单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-08-08 |
Inhibition of APOE potentiates immune checkpoint therapy for cancer
2022, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.70117
PMID:36147474
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研究论文 | 本研究探讨了抑制APOE对免疫检查点疗法在癌症治疗中的增强作用 | 首次报道了APOE抑制剂COG 133TFA与αPD-1联合使用可以抑制肿瘤生长并促进肿瘤消退 | NA | 研究APOE在肿瘤免疫治疗中的作用及其潜在的靶向治疗策略 | APOE在肿瘤浸润巨噬细胞中的表达及其对免疫检查点疗法的影响 | 肿瘤学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括Apoe小鼠和野生型小鼠，以及对αPD-1治疗有反应和无反应的癌症患者 |
| 502 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis to explore immune cell heterogeneity and novel biomarkers for the prognosis of lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.975542
PMID:36147484
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肺腺癌（LUAD）的细胞异质性，并探索新的预后生物标志物 | 首次对GSE149655单细胞数据进行降维处理，并通过统计分析发现肿瘤组织中高度富集的亚群，构建了10基因预后风险模型，并通过qPCR和免疫组化验证了新分子标记HLA-DRB5和CCDC50 | NA | 探索肺腺癌的免疫细胞异质性和新的预后生物标志物 | 肺腺癌（LUAD）的细胞亚群及其在肿瘤发生发展中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | GSE149655单细胞数据集中的23个亚群和11个细胞子群，以及TCGA-LUAD数据集中的462个基因 |
| 503 | 2024-08-08 |
Computational solutions for spatial transcriptomics
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.043
PMID:36147664
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综述 | 本文综述了空间转录组学平台及其计算解决方案的优势与局限，并探讨了如何利用这些平台和方法进行空间转录组学研究 | 介绍了基于深度学习的联合分析表达、空间和图像数据的新解决方案，以提取空间解析转录组中的生物信息 | 当前平台在空间分辨率、转录组异质性捕获和大规模研究吞吐量方面仍存在不足 | 旨在帮助选择适合的空间转录组学研究平台和计算解决方案 | 空间转录组学平台及其计算方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学平台 | 深度学习 | 转录组数据 | NA |
| 504 | 2024-08-08 |
Mathematical model for the relationship between single-cell and bulk gene expression to clarify the interpretation of bulk gene expression data
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.062
PMID:36147671
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研究论文 | 本文开发了一个数学模型，用于阐明单细胞和批量基因表达之间的关系，并解释批量基因表达数据的均值和方差 | 提出了一个数学模型，将批量基因表达值与单细胞基因表达轮廓的均值成比例，并通过理论、模拟和真实单细胞RNA-seq数据分析验证了其有效性 | NA | 阐明批量基因表达数据的均值和方差的解释 | 单细胞和批量基因表达之间的关系 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | 数学模型 | 基因表达数据 | NA |
| 505 | 2024-08-08 |
scWizard: A web-based automated tool for classifying and annotating single cells and downstream analysis of single-cell RNA-seq data in cancers
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.028
PMID:36147672
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研究论文 | 开发了一个名为scWizard的网络自动化工具，用于分类和注释单细胞以及下游分析单细胞RNA测序数据在癌症中的应用 | scWizard集成了基于深度神经网络学习的细胞注释方法和11种下游分析方法，提供了预训练集供用户灵活选择，并在注释肿瘤衍生淋巴细胞/自然杀伤细胞和骨髓细胞亚型方面具有更高的准确性 | NA | 开发一个集成多种分析方法的自动化工具，用于单细胞RNA测序数据的分类、注释和下游分析 | 单细胞RNA测序数据在肿瘤微环境中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 单细胞数据 | 使用113,976个细胞跨越13种癌症类型作为内置参考数据集 |
| 506 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals several LncRNAs differentially expressed in idiopathic germ cell aplasia
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.952518
PMID:36147743
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了特发性生殖细胞发育不全患者睾丸中的长链非编码RNA（LncRNA）表达差异 | 首次在单细胞水平上揭示了特发性生殖细胞发育不全患者中差异表达的LncRNA，并发现这些LncRNA与转录因子TAF9B及环境污染物双酚A的激活有关 | NA | 深入理解特发性生殖细胞发育不全的分子机制及其临床进程 | 特发性生殖细胞发育不全患者的睾丸组织 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个特发性生殖细胞发育不全患者的睾丸组织样本 |
| 507 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Different Immune Signatures in HPV- and HPV + Driven Human Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/2079389
PMID:36157879
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了HPV阳性和HPV阴性驱动的人类头颈鳞状细胞癌中不同的免疫特征 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了HPV阳性和HPV阴性头颈鳞状细胞癌微环境中的细胞组成和信号通路差异 | 研究样本量较小，且仅基于公开数据库的数据进行分析，可能影响结果的普遍性 | 评估病毒（特别是人乳头瘤病毒[HPV]）和致癌物驱动的头颈鳞状细胞癌（HNSCC）微环境 | HPV阳性和HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 131224个细胞，来自18名HPV阴性HNSCC患者和8名HPV阳性HNSCC患者 |
| 508 | 2024-08-08 |
Identification of macrophage correlated biomarkers to predict the prognosis in patients with intrahepatic cholangiocarcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.967982
PMID:36158683
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，识别与肝内胆管癌（ICC）预后相关的巨噬细胞相关生物标志物，并探讨其对免疫治疗反应的预测作用 | 首次在单细胞水平上研究ICC患者中的巨噬细胞，并发现MMP19和SIRPα可预测ICC的预后和免疫检查点阻断（ICB）反应 | 研究仅限于特定的生物标志物和特定的免疫治疗反应，未来研究需扩大样本量和探索更多潜在的生物标志物 | 探讨巨噬细胞在肝内胆管癌发展及治疗反应中的作用，并寻找相关的预后生物标志物 | 肝内胆管癌患者的巨噬细胞及相关生物标志物 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 转录组数据 | ICC和邻近组织的巨噬细胞被分为12个集群 |
| 509 | 2024-08-08 |
Comparable bidirectional neutrophil immune dysregulation between Kawasaki disease and severe COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.995886
PMID:36159873
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了川崎病和严重COVID-19之间的免疫失调差异 | 发现川崎病和严重COVID-19在单细胞RNA测序中显示出相似的免疫失调模式，特别是在中性粒细胞活化和MHC II类分子表达减少方面 | NA | 分析川崎病和严重COVID-19在单细胞RNA测序中的差异 | 川崎病患者和严重COVID-19患者的免疫失调机制 | NA | 川崎病, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 22个单细胞RNA测序数据，共102,355个细胞核 |
| 510 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of prognostic and immunological role of DTYMK in human tumors
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.989460
PMID:36159971
|
研究论文 | 本研究探讨了脱氧胸苷酸激酶（DTYMK）在人类癌症中的预后价值、功能状态及其与免疫浸润的相关性 | 首次全面分析了DTYMK在多种人类癌症中的表达及其与预后、恶性功能状态和免疫细胞浸润的关系 | NA | 研究DTYMK在人类癌症中的预后作用和免疫学角色 | DTYMK在不同癌症类型中的表达及其与临床病理特征和免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个数据库中的数据，包括TCGA、GTEx、UALCAN、CPTAC等 |
| 511 | 2024-08-08 |
Analyzing network diversity of cell-cell interactions in COVID-19 using single-cell transcriptomics
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.948508
PMID:36105110
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析了COVID-19中细胞间相互作用网络的多样性 | 本文首次在群体层面比较了不同疾病状态下的细胞间相互作用网络，而不仅仅是单个样本间的直接比较 | NA | 揭示不同疾病状态下细胞间相互作用网络的生物学特征 | COVID-19患者的细胞间相互作用网络 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集 |
| 512 | 2024-08-08 |
Classification of pyroptosis patterns and construction of a novel prognostic model for prostate cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.1003594
PMID:36105400
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，构建了一个新的与细胞焦亡相关的预后模型，用于预测前列腺癌患者的复发风险 | 首次基于批量和单细胞RNA测序数据构建了与细胞焦亡相关的预后模型，用于前列腺癌患者的复发风险预测 | NA | 开发一种新的与细胞焦亡相关的预后模型，以提高前列腺癌复发预测的准确性 | 前列腺癌患者的批量和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序 | LASSO回归 | RNA测序数据 | 多个在线数据库中的前列腺癌患者数据 |
| 513 | 2024-08-08 |
Systematic identification of cancer-associated-fibroblast-derived genes in patients with colorectal cancer based on single-cell sequencing and transcriptomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.988246
PMID:36105798
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和转录组学方法，系统识别了结直肠癌患者中癌症相关成纤维细胞（CAFs）来源的基因 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了结直肠癌中成纤维细胞的亚群及其在肿瘤微环境中的作用 | 研究仅限于结直肠癌患者，结果的普遍性和其他类型癌症的适用性有待验证 | 探讨癌症相关成纤维细胞在结直肠癌发生发展中的作用机制 | 结直肠癌患者的癌症相关成纤维细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | lasso回归分析 | 基因表达数据 | 结直肠癌患者的成纤维细胞亚群 |
| 514 | 2024-08-08 |
Single-cell gene expression analysis of cryopreserved equine bronchoalveolar cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.929922
PMID:36105804
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研究论文 | 本研究使用单细胞mRNA测序技术（scRNA-seq）分析了冷冻保存的马支气管肺泡灌洗液（BALF）细胞的转录组特征 | 首次在马中检测到与单核细胞-淋巴细胞复合体一致的转录组特征，并发现了先前未探索的T细胞和巨噬细胞亚群 | NA | 探索马支气管肺泡灌洗液的细胞组成，并深入分析主要免疫细胞群体的组成 | 冷冻保存的马支气管肺泡灌洗液细胞 | 数字病理学 | 马哮喘 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 4,631个细胞来自三匹处于缓解期的哮喘马 |
| 515 | 2024-08-08 |
Primitive genotypic characteristics in umbilical cord neutrophils identified by single-cell transcriptome profiling and functional prediction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.970909
PMID:36105817
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞转录组测序分析了新生儿脐带血和健康成人中的中性粒细胞，发现了六个具有不同标记基因和功能的亚群 | 首次揭示了新生儿脐带血中中性粒细胞的异质性和功能多样性，并发现了新的中性粒细胞亚群 | NA | 探究新生儿脐带血中中性粒细胞的功能和异质性 | 新生儿脐带血和健康成人的中性粒细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生儿脐带血和健康成人的中性粒细胞样本 |
| 516 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of the prognosis and immunological role of AKAP12: A potential biomarker for resistance to anti-VEGF inhibitors
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.943006
PMID:36110213
|
研究论文 | 本研究系统分析了A-kinase anchor protein 12 (AKAP12)与抗VEGF抑制剂敏感性、临床预后、DNA甲基化、蛋白质磷酸化和免疫细胞浸润在多种癌症中的关联 | 首次全面探讨了AKAP12在多种癌症中的作用及其作为抗VEGF抑制剂耐药性生物标志物的潜力 | NA | 探讨AKAP12在多种癌症中的作用及其作为抗VEGF抑制剂耐药性生物标志物的潜力 | AKAP12在多种癌症中的表达、功能及其与抗VEGF抑制剂耐药性的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 生物信息学工具 | NA | 基因表达数据 | 涉及卵巢癌、胶质瘤、非小细胞肺癌和结直肠癌等多种癌症类型 |
| 517 | 2024-08-08 |
The imbalance between Type 17 T-cells and regulatory immune cell subsets in psoriasis vulgaris
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1005115
PMID:36110854
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研究论文 | 本文探讨了寻常型银屑病中17型T细胞与调节性免疫细胞亚群之间的不平衡 | 利用单细胞RNA测序技术研究皮肤中免疫细胞亚群的新技术，提供了比较17型T细胞亚群转录组差异的机会 | NA | 研究寻常型银屑病中免疫细胞亚群的不平衡及其对疾病发展的影响 | 寻常型银屑病中的17型T细胞和调节性T细胞亚群 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 518 | 2024-08-08 |
A novel necroptosis-related gene signature for predict prognosis of glioma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.984712
PMID:36111134
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据，建立了一种与坏死性凋亡相关基因特征，用于预测胶质瘤患者的预后 | 首次揭示了坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的作用，并建立了一个新的基因特征模型用于预测胶质瘤的预后 | NA | 研究坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的作用，并开发一个预测胶质瘤患者预后的基因特征模型 | 胶质瘤患者的预后预测 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个胶质瘤细胞系和人类星形胶质细胞 |
| 519 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of gene expression in the substantia nigra pars compacta of a pesticide-induced mouse model of Parkinson's disease
2022-Jan-01, Translational neuroscience
IF:1.8Q4
DOI:10.1515/tnsci-2022-0237
PMID:36117858
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析了农药诱导的帕金森病小鼠模型中黑质致密部的基因表达 | 研究强调了支持细胞在农药诱导的帕金森病中的重要性，并重新关注这些细胞在疾病中的作用，而不仅仅是神经元 | NA | 阐明农药暴露导致帕金森病的机制 | C57BL/6J小鼠的黑质致密部细胞 | digital pathology | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 520 | 2024-08-08 |
High-throughput sequencing unravels the cell heterogeneity of cerebrospinal fluid in the bacterial meningitis of children
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.872832
PMID:36119025
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组测序，揭示了儿童细菌性脑膜炎中脑脊液细胞的异质性及其在疾病进展中的动态变化 | 发现了两种新型细胞亚型：FFAR2TNFAIP6中性粒细胞和THBS1IL1B单核细胞，并揭示了它们与脑脊液炎症反应强度的正相关性 | NA | 深入探索儿童细菌性脑膜炎进展中脑脊液细胞的特征，为急性中枢神经系统感染中的免疫细胞作用提供新见解 | 儿童细菌性脑膜炎患者的脑脊液样本 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个细菌性脑膜炎患者在疾病进展不同阶段的脑脊液样本 |