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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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741 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis Identifies Cell-Type-Specific Genes Within Tumor Microenvironment as Prognostic Indicators in Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.878923
PMID:35707353
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研究论文 | 本研究通过综合分析确定了肿瘤微环境中特定细胞类型的基因作为肝细胞癌的预后标志物 | 开发了一种基于优化标志物的肝细胞癌复发预测模型,并验证了其在预测肝细胞癌复发中的独立性和优越性 | NA | 旨在提高肝细胞癌复发的预测准确性和理解其复发机制 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的特定细胞类型基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 训练和三个验证队列中的肝细胞癌样本 |
742 | 2024-08-08 |
Redefining the Foreign Antigen and Self-Driven Memory CD4+ T-Cell Compartments via Transcriptomic, Phenotypic, and Functional Analyses
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.870542
PMID:35707543
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析,重新定义了自我驱动记忆CD4+ T细胞和外来抗原特异性记忆CD4+ T细胞的亚群 | 首次识别出自我驱动记忆CD4+ T细胞的不同亚群,并揭示了这些亚群与传统外来抗原特异性记忆细胞在标记表达和功能上的差异 | NA | 重新定义和区分自我驱动记忆CD4+ T细胞和外来抗原特异性记忆CD4+ T细胞的亚群 | CD4+ T淋巴细胞的亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 细胞 | 多个CD4+ T细胞亚群 |
743 | 2024-08-08 |
A gastruloid model of the interaction between embryonic and extra-embryonic cell types
2022 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314221103042
PMID:35707767
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研究论文 | 本文报道了由小鼠胚胎干细胞(mESCs)和胚外内胚层(XEN)细胞组成的gastruloids的形成,并展示了这些XEN增强型gastruloids(XEGs)在神经上皮形成方面的特性 | 首次报道了XEN细胞与mESCs在gastruloids中的相互作用,以及这种相互作用对神经上皮组织形成的影响 | NA | 探索异型细胞间的相互作用及其在体外发育中的后果 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs)和胚外内胚层(XEN)细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序,成像技术,分化实验 | NA | 细胞 | NA |
744 | 2024-08-08 |
Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11A upregulation is a biomarker of poor prognosis in patients with head and neck squamous cell carcinoma
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0269166
PMID:35653344
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研究论文 | 本研究旨在探讨微粒体信号肽酶复合体(SPC)五个亚基基因(SEC11A、SEC11C、SPCS1、SPCS2和SPCS3)在头颈部鳞状细胞癌(HNSC)中的表达及其预后价值 | 发现SEC11A上调是头颈部鳞状细胞癌中的一个独立预后生物标志物,并与特定类型免疫细胞的浸润有关 | NA | 研究头颈部鳞状细胞癌中微粒体信号肽酶复合体亚基基因的表达及其预后价值 | 微粒体信号肽酶复合体五个亚基基因在头颈部鳞状细胞癌中的表达 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | 基因集富集分析(GSEA),单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自TCGA的头颈部鳞状细胞癌子集数据和一个先前的单细胞RNA测序数据集 |
745 | 2024-08-08 |
Intracranial Aneurysms Induced by RUNX1 Through Regulation of NFKB1 in Patients With Hypertension-An Integrated Analysis Based on Multiple Datasets and Algorithms
2022, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2022.877801
PMID:35655614
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研究论文 | 本研究旨在通过分析高血压患者颅内动脉瘤(IA)进展中的关键基因,识别潜在的治疗靶点 | 本研究通过整合多个数据集和算法,识别了RUNX1作为高血压患者颅内动脉瘤进展中的关键基因,并揭示了其通过调节NFKB1在单核细胞/巨噬细胞相关网络中的作用 | NA | 识别高血压患者颅内动脉瘤进展中的潜在治疗靶点 | 高血压患者的颅内动脉瘤进展 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | 支持向量机-递归特征消除算法 | 基因表达数据 | 包括高血压和颅内动脉瘤的批量RNA测序数据集,以及腹主动脉瘤患者的单细胞RNA测序数据集 |
746 | 2024-08-08 |
Leveraging Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data of NSCLC Tumor Microenvironment and Therapeutic Potential of NLOC-15A, A Novel Multi-Target Small Molecule
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.872470
PMID:35655775
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研究论文 | 本文通过分析大量和单细胞RNA测序数据,探讨了NSCLC肿瘤微环境及新型多靶点小分子NLOC-15A的治疗潜力 | 本文首次提供了NLOC-015A作为多靶点小分子抑制剂在治疗NSCLC中的临床前证据,并揭示了其在重塑肿瘤免疫微环境中的作用 | NA | 研究新型多靶点小分子NLOC-015A在治疗NSCLC中的疗效和机制 | NSCLC肿瘤微环境及NLOC-015A的作用机制 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个NSCLC患者的临床数据和细胞系 |
747 | 2024-08-08 |
Astrocyte Reprogramming in Stroke: Opportunities and Challenges
2022, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2022.885707
PMID:35663583
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞重编程在脑卒中治疗中的应用及其争议 | 介绍了通过靶向关键转录因子或微小RNA使小鼠脑中的星形胶质细胞重编程为功能性神经元的方法 | 目前缺乏细胞谱系追踪和单细胞测序实验来提供基因表达谱变化证据 | 探讨星形胶质细胞重编程的过程及其在脑卒中治疗中的应用 | 星形胶质细胞重编程及其在脑卒中治疗中的应用 | NA | 脑卒中 | 细胞谱系追踪和单细胞测序 | NA | 基因表达谱 | 小鼠脑中的星形胶质细胞 |
748 | 2024-08-08 |
Lessons From Transcriptome Analysis of Autoimmune Diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.857269
PMID:35663941
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综述 | 本文综述了转录组分析如何增进我们对自身免疫疾病中免疫细胞病理作用的认识,特别关注了ImmuNexUT数据库 | 介绍了单细胞RNA测序在识别各种自身免疫疾病病变中浸润免疫细胞的作用,以及eQTL分析在识别候选因果基因和免疫细胞中的应用 | NA | 总结转录组分析在自身免疫疾病中免疫细胞病理作用的理解上的进展 | 自身免疫疾病中的免疫细胞及其在疾病中的作用 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
749 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Cellular Functional Heterogeneity in Dermis Between Fibrotic and Regenerative Wound Healing Fates
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.875407
PMID:35664010
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术,详细分析了纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的类型和功能差异 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能不完全适用于人类伤口愈合的情况 | 旨在揭示纤维化和再生性伤口愈合过程中真皮细胞的功能异质性 | 纤维化和再生性伤口愈合过程中的真皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 纤维化和再生性伤口的真皮细胞 |
750 | 2024-08-08 |
Lactate metabolism coordinates macrophage response and regeneration in zebrafish
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.65235
PMID:35664055
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研究论文 | 本研究使用斑马鱼模型和尾鳍切除作为强健的再生系统,通过单细胞RNA测序分析和全组织转录组分析,探索了组织截肢后基因表达的特定变化,并证实了乳酸途径在巨噬细胞反应和鳍再生中的作用 | 首次在体内解码了巨噬细胞微环境对代谢重编程的控制,并揭示了乳酸在巨噬细胞分化为促炎表型中的关键作用 | NA | 探索巨噬细胞在组织损伤和再生过程中的代谢适应和变化 | 斑马鱼的巨噬细胞和尾鳍再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
751 | 2024-08-08 |
Single-cell landscape reveals active cell subtypes and their interaction in the tumor microenvironment of gastric cancer
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.71833
PMID:35664061
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了九名未转移的胃癌患者的肿瘤微环境,揭示了胃癌中的活跃细胞亚型及其相互作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胃癌肿瘤微环境中的细胞异质性,并发现了与免疫抑制和肿瘤血管生成相关的新分子标志物。 | 研究样本仅限于九名未转移的胃癌患者,可能限制了结果的普遍性。 | 深入理解胃癌的肿瘤细胞及其微环境,为开发新的治疗策略提供依据。 | 胃癌患者的肿瘤微环境中的单个细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 47,304个细胞来自九名患者 |
752 | 2024-08-08 |
New insights empowered by single-cell sequencing: From neural crest to enteric nervous system
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.025
PMID:35664232
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综述 | 本文综述了单细胞多模态测序技术在肠神经系统(ENS)研究中的最新发现,特别是基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)在人类和小鼠的ENS细胞中的应用 | 利用单细胞多模态测序技术探索染色质可及性、基因表达和空间转录组,为构建新的肠神经病变诊断框架提供了前所未有的资源 | NA | 总结单细胞多模态测序技术在肠神经系统研究中的应用,并讨论其在生物医学研究领域的潜在影响 | 肠神经系统细胞,包括前体细胞、神经嵴(NC)细胞和成熟的ENS电路 | 生物技术 | 肠神经病变 | 单细胞多模态测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类和小鼠的ENS细胞 |
753 | 2024-08-08 |
Prognostic Significance of Lineage Diversity in Bladder Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.862634
PMID:35664301
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,探讨了膀胱癌中细胞谱系的临床意义 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了膀胱癌中细胞谱系多样性与患者预后的关联 | NA | 探讨膀胱癌中细胞谱系多样性对患者预后的影响 | 膀胱癌患者的细胞谱系多样性及其临床意义 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 12,424个细胞 |
754 | 2024-08-08 |
Development of a Chemoresistant Risk Scoring Model for Prechemotherapy Osteosarcoma Using Single-Cell Sequencing
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.893282
PMID:35664733
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术,为化疗前骨肉瘤建立了一个有效的化疗耐药风险评分模型 | 本研究首次利用单细胞测序技术构建化疗耐药风险评分模型,相较于传统的基于大量RNA的模型,在验证环境中表现出更强的性能 | NA | 旨在理解和评估化疗前骨肉瘤的化疗耐药性 | 化疗前骨肉瘤的化疗耐药性 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO回归模型 | RNA数据 | 使用了TARGET-OS数据集作为训练组,GSE33382数据集作为验证组 |
755 | 2024-08-08 |
Using Single Cell Transcriptomics to Elucidate the Myeloid Compartment in Pancreatic Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.881871
PMID:35664793
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术解析胰腺癌中髓系细胞分化的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术定义人类胰腺导管腺癌中的髓系细胞区室,并阐明髓系细胞与其他肿瘤免疫微环境成分之间的相互作用 | 目前对胰腺导管腺癌中髓系细胞亚群的了解有限,尤其是在人类研究中 | 探讨调节髓系细胞功能的疗法可能增强胰腺导管腺癌标准治疗效果的可能性 | 胰腺导管腺癌中的髓系细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
756 | 2024-08-08 |
The Development of Mechanical Allodynia in Diabetic Rats Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.856299
PMID:35668789
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了糖尿病大鼠模型中机械性痛觉过敏(MA)相关的背根神经节(DRG)神经元的转录组变化 | 发现了在痛性糖尿病周围神经病变(PDPN)中的一种新型神经元类型MAAC,并揭示了其基因调控网络和细胞间通信机制 | NA | 探究糖尿病周围神经病变中神经转录变化,以深入理解其复杂的发病机制 | 糖尿病大鼠模型的背根神经节神经元 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
757 | 2024-08-08 |
Digital Cell Atlas of Mouse Uterus: From Regenerative Stage to Maturational Stage
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.847646
PMID:35669188
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据构建了从小鼠再生期到成熟期的子宫细胞图谱,详细描述了动情周期中上皮细胞、基质细胞和免疫细胞的转变 | 首次在单细胞水平上构建了从小鼠再生期到成熟期的子宫细胞图谱,提供了基于细胞学的更精确的子宫内膜变化阐释 | 研究结论可能受到参与研究的小鼠数量有限的限制 | 旨在提高我们对从小鼠再生期到成熟期子宫内膜转变的理解 | 小鼠子宫内膜在动情周期中的细胞转变 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠子宫样本 |
758 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics-Based Study of Transcriptional Regulatory Features in the Non-Obstructive Azoospermia Testis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.875762
PMID:35669193
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建转录调控网络,探讨非阻塞性无精症睾丸中转录因子的相互调控关系及因果关系 | 首次在非阻塞性无精症睾丸中发现特定的转录因子,并揭示这些因子在细胞命运、功能及微环境稳态中的重要作用 | NA | 探究非阻塞性无精症的转录调控特征 | 非阻塞性无精症睾丸中的转录因子及其调控网络 | 基因表达 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus数据库的GSE149512数据集 |
759 | 2024-08-08 |
Prostaglandin E2 Exerts Biphasic Dose Response on the PreBötzinger Complex Respiratory-Related Rhythm
2022, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2022.826497
PMID:35669453
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研究论文 | 研究前列腺素E2(PGE2)对preBötzinger复合体呼吸相关节律的双相剂量反应 | 首次揭示了PGE2在不同浓度下对呼吸节律的双相影响,并阐明了EP2和EP3受体在其中的作用机制 | 研究主要基于离体脑片实验,未来需在活体模型中验证结果 | 探讨PGE2在炎症过程中对呼吸功能的影响及其分子机制 | PGE2对preBötzinger复合体呼吸节律的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
760 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed Subtype-Specific Tumor Immune Microenvironments in Human Glioblastomas
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.914236
PMID:35669791
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了7名人类胶质母细胞瘤患者的手术切除肿瘤样本,揭示了肿瘤亚型特异性的免疫微环境 | 首次系统性地描述了不同肿瘤亚型与非恶性细胞之间的相互作用,以及它们如何共同塑造肿瘤微环境 | 研究样本仅限于7名患者,可能不足以代表所有胶质母细胞瘤的情况 | 探究人类胶质母细胞瘤中肿瘤亚型特异性的免疫微环境 | 人类胶质母细胞瘤的肿瘤亚型及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 7名胶质母细胞瘤患者 |