单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2024-08-08 |
CCL5-Secreting Virtual Memory CD8+ T Cells Inversely Associate With Viral Reservoir Size in HIV-1-Infected Individuals on Antiretroviral Therapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.897569
PMID:35720272
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研究论文 | 研究探讨了HIV-1感染者在抗逆转录病毒治疗(ART)下，CD8+ T细胞的效应分子和表型亚群与HIV-1 DNA及细胞相关未剪接RNA(CA usRNA)的相关性 | 发现CCL5分泌的虚拟记忆CD8+ T细胞亚群可能是HIV-1病毒库大小的潜在决定因素 | 研究对象仅为60名病毒学抑制的HIV-1感染者，样本量有限 | 揭示HIV-1感染者在ART下CD8+ T细胞的细胞和分子机制 | CD8+ T细胞的效应分子和表型亚群与HIV-1 DNA及CA usRNA的相关性 | NA | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 60名病毒学抑制的HIV-1感染者 |
| 722 | 2024-08-08 |
A Global Regulatory Network for Dysregulated Gene Expression and Abnormal Metabolic Signaling in Immune Cells in the Microenvironment of Graves' Disease and Hashimoto's Thyroiditis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.879824
PMID:35720300
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研究论文 | 本研究探讨了桥本甲状腺炎和格雷夫斯病中免疫细胞亚群异常表达基因和代谢信号的分子机制，并通过单细胞RNA测序等技术构建了免疫细胞的全球调控网络。 | 首次在单细胞水平上揭示了桥本甲状腺炎和格雷夫斯病中免疫细胞亚群的异常基因表达和代谢信号，并构建了免疫细胞的全球调控网络。 | 研究样本量较小，仅包括2名桥本甲状腺炎患者、2名格雷夫斯病患者和1名对照捐赠者。 | 阐明桥本甲状腺炎和格雷夫斯病中免疫细胞亚群异常免疫功能的分子机制。 | 桥本甲状腺炎和格雷夫斯病患者的甲状腺样本中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 甲状腺疾病 | 单细胞RNA测序、全转录组测序、全长转录组测序（Oxford Nanopore Technologies）、代谢组测序 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 2名桥本甲状腺炎患者、2名格雷夫斯病患者和1名对照捐赠者的甲状腺样本 |
| 723 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA and ATAC Sequencing Reveal Hemodialysis-Related Immune Dysregulation of Circulating Immune Cell Subpopulations
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.878226
PMID:35720370
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）技术，分析了健康对照组和维持性血液透析患者的循环免疫细胞亚群的转录组和染色质可及性特征 | 首次揭示了长期血液透析对循环免疫细胞亚群的转录程序和染色质可及性的影响 | NA | 探讨血液透析相关的免疫失调机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 健康对照组和维持性血液透析患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 健康对照组和维持性血液透析患者的PBMCs |
| 724 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis of the db/db Mouse Hippocampus Reveals Cell-Type-Specific Insights Into the Pathobiology of Diabetes-Associated Cognitive Dysfunction
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.891039
PMID:35721719
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了db/db小鼠海马体的细胞类型特异性变化，以揭示糖尿病相关认知功能障碍的病理生物学机制 | 首次在单细胞水平上揭示了糖尿病小鼠海马体中与炎症和氧化应激相关的细胞类型特异性基因表达变化，并发现了一种与促炎性疾病相关的微胶质细胞亚群 | 研究仅限于db/db小鼠模型，可能需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 深入了解糖尿病相关认知功能障碍的分子和细胞变化，并识别潜在的诊断生物标志物和治疗干预措施 | db/db小鼠的海马体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 14621个海马体细胞 |
| 725 | 2024-08-08 |
Identification of Type 2 Diabetes Biomarkers From Mixed Single-Cell Sequencing Data With Feature Selection Methods
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.890901
PMID:35721855
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研究论文 | 本研究通过特征选择方法从混合单细胞测序数据中识别出2型糖尿病的生物标志物 | 揭示了传统批量测序技术忽视的新型潜在致病机制，并发现了与2型糖尿病相关的新的基因 | NA | 探索2型糖尿病在分子层面的本质，并识别其在单细胞水平的差异表达特征 | 2型糖尿病患者的单细胞表达谱 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 1600多个单细胞，其中949个来自2型糖尿病患者，651个来自正常对照 |
| 726 | 2024-08-08 |
Single Cell Transcriptomic Analysis Reveals Organ Specific Pericyte Markers and Identities
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.876591
PMID:35722109
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，识别了特定组织中周细胞的特异性标记物 | 首次在肺、心脏、肾脏和膀胱中识别出特定周细胞标记物，并揭示了壁细胞之间的差异表达基因和功能关系 | NA | 识别周细胞特异性标记物，并揭示其在不同组织中的功能和关系 | 小鼠特定组织的周细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自小鼠肺、心脏、肾脏和膀胱的特定组织周细胞群体 |
| 727 | 2024-08-08 |
Correction: Differential expression profile of gluten-specific T cells identified by single-cell RNA-seq
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0270444
PMID:35727765
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 728 | 2024-08-08 |
Identification of Ligand-Receptor Pairs Associated With Tumour Characteristics in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.874056
PMID:35734169
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞测序数据，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤微环境中配体-受体（LR）对的复杂组成及其与肿瘤特征的关联 | 提出了基于46个LR对的新的分子亚型分类模型，并构建了LR.score模型用于准确预测ccRCC患者的预后 | NA | 识别与透明细胞肾细胞癌肿瘤特征相关的配体-受体对，并探索其在分子亚型分类和免疫治疗效果预测中的应用 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤微环境及其配体-受体对的表达模式和临床相关性 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自Gene expression omnibus数据库和TCGA-KIRC数据集的ccRCC患者数据 |
| 729 | 2024-08-08 |
Identification of the Immune Subtype of Hepatocellular Carcinoma for the Prediction of Disease-Free Survival Time and Prevention of Recurrence by Integrated Analysis of Bulk- and Single-Cell RNA Sequencing Data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.868325
PMID:35734185
|
研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，识别肝细胞癌的免疫亚型，用于预测无病生存时间并预防复发 | 构建了一种新的高效T细胞风险评分（TCRS），用于识别具有较长无病生存时间和炎症免疫特征的肝细胞癌患者免疫亚型 | NA | 预测肝细胞癌患者手术后的无病生存时间并预防复发 | 肝细胞癌患者的免疫细胞及其在无病生存时间预测和复发预防中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归模型 | RNA测序数据 | NA |
| 730 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Using Fluidigm C1 Platform for Characterization of Heterogeneous Transcriptomes
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2376-3_19
PMID:35737246
|
研究论文 | 本文详细介绍了一种使用Fluidigm C1平台进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析的工作流程和协议，并引入了验证差异基因表达的策略 | scRNA-seq技术能够在单细胞分辨率下表征转录组异质性 | NA | 表征转录组异质性 | 单细胞RNA测序分析 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | cDNA | 单细胞 |
| 731 | 2024-08-08 |
Can we infer tumor presence of single cell transcriptomes and their tumor of origin from bulk transcriptomes by machine learning?
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.035
PMID:35685355
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研究论文 | 研究使用机器学习模型从批量转录组数据中推断单细胞转录组的肿瘤存在及其原发肿瘤类型 | 引入scTumorTrace方法，该方法使用转录组范围内的2元组，无需标准化且不受log2转换量的限制，能够从批量转录组数据中推断单细胞转录组的肿瘤存在及其原发肿瘤类型 | 现有的机器学习模型中，只有scTumorTrace适用于单细胞转录组数据，其他模型均不适用 | 探索是否可以从批量转录组数据中使用机器学习模型推断单细胞转录组的肿瘤存在及其原发肿瘤类型 | 单细胞转录组数据和批量转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | k-最近邻，一对多支持向量机，一对一支持向量机，随机森林，scTumorTrace | 转录组数据 | 包含白细胞和七种主要癌症类型的实验数据 |
| 732 | 2024-08-08 |
Genome-wide characterization of RNA editing highlights roles of high editing events of glutamatergic synapse during mouse retinal development
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.029
PMID:35685368
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研究论文 | 本文通过全基因组筛选高可信度的RNA编辑事件，揭示了RNA编辑在小鼠视网膜发育中的动态转录调控作用 | 首次系统地分析了小鼠视网膜发育过程中RNA编辑的模式及其对神经递质受体功能的调控作用 | NA | 探讨RNA编辑在小鼠视网膜发育中的作用及其机制 | 小鼠视网膜发育过程中的RNA编辑事件 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 2000个高可信度编辑位点，跨越八个发育阶段的视网膜 |
| 733 | 2024-08-08 |
Constructing a Prognostic Gene Signature for Lung Adenocarcinoma Based on Weighted Gene Co-Expression Network Analysis and Single-Cell Analysis
2022, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S353848
PMID:35685695
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研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析和单细胞分析技术构建了肺腺癌的预后基因标志物 | 利用先进的单细胞RNA测序技术分析肿瘤内异质性，提高了基于单细胞表达数据识别生物标志物的准确性，从而有助于预测癌症患者的预后并辅助癌症治疗决策 | NA | 构建肺腺癌的预后基因标志物 | 肺腺癌及其癌旁组织样本 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 包含两个肺腺癌和两个癌旁组织样本的scRNA-seq数据 |
| 734 | 2024-08-08 |
The Chemokines Initiating and Maintaining Immune Hot Phenotype Are Prognostic in ICB of HNSCC
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.820065
PMID:35692828
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，探索了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中肿瘤相关巨噬细胞（TAMM）的异质性与免疫特性和预后的关系，并利用深度学习框架构建神经网络模型预测抗PD-1/PDL-1治疗的疗效。 | 本研究首次通过网络拓扑结构筛选出CXCL9、10、11和CCL5等关键基因，这些基因在HNSCC中启动和维持免疫热表型，并通过构建神经网络模型预测抗PD-1/PDL-1治疗的疗效。 | NA | 探索HNSCC中TAMM异质性对免疫反应的调控作用及预测ICB治疗的有效性。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMM）及其免疫反应。 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 神经网络模型 | RNA测序数据 | NA |
| 735 | 2024-08-08 |
Identification of Biomarkers for Predicting Ovarian Reserve of Primordial Follicle via Transcriptomic Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.879974
PMID:35692832
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研究论文 | 本研究通过转录组分析，识别与原始卵泡池卵巢储备相关的基因标志物 | 首次识别出与原始卵泡池卵巢储备高度相关的基因，这些基因可能作为预测卵巢储备的生物标志物 | NA | 识别用于预测原始卵泡卵巢储备的生物标志物 | 小鼠卵巢的批量RNA-seq数据和不同发育阶段的卵泡单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的小鼠卵巢批量RNA-seq数据和不同阶段的卵泡单细胞RNA-seq数据 |
| 736 | 2024-08-08 |
SpatialMap: Spatial Mapping of Unmeasured Gene Expression Profiles in Spatial Transcriptomic Data Using Generalized Linear Spatial Models
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.893522
PMID:35692845
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研究论文 | 本文开发了一种名为SpatialMap的计算方法，用于整合单细胞RNA测序数据和基于图像的转录组学数据，以实现空间转录组数据中未测量基因表达谱的空间映射 | SpatialMap通过广义线性空间模型直接建模空间基因表达数据，并使用条件自回归（CAR）先验考虑空间位置之间的相关性，采用基于惩罚拟似然（PQL）的算法进行大规模空间映射分析 | NA | 旨在开发一种方法，将单细胞RNA测序数据与基于图像的转录组学数据整合，以实现空间转录组数据中未测量基因表达谱的空间映射 | 单细胞RNA测序数据和基于图像的转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 广义线性空间模型 | 基因表达数据 | 四个公开可用的组织配对研究 |
| 737 | 2024-08-08 |
MYBL2 accelerates epithelial-mesenchymal transition and hepatoblastoma metastasis via the Smad/SNAI1 pathway
2022, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:35693071
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了来自两名肝母细胞瘤患者的25,264个转移细胞的转录组特征，发现MYBL2通过Smad/SNAI1途径加速上皮-间质转化和肝母细胞瘤转移。 | 首次揭示了MYBL2在肝母细胞瘤转移中的作用及其通过Smad/SNAI1途径调控上皮-间质转化的机制。 | 研究主要集中在体外和体内实验验证，需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 探究肝母细胞瘤转移的分子机制及其关键调控因子。 | 肝母细胞瘤转移细胞及其转录组特征。 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 25,264个转移细胞 |
| 738 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Signatures and Alterations of Microglia Associated With Glioblastoma Associate Microglia Contribution to Tumor Formation
2022, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2022.1610067
PMID:35693633
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据揭示了胶质母细胞瘤中微胶质细胞的异质性，并探讨了不同微胶质细胞亚型在肿瘤发生和发展中的作用 | 研究首次利用单细胞RNA测序技术分析了胶质母细胞瘤中微胶质细胞的转录组特征和变化，为胶质母细胞瘤的免疫治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 探讨微胶质细胞在胶质母细胞瘤发生和发展中的作用，寻找新的免疫治疗靶点 | 胶质母细胞瘤中的微胶质细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 739 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Immune Cell Heterogeneity in IgG4-Related Disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.904288
PMID:35693817
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了IgG4相关疾病患者外周血单个核细胞中的免疫细胞异质性及其转录特征 | 首次在单细胞水平上揭示了IgG4相关疾病中免疫细胞亚群的转录谱，并发现了特定细胞亚群和通路的变化 | 研究样本量较小，仅包括四名患者和三名健康对照 | 探究IgG4相关疾病中免疫细胞的异质性和转录特征 | IgG4相关疾病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 免疫介导疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 四名IgG4相关疾病患者和三名健康对照 |
| 740 | 2024-08-08 |
Comparative Analysis of Single-Cell Transcriptome Data Reveals a Novel Role of Keratinocyte-Derived IL-23 in Psoriasis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.905239
PMID:35693818
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研究论文 | 本研究通过分析公开的单细胞转录组测序数据，探讨了角质形成细胞衍生的IL-23在银屑病中的存在及其潜在作用 | 发现角质形成细胞衍生的IL-23与IL-36在银屑病进展中的新关联 | NA | 确定角质形成细胞衍生的IL-23在银屑病中的存在及其潜在作用 | 角质形成细胞衍生的IL-23及其在银屑病中的作用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用公开的人类样本数据和咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型 |