单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2024-08-08 |
NISC: Neural Network-Imputation for Single-Cell RNA Sequencing and Cell Type Clustering
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.847112
PMID:35591853
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于神经网络的单细胞RNA测序数据插补方法NISC，用于处理高稀疏性的scRNA-seq数据并提高细胞类型识别的准确性 | NISC利用自编码器结合加权损失函数和正则化技术，有效纠正scRNA-seq数据中的缺失值，其性能优于现有的插补方法 | NA | 开发一种新的插补方法以处理单细胞RNA测序数据中的高稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据及其细胞类型聚类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 数万个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 782 | 2024-08-08 |
PRKAR1A and SDCBP Serve as Potential Predictors of Heart Failure Following Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.878876
PMID:35592331
|
研究论文 | 本研究旨在通过转录组数据分析，识别急性心肌梗死后心力衰竭进展的新预测生物标志物，并揭示这些标志基因在心力衰竭进展中的病理机制 | 本研究首次发现PRKAR1A和SDCBP作为急性心肌梗死后心力衰竭的新预测生物标志物，并揭示了它们在心力衰竭进展中的潜在调控机制 | 研究样本量较小，需要在更大规模的研究中验证这些生物标志物的预测价值 | 识别急性心肌梗死后心力衰竭的新预测生物标志物，并揭示其病理机制 | 急性心肌梗死患者的心力衰竭进展 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 转录组数据 | 32名急性心肌梗死患者（16名心力衰竭进展，16名无进展），17名急性心肌梗死患者（9名心力衰竭进展，8名无进展），正常和梗死小鼠心脏组织中的白细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 783 | 2024-08-08 |
A Protocol for the Cryopreservation of Human Intestinal Mucosal Biopsies Compatible With Single-Cell Transcriptomics and Ex Vivo Studies
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.878389
PMID:35600311
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于人肠道黏膜活检的冷冻保存工作流程，该流程适用于单细胞转录组学和体外研究 | 该研究提供了一种可行的方法，用于从冷冻保存的肠道黏膜活检中进行单细胞转录组学研究 | NA | 旨在理解疾病状态下人肠道上皮细胞的异质性及其病理生理机制 | 人肠道黏膜活检和肠道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 单细胞 | 59,653个肠道细胞，来自10名参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 784 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Uncovers Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Targets for Parkinson's Disease
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.686739
PMID:35601482
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示帕金森病（PD）的细胞异质性、机制及治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析PD患者与健康人的中脑样本，揭示了PD的细胞异质性及其在细胞间通讯中的作用，并发现了五个可能的治疗靶点 | 研究样本量较小，且仅限于中脑样本，需要进一步的大规模临床研究验证 | 揭示帕金森病的细胞异质性、机制及治疗靶点 | 帕金森病患者与健康人的中脑样本 | 单细胞转录组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 主成分分析（PCA） | 转录组数据 | 18名帕金森病患者和18名健康人的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 785 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveal Intratumoral Heterogeneity and Tumor Microenvironment Characteristics in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.881345
PMID:35601491
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的肿瘤内异质性和肿瘤微环境特征 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了DLBCL中恶性细胞和免疫细胞的不同亚群，并构建了一个预测DLBCL患者预后的模型 | NA | 旨在深入解析弥漫大B细胞淋巴瘤的转录特征和肿瘤微环境 | 弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2个反应性淋巴结组织样本和2个DLBCL淋巴结活检组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 786 | 2024-08-08 |
A Molecular Landscape of Mouse Hippocampal Neuromodulation
2022, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2022.836930
PMID:35601530
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据和转录组神经分类学，探索了小鼠海马区CA1区域的细胞类型特异性基因表达，旨在揭示这一脑结构的神经调节网络架构 | 利用新的单细胞RNA测序数据和转录组神经分类学，为神经调节的网络级组织提供了新的见解 | 神经调节在网络级别的组织仍然是一个谜 | 揭示小鼠海马区CA1区域的神经调节网络架构 | 小鼠海马区CA1区域的细胞类型特异性基因表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠海马区CA1区域的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 787 | 2024-08-08 |
Revisiting the Transcriptome Landscape of Pig Embryo Implantation Site at Single-Cell Resolution
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.796358
PMID:35602598
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了猪胚胎着床位点的转录组景观，揭示了胚胎细胞与母体子宫内膜细胞之间的细胞间通讯机制 | 成功分离胚胎细胞与母体子宫内膜细胞，并利用CellChat工具揭示了两种细胞类型间的细胞间通讯 | NA | 解析猪胚胎着床的分子机制 | 猪胚胎着床位点的胚胎细胞与母体子宫内膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 少量胚胎及其周围子宫内膜组织 | NA | NA | NA | NA |
| 788 | 2024-08-08 |
Identification of Energy Metabolism-Related Gene Signatures From scRNA-Seq Data to Predict the Prognosis of Liver Cancer Patients
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.858336
PMID:35602603
|
研究论文 | 本研究基于单细胞测序数据，从能量代谢角度分析肝癌，并识别与能量代谢相关的基因特征，以预测肝癌患者的预后 | 首次基于单细胞测序数据，从能量代谢角度分析肝癌，并建立能量代谢相关评分（EM评分），分析不同评分组患者对化疗药物和免疫检查点抑制剂的敏感性 | NA | 通过分析肝癌患者的单细胞测序数据，识别与能量代谢相关的基因特征，以改善肝癌的靶向治疗策略 | 肝癌患者的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-Seq | NA | 基因数据 | 肝癌患者的单细胞和批量测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 789 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals Types of Hepatopancreatic Cells and Haemocytes in Black Tiger Shrimp (Penaeus monodon) and Their Molecular Responses to Ammonia Stress
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.883043
PMID:35603188
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了黑虎虾肝胰腺和血细胞的单细胞转录图谱，并分析了它们对氨氮压力的分子应答机制 | 首次应用10× Genomics的单细胞RNA测序技术于虾类研究，构建了虾类肝胰腺细胞和血细胞在氨氮压力下的单细胞转录图谱 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术分析虾类细胞类型及其对氨氮压力的免疫应答分子机制 | 黑虎虾的肝胰腺细胞和血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 在两种组织（血细胞和肝胰腺）中分别成功识别出七个细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 790 | 2024-08-08 |
Single Cell Dissection of Epithelial-Immune Cellular Interplay in Acute Kidney Injury Microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.857025
PMID:35603220
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，系统解析了急性肾损伤（AKI）微环境中上皮细胞与免疫细胞的相互作用 | 发现了三种新的近端小管细胞亚型，并揭示了它们在AKI进展中的分子变化和功能 | NA | 深入理解急性肾损伤的分子变化机制，并开发新的靶向治疗 | 小鼠肾脏组织样本在缺血-再灌注AKI后的不同时间点 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠肾脏组织样本在AKI后的1天、2天和3天以及健康对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 791 | 2024-08-08 |
scEFSC: Accurate single-cell RNA-seq data analysis via ensemble consensus clustering based on multiple feature selections
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.04.023
PMID:35615016
|
研究论文 | 本文提出了一种基于多特征选择的集成共识聚类方法scEFSC，用于准确分析单细胞RNA测序数据 | scEFSC算法采用多种无监督特征选择方法去除对单细胞RNA测序数据贡献不大的基因，并通过加权元聚类组合不同聚类算法的结果，提高了聚类性能 | 文章未明确提及现有方法的具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据分析中的数值不稳定、高维度和计算可扩展性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | RNA测序数据 | 14个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 792 | 2024-08-08 |
Landscape of Peripheral Blood Mononuclear Cells and Soluble Factors in Severe COVID-19 Patients With Pulmonary Fibrosis Development
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.831194
PMID:35558069
|
研究论文 | 研究探讨了严重COVID-19患者外周血单个核细胞和可溶性因子在肺纤维化发展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析了严重COVID-19患者中CD4+激活T细胞和Treg细胞的频率变化，并探讨了IFN应答基因及相关信号通路在肺纤维化进展中的作用 | 研究样本量较小，仅包括12名患者 | 探究免疫反应在COVID-19患者肺纤维化进展中的作用 | 严重COVID-19患者的外周血单个核细胞和可溶性因子 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 12名严重COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 793 | 2024-08-08 |
Dissecting Intra-Tumoral Changes Following Immune Checkpoint Blockades in Intrahepatic Cholangiocarcinoma via Single-Cell Analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.871769
PMID:35558087
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术，探讨了免疫检查点阻断剂在肝内胆管癌中的肿瘤内变化。 | 发现了免疫检查点阻断剂治疗后肝内胆管癌中细胞间通信网络的紧密化，以及通过PGF-VEGFR1介导的VEGF信号的新兴作用。 | 研究样本量相对较小，仅基于10名患者的单细胞RNA测序数据。 | 旨在通过单细胞水平分析，揭示免疫检查点阻断剂在肝内胆管癌中的肿瘤生态系统变化。 | 肝内胆管癌患者在接受免疫检查点阻断剂治疗后的肿瘤生态系统变化。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 10名肝内胆管癌患者的单细胞RNA测序数据，255名患者的批量RNA测序数据，264份切除的肝内胆管癌样本的双重免疫荧光染色数据 | NA | NA | NA | NA |
| 794 | 2024-08-08 |
Robust Colonic Epithelial Regeneration and Amelioration of Colitis via FZD-Specific Activation of Wnt Signaling
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.05.003
PMID:35569814
|
研究论文 | 本文研究了通过FZD特异性激活Wnt信号通路来实现结肠上皮再生和改善结肠炎的方法 | 开发了FZD5/8和LRP6受体特异性的Wnt模拟物SZN-1326-p，能有效修复受损的结肠上皮并减少炎症 | NA | 探索通过调节Wnt信号通路来治疗炎症性肠病中的上皮损伤 | 结肠上皮细胞和炎症性肠病模型 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用右旋糖酐硫酸钠小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 795 | 2024-08-08 |
Immunophenotyping of Acute Inflammatory Exacerbations of Lung Injury Driven by Mutant Surfactant Protein-C: A Role for Inflammatory Eosinophils
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.875887
PMID:35571100
|
研究论文 | 本研究利用临床相关模型，研究了突变型表面活性蛋白C引发的急性炎症加重期间，嗜酸性粒细胞与肺实质的相互作用及其在肺纤维化中的作用。 | 通过单细胞测序分析和遗传学方法，揭示了嗜酸性粒细胞在肺纤维化前炎症事件中的有害作用，并证明了皮质类固醇治疗在高度嗜酸性粒细胞性加重中的有效性。 | NA | 研究嗜酸性粒细胞在肺纤维化前急性炎症加重中的作用及皮质类固醇治疗的效果。 | 嗜酸性粒细胞、肺纤维化、皮质类固醇治疗。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞测序分析、流式细胞术 | NA | 细胞、组织 | 控制组和突变型SP-C模型小鼠，以及SP-CGATA1模型小鼠，时间跨度为7-42天。 | NA | NA | NA | NA |
| 796 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing and Its Applications in Liver Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.857037
PMID:35574365
|
review | 本文介绍了单细胞测序技术及其在肝癌中的应用 | 单细胞测序技术能够检测癌细胞间的异质性，区分肿瘤微环境中的每个细胞亚群，并揭示癌细胞的克隆特征 | 讨论了该领域目前面临的一些挑战 | 理解肿瘤的演化 | 肝癌的癌细胞异质性、肿瘤微环境、癌变和转移机制 | digital pathology | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 797 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Liver Cancer: Hype or Insights?
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.04.014
PMID:35577269
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肝细胞癌（HCC）研究中的最新发现及其在解析HCC复杂生态系统中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的分辨率来表征HCC的潜在发病机制和异质性 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在HCC研究中的应用及其在个性化医学时代的转化应用 | 肝细胞癌的肿瘤微环境及其细胞层面的主要特征，包括恶性细胞、不同类型的免疫细胞及细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 798 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Uncovered the Involvement of an Endothelial Subset in Neutrophil Recruitment in Chemically Induced Rat Pulmonary Inflammation
2022, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.67806
PMID:35582423
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了化学诱导的大鼠肺部炎症中内皮细胞亚群在嗜中性粒细胞招募中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了肺部炎症的复杂过程，并鉴定了参与嗜中性粒细胞招募的促炎性内皮细胞亚群 | NA | 探索慢性炎症促进肺部肿瘤发生的分子和细胞基础 | 化学诱导的大鼠肺部炎症中的细胞类型和基因表达模式 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 化学处理和对照组大鼠中鉴定了14种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 799 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of transcriptomic changes during in vitro maturation of human oocytes
2022 Jan-Dec, Reproductive medicine and biology
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/rmb2.12464
PMID:35582522
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了体外成熟人卵母细胞的基因表达谱，以揭示其分子机制 | 首次在单细胞水平上研究了人卵母细胞体外成熟过程中的转录组变化，并揭示了可能调控卵母细胞成熟的分子途径和上游调节因子 | 样本量较小，仅涉及11名患者的19个卵母细胞 | 探讨体外成熟人卵母细胞的分子机制 | 人卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19个卵母细胞来自11名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 800 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis Based on Public Databases for Constructing a Metastasis-Related Prognostic Model for Gastric Cancer
2022, Applied bionics and biomechanics
IF:1.8Q3
DOI:10.1155/2022/7061263
PMID:35528539
|
研究论文 | 本研究利用TCGA和GEO数据库中的转录组和单细胞测序数据，分析了转移性和非转移性胃癌中免疫细胞的差异基因表达，并构建了一个与转移相关的胃癌预后模型。 | 本研究构建了一个新的胃癌预后模型，并筛选出了一个潜在的胃癌疫苗候选基因PTPN6。 | 研究主要依赖于公共数据库中的数据，可能存在样本选择偏倚和数据质量问题。 | 探索胃癌的免疫微环境，并为胃癌的治疗提供新的思路。 | 胃癌患者的预后预测和潜在疫苗基因的筛选。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的数据集GSE62254 | NA | NA | NA | NA |