单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2024-08-08 |
A Reproducible and Dynamic Workflow for Analysis and Annotation of scRNA-Seq Data
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2281-0_10
PMID:35486243
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研究论文 | 本文介绍了一种可重复且动态的工作流程，用于单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据的预处理、基因丰度量化以及细胞的可视化和注释 | 提出了一种可重复且动态的工作流程，用于处理和分析scRNA-Seq数据 | NA | 开发一种用于scRNA-Seq数据分析和注释的工作流程 | scRNA-Seq数据 | 基因组学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 822 | 2024-08-08 |
Complete Transcriptome Analysis by 5'-End Single-Cell RNA-Seq with Random Priming
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2281-0_11
PMID:35486244
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研究论文 | 本文介绍了一种使用随机引物在Fluidigm C1™平台上进行单细胞5'端转录组分析的方法 | 该方法能够检测单细胞分辨率下的转录起始位点（TSS），提供更全面的基因调控元件概览，包括非多聚腺苷酸RNA和增强子RNA活性 | NA | 实现完整的转录组分析 | 单细胞5'端转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每次运行可从单个样本中分离和处理多达96个细胞 |
| 823 | 2024-08-08 |
Identifying luminal and basal mammary cell specific genes and their expression patterns during pregnancy
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0267211
PMID:35486595
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据深入分析了未怀孕和怀孕小鼠乳腺上皮细胞，以探索乳腺祖细胞或其后代分化为管腔细胞和肌上皮细胞的机制 | 本研究采用蒙特卡洛特征选择和增量特征选择曲线，结合支持向量机或RIPPER算法，找到了能够将上皮细胞分为不同亚型和阶段的优化基因特征和规则 | NA | 探索乳腺祖细胞或其后代分化为管腔细胞和肌上皮细胞的机制 | 未怀孕和怀孕小鼠的乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 支持向量机 | 基因表达数据 | 未怀孕和怀孕小鼠的乳腺上皮细胞样本 |
| 824 | 2024-08-08 |
Transcriptional Regulation of Early T-Lymphocyte Development in Thymus
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.884569
PMID:35432347
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综述 | 本文综述了过去十年中参与T细胞早期发育的转录调控因子，并探讨了这些因子在T细胞发育过程中的级联网络及未来可能的研究方向 | 使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）等先进技术，深入研究T细胞发育过程中的转录调控因子 | NA | 总结T细胞早期发育中的转录调控因子，并探讨未来的研究方向 | T细胞在胸腺中的早期发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | NA | RNA | NA |
| 825 | 2024-08-08 |
SLAMF8 Participates in Acute Renal Transplant Rejection via TLR4 Pathway on Pro-Inflammatory Macrophages
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.846695
PMID:35432371
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研究论文 | 本研究通过分析急性肾移植排斥反应患者的微阵列数据，构建基因网络并识别与排斥反应相关的关键基因和信号通路 | 首次揭示了SLAMF8通过TLR4途径在促炎性巨噬细胞中参与急性肾移植排斥反应的机制 | NA | 探索急性肾移植排斥反应中的关键基因和信号通路，为治疗提供新的靶点 | 急性肾移植排斥反应患者和非急性排斥反应患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 微阵列分析 | WGCNA | 基因表达数据 | 15名急性排斥反应患者和37名非急性排斥反应患者 |
| 826 | 2024-08-08 |
Multiscale Transcriptomic Integration Reveals B-Cell Depletion and T-Cell Mistrafficking in Nasopharyngeal Carcinoma Progression
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.857137
PMID:35433690
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研究论文 | 本研究开发了一种新的计算框架，用于在鼻咽癌进展过程中进行多尺度转录组分析 | 提出了一个包含四个模块的计算框架，能够进行从单细胞、批量、微环境到队列尺度的转录组分析 | NA | 揭示鼻咽癌进展中的分子机制 | 鼻咽癌的转录组和免疫细胞变化 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 133个鼻咽癌或正常样本 |
| 827 | 2024-08-08 |
A scRNA-seq Approach to Identifying Changes in Spermatogonial Stem Cell Gene Expression Following in vitro Culture
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.782996
PMID:35433696
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，研究了体外培养对小鼠未分化精原干细胞基因表达的影响 | 首次描述了体外培养的精原干细胞中泛素化蛋白的显著积累 | NA | 探索体外培养对未分化精原干细胞基因表达的影响及其与再生能力下降的关系 | 小鼠的未分化精原干细胞 | 数字病理学 | 人类不育症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自成年小鼠睾丸的未分化精原干细胞与经过10周体外培养的细胞进行比较 |
| 828 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Immune Cells in Human Aortic Dissection Tissue Provides Insights Into Immune Cell Heterogeneity
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.791875
PMID:35433892
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类主动脉夹层组织中的免疫细胞异质性 | 首次全面描述了主动脉夹层组织中免疫细胞的异质性，特别是巨噬细胞和T细胞的作用 | NA | 揭示主动脉夹层中免疫细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 人类主动脉夹层组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 829 | 2024-08-08 |
Commentary: Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.868685
PMID:35444665
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 830 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Identifies the Heterogeneity of CD8+ T Cells and Novel Biomarker Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2022/8256314
PMID:35449866
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞亚群的异质性，并发现了新的生物标志物基因 | 本研究首次通过单细胞测序技术揭示了肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性，并发现了与生存和预后密切相关的四个差异基因 | NA | 揭示肝细胞癌中CD8+ T细胞的异质性，并发现新的生物标志物基因 | 肝细胞癌中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE149614数据集和来自TCGA数据库的TCGA-LIHC数据集 |
| 831 | 2024-08-08 |
The Role of RNA-Binding Protein HuR in Lung Cancer by RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.813268
PMID:35450220
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研究论文 | 本文通过RNA测序分析研究了RNA结合蛋白HuR在肺癌中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析了A549 HuR敲降细胞中的基因、蛋白质、mRNA和lncRNA变化，并评估了HuR在肺癌细胞增殖、迁移和侵袭中的作用 | 研究样本量较小，仅包括十名肺癌患者和十名良性肺疾病患者 | 探讨HuR在肺癌中的作用及其对肿瘤促进基因mRNA稳定性的影响 | 肺癌细胞A549中的HuR表达及其对细胞增殖、迁移和侵袭的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 20名患者（10名肺癌患者和10名良性肺疾病患者） |
| 832 | 2024-08-08 |
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Mesenchymal Stem/Stromal Cells Derived from Human Placenta
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.836887
PMID:35450295
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）技术，对从人类足月胎盘中提取的间充质干细胞/基质细胞（PMSCs）进行了综合分析 | 首次提供了PMSCs转录组和表观基因组特征的综合视图，揭示了免疫调节潜能和增殖相关基因的潜在调控元件 | NA | 深入理解PMSCs的细胞异质性，并为基于PMSC亚群的细胞治疗提供基础生物学见解 | 从人类足月胎盘提取的间充质干细胞/基质细胞（PMSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组和表观基因组数据 | 从人类足月胎盘提取的PMSCs |
| 833 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Interaction of Injected ADSCs with Lung-Originated Cells in Mouse Pulmonary Fibrosis
2022, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2022/9483166
PMID:35450342
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了脂肪源性间充质干细胞（ADSCs）与小鼠肺纤维化模型中肺源性细胞的相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了ADSCs与肺源性细胞的相互作用及其对肺细胞转录组的影响 | NA | 阐明ADSCs在肺纤维化治疗中的作用机制 | ADSCs与肺源性细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用BLM诱导的小鼠肺纤维化模型和GFP标记的ADSCs进行实验 |
| 834 | 2024-08-08 |
Macrophages in the kidney in health, injury and repair
2022, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2022.01.005
PMID:35461656
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在肾脏健康、损伤和修复中的作用 | 单细胞RNA测序揭示了先前未被重视的巨噬细胞表型谱，这些表型可能在损伤或修复中特异性地存在 | NA | 研究巨噬细胞在肾脏疾病中的作用及潜在的治疗策略 | 巨噬细胞在肾脏健康、损伤和修复中的角色 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 835 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and function of macrophages in the breast during homeostasis and cancer
2022, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2022.01.002
PMID:35461657
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综述 | 本文综述了近年来利用命运图谱、成像和单细胞RNA测序技术对乳腺巨噬细胞在稳态及乳腺癌发展中的起源、异质性和功能的最新研究进展 | 利用新兴技术如命运图谱、成像和单细胞RNA测序技术，深入解析了乳腺巨噬细胞的异质性和功能 | NA | 旨在全面回顾研究乳腺健康组织和乳腺癌中巨噬细胞异质性的最新进展 | 乳腺巨噬细胞在稳态及乳腺癌发展中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 836 | 2024-08-08 |
IL-17 Producing Lymphocytes Cause Dry Eye and Corneal Disease With Aging in RXRα Mutant Mouse
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.849990
PMID:35402439
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研究论文 | 研究RXRα突变小鼠中IL-17相关机制在干眼病发展中的作用 | 首次揭示了RXRα在抑制干眼病诱导的IL-17产生淋巴细胞生成中的作用，并识别RXRα作为干眼病的潜在治疗靶点 | NA | 探讨IL-17相关机制在RXRα突变小鼠干眼病发展中的作用 | RXRα突变小鼠的干眼病症状及IL-17产生淋巴细胞 | NA | 干眼病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术，共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据 | Pinkie小鼠与野生型C57BL/6小鼠的比较研究 |
| 837 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of Nasal Polyps Reveals a More Pronounced Type 2 Transcriptomic Profile of Epithelial Cells and Mast Cells in Aspirin-Exacerbated Respiratory Disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.850494
PMID:35418991
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了鼻息肉中上皮细胞和肥大细胞的转录组特征，特别是在阿司匹林加重呼吸疾病患者中的表现 | 首次详细描述了阿司匹林不耐受患者鼻息肉中上皮细胞和肥大细胞的转录组差异，并揭示了这些细胞在疾病发病机制中的潜在作用 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究鼻息肉中上皮细胞和肥大细胞在阿司匹林不耐受患者中的转录组特征及它们在疾病发病机制中的作用 | 鼻息肉中的上皮细胞和肥大细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名阿司匹林加重呼吸疾病患者和9名慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 |
| 838 | 2024-08-08 |
Discovery of Novel Circulating Immune Complexes in Lupus Nephritis Using Immunoproteomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.850015
PMID:35419005
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研究论文 | 本研究通过免疫蛋白质组学方法，发现并验证了系统性红斑狼疮肾炎（LN）中的新型循环免疫复合物（ICx）作为潜在生物标志物。 | 本研究首次通过蛋白质A/G磁珠或C1q包被板捕获LN血清中的ICx，并利用液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）和单细胞RNA测序（scRNA Seq）数据库筛选出潜在的ICx标志物。 | NA | 发现系统性红斑狼疮肾炎（LN）中的新型循环免疫复合物（ICx）作为潜在生物标志物。 | 系统性红斑狼疮肾炎（LN）患者的血清样本。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS），单细胞RNA测序（scRNA Seq） | NA | 蛋白质 | 验证队列包括62名LN患者和21名健康对照（HC）。 |
| 839 | 2024-08-08 |
Lipid Droplet-Related PLIN2 in CD68+ Tumor-Associated Macrophage of Oral Squamous Cell Carcinoma: Implications for Cancer Prognosis and Immunotherapy
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.824235
PMID:35372038
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研究论文 | 本研究探讨了PLIN2在口腔鳞状细胞癌肿瘤相关巨噬细胞中的作用及其对癌症预后和免疫治疗的影响。 | 首次研究了PLIN2在肿瘤微环境中的异质性功能及其对免疫调节的影响。 | 本研究为回顾性研究，样本量有限，可能影响结果的普遍性。 | 研究PLIN2在口腔鳞状细胞癌中的表达及其对免疫微环境的影响。 | 口腔鳞状细胞癌样本中的PLIN2表达及其与免疫细胞的关系。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组化(IHC)、免疫荧光(IF)、单细胞测序 | NA | 组织样本 | 96个口腔鳞状细胞癌样本 |
| 840 | 2024-08-08 |
Tenogenic Induction From Induced Pluripotent Stem Cells Unveils the Trajectory Towards Tenocyte Differentiation
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.780038
PMID:35372337
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研究论文 | 本文开发了一种使用诱导多能干细胞（iPS细胞）的新型成纤维细胞诱导方法，并通过单细胞RNA测序揭示了成纤维细胞分化的轨迹 | 首次使用iPS细胞和单细胞RNA测序技术，揭示了成纤维细胞分化的详细过程和关键调控因子 | NA | 探索成纤维细胞的分化机制及其在肌肉骨骼系统中的作用 | 诱导多能干细胞（iPS细胞）和成纤维细胞的分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 11个不同的细胞集群 |