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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Atlas Reveals the Tumor Microenvironment of Metastatic High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.923194
PMID:35935940
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,揭示了转移性高级别浆液性卵巢癌的肿瘤微环境特征 | 发现了ERBB2和HOXB-AS3基因在转移性肿瘤中的扩增,以及与上皮-间质转化相关的恶性细胞和癌症相关成纤维细胞的特征 | NA | 探究转移性高级别浆液性卵巢癌的分子机制和生物学特性 | 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)的原发和转移样本,以及子宫内膜样癌(EC)样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括高级别浆液性卵巢癌的原发和转移样本,以及子宫内膜样癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 622 | 2024-08-08 |
Receptor-ligand pair typing and prognostic risk model for papillary thyroid carcinoma based on single-cell sequencing
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.902550
PMID:35935973
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序技术,分析了乳头状甲状腺癌(PTC)微环境中的细胞间通讯网络,并通过配体-受体(LR)对开发了一种新的PTC分子表型,同时建立了一个风险模型来预测患者对PD-1阻断免疫治疗的反应 | 首次基于单细胞测序数据,通过LR对分析细胞间通讯网络,并开发了新的PTC分子表型和风险模型来预测免疫治疗反应 | NA | 研究乳头状甲状腺癌的细胞间通讯网络及其对免疫治疗反应的预测 | 乳头状甲状腺癌的细胞间通讯网络和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Lasso Cox回归 | RNA测序数据 | 使用了来自GSE184362的单细胞测序数据和来自The Cancer Genome Atlas的批量肿瘤RNA测序数据,以及IMvigor210和GSE78220队列作为外部验证 | NA | NA | NA | NA |
| 623 | 2024-08-08 |
Comprehensive Network Analysis Reveals the Targets and Potential Multitarget Drugs of Type 2 Diabetes Mellitus
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/8255550
PMID:35936218
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA表达谱分析、网络药理学和分子对接技术,探索了2型糖尿病的新治疗靶点和候选药物 | 本研究首次识别CCR5作为2型糖尿病的潜在治疗靶点,并筛选出DB05494作为潜在的多靶点药物 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和分子对接模拟,未进行临床试验验证 | 探索2型糖尿病的新治疗靶点和候选药物 | 2型糖尿病患者的胰岛细胞样本 | 分子生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、分子对接 | NA | RNA表达谱 | 11个细胞集群,其中3个(C2、C8和C10)在2型糖尿病样本和正常样本间有显著差异 | NA | NA | NA | NA |
| 624 | 2024-08-08 |
Full-Length Spatial Transcriptomics Reveals the Unexplored Isoform Diversity of the Myocardium Post-MI
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.912572
PMID:35937994
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研究论文 | 本文介绍了单细胞纳米孔空间转录组学(scNaST)软件套件,用于分析来自第二代和第三代测序的空间基因表达,生成组织微环境的近单细胞转录组全景图。 | 首次使用scNaST软件套件结合Visium空间平台,成功分析了心肌梗死后小鼠心脏的完整转录组,并识别了未被充分研究的转录本多样性。 | NA | 探索心肌梗死后心肌组织中未被充分研究的转录本多样性。 | 心肌梗死后小鼠心脏的四个短轴切片。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞纳米孔空间转录组学(scNaST) | NA | 转录组数据 | 19,794个转录本 | NA | NA | NA | NA |
| 625 | 2024-08-08 |
8-Gene signature related to CD8+ T cell infiltration by integrating single-cell and bulk RNA-sequencing in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.938611
PMID:35938006
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,在头颈鳞状细胞癌中建立与CD8+ T细胞浸润相关的8基因分子特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据的整合,识别出与头颈鳞状细胞癌中CD8+ T细胞浸润相关的8基因特征,为免疫治疗提供了新的生物标志物 | NA | 旨在为头颈鳞状细胞癌建立与CD8+ T细胞浸润相关的分子特征,以作为癌症免疫治疗的生物标志物 | 头颈鳞状细胞癌中的CD8+ T细胞浸润及相关基因 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析(WGCNA), LASSO-Cox分析 | NA | RNA测序数据 | 215个差异表达的免疫相关基因,其中45个与头颈鳞状细胞癌的总体生存相关,基于8个基因建立风险模型 | NA | NA | NA | NA |
| 626 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of CRIP1 Expression in Acute Myeloid Leukemia
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.923568
PMID:35938037
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因表达数据分析了t(8;21)急性髓系白血病患者的免疫和调控网络,并验证了CRIP1表达与甲基化状态的关系 | 首次全面分析了CRIP1在急性髓系白血病中的表达及其对免疫相关通路的影响 | 研究仅限于t(8;21)急性髓系白血病患者,可能不适用于所有AML患者 | 探讨CRIP1在急性髓系白血病中的表达调控及其对治疗策略的影响 | 急性髓系白血病患者的CRIP1表达及其免疫调控网络 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个独立队列,分别来自GSE37642和The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 627 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals male germ cells and Sertoli cells developmental patterns in dairy goats
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.944325
PMID:35938151
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了奶山羊中雄性生殖细胞和Sertoli细胞的发育模式 | 首次系统地研究了奶山羊中雄性生殖细胞和Sertoli细胞的发育模式,并识别了与关键发育事件相关的基因 | NA | 旨在识别与奶山羊雄性生殖细胞和Sertoli细胞关键发育事件相关的基因 | 奶山羊的雄性生殖细胞和Sertoli细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 25,373个细胞来自45天(青春期前)、90天(青春期)和180天(青春期后)的奶山羊睾丸 | NA | NA | NA | NA |
| 628 | 2024-08-08 |
Reconstruction of the Global Polarity of an Early Spider Embryo by Single-Cell and Single-Nucleus Transcriptome Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.933220
PMID:35938158
|
研究论文 | 本文通过单细胞和单核转录组分析,重建了早期蜘蛛胚胎的全球极性 | 应用单细胞RNA测序技术,成功检测到与胚层和一些瞬态细胞状态相对应的3种细胞群体,并展示了这些数据资源在全基因组范围内搜索空间调控表达基因的应用潜力 | 文中未明确提及具体限制 | 研究早期蜘蛛胚胎中基于极性的细胞状态多样性的生成和发展 | 早期蜘蛛胚胎的细胞极性和细胞状态 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约2000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 629 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Proliferative Phase Endometrium: Systems Analysis of Cell-Cell Communication Network Using CellChat
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.919731
PMID:35938159
|
研究论文 | 研究使用单细胞转录组学分析人类增殖期子宫内膜细胞间的相互作用网络 | 首次详细描绘了增殖期子宫内膜细胞间的相互作用网络,并验证了与子宫内膜生长高度相关的信号通路 | NA | 深入理解子宫内膜细胞间的通信机制 | 人类增殖期子宫内膜细胞及其相互作用 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | CellChat | 转录组 | 33,240个初级子宫内膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 630 | 2024-08-08 |
A single cell survey of the microbial impacts on the mouse small intestinal epithelium
2022 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2022.2108281
PMID:35939622
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了无菌和特定病原体无菌小鼠的小肠上皮细胞,以研究微生物与上皮细胞之间的相互作用。 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了微生物对小肠上皮细胞的转录和细胞影响,特别是微生物如何通过调节代谢基因表达和mTOR信号通路来影响上皮细胞。 | 研究仅限于无菌和特定病原体无菌小鼠模型,可能无法完全代表所有微生物对小肠上皮细胞的影响。 | 探讨微生物与小肠上皮细胞之间的动态关系及其对生理炎症和耐受性的影响。 | 小肠上皮细胞及其与肠道微生物的相互作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 无菌和特定病原体无菌小鼠的小肠上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 631 | 2024-08-08 |
Preparation of acute midbrain slices containing the superior colliculus and periaqueductal Gray for patch-clamp recordings
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0271832
PMID:35951507
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研究论文 | 本文提供了一种实用的指南,用于制备包含上丘和导水管周围灰质的年轻成年小鼠中脑冠状切片,以进行电生理实验 | 介绍了两种不同的溶液及其各自的孵育策略,以及两种脑提取的替代程序 | NA | 研究中脑神经元的电生理特性 | 年轻成年小鼠的中脑切片 | NA | NA | 膜片钳记录 | NA | 切片 | 野生型小鼠以及经过基因修饰或病毒转染的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 632 | 2024-08-08 |
Identification and Quantification of Microexons Using Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2521-7_8
PMID:35895262
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MicroExonator的可重复计算工作流程,用于使用批量或单细胞RNA-seq数据进行微外显子剪接分析 | 提出了专门用于检测和量化微外显子的计算工作流程MicroExonator | NA | 改进对转录组的表征和理解,特别是扩展替代剪接事件的目录 | 微外显子,即长度可达30 nt的极短外显子 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 633 | 2024-08-08 |
Bioinformatics Analysis Identifies Potential Ferroptosis Key Gene in Type 2 Diabetic Islet Dysfunction
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.904312
PMID:35898457
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析,筛选出与2型糖尿病胰岛β细胞功能障碍相关的潜在铁死亡关键基因 | 首次揭示了铁死亡与2型糖尿病胰岛β细胞功能障碍之间的关系,并筛选出潜在的关键基因MGST1 | 仅在两个数据集中验证了MGST1,需要更多实验和数据集来进一步验证 | 旨在筛选潜在的铁死亡关键基因,揭示2型糖尿病胰岛β细胞功能障碍的潜在生理和病理过程 | 2型糖尿病胰岛β细胞功能障碍及其与铁死亡的关系 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 89个2型糖尿病关键基因,3个2型糖尿病-铁死亡相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 634 | 2024-08-08 |
Characterization of Immune-Related Molecular Subtypes and a Prognostic Signature Correlating With the Response to Immunotherapy in Patients With Gastric Cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.939836
PMID:35898512
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研究论文 | 本研究通过无监督共识聚类定义了两种基于免疫相关失调基因的分子亚型,并建立了与免疫治疗反应相关的免疫相关预后签名 | 首次定义了胃癌的免疫相关分子亚型,并构建了与免疫治疗反应相关的预后签名 | NA | 探索胃癌的肿瘤免疫微环境并定义分子亚型,以增强个性化治疗和临床决策 | 胃癌患者的免疫相关分子亚型及预后签名 | 数字病理学 | 胃癌 | RT-qPCR | LASSO-Cox回归分析 | scRNA-seq数据 | 包括三个独立的外部队列和IMvigor210队列的胃癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 635 | 2024-08-08 |
Cebpb Regulates Skeletal Stem Cell Osteogenic Differentiation and Fracture Healing via the WNT/β-Catenin Pathway
2022, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2022/2091615
PMID:35898655
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研究论文 | 研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了Cebpb转录因子通过WNT/β-Catenin信号通路调控骨骼干细胞成骨分化和骨折愈合的机制 | 首次证明Cebpb通过抑制WNT/β-Catenin信号通路促进骨骼干细胞的成骨分化和骨折愈合 | NA | 探讨骨骼干细胞分化和骨折愈合的机制,以开发新的治疗策略 | 骨骼干细胞(SSC)和小鼠成骨前体细胞 | NA | 骨折 | scRNA-seq, FACS, qPCR, 免疫印迹, 碱性磷酸酶测定, 茜素红S染色, 微CT, 力学测试 | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨骼干细胞和小鼠成骨前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 636 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomics for Tumor Heterogeneity Analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.906158
PMID:35899203
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综述 | 本文综述了空间转录组学在肿瘤异质性研究中的应用,包括发现新的空间依赖性机制、肿瘤免疫微环境、基质微环境以及癌症的病理分类和预后 | 空间转录组学通过提供定位索引的基因表达信息,有望解码癌症的复杂异质性 | 讨论了空间转录组学技术在癌症应用中的未来挑战和机遇 | 更好地理解癌症异质性,以促进更精确的诊断和改善患者预后 | 肿瘤异质性、空间依赖性机制、肿瘤免疫微环境、基质微环境以及癌症的病理分类和预后 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 637 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals the Crosstalk Propensity Between the Tumor Intermediate State and the CD8+ T Exhausted State to be Associated with Clinical Benefits in Melanoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.766852
PMID:35903095
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析了黑色素瘤中肿瘤细胞与CD8+ T细胞之间的交叉对话倾向性,并探讨了这种倾向性对临床结果的影响 | 首次揭示了肿瘤中间状态与CD8+ T细胞耗竭状态之间的交叉对话倾向性,并验证了其在样本层面的临床意义 | NA | 探讨黑色素瘤中肿瘤细胞与CD8+ T细胞之间的交叉对话倾向性及其对临床结果的影响 | 肿瘤细胞与CD8+ T细胞的交叉对话倾向性 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 638 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis of Bulk RNA-Seq and Single-Cell RNA-Seq Unveils the Characteristics of the Immune Microenvironment and Prognosis Signature in Prostate Cancer
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/6768139
PMID:35909899
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示了前列腺癌中免疫微环境的特征及其预后标志 | 本研究首次通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据,识别了前列腺癌中关键的细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 研究主要基于已有的测序数据,未来需要更多的临床样本验证这些发现 | 探讨前列腺癌中免疫微环境的分子机制及其在疾病发生中的作用 | 前列腺癌中的免疫微环境及其预后标志 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络 | RNA测序数据 | 144个自然杀伤细胞相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 639 | 2024-08-08 |
Enriched circulating and tumor-resident TGF-β+ regulatory B cells in patients with melanoma promote FOXP3+ Tregs
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2104426
PMID:35909944
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研究论文 | 研究探讨了黑色素瘤患者中表达调节性和促炎细胞因子的B细胞,通过多种技术分析发现患者循环中的调节性B细胞增加,而促炎性B细胞减少,这些B细胞在肿瘤微环境中与T细胞相互作用,促进FOXP3+ Treg的分化。 | 首次揭示了黑色素瘤患者中调节性B细胞在循环和肿瘤病变中的分布,以及B细胞与T细胞亚群之间的双向交流具有免疫抑制特性。 | NA | 研究黑色素瘤患者中B细胞的免疫调节作用及其与T细胞的相互作用。 | 黑色素瘤患者中的B细胞及其在免疫反应中的作用。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 流式细胞术、质谱流式细胞术、转录组学、免疫荧光、单细胞RNA测序、B细胞与T细胞共培养分析 | NA | 细胞 | 患者与健康志愿者的B细胞和T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 640 | 2024-08-08 |
Construction and Verification of a Fibroblast-Related Prognostic Signature Model for Colon Cancer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.908957
PMID:35910200
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建并验证了一个与结肠癌相关的成纤维细胞预后标志物模型 | 首次基于单细胞RNA测序数据,识别出六种新型成纤维细胞亚型,并构建了与结肠癌预后相关的成纤维细胞标志物模型 | 研究主要基于数据库中的数据,未来需要更多的临床样本验证模型的准确性和实用性 | 探讨成纤维细胞在结肠癌进展中的作用及其预后价值 | 结肠癌患者及其成纤维细胞亚型 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO Cox回归模型 | RNA测序数据 | 23个单细胞RNA测序样本和452个批量RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |