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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-08 |
A Study on the Radiosensitivity of Radiation-Induced Lung Injury at the Acute Phase Based on Single-Cell Transcriptomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.941976
PMID:35967301
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组学探讨了放射性诱导肺损伤在急性期的辐射敏感性及其细胞微环境变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了急性期放射性诱导肺损伤中不同细胞类型的异质性和辐射敏感性 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证结果 | 探讨放射性诱导肺损伤在急性期的细胞微环境变化及其对不同细胞类型的影响 | 放射性诱导肺损伤中的细胞类型及其在急性期的辐射敏感性 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 18,500个单细胞转录本,涉及10种主要细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 602 | 2024-08-08 |
Monocyte biology conserved across species: Functional insights from cattle
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.889175
PMID:35967310
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研究论文 | 本文深入分析了牛单核细胞在稳态下的批量和单细胞转录组,揭示了它们的功能特化和转录相关性 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了先前未被重视的cM内部异质性,并提出intM作为cM和ncM之间的瞬态分化中间体 | NA | 探讨不同类型单核细胞的功能特化和转录相关性 | 牛的单核细胞,包括经典型、中间型和非经典型单核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 603 | 2024-08-08 |
Immunosuppressive landscape in hepatocellular carcinoma revealed by single-cell sequencing
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.950536
PMID:35967424
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了肝细胞癌(HCC)的肿瘤免疫微环境(TIME),揭示了主要免疫细胞类型的分布及其潜在机制。 | 发现了调节性T细胞(Treg)在HCC的TIME中的特异性分布,以及多个免疫检查点的过度表达和糖酵解/糖异生途径的富集。 | NA | 研究肝细胞癌的肿瘤免疫微环境,探索免疫细胞的异质性及其在形成免疫抑制环境中的潜在机制。 | 肝细胞癌的肿瘤免疫微环境中的主要免疫细胞类型。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞和组织测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 604 | 2024-08-08 |
A robust experimental and computational analysis framework at multiple resolutions, modalities and coverages
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.911873
PMID:35967449
|
研究论文 | 本文构建并评估了一个集成的实验框架和分析流程,用于在全肿瘤切片水平上发现和验证潜在的配体-受体相互作用,无需组织解离 | 开发了STRISH计算方法,能够自动扫描整个组织切片,重现细胞间相互作用的全景 | 空间转录组学仍存在低表达配体-受体相互作用的误检问题,但减少了误发现 | 研究癌症免疫细胞间的通信,以促进癌症免疫治疗的发展 | 基底细胞癌和鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA原位杂交、Opal Polaris多重蛋白染色 | NA | 基因表达数据、蛋白表达数据 | 涉及两种癌症类型,占所有癌症病例的70%以上 | NA | NA | NA | NA |
| 605 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Role of Epithelial Cell Marker Genes in Predicting the Prognosis of Colorectal Cancer Patients
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/8347125
PMID:35968507
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,探讨了上皮细胞相关生物标志物在结直肠癌(CRC)中的预后价值 | 本研究首次基于单细胞RNA测序数据,构建了一个基于上皮细胞标记基因的风险评估模型,用于预测结直肠癌患者的预后 | 研究样本量较小,仅使用了四个CRC样本的数据,可能影响结果的普遍性 | 探讨上皮细胞标记基因在结直肠癌预后预测中的作用 | 结直肠癌患者的预后 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox比例风险模型 | 转录组数据 | 四个CRC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 606 | 2024-08-08 |
Identification of Human Retinal Organoid Cell Differentiation-Related Genes via Single-Cell Sequencing Data Analysis
2022, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2022/9717599
PMID:35979045
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,识别了与人类视网膜类器官细胞分化相关的基因 | 本研究首次通过单细胞测序技术识别了220个与视网膜类器官细胞分化相关的基因,并分析了这些基因在视网膜发育和视觉感知中的作用 | 本研究主要依赖于公共数据库中的单细胞RNA测序数据,可能存在样本量和数据质量的限制 | 研究人类视网膜的发育过程,识别与视网膜类器官细胞分化相关的基因 | 人类视网膜类器官的细胞分化过程及相关基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类视网膜类器官的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 607 | 2024-08-08 |
A Pan-Cancer Analysis Reveals CLEC5A as a Biomarker for Cancer Immunity and Prognosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.831542
PMID:35979347
|
研究论文 | 本研究通过分析TCGA、GTEx等多个数据库的数据,探讨CLEC5A在多种癌症中的表达及其与免疫浸润和患者预后的关系 | 首次揭示CLEC5A在多种癌症中的表达与免疫浸润和患者预后的关联,并发现其作为潜在的癌症预后生物标志物和抗肿瘤治疗靶点 | NA | 探讨CLEC5A在癌症中的表达及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | CLEC5A在多种癌症中的表达及其与免疫浸润、患者预后的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 608 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing to decipher the immunogenicity of ChAdOx1 nCoV-19/AZD1222 and mRNA-1273 vaccines in patients with autoimmune rheumatic diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.920865
PMID:35979368
|
研究论文 | 研究比较了ChAdOx1 nCoV-19/AZD1222和mRNA-1273疫苗在自身免疫性风湿病患者中的免疫原性,并使用单细胞RNA测序探索了风湿性关节炎患者中高和低抗SARS-CoV-2 IgG水平之间的细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了CD16单核细胞在抗SARS-CoV-2 IgG水平较高的风湿性关节炎患者中的主导作用,并发现了与MHC II类分子介导的抗原呈递相关的富集通路 | 研究样本仅包括445名参与者,且仅限于自身免疫性风湿病患者和健康对照组 | 探讨ChAdOx1 nCoV-19/AZD1222和mRNA-1273疫苗在自身免疫性风湿病患者中的免疫原性差异 | 自身免疫性风湿病患者和健康对照组的免疫反应 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 445名参与者,包括389名自身免疫性风湿病患者和56名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 609 | 2024-08-08 |
Analysis of Single-Cell Transcriptome Data in Drosophila
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2541-5_4
PMID:35980574
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研究论文 | 本文章节旨在指导分析基于液滴的果蝇单细胞转录组数据 | 本文介绍了针对果蝇单细胞RNA测序数据开发的计算方法 | NA | 提供分析果蝇单细胞转录组数据的指导 | 果蝇的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-08-08 |
Transcriptome Analysis Reveals Hub Genes Regulating Autophagy in Patients With Severe COVID-19
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.908826
PMID:35923698
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了严重COVID-19患者的外周血单个核细胞(PBMCs),揭示了调控自噬的关键基因 | 首次通过RNA测序和基因表达分析,识别出在严重COVID-19中特异性表达的差异表达基因(DEGs),并发现这些基因与自噬过程显著相关 | 研究样本量较小,仅包括四名严重COVID-19患者、四名轻度COVID-19患者和四名健康对照 | 深入了解严重COVID-19的生物学特征和发病机制,并开发新的治疗策略 | 严重COVID-19患者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序(RNA-Seq) | NA | RNA | 12名参与者(4名严重COVID-19患者,4名轻度COVID-19患者,4名健康对照) | NA | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-08-08 |
IL-17A Increases Doxorubicin Efficacy in Triple Negative Breast Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.928474
PMID:35924165
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-17A在三阴性乳腺癌中增强多柔比星疗效的作用 | 首次发现γδ T细胞衍生的IL-17A在敏感肿瘤微环境中高度丰富,并能直接增加TNBC细胞对多柔比星的敏感性 | NA | 研究IL-17A在三阴性乳腺癌中对多柔比星化疗效果的影响 | 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤微环境中的T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用4T1同源小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 612 | 2024-08-08 |
Integrative Analyses Identify Potential Key Genes and Calcium-Signaling Pathway in Familial Atrioventricular Nodal Reentrant Tachycardia Using Whole-Exome Sequencing
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.910826
PMID:35924220
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序技术,分析了家族性房室结折返性心动过速患者的基因突变情况,并识别了潜在的关键基因和钙信号通路 | 首次报道了家族性房室结折返性心动过速的疾病相关基因,并揭示了钙信号通路在该疾病发生中的核心作用 | 研究样本仅限于20名患者和100名对照组,可能需要更大样本量以验证结果 | 探究家族性房室结折返性心动过速的遗传贡献 | 家族性房室结折返性心动过速患者及其基因突变 | 遗传学 | 心血管疾病 | 全外显子测序 | NA | 基因序列 | 20名患者和100名对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 613 | 2024-08-08 |
FGL2-MCOLN3-Autophagy Axis-Triggered Neutrophil Extracellular Traps Exacerbate Liver Injury in Fulminant Viral Hepatitis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.07.014
PMID:35926777
|
研究论文 | 本文研究了中性粒细胞外陷阱(NETs)在暴发性病毒性肝炎(FVH)发病机制中的作用及机制 | 发现了FGL2-mucolipin 3-自噬轴调控NETs形成,为FVH治疗提供了新策略 | NA | 探究NETs在FVH发病机制中的作用及调控机制 | 暴发性病毒性肝炎(FVH) | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序,全转录组测序 | NA | RNA | 使用了感染或未感染小鼠的肝脏白细胞,以及HBV相关急性肝损伤患者的肝脏、血浆和外周中性粒细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 614 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomics as a Novel Approach to Redefine Electrical Stimulation Safety
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.937923
PMID:35928007
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术评估大脑对电刺激的生物学反应,并探索其对电刺激安全性的潜在影响 | 首次使用空间转录组学技术来评估电刺激对大脑的生物学影响,并与传统的组织损伤指标进行直接比较 | 研究仅限于大鼠视觉皮层,且使用特定的电极类型和刺激参数 | 探索电刺激对大脑的生理效应,并重新定义电刺激的安全标准 | 大鼠视觉皮层对电刺激的生物学反应 | 分子生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达 | 使用碳纤维超微电极阵列和微线电极阵列进行电刺激,刺激参数在报告的组织损伤阈值之上和之下 | NA | NA | NA | NA |
| 615 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of the Expression and Prognosis for Tripartite Motif-Containing Genes in Breast Cancer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.876325
PMID:35928444
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研究论文 | 本研究综合分析了三重基序含基因(TRIMs)在乳腺癌中的表达模式及其预后价值 | 首次全面分析了TRIMs在乳腺癌中的表达及其预后意义,并发现TRIMs在非肿瘤细胞中的表达及其在乳腺癌微环境中的作用 | 研究主要基于数据集和软件分析,未进行体内外实验验证 | 探讨TRIMs在乳腺癌中的表达模式及其预后价值 | 三重基序含基因(TRIMs)在乳腺癌中的表达及其预后影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集和独立队列 | NA | NA | NA | NA |
| 616 | 2024-08-08 |
Upregulation of CCNB2 and Its Perspective Mechanisms in Cerebral Ischemic Stroke and All Subtypes of Lung Cancer: A Comprehensive Study
2022, Frontiers in integrative neuroscience
IF:2.6Q3
DOI:10.3389/fnint.2022.854540
PMID:35928585
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研究论文 | 本研究收集了103个与肺癌症和脑缺血性中风相关的CCNB2表达的高通量数据集,分析了CCNB2在这些疾病中的上调表达及其潜在机制 | 通过多尺度嵌入基因共表达网络分析(MEGENA)和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,揭示了CCNB2在肺癌症和脑缺血性中风中的关键作用及其参与的生物过程 | NA | 探讨CCNB2在肺癌症和脑缺血性中风中的上调表达及其潜在机制 | 肺癌症和脑缺血性中风 | 数字病理学 | 肺癌症,脑缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 103个高通量数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 617 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Killing Mechanisms of Antitumor Cytotoxic CD4+ TCR-T Cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.939940
PMID:35928827
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了抗肿瘤细胞毒性CD4+ TCR-T细胞的杀伤机制 | 首次全面揭示了CD4 TCR-T细胞的细胞毒性机制,并发现其与CD8 TCR-T细胞在杀伤途径上的共同点和独特特征 | NA | 探索CD4 TCR-T细胞的抗肿瘤效果及其杀伤机制 | CD4 TCR-T细胞和CD8 TCR-T细胞的杀伤机制 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞V(D)J测序技术 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 618 | 2024-08-08 |
A Detailed Overview About the Single-Cell Analyses of Solid Tumors Focusing on Colorectal Cancer
2022, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2022.1610342
PMID:35928965
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术在结直肠癌研究中的应用及其对肿瘤异质性的深入解析 | 介绍了单细胞测序技术如何实现对肿瘤异质性、肿瘤微环境及其相互作用的详细描述 | 讨论了传统研究方法的局限性 | 强调单细胞分析在肿瘤研究中的重要性 | 结直肠癌的肿瘤异质性及其微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 619 | 2024-08-08 |
Manipulation of single cells via a Stereo Acoustic Streaming Tunnel (SteAST)
2022, Microsystems & nanoengineering
IF:7.3Q1
DOI:10.1038/s41378-022-00424-9
PMID:35935274
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研究论文 | 本文介绍了一种通过立体声学流隧道(SteAST)操纵单细胞的多功能微系统 | 该系统利用超高频体声波触发并由微通道高度限制的立体声学流,实现了单细胞的3D重建、集群分离、选择性捕获/释放、原位分析及与条形码凝胶珠的配对 | NA | 开发一种用于观察、预处理和分析单细胞的虚拟隧道,以应用于不同的单细胞研究 | 单细胞及其集群的异质性和行为 | 生物技术 | NA | 立体声学流技术 | NA | 细胞 | 未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 620 | 2024-08-08 |
Intrarenal Single-Cell Sequencing of Hepatitis B Virus Associated Membranous Nephropathy
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.869284
PMID:35935760
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了乙型肝炎病毒相关膜性肾病患者的肾脏活检样本,揭示了其发病机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了乙型肝炎病毒相关膜性肾病患者的肾脏细胞表达谱,揭示了细胞间的相互作用和潜在的治疗靶点 | 研究样本仅来自一名患者和两名健康个体,可能影响结果的普遍性 | 解析乙型肝炎病毒相关膜性肾病的发病机制 | 乙型肝炎病毒相关膜性肾病患者的肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4,114个肾脏单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |