单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Deciphering Mesenchymal Drivers of Human Dupuytren's Disease at Single-Cell Level
2022-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.05.030
PMID:34274346
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别人类掌腱膜挛缩症中致病性间充质细胞亚群及其关键分子通路 | 首次在单细胞水平鉴定出Dupuytren病特异性PDPN/FAP致病性间充质细胞群，并发现TNFRSF12A和SCX在成纤维细胞分化中的关键作用 | 样本量相对有限（35,250个细胞），功能验证仅通过体外细胞培养实验完成 | 解析Dupuytren病的细胞和分子驱动机制，为开发新疗法提供靶点 | 人类Dupuytren病变组织、非致病性筋膜和健康真皮组织 | 单细胞组学 | 掌腱膜挛缩症 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 35,250个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
Simultaneous Analysis of Single-Cell Transcriptomes and Cell Surface Protein Expression of Human Hematopoietic Stem Cells and Progenitors Using the 10x Genomics Platform
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_13
PMID:34766273
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研究论文 | 本文介绍使用10x Genomics平台同时分析人类造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组与细胞表面蛋白表达的方法 | 将CITE-seq工作流程与10x Genomics平台结合，实现单细胞转录组和表面蛋白表达的同时分析 | NA | 开发同时表征蛋白质和RNA的单细胞分析方法 | 人类脐带血单核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 | 单细胞多组学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | 10x Genomics, BioLegend | 单细胞RNA-seq, 免疫表型分析 | 10x Chromium, TotalSeq | 基于液滴的单细胞RNA-seq商业平台, TotalSeq™寡核苷酸偶联抗体 |
| 43 | 2025-10-06 |
Delineating chromatin accessibility re-patterning at single cell level during early stage of direct cardiac reprogramming
2022-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.09.002
PMID:34509499
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC-seq技术揭示了心脏重编程早期阶段染色质可及性重塑的动态过程 | 首次在单细胞水平系统描绘心脏重编程早期的染色质可及性重编程模式，并发现Smad3在重编程过程中具有双重作用 | 研究聚焦于重编程早期阶段（第3天），未涵盖完整重编程过程 | 解析心脏成纤维细胞直接重编程为心肌细胞过程中染色质景观变化的驱动机制 | 由Mef2c、Gata4和Tbx5诱导的早期重编程心肌细胞（iCMs） | 表观基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 表观基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Identification of HSC/MPP expansion units in fetal liver by single-cell spatiotemporal transcriptomics
2022-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00540-7
PMID:34341490
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研究论文 | 通过单细胞时空转录组技术识别小鼠胎肝中造血干细胞/多能祖细胞扩张单元 | 首次构建小鼠胎肝时空转录组图谱，发现CD93富集的HSC/MPP亚群和由多种生态位细胞组成的HSC PLUS结构单元 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 解析造血干细胞和祖细胞在天然生态位中的扩张机制 | 小鼠胎肝中的造血干细胞/多能祖细胞及其生态位细胞 | 单细胞组学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞转录组测序，空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Molecular Genetics of Kappa Opioids in Pain and Itch Sensations
2022, Handbook of experimental pharmacology
DOI:10.1007/164_2020_397
PMID:33145633
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综述 | 本文综述了κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽在调节瘙痒和疼痛感觉中的分子遗传学机制 | 整合了单细胞测序数据重新分析显示这些分子的表达谱，并基于解剖结构系统梳理了κ阿片系统在不同部位的作用 | 仅考虑强啡肽与KOR的相互作用，未深入探讨高剂量下其他肽类对KOR的潜在刺激作用 | 探讨κ阿片受体系统在疼痛和瘙痒感觉调节中的分子遗传机制 | κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽，以及受其影响的细胞和神经回路 | 神经科学 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Lysyl oxidase promotes anaplastic thyroid carcinoma cell proliferation and metastasis mediated via BMP1
2022-Jan, Gland surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.21037/gs-21-908
PMID:35242686
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研究论文 | 本研究探讨赖氨酰氧化酶(LOX)通过BMP1促进甲状腺未分化癌增殖和转移的机制 | 首次在单细胞水平揭示LOX/BMP1轴在甲状腺未分化癌恶性进展中的关键作用 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索甲状腺未分化癌的新型治疗靶点 | 甲状腺未分化癌细胞系(8505C) | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, qRT-PCR, Western blot, RNA干扰 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | GEO数据库中的ATC单细胞RNA测序数据和微阵列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-07 |
Mucosal Vaccination with Cyclic Dinucleotide Adjuvants Induces Effective T Cell Homing and IL-17-Dependent Protection against Mycobacterium tuberculosis Infection
2022-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100029
PMID:34965963
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研究论文 | 本研究揭示了环二核苷酸佐剂通过黏膜疫苗接种诱导T细胞归巢和IL-17依赖性保护机制抵抗结核分枝杆菌感染 | 首次阐明CDN佐剂疫苗通过诱导Th17细胞代谢状态改变和CD153表达实现保护作用的机制，并证明单纯诱导Th17细胞不足以提供保护 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证 | 探究环二核苷酸佐剂疫苗对抗结核感染的免疫保护机制 | 小鼠模型中的免疫细胞反应和结核分枝杆菌感染 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-07 |
Targeting the TREM1-positive myeloid microenvironment in glioblastoma
2022 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdac149
PMID:36249290
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研究论文 | 本研究探讨了胶质母细胞瘤中TREM1阳性髓系微环境的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现TREM1阳性髓系微环境促进胶质母细胞瘤异质性，并证明HuR二聚化抑制剂SRI42127可有效抑制该微环境 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 研究胶质母细胞瘤中髓系微环境的作用机制并探索其治疗靶向策略 | 胶质母细胞瘤患者样本、PDX细胞系、小鼠胶质母细胞瘤模型 | 肿瘤微环境研究 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、体外细胞融合实验、细胞迁移实验 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 转录组数据、单细胞数据、体内外实验数据 | 5个PDX细胞系、2个小鼠胶质母细胞瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-10-07 |
Transcriptional programming of immunoregulatory responses in human Langerhans cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.892254
PMID:36203560
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析研究人表皮朗格汉斯细胞在稳态和迁移过程中的转录编程及其免疫调节功能 | 首次揭示稳态朗格汉斯细胞存在于连续成熟状态，并发现迁移诱导的免疫调节基因组模块和关键转录因子网络 | NA | 研究人原代朗格汉斯细胞在稳态期间的转录编程和免疫调节功能 | 人表皮朗格汉斯细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC, Partial Information Decomposition in Context | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-10-07 |
Oncostatin M expression induced by bacterial triggers drives airway inflammatory and mucus secretion in severe asthma
2022-01-12, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abf8188
PMID:35020406
|
研究论文 | 本研究揭示了细菌感染通过诱导OSM表达驱动严重哮喘气道炎症和黏液分泌的分子机制 | 首次发现细菌脂多糖通过诱导OSM表达驱动严重哮喘的病理特征，并确定巨噬细胞是OSM的主要来源 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，需要在人类患者中进行更直接的验证 | 阐明细菌感染加重严重哮喘症状的分子机制 | 严重哮喘患者的气道活检组织、原代人肺组织、人上皮细胞和间充质细胞、小鼠巨噬细胞 | 分子生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序，抗体阻断实验 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 人类气道活检组织和原代细胞，小鼠巨噬细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-07 |
Distinct Injury Responsive Regulatory T Cells Identified by Multi-Dimensional Phenotyping
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.833100
PMID:35634302
|
研究论文 | 通过多维表型分析技术鉴定损伤响应性调节性T细胞的独特特征 | 首次通过多组学技术全面表征损伤响应性CD44+ Treg细胞，揭示其克隆扩增和功能特异性 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 解析损伤响应性调节性T细胞的分子特征和功能机制 | 小鼠CD4+调节性T细胞（Tregs） | 免疫学 | 组织损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR repertoire分析, 质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-07 |
A scoping review on the significance of programmed death-ligand 1-inhibiting microRNAs in non-small cell lung treatment: A single-cell RNA sequencing-based study
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1027758
PMID:36388933
|
综述 | 本文通过单细胞RNA测序系统综述了PD-L1抑制性microRNAs在非小细胞肺癌治疗中的意义 | 首次结合单细胞RNA测序技术系统评估PD-L1抑制性miRNAs在NSCLC中的作用机制 | 仍需进一步研究将这一方法转化为临床应用 | 系统回顾PD-L1抑制性miRNAs在NSCLC抑制中的意义及其作用机制 | 非小细胞肺癌和PD-L1抑制性microRNAs | 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 肿瘤bulk RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2024-12-17 |
Dynamic Molecular Profiles of Bone Marrow-Derived Osteoblasts at the Single-Cell Level
2022, Folia biologica
IF:1.1Q4
DOI:10.14712/fb2022068030097
PMID:36689316
|
研究论文 | 研究探讨了单细胞水平上骨髓来源成骨细胞的异质性及其发育轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨髓来源成骨细胞的异质性及其发育轨迹，并识别了不同亚群的特征基因和信号通路 | 研究仅限于小鼠骨髓细胞，未涉及人类样本 | 揭示成骨细胞的异质性及其发育机制，为骨骼系统疾病的研究提供新思路 | 骨髓来源的成骨细胞及其在单细胞水平上的分子特征 | 数字病理学 | 骨骼系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠骨髓细胞的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-12-14 |
A high OXPHOS CD8 T cell subset is predictive of immunotherapy resistance in melanoma patients
2022-01-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20202084
PMID:34807232
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学发现了一种高氧化磷酸化（OXPHOS）的CD8 T细胞亚群，该亚群在黑色素瘤患者中与免疫检查点抑制剂（ICI）疗法的耐药性相关，并开发了一种基于该细胞亚群转录组特征的ICI疗法反应预测模型 | 首次发现并验证了高OXPHOS的CD8 T细胞亚群（CD8+ TOXPHOS细胞）与黑色素瘤患者ICI疗法耐药性的关联，并开发了基于该细胞亚群的预测模型 | NA | 研究黑色素瘤患者中与免疫检查点抑制剂疗法耐药性相关的免疫细胞亚群，并开发预测ICI疗法反应的模型 | 黑色素瘤患者的CD8 T细胞亚群及其与ICI疗法耐药性的关系 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个验证队列中的黑色素瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-12-14 |
Cancer-Associated Fibroblasts and Squamous Epithelial Cells Constitute a Unique Microenvironment in a Mouse Model of Inflammation-Induced Colon Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.878920
PMID:35600339
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和多重免疫荧光成像（MxIF）分析了两种小鼠结直肠癌模型中的肿瘤微环境差异 | 发现了AOM/DSS模型中癌症相关成纤维细胞（CAFs）和鳞状上皮细胞的独特微环境，并揭示了它们与肿瘤细胞的潜在机制联系 | NA | 揭示炎症诱导的结直肠癌模型中肿瘤微环境的复杂性 | 小鼠结直肠癌模型中的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光成像（MxIF） | NA | 基因表达数据，图像 | 两种小鼠结直肠癌模型（Lrig1;Apc和AOM/DSS） | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-12-08 |
Single-cell multiomics revealed the dynamics of antigen presentation, immune response and T cell activation in the COVID-19 positive and recovered individuals
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1034159
PMID:36532041
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术研究COVID-19阳性、康复和健康个体中的抗原呈递、免疫反应和T细胞激活的动态变化 | 首次使用单细胞多组学技术研究COVID-19康复个体中的免疫反应动态变化 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 深入理解COVID-19感染后的免疫反应动态变化，特别是康复患者的免疫状态 | COVID-19阳性、康复和健康个体的免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞多组学（全转录组分析和抗体测序） | 贝叶斯网络模型 | 单细胞转录组和表面标记数据 | 33个个体（健康=4，COVID-19阳性=16，COVID-19康复=13），共163,197个细胞（数据质控后124,726个细胞） | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-12-06 |
Severe COVID-19 patients display hyper-activated NK cells and NK cell-platelet aggregates
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.861251
PMID:36275702
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研究论文 | 研究分析了COVID-19患者血液中自然杀伤细胞（NK细胞）的表型和活性，发现严重COVID-19患者显示出超激活的NK细胞和NK细胞-血小板聚集体 | 首次揭示了严重COVID-19患者中NK细胞的超激活状态及其与血小板形成的聚集体，为理解SARS-CoV-2的抗病毒免疫和疾病病理提供了新的视角 | 研究样本主要集中在住院患者，未涵盖轻症或无症状患者，可能影响结果的普适性 | 探讨COVID-19患者中NK细胞的表型变化及其在疾病病理中的作用 | COVID-19患者的NK细胞及其与血小板的相互作用 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞毒性杀伤实验 | NA | 血液样本 | 包括住院的COVID-19患者、重症COVID-19患者和出院六周后的COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-11-19 |
Comparative analysis of common alignment tools for single-cell RNA sequencing
2022-01-27, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giac001
PMID:35084033
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研究论文 | 本文比较了几种常见的单细胞RNA测序数据对齐工具的性能 | 本文首次详细比较了Cell Ranger 6、STARsolo、Kallisto、Alevin和Alevin-fry在10X Genomics数据上的表现 | 研究仅限于10X Genomics数据，未涵盖其他测序平台 | 评估不同单细胞RNA测序对齐工具在基因定量、整体性能和差异表达基因检测方面的差异 | Cell Ranger 6、STARsolo、Kallisto、Alevin和Alevin-fry五种工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个已发表的人类和小鼠数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-11-15 |
Effects of Metformin on Modulating the Expression of Brain-related Genes of APP/PS1 Transgenic Mice based on Single Cell Sequencing
2022, Current Alzheimer research
IF:1.8Q4
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研究论文 | 研究了二甲双胍对APP/PS1转基因小鼠大脑相关基因表达的调节作用，通过单细胞测序技术分析了其对小鼠认知功能和细胞分化的影响 | 首次通过单细胞测序技术研究二甲双胍对APP/PS1转基因小鼠大脑细胞类型和基因表达的调节作用 | 研究仅限于APP/PS1转基因小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨二甲双胍对阿尔茨海默病模型小鼠大脑基因表达和认知功能的调节作用 | APP/PS1转基因小鼠的大脑细胞和基因表达 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | APP/PS1转基因小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-10-06 |
Epstein-Barr virus perpetuates B cell germinal center dynamics and generation of autoimmune-associated phenotypes in vitro
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1001145
PMID:36248899
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研究论文 | 研究EB病毒如何通过体外实验维持B细胞生发中心动态并产生与自身免疫相关表型 | 首次通过单细胞方法揭示EB病毒感染和LCLs中的B细胞异质性，并提出EB病毒持续驱动B细胞进入、通过和退出生发中心反应的模型 | 研究主要在体外进行，缺乏体内实验验证 | 探讨EB病毒如何影响B细胞的动态变化及其与自身免疫疾病的关系 | EB病毒感染的B细胞及其在生发中心中的动态变化 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从LCLs中分离的多个亚群B细胞 | NA | NA | NA | NA |