水平上的分子通路激活情况及肿瘤微环境与肿瘤细胞间的细胞间通讯 | 成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)的冷冻保存皮肤组织 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 824 | 2024-08-08 |
Dissecting chicken germ cell dynamics by combining a germ cell tracing transgenic chicken model with single-cell RNA sequencing
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.03.040
PMID:35465157
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研究论文 | 本文通过结合转基因鸡胚胎模型和单细胞RNA测序技术,研究了鸡生殖细胞发育过程中的动态转录景观 | 首次使用了一种新的生殖细胞追踪方法来监测和分离不同发育阶段的鸡生殖细胞,并揭示了性别特异性的发育阶段和轨迹 | NA | 揭示鸡生殖细胞发育过程中的动态转录景观 | 鸡生殖细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | 转基因鸡胚胎模型 | RNA | 4,752个雄性和13,028个雌性生殖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 825 | 2024-08-08 |
The use of base editing technology to characterize single nucleotide variants
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.03.031
PMID:35465164
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综述 | 本文综述了碱基编辑技术在单核苷酸变异(SNVs)特性研究中的应用及其潜力 | 探讨了碱基编辑技术与单细胞RNA测序结合的可能性,以加速该领域进展,并强调了其在非欧洲人群遗传机制研究中的潜在应用 | 当前研究主要集中在欧洲人群,其他人群的遗传特征机制研究不足 | 加速单核苷酸变异与特定疾病表型的关联研究,并扩展到非欧洲人群 | 单核苷酸变异及其对人类基因组的影响 | NA | NA | 碱基编辑技术 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 826 | 2024-08-08 |
Digital Spatial Profiling Reveals Functional Shift of Enterochromaffin Cell in Patients With Ulcerative Colitis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.841090
PMID:35465329
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研究论文 | 本研究利用数字空间分析技术,探讨了肠嗜铬细胞在溃疡性结肠炎患者中的功能转变 | 首次通过数字空间分析技术揭示了肠嗜铬细胞在溃疡性结肠炎中的功能转变,包括蛋白质合成能力的增强和新免疫功能的获得 | 研究样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 探究肠嗜铬细胞在溃疡性结肠炎中的功能变化 | 肠嗜铬细胞及其他上皮细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 数字空间分析 | NA | 转录组数据 | 8名溃疡性结肠炎患者和7名健康对照者的结肠镜活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 827 | 2024-08-08 |
Synergy of single-cell sequencing analyses and in vivo lineage-tracing approaches: A new opportunity for stem cell biology
2022, Biocell : official journal of the Sociedades Latinoamericanas de Microscopia Electronica ... et. al
IF:0.8Q4
DOI:10.32604/biocell.2022.018960
PMID:35475293
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研究论文 | 本文讨论了单细胞测序分析与体内谱系追踪方法在干细胞生物学中的潜在协同作用 | 结合单细胞测序技术和谱系追踪方法,更清晰地定义干细胞的分化路径 | 目前难以定义“干细胞”群体内的微异质性 | 探讨单细胞测序分析与谱系追踪方法在干细胞生物学中的应用 | 干细胞及其分化路径 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 828 | 2024-08-08 |
Contact-Dependent Granzyme B-Mediated Cytotoxicity of Th17-Polarized Cells Toward Human Oligodendrocytes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.850616
PMID:35479072
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研究论文 | 研究了人类CD4 T细胞介导的少突胶质细胞死亡的机制,发现Th17极化细胞通过释放granzyme B对少突胶质细胞产生直接毒性 | 首次揭示了Th17极化细胞与少突胶质细胞的生物学显著接触,并通过释放granzyme B产生直接毒性 | NA | 探讨多发性硬化症中Th17细胞对少突胶质细胞的毒性机制 | 人类CD4 T细胞和少突胶质细胞 | NA | 多发性硬化症 | 荧光和明场活体成像、单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光 | NA | 细胞 | 使用了人类原代少突胶质细胞和人类少突胶质细胞系MO3.13 | NA | NA | NA | NA |
| 829 | 2024-08-08 |
The Establishment and Experimental Verification of an lncRNA-Derived CD8+ T Cell Infiltration ceRNA Network in Colorectal Cancer
2022, Clinical Medicine Insights. Oncology
DOI:10.1177/11795549221092218
PMID:35479766
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研究论文 | 本研究旨在探讨长非编码RNA(lncRNA)在结直肠癌(CRC)中调控CD8+ T细胞功能的潜在机制 | 成功构建了一个针对结直肠癌中lncRNA介导的CD8+ T细胞浸润的竞争性内源RNA(ceRNA)网络,并发现LINC00657可能是结直肠癌免疫逃逸的关键因素 | NA | 揭示lncRNA在结直肠癌中调控CD8+ T细胞功能的机制 | lncRNA、CD8+ T细胞、结直肠癌 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、qPCR | NA | RNA序列数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas(TCGA)和Gene Expression Omnibus(GEO)数据库的批量RNA-seq、miRNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 830 | 2024-08-08 |
Establishment of a Prognostic Model of Lung Adenocarcinoma Based on Tumor Heterogeneity
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.807497
PMID:35480896
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研究论文 | 本研究旨在基于肺腺癌(LUAD)的异质性识别独立预后基因,生成预后风险评分模型,并结合其他病理特征构建诺模图以预测患者的总体生存(OS) | 本研究首次基于肺腺癌的异质性建立了预后风险评分模型,并发现高风险患者对免疫检查点阻断疗法更敏感 | NA | 建立一个基于肺腺癌异质性的预后模型,以指导临床实践 | 肺腺癌(LUAD)患者的预后 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),RNA测序(RNA-seq),体细胞突变分析 | 风险评分模型,诺模图 | 基因数据 | 大量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 831 | 2024-08-08 |
A Reproducible and Dynamic Workflow for Analysis and Annotation of scRNA-Seq Data
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2281-0_10
PMID:35486243
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研究论文 | 本文介绍了一种可重复且动态的工作流程,用于单细胞RNA测序(scRNA-Seq)数据的预处理、基因丰度量化以及细胞的可视化和注释 | 提出了一种可重复且动态的工作流程,用于处理和分析scRNA-Seq数据 | NA | 开发一种用于scRNA-Seq数据分析和注释的工作流程 | scRNA-Seq数据 | 基因组学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 832 | 2024-08-08 |
Complete Transcriptome Analysis by 5'-End Single-Cell RNA-Seq with Random Priming
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2281-0_11
PMID:35486244
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研究论文 | 本文介绍了一种使用随机引物在Fluidigm C1™平台上进行单细胞5'端转录组分析的方法 | 该方法能够检测单细胞分辨率下的转录起始位点(TSS),提供更全面的基因调控元件概览,包括非多聚腺苷酸RNA和增强子RNA活性 | NA | 实现完整的转录组分析 | 单细胞5'端转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每次运行可从单个样本中分离和处理多达96个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 833 | 2024-08-08 |
Identifying luminal and basal mammary cell specific genes and their expression patterns during pregnancy
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0267211
PMID:35486595
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据深入分析了未怀孕和怀孕小鼠乳腺上皮细胞,以探索乳腺祖细胞或其后代分化为管腔细胞和肌上皮细胞的机制 | 本研究采用蒙特卡洛特征选择和增量特征选择曲线,结合支持向量机或RIPPER算法,找到了能够将上皮细胞分为不同亚型和阶段的优化基因特征和规则 | NA | 探索乳腺祖细胞或其后代分化为管腔细胞和肌上皮细胞的机制 | 未怀孕和怀孕小鼠的乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 支持向量机 | 基因表达数据 | 未怀孕和怀孕小鼠的乳腺上皮细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 834 | 2024-08-08 |
Transcriptional Regulation of Early T-Lymphocyte Development in Thymus
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.884569
PMID:35432347
|
综述 | 本文综述了过去十年中参与T细胞早期发育的转录调控因子,并探讨了这些因子在T细胞发育过程中的级联网络及未来可能的研究方向 | 使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)等先进技术,深入研究T细胞发育过程中的转录调控因子 | NA | 总结T细胞早期发育中的转录调控因子,并探讨未来的研究方向 | T细胞在胸腺中的早期发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 835 | 2024-08-08 |
SLAMF8 Participates in Acute Renal Transplant Rejection via TLR4 Pathway on Pro-Inflammatory Macrophages
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.846695
PMID:35432371
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研究论文 | 本研究通过分析急性肾移植排斥反应患者的微阵列数据,构建基因网络并识别与排斥反应相关的关键基因和信号通路 | 首次揭示了SLAMF8通过TLR4途径在促炎性巨噬细胞中参与急性肾移植排斥反应的机制 | NA | 探索急性肾移植排斥反应中的关键基因和信号通路,为治疗提供新的靶点 | 急性肾移植排斥反应患者和非急性排斥反应患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 微阵列分析 | WGCNA | 基因表达数据 | 15名急性排斥反应患者和37名非急性排斥反应患者 | NA | NA | NA | NA |
| 836 | 2024-08-08 |
Multiscale Transcriptomic Integration Reveals B-Cell Depletion and T-Cell Mistrafficking in Nasopharyngeal Carcinoma Progression
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.857137
PMID:35433690
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研究论文 | 本研究开发了一种新的计算框架,用于在鼻咽癌进展过程中进行多尺度转录组分析 | 提出了一个包含四个模块的计算框架,能够进行从单细胞、批量、微环境到队列尺度的转录组分析 | NA | 揭示鼻咽癌进展中的分子机制 | 鼻咽癌的转录组和免疫细胞变化 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 133个鼻咽癌或正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 837 | 2024-08-08 |
A scRNA-seq Approach to Identifying Changes in Spermatogonial Stem Cell Gene Expression Following in vitro Culture
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.782996
PMID:35433696
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,研究了体外培养对小鼠未分化精原干细胞基因表达的影响 | 首次描述了体外培养的精原干细胞中泛素化蛋白的显著积累 | NA | 探索体外培养对未分化精原干细胞基因表达的影响及其与再生能力下降的关系 | 小鼠的未分化精原干细胞 | 数字病理学 | 人类不育症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自成年小鼠睾丸的未分化精原干细胞与经过10周体外培养的细胞进行比较 | NA | NA | NA | NA |
| 838 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Immune Cells in Human Aortic Dissection Tissue Provides Insights Into Immune Cell Heterogeneity
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.791875
PMID:35433892
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类主动脉夹层组织中的免疫细胞异质性 | 首次全面描述了主动脉夹层组织中免疫细胞的异质性,特别是巨噬细胞和T细胞的作用 | NA | 揭示主动脉夹层中免疫细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 人类主动脉夹层组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 839 | 2024-08-08 |
Commentary: Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.868685
PMID:35444665
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 840 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Identifies the Heterogeneity of CD8+ T Cells and Novel Biomarker Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2022/8256314
PMID:35449866
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞亚群的异质性,并发现了新的生物标志物基因 | 本研究首次通过单细胞测序技术揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性,并发现了与生存和预后密切相关的四个差异基因 | NA | 揭示肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性,并发现新的生物标志物基因 | 肝细胞癌中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE149614数据集和来自TCGA数据库的TCGA-LIHC数据集 | NA | NA | NA | NA |