本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2024-08-08 |
Gut Epithelial Inositol Polyphosphate Multikinase Alleviates Experimental Colitis via Governing Tuft Cell Homeostasis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.08.004
PMID:35988719
|
研究论文 | 研究肠道上皮细胞中的肌醇多磷酸多激酶(IPMK)如何通过调控簇细胞稳态减轻实验性结肠炎 | 首次探讨了IPMK在肠道上皮细胞中的功能,特别是其对簇细胞稳态的影响及其在结肠炎中的作用 | NA | 探究IPMK在肠道上皮细胞中的功能意义 | 肠道上皮细胞和簇细胞 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序 | NA | RNA | IPMKΔIEC小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 582 | 2024-08-08 |
Fibroblasts: Immunomodulatory factors in refractory diabetic wound healing
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.918223
PMID:35990622
|
研究论文 | 本文探讨了纤维母细胞在糖尿病难治性伤口愈合中的免疫调节作用 | 通过单细胞RNA测序技术,发现纤维母细胞不仅是伤口愈合中的关键细胞,还能作为免疫哨兵细胞,监测免疫反应的激活和调节以及与损伤相关的分子模式 | NA | 探讨纤维母细胞在糖尿病难治性伤口愈合中的潜在作用 | 糖尿病患者的伤口愈合过程及纤维母细胞的功能 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 583 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct immunology profiles in human keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.940645
PMID:35990663
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术系统地捕获了瘢痕瘤的细胞组成,并发现了瘢痕瘤与邻近正常组织中大多数细胞类型的显著差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了瘢痕瘤的免疫学特征,并揭示了瘢痕瘤中以巨噬细胞为中心的细胞通讯调控网络 | NA | 揭示瘢痕瘤的免疫学特征及其形成机制 | 瘢痕瘤及其邻近正常组织的细胞组成和免疫学特征 | 数字病理学 | 瘢痕瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12对瘢痕瘤和邻近正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 584 | 2024-08-08 |
Optimization of cancer immunotherapy through pyroptosis: A pyroptosis-related signature predicts survival benefit and potential synergy for immunotherapy in glioma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.961933
PMID:35990696
|
研究论文 | 本研究旨在建立一个与细胞焦亡相关的综合特征,并探讨其在胶质瘤中的潜在临床应用 | 首次系统研究了细胞焦亡在胶质瘤进展和肿瘤微环境重塑中的作用,并建立了一个与细胞焦亡相关的风险特征 | NA | 探索细胞焦亡在胶质瘤中的作用及其在免疫治疗中的潜在应用 | 胶质瘤患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 脑瘤 | 实时定量PCR,免疫组化染色,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TCGA胶质瘤队列和CGGA胶质瘤队列 | NA | NA | NA | NA |
| 585 | 2024-08-08 |
Characterizing the role of SLC3A2 in the molecular landscape and immune microenvironment across human tumors
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.961410
PMID:35992269
|
研究论文 | 本研究探讨了SLC3A2在人类肿瘤分子景观和免疫微环境中的作用 | 首次系统阐述了SLC3A2在癌症患者生存和潜在免疫治疗反应中的作用 | 目前研究中关于SLC3A2调节抗肿瘤免疫的分子机制尚未完全阐明 | 揭示SLC3A2在癌症患者生存和免疫治疗反应中的作用 | SLC3A2在不同肿瘤类型中的表达及其对患者预后和免疫微环境的影响 | 数字病理学 | NA | 转录组测序、单细胞测序、免疫组化染色 | NA | 转录组数据、单细胞数据、组织图像 | 涉及多种癌症类型,包括低级别胶质瘤和急性髓系白血病,以及食管癌细胞系ESO51 | NA | NA | NA | NA |
| 586 | 2024-08-08 |
Exploring strain diversity of dominant human skin bacterial species using single-cell genome sequencing
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.955404
PMID:35992707
|
研究论文 | 本文通过单细胞基因组测序技术,从皮肤拭子中获取未培养皮肤细菌的全面全基因组序列,以探索人类皮肤细菌的优势种群的菌株多样性 | 单细胞测序技术在从相同皮肤拭子中恢复基因组方面表现更优,显示出比鸟枪法宏基因组测序和分箱方法多10倍的非冗余菌株基因组 | NA | 理解皮肤共生细菌群落在皮肤健康和病原体传播中的作用 | 人类个体对应的皮肤细菌菌株的遗传差异 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组 | 从八名个体(包括同居群体)中恢复了281个高质量和244个中等质量的单扩增基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 587 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics uncover the key ferroptosis regulators contribute to cancer progression in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.962742
PMID:36003082
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了铁死亡调控因子在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)进展中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了铁死亡途径与HNSCC发展和预后的显著关联 | NA | 探讨头颈部鳞状细胞癌与铁死亡之间的关联机制 | 5902个单细胞的转录组数据 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5902个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 588 | 2024-08-08 |
Pan-Cancer Analysis of the Immunological Role of PDIA5: A Potential Target for Immunotherapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.881722
PMID:36003400
|
研究论文 | 本研究通过大规模生物信息学分析和实验,全面分析了PDIA5在人类癌症中的免疫浸润作用 | 首次揭示了PDIA5与免疫细胞的相互作用及其在肿瘤免疫中的作用,并证明了PDIA5沉默对癌细胞增殖、克隆形成和侵袭能力的抑制作用 | NA | 探讨PDIA5在人类癌症中的免疫学作用及其作为免疫治疗潜在靶点的可能性 | PDIA5在人类癌症中的表达及其对肿瘤免疫的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种人类癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 589 | 2024-08-08 |
Comprehensive analyses of PDHA1 that serves as a predictive biomarker for immunotherapy response in cancer
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.947372
PMID:36003495
|
研究论文 | 本研究利用TCGA、GEPIA2和cBioPortal数据库,全面分析了PDHA1在多种癌症中的表达及其与免疫治疗反应的关系 | 首次系统探讨了PDHA1在多种癌症中的功能及其调控机制,并揭示了其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | 研究主要基于数据库分析,缺乏实验验证 | 探讨PDHA1在多种癌症中的表达及其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | PDHA1在33种肿瘤类型中的表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤类型 | NA | NA | NA | NA |
| 590 | 2024-08-08 |
Revealing the intratumoral heterogeneity of non-DS acute megakaryoblastic leukemia in single-cell resolution
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.915833
PMID:36003795
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了非DS急性巨核细胞白血病(AMKL)的肿瘤内异质性 | 首次建立了AMKL的单细胞转录组图谱,并揭示了其肿瘤内异质性 | NA | 探究非DS急性巨核细胞白血病的肿瘤内异质性 | 来自两名融合阳性及一名融合阳性非DS-AMKL儿童的骨髓样本 | NA | 急性巨核细胞白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 三名儿童的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 591 | 2024-08-08 |
PlaqView 2.0: A comprehensive web portal for cardiovascular single-cell genomics
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.969421
PMID:36003902
|
研究论文 | 本文介绍了PlaqView 2.0,一个全面的网络门户,用于心血管领域的单细胞基因组学研究 | PlaqView 2.0提供了扩展的功能和数据集,包括基因查询、元数据浏览器、细胞身份预测等新工具 | NA | 旨在为心血管领域的单细胞数据提供一个集中的存储和分析平台 | 心血管领域的单细胞数据集,包括人类主动脉瘤、基因特异性小鼠敲除和健康参考数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | 包括多个数据集,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 592 | 2024-08-08 |
Identification of Human Cell Cycle Phase Markers Based on Single-Cell RNA-Seq Data by Using Machine Learning Methods
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/2516653
PMID:36004205
|
研究论文 | 本文利用机器学习方法,基于单细胞RNA测序数据,构建分类器并识别关键基因标记,用于确定人类细胞周期的阶段 | 本文提供了一种新的方法来确定细胞周期,并识别了新的潜在细胞周期相关基因 | NA | 确定细胞周期阶段,为癌症发展和靶向细胞周期药物的研究提供关键信息 | 人类细胞周期的阶段 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 分类算法 | RNA测序数据 | 大规模单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 593 | 2024-08-08 |
Advances in application of single-cell RNA sequencing in cardiovascular research
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.905151
PMID:35958408
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的应用及其最新进展 | 单细胞RNA测序技术为心血管系统的发育轨迹、表型转变和细胞互作提供了新的见解 | NA | 探讨单细胞RNA测序在心血管研究领域的应用前景 | 单细胞RNA测序技术及其在心血管系统研究中的应用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 594 | 2024-08-08 |
Identification of hub biomarkers of myocardial infarction by single-cell sequencing, bioinformatics, and machine learning
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.939972
PMID:35958412
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序、生物信息学和机器学习方法,识别心肌梗死的关键生物标志物 | 首次综合运用单细胞测序、生物信息学和机器学习三种方法研究心肌梗死中mRNA的作用 | 研究仅使用了四个RNA微阵列数据集,可能需要更多数据集以增强结果的普遍性 | 筛选心肌梗死中mRNA的表达,探究其功能,并为心肌梗死的诊断提供科学依据 | 心肌梗死中的mRNA表达及其在炎症反应中的作用 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序(SCS) | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 四个RNA微阵列数据集,包括GSE66360, GSE97320, GSE60993, 和 GSE48060 | NA | NA | NA | NA |
| 595 | 2024-08-08 |
Defining Patient-Level Molecular Heterogeneity in Psoriasis Vulgaris Based on Single-Cell Transcriptomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.842651
PMID:35958578
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了寻常型银屑病患者层面的分子异质性 | 通过单细胞RNA测序技术,提高了对复杂组织如皮肤中分子异质性的分辨率 | NA | 确定人类疾病背后的遗传变异,为治疗开发建立目标,并帮助为个体患者定制治疗方案 | 寻常型银屑病患者的分子异质性 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从活动性病变中分离的CD45细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 596 | 2024-08-08 |
Ednrb -/- mice with hirschsprung disease are missing Gad2-expressing enteric neurons in the ganglionated small intestine
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.917243
PMID:35959491
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫染色,探讨了Ednrb-/-小鼠小肠中表达Gad2的神经元缺失情况及其对胃肠道功能的影响 | 首次发现Hirschsprung病小肠神经节区域中存在神经亚群的缺失,这可能解释了手术矫正后持续的胃肠道功能障碍 | NA | 探究Ednrb-/-小鼠小肠神经节区域中神经系统的异常是否导致胃肠道功能异常 | Ednrb-/-小鼠的小肠神经节细胞 | NA | Hirschsprung病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | Ednrb-/-小鼠及其野生型同窝小鼠的小肠神经节细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 597 | 2024-08-08 |
The Role of NR4A1 in the Pathophysiology of Osteosarcoma: A Comprehensive Bioinformatics Analysis of the Single-Cell RNA Sequencing Dataset
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.879288
PMID:35965537
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析单细胞RNA测序数据集,探讨了核受体NR4A1在骨肉瘤病理生理学中的潜在作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了NR4A1在不同类型骨肉瘤中的表达差异及其与患者生存率的关联 | 研究结果需要进一步的验证研究来确认 | 旨在进一步理解骨肉瘤组织的单细胞RNA测序数据,并探索核受体相关基因在骨肉瘤病理生理学中的作用 | 骨肉瘤组织及其核受体NR4A1的表达 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 分析了骨肉瘤组织的单细胞RNA测序数据集GSE152048,识别了11种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 598 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals the regulative roles of cancer associated fibroblasts in tumor immune microenvironment of recurrent osteosarcoma
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.73714
PMID:35966586
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术探索复发性骨肉瘤的肿瘤微环境,特别是癌相关成纤维细胞的调控作用 | 首次揭示了癌相关成纤维细胞通过LOX调控骨肉瘤的EMT过程,为治疗复发性骨肉瘤提供了新的靶点 | 实验部分未详细描述验证相关细胞和标记物功能的实验方法 | 探究骨肉瘤的肿瘤微环境和基因表达模式,寻找有效的抗肿瘤策略 | 骨肉瘤的原发和复发组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE152048和GSE162454数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 599 | 2024-08-08 |
MAP4K3/GLK inhibits Treg differentiation by direct phosphorylating IKKβ and inducing IKKβ-mediated FoxO1 nuclear export and Foxp3 downregulation
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72148
PMID:35966593
|
研究论文 | 本文研究了MAP4K3/GLK通过直接磷酸化IKKβ并诱导IKKβ介导的FoxO1核外排和Foxp3下调来抑制Treg分化的机制 | 发现GLK信号通过直接磷酸化并激活IKKβ,进而诱导FoxO1的磷酸化和核外排,导致Foxp3下调,从而抑制Treg分化 | NA | 探究GLK和IKKβ在Treg分化和功能中的作用及其机制 | Treg分化和功能 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用T细胞特异性GLK转基因小鼠和IKKβ条件性敲除小鼠进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 600 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals changes in immune landscape in post-traumatic osteoarthritis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.938075
PMID:35967299
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了前交叉韧带断裂后小鼠膝关节中免疫细胞的动态变化 | 首次详细描述了前交叉韧带断裂后膝关节中多种免疫细胞类型及其亚型的转录组特征,特别是巨噬细胞和单核细胞的显著变化 | NA | 旨在理解创伤后骨关节炎中免疫细胞在关节退化或修复中的作用,以改进治疗策略 | 小鼠膝关节中的免疫细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种免疫细胞类型及其亚型 | NA | NA | NA | NA |