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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2024-08-08 |
Knowledge structure and emerging trends in the application of deep learning in genetics research: A bibliometric analysis [2000-2021]
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.951939
PMID:36081985
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综述 | 本文通过文献计量分析，总结了2000年至2021年间深度学习在遗传学研究中的应用知识结构和新兴趋势 | 利用CiteSpace和VOSviewer工具，识别了国家、机构、期刊、共引文献、关键词、主题演变、路径、当前特征和新兴话题 | NA | 总结标准化知识和潜在创新方法，鼓励更多研究 | 深度学习在遗传学研究中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 文献 | 分析了69,806篇参考文献和1,754篇相关论文 | NA | NA | NA | NA |
| 542 | 2024-08-08 |
Identification of Four Biomarkers of Human Skin Aging by Comprehensive Single Cell Transcriptome, Transcriptome, and Proteomics
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.881051
PMID:36081986
|
研究论文 | 本文通过综合单细胞转录组、转录组和蛋白质组学方法，鉴定了四种与人类皮肤衰老相关的生物标志物。 | 首次结合蛋白质组学和转录组学数据，鉴定了四种与衰老相关的关键分子，并探讨了它们与衰老相关通路的关联。 | NA | 寻找能够预防衰老的生物标志物，特别是针对皮肤衰老。 | 年轻和衰老的成纤维细胞，以及衰老组织/细胞中的关键衰老相关分子。 | 数字病理学 | 皮肤老化 | Q-Exactive-MS, qPCR, 单细胞转录组 | NA | 转录组, 蛋白质组 | 包括GSE63577, GSE64553, GSE18876, GSE85358等多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 543 | 2024-08-08 |
Construction of a prognostic model related to copper dependence in breast cancer by single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.949852
PMID:36082002
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析构建了一个与乳腺癌铜依赖相关的预后模型 | 首次通过单细胞分析获得铜依赖相关基因，并构建了预后模型 | 需要进一步的研究来验证模型的长期效力和在不同人群中的适用性 | 探索铜依赖相关基因在女性乳腺癌中的临床意义 | 女性乳腺癌患者及其铜依赖相关基因 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | COX和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 训练集和测试集各一半，外部验证集包括GSE20685和GSE20711数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 544 | 2024-08-08 |
Enriching and Characterizing T Cell Repertoires from 3' Barcoded Single-Cell Whole Transcriptome Amplification Products
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2712-9_7
PMID:36087201
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研究论文 | 本文介绍了一种从已使用3'条形码单细胞全转录组扩增产物中富集和表征T细胞受体（TCR）转录本的方法 | 该方法能够在不改变原有3'条形码单细胞RNA测序流程的情况下，实现单细胞分辨率的TCR序列捕获 | NA | 旨在简化并扩展单细胞TCR测序数据获取的方法，同时保持单细胞分辨率 | T细胞受体（TCR）转录本 | NA | 癌症 | 3'条形码单细胞RNA测序 | NA | 转录本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 545 | 2024-08-08 |
A Bioinformatic Framework for Dissecting the Dynamics of T Cells from Single-Cell Transcriptome
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2712-9_14
PMID:36087208
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STARTRAC的生物信息学框架，该框架整合单细胞转录组和TCR序列作为谱系特异性标记，用于定量评估T细胞的动态特性 | 提出了一种新的生物信息学框架STARTRAC，该框架能够整合单细胞转录组和TCR序列，以定量评估T细胞的动态特性，包括克隆扩增、组织迁移和发展转变 | 目前的方法在揭示具有相同克隆型的T细胞表型差异方面存在局限性 | 定量追踪人类免疫学中T细胞的动态 | T细胞的动态特性，包括克隆扩增、组织迁移和发展转变 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 546 | 2024-08-08 |
ATAXIC: An Algorithm to Quantify Transcriptomic Perturbation Heterogeneity in Single Cancer Cells
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/4106736
PMID:36090907
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研究论文 | 本文提出了一种名为ATAXIC的算法，用于量化单个癌细胞中转录组扰动的异质性 | ATAXIC算法通过计算单个细胞中绝对z分数基因表达值的标准偏差，量化了转录组扰动的异质性水平 | NA | 研究单个癌细胞中转录组扰动的异质性，并探讨其在肿瘤生物学中的应用 | 单个癌细胞中的转录组扰动异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了八种癌症类型的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 547 | 2024-08-08 |
Transcriptome profiles of latently- and reactivated HIV-1 infected primary CD4+ T cells: A pooled data-analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.915805
PMID:36090997
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研究论文 | 本研究通过综合分析5个HIV-1潜伏期和2个再激活期的原代CD4+ T细胞模型的转录组数据，探讨了HIV-1潜伏期和再激活期感染细胞的基因表达差异 | 首次综合分析了多个HIV-1潜伏期和再激活期的原代CD4+ T细胞模型的转录组数据，识别了在潜伏期和再激活期感染细胞中差异表达的基因 | 研究仅限于转录组数据分析，未涉及其他类型的生物标志物或治疗方法 | 通过比较HIV-1潜伏期和再激活期感染细胞的转录组特征，寻找差异表达的基因，以更好地理解和表征HIV-1的潜伏和再激活 | HIV-1潜伏期和再激活期感染的原代CD4+ T细胞 | 数字病理学 | HIV-1感染 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 5个HIV-1潜伏期原代CD4+ T细胞模型和2个再激活期研究 | NA | NA | NA | NA |
| 548 | 2024-08-08 |
An immunotherapy response prediction model derived from proliferative CD4+ T cells and antigen-presenting monocytes in ccRCC
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.972227
PMID:36091022
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研究论文 | 本研究通过重新分析两个接受免疫检查点阻断（ICB）治疗的透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，探索了具有良好预测性能的免疫细胞亚型和特征 | 本研究识别了具有良好预测能力的增殖性CD4 T细胞和调节性T细胞亚型以及抗原呈递单核细胞亚型，并开发了一个预测模型，该模型在CheckMate队列中达到了93%的AUC | NA | 探索透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中对免疫检查点阻断（ICB）治疗反应具有良好预测性能的免疫细胞亚型和特征 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的免疫细胞亚型和特征 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 172个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 549 | 2024-08-08 |
Identification and Characterization of Genes Related to the Prognosis of Hepatocellular Carcinoma Based on Single-Cell Sequencing
2022, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2022.1610199
PMID:36091935
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和大数据分析，筛选与肝细胞癌（HCC）预后相关的基因，并构建了一个预测HCC预后的模型 | 通过单细胞RNA测序和大数据分析，首次构建了一个包含七个关键基因的HCC预后模型，为HCC的临床靶点和生物标志物研究提供了新视角 | NA | 研究HCC的预后相关基因，并构建一个有效的预后预测模型 | 肝细胞癌（HCC）的细胞和基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 71,915个细胞，包括34,414个肿瘤细胞，以及371个HCC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 550 | 2024-08-08 |
Network analysis of hepatocellular carcinoma liquid biopsies augmented by single-cell sequencing data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.921195
PMID:36092896
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研究论文 | 本研究通过构建基因网络，分析了肝细胞癌患者的细胞外转录组基因网络，并与健康对照组进行比较，同时结合单细胞RNA测序数据，探讨了基因共表达网络分析在肝细胞癌研究中的应用。 | 本研究首次将单细胞RNA测序数据与细胞外RNA网络分析相结合，以细胞类型特异性转录组为背景，深入探讨了肝细胞癌的基因关联网络。 | NA | 旨在通过基因共表达网络分析，揭示肝细胞癌患者的细胞外转录组基因网络特征。 | 肝细胞癌患者的细胞外转录组基因网络。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 551 | 2024-08-08 |
Repression of enhancer RNA PHLDA1 promotes tumorigenesis and progression of Ewing sarcoma via decreasing infiltrating T-lymphocytes: A bioinformatic analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.952162
PMID:36092920
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，探讨了增强子RNA PHLDA1在Ewing肉瘤中的作用，发现其通过减少浸润性T淋巴细胞促进肿瘤发生和发展 | 首次揭示了PHLDA1作为关键调节因子在Ewing肉瘤发生和发展中的作用，并通过Connectivity Map分析筛选出可能靶向Ewing肉瘤的候选化合物 | 研究主要基于数据库分析和生物信息学方法，需要进一步的实验验证 | 探索Ewing肉瘤的分子机制，寻找新的靶向治疗途径 | Ewing肉瘤样本和正常骨样本中的差异表达基因和增强子RNA | 数字病理学 | Ewing肉瘤 | CIBERSORT, GSVA, ssGSEA | NA | RNA序列 | 85个Ewing肉瘤样本和3个正常骨样本 | NA | NA | NA | NA |
| 552 | 2024-08-08 |
B7H3-dependent myeloid-derived suppressor cell recruitment and activation in pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.901349
PMID:36045668
|
研究论文 | 本研究探讨了特发性肺纤维化（IPF）中髓源性抑制细胞（MDSCs）的作用及其通过B7H3的潜在介导机制 | 首次揭示了B7H3依赖的MDSC招募和激活在肺纤维化中的作用，以及MDSCs在肺纤维化进展中的旁分泌作用 | NA | 研究MDSCs在特发性肺纤维化中的作用及其通过B7H3的潜在介导机制 | 特发性肺纤维化患者的循环MDSCs和B7H3表达 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液样本 | 特发性肺纤维化患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 553 | 2024-08-08 |
Identification of novel tumor microenvironment-associated genes in gastric cancer based on single-cell RNA-sequencing datasets
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.896064
PMID:36046240
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，识别胃癌中与肿瘤微环境相关的新基因 | 通过分析受体-配体对和细胞间相互作用，获得了MIF信号通路网络，并识别了64个在肠上皮化生和早期胃癌中差异表达的基因 | NA | 研究胃癌肿瘤微环境与异质性的关系，并探索其对患者预后的影响 | 胃癌中的肿瘤微环境相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO风险评分模型 | RNA测序数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus数据库的GSE134520数据集，识别了25个细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 554 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular and molecular changes that contribute to the progression of lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.927300
PMID:36046337
|
研究论文 | 本研究通过分析76,762个细胞的单细胞转录组数据，揭示了肺腺癌从纯磨玻璃结节（GGN）到实性结节（SN）进展过程中的细胞和分子变化 | 首次全面阐明了纯GGN和SN的细胞和分子特征，并揭示了肺腺癌进展的机制 | NA | 揭示肺腺癌进展过程中的细胞和分子变化，并发现新的治疗靶点 | 肺腺癌的纯磨玻璃结节和实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 76,762个细胞，来自四个纯GGN、四个SN和四个正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 555 | 2024-08-08 |
Heterogeneity in NK Cell Subpopulations May Be Involved in Kidney Cancer Metastasis
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/6378567
PMID:36046723
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分离出自然杀伤（NK）细胞亚群，并探讨其在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）转移中的作用 | 首次揭示了NK细胞亚群NK(EGR1)和NK(CAPG)与肾癌转移的密切关系 | NA | 研究肾癌免疫微环境和免疫细胞异质性，以改善肾癌治疗效果 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的NK细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 556 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of neuroblastoma identifies chemoresistance-associated genes and pathways
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.031
PMID:36051886
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了神经母细胞瘤中与化疗耐药相关的基因和通路 | 首次揭示了化疗耐药神经母细胞瘤细胞的双向能力，即肾上腺素能向间充质转化 | NA | 探讨神经母细胞瘤中肿瘤内异质性与治疗耐药性的关联 | 神经母细胞瘤细胞及其对依托泊苷和顺铂的耐药性 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 498个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 557 | 2024-08-08 |
Bioinformatics analysis of potential pathogenesis and risk genes of immunoinflammation-promoted renal injury in severe COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.950076
PMID:36052061
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研究论文 | 本研究通过整合166个COVID-19患者的外周血转录组数据，利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）和短时序表达挖掘（STEM）分析，识别与严重COVID-19相关的肾损伤关键基因，并探讨其潜在的免疫炎症机制。 | 本研究首次在严重COVID-19患者中识别出一组与肾损伤进展相关的关键基因，并通过蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和单细胞测序分析，深入探讨了这些基因在免疫细胞中的分布及其在肾损伤中的作用机制。 | 本研究主要基于转录组数据进行分析，未来需要更多的实验验证来支持这些发现，并进一步探讨这些基因在COVID-19肾损伤中的具体作用机制。 | 探讨严重COVID-19中免疫炎症促进肾损伤的病理机制，并识别相关的风险基因。 | 严重COVID-19患者的肾损伤及其相关的免疫炎症机制。 | 生物信息学 | COVID-19 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），短时序表达挖掘（STEM）分析，蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析，单细胞测序 | 随机森林，Nomogram模型 | 转录组数据，单细胞测序数据 | 166个COVID-19患者的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 558 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals the potential risk of anti-mesothelin CAR T Cell therapy toxicity to different organs in humans
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.807915
PMID:36059490
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了来自人类主要生理系统的数据，评估了抗间皮素CAR-T细胞疗法对不同器官的潜在毒性风险 | 首次利用scRNA-seq数据对不同器官在抗间皮素CAR-T细胞疗法中的毒性风险进行分级 | NA | 评估抗间皮素CAR-T细胞疗法对不同器官的潜在毒性风险 | 人类主要生理系统的器官，包括呼吸、心血管、消化和泌尿系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多个器官的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 559 | 2024-08-08 |
Research progress on application of single-cell TCR/BCR sequencing technology to the tumor immune microenvironment, autoimmune diseases, and infectious diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.969808
PMID:36059506
|
研究论文 | 本文总结了单细胞TCR/BCR测序技术在肿瘤免疫微环境、自身免疫疾病、传染病、免疫治疗和慢性炎症疾病中的应用进展 | 单细胞TCR/BCR测序技术能够克服细胞异质性问题，提供新的方法和视角，深入分析细胞群体中个体细胞的行为和机制及其与机体的关系 | 讨论了该技术的不足和未来应用的前景 | 探讨单细胞TCR/BCR测序技术在多种疾病中的应用及其未来发展 | 肿瘤免疫微环境、自身免疫疾病、传染病、免疫治疗和慢性炎症疾病 | 生物技术 | NA | 单细胞TCR/BCR测序 | NA | 基因表达和免疫组学数据 | 大量单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 560 | 2024-08-08 |
Identification and verification of YBX3 and its regulatory gene HEIH as an oncogenic system: A multidimensional analysis in colon cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.957865
PMID:36059530
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研究论文 | 本研究探讨了YBX3基因及其调控的lncRNA HEIH在结肠癌中的致病作用及其对肿瘤进展的影响 | 首次揭示了YBX3及其调控基因HEIH在多种癌症中的致病作用，特别是在结肠癌中的免疫逃逸机制 | 研究主要集中在结肠癌，可能需要进一步研究其在其他癌症类型中的作用 | 研究YBX3及其调控基因HEIH在癌症中的致病作用及其对肿瘤进展的影响 | YBX3基因及其调控的lncRNA HEIH在结肠癌中的作用 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA pull-down, 质谱(MS), 组织微阵列(TMA), qPCR, 蛋白质印迹(western blotting) | NA | RNA | 93名患者, 12名不同临床病理阶段的患者 | NA | NA | NA | NA |