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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-08 |
Integrating bulk and single-cell sequencing reveals the phenotype-associated cell subpopulations in sepsis-induced acute lung injury
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.981784
PMID:36405762
|
研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞测序数据,揭示了败血症诱导的急性肺损伤中与表型相关的细胞亚群 | 首次提供了败血症肺损伤中单细胞水平的细胞变化视图,并通过Scissors方法整合批量和单细胞数据,识别了与败血症肺损伤表型最相关的细胞亚群 | NA | 系统阐明败血症损伤肺组织中主要构成细胞的转录组变化 | 败血症和对照小鼠的肺组织样本 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 25044个细胞,包括11317个免疫细胞和13727个非免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-08 |
Identification of Glucose Metabolism-Related Genes in the Progression from Nonalcoholic Fatty Liver Disease to Hepatocellular Carcinoma
2022, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2022/8566342
PMID:36407083
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析,基于多组学数据识别出两个共表达模块,用于区分非酒精性脂肪肝病亚型,并构建了肝细胞癌患者的预后模型 | 首次发现葡萄糖代谢途径在非酒精性脂肪肝病向肝细胞癌进展中的重要作用,并识别出三个可能的免疫治疗靶点 | NA | 探索非酒精性脂肪肝病与肝细胞癌之间的分子联系,并识别潜在的治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病患者的肝组织及肝细胞癌细胞 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 19例非酒精性脂肪肝病患者肝组织 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-08-08 |
Intercellular communication analysis of the human retinal pigment epithelial and choroidal cells predicts pathways associated with aging, cellular senescence and age-related macular degeneration
2022, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2022.1016293
PMID:36408112
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研究论文 | 研究分析了人视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞间的细胞间通讯,预测了与衰老、细胞衰老及年龄相关性黄斑变性相关的通路 | 通过应用CellChat和scDiffCom分析公开的scRNA-seq数据集,识别了与衰老和细胞衰老相关的细胞间通讯通路,并发现这些通路的信号强度在具有高衰老评分的细胞亚群中增强 | 研究依赖于公开的scRNA-seq和微阵列数据集,可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探讨视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞间的细胞间通讯在衰老、细胞衰老及年龄相关性黄斑变性中的作用 | 人视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | scRNA-seq, 微阵列 | CellChat, scDiffCom | scRNA-seq数据, 微阵列数据 | 三个健康人和三个AMD患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-08-08 |
Novel IKZF3 transcriptomic signature correlates with positive outcomes of skin cutaneous melanoma: A pan-cancer analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1036402
PMID:36353107
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研究论文 | 本研究通过多数据库分析,探讨了Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤(SKCM)之间的潜在关系,并评估了其在不同癌症类型中的转录特征和临床预后。 | 首次识别出Ikaros基因家族在不同癌症中的泛癌基因组特征,并发现其高表达与SKCM的良好免疫状态和有益临床结果相关。 | NA | 研究Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤的关系及其在不同癌症类型中的表达特征和临床预后。 | Ikaros家族基因在皮肤皮肤黑色素瘤及其他癌症中的表达及其与临床预后的关系。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 10,327个转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-08-08 |
Identification of biomarkers for hepatocellular carcinoma based on single cell sequencing and machine learning algorithms
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.873218
PMID:36353113
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和机器学习算法,从八名肝细胞癌患者的肿瘤细胞和配对正常肝细胞中筛选出区分肝细胞癌和正常肝组织的核心生物标志物 | 采用单细胞RNA测序技术揭示肿瘤异质性,并结合机器学习算法筛选生物标志物 | 研究样本量较小,仅涉及八名患者 | 提高肝细胞癌患者的预后 | 肝细胞癌的生物标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 八名肝细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of human gut T cells identifies cytotoxic CD4+CD8A+ T cells related to mouse CD4 cytotoxic T cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.977117
PMID:36353619
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,在人类肠道T细胞中鉴定出与小鼠CD4细胞毒性T细胞相关的细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞 | 首次在人类肠道中发现细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞,并与小鼠CD4细胞毒性T细胞进行比较分析 | 研究主要集中在肠道炎症疾病患者,未涉及其他疾病状态 | 鉴定人类肠道中的细胞毒性CD4 T细胞,并分析其在炎症性肠病(IBD)患者中的特征 | 人类肠道T细胞及炎症性肠病患者的细胞毒性CD4 T细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-08-08 |
Exploration the global single-cell ecological landscape of adenomyosis-related cell clusters by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1020757
PMID:36324511
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了子宫内膜异位症(AM)的全球单细胞图谱,并探索了相关细胞簇的生物学功能及其在AM中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了AM相关细胞簇的免疫生态特征,并分析了细胞簇中的染色体拷贝数变异(CNV) | NA | 探索子宫内膜异位症(AM)相关细胞簇的单细胞生态景观 | 子宫内膜异位症(AM)患者的细胞簇及其免疫生态特征 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 42260个细胞,10个细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immune Cell Profiling in IMQ Induced Psoriasis-Like Model
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S379349
PMID:36330167
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了咪喹莫特诱导的银屑病样模型中的免疫细胞特征 | 首次系统地研究了咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型中皮肤免疫细胞的异质性,并识别了10个主要细胞群及其标记基因 | NA | 揭示银屑病小鼠模型中的免疫环境特征,并提供对银屑病小鼠免疫反应的系统性见解 | 咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 14,439个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-08-08 |
EPSTI1 as an immune biomarker predicts the prognosis of patients with stage III colon cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.987394
PMID:36330510
|
研究论文 | 本文探讨了肿瘤微环境中的免疫分子EPSTI1作为III期结肠癌的预后标志物的潜力 | 首次揭示了EPSTI1与III期结肠癌复发自由生存期的显著相关性,并验证了其作为保护因子的作用 | 研究样本量相对较小,需要更大规模的研究来验证结果 | 探索与III期结肠癌预后相关的新的免疫浸润相关分子 | III期结肠癌患者及其肿瘤微环境中的免疫分子 | 数字病理学 | 结肠癌 | TMEscore算法, 分子复合物检测算法, 免疫组化, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 547名III期结肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-08-08 |
Toward a granular molecular-anatomic map of the blood vasculature - single-cell RNA sequencing makes the leap
2022, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v127.9051
PMID:36337278
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNAseq)在生理学和医学领域的新时代中的应用,特别是在血管生物学研究中的潜在影响 | scRNAseq技术使得我们能够精确了解体内不同细胞类型和亚型的基因表达水平及其在发育、组织修复或疾病中的特定细胞状态 | NA | 探讨scRNAseq技术在血管生物学研究中的应用及其对生命科学各领域的影响 | 血管细胞的基因表达差异及其在器官特异性功能中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-08-08 |
Fatty acid metabolism predicts prognosis and NK cell immunosurveillance of acute myeloid leukemia patients
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1018154
PMID:36338749
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪酸代谢(FAM)与急性髓系白血病(AML)患者预后及自然杀伤细胞免疫监视之间的关系 | 首次揭示了FAM在AML患者中的预后价值及其对TME免疫监视的影响,并开发了一种基于FAM相关基因的预后模型 | NA | 研究FAM与AML患者预后及免疫监视之间的关系 | 急性髓系白血病患者及其脂肪酸代谢 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的AML患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-08-08 |
Combining bulk RNA-sequencing and single-cell RNA-sequencing data to reveal the immune microenvironment and metabolic pattern of osteosarcoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.976990
PMID:36338972
|
研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示了骨肉瘤的免疫微环境和代谢模式 | 首次通过批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,结合四种代谢模型,分析了骨肉瘤的肿瘤间异质性和肿瘤内异质性 | NA | 探索骨肉瘤的肿瘤微环境异质性和代谢调控模式 | 骨肉瘤的肿瘤微环境和代谢模式 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 28608个免疫细胞样本,其中7617个为恶性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing technologies in bladder cancer research: Applications and challenges
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1027909
PMID:36338973
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用及其面临的挑战 | 单细胞测序技术提供了高吞吐量的测序工具,揭示了膀胱肿瘤的发生、进展和侵袭机制,并有助于发现新的治疗靶点和预后模型 | 缺乏针对膀胱癌的有效靶向治疗或免疫治疗的特定生物标志物 | 探讨单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用,以增进对膀胱肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境复杂生态系统的理解 | 膀胱癌及其治疗抵抗机制和尿液脱落肿瘤细胞的检测 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-08-08 |
Characterization of the SARS-CoV-2 co-receptor NRP1 expression profiles in healthy people and cancer patients: Implication for susceptibility to COVID-19 disease and potential therapeutic strategy
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.995736
PMID:36338984
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研究论文 | 研究分析了NRP1在健康人群、COVID-19患者和癌症患者中的表达情况,并探讨了其作为SARS-CoV-2感染易感性和治疗策略的潜在生物标志物的作用 | 首次全面分析NRP1在不同人群中的表达情况及其与SARS-CoV-2感染和肿瘤发生的关系 | NA | 预测健康人群和癌症患者对SARS-CoV-2的易感性和感染后的预后 | NRP1在健康人群、COVID-19患者和癌症患者中的表达情况 | 数字病理学 | COVID-19疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及健康人群、COVID-19患者和癌症患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-08-08 |
Pathological implications of metabolic reprogramming and its therapeutic potential in medulloblastoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1007641
PMID:36340043
|
综述 | 本文综述了髓母细胞瘤(MB)中代谢重编程的机制及其在治疗中的潜在应用 | 强调了MB细胞如何通过重编程代谢和能量生产网络来支持快速生长、生存、侵袭、转移和治疗抵抗 | NA | 探讨靶向能量代谢的现有药物在抑制MB进展和提高当前MB治疗效果方面的潜在临床益处 | 髓母细胞瘤及其代谢重编程机制 | NA | 儿童脑肿瘤 | 基因组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome of Nepeta tenuifolia leaves reveal differentiation trajectories in glandular trichomes
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.988594
PMID:36340347
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了Nepeta tenuifolia叶片的腺毛细胞,揭示了其分化轨迹 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细描绘了Nepeta tenuifolia叶片腺毛细胞的分化和发展轨迹 | NA | 探索植物细胞发育和分化,特别是腺毛的启动和发展 | Nepeta tenuifolia叶片的腺毛细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 33,254个原生质体 | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics of the lacrimal gland features macrophage activity and epithelium metabolism as key alterations during chronic inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011125
PMID:36341342
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研究论文 | 本研究分析了NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中泪腺的慢性炎症,利用bulk RNAseq和Visium空间基因表达技术,通过Seurat进行无监督聚类,分析了泪腺切片中细胞的空间分布和基因表达变化。 | 首次使用Visium技术验证了bulk RNAseq定义的特定通路在泪腺切片中的激活情况,并发现了一个在Sjögren's综合征中未曾描述过的“TYROBP因果网络”。 | NA | 探讨泪腺慢性炎症过程中的关键改变及其对干眼症的治疗潜力。 | 泪腺的慢性炎症及其在Sjögren's综合征中的表现。 | 数字病理学 | 干眼症 | bulk RNAseq, Visium空间基因表达 | NA | 基因表达数据 | NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中的泪腺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-08-08 |
Molecular profiling of core immune-escape genes highlights LCK as an immune-related prognostic biomarker in melanoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1024931
PMID:36341345
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研究论文 | 本研究通过整合多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集,识别与黑色素瘤免疫治疗相关的潜在预后生物标志物,特别是LCK基因。 | 首次揭示LCK作为免疫相关预后生物标志物在黑色素瘤中的作用,并通过多种分析方法验证其表达与免疫细胞浸润水平及临床预后的关联。 | 研究主要基于现有数据库和测序数据,未涉及大规模临床试验验证。 | 识别与黑色素瘤免疫治疗相关的预后生物标志物。 | 黑色素瘤及其肿瘤微环境中的免疫逃逸相关基因。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | 回归分析 | 转录组数据 | 涉及多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-08-08 |
The shared biomarkers and pathways of systemic lupus erythematosus and metabolic syndrome analyzed by bioinformatics combining machine learning algorithm and single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1015882
PMID:36341378
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法结合机器学习算法和单细胞测序分析,探讨了系统性红斑狼疮(SLE)和代谢综合征(MetS)之间的共享生物标志物和通路 | 本研究首次通过机器学习技术和单细胞RNA测序验证了SLE和MetS之间的共享关键基因,并构建了有效的诊断模型 | NA | 探讨系统性红斑狼疮和代谢综合征之间的潜在关联及其发病机制 | 系统性红斑狼疮和代谢综合征的共享基因及其在免疫和代谢过程中的作用 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | XG-Boost | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq reveals the role of MYC signaling in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1021978
PMID:36299592
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研究论文 | 本文通过综合分析大量和单细胞RNA测序数据,揭示了MYC信号在肺腺癌中的作用 | 首次将大量和单细胞RNA测序数据结合,通过GSVA评分和Spearman相关性分析,将基因分为与MYC信号高度相关的两个基因集,并验证了MYC信号与细胞分化的关联 | NA | 揭示MYC信号在肺腺癌中的作用及其对疾病进展的影响 | 肺腺癌的多组学数据,包括基因组、转录组和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 多个队列的肺腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |