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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2025-10-07
Distinct Injury Responsive Regulatory T Cells Identified by Multi-Dimensional Phenotyping
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多维表型分析技术鉴定损伤响应性调节性T细胞的独特特征 首次通过多组学技术全面表征损伤响应性CD44+ Treg细胞,揭示其克隆扩增和功能特异性 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证 解析损伤响应性调节性T细胞的分子特征和功能机制 小鼠CD4+调节性T细胞(Tregs) 免疫学 组织损伤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR repertoire分析, 质谱流式细胞术 NA 基因表达数据, TCR序列数据, 蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱流式细胞术 NA NA
42 2025-10-07
A scoping review on the significance of programmed death-ligand 1-inhibiting microRNAs in non-small cell lung treatment: A single-cell RNA sequencing-based study
2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
综述 本文通过单细胞RNA测序系统综述了PD-L1抑制性microRNAs在非小细胞肺癌治疗中的意义 首次结合单细胞RNA测序技术系统评估PD-L1抑制性miRNAs在NSCLC中的作用机制 仍需进一步研究将这一方法转化为临床应用 系统回顾PD-L1抑制性miRNAs在NSCLC抑制中的意义及其作用机制 非小细胞肺癌和PD-L1抑制性microRNAs 自然语言处理 肺癌 单细胞RNA测序, 肿瘤bulk RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
43 2024-12-17
Dynamic Molecular Profiles of Bone Marrow-Derived Osteoblasts at the Single-Cell Level
2022, Folia biologica IF:1.1Q4
研究论文 研究探讨了单细胞水平上骨髓来源成骨细胞的异质性及其发育轨迹 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨髓来源成骨细胞的异质性及其发育轨迹,并识别了不同亚群的特征基因和信号通路 研究仅限于小鼠骨髓细胞,未涉及人类样本 揭示成骨细胞的异质性及其发育机制,为骨骼系统疾病的研究提供新思路 骨髓来源的成骨细胞及其在单细胞水平上的分子特征 数字病理学 骨骼系统疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 小鼠骨髓细胞的单细胞测序数据 NA NA NA NA
44 2024-12-14
A high OXPHOS CD8 T cell subset is predictive of immunotherapy resistance in melanoma patients
2022-01-03, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 研究通过单细胞转录组学发现了一种高氧化磷酸化(OXPHOS)的CD8 T细胞亚群,该亚群在黑色素瘤患者中与免疫检查点抑制剂(ICI)疗法的耐药性相关,并开发了一种基于该细胞亚群转录组特征的ICI疗法反应预测模型 首次发现并验证了高OXPHOS的CD8 T细胞亚群(CD8+ TOXPHOS细胞)与黑色素瘤患者ICI疗法耐药性的关联,并开发了基于该细胞亚群的预测模型 NA 研究黑色素瘤患者中与免疫检查点抑制剂疗法耐药性相关的免疫细胞亚群,并开发预测ICI疗法反应的模型 黑色素瘤患者的CD8 T细胞亚群及其与ICI疗法耐药性的关系 免疫学 黑色素瘤 单细胞转录组学 NA 转录组数据 多个验证队列中的黑色素瘤患者 NA NA NA NA
45 2024-12-14
Cancer-Associated Fibroblasts and Squamous Epithelial Cells Constitute a Unique Microenvironment in a Mouse Model of Inflammation-Induced Colon Cancer
2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和多重免疫荧光成像(MxIF)分析了两种小鼠结直肠癌模型中的肿瘤微环境差异 发现了AOM/DSS模型中癌症相关成纤维细胞(CAFs)和鳞状上皮细胞的独特微环境,并揭示了它们与肿瘤细胞的潜在机制联系 NA 揭示炎症诱导的结直肠癌模型中肿瘤微环境的复杂性 小鼠结直肠癌模型中的肿瘤微环境 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重免疫荧光成像(MxIF) NA 基因表达数据,图像 两种小鼠结直肠癌模型(Lrig1;Apc和AOM/DSS) NA NA NA NA
46 2024-12-08
Single-cell multiomics revealed the dynamics of antigen presentation, immune response and T cell activation in the COVID-19 positive and recovered individuals
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞多组学技术研究COVID-19阳性、康复和健康个体中的抗原呈递、免疫反应和T细胞激活的动态变化 首次使用单细胞多组学技术研究COVID-19康复个体中的免疫反应动态变化 研究样本量相对较小,可能影响结果的普适性 深入理解COVID-19感染后的免疫反应动态变化,特别是康复患者的免疫状态 COVID-19阳性、康复和健康个体的免疫细胞 免疫学 COVID-19 单细胞多组学(全转录组分析和抗体测序) 贝叶斯网络模型 单细胞转录组和表面标记数据 33个个体(健康=4,COVID-19阳性=16,COVID-19康复=13),共163,197个细胞(数据质控后124,726个细胞) NA NA NA NA
47 2024-12-06
Severe COVID-19 patients display hyper-activated NK cells and NK cell-platelet aggregates
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究分析了COVID-19患者血液中自然杀伤细胞(NK细胞)的表型和活性,发现严重COVID-19患者显示出超激活的NK细胞和NK细胞-血小板聚集体 首次揭示了严重COVID-19患者中NK细胞的超激活状态及其与血小板形成的聚集体,为理解SARS-CoV-2的抗病毒免疫和疾病病理提供了新的视角 研究样本主要集中在住院患者,未涵盖轻症或无症状患者,可能影响结果的普适性 探讨COVID-19患者中NK细胞的表型变化及其在疾病病理中的作用 COVID-19患者的NK细胞及其与血小板的相互作用 免疫学 COVID-19 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞毒性杀伤实验 NA 血液样本 包括住院的COVID-19患者、重症COVID-19患者和出院六周后的COVID-19患者 NA NA NA NA
48 2024-11-19
Comparative analysis of common alignment tools for single-cell RNA sequencing
2022-01-27, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文比较了几种常见的单细胞RNA测序数据对齐工具的性能 本文首次详细比较了Cell Ranger 6、STARsolo、Kallisto、Alevin和Alevin-fry在10X Genomics数据上的表现 研究仅限于10X Genomics数据,未涵盖其他测序平台 评估不同单细胞RNA测序对齐工具在基因定量、整体性能和差异表达基因检测方面的差异 Cell Ranger 6、STARsolo、Kallisto、Alevin和Alevin-fry五种工具 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 3个已发表的人类和小鼠数据集 NA NA NA NA
49 2024-11-15
Effects of Metformin on Modulating the Expression of Brain-related Genes of APP/PS1 Transgenic Mice based on Single Cell Sequencing
2022, Current Alzheimer research IF:1.8Q4
研究论文 研究了二甲双胍对APP/PS1转基因小鼠大脑相关基因表达的调节作用,通过单细胞测序技术分析了其对小鼠认知功能和细胞分化的影响 首次通过单细胞测序技术研究二甲双胍对APP/PS1转基因小鼠大脑细胞类型和基因表达的调节作用 研究仅限于APP/PS1转基因小鼠模型,结果的普适性有待进一步验证 探讨二甲双胍对阿尔茨海默病模型小鼠大脑基因表达和认知功能的调节作用 APP/PS1转基因小鼠的大脑细胞和基因表达 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞测序 NA 基因表达数据 APP/PS1转基因小鼠 NA NA NA NA
50 2024-10-06
Epstein-Barr virus perpetuates B cell germinal center dynamics and generation of autoimmune-associated phenotypes in vitro
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究EB病毒如何通过体外实验维持B细胞生发中心动态并产生与自身免疫相关表型 首次通过单细胞方法揭示EB病毒感染和LCLs中的B细胞异质性,并提出EB病毒持续驱动B细胞进入、通过和退出生发中心反应的模型 研究主要在体外进行,缺乏体内实验验证 探讨EB病毒如何影响B细胞的动态变化及其与自身免疫疾病的关系 EB病毒感染的B细胞及其在生发中心中的动态变化 免疫学 自身免疫疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 从LCLs中分离的多个亚群B细胞 NA NA NA NA
51 2024-10-06
Loss of OTUD6B Stimulates Angiogenesis and Promotes Diabetic Atherosclerosis
2022, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
研究论文 研究OTUD6B在糖尿病性动脉粥样硬化斑块中对血管生成的影响 首次探讨OTUD6B在糖尿病性动脉粥样硬化斑块中对血管生成的调控作用 仅限于动物模型和人类样本的初步研究,需要进一步的临床验证 探讨OTUD6B在糖尿病性动脉粥样硬化中的作用机制 OTUD6B在糖尿病性动脉粥样硬化斑块中的表达及其对血管生成的影响 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和RNA测序 (RNA-seq) NA RNA 包括糖尿病截肢患者的人类前胫动脉样本和ApoE-/-小鼠模型 NA NA NA NA
52 2024-09-30
Cell-type modeling in spatial transcriptomics data elucidates spatially variable colocalization and communication between cell-types in mouse brain
2022-01-19, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 本文开发了一种神经网络模型STANN,用于空间转录组数据中的细胞类型建模,并揭示了小鼠大脑中细胞类型的空间变异共定位和通信机制 本文提出了STANN模型,解决了单细胞空间转录组数据与单细胞RNA测序数据整合的难题,揭示了小鼠嗅球中细胞类型的空间变异特征 NA 研究单细胞空间转录组数据中的细胞类型建模及其在复杂组织中的应用 小鼠嗅球中的细胞类型及其空间变异特征 生物信息学 NA 单细胞空间转录组技术 神经网络模型 转录组数据 小鼠嗅球样本 NA NA NA NA
53 2024-09-30
Transcriptional census of epithelial-mesenchymal plasticity in cancer
2022-Jan-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序数据,研究了八种不同癌症类型中上皮-间质可塑性的转录特征 通过大规模单细胞RNA测序数据,揭示了肿瘤内上皮-间质可塑性的表达模式及其多样性 NA 研究上皮-间质可塑性在癌症中的分子特征及其对治疗和免疫逃逸的影响 八种不同癌症类型的266个肿瘤样本 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 266个肿瘤样本 NA NA NA NA
54 2024-09-30
Probing transient memory of cellular states using single-cell lineages
2022, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2
综述 本文综述了利用单细胞谱系研究细胞状态瞬时记忆的最新进展 提出了一种基于波动的方法,通过时间点测量揭示细胞状态转换,特别适用于导致细胞死亡或不可逆生理变化的测量 NA 探讨细胞状态瞬时遗传性的建模方法及其在不同生物系统中的应用 单细胞在不同状态间的动态转换 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
55 2024-09-30
Recent Technical Advances in Accelerating the Clinical Translation of Small Animal Brain Imaging: Hybrid Imaging, Deep Learning, and Transcriptomics
2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
综述 本文综述了加速小动物脑成像临床转化的最新技术进展,重点介绍了混合成像、深度学习和转录组学 本文介绍了单细胞转录组学和PET示踪剂细胞来源鉴定方法的发展,以及基于深度学习的图像分析技术,以增强成像协议的量化和优化 本文讨论了从小动物脑成像向临床转化过程中存在的几个主要障碍,包括生物物种间的内在差异和成像技术上的挑战 本文旨在总结小动物神经成像领域的最新进展,以提高其临床转化能力 本文主要研究小动物脑成像技术及其临床转化 计算机视觉 NA 混合成像、深度学习、转录组学 深度学习 图像 小动物(如啮齿动物)脑部样本 NA NA NA NA
56 2024-09-30
Comparison and evaluation of statistical error models for scRNA-seq
2022-01-18, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文比较和评估了单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中统计误差模型的性能 本文分析了59个scRNA-seq数据集,发现负二项分布模型在处理具有足够测序深度的基因时表现更好,并提出了数据驱动的方法来进行参数估计 本文主要集中在统计误差模型的比较和评估,未涉及其他可能影响scRNA-seq数据质量的因素 评估不同统计误差模型在scRNA-seq数据中的适用性,并提供建模建议 scRNA-seq数据中的统计误差模型 NA NA scRNA-seq 负二项分布模型 scRNA-seq数据 59个scRNA-seq数据集 NA NA NA NA
57 2024-09-28
Multi-Modal Single-Cell Sequencing Identifies Cellular Immunophenotypes Associated With Juvenile Dermatomyositis Disease Activity
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究使用多模态单细胞测序技术,分析了与青少年皮肌炎疾病活动相关的细胞免疫表型 首次通过多模态单细胞测序技术,揭示了青少年皮肌炎患者中不同细胞类型的免疫表型和基因表达特征,为该疾病的研究提供了新的资源 研究样本量较小,仅包括4名未治疗患者和4名治疗后疾病不活跃的患者 探讨青少年皮肌炎疾病活动相关的免疫表型和细胞特异性基因 未治疗和治疗后疾病不活跃的青少年皮肌炎患者的PBMCs 数字病理学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序和蛋白质测序 NA 单细胞RNA和蛋白质数据 4名未治疗患者和4名治疗后疾病不活跃的患者,共分析了55,564个细胞 NA NA NA NA
58 2024-09-28
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell Transcriptomic Data Using Bidirectional RNN
2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 提出了一种名为BiRGRN的新算法,用于从时间序列单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 利用双向循环神经网络来推断基因调控网络,将基因表达数据的推断转化为回归问题,并采用双向结构和先验知识过滤策略提高算法的准确性和稳定性 NA 推断基因调控规则以理解细胞过程 基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 双向循环神经网络 时间序列数据 四个模拟数据集和三个真实单细胞RNA测序数据集 NA NA NA NA
59 2024-09-28
A Toolkit for Profiling the Immune Landscape of Pediatric Central Nervous System Malignancies
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了用于儿童中枢神经系统恶性肿瘤免疫景观分析的技术,并详细介绍了这些技术在不同组织类型和研究中的应用 本文首次系统地探讨了儿童中枢神经系统恶性肿瘤的肿瘤免疫微环境(TIME),并提出了通过液体活检评估免疫系统的其他部分在免疫监测研究中的潜力 本文主要为综述性质,未提供具体的实验数据或模型 旨在深入了解和统一评估儿童中枢神经系统恶性肿瘤的肿瘤免疫微环境和免疫景观,以期将免疫疗法整合到临床实践中 儿童中枢神经系统恶性肿瘤的肿瘤免疫微环境 NA 中枢神经系统恶性肿瘤 免疫组化、流式细胞术、批量和单细胞转录组学、功能性检测 NA 组织、脑脊液、血液 NA NA NA NA NA
60 2024-09-28
MOCA for Integrated Analysis of Gene Expression and Genetic Variation in Single Cells
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文介绍了MOCA软件,用于联合分析单细胞RNA测序数据中的基因表达和遗传变异 提出了MOCA软件,能够同时分析基因表达和遗传变异,揭示基因表达模式与细胞分子进化轨迹的一致性 NA 探讨体细胞变异对基因表达模式进化的影响 单细胞RNA测序数据中的基因表达和遗传变异 基因组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
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