单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-08-08 |
A Novel Artificial Neural Network Prognostic Model Based on a Cancer-Associated Fibroblast Activation Score System in Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.927041
PMID:35874676
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研究论文 | 本文构建了一种基于癌症相关成纤维细胞激活评分系统的新型人工神经网络预测模型，用于肝细胞癌的预后评估 | 本文创新性地利用12个癌症相关成纤维细胞相关基因构建了人工神经网络模型，并通过功能、突变、免疫和临床分析揭示了模型的信息 | NA | 识别肝细胞癌进展机制并预测患者预后 | 肝细胞癌患者及其癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组和配体-受体相互作用分析 | 人工神经网络（ANN） | 基因表达数据 | 数据来自The Cancer Genome Atlas、International Cancer Genome Consortium和Gene Expression Omnibus数据库 |
| 642 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis From Multicenter Studies Identifies a WGCNA-Derived Cancer-Associated Fibroblast Signature for Ovarian Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.951582
PMID:35874760
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研究论文 | 本研究通过多中心研究的综合分析，利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）鉴定了与卵巢癌相关的癌症相关成纤维细胞（CAF）特征。 | 首次通过多中心研究的综合分析，利用WGCNA方法鉴定了与卵巢癌相关的CAF特征，并构建了预后标志物。 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证。 | 旨在鉴定与卵巢癌高发病率和死亡率相关的CAF预后基因。 | 卵巢癌患者的癌症相关成纤维细胞及其预后基因。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 机器学习 | 基因表达数据 | 2742名患者 |
| 643 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unravels Distinct Tumor Microenvironment of Different Components of Lung Adenocarcinoma Featured as Mixed Ground-Glass Opacity
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.903513
PMID:35874770
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了混合磨玻璃影特征的肺腺癌中不同成分的肿瘤微环境差异 | 首次通过单细胞测序技术，详细分析了混合磨玻璃影肺腺癌中固体成分和磨玻璃成分的细胞组成和转录组特征 | 研究样本仅限于三名患者的六对成分，可能限制了结果的普遍性 | 探究混合磨玻璃影特征的肺腺癌中不同成分的肿瘤微环境差异及其机制 | 混合磨玻璃影肺腺癌的固体成分和磨玻璃成分 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 19,391个单细胞数据，来自三名患者的六对成分 |
| 644 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Immune Cells Reveal Diversity and Exhaustion Signatures in Non-Small-Cell Lung Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.854724
PMID:35874785
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了非小细胞肺癌患者肿瘤、正常组织和血液中的CD45免疫细胞，揭示了免疫细胞的多样性和耗竭特征。 | 本文首次识别出三种具有免疫抑制作用的免疫细胞簇，包括耗竭的CD8 T细胞、具有促炎M2表型的肿瘤相关巨噬细胞和具有肿瘤促进特性的调节性B细胞。 | NA | 旨在理解肿瘤微环境中免疫细胞表型，以解释和预测非小细胞肺癌的进展及其对免疫治疗的反应。 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤、正常组织和血液中的CD45免疫细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 645 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Pathogenic Relevance of Intracranial Atherosclerosis in Blood Blister-Like Aneurysms
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.927125
PMID:35874788
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了颅内非分支部位血泡样动脉瘤（BBA）与颅内动脉粥样硬化的致病相关性 | 首次通过单细胞RNA测序技术研究BBA的转录组景观，揭示了其与颅内动脉粥样硬化的致病相关性 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的颅内动脉瘤类型 | 探究颅内血泡样动脉瘤的转录组景观及其与颅内动脉粥样硬化的潜在致病机制 | 颅内血泡样动脉瘤和囊状颅内动脉瘤的细胞 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat-based pipeline | 细胞 | 12,245个细胞来自1个BBA和2个囊状颅内动脉瘤，以及10个BBA和30个颅内动脉瘤用于病理验证 |
| 646 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Difference in Human Normal and Degenerative Nucleus Pulposus Tissue Profiles and Cellular Interactions
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.910626
PMID:35874809
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序技术，比较了人类正常和退变髓核细胞的表达谱，揭示了两者在细胞类型和功能上的差异 | 首次在椎间盘组织单细胞转录组测序研究中发现并鉴定了表达疼痛炎症基因的软骨细胞4和钙化软骨细胞5 | NA | 阐明人类正常和退变髓核细胞的转录组差异表达谱，探索其细胞异质性及功能 | 人类正常髓核细胞（NNP）和退变髓核细胞（DNP） | 数字病理学 | 椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两组样本，分别包含正常和退变的髓核细胞 |
| 647 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing for Analyzing the Intestinal Tract in Healthy and Diseased Individuals
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.915654
PMID:35874838
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在健康和患病个体肠道分析中的应用 | scRNA-seq技术能够揭示在整体水平上难以观察到的罕见和中间细胞状态 | NA | 探讨scRNA-seq在识别新的细胞亚型和状态、目标以及解释肠道疾病分子机制中的应用 | 肠道中的不同细胞系及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 648 | 2024-08-08 |
Arecoline Is Associated With Inhibition of Cuproptosis and Proliferation of Cancer-Associated Fibroblasts in Oral Squamous Cell Carcinoma: A Potential Mechanism for Tumor Metastasis
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.925743
PMID:35875097
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研究论文 | 本文探讨了槟榔碱与口腔鳞状细胞癌（OSCC）中铜死亡和癌症相关成纤维细胞（CAFs）增殖的抑制之间的关系，以及这种关系对肿瘤转移的可能机制。 | 首次揭示了槟榔碱通过影响铜死亡和CAFs的增殖，可能在OSCC的转移中发挥重要作用。 | 研究主要基于基因表达数据和细胞实验，缺乏临床样本的直接验证。 | 探究槟榔碱在口腔鳞状细胞癌转移中的作用机制。 | 口腔鳞状细胞癌、癌症相关成纤维细胞、槟榔碱的作用。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 基因表达分析、LASSO回归、GO和KEGG分析、单细胞测序。 | NA | 基因表达数据 | GSE139869数据集（n=10）和TCGA-OSCC数据集（n=361）。 |
| 649 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of the immune space-time landscape reveals dendritic cell regulatory program in polymicrobial sepsis
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72760
PMID:35832091
|
研究论文 | 本研究利用多隔室单细胞RNA测序技术，分析了脓毒症进展过程中免疫细胞亚群的异质性，并揭示了树突状细胞在脓毒症中的免疫调节程序。 | 首次全面描绘了多微生物脓毒症的单细胞免疫时空景观，并发现了树突状细胞中与超炎症和器官功能障碍相关的保守且可靶向的免疫调节程序。 | NA | 揭示脓毒症中宿主免疫反应的全面视图，并探索树突状细胞在脓毒症中的免疫调节功能。 | 小鼠脓毒症模型中的免疫细胞亚群，特别是树突状细胞。 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型中的多个免疫相关组织部位 |
| 650 | 2024-08-08 |
Concordant and Heterogeneity of Single-Cell Transcriptome in Cardiac Development of Human and Mouse
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.892766
PMID:35832197
|
研究论文 | 本研究基于人类和小鼠胚胎心脏的单细胞转录组数据，鉴定了几种主要类型的心脏细胞，并比较了这些细胞在两个物种中的发育阶段相似性 | 首次详细比较了人类和小鼠心脏细胞在发育过程中的转录组异同，并确定了物种共享和物种特异的标记基因 | NA | 揭示哺乳动物心脏发育的异同，为研究心脏细胞类型和发育轨迹提供资源 | 人类和小鼠的胚胎心脏细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的胚胎心脏细胞 |
| 651 | 2024-08-08 |
Bulk RNA Sequencing With Integrated Single-Cell RNA Sequencing Identifies BCL2A1 as a Potential Diagnostic and Prognostic Biomarker for Sepsis
2022, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2022.937303
PMID:35832273
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研究论文 | 本研究通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，识别出BCL2A1作为脓毒症潜在的诊断和预后生物标志物 | 首次通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，识别出BCL2A1作为脓毒症的潜在生物标志物 | NA | 旨在发现新的脓毒症相关生物标志物，并验证其诊断和预后价值 | 脓毒症及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | 随机森林回归分析 | RNA序列 | 141个候选基因，17个预后基因 |
| 652 | 2024-08-08 |
Revealing the Key MSCs Niches and Pathogenic Genes in Influencing CEP Homeostasis: A Conjoint Analysis of Single-Cell and WGCNA
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.933721
PMID:35833124
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和加权基因共表达网络分析（WGCNA），系统分析了软骨终板（CEP）中的感兴趣模块、免疫浸润情况和细胞微环境，揭示了CEP中间充质干细胞群体的复杂性和表型特征。 | 首次结合scRNA-seq和WGCNA技术，全面分析了CEP中的细胞异质性和基因共表达网络，揭示了CEP中关键的间充质干细胞微环境和致病基因。 | NA | 揭示软骨终板（CEP）中的间充质干细胞群体复杂性和表型特征，以及这些细胞在维持CEP稳态中的作用。 | 软骨终板（CEP）中的间充质干细胞和其他细胞成分。 | 数字病理学 | 退行性椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | RNA | 8个不同的细胞亚群 |
| 653 | 2024-08-08 |
Checkpoint Inhibitors Modulate Plasticity of Innate Lymphoid Cells in Peripheral Blood of Patients With Hepatocellular Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.849958
PMID:35833139
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研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点抑制剂对肝细胞癌患者外周血中固有淋巴细胞（ILC）可塑性的影响 | 首次探索了ILC在外周血中的存在及其在免疫检查点抑制剂治疗中的作用和功能 | NA | 研究免疫检查点抑制剂对肝细胞癌患者外周血中ILC组成和可塑性的影响 | 肝细胞癌患者外周血中的固有淋巴细胞（ILC） | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 细胞 | 大型肝细胞癌队列 |
| 654 | 2024-08-08 |
Overexpression of LIMA1 Indicates Poor Prognosis and Promotes Epithelial-Mesenchymal Transition in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2022, Clinical Medicine Insights. Oncology
DOI:10.1177/11795549221109493
PMID:35837368
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研究论文 | 本文研究了LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其对患者预后的影响 | 首次全面探讨了LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的恶性行为及其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其对患者预后的影响 | LIMA1在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其对肿瘤细胞功能状态的影响 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 多组学研究 | NA | 基因组数据 | 基于The Cancer Genome Atlas数据 |
| 655 | 2024-08-08 |
Response: Commentary: Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted CoExpression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.923283
PMID:35837392
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 656 | 2024-08-08 |
Vascular Regulation by Super Enhancer-Derived LINC00607
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.881916
PMID:35837599
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研究论文 | 研究探讨了超级增强子衍生的长非编码RNA LINC00607在人动脉内皮细胞中的表达及其对糖尿病条件下血管细胞基因调控网络的影响 | 首次展示了LINC00607在糖尿病患者动脉中的高表达，并证明了其通过c-Myc转录因子调控内皮细胞和血管平滑肌细胞的转录组 | NA | 研究LINC00607在血管细胞中的功能及其在糖尿病等疾病中的作用 | 人动脉内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康和糖尿病捐赠者的人动脉样本 |
| 657 | 2024-08-08 |
Deciphering the Intercellular Communication Between Immune Cells and Altered Vascular Smooth Muscle Cell Phenotypes in Aortic Aneurysm From Single-Cell Transcriptome Data
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.936287
PMID:35837612
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据分析，揭示了主动脉瘤中免疫细胞与血管平滑肌细胞（VSMC）之间的细胞间通讯及其在主动脉瘤发展中的作用 | 首次详细分析了主动脉瘤中免疫细胞与VSMC之间的细胞间通讯网络，并识别了关键的信号通路和配体-受体对 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及实验验证所有识别的信号通路和配体-受体对 | 探讨主动脉瘤中VSMC表型转换的驱动因素及其在疾病中的作用 | 主动脉瘤中的免疫细胞和VSMC | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8个主动脉瘤样本和3个正常主动脉样本，共42,611个细胞 |
| 658 | 2024-08-08 |
T Cells With Activated STAT4 Drive the High-Risk Rejection State to Renal Allograft Failure After Kidney Transplantation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.895762
PMID:35844542
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研究论文 | 本研究利用统一流形近似和投影及莱顿算法分析2611个公开的肾移植微阵列数据集，揭示了六种排斥状态及其特征基因，并识别出与高风险排斥状态相关的T细胞群，通过构建基因调控网络，发现激活的STAT4作为核心转录因子与移植肾功能和预后密切相关。 | 本研究首次揭示了肾移植后的六种排斥状态及其特征基因，并识别出与高风险排斥状态相关的T细胞群，为精确诊断肾移植排斥进展提供了新策略。 | NA | 研究肾移植后排斥状态的分子机制，以提高排斥反应的诊断和治疗水平。 | 肾移植排斥状态及其相关基因和细胞群。 | NA | 肾移植 | 微阵列数据分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2611个微阵列数据集 |
| 659 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unravels Upregulation of Immune Cell Crosstalk in Relapsed Pediatric Ependymoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.903246
PMID:35844565
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了儿童复发性室管膜瘤中免疫细胞间相互作用的增强 | 采用了一种新的轨迹评分方法来揭示与不良生存结果相关的细胞组成，并识别了复发和原发样本之间的潜在细胞间通信特征 | NA | 研究儿童室管膜瘤的肿瘤内异质性及其对生存结果的影响 | 儿童室管膜瘤的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 660 | 2024-08-08 |
Mapping the Tumor Microenvironment in TNBC and Deep Exploration for M1 Macrophages-Associated Prognostic Genes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.923481
PMID:35844580
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，探索了三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤微环境和M1巨噬细胞相关的预后基因 | 发现了与M1巨噬细胞密切相关的三个标记基因IFI35、PSMB9和SAMD9L，其中IFI35与巨噬细胞激活、趋化性和迁移正相关，且高表达IFI35的患者预后更好 | NA | 研究TNBC的肿瘤微环境和M1巨噬细胞相关的预后基因 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤微环境和M1巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 使用了公共数据库和本研究队列的数据 |