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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of AIM2 inflammasomes with potential implications for immunotherapy in human cancer: A bulk omics research and single cell sequencing validation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.998266
PMID:36248785
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研究论文 | 本研究通过大规模组学研究和单细胞测序验证,分析了AIM2炎症小体在泛癌中的作用,并探讨了其对人类癌症免疫治疗的潜在影响。 | 首次在泛癌背景下全面分析AIM2炎症小体,并通过单细胞转录组测序技术验证其在肿瘤微环境中的激活状态。 | 研究主要依赖于公共数据库和单细胞测序数据,可能存在样本选择偏倚和数据解释的局限性。 | 探讨AIM2炎症小体在泛癌中的表达模式、预后意义及其与免疫治疗的相关性。 | AIM2炎症小体及其相关基因在不同癌症中的表达和功能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas (TCGA)和The Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库中的数据,具体样本数量未详细说明。 | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-08-08 |
Single cell meta-analysis of EndMT and EMT state in COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.976512
PMID:36248845
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meta-分析 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组,以探究COVID-19中的间质过渡状态 | 首次通过分析公共数据库的单细胞测序数据,识别了早期和晚期的内皮间质过渡(EndMT)和上皮-间质过渡(EMT) | NA | 探究COVID-19患者肺部间质过渡状态及其与纤维化的关系 | 健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体45例,COVID-19患者58例,特发性肺纤维化患者64例 | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-08-08 |
Transcriptional states of CAR-T infusion relate to neurotoxicity - lessons from high-resolution single-cell SOM expression portraying
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.994885
PMID:36248848
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研究论文 | 本文通过重新分析24名患者的单细胞RNA测序数据,探讨了CAR-T细胞免疫疗法中细胞状态与神经毒性的关系 | 开发了一种单细胞数据描绘工作流程,用于解析单细胞分辨率的转录状态空间,并通过直观的可视化、功能挖掘、分子细胞分层和变异性分析展示了单细胞数据描绘的能力 | NA | 研究CAR-T细胞免疫疗法中的细胞状态与神经毒性的关系 | 24名患者的单细胞RNA测序数据 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 24名患者,超过130,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals effects of chemotherapy on the immune landscape and TCR/BCR clonal expansion in a relapsed ovarian cancer patient
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.985187
PMID:36248860
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,揭示了化疗对复发性卵巢癌患者免疫景观及TCR/BCR克隆扩增的影响 | 首次在单细胞分辨率下,全面描述了化疗耐药患者在不同治疗阶段肿瘤、腹水和外周血中的多维细胞和免疫学图谱 | 研究仅基于单一患者的数据,可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探讨化疗对复发性卵巢癌患者免疫环境的具体影响,并提出改善化疗引起的免疫损伤的策略 | 复发性化疗耐药的卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 单一患者 | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-08-08 |
Evaluating the role of IDO1 macrophages in immunotherapy using scRNA-seq and bulk-seq in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1006501
PMID:36248886
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量测序(bulk-seq)分析结直肠癌(CRC)患者,以评估IDO1巨噬细胞在免疫治疗中的作用 | 首次详细分类了结直肠癌中的巨噬细胞亚群,并揭示了IDO1巨噬细胞在不同亚群中的浸润程度差异 | NA | 研究IDO1巨噬细胞在结直肠癌免疫治疗中的作用 | 结直肠癌患者及其巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量测序(bulk-seq) | NA | RNA序列数据 | 多个结直肠癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-08-08 |
Metabolic-related gene pairs signature analysis identifies ABCA1 expression levels on tumor-associated macrophages as a prognostic biomarker in primary IDHWT glioblastoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.869061
PMID:36248907
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研究论文 | 本研究通过分析代谢相关基因对签名,确定了肿瘤相关巨噬细胞中ABCA1表达水平作为原发性IDHWT胶质母细胞瘤的预后生物标志物。 | 开发了一种基于代谢相关基因对的预后签名,用于原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的个性化管理。 | NA | 开发一种针对IDHWT胶质母细胞瘤患者的稳健预后签名。 | 原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织和临床数据。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了377个样本,包括204个训练集样本和173个验证集样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-08-08 |
Expression Analysis of Ligand-Receptor Pairs Identifies Cell-to-Cell Crosstalk between Macrophages and Tumor Cells in Lung Adenocarcinoma
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/9589895
PMID:36249427
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了肺腺癌中的配体-受体对表达,揭示了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间对话。 | 首次在肺腺癌中详细分析了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的自分泌和旁分泌网络,并构建了基于细胞间相互作用的机器学习预测模型。 | 研究依赖于已发表文献和公开数据库中的样本,可能存在数据来源的局限性。 | 探索肺腺癌中巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间通信,并识别与患者预后相关的关键基因对。 | 肺腺癌患者的单细胞和批量RNA测序样本,以及巨噬细胞和肿瘤细胞的细胞亚型。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 159,219个单细胞(包括18,248个肿瘤细胞和29,520个巨噬细胞) | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-08-08 |
Identification of cellular heterogeneity and immunogenicity of chondrocytes via single-cell RNA sequencing technique in human osteoarthritis
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1004766
PMID:36249797
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人骨关节炎中软骨细胞的异质性和免疫原性 | 首次定义了八种具有不同生物学功能的软骨细胞亚型,并发现效应软骨细胞和纤维软骨细胞可能促进骨关节炎的发展 | NA | 探索软骨细胞的生物学功能和标志物,以促进骨关节炎的准确诊断和靶向治疗 | 人骨关节炎中的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-08-08 |
[New insights into the bone marrow niche in multiple myeloma revealed by single-cell profiling technologies]
2022, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.63.1188
PMID:36198544
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术等新技术揭示的多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | 利用单细胞RNA测序和高参数流式细胞术等新技术深入研究了多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | NA | 探讨多发性骨髓瘤骨髓微环境中的细胞组成及其相互作用 | 多发性骨髓瘤骨髓微环境中的非造血细胞和成熟造血细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-08-08 |
Identification of Diagnostic Genes and Effective Drugs Associated with Osteoporosis Treatment by Single-Cell RNA-Seq Analysis and Network Pharmacology
2022, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2022/6830635
PMID:36199280
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析和网络药理学方法,识别与骨质疏松治疗相关的诊断基因和有效药物 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学方法,识别出与骨质疏松特定细胞亚群相关的关键基因和潜在药物 | 研究仅基于特定数据集和计算方法,实际临床应用的有效性和安全性需进一步验证 | 探索骨质疏松的诊断和治疗方法 | 骨质疏松相关的诊断基因和有效药物 | 数字病理学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15,577个细胞,识别出12个细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-08-08 |
Bulk and Single-Cell Transcriptome Analyses Revealed That the Pyroptosis of Glioma-Associated Macrophages Participates in Tumor Progression and Immunosuppression
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1803544
PMID:36199426
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的细胞焦亡参与肿瘤进展和免疫抑制 | 首次阐明了胶质瘤中细胞焦亡与临床预后及免疫细胞浸润的关系,并发现了潜在的治疗靶点,如细胞焦亡抑制剂 | NA | 探索胶质瘤中细胞焦亡的作用及其对预后和免疫环境的影响 | 胶质瘤相关巨噬细胞的细胞焦亡及其在肿瘤进展和免疫抑制中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个数据集,包括TCGA和CGGA队列,以及三个独立的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-08-08 |
Stability of scRNA-Seq Analysis Workflows is Susceptible to Preprocessing and is Mitigated by Regularized or Supervised Approaches
2022, Evolutionary bioinformatics online
DOI:10.1177/11769343221123050
PMID:36199555
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序(scRNA-Seq)分析工作流程的稳定性,特别是预处理步骤对其的影响,并探讨了正则化或监督方法如何缓解这一问题。 | 本文首次全面评估了scRNA-Seq分析工作流程在降维、聚类和轨迹推断中的稳健性,并引入了神经网络方法来评估模型复杂度对偏差/方差权衡的影响。 | 研究主要集中在公共数据库中的时间序列单细胞转录组数据,可能无法完全代表所有scRNA-Seq数据的情况。 | 旨在全面审查scRNA-Seq分析工作流程的稳健性,特别是在降维、聚类和轨迹推断方面。 | 单细胞RNA测序数据分析工作流程的稳定性及其对预处理步骤的敏感性。 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | 神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | 超过6000次分析 | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-08-08 |
Regulatory pattern of abnormal promoter CpG island methylation in the glioblastoma multiforme classification
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.989985
PMID:36199581
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研究论文 | 本研究探讨了启动子CpG岛甲基化异常在胶质母细胞瘤分类中的调控模式 | 首次构建了基于启动子CpG岛甲基化驱动基因的胶质母细胞瘤样本集群的多组学尺度图,并开发了胶质母细胞瘤的诊断图和预测模型 | NA | 研究启动子CpG岛甲基化异常在胶质母细胞瘤分类中的作用 | 胶质母细胞瘤的分类和诊断 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CpG岛甲基化测序 | NA | 甲基化谱、表达谱和单细胞测序数据 | 多个高注释公共临床队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-08-08 |
Versican enrichment predicts poor prognosis and response to adjuvant therapy and immunotherapy in gastric cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.960570
PMID:36203562
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研究论文 | 本文评估了胃癌(GC)患者中VCAN表达对预后及辅助治疗和免疫治疗反应的影响 | VCAN可作为预测胃癌患者对辅助化疗、辅助放化疗及免疫治疗反应的潜在指标 | NA | 研究VCAN表达在胃癌中的作用及其对治疗反应的预测价值 | 胃癌患者的VCAN表达及其对治疗反应的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1353名胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-08-08 |
Mechanism investigation and experiment validation of capsaicin on uterine corpus endometrial carcinoma
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.953874
PMID:36210802
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验操作,探讨辣椒素目标基因GATA1在子宫内膜癌治疗中的潜在机制,并开发疾病预后模型以验证该模型 | 本研究首次筛选出与预后相关的高风险基因GATA1,并通过Kaplan-Meier分析和ROC曲线验证了其作为独立预后因子的有效性 | NA | 探讨辣椒素在子宫内膜癌治疗中的作用机制并开发预后模型 | 辣椒素、GATA1基因、子宫内膜癌 | NA | 子宫内膜癌 | 生物信息学分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of immune-related autophagy in spinal cord injury in rats
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.987344
PMID:36211348
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了大鼠脊髓损伤后免疫相关自噬的作用 | 首次全面评估了脊髓损伤部位的细胞类型,并筛选了免疫自噬相关因子的表达及信号通路 | NA | 探究脊髓损伤后的细胞组成变化、细胞发展轨迹及细胞间通讯 | 大鼠脊髓损伤部位的细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 几乎涵盖了所有脊髓损伤部位的细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-08-08 |
A novel T-cell proliferation-associated regulator signature pre-operatively predicted the prognostic of bladder cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.970949
PMID:36211359
|
研究论文 | 本研究通过收集膀胱癌患者的mRNA表达谱和临床信息,利用LASSO Cox回归模型建立了一个多基因签名,用于预测膀胱癌的预后和分期 | 本研究首次建立了一个与T细胞增殖相关调节因子签名,用于膀胱癌的预后预测 | NA | 研究T细胞增殖及其免疫微环境,以改善膀胱癌的预后和免疫治疗反应 | 膀胱癌患者的mRNA表达谱和临床信息 | 数字病理学 | 膀胱癌 | LASSO Cox回归模型 | LASSO Cox回归模型 | mRNA表达谱 | TCGA队列和验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of CSF reveals neuroprotective RAC1+ NK cells in Parkinson's disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.992505
PMID:36211372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了帕金森病患者的脑脊液,揭示了神经保护性的RAC1+ NK细胞在帕金森病中的作用 | 首次在帕金森病患者中发现RAC1在NK细胞中显著上调,并探讨了RAC1 NK细胞在神经保护中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和公开的单细胞RNA测序数据,需要进一步的人体临床研究验证 | 探究NK细胞在帕金森病中的分子机制及其神经保护作用 | 帕金森病患者的脑脊液中的NK细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了公开的单细胞RNA测序数据(GSE141578),涉及帕金森病患者的脑脊液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-08-08 |
Identification of immune cell infiltration and diagnostic biomarkers in unstable atherosclerotic plaques by integrated bioinformatics analysis and machine learning
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.956078
PMID:36211422
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和机器学习方法,识别了不稳定动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞浸润和诊断生物标志物。 | 本研究首次详细分析了不稳定斑块中免疫细胞的浸润情况,并发现了与斑块稳定性相关的关键基因和潜在治疗药物。 | 研究主要依赖于公共数据库的数据,需要进一步的临床样本验证。 | 旨在探讨免疫细胞在不稳定斑块形成中的作用,并探索相关的诊断生物标志物。 | 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞和相关基因。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 22种免疫细胞类型,来自公共GEO数据库的RNA测序和微阵列数据。 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-08-08 |
The emerging roles of interstitial macrophages in pulmonary fibrosis: A perspective from scRNA-seq analyses
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.923235
PMID:36211428
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综述 | 本文综述了间质巨噬细胞在肺纤维化中的新兴作用,并通过单细胞RNA测序分析提供了新的视角 | 利用单细胞RNA测序技术结合生物信息学方法,重新认识间质巨噬细胞在肺纤维化中的作用 | NA | 探讨间质巨噬细胞在肺纤维化中的作用及其分类和功能 | 间质巨噬细胞及其在肺纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |