单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2024-08-08 |
Prioritizing Autism Risk Genes using Personalized Graphical Models Estimated from Single Cell RNA-seq Data
2022, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2021.1933495
PMID:35529781
|
研究论文 | 本文通过个性化基因相互作用图谱，利用单细胞RNA测序数据，识别与自闭症相关的风险基因 | 提出了一种新的方法，通过分析已知自闭症风险基因的连接，利用个性化基因相互作用图谱来识别更多的自闭症风险基因 | 需要进一步的功能研究来验证这些基因的相关性 | 识别更多的自闭症风险基因 | 自闭症风险基因及其在个性化基因相互作用图谱中的连接 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 每个个体的细胞数量从891到1241不等，分析了1500个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 802 | 2024-08-08 |
Ulcerative Colitis: Novel Epithelial Insights Provided by Single Cell RNA Sequencing
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.868508
PMID:35530046
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在溃疡性结肠炎中对上皮细胞转录组景观的研究 | 单细胞RNA测序技术揭示了与溃疡性结肠炎发病机制相关的细胞亚群，并提供了连接基因组与病理的新途径 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在溃疡性结肠炎中的应用及其对上皮细胞转录组的新发现 | 溃疡性结肠炎中的上皮细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 803 | 2024-08-08 |
Characterization of Immunogenicity of Malignant Cells with Stemness in Intrahepatic Cholangiocarcinoma by Single-Cell RNA Sequencing
2022, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2022/3558200
PMID:35530414
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了肝内胆管癌（iCCA）中具有干细胞特性的恶性细胞的免疫原性 | 首次揭示了肝内胆管癌中高干细胞特性恶性细胞的免疫逃避机制 | NA | 研究肝内胆管癌中癌症干细胞的免疫原性及其与干细胞特性的关系 | 肝内胆管癌中的恶性细胞 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 804 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Analyses Revealed Heterogeneity and Dynamic Changes of Metabolic Pathways in Astrocytes at the Acute Phase of Ischemic Stroke
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1817721
PMID:35535357
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了缺血性中风急性期星形胶质细胞代谢途径的异质性和动态变化 | 本研究首次通过单细胞测序技术，比较了短暂性大脑中动脉闭塞后12小时和24小时的星形胶质细胞的细胞表型和动态变化 | NA | 研究缺血性中风急性期星形胶质细胞的特征变化及其在神经保护中的潜在作用 | 星形胶质细胞在缺血性中风急性期的代谢途径异质性和动态变化 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠皮质样本在短暂性大脑中动脉闭塞后12小时和24小时 | NA | NA | NA | NA |
| 805 | 2024-08-08 |
Multi-scale integrative analyses identify THBS2+ cancer-associated fibroblasts as a key orchestrator promoting aggressiveness in early-stage lung adenocarcinoma
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.69590
PMID:35547750
|
研究论文 | 本研究通过多尺度综合分析，揭示了THBS2+癌症相关成纤维细胞在早期肺腺癌中的关键作用，促进其侵袭性 | 首次在多组学水平上验证了THBS2作为早期肺腺癌的独立预后标志物，并揭示了THBS2+癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的具体作用机制 | NA | 旨在识别和验证早期肺腺癌中促进侵袭性表型的分子基础 | 早期肺腺癌样本及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、分泌组数据和空间组数据 | 多个独立临床队列的早期肺腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 806 | 2024-08-08 |
Identify the Prognostic and Immune Profile of VSIR in the Tumor Microenvironment: A Pan-Cancer Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.821649
PMID:35493077
|
研究论文 | 本研究系统探讨了VSIR在33种癌症肿瘤微环境中的预后和免疫特征 | 首次全面分析了VSIR在多种癌症中的表达模式及其与肿瘤免疫的关系，并预测了针对VSIR的敏感药物和免疫治疗价值 | NA | 探讨VSIR在肿瘤微环境中的预后和免疫特征 | VSIR在33种癌症肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序分析，免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 33种癌症的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 807 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Metastatic Testicular Seminoma Reveals the Cellular and Molecular Characteristics of Metastatic Cell Lineage
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.871489
PMID:35494058
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了转移性睾丸精原细胞瘤的细胞和分子特征 | 首次构建了转移性睾丸精原细胞瘤的单细胞图谱，并发现了特定表达的分子标记 | 研究样本仅来自单一患者，可能限制了结果的普遍性 | 揭示睾丸精原细胞瘤，特别是转移性肿瘤细胞的分子特征 | 转移性睾丸精原细胞瘤的细胞和分子特征 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 共18,206个高质量单细胞转录组信息 | NA | NA | NA | NA |
| 808 | 2024-08-08 |
A Regularized Multi-Task Learning Approach for Cell Type Detection in Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.788832
PMID:35495159
|
研究论文 | 本文提出了一种基于正则化多任务学习（RMTL）的框架，用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型检测 | 该方法通过同时学习与特定细胞类型相关的亚群，简化了在每个集群中寻找潜在标记基因的繁琐过程 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型预测的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型检测 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 正则化多任务学习 | RNA测序数据 | 使用了从单细胞RNA测序实验构建的参考数据进行训练，并应用于查询数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 809 | 2024-08-08 |
Identification of Neutrophil-Related Factor LCN2 for Predicting Severity of Patients With Influenza A Virus and SARS-CoV-2 Infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.854172
PMID:35495713
|
研究论文 | 本研究旨在探索与流感A病毒和SARS-CoV-2感染严重程度相关的免疫相关宿主因子，特别是中性粒细胞相关的LCN2因子 | 发现LCN2在中性粒细胞中显著上调，并与疾病严重程度正相关，为预测和治疗流感A病毒及SARS-CoV-2感染的严重病例提供了新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探索与流感A病毒和SARS-CoV-2感染严重程度相关的免疫相关宿主因子和核心生物标志物 | 流感A病毒和SARS-CoV-2感染患者 | 数字病理学 | 流感 | 酶联免疫吸附试验（ELISA） | NA | 单细胞转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 810 | 2024-08-08 |
Proximal and Distal Regions of Pathogenic Th17 Related Chromatin Loci Are Sequentially Accessible During Pathogenicity of Th17
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.864314
PMID:35514969
|
研究论文 | 本文研究了致病性Th17相关染色质位点的近端和远端区域的染色质可及性，并探讨了其在Th17致病性中的作用 | 首次全面比较了致病性Th17和常规调节性Th17的染色质可及性，并发现致病性Th17特异的染色质可及区域（patho-ChARs）在TSS近端区域有显著分布偏好 | NA | 揭示致病性Th17生成的新调控机制，为自身免疫疾病治疗提供新思路 | 致病性Th17和常规调节性Th17的染色质可及性 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 染色质可及性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 811 | 2024-08-08 |
Mapping Breast Cancer Microenvironment Through Single-Cell Omics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.868813
PMID:35514975
|
综述 | 本文综述了乳腺癌微环境的最新研究，特别是通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术分析不同细胞类型的异质性和空间位置 | 讨论了新型单细胞组学技术如多组学联合分析模式和深度学习网络架构对乳腺癌免疫微环境未来研究的影响 | 对乳腺癌微环境的复杂性仍有许多未知之处，特别是微环境细胞的独特模式及其在发病机制中的支持作用尚未充分评估 | 提供对乳腺癌微环境的更全面认识，并为临床分类、诊断和治疗提供注释 | 乳腺癌微环境中的不同细胞类型，包括T细胞、B细胞、巨噬细胞/单核细胞、中性粒细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 812 | 2024-08-08 |
Single-Cell Characterization of Hepatic CD8+ T Cells in a Murine Model of Primary Biliary Cholangitis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.860311
PMID:35514982
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了在小鼠原发性胆管炎模型中肝内CD8+ T细胞的功能异质性 | 首次在小鼠原发性胆管炎模型中详细描述了肝内CD8 T细胞亚群的发育和分化轨迹 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 阐明肝内免疫细胞在人类和实验性原发性胆管炎发病机制中的重要作用 | 肝内CD8+ T细胞及其在原发性胆管炎发病机制中的作用 | NA | 原发性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了dnTGFβRII小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 813 | 2024-08-08 |
Accurate Machine Learning Model to Diagnose Chronic Autoimmune Diseases Utilizing Information From B Cells and Monocytes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.870531
PMID:35515003
|
研究论文 | 本研究利用大规模公开的单细胞RNA测序数据，通过数据集整合和细胞间相互作用分析，建立了一个无偏随机森林机器学习模型，用于区分系统性红斑狼疮患者和健康捐赠者，并能准确识别类风湿关节炎和多发性硬化症患者。 | 本研究首次利用单细胞RNA测序数据和机器学习模型，不仅区分系统性红斑狼疮患者和健康捐赠者，还能准确识别其他慢性自身免疫疾病患者。 | NA | 开发一个高效的机器学习模型，用于准确诊断慢性自身免疫疾病。 | 系统性红斑狼疮、类风湿关节炎和多发性硬化症患者。 | 机器学习 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林 | RNA测序数据 | 3.1 × 10 PBMCs来自十五名系统性红斑狼疮患者和八名健康捐赠者，3.8 × 10 PBMCs来自二十八名系统性红斑狼疮患者和八名健康捐赠者，以及688个样本的bulk RNA-seq数据。 | NA | NA | NA | NA |
| 814 | 2024-08-08 |
Identification of Cell Subpopulations and Interactive Signaling Pathways From a Single-Cell RNA Sequencing Dataset in Osteosarcoma: A Comprehensive Bioinformatics Analysis
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.853979
PMID:35515114
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据集对骨肉瘤进行综合生物信息学分析，识别了细胞亚群及其相互作用信号通路 | 首次探索了骨肉瘤中的单细胞RNA测序数据集，揭示了11种聚类细胞类型及其在原发、转移和复发骨肉瘤中的新型细胞间相互作用 | NA | 阐明骨肉瘤发展的分子机制 | 骨肉瘤组织中的细胞亚群及其相互作用信号通路 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11个骨肉瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 815 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human Corpus Cavernosum Reveals Cellular Heterogeneity Landscapes in Erectile Dysfunction
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.874915
PMID:35518933
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了严重勃起功能障碍（ED）患者的人体海绵体组织中的细胞异质性 | 首次在单细胞水平上揭示了ED患者人体海绵体组织中的细胞类型异质性及其基因表达特征 | 研究样本量较小，仅包括三名患者，未来研究需扩大样本量以验证结果的普遍性 | 评估严重ED患者人体海绵体组织中细胞种群的多样性 | 人体海绵体组织中的细胞种群 | 数字病理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名患者的阴茎组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 816 | 2024-08-08 |
A Bayesian factorization method to recover single-cell RNA sequencing data
2022-01-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100133
PMID:35474868
|
研究论文 | 本文介绍了一种贝叶斯分解方法Bfimpute，用于恢复单细胞RNA测序数据中的缺失事件 | Bfimpute算法通过重建潜在的基因和细胞矩阵来填补最终的基因表达矩阵，无需细胞类型标签或批量数据，且能灵活整合用户提供的基因或细胞相关信息 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的矩阵完成问题，提高数据恢复的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯分解 | 基因表达矩阵 | 数万个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 817 | 2024-08-08 |
Single-Cell Profiling of Tumor Microenvironment Heterogeneity in Osteosarcoma Identifies a Highly Invasive Subcluster for Predicting Prognosis
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.732862
PMID:35463309
|
研究论文 | 本研究通过综合分析骨肉瘤单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA-seq数据，识别了肿瘤细胞与非肿瘤细胞之间的细胞通讯，并揭示了骨肉瘤微环境中的复杂调控网络 | 发现与肺转移密切相关的骨肉瘤细胞亚群，并建立了能够准确评估患者转移风险和预后的BCDEG风险回归模型 | NA | 评估和预测骨肉瘤转移的风险，提高诊断和治疗策略 | 骨肉瘤的肿瘤微环境异质性及其与转移的关系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 风险回归模型 | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 818 | 2024-08-08 |
Integrating Bulk Transcriptome and Single-Cell RNA Sequencing Data Reveals the Landscape of the Immune Microenvironment in Thoracic Aortic Aneurysms
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.846421
PMID:35463756
|
研究论文 | 本研究利用多个胸主动脉瘤（TAA）数据集（微阵列数据和单细胞RNA测序数据）以及多种免疫相关算法（ssGSEA、CIBERSORT和Seurat）揭示了TAA中免疫微环境的景观 | 首次综合利用批量转录组和单细胞RNA测序数据，全面评估了胸主动脉瘤中免疫细胞组成及细胞间通信 | NA | 阐明免疫细胞浸润在胸主动脉瘤发病机制中的作用 | 胸主动脉瘤中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个胸主动脉瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 819 | 2024-08-08 |
Endoplasmic Reticulum Stress Mediates Renal Tubular Vacuolation in BK Polyomavirus-Associated Nephropathy
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.834187
PMID:35464062
|
研究论文 | 本研究探讨了BK多瘤病毒引起的细胞质空泡化的分子机制，并寻找潜在的药物再利用目标 | 首次揭示了内质网应激在BK多瘤病毒相关肾病中的作用，并通过单细胞RNA测序和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析确定了潜在的治疗药物 | NA | 探索BK多瘤病毒引起的细胞质空泡化的分子机制，寻找潜在的药物再利用目标 | BK多瘤病毒相关肾病中的肾小管细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括多个基因表达数据集和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 820 | 2024-08-08 |
Pathological Osteoclasts and Precursor Macrophages in Inflammatory Arthritis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.867368
PMID:35464401
|
综述 | 本文综述了在炎症性关节炎中，利用单细胞RNA测序和双光子显微镜等新技术，研究巨噬细胞及其分化成的病理性破骨细胞在关节炎症和骨质破坏中的作用 | 应用单细胞RNA测序和双光子显微镜技术，首次鉴定出与关节炎相关的具有破骨生成能力的巨噬细胞亚群（AtoMs），并实时观察了其在滑膜微环境中的动态变化 | NA | 探讨新技术如何帮助更好地理解巨噬细胞在炎症性关节炎中的作用，特别是破骨细胞生成在滑膜-骨交界面的作用 | 巨噬细胞及其分化成的破骨细胞在炎症性关节炎中的作用 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、双光子显微镜 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |