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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-08-08 |
Identification of cuproptosis-related subtypes in lung adenocarcinoma and its potential significance
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.934722
PMID:36263125
|
研究论文 | 本研究探讨了铜死亡相关基因(CRGs)在肺腺癌(LUAD)中的转录和遗传改变,及其在肿瘤微环境和预测LUAD预后中的潜在意义 | 首次识别出与铜死亡相关的肺腺癌分子亚型,并开发了铜死亡相关基因评分(CRG_score),用于预测免疫治疗反应和临床价值 | NA | 研究铜死亡相关基因在肺腺癌中的功能及其在临床病理特征、药物敏感性和预后中的作用 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个独立队列和临床亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in atherosclerosis: Mechanism and precision medicine
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.977490
PMID:36267275
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化研究中的应用,旨在揭示其发生、发展和治疗机制 | 利用单细胞RNA测序技术揭示细胞水平的生物机制,解决传统批量RNA测序无法解决的细胞异质性问题 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化研究中的应用 | 动脉粥样硬化的发生、发展和治疗机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-08-08 |
Atlas of human dental pulp cells at multiple spatial and temporal levels based on single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.993478
PMID:36267574
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析技术,探讨了人类牙髓细胞在不同空间和时间水平上的细胞异质性 | 首次揭示了牙髓细胞在不同发育阶段的细胞异质性,特别是牙髓干细胞的异质性 | 研究仅限于四个不同发育阶段的牙髓样本,可能无法涵盖所有可能的细胞类型和状态 | 阐明牙髓再生机制及牙髓干细胞在发育和再生中的作用 | 人类牙髓细胞及其在不同空间和时间水平上的细胞异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个不同发育阶段的牙髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 444 | 2024-08-08 |
Comprehensive single cell analysis of pandemic influenza A virus infection in the human airways uncovers cell-type specific host transcriptional signatures relevant for disease progression and pathogenesis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.978824
PMID:36268025
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类呼吸道上皮细胞对流感A病毒感染的细胞类型特异性宿主转录反应 | 首次全面分析了人类呼吸道上皮细胞在流感病毒感染中的细胞类型特异性宿主抗病毒反应 | NA | 探究不同细胞类型在流感A病毒感染中的宿主转录反应及其对疾病进展和发病机制的影响 | 人类呼吸道上皮细胞在流感A病毒感染中的反应 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过19,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 445 | 2024-08-08 |
Revealing key regulators of neutrophil function during inflammation by re-analysing single-cell RNA-seq
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0276460
PMID:36269754
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研究论文 | 本研究通过重新分析已发表的小鼠和人类中性粒细胞的单细胞RNA测序数据,揭示了在稳态和炎症条件下调控中性粒细胞分化和炎症反应的转录调控网络 | 发现了在COVID19患者中,中性粒细胞的激活与炎症特异性转录因子模块的选择性激活相关,特别是IRF7的表达在中性粒细胞中显著增加,并与炎症反应的强度正相关 | NA | 揭示炎症过程中中性粒细胞功能的关键调控因子 | 小鼠和人类中性粒细胞 | 数字病理学 | COVID19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 涉及小鼠和人类中性粒细胞的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 446 | 2024-08-08 |
A novel testis-enriched gene, Samd4a, regulates spermatogenesis as a spermatid-specific factor
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.978343
PMID:36274854
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定了一种新的睾丸特异性基因Samd4a,并探讨了其在精子发生中的作用 | 首次鉴定并研究了Samd4a基因在精子发生中的特异性表达及其对精子发生的影响 | NA | 探讨Samd4a基因在精子发生中的作用及其在男性不育中的潜在应用 | Samd4a基因及其在精子发生中的功能 | NA | 男性不育 | 转录组分析、CRISPR/Cas9系统、Western blot分析、单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 包括正常对照组、阻塞性无精子症患者和非阻塞性无精子症患者的多组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-08-08 |
Identification of a six-gene prognostic signature for bladder cancer associated macrophage
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.930352
PMID:36275756
|
研究论文 | 本研究基于TCGA数据,利用WGCNA、GO富集分析和KEGG信号通路分析,结合LASSO和Cox回归方法,开发了一种与膀胱癌相关的TAM(M2巨噬细胞)相关的六基因预后模型 | 首次报道了膀胱癌中特定的TAM基因特征,并建立了一个包含六个关键基因的预后模型 | NA | 开发一种与膀胱癌相关的TAM相关的预后模型 | 膀胱癌患者的TAM相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | WGCNA, GO富集分析, KEGG信号通路分析, LASSO, Cox回归 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA数据和GEO下载的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-08-08 |
Transcriptome profile and clinical characterization of ICOS expression in gliomas
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.946967
PMID:36276141
|
研究论文 | 本研究调查了诱导共刺激分子(ICOS)在胶质瘤中的转录组特征和临床特征 | 发现ICOS在高分级、IDH野生型和间充质亚型的胶质瘤中显著上调,并与T细胞活性及免疫检查点有强相关性 | NA | 探讨ICOS在胶质瘤中的表达及其与临床特征和免疫反应的关系 | ICOS在胶质瘤中的表达及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 301个胶质瘤样本(CGGA301队列),697个样本(TCGA胶质瘤数据集),325个胶质瘤样本(CGGA325数据集) | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2024-08-08 |
Pan-Cancer Analysis on the Oncogenic Role of Programmed Cell Death 10
2022, Journal of oncology
DOI:10.1155/2022/1242658
PMID:36276268
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了程序性细胞死亡因子10(PDCD10)在多种肿瘤中的作用及其可能的机制 | 首次全面分析PDCD10在多种癌症中的表达及其与预后的关联,并探讨了其通过Hippo信号通路、RNA转运等途径在肿瘤发生中的作用 | 研究主要基于数据库分析,缺乏实验验证 | 探索PDCD10在不同肿瘤中的作用及其机制 | PDCD10基因及其结合蛋白在多种癌症中的表达与功能 | 数字病理学 | 多种癌症 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞测序数据 | 多种癌症类型的患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2024-08-08 |
Chitinase-3 like-protein-1 promotes glioma progression via the NF-κB signaling pathway and tumor microenvironment reprogramming
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.75069
PMID:36276655
|
研究论文 | 本文研究了壳多糖酶-3样蛋白1(CHI3L1)在胶质瘤进展中的作用及其通过NF-κB信号通路和肿瘤微环境重编程的机制。 | 首次揭示了CHI3L1通过与ACTN4和NFKB1结合,促进NF-κB亚基在胶质瘤细胞中的核转位,以及通过与肿瘤相关巨噬细胞上的CD44相互作用激活AKT通路,促进M2巨噬细胞极化,从而重编程肿瘤微环境。 | NA | 探讨CHI3L1在胶质瘤进展中的作用及其分子机制。 | CHI3L1在胶质瘤中的表达及其对患者生存的影响,以及CHI3L1与NF-κB信号通路和肿瘤微环境的关系。 | 数字病理学 | 脑癌 | 酶联免疫吸附试验,蛋白质印迹,免疫组织化学,单细胞RNA测序,人蛋白质组微阵列,共免疫沉淀 | NA | 蛋白质,RNA | 涉及人胶质瘤细胞系和动物实验 | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2024-08-08 |
Eicosanoids in the pancreatic tumor microenvironment - a multicellular, multifaceted progression
2022, Gastro hep advances
DOI:10.1016/j.gastha.2022.02.007
PMID:36277993
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研究论文 | 本文研究了胰腺肿瘤微环境中与肿瘤发生相关的二十烷类物质及其合成细胞类型 | 识别了胰腺肿瘤发生过程中关键的二十烷类物质变化及其合成细胞类型,并发现血栓素和前列环素的表达在动物模型和人类疾病中保守,可能成为新的可药物靶点 | NA | 旨在识别与胰腺肿瘤发生相关的二十烷类物质及其合成细胞类型 | 胰腺肿瘤微环境中的二十烷类物质及其合成细胞类型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 质谱法,RNA测序 | NA | scRNA-seq数据 | 小鼠模型和患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2024-08-08 |
STtools: A Comprehensive Software Pipeline for Ultra-high Resolution Spatial Transcriptomics Data
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac061
PMID:36284674
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为STtools的软件管道,用于处理超高清分辨率的空间转录组数据 | STtools能够处理由新兴技术生成的亚微米分辨率空间转录组数据,具有计算可扩展性且不降低分辨率 | NA | 开发一种能够处理不同分辨率空间转录组数据的软件工具 | 空间转录组数据,包括Seq-Scope、Slide-seq和VISIUM产生的数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing and establishment of an 8-gene prognostic model for pancreatic cancer patients
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1000447
PMID:36237305
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析胰腺癌中的基因结构和表达数据,并建立了一个包含8个基因的胰腺癌预后模型 | 首次在胰腺癌中应用单细胞测序技术进行深入分析,并成功建立了一个新的胰腺癌预后模型 | 需要进一步的临床验证来确认该模型的准确性和广泛适用性 | 通过单细胞测序技术分析胰腺癌的基因表达,并建立预后模型以预测患者的预后和治疗反应 | 胰腺癌患者的单细胞测序数据和基因表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序(SCS) | LASSO回归 | 基因表达数据 | 涉及多个数据库的胰腺癌单细胞测序数据,包括15个细胞亚群和10种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 454 | 2024-08-08 |
CEP192 is a novel prognostic marker and correlates with the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.950884
PMID:36238304
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验方法评估CEP192蛋白在肝细胞癌中的预后和治疗潜力 | 发现CEP192与免疫微环境密切相关,可能作为免疫检查点抑制剂反应的预测因子 | NA | 探索CEP192作为肝细胞癌的新治疗靶点和预后标志物 | CEP192蛋白在肝细胞癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-08-08 |
The impact of single-cell genomics on the field of mycobacterial infection
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.989464
PMID:36246265
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学在分枝杆菌感染研究领域的应用及其最新进展 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)及其变体提供了大量个体细胞的无偏转录组测序,超越了传统的“批量”方法,深化了对细胞异质性和动态转录状态的理解 | 尽管单细胞基因组学在生命科学和生物医学研究中应用广泛,但在分枝杆菌感染领域的进展相对有限 | 旨在总结单细胞基因组学在分枝杆菌感染研究中的重要发现,强调不同和最新的单细胞方法,并探讨当前的研究空白和未来的发展潜力 | 研究对象为感染分枝杆菌的宿主细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 大量个体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 456 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Active Involvement of Macrophage Polarizations in Pulmonary Hypertension
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/5398157
PMID:36246557
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了肺动脉高压中巨噬细胞极化的状态及其在疾病发展中的作用 | 首次揭示了在肺动脉高压早期阶段,巨噬细胞向M2型极化的现象,并验证了其在患者中的存在 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本,需要更多临床数据支持 | 探究肺动脉高压中巨噬细胞极化的状态及其在疾病发展中的作用 | 肺动脉高压中的巨噬细胞极化 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型及肺动脉高压患者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-08-08 |
A novel risk score model based on fourteen chromatin regulators-based genes for predicting overall survival of patients with lower-grade gliomas
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.957059
PMID:36246611
|
研究论文 | 本文构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型,用于预测低级别胶质瘤患者的总体生存率 | 首次构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型,用于预测低级别胶质瘤患者的预后 | NA | 揭示染色质调控因子在低级别胶质瘤患者中的功能和价值 | 低级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | LASSO算法 | 基因表达数据 | 870个染色质调控因子 | NA | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-08-08 |
Critical role of guanylate binding protein 5 in tumor immune microenvironment and predictive value of immunotherapy response
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.984615
PMID:36246628
|
研究论文 | 本研究探讨了鸟苷酸结合蛋白5(GBP5)在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | 首次详细分析了GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境(TME)的关系,并构建了基于GBP5表达的预后模型 | 研究主要基于公开的基因表达数据,可能存在样本选择偏倚;预后模型的外部验证有限 | 探索GBP5在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 基于The Cancer Genome Atlas的33种癌症的RNA测序数据,以及来自Gene Expression Omnibus数据库的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 459 | 2024-08-08 |
The soldiers needed to be awakened: Tumor-infiltrating immune cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.988703
PMID:36246629
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研究论文 | 本文综述了肿瘤浸润性免疫细胞(TIICs)在肿瘤微环境中的作用及其在不同肿瘤中的免疫治疗策略 | 介绍了基于TIICs功能开发的各种抗肿瘤策略,如免疫检查点阻断(ICB)、过继细胞疗法(ACT)等,并探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在研究肿瘤特异性免疫细胞特征中的应用 | NA | 探讨肿瘤浸润性免疫细胞的功能、预后价值及针对不同肿瘤的免疫治疗策略 | 肿瘤浸润性免疫细胞(TIICs)及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of immune ferroptosis gene in renal clear cell carcinoma: prognosis and influence of tumor microenvironment
2022, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:36247256
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研究论文 | 本研究深入探讨了免疫系统与铁死亡在肾透明细胞癌中的作用,识别了预测性生物标志物和治疗靶点。 | 构建了一个新的与免疫铁死亡相关基因的预测模型,该模型在免疫浸润、微环境和免疫逃逸中起重要作用。 | NA | 识别肾透明细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点。 | 肾透明细胞癌患者的预后和肿瘤微环境影响。 | 数字病理学 | 肾癌 | lasso-Cox风险评分模型 | lasso-Cox | 基因表达数据 | 103个免疫铁死亡相关差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |