单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2024-08-08 |
Identification of novel key genes and potential candidate small molecule drugs in diabetic kidney disease using comprehensive bioinformatics analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.934555
PMID:36035169
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research paper | 本研究通过综合生物信息学分析，鉴定了糖尿病肾病中的新型关键基因和潜在的小分子候选药物。 | 首次揭示了糖尿病肾病患者肾脏中浸润免疫细胞的比例显著增高，并通过单细胞转录组学探索了免疫景观。 | NA | 旨在揭示糖尿病肾病中的基因表达变化，并发现关键基因，为诊断和治疗提供新的分子标记和治疗靶点。 | 糖尿病肾病患者和健康供体的肾脏样本。 | digital pathology | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学, 加权共表达网络分析 (WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络, 实时定量PCR, 免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据 | 包括健康供体、早期和晚期糖尿病肾病患者的肾脏样本 |
| 562 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Smooth Muscle Cells Heterogeneity in Experimental Aortic Dissection
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.836593
PMID:36035191
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研究论文 | 本研究旨在阐明实验性主动脉夹层（AD）中主动脉的细胞景观，并详细阐述不同细胞类型中的平滑肌细胞（SMCs）及其功能 | 本研究首次提供了从老鼠AD组织中完整的细胞景观，并鉴定了七个核心差异表达基因（DEGs）和八种SMCs亚型 | NA | 阐明实验性主动脉夹层中主动脉的细胞景观，并详细阐述不同细胞类型中的平滑肌细胞及其功能 | 实验性主动脉夹层中的主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 28周龄的雄性Apolipoprotein缺乏（ApoE）小鼠 |
| 563 | 2024-08-08 |
Colorectal Cancer Cell Differentiation Trajectory Predicts Patient Immunotherapy Response and Prognosis
2022 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748221121382
PMID:36036380
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研究论文 | 本研究旨在探讨结直肠癌细胞的分化状态及其临床意义，并基于结直肠癌的分化相关基因预测患者的免疫反应和预后 | 本研究结合单细胞测序数据和转录组数据，开发了一种基于结直肠癌分化相关基因的分子分型和预后模型，以预测患者的免疫反应和预后 | NA | 探讨结直肠癌细胞的分化状态及其临床意义，并预测患者的免疫反应和预后 | 结直肠癌细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 5种不同的细胞分化亚群和620个结直肠癌分化相关基因 |
| 564 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of the potential cuproptosis-related biomarker LIAS that regulates prognosis and immunotherapy of pan-cancers
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.952129
PMID:35982953
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研究论文 | 本研究通过多种生物信息学平台分析了LIAS在泛癌中的表达水平及其与预后的关系，并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 | 首次全面分析了LIAS在多种癌症中的表达与预后关系，并探讨了其在免疫治疗中的预测价值 | NA | 探索LIAS在泛癌中的表达水平及其对预后和免疫治疗的影响 | LIAS在不同癌症中的表达及其生物学功能 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种癌症类型 |
| 565 | 2024-08-08 |
Bioinformatics analysis and experimental verification of the prognostic and biological significance mediated by fatty acid metabolism related genes for hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.972744
PMID:35982956
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了脂肪酸代谢相关基因在肝细胞癌中的预后和生物学意义 | 本研究首次发现并验证了一个新的脂肪酸代谢相关预后模型，为肝细胞癌的治疗和预防提供了潜在策略 | NA | 旨在发现脂肪酸代谢相关风险特征，并为肝细胞癌患者的预后预测制定更好的模型 | 肝细胞癌患者的mRNA表达数据和临床参数 | 生物信息学 | 肝癌 | 共识聚类、单因素和多因素Cox回归分析、单样本GSEA算法、qRT-PCR、Western blotting和单细胞转录组学 | NA | mRNA表达数据 | 使用TCGA数据库收集的肝细胞癌患者数据，并在ICGC数据集中进行验证 |
| 566 | 2024-08-08 |
Dynamically upregulated mast cell CPA3 patterns in chronic obstructive pulmonary disease and idiopathic pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.924244
PMID:35983043
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研究论文 | 本研究通过基于组织学的方法，定量分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）和特发性肺纤维化（IPF）患者肺部肥大细胞CPA3表达的动态变化及其空间分布 | 首次揭示了COPD和IPF患者肺部肥大细胞CPA3表达的动态变化及其与免疫病理改变和肺功能的关系 | NA | 探讨肥大细胞特异性金属蛋白酶CPA3在肺部疾病中的表达模式及其与疾病发展的关系 | COPD和IPF患者的肺部肥大细胞CPA3表达 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病，特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA，蛋白质 | 控制组和COPD及IPF患者的肺部样本 |
| 567 | 2024-08-08 |
Increased proportion of follicular helper T cells is associated with B cell activation and disease severity in IgA nephropathy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.901465
PMID:35983053
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研究论文 | 本文研究了IgA肾病中CD4T细胞亚群的变化及其在B细胞激活和疾病进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组化染色揭示了IgA肾病患者中Th2、Th17和Tfh细胞比例的增加，以及Tfh细胞与B细胞之间的细胞间相互作用 | NA | 探讨IgA肾病中CD4T细胞的特征及其在疾病进展中的作用 | IgA肾病患者中的CD4T细胞和B细胞 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，多重免疫组化染色 | NA | 细胞 | IgA肾病患者和健康对照组 |
| 568 | 2024-08-08 |
Heterozygosity and homozygosity regions affect reproductive success and the loss of reproduction: A case study with litter traits in pigs
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.07.039
PMID:35983229
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研究论文 | 本研究探讨了杂合子区域（ROHet）和纯合子区域（ROH）对中国本土猪种繁殖成功率和繁殖损失的影响 | 首次深入研究了ROHet和ROH对哺乳动物繁殖成功率和繁殖损失的影响，并发现了一系列与繁殖性能相关的新候选基因 | 研究仅限于特定的中国本土猪种和其他五个猪种，可能需要进一步扩大样本范围以验证结果的普遍性 | 揭示ROHet和ROH对哺乳动物繁殖性能的影响，并识别相关的候选基因 | 中国本土猪种（如金华猪、淳安猪、龙游黑猪和嵊县花猪）及其他五个猪种的基因组 | 遗传学 | NA | 关联分析、线性模型、转录组关联研究、单细胞RNA测序 | 线性模型 | 基因组数据、转录组数据 | 涉及四个中国本土猪种和五个其他猪种 |
| 569 | 2024-08-08 |
Gut Epithelial Inositol Polyphosphate Multikinase Alleviates Experimental Colitis via Governing Tuft Cell Homeostasis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.08.004
PMID:35988719
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研究论文 | 研究肠道上皮细胞中的肌醇多磷酸多激酶（IPMK）如何通过调控簇细胞稳态减轻实验性结肠炎 | 首次探讨了IPMK在肠道上皮细胞中的功能，特别是其对簇细胞稳态的影响及其在结肠炎中的作用 | NA | 探究IPMK在肠道上皮细胞中的功能意义 | 肠道上皮细胞和簇细胞 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序 | NA | RNA | IPMKΔIEC小鼠 |
| 570 | 2024-08-08 |
Fibroblasts: Immunomodulatory factors in refractory diabetic wound healing
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.918223
PMID:35990622
|
研究论文 | 本文探讨了纤维母细胞在糖尿病难治性伤口愈合中的免疫调节作用 | 通过单细胞RNA测序技术，发现纤维母细胞不仅是伤口愈合中的关键细胞，还能作为免疫哨兵细胞，监测免疫反应的激活和调节以及与损伤相关的分子模式 | NA | 探讨纤维母细胞在糖尿病难治性伤口愈合中的潜在作用 | 糖尿病患者的伤口愈合过程及纤维母细胞的功能 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 571 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct immunology profiles in human keloid
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.940645
PMID:35990663
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术系统地捕获了瘢痕瘤的细胞组成，并发现了瘢痕瘤与邻近正常组织中大多数细胞类型的显著差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了瘢痕瘤的免疫学特征，并揭示了瘢痕瘤中以巨噬细胞为中心的细胞通讯调控网络 | NA | 揭示瘢痕瘤的免疫学特征及其形成机制 | 瘢痕瘤及其邻近正常组织的细胞组成和免疫学特征 | 数字病理学 | 瘢痕瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12对瘢痕瘤和邻近正常组织样本 |
| 572 | 2024-08-08 |
Optimization of cancer immunotherapy through pyroptosis: A pyroptosis-related signature predicts survival benefit and potential synergy for immunotherapy in glioma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.961933
PMID:35990696
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研究论文 | 本研究旨在建立一个与细胞焦亡相关的综合特征，并探讨其在胶质瘤中的潜在临床应用 | 首次系统研究了细胞焦亡在胶质瘤进展和肿瘤微环境重塑中的作用，并建立了一个与细胞焦亡相关的风险特征 | NA | 探索细胞焦亡在胶质瘤中的作用及其在免疫治疗中的潜在应用 | 胶质瘤患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 脑瘤 | 实时定量PCR，免疫组化染色，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TCGA胶质瘤队列和CGGA胶质瘤队列 |
| 573 | 2024-08-08 |
Characterizing the role of SLC3A2 in the molecular landscape and immune microenvironment across human tumors
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.961410
PMID:35992269
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研究论文 | 本研究探讨了SLC3A2在人类肿瘤分子景观和免疫微环境中的作用 | 首次系统阐述了SLC3A2在癌症患者生存和潜在免疫治疗反应中的作用 | 目前研究中关于SLC3A2调节抗肿瘤免疫的分子机制尚未完全阐明 | 揭示SLC3A2在癌症患者生存和免疫治疗反应中的作用 | SLC3A2在不同肿瘤类型中的表达及其对患者预后和免疫微环境的影响 | 数字病理学 | NA | 转录组测序、单细胞测序、免疫组化染色 | NA | 转录组数据、单细胞数据、组织图像 | 涉及多种癌症类型，包括低级别胶质瘤和急性髓系白血病，以及食管癌细胞系ESO51 |
| 574 | 2024-08-08 |
Exploring strain diversity of dominant human skin bacterial species using single-cell genome sequencing
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.955404
PMID:35992707
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组测序技术，从皮肤拭子中获取未培养皮肤细菌的全面全基因组序列，以探索人类皮肤细菌的优势种群的菌株多样性 | 单细胞测序技术在从相同皮肤拭子中恢复基因组方面表现更优，显示出比鸟枪法宏基因组测序和分箱方法多10倍的非冗余菌株基因组 | NA | 理解皮肤共生细菌群落在皮肤健康和病原体传播中的作用 | 人类个体对应的皮肤细菌菌株的遗传差异 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组 | 从八名个体（包括同居群体）中恢复了281个高质量和244个中等质量的单扩增基因组 |
| 575 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics uncover the key ferroptosis regulators contribute to cancer progression in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.962742
PMID:36003082
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了铁死亡调控因子在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）进展中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了铁死亡途径与HNSCC发展和预后的显著关联 | NA | 探讨头颈部鳞状细胞癌与铁死亡之间的关联机制 | 5902个单细胞的转录组数据 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5902个单细胞 |
| 576 | 2024-08-08 |
Pan-Cancer Analysis of the Immunological Role of PDIA5: A Potential Target for Immunotherapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.881722
PMID:36003400
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研究论文 | 本研究通过大规模生物信息学分析和实验，全面分析了PDIA5在人类癌症中的免疫浸润作用 | 首次揭示了PDIA5与免疫细胞的相互作用及其在肿瘤免疫中的作用，并证明了PDIA5沉默对癌细胞增殖、克隆形成和侵袭能力的抑制作用 | NA | 探讨PDIA5在人类癌症中的免疫学作用及其作为免疫治疗潜在靶点的可能性 | PDIA5在人类癌症中的表达及其对肿瘤免疫的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种人类癌症样本 |
| 577 | 2024-08-08 |
Comprehensive analyses of PDHA1 that serves as a predictive biomarker for immunotherapy response in cancer
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.947372
PMID:36003495
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研究论文 | 本研究利用TCGA、GEPIA2和cBioPortal数据库，全面分析了PDHA1在多种癌症中的表达及其与免疫治疗反应的关系 | 首次系统探讨了PDHA1在多种癌症中的功能及其调控机制，并揭示了其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | 研究主要基于数据库分析，缺乏实验验证 | 探讨PDHA1在多种癌症中的表达及其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | PDHA1在33种肿瘤类型中的表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤类型 |
| 578 | 2024-08-08 |
Revealing the intratumoral heterogeneity of non-DS acute megakaryoblastic leukemia in single-cell resolution
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.915833
PMID:36003795
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了非DS急性巨核细胞白血病（AMKL）的肿瘤内异质性 | 首次建立了AMKL的单细胞转录组图谱，并揭示了其肿瘤内异质性 | NA | 探究非DS急性巨核细胞白血病的肿瘤内异质性 | 来自两名融合阳性及一名融合阳性非DS-AMKL儿童的骨髓样本 | NA | 急性巨核细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 三名儿童的骨髓样本 |
| 579 | 2024-08-08 |
PlaqView 2.0: A comprehensive web portal for cardiovascular single-cell genomics
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.969421
PMID:36003902
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研究论文 | 本文介绍了PlaqView 2.0，一个全面的网络门户，用于心血管领域的单细胞基因组学研究 | PlaqView 2.0提供了扩展的功能和数据集，包括基因查询、元数据浏览器、细胞身份预测等新工具 | NA | 旨在为心血管领域的单细胞数据提供一个集中的存储和分析平台 | 心血管领域的单细胞数据集，包括人类主动脉瘤、基因特异性小鼠敲除和健康参考数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 包括多个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 580 | 2024-08-08 |
Identification of Human Cell Cycle Phase Markers Based on Single-Cell RNA-Seq Data by Using Machine Learning Methods
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/2516653
PMID:36004205
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研究论文 | 本文利用机器学习方法，基于单细胞RNA测序数据，构建分类器并识别关键基因标记，用于确定人类细胞周期的阶段 | 本文提供了一种新的方法来确定细胞周期，并识别了新的潜在细胞周期相关基因 | NA | 确定细胞周期阶段，为癌症发展和靶向细胞周期药物的研究提供关键信息 | 人类细胞周期的阶段 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 分类算法 | RNA测序数据 | 大规模单细胞 |