本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2024-08-08 |
Single-cell landscape reveals active cell subtypes and their interaction in the tumor microenvironment of gastric cancer
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.71833
PMID:35664061
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了九名未转移的胃癌患者的肿瘤微环境,揭示了胃癌中的活跃细胞亚型及其相互作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胃癌肿瘤微环境中的细胞异质性,并发现了与免疫抑制和肿瘤血管生成相关的新分子标志物。 | 研究样本仅限于九名未转移的胃癌患者,可能限制了结果的普遍性。 | 深入理解胃癌的肿瘤细胞及其微环境,为开发新的治疗策略提供依据。 | 胃癌患者的肿瘤微环境中的单个细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 47,304个细胞来自九名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 762 | 2024-08-08 |
New insights empowered by single-cell sequencing: From neural crest to enteric nervous system
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.025
PMID:35664232
|
综述 | 本文综述了单细胞多模态测序技术在肠神经系统(ENS)研究中的最新发现,特别是基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)在人类和小鼠的ENS细胞中的应用 | 利用单细胞多模态测序技术探索染色质可及性、基因表达和空间转录组,为构建新的肠神经病变诊断框架提供了前所未有的资源 | NA | 总结单细胞多模态测序技术在肠神经系统研究中的应用,并讨论其在生物医学研究领域的潜在影响 | 肠神经系统细胞,包括前体细胞、神经嵴(NC)细胞和成熟的ENS电路 | 生物技术 | 肠神经病变 | 单细胞多模态测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类和小鼠的ENS细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 763 | 2024-08-08 |
Prognostic Significance of Lineage Diversity in Bladder Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.862634
PMID:35664301
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,探讨了膀胱癌中细胞谱系的临床意义 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了膀胱癌中细胞谱系多样性与患者预后的关联 | NA | 探讨膀胱癌中细胞谱系多样性对患者预后的影响 | 膀胱癌患者的细胞谱系多样性及其临床意义 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 12,424个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 764 | 2024-08-08 |
Development of a Chemoresistant Risk Scoring Model for Prechemotherapy Osteosarcoma Using Single-Cell Sequencing
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.893282
PMID:35664733
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术,为化疗前骨肉瘤建立了一个有效的化疗耐药风险评分模型 | 本研究首次利用单细胞测序技术构建化疗耐药风险评分模型,相较于传统的基于大量RNA的模型,在验证环境中表现出更强的性能 | NA | 旨在理解和评估化疗前骨肉瘤的化疗耐药性 | 化疗前骨肉瘤的化疗耐药性 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO回归模型 | RNA数据 | 使用了TARGET-OS数据集作为训练组,GSE33382数据集作为验证组 | NA | NA | NA | NA |
| 765 | 2024-08-08 |
Using Single Cell Transcriptomics to Elucidate the Myeloid Compartment in Pancreatic Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.881871
PMID:35664793
|
综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术解析胰腺癌中髓系细胞分化的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术定义人类胰腺导管腺癌中的髓系细胞区室,并阐明髓系细胞与其他肿瘤免疫微环境成分之间的相互作用 | 目前对胰腺导管腺癌中髓系细胞亚群的了解有限,尤其是在人类研究中 | 探讨调节髓系细胞功能的疗法可能增强胰腺导管腺癌标准治疗效果的可能性 | 胰腺导管腺癌中的髓系细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 766 | 2024-08-08 |
The Development of Mechanical Allodynia in Diabetic Rats Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.856299
PMID:35668789
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了糖尿病大鼠模型中机械性痛觉过敏(MA)相关的背根神经节(DRG)神经元的转录组变化 | 发现了在痛性糖尿病周围神经病变(PDPN)中的一种新型神经元类型MAAC,并揭示了其基因调控网络和细胞间通信机制 | NA | 探究糖尿病周围神经病变中神经转录变化,以深入理解其复杂的发病机制 | 糖尿病大鼠模型的背根神经节神经元 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 767 | 2024-08-08 |
Digital Cell Atlas of Mouse Uterus: From Regenerative Stage to Maturational Stage
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.847646
PMID:35669188
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据构建了从小鼠再生期到成熟期的子宫细胞图谱,详细描述了动情周期中上皮细胞、基质细胞和免疫细胞的转变 | 首次在单细胞水平上构建了从小鼠再生期到成熟期的子宫细胞图谱,提供了基于细胞学的更精确的子宫内膜变化阐释 | 研究结论可能受到参与研究的小鼠数量有限的限制 | 旨在提高我们对从小鼠再生期到成熟期子宫内膜转变的理解 | 小鼠子宫内膜在动情周期中的细胞转变 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠子宫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 768 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics-Based Study of Transcriptional Regulatory Features in the Non-Obstructive Azoospermia Testis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.875762
PMID:35669193
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建转录调控网络,探讨非阻塞性无精症睾丸中转录因子的相互调控关系及因果关系 | 首次在非阻塞性无精症睾丸中发现特定的转录因子,并揭示这些因子在细胞命运、功能及微环境稳态中的重要作用 | NA | 探究非阻塞性无精症的转录调控特征 | 非阻塞性无精症睾丸中的转录因子及其调控网络 | 基因表达 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus数据库的GSE149512数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 769 | 2024-08-08 |
Prostaglandin E2 Exerts Biphasic Dose Response on the PreBötzinger Complex Respiratory-Related Rhythm
2022, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2022.826497
PMID:35669453
|
研究论文 | 研究前列腺素E2(PGE2)对preBötzinger复合体呼吸相关节律的双相剂量反应 | 首次揭示了PGE2在不同浓度下对呼吸节律的双相影响,并阐明了EP2和EP3受体在其中的作用机制 | 研究主要基于离体脑片实验,未来需在活体模型中验证结果 | 探讨PGE2在炎症过程中对呼吸功能的影响及其分子机制 | PGE2对preBötzinger复合体呼吸节律的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 770 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed Subtype-Specific Tumor Immune Microenvironments in Human Glioblastomas
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.914236
PMID:35669791
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了7名人类胶质母细胞瘤患者的手术切除肿瘤样本,揭示了肿瘤亚型特异性的免疫微环境 | 首次系统性地描述了不同肿瘤亚型与非恶性细胞之间的相互作用,以及它们如何共同塑造肿瘤微环境 | 研究样本仅限于7名患者,可能不足以代表所有胶质母细胞瘤的情况 | 探究人类胶质母细胞瘤中肿瘤亚型特异性的免疫微环境 | 人类胶质母细胞瘤的肿瘤亚型及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 7名胶质母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 771 | 2024-08-08 |
APOBEC-mediated mutagenesis is a favorable predictor of prognosis and immunotherapy for bladder cancer patients: evidence from pan-cancer analysis and multiple databases
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.73235
PMID:35673559
|
研究论文 | 本研究通过一系列生物信息学和统计学方法,全面分析了包括全外显子测序、靶向下一代测序、转录组(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq)、免疫特征、免疫检查点阻断潜力、患者生存和药物敏感性等多层次数据,揭示了APOBEC及其突变在泛癌尤其是膀胱癌中的分布特征和临床意义。 | 本研究首次在泛癌背景下探讨了APOBEC突变与膀胱癌患者预后和免疫治疗反应的关系,并利用机器学习方法建立了与APOBEC突变相关的预后模型。 | 研究主要基于数据库和现有数据进行分析,未来需要更多的临床试验和前瞻性研究来验证这些发现。 | 探讨APOBEC介导的突变在泛癌尤其是膀胱癌中的生物学特征和临床相关性。 | APOBEC家族介导的突变在膀胱癌中的分布特征和临床意义。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 全外显子测序(WES)、靶向下一代测序(NGS)、RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 多个膀胱癌队列 | NA | NA | NA | NA |
| 772 | 2024-08-08 |
Spatial maps of hepatocellular carcinoma transcriptomes reveal spatial expression patterns in tumor immune microenvironment
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.71873
PMID:35673582
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组测序技术分析肝细胞癌样本,揭示了肿瘤免疫微环境中免疫细胞的空间表达模式 | 首次揭示了肝细胞癌中免疫细胞在肿瘤微环境中的空间表达模式,并验证了关键分子如CCL15、CCL19和CCL21的功能机制 | 研究仅基于两个肝细胞癌样本,可能需要更多样本以增强结果的普遍性 | 探索肝细胞癌中肿瘤免疫微环境的空间表达模式及其临床意义 | 肝细胞癌样本中的免疫细胞及其空间表达模式 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组测序(ST) | NA | 转录组数据 | 7553个spots,分为15个亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 773 | 2024-08-08 |
Dissecting Human Blood Immune Cells Response to Intracellular Infection Using Single-Cell RNA Sequencing
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1971-1_12
PMID:35619031
|
研究论文 | 本文开发了一种使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析体外感染的人外周血单个核细胞(PBMCs)对细胞内病原体反应的协议 | 利用scRNA-seq技术揭示人体免疫系统对多种细胞内病原体的复杂相互作用 | NA | 揭示人体免疫系统对细胞内病原体的复杂相互作用 | 人体外周血单个核细胞(PBMCs)对细胞内病原体的免疫反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 774 | 2024-08-08 |
Landscape of Immune Cells Heterogeneity in Liver Transplantation by Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.890019
PMID:35619708
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了肝移植中免疫细胞异质性的全景图 | 首次在人类肝移植中发现CD4+CD8+FOXP3+ T细胞亚群,并识别LDLR作为激活MDSC的新标志物,以防止肝移植排斥反应 | NA | 揭示肝移植排斥反应的潜在机制 | 肝移植中的T细胞、NK细胞、B细胞和髓样细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类肝和血液中的多种免疫细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 775 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Profiles Identify Important Pathophysiologic Factors in the Progression of Diabetic Nephropathy
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.798316
PMID:35620059
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析糖尿病肾病中的细胞类型和病理生理因子 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别糖尿病肾病中的关键细胞类型和病理生理因子 | 研究样本量较小,仅包括三个人类糖尿病肾病样本和三个对照样本 | 旨在识别糖尿病肾病进展中的细胞类型和病理生理因子 | 人类糖尿病肾病样本和对照样本中的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 三个人类糖尿病肾病样本和三个对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 776 | 2024-08-08 |
Intercellular Communication-Related Molecular Subtypes and a Gene Signature Identified by the Single-Cell RNA Sequencing Combined with a Transcriptomic Analysis
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/6837849
PMID:35620271
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合转录组分析,识别了肺腺癌中的细胞类型,并筛选了细胞间通讯相关的基因,进而构建了一个新的预后风险模型。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了肺腺癌中的细胞类型,并基于细胞间通讯相关基因开发了一个新的预后风险模型。 | NA | 识别肺腺癌中的细胞类型,并开发基于细胞间通讯相关基因的预后风险模型。 | 肺腺癌患者的肿瘤微环境中的细胞类型和细胞间通讯相关基因。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | RNA-seq数据 | 8170个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 777 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Dysregulated Cell-Cell Interactions in a Tumor Microenvironment Related to HCC Development
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/4971621
PMID:35634447
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境中细胞间相互作用(CCE)的失调情况 | 本研究构建了肿瘤微环境的CCE景观,并识别了在HCC中失调的细胞类型和改变的分子功能,提取了基于CCE的免疫调节网络,并确定了基于CCE基因的预后标志 | NA | 揭示从健康供体到HCC的肝脏组织中CCE的差异 | 健康供体、癌旁非肿瘤组织和HCC的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约62000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 778 | 2024-08-08 |
Heterogeneous Skeletal Muscle Cell and Nucleus Populations Identified by Single-Cell and Single-Nucleus Resolution Transcriptome Assays
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.835099
PMID:35646075
|
研究论文 | 本文通过单细胞和单核分辨率转录组测定法,研究了骨骼肌细胞和细胞核的异质性 | 单核RNA测序(snRNA-seq)不仅作为单细胞RNA测序(scRNA-seq)的替代方法,而且作为一种新颖的方法,为多核细胞如肌纤维提供了有价值的见解 | NA | 探讨单细胞和单核分辨率转录组测定法在骨骼肌研究中的应用 | 骨骼肌细胞、肌纤维及其细胞核 | 基因组学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及卫星细胞、肌母细胞、肌管和肌纤维等多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 779 | 2024-08-08 |
Identification of Transcriptional Heterogeneity and Construction of a Prognostic Model for Melanoma Based on Single-Cell and Bulk Transcriptome Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.874429
PMID:35646893
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量转录组分析探索黑色素瘤细胞亚群的肿瘤内异质性,并构建了一个预测黑色素瘤患者预后的诺模图工具 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析黑色素瘤细胞亚群的异质性,并开发了一种新的诺模图工具来预测黑色素瘤患者的预后 | NA | 探索黑色素瘤的转录异质性并构建预后模型 | 黑色素瘤细胞亚群及其临床预后 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TCGA数据集的黑色素瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 780 | 2024-08-08 |
Deciphering Innate Immune Cell-Tumor Microenvironment Crosstalk at a Single-Cell Level
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.803947
PMID:35646915
|
综述 | 本文综述了基于单细胞技术在肿瘤微环境中对先天免疫细胞亚型及其功能的最新研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术解析肿瘤微环境中先天免疫细胞的转录组,为癌症免疫治疗提供了新的见解 | NA | 总结先天免疫细胞在肿瘤微环境中的亚型和功能,并探讨如何利用这些细胞进行癌症免疫治疗 | 肿瘤微环境中的先天免疫细胞,包括树突状细胞、单核细胞/巨噬细胞、自然杀伤细胞和先天淋巴细胞 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |