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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2024-08-08
Impaired expression of serine/arginine protein kinase 2 (SRPK2) affects melanoma progression
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文研究了丝氨酸/精氨酸蛋白激酶2(SRPK2)在黑色素瘤进展中的作用 发现SRPK2在黑色素瘤细胞中的表达与不良预后相关,并通过CRISPR-Cas9基因编辑技术验证了SRPK2在抑制黑色素瘤细胞增殖和侵袭能力中的特定作用 NA 探讨SRPK1和SRPK2在黑色素瘤进展中的不同功能角色 黑色素瘤细胞中的SRPK2表达 NA 黑色素瘤 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑 NA RNA 多个黑色素瘤患者样本 NA NA NA NA
482 2024-08-08
A necroptosis-related prognostic model for predicting prognosis, immune landscape, and drug sensitivity in hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing analysis and weighted co-expression network
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于单细胞测序分析和加权共表达网络,构建了一个与坏死性凋亡相关的预后模型,用于预测肝细胞癌的预后、免疫景观和药物敏感性 首次构建了基于坏死性凋亡相关基因的预后模型,并探讨了高和低坏死性凋亡组与肝细胞癌中免疫细胞浸润的关系 NA 研究坏死性凋亡相关基因在肝细胞癌中的临床预后特征及其与免疫微环境的关系 肝细胞癌患者及其坏死性凋亡相关基因 数字病理学 肝细胞癌 单细胞测序 加权共表达网络 单细胞数据 使用了来自GEO数据库的GSE125449和GSE151530数据集,以及TCGA和ICGC队列中的肝细胞癌患者数据 NA NA NA NA
483 2024-08-08
Fibronectin-1 is a dominant mechanism for rheumatoid arthritis via the mediation of synovial fibroblasts activity
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究使用scRNA-seq技术评估与类风湿性关节炎(RA)相关的分子机制,并识别出纤维连接蛋白-1(FN-1)作为关键基因,可能成为RA治疗的新靶点 首次通过scRNA-seq技术识别出FN-1在RA发展中的关键作用,并提出其作为潜在的治疗靶点 研究仅基于GEO数据库中的scRNA-seq数据,可能需要进一步的实验验证 评估类风湿性关节炎的分子机制并识别关键基因 类风湿性关节炎患者的滑膜成纤维细胞 NA 类风湿性关节炎 scRNA-seq NA 基因表达数据 来自类风湿性关节炎患者的滑膜成纤维细胞的scRNA-seq数据集 NA NA NA NA
484 2024-08-08
Comprehensive pan-cancer analysis identifies cellular senescence as a new therapeutic target for cancer: multi-omics analysis and single-cell sequencing validation
2022, American journal of cancer research IF:3.6Q2
PMID:36225642
研究论文 本文通过多组学分析和单细胞测序验证,全面分析了细胞衰老相关基因在33种肿瘤类型中的表达、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化和药物敏感性变化,并探讨了细胞衰老评分与预后、肿瘤免疫微环境及肿瘤免疫相关基因表达的关系。 首次全面分析了细胞衰老在多种癌症类型中的作用,并验证了其在肿瘤免疫微环境中的重要性,为癌症治疗提供了新的靶点。 NA 探讨细胞衰老与肿瘤免疫之间的关系,并验证其作为癌症治疗新靶点的潜力。 细胞衰老相关基因在多种肿瘤类型中的表达、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化和药物敏感性。 数字病理学 癌症 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 33种肿瘤类型的样本 NA NA NA NA
485 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing combined with whole exome sequencing reveals the landscape of the immune pathogenic response to chronic mucocutaneous candidiasis with STAT1 GOF mutation
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序结合全外显子测序,揭示了STAT1 GOF突变导致的慢性黏膜皮肤念珠菌病免疫发病机制的景观 首次结合单细胞RNA测序和全外显子测序技术,深入分析了STAT1 GOF突变患者的免疫细胞变化和相关基因表达 研究样本量较小,且部分病例缺乏详细数据 探究慢性黏膜皮肤念珠菌病的免疫发病机制 慢性黏膜皮肤念珠菌病患者及STAT1 GOF突变 数字病理学 慢性黏膜皮肤念珠菌病 单细胞RNA测序,全外显子测序 NA 基因表达数据 共分析了4例慢性黏膜皮肤念珠菌病患者,其中3例数据缺失 NA NA NA NA
486 2024-08-08
Integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing to reveal an immunogenic cell death-related 5-gene panel as a prognostic model for osteosarcoma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了与免疫原性细胞死亡相关的5基因面板,作为骨肉瘤的预后模型 开发了一个基于免疫原性细胞死亡的5基因风险面板,用于评估骨肉瘤患者的预后风险 NA 确定免疫原性细胞死亡在骨肉瘤中的作用,并构建基于免疫原性细胞死亡的预后面板 骨肉瘤的恶性细胞和正常细胞,以及免疫原性细胞死亡相关基因 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序,批量RNA测序 LASSO-Cox回归分析 RNA测序数据 212名骨肉瘤患者 NA NA NA NA
487 2024-08-08
Identification of tumor antigens and immune subtypes in breast cancer for mRNA vaccine development
2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 研究旨在识别与乳腺癌相关的肿瘤抗原,以开发针对乳腺癌的mRNA疫苗,并确定适合mRNA疫苗接种的人群 识别了三种与乳腺癌相关的肿瘤抗原,并确定了三种免疫亚型,为乳腺癌mRNA疫苗的开发提供了新的方向 NA 开发针对乳腺癌的mRNA疫苗并确定适合接种的人群 乳腺癌相关的肿瘤抗原和免疫亚型 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序 NA 基因表达数据和临床数据 数据来自TCGA和METABRIC数据库,具体样本数量未提及 NA NA NA NA
488 2024-08-08
Integrated Single-Cell and RNA Sequencing Analysis Identifies Key Immune Cell and Dendritic Cells Associated Genes Participated in Myocarditis
2022, Journal of immunology research IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和RNA测序分析,识别了与心肌炎相关的关键免疫细胞和树突状细胞相关基因 本研究首次通过单细胞RNA测序技术,详细分析了心肌炎中免疫细胞的浸润及其相关基因的表达模式 NA 探究心肌炎中免疫细胞的基因和单细胞特征,以了解免疫细胞在心肌炎中的作用 心肌炎中的免疫细胞和树突状细胞相关基因 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 20972个细胞 NA NA NA NA
489 2024-08-08
Single-Cell RNA sequencing reveals immune cell dynamics and local intercellular communication in acute murine cardiac allograft rejection
2022, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了急性小鼠心脏同种异体移植排斥反应中的免疫细胞动态和局部细胞间通讯 首次在单细胞水平上展示了急性小鼠心脏同种异体移植排斥反应的免疫细胞图谱,并揭示了CXCR3通路在排斥反应中的作用 NA 探索急性心脏同种异体移植排斥反应中的免疫细胞动态和局部细胞间通讯 小鼠心脏移植模型中的CD45免疫细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠心脏移植模型中的CD45免疫细胞 NA NA NA NA
490 2024-08-08
Integration of single-cell and bulk RNA-seq to establish a predictive signature based on the differentiation trajectory of M2 macrophages in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,建立了基于M2巨噬细胞分化轨迹的肺腺癌预测标志物 首次在单细胞水平上研究M2巨噬细胞的异质性及其与肺腺癌分化相关的基因,以指导临床治疗 NA 建立基于M2巨噬细胞分化轨迹的肺腺癌预测模型,以提高精准治疗的效果 M2巨噬细胞在肺腺癌中的异质性和分化相关基因 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 Lasso-Cox, 多元逐步回归 RNA序列 12个肺腺癌样本 NA NA NA NA
491 2024-08-08
Integrative bioinformatics analysis to identify the effects of circadian rhythm on Crohn's disease
2022, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过综合生物信息学分析,探讨了昼夜节律对克罗恩病发病机制的影响 首次揭示了昼夜节律相关基因在克罗恩病中的异常表达及其与疾病严重程度的关系 研究主要基于公共数据库的数据,未来需要更多的临床样本验证 探究昼夜节律在克罗恩病发病机制中的作用 克罗恩病患者的多组学数据和临床信息 生物信息学 炎症性肠病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, CIBERSORT NA 基因表达数据 来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的克罗恩病患者样本 NA NA NA NA
492 2024-08-08
Fibroblasts mediate the angiogenesis of pheochromocytoma by increasing COX4I2 expression
2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了COX4I2在调节嗜铬细胞瘤血管生成中的作用 发现成纤维细胞通过增加COX4I2表达来介导嗜铬细胞瘤的血管生成 NA 探索COX4I2在嗜铬细胞瘤血管生成中的作用 COX4I2在嗜铬细胞瘤中的表达及其对血管生成的影响 NA 嗜铬细胞瘤 scRNA-seq, 免疫染色, qPCR NA mRNA 一个嗜铬细胞瘤病例及NIH3T3细胞系 NA NA NA NA
493 2024-08-08
Single-cell transcriptome analysis reveals T-cell exhaustion in denosumab-treated giant cell tumor of bone
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫染色实验,探讨了地诺单抗治疗后骨巨细胞瘤中的免疫景观,特别是CD8 T细胞的耗竭情况。 首次揭示了地诺单抗治疗后骨巨细胞瘤中CD8 T细胞的耗竭现象,并发现肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的M2型偏斜以及POSTN表达的增加与肿瘤复发相关。 NA 研究地诺单抗治疗骨巨细胞瘤后,肿瘤浸润淋巴细胞的分子和功能特性。 骨巨细胞瘤中的CD8 T细胞和肿瘤相关巨噬细胞。 数字病理学 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
494 2024-08-08
Integrated single-cell RNA-seq analysis identifies immune heterogeneity associated with KRAS/TP53 mutation status and tumor-sideness in colorectal cancers
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,分析了KRAS/TP53突变状态和肿瘤侧性对结直肠癌免疫微环境的影响 发现了结直肠癌中两种耗竭的CD8+ T细胞亚型和预示不良预后的FOLR2+ LYVE1+巨噬细胞,并揭示了KRAS/TP53双突变通过影响免疫细胞的能量代谢和细胞间通讯,促进免疫抑制 NA 分析KRAS/TP53突变状态和肿瘤侧性对结直肠癌免疫微环境的影响 结直肠癌的免疫微环境 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 共包括78个单细胞RNA测序数据集,涵盖42个未经治疗的结直肠肿瘤、13个肿瘤邻近组织和23个正常黏膜组织 NA NA NA NA
495 2024-08-08
Case report: Understanding the impact of persistent tissue-localization of SARS-CoV-2 on immune response activity via spatial transcriptomic analysis of two cancer patients with COVID-19 co-morbidity
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
病例报告 本报告通过空间转录组学分析,研究了两位患有COVID-19合并症的癌症患者的组织定位免疫反应 首次展示了空间转录组学分析在肿瘤和邻近正常组织中与淋巴细胞相关的SARS-CoV-2反应的一致性,并揭示了患者特异性SARS-CoV-2记忆B细胞的主要贡献 研究样本量较小,仅包括两位患者,可能影响结果的普遍性 探讨SARS-CoV-2在长期免疫记忆和癌症治疗中的影响 患有COVID-19合并症的癌症患者的免疫反应 数字病理学 肝细胞癌,结直肠癌 空间转录组学分析,RNAscope,多重免疫组织化学,单细胞RNA测序 NA 转录组数据 两位患者(一位肝细胞癌患者和一位结直肠癌患者) NA NA NA NA
496 2024-08-08
L36G is associated with cutaneous antiviral competence in psoriasis
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文研究了L36G与银屑病皮肤抗病毒能力的关系,通过基因表达谱分析、GO和KEGG通路富集分析、蛋白质相互作用网络构建等方法,发现IL36G与抗病毒蛋白在银屑病发病机制中的潜在关联。 首次揭示了IL36G与抗病毒蛋白在银屑病发病机制中的关联,并提出它们可能是银屑病发生和严重程度的新候选分子标记。 研究主要基于基因表达数据和蛋白质相互作用网络分析,未涉及临床试验验证。 探讨银屑病发病机制中IL36G与抗病毒蛋白的关系。 银屑病患者的皮肤样本和健康对照皮肤样本。 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序、基因共表达网络分析 NA 基因表达数据 银屑病样本和健康对照样本 NA NA NA NA
497 2024-08-08
Proteomics Combined with RNA Sequencing to Screen Biomarkers of Sepsis
2022, Infection and drug resistance IF:2.9Q2
研究论文 本文通过蛋白质组学结合RNA测序技术筛选脓毒症患者血清中的生物标志物,并寻找新的诊断和治疗靶点 采用数据非依赖采集(DIA)方法进行蛋白质谱分析,结合RNA测序技术,通过九象限分析和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)及基因本体(GO)功能富集分析,筛选出在蛋白质组和转录组中表达趋势一致的差异因子 NA 筛选脓毒症的生物标志物和新的诊断及治疗靶点 脓毒症患者和健康志愿者的血样 数字病理学 脓毒症 RNA测序 NA 蛋白质和基因数据 22名脓毒症患者和10名健康志愿者的血样 NA NA NA NA
498 2024-08-08
Corrigendum: The role of NR4A1 in the pathophysiology of osteosarcoma: A comprehensive bioinformatics analysis of the single-cell RNA sequencing dataset
2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
correction NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
499 2024-08-08
Single-cell sequencing of brain tissues reveal the central nervous system's susceptibility to SARS-CoV-2 and the drug
2022, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组分析大脑组织,探讨了SARS-CoV-2感染对人类中枢神经系统的脆弱性,并预测了药物(-)-儿茶素对神经系统的影响。 首次通过单细胞测序技术揭示了SARS-CoV-2入侵大脑的机制,并发现了(-)-儿茶素可能减轻COVID-19对神经系统的影响。 NA 探讨SARS-CoV-2对中枢神经系统的感染机制及可能的治疗药物。 人类大脑组织及SARS-CoV-2病毒。 数字病理学 COVID-19 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 涉及不同年龄段的大鼠及人类大脑组织样本。 NA NA NA NA
500 2024-08-08
M2-like tumor-associated macrophage-related biomarkers to construct a novel prognostic signature, reveal the immune landscape, and screen drugs in hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过综合分析单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序数据,鉴定与M2样肿瘤相关巨噬细胞(M2-like TAMs)相关的生物标志物,构建新的预后标志物,揭示肝细胞癌(HCC)的免疫景观,并筛选潜在的治疗药物。 本研究通过综合分析scRNA-seq和批量RNA-seq数据,首次构建了基于M2样TAM相关基因的预后标志物,并揭示了HCC的免疫景观。 NA 旨在通过综合分析scRNA-seq和批量RNA-seq数据,鉴定与M2样TAM相关的生物标志物,构建新的预后标志物,揭示HCC的免疫景观,并筛选潜在的治疗药物。 M2样肿瘤相关巨噬细胞(M2-like TAMs)相关的生物标志物及其在肝细胞癌(HCC)中的作用。 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 加权基因共表达网络分析(WGCNA) RNA-seq数据 127个M2样TAM相关基因 NA NA NA NA
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