单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2024-08-08 |
scEFSC: Accurate single-cell RNA-seq data analysis via ensemble consensus clustering based on multiple feature selections
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.04.023
PMID:35615016
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研究论文 | 本文提出了一种基于多特征选择的集成共识聚类方法scEFSC，用于准确分析单细胞RNA测序数据 | scEFSC算法采用多种无监督特征选择方法去除对单细胞RNA测序数据贡献不大的基因，并通过加权元聚类组合不同聚类算法的结果，提高了聚类性能 | 文章未明确提及现有方法的具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据分析中的数值不稳定、高维度和计算可扩展性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | RNA测序数据 | 14个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 782 | 2024-08-08 |
Landscape of Peripheral Blood Mononuclear Cells and Soluble Factors in Severe COVID-19 Patients With Pulmonary Fibrosis Development
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.831194
PMID:35558069
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研究论文 | 研究探讨了严重COVID-19患者外周血单个核细胞和可溶性因子在肺纤维化发展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析了严重COVID-19患者中CD4+激活T细胞和Treg细胞的频率变化，并探讨了IFN应答基因及相关信号通路在肺纤维化进展中的作用 | 研究样本量较小，仅包括12名患者 | 探究免疫反应在COVID-19患者肺纤维化进展中的作用 | 严重COVID-19患者的外周血单个核细胞和可溶性因子 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 12名严重COVID-19患者 |
| 783 | 2024-08-08 |
Dissecting Intra-Tumoral Changes Following Immune Checkpoint Blockades in Intrahepatic Cholangiocarcinoma via Single-Cell Analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.871769
PMID:35558087
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术，探讨了免疫检查点阻断剂在肝内胆管癌中的肿瘤内变化。 | 发现了免疫检查点阻断剂治疗后肝内胆管癌中细胞间通信网络的紧密化，以及通过PGF-VEGFR1介导的VEGF信号的新兴作用。 | 研究样本量相对较小，仅基于10名患者的单细胞RNA测序数据。 | 旨在通过单细胞水平分析，揭示免疫检查点阻断剂在肝内胆管癌中的肿瘤生态系统变化。 | 肝内胆管癌患者在接受免疫检查点阻断剂治疗后的肿瘤生态系统变化。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 10名肝内胆管癌患者的单细胞RNA测序数据，255名患者的批量RNA测序数据，264份切除的肝内胆管癌样本的双重免疫荧光染色数据 |
| 784 | 2024-08-08 |
Robust Colonic Epithelial Regeneration and Amelioration of Colitis via FZD-Specific Activation of Wnt Signaling
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.05.003
PMID:35569814
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研究论文 | 本文研究了通过FZD特异性激活Wnt信号通路来实现结肠上皮再生和改善结肠炎的方法 | 开发了FZD5/8和LRP6受体特异性的Wnt模拟物SZN-1326-p，能有效修复受损的结肠上皮并减少炎症 | NA | 探索通过调节Wnt信号通路来治疗炎症性肠病中的上皮损伤 | 结肠上皮细胞和炎症性肠病模型 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用右旋糖酐硫酸钠小鼠模型进行实验 |
| 785 | 2024-08-08 |
Immunophenotyping of Acute Inflammatory Exacerbations of Lung Injury Driven by Mutant Surfactant Protein-C: A Role for Inflammatory Eosinophils
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.875887
PMID:35571100
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研究论文 | 本研究利用临床相关模型，研究了突变型表面活性蛋白C引发的急性炎症加重期间，嗜酸性粒细胞与肺实质的相互作用及其在肺纤维化中的作用。 | 通过单细胞测序分析和遗传学方法，揭示了嗜酸性粒细胞在肺纤维化前炎症事件中的有害作用，并证明了皮质类固醇治疗在高度嗜酸性粒细胞性加重中的有效性。 | NA | 研究嗜酸性粒细胞在肺纤维化前急性炎症加重中的作用及皮质类固醇治疗的效果。 | 嗜酸性粒细胞、肺纤维化、皮质类固醇治疗。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞测序分析、流式细胞术 | NA | 细胞、组织 | 控制组和突变型SP-C模型小鼠，以及SP-CGATA1模型小鼠，时间跨度为7-42天。 |
| 786 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing and Its Applications in Liver Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.857037
PMID:35574365
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review | 本文介绍了单细胞测序技术及其在肝癌中的应用 | 单细胞测序技术能够检测癌细胞间的异质性，区分肿瘤微环境中的每个细胞亚群，并揭示癌细胞的克隆特征 | 讨论了该领域目前面临的一些挑战 | 理解肿瘤的演化 | 肝癌的癌细胞异质性、肿瘤微环境、癌变和转移机制 | digital pathology | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 787 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Liver Cancer: Hype or Insights?
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.04.014
PMID:35577269
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肝细胞癌（HCC）研究中的最新发现及其在解析HCC复杂生态系统中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的分辨率来表征HCC的潜在发病机制和异质性 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在HCC研究中的应用及其在个性化医学时代的转化应用 | 肝细胞癌的肿瘤微环境及其细胞层面的主要特征，包括恶性细胞、不同类型的免疫细胞及细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 788 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Uncovered the Involvement of an Endothelial Subset in Neutrophil Recruitment in Chemically Induced Rat Pulmonary Inflammation
2022, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.67806
PMID:35582423
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了化学诱导的大鼠肺部炎症中内皮细胞亚群在嗜中性粒细胞招募中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了肺部炎症的复杂过程，并鉴定了参与嗜中性粒细胞招募的促炎性内皮细胞亚群 | NA | 探索慢性炎症促进肺部肿瘤发生的分子和细胞基础 | 化学诱导的大鼠肺部炎症中的细胞类型和基因表达模式 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 化学处理和对照组大鼠中鉴定了14种细胞类型 |
| 789 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of transcriptomic changes during in vitro maturation of human oocytes
2022 Jan-Dec, Reproductive medicine and biology
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/rmb2.12464
PMID:35582522
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了体外成熟人卵母细胞的基因表达谱，以揭示其分子机制 | 首次在单细胞水平上研究了人卵母细胞体外成熟过程中的转录组变化，并揭示了可能调控卵母细胞成熟的分子途径和上游调节因子 | 样本量较小，仅涉及11名患者的19个卵母细胞 | 探讨体外成熟人卵母细胞的分子机制 | 人卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19个卵母细胞来自11名患者 |
| 790 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis Based on Public Databases for Constructing a Metastasis-Related Prognostic Model for Gastric Cancer
2022, Applied bionics and biomechanics
IF:1.8Q3
DOI:10.1155/2022/7061263
PMID:35528539
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研究论文 | 本研究利用TCGA和GEO数据库中的转录组和单细胞测序数据，分析了转移性和非转移性胃癌中免疫细胞的差异基因表达，并构建了一个与转移相关的胃癌预后模型。 | 本研究构建了一个新的胃癌预后模型，并筛选出了一个潜在的胃癌疫苗候选基因PTPN6。 | 研究主要依赖于公共数据库中的数据，可能存在样本选择偏倚和数据质量问题。 | 探索胃癌的免疫微环境，并为胃癌的治疗提供新的思路。 | 胃癌患者的预后预测和潜在疫苗基因的筛选。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的数据集GSE62254 |
| 791 | 2024-08-08 |
Prioritizing Autism Risk Genes using Personalized Graphical Models Estimated from Single Cell RNA-seq Data
2022, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2021.1933495
PMID:35529781
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研究论文 | 本文通过个性化基因相互作用图谱，利用单细胞RNA测序数据，识别与自闭症相关的风险基因 | 提出了一种新的方法，通过分析已知自闭症风险基因的连接，利用个性化基因相互作用图谱来识别更多的自闭症风险基因 | 需要进一步的功能研究来验证这些基因的相关性 | 识别更多的自闭症风险基因 | 自闭症风险基因及其在个性化基因相互作用图谱中的连接 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 每个个体的细胞数量从891到1241不等，分析了1500个基因 |
| 792 | 2024-08-08 |
Ulcerative Colitis: Novel Epithelial Insights Provided by Single Cell RNA Sequencing
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.868508
PMID:35530046
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在溃疡性结肠炎中对上皮细胞转录组景观的研究 | 单细胞RNA测序技术揭示了与溃疡性结肠炎发病机制相关的细胞亚群，并提供了连接基因组与病理的新途径 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在溃疡性结肠炎中的应用及其对上皮细胞转录组的新发现 | 溃疡性结肠炎中的上皮细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 793 | 2024-08-08 |
Characterization of Immunogenicity of Malignant Cells with Stemness in Intrahepatic Cholangiocarcinoma by Single-Cell RNA Sequencing
2022, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2022/3558200
PMID:35530414
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了肝内胆管癌（iCCA）中具有干细胞特性的恶性细胞的免疫原性 | 首次揭示了肝内胆管癌中高干细胞特性恶性细胞的免疫逃避机制 | NA | 研究肝内胆管癌中癌症干细胞的免疫原性及其与干细胞特性的关系 | 肝内胆管癌中的恶性细胞 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE | 转录组数据 | NA |
| 794 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Analyses Revealed Heterogeneity and Dynamic Changes of Metabolic Pathways in Astrocytes at the Acute Phase of Ischemic Stroke
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1817721
PMID:35535357
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了缺血性中风急性期星形胶质细胞代谢途径的异质性和动态变化 | 本研究首次通过单细胞测序技术，比较了短暂性大脑中动脉闭塞后12小时和24小时的星形胶质细胞的细胞表型和动态变化 | NA | 研究缺血性中风急性期星形胶质细胞的特征变化及其在神经保护中的潜在作用 | 星形胶质细胞在缺血性中风急性期的代谢途径异质性和动态变化 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠皮质样本在短暂性大脑中动脉闭塞后12小时和24小时 |
| 795 | 2024-08-08 |
Multi-scale integrative analyses identify THBS2+ cancer-associated fibroblasts as a key orchestrator promoting aggressiveness in early-stage lung adenocarcinoma
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.69590
PMID:35547750
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研究论文 | 本研究通过多尺度综合分析，揭示了THBS2+癌症相关成纤维细胞在早期肺腺癌中的关键作用，促进其侵袭性 | 首次在多组学水平上验证了THBS2作为早期肺腺癌的独立预后标志物，并揭示了THBS2+癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的具体作用机制 | NA | 旨在识别和验证早期肺腺癌中促进侵袭性表型的分子基础 | 早期肺腺癌样本及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、分泌组数据和空间组数据 | 多个独立临床队列的早期肺腺癌样本 |
| 796 | 2024-08-08 |
Identify the Prognostic and Immune Profile of VSIR in the Tumor Microenvironment: A Pan-Cancer Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.821649
PMID:35493077
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研究论文 | 本研究系统探讨了VSIR在33种癌症肿瘤微环境中的预后和免疫特征 | 首次全面分析了VSIR在多种癌症中的表达模式及其与肿瘤免疫的关系，并预测了针对VSIR的敏感药物和免疫治疗价值 | NA | 探讨VSIR在肿瘤微环境中的预后和免疫特征 | VSIR在33种癌症肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序分析，免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 33种癌症的样本 |
| 797 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Metastatic Testicular Seminoma Reveals the Cellular and Molecular Characteristics of Metastatic Cell Lineage
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.871489
PMID:35494058
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了转移性睾丸精原细胞瘤的细胞和分子特征 | 首次构建了转移性睾丸精原细胞瘤的单细胞图谱，并发现了特定表达的分子标记 | 研究样本仅来自单一患者，可能限制了结果的普遍性 | 揭示睾丸精原细胞瘤，特别是转移性肿瘤细胞的分子特征 | 转移性睾丸精原细胞瘤的细胞和分子特征 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 共18,206个高质量单细胞转录组信息 |
| 798 | 2024-08-08 |
A Regularized Multi-Task Learning Approach for Cell Type Detection in Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.788832
PMID:35495159
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研究论文 | 本文提出了一种基于正则化多任务学习（RMTL）的框架，用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型检测 | 该方法通过同时学习与特定细胞类型相关的亚群，简化了在每个集群中寻找潜在标记基因的繁琐过程 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型预测的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型检测 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 正则化多任务学习 | RNA测序数据 | 使用了从单细胞RNA测序实验构建的参考数据进行训练，并应用于查询数据集 |
| 799 | 2024-08-08 |
Identification of Neutrophil-Related Factor LCN2 for Predicting Severity of Patients With Influenza A Virus and SARS-CoV-2 Infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.854172
PMID:35495713
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研究论文 | 本研究旨在探索与流感A病毒和SARS-CoV-2感染严重程度相关的免疫相关宿主因子，特别是中性粒细胞相关的LCN2因子 | 发现LCN2在中性粒细胞中显著上调，并与疾病严重程度正相关，为预测和治疗流感A病毒及SARS-CoV-2感染的严重病例提供了新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探索与流感A病毒和SARS-CoV-2感染严重程度相关的免疫相关宿主因子和核心生物标志物 | 流感A病毒和SARS-CoV-2感染患者 | 数字病理学 | 流感 | 酶联免疫吸附试验（ELISA） | NA | 单细胞转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 800 | 2024-08-08 |
Proximal and Distal Regions of Pathogenic Th17 Related Chromatin Loci Are Sequentially Accessible During Pathogenicity of Th17
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.864314
PMID:35514969
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研究论文 | 本文研究了致病性Th17相关染色质位点的近端和远端区域的染色质可及性，并探讨了其在Th17致病性中的作用 | 首次全面比较了致病性Th17和常规调节性Th17的染色质可及性，并发现致病性Th17特异的染色质可及区域（patho-ChARs）在TSS近端区域有显著分布偏好 | NA | 揭示致病性Th17生成的新调控机制，为自身免疫疾病治疗提供新思路 | 致病性Th17和常规调节性Th17的染色质可及性 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 染色质可及性数据 | NA |