单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2024-08-08 |
Can we infer tumor presence of single cell transcriptomes and their tumor of origin from bulk transcriptomes by machine learning?
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.035
PMID:35685355
|
研究论文 | 研究使用机器学习模型从批量转录组数据中推断单细胞转录组的肿瘤存在及其原发肿瘤类型 | 引入scTumorTrace方法，该方法使用转录组范围内的2元组，无需标准化且不受log2转换量的限制，能够从批量转录组数据中推断单细胞转录组的肿瘤存在及其原发肿瘤类型 | 现有的机器学习模型中，只有scTumorTrace适用于单细胞转录组数据，其他模型均不适用 | 探索是否可以从批量转录组数据中使用机器学习模型推断单细胞转录组的肿瘤存在及其原发肿瘤类型 | 单细胞转录组数据和批量转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | k-最近邻，一对多支持向量机，一对一支持向量机，随机森林，scTumorTrace | 转录组数据 | 包含白细胞和七种主要癌症类型的实验数据 | NA | NA | NA | NA |
| 742 | 2024-08-08 |
Genome-wide characterization of RNA editing highlights roles of high editing events of glutamatergic synapse during mouse retinal development
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.029
PMID:35685368
|
研究论文 | 本文通过全基因组筛选高可信度的RNA编辑事件，揭示了RNA编辑在小鼠视网膜发育中的动态转录调控作用 | 首次系统地分析了小鼠视网膜发育过程中RNA编辑的模式及其对神经递质受体功能的调控作用 | NA | 探讨RNA编辑在小鼠视网膜发育中的作用及其机制 | 小鼠视网膜发育过程中的RNA编辑事件 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 2000个高可信度编辑位点，跨越八个发育阶段的视网膜 | NA | NA | NA | NA |
| 743 | 2024-08-08 |
Constructing a Prognostic Gene Signature for Lung Adenocarcinoma Based on Weighted Gene Co-Expression Network Analysis and Single-Cell Analysis
2022, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S353848
PMID:35685695
|
研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析和单细胞分析技术构建了肺腺癌的预后基因标志物 | 利用先进的单细胞RNA测序技术分析肿瘤内异质性，提高了基于单细胞表达数据识别生物标志物的准确性，从而有助于预测癌症患者的预后并辅助癌症治疗决策 | NA | 构建肺腺癌的预后基因标志物 | 肺腺癌及其癌旁组织样本 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 包含两个肺腺癌和两个癌旁组织样本的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 744 | 2024-08-08 |
The Chemokines Initiating and Maintaining Immune Hot Phenotype Are Prognostic in ICB of HNSCC
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.820065
PMID:35692828
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，探索了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中肿瘤相关巨噬细胞（TAMM）的异质性与免疫特性和预后的关系，并利用深度学习框架构建神经网络模型预测抗PD-1/PDL-1治疗的疗效。 | 本研究首次通过网络拓扑结构筛选出CXCL9、10、11和CCL5等关键基因，这些基因在HNSCC中启动和维持免疫热表型，并通过构建神经网络模型预测抗PD-1/PDL-1治疗的疗效。 | NA | 探索HNSCC中TAMM异质性对免疫反应的调控作用及预测ICB治疗的有效性。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMM）及其免疫反应。 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 神经网络模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 745 | 2024-08-08 |
Identification of Biomarkers for Predicting Ovarian Reserve of Primordial Follicle via Transcriptomic Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.879974
PMID:35692832
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析，识别与原始卵泡池卵巢储备相关的基因标志物 | 首次识别出与原始卵泡池卵巢储备高度相关的基因，这些基因可能作为预测卵巢储备的生物标志物 | NA | 识别用于预测原始卵泡卵巢储备的生物标志物 | 小鼠卵巢的批量RNA-seq数据和不同发育阶段的卵泡单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的小鼠卵巢批量RNA-seq数据和不同阶段的卵泡单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 746 | 2024-08-08 |
SpatialMap: Spatial Mapping of Unmeasured Gene Expression Profiles in Spatial Transcriptomic Data Using Generalized Linear Spatial Models
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.893522
PMID:35692845
|
研究论文 | 本文开发了一种名为SpatialMap的计算方法，用于整合单细胞RNA测序数据和基于图像的转录组学数据，以实现空间转录组数据中未测量基因表达谱的空间映射 | SpatialMap通过广义线性空间模型直接建模空间基因表达数据，并使用条件自回归（CAR）先验考虑空间位置之间的相关性，采用基于惩罚拟似然（PQL）的算法进行大规模空间映射分析 | NA | 旨在开发一种方法，将单细胞RNA测序数据与基于图像的转录组学数据整合，以实现空间转录组数据中未测量基因表达谱的空间映射 | 单细胞RNA测序数据和基于图像的转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 广义线性空间模型 | 基因表达数据 | 四个公开可用的组织配对研究 | NA | NA | NA | NA |
| 747 | 2024-08-08 |
MYBL2 accelerates epithelial-mesenchymal transition and hepatoblastoma metastasis via the Smad/SNAI1 pathway
2022, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:35693071
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了来自两名肝母细胞瘤患者的25,264个转移细胞的转录组特征，发现MYBL2通过Smad/SNAI1途径加速上皮-间质转化和肝母细胞瘤转移。 | 首次揭示了MYBL2在肝母细胞瘤转移中的作用及其通过Smad/SNAI1途径调控上皮-间质转化的机制。 | 研究主要集中在体外和体内实验验证，需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 探究肝母细胞瘤转移的分子机制及其关键调控因子。 | 肝母细胞瘤转移细胞及其转录组特征。 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 25,264个转移细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 748 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Signatures and Alterations of Microglia Associated With Glioblastoma Associate Microglia Contribution to Tumor Formation
2022, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2022.1610067
PMID:35693633
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据揭示了胶质母细胞瘤中微胶质细胞的异质性，并探讨了不同微胶质细胞亚型在肿瘤发生和发展中的作用 | 研究首次利用单细胞RNA测序技术分析了胶质母细胞瘤中微胶质细胞的转录组特征和变化，为胶质母细胞瘤的免疫治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 探讨微胶质细胞在胶质母细胞瘤发生和发展中的作用，寻找新的免疫治疗靶点 | 胶质母细胞瘤中的微胶质细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 749 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Immune Cell Heterogeneity in IgG4-Related Disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.904288
PMID:35693817
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了IgG4相关疾病患者外周血单个核细胞中的免疫细胞异质性及其转录特征 | 首次在单细胞水平上揭示了IgG4相关疾病中免疫细胞亚群的转录谱，并发现了特定细胞亚群和通路的变化 | 研究样本量较小，仅包括四名患者和三名健康对照 | 探究IgG4相关疾病中免疫细胞的异质性和转录特征 | IgG4相关疾病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 免疫介导疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 四名IgG4相关疾病患者和三名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 750 | 2024-08-08 |
Comparative Analysis of Single-Cell Transcriptome Data Reveals a Novel Role of Keratinocyte-Derived IL-23 in Psoriasis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.905239
PMID:35693818
|
研究论文 | 本研究通过分析公开的单细胞转录组测序数据，探讨了角质形成细胞衍生的IL-23在银屑病中的存在及其潜在作用 | 发现角质形成细胞衍生的IL-23与IL-36在银屑病进展中的新关联 | NA | 确定角质形成细胞衍生的IL-23在银屑病中的存在及其潜在作用 | 角质形成细胞衍生的IL-23及其在银屑病中的作用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用公开的人类样本数据和咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 751 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis Identifies Cell-Type-Specific Genes Within Tumor Microenvironment as Prognostic Indicators in Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.878923
PMID:35707353
|
研究论文 | 本研究通过综合分析确定了肿瘤微环境中特定细胞类型的基因作为肝细胞癌的预后标志物 | 开发了一种基于优化标志物的肝细胞癌复发预测模型，并验证了其在预测肝细胞癌复发中的独立性和优越性 | NA | 旨在提高肝细胞癌复发的预测准确性和理解其复发机制 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的特定细胞类型基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 训练和三个验证队列中的肝细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 752 | 2024-08-08 |
Redefining the Foreign Antigen and Self-Driven Memory CD4+ T-Cell Compartments via Transcriptomic, Phenotypic, and Functional Analyses
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.870542
PMID:35707543
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析，重新定义了自我驱动记忆CD4+ T细胞和外来抗原特异性记忆CD4+ T细胞的亚群 | 首次识别出自我驱动记忆CD4+ T细胞的不同亚群，并揭示了这些亚群与传统外来抗原特异性记忆细胞在标记表达和功能上的差异 | NA | 重新定义和区分自我驱动记忆CD4+ T细胞和外来抗原特异性记忆CD4+ T细胞的亚群 | CD4+ T淋巴细胞的亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 细胞 | 多个CD4+ T细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 753 | 2024-08-08 |
A gastruloid model of the interaction between embryonic and extra-embryonic cell types
2022 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314221103042
PMID:35707767
|
研究论文 | 本文报道了由小鼠胚胎干细胞（mESCs）和胚外内胚层（XEN）细胞组成的gastruloids的形成，并展示了这些XEN增强型gastruloids（XEGs）在神经上皮形成方面的特性 | 首次报道了XEN细胞与mESCs在gastruloids中的相互作用，以及这种相互作用对神经上皮组织形成的影响 | NA | 探索异型细胞间的相互作用及其在体外发育中的后果 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs）和胚外内胚层（XEN）细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，成像技术，分化实验 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 754 | 2024-08-08 |
Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11A upregulation is a biomarker of poor prognosis in patients with head and neck squamous cell carcinoma
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0269166
PMID:35653344
|
研究论文 | 本研究旨在探讨微粒体信号肽酶复合体（SPC）五个亚基基因（SEC11A、SEC11C、SPCS1、SPCS2和SPCS3）在头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的表达及其预后价值 | 发现SEC11A上调是头颈部鳞状细胞癌中的一个独立预后生物标志物，并与特定类型免疫细胞的浸润有关 | NA | 研究头颈部鳞状细胞癌中微粒体信号肽酶复合体亚基基因的表达及其预后价值 | 微粒体信号肽酶复合体五个亚基基因在头颈部鳞状细胞癌中的表达 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | 基因集富集分析（GSEA），单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自TCGA的头颈部鳞状细胞癌子集数据和一个先前的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 755 | 2024-08-08 |
Intracranial Aneurysms Induced by RUNX1 Through Regulation of NFKB1 in Patients With Hypertension-An Integrated Analysis Based on Multiple Datasets and Algorithms
2022, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2022.877801
PMID:35655614
|
研究论文 | 本研究旨在通过分析高血压患者颅内动脉瘤（IA）进展中的关键基因，识别潜在的治疗靶点 | 本研究通过整合多个数据集和算法，识别了RUNX1作为高血压患者颅内动脉瘤进展中的关键基因，并揭示了其通过调节NFKB1在单核细胞/巨噬细胞相关网络中的作用 | NA | 识别高血压患者颅内动脉瘤进展中的潜在治疗靶点 | 高血压患者的颅内动脉瘤进展 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | 支持向量机-递归特征消除算法 | 基因表达数据 | 包括高血压和颅内动脉瘤的批量RNA测序数据集，以及腹主动脉瘤患者的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 756 | 2024-08-08 |
Leveraging Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data of NSCLC Tumor Microenvironment and Therapeutic Potential of NLOC-15A, A Novel Multi-Target Small Molecule
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.872470
PMID:35655775
|
研究论文 | 本文通过分析大量和单细胞RNA测序数据，探讨了NSCLC肿瘤微环境及新型多靶点小分子NLOC-15A的治疗潜力 | 本文首次提供了NLOC-015A作为多靶点小分子抑制剂在治疗NSCLC中的临床前证据，并揭示了其在重塑肿瘤免疫微环境中的作用 | NA | 研究新型多靶点小分子NLOC-015A在治疗NSCLC中的疗效和机制 | NSCLC肿瘤微环境及NLOC-015A的作用机制 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个NSCLC患者的临床数据和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 757 | 2024-08-08 |
Astrocyte Reprogramming in Stroke: Opportunities and Challenges
2022, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2022.885707
PMID:35663583
|
综述 | 本文综述了星形胶质细胞重编程在脑卒中治疗中的应用及其争议 | 介绍了通过靶向关键转录因子或微小RNA使小鼠脑中的星形胶质细胞重编程为功能性神经元的方法 | 目前缺乏细胞谱系追踪和单细胞测序实验来提供基因表达谱变化证据 | 探讨星形胶质细胞重编程的过程及其在脑卒中治疗中的应用 | 星形胶质细胞重编程及其在脑卒中治疗中的应用 | NA | 脑卒中 | 细胞谱系追踪和单细胞测序 | NA | 基因表达谱 | 小鼠脑中的星形胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 758 | 2024-08-08 |
Lessons From Transcriptome Analysis of Autoimmune Diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.857269
PMID:35663941
|
综述 | 本文综述了转录组分析如何增进我们对自身免疫疾病中免疫细胞病理作用的认识，特别关注了ImmuNexUT数据库 | 介绍了单细胞RNA测序在识别各种自身免疫疾病病变中浸润免疫细胞的作用，以及eQTL分析在识别候选因果基因和免疫细胞中的应用 | NA | 总结转录组分析在自身免疫疾病中免疫细胞病理作用的理解上的进展 | 自身免疫疾病中的免疫细胞及其在疾病中的作用 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 759 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Cellular Functional Heterogeneity in Dermis Between Fibrotic and Regenerative Wound Healing Fates
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.875407
PMID:35664010
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的类型和功能差异 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类伤口愈合的情况 | 旨在揭示纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的功能异质性 | 纤维化和再生性伤口愈合过程中的真皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 纤维化和再生性伤口的真皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 760 | 2024-08-08 |
Lactate metabolism coordinates macrophage response and regeneration in zebrafish
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.65235
PMID:35664055
|
研究论文 | 本研究使用斑马鱼模型和尾鳍切除作为强健的再生系统，通过单细胞RNA测序分析和全组织转录组分析，探索了组织截肢后基因表达的特定变化，并证实了乳酸途径在巨噬细胞反应和鳍再生中的作用 | 首次在体内解码了巨噬细胞微环境对代谢重编程的控制，并揭示了乳酸在巨噬细胞分化为促炎表型中的关键作用 | NA | 探索巨噬细胞在组织损伤和再生过程中的代谢适应和变化 | 斑马鱼的巨噬细胞和尾鳍再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |