单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2024-08-08 |
APOBEC-mediated mutagenesis is a favorable predictor of prognosis and immunotherapy for bladder cancer patients: evidence from pan-cancer analysis and multiple databases
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.73235
PMID:35673559
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研究论文 | 本研究通过一系列生物信息学和统计学方法，全面分析了包括全外显子测序、靶向下一代测序、转录组（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq）、免疫特征、免疫检查点阻断潜力、患者生存和药物敏感性等多层次数据，揭示了APOBEC及其突变在泛癌尤其是膀胱癌中的分布特征和临床意义。 | 本研究首次在泛癌背景下探讨了APOBEC突变与膀胱癌患者预后和免疫治疗反应的关系，并利用机器学习方法建立了与APOBEC突变相关的预后模型。 | 研究主要基于数据库和现有数据进行分析，未来需要更多的临床试验和前瞻性研究来验证这些发现。 | 探讨APOBEC介导的突变在泛癌尤其是膀胱癌中的生物学特征和临床相关性。 | APOBEC家族介导的突变在膀胱癌中的分布特征和临床意义。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 全外显子测序(WES)、靶向下一代测序(NGS)、RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 多个膀胱癌队列 |
| 762 | 2024-08-08 |
Spatial maps of hepatocellular carcinoma transcriptomes reveal spatial expression patterns in tumor immune microenvironment
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.71873
PMID:35673582
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研究论文 | 本研究利用空间转录组测序技术分析肝细胞癌样本，揭示了肿瘤免疫微环境中免疫细胞的空间表达模式 | 首次揭示了肝细胞癌中免疫细胞在肿瘤微环境中的空间表达模式，并验证了关键分子如CCL15、CCL19和CCL21的功能机制 | 研究仅基于两个肝细胞癌样本，可能需要更多样本以增强结果的普遍性 | 探索肝细胞癌中肿瘤免疫微环境的空间表达模式及其临床意义 | 肝细胞癌样本中的免疫细胞及其空间表达模式 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组测序(ST) | NA | 转录组数据 | 7553个spots，分为15个亚群 |
| 763 | 2024-08-08 |
Dissecting Human Blood Immune Cells Response to Intracellular Infection Using Single-Cell RNA Sequencing
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1971-1_12
PMID:35619031
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研究论文 | 本文开发了一种使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析体外感染的人外周血单个核细胞（PBMCs）对细胞内病原体反应的协议 | 利用scRNA-seq技术揭示人体免疫系统对多种细胞内病原体的复杂相互作用 | NA | 揭示人体免疫系统对细胞内病原体的复杂相互作用 | 人体外周血单个核细胞（PBMCs）对细胞内病原体的免疫反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 764 | 2024-08-08 |
Landscape of Immune Cells Heterogeneity in Liver Transplantation by Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.890019
PMID:35619708
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肝移植中免疫细胞异质性的全景图 | 首次在人类肝移植中发现CD4+CD8+FOXP3+ T细胞亚群，并识别LDLR作为激活MDSC的新标志物，以防止肝移植排斥反应 | NA | 揭示肝移植排斥反应的潜在机制 | 肝移植中的T细胞、NK细胞、B细胞和髓样细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类肝和血液中的多种免疫细胞亚群 |
| 765 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Profiles Identify Important Pathophysiologic Factors in the Progression of Diabetic Nephropathy
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.798316
PMID:35620059
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析糖尿病肾病中的细胞类型和病理生理因子 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别糖尿病肾病中的关键细胞类型和病理生理因子 | 研究样本量较小，仅包括三个人类糖尿病肾病样本和三个对照样本 | 旨在识别糖尿病肾病进展中的细胞类型和病理生理因子 | 人类糖尿病肾病样本和对照样本中的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 三个人类糖尿病肾病样本和三个对照样本 |
| 766 | 2024-08-08 |
Intercellular Communication-Related Molecular Subtypes and a Gene Signature Identified by the Single-Cell RNA Sequencing Combined with a Transcriptomic Analysis
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/6837849
PMID:35620271
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合转录组分析，识别了肺腺癌中的细胞类型，并筛选了细胞间通讯相关的基因，进而构建了一个新的预后风险模型。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了肺腺癌中的细胞类型，并基于细胞间通讯相关基因开发了一个新的预后风险模型。 | NA | 识别肺腺癌中的细胞类型，并开发基于细胞间通讯相关基因的预后风险模型。 | 肺腺癌患者的肿瘤微环境中的细胞类型和细胞间通讯相关基因。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | RNA-seq数据 | 8170个细胞样本 |
| 767 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Dysregulated Cell-Cell Interactions in a Tumor Microenvironment Related to HCC Development
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/4971621
PMID:35634447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中细胞间相互作用（CCE）的失调情况 | 本研究构建了肿瘤微环境的CCE景观，并识别了在HCC中失调的细胞类型和改变的分子功能，提取了基于CCE的免疫调节网络，并确定了基于CCE基因的预后标志 | NA | 揭示从健康供体到HCC的肝脏组织中CCE的差异 | 健康供体、癌旁非肿瘤组织和HCC的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约62000个细胞 |
| 768 | 2024-08-08 |
Heterogeneous Skeletal Muscle Cell and Nucleus Populations Identified by Single-Cell and Single-Nucleus Resolution Transcriptome Assays
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.835099
PMID:35646075
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研究论文 | 本文通过单细胞和单核分辨率转录组测定法，研究了骨骼肌细胞和细胞核的异质性 | 单核RNA测序（snRNA-seq）不仅作为单细胞RNA测序（scRNA-seq）的替代方法，而且作为一种新颖的方法，为多核细胞如肌纤维提供了有价值的见解 | NA | 探讨单细胞和单核分辨率转录组测定法在骨骼肌研究中的应用 | 骨骼肌细胞、肌纤维及其细胞核 | 基因组学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及卫星细胞、肌母细胞、肌管和肌纤维等多种细胞类型 |
| 769 | 2024-08-08 |
Identification of Transcriptional Heterogeneity and Construction of a Prognostic Model for Melanoma Based on Single-Cell and Bulk Transcriptome Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.874429
PMID:35646893
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量转录组分析探索黑色素瘤细胞亚群的肿瘤内异质性，并构建了一个预测黑色素瘤患者预后的诺模图工具 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析黑色素瘤细胞亚群的异质性，并开发了一种新的诺模图工具来预测黑色素瘤患者的预后 | NA | 探索黑色素瘤的转录异质性并构建预后模型 | 黑色素瘤细胞亚群及其临床预后 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TCGA数据集的黑色素瘤患者样本 |
| 770 | 2024-08-08 |
Deciphering Innate Immune Cell-Tumor Microenvironment Crosstalk at a Single-Cell Level
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.803947
PMID:35646915
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综述 | 本文综述了基于单细胞技术在肿瘤微环境中对先天免疫细胞亚型及其功能的最新研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术解析肿瘤微环境中先天免疫细胞的转录组，为癌症免疫治疗提供了新的见解 | NA | 总结先天免疫细胞在肿瘤微环境中的亚型和功能，并探讨如何利用这些细胞进行癌症免疫治疗 | 肿瘤微环境中的先天免疫细胞，包括树突状细胞、单核细胞/巨噬细胞、自然杀伤细胞和先天淋巴细胞 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 771 | 2024-08-08 |
NISC: Neural Network-Imputation for Single-Cell RNA Sequencing and Cell Type Clustering
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.847112
PMID:35591853
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于神经网络的单细胞RNA测序数据插补方法NISC，用于处理高稀疏性的scRNA-seq数据并提高细胞类型识别的准确性 | NISC利用自编码器结合加权损失函数和正则化技术，有效纠正scRNA-seq数据中的缺失值，其性能优于现有的插补方法 | NA | 开发一种新的插补方法以处理单细胞RNA测序数据中的高稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据及其细胞类型聚类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 数万个单个细胞 |
| 772 | 2024-08-08 |
PRKAR1A and SDCBP Serve as Potential Predictors of Heart Failure Following Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.878876
PMID:35592331
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研究论文 | 本研究旨在通过转录组数据分析，识别急性心肌梗死后心力衰竭进展的新预测生物标志物，并揭示这些标志基因在心力衰竭进展中的病理机制 | 本研究首次发现PRKAR1A和SDCBP作为急性心肌梗死后心力衰竭的新预测生物标志物，并揭示了它们在心力衰竭进展中的潜在调控机制 | 研究样本量较小，需要在更大规模的研究中验证这些生物标志物的预测价值 | 识别急性心肌梗死后心力衰竭的新预测生物标志物，并揭示其病理机制 | 急性心肌梗死患者的心力衰竭进展 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 转录组数据 | 32名急性心肌梗死患者（16名心力衰竭进展，16名无进展），17名急性心肌梗死患者（9名心力衰竭进展，8名无进展），正常和梗死小鼠心脏组织中的白细胞 |
| 773 | 2024-08-08 |
A Protocol for the Cryopreservation of Human Intestinal Mucosal Biopsies Compatible With Single-Cell Transcriptomics and Ex Vivo Studies
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.878389
PMID:35600311
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研究论文 | 本文介绍了一种用于人肠道黏膜活检的冷冻保存工作流程，该流程适用于单细胞转录组学和体外研究 | 该研究提供了一种可行的方法，用于从冷冻保存的肠道黏膜活检中进行单细胞转录组学研究 | NA | 旨在理解疾病状态下人肠道上皮细胞的异质性及其病理生理机制 | 人肠道黏膜活检和肠道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 单细胞 | 59,653个肠道细胞，来自10名参与者 |
| 774 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Uncovers Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Targets for Parkinson's Disease
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.686739
PMID:35601482
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示帕金森病（PD）的细胞异质性、机制及治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析PD患者与健康人的中脑样本，揭示了PD的细胞异质性及其在细胞间通讯中的作用，并发现了五个可能的治疗靶点 | 研究样本量较小，且仅限于中脑样本，需要进一步的大规模临床研究验证 | 揭示帕金森病的细胞异质性、机制及治疗靶点 | 帕金森病患者与健康人的中脑样本 | 单细胞转录组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 主成分分析（PCA） | 转录组数据 | 18名帕金森病患者和18名健康人的血液样本 |
| 775 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveal Intratumoral Heterogeneity and Tumor Microenvironment Characteristics in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.881345
PMID:35601491
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的肿瘤内异质性和肿瘤微环境特征 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了DLBCL中恶性细胞和免疫细胞的不同亚群，并构建了一个预测DLBCL患者预后的模型 | NA | 旨在深入解析弥漫大B细胞淋巴瘤的转录特征和肿瘤微环境 | 弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2个反应性淋巴结组织样本和2个DLBCL淋巴结活检组织样本 |
| 776 | 2024-08-08 |
A Molecular Landscape of Mouse Hippocampal Neuromodulation
2022, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2022.836930
PMID:35601530
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据和转录组神经分类学，探索了小鼠海马区CA1区域的细胞类型特异性基因表达，旨在揭示这一脑结构的神经调节网络架构 | 利用新的单细胞RNA测序数据和转录组神经分类学，为神经调节的网络级组织提供了新的见解 | 神经调节在网络级别的组织仍然是一个谜 | 揭示小鼠海马区CA1区域的神经调节网络架构 | 小鼠海马区CA1区域的细胞类型特异性基因表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠海马区CA1区域的细胞 |
| 777 | 2024-08-08 |
Revisiting the Transcriptome Landscape of Pig Embryo Implantation Site at Single-Cell Resolution
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.796358
PMID:35602598
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了猪胚胎着床位点的转录组景观，揭示了胚胎细胞与母体子宫内膜细胞之间的细胞间通讯机制 | 成功分离胚胎细胞与母体子宫内膜细胞，并利用CellChat工具揭示了两种细胞类型间的细胞间通讯 | NA | 解析猪胚胎着床的分子机制 | 猪胚胎着床位点的胚胎细胞与母体子宫内膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 少量胚胎及其周围子宫内膜组织 |
| 778 | 2024-08-08 |
Identification of Energy Metabolism-Related Gene Signatures From scRNA-Seq Data to Predict the Prognosis of Liver Cancer Patients
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.858336
PMID:35602603
|
研究论文 | 本研究基于单细胞测序数据，从能量代谢角度分析肝癌，并识别与能量代谢相关的基因特征，以预测肝癌患者的预后 | 首次基于单细胞测序数据，从能量代谢角度分析肝癌，并建立能量代谢相关评分（EM评分），分析不同评分组患者对化疗药物和免疫检查点抑制剂的敏感性 | NA | 通过分析肝癌患者的单细胞测序数据，识别与能量代谢相关的基因特征，以改善肝癌的靶向治疗策略 | 肝癌患者的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-Seq | NA | 基因数据 | 肝癌患者的单细胞和批量测序数据 |
| 779 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals Types of Hepatopancreatic Cells and Haemocytes in Black Tiger Shrimp (Penaeus monodon) and Their Molecular Responses to Ammonia Stress
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.883043
PMID:35603188
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了黑虎虾肝胰腺和血细胞的单细胞转录图谱，并分析了它们对氨氮压力的分子应答机制 | 首次应用10× Genomics的单细胞RNA测序技术于虾类研究，构建了虾类肝胰腺细胞和血细胞在氨氮压力下的单细胞转录图谱 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术分析虾类细胞类型及其对氨氮压力的免疫应答分子机制 | 黑虎虾的肝胰腺细胞和血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 在两种组织（血细胞和肝胰腺）中分别成功识别出七个细胞簇 |
| 780 | 2024-08-08 |
Single Cell Dissection of Epithelial-Immune Cellular Interplay in Acute Kidney Injury Microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.857025
PMID:35603220
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，系统解析了急性肾损伤（AKI）微环境中上皮细胞与免疫细胞的相互作用 | 发现了三种新的近端小管细胞亚型，并揭示了它们在AKI进展中的分子变化和功能 | NA | 深入理解急性肾损伤的分子变化机制，并开发新的靶向治疗 | 小鼠肾脏组织样本在缺血-再灌注AKI后的不同时间点 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠肾脏组织样本在AKI后的1天、2天和3天以及健康对照组 |