单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-08 |
Pathological implications of metabolic reprogramming and its therapeutic potential in medulloblastoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1007641
PMID:36340043
|
综述 | 本文综述了髓母细胞瘤（MB）中代谢重编程的机制及其在治疗中的潜在应用 | 强调了MB细胞如何通过重编程代谢和能量生产网络来支持快速生长、生存、侵袭、转移和治疗抵抗 | NA | 探讨靶向能量代谢的现有药物在抑制MB进展和提高当前MB治疗效果方面的潜在临床益处 | 髓母细胞瘤及其代谢重编程机制 | NA | 儿童脑肿瘤 | 基因组学、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome of Nepeta tenuifolia leaves reveal differentiation trajectories in glandular trichomes
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.988594
PMID:36340347
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了Nepeta tenuifolia叶片的腺毛细胞，揭示了其分化轨迹 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细描绘了Nepeta tenuifolia叶片腺毛细胞的分化和发展轨迹 | NA | 探索植物细胞发育和分化，特别是腺毛的启动和发展 | Nepeta tenuifolia叶片的腺毛细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 33,254个原生质体 |
| 403 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics of the lacrimal gland features macrophage activity and epithelium metabolism as key alterations during chronic inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011125
PMID:36341342
|
研究论文 | 本研究分析了NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中泪腺的慢性炎症，利用bulk RNAseq和Visium空间基因表达技术，通过Seurat进行无监督聚类，分析了泪腺切片中细胞的空间分布和基因表达变化。 | 首次使用Visium技术验证了bulk RNAseq定义的特定通路在泪腺切片中的激活情况，并发现了一个在Sjögren's综合征中未曾描述过的“TYROBP因果网络”。 | NA | 探讨泪腺慢性炎症过程中的关键改变及其对干眼症的治疗潜力。 | 泪腺的慢性炎症及其在Sjögren's综合征中的表现。 | 数字病理学 | 干眼症 | bulk RNAseq, Visium空间基因表达 | NA | 基因表达数据 | NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中的泪腺组织 |
| 404 | 2024-08-08 |
Molecular profiling of core immune-escape genes highlights LCK as an immune-related prognostic biomarker in melanoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1024931
PMID:36341345
|
研究论文 | 本研究通过整合多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集，识别与黑色素瘤免疫治疗相关的潜在预后生物标志物，特别是LCK基因。 | 首次揭示LCK作为免疫相关预后生物标志物在黑色素瘤中的作用，并通过多种分析方法验证其表达与免疫细胞浸润水平及临床预后的关联。 | 研究主要基于现有数据库和测序数据，未涉及大规模临床试验验证。 | 识别与黑色素瘤免疫治疗相关的预后生物标志物。 | 黑色素瘤及其肿瘤微环境中的免疫逃逸相关基因。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | 回归分析 | 转录组数据 | 涉及多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集 |
| 405 | 2024-08-08 |
The shared biomarkers and pathways of systemic lupus erythematosus and metabolic syndrome analyzed by bioinformatics combining machine learning algorithm and single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1015882
PMID:36341378
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法结合机器学习算法和单细胞测序分析，探讨了系统性红斑狼疮（SLE）和代谢综合征（MetS）之间的共享生物标志物和通路 | 本研究首次通过机器学习技术和单细胞RNA测序验证了SLE和MetS之间的共享关键基因，并构建了有效的诊断模型 | NA | 探讨系统性红斑狼疮和代谢综合征之间的潜在关联及其发病机制 | 系统性红斑狼疮和代谢综合征的共享基因及其在免疫和代谢过程中的作用 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | XG-Boost | 基因表达数据 | NA |
| 406 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq reveals the role of MYC signaling in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1021978
PMID:36299592
|
研究论文 | 本文通过综合分析大量和单细胞RNA测序数据，揭示了MYC信号在肺腺癌中的作用 | 首次将大量和单细胞RNA测序数据结合，通过GSVA评分和Spearman相关性分析，将基因分为与MYC信号高度相关的两个基因集，并验证了MYC信号与细胞分化的关联 | NA | 揭示MYC信号在肺腺癌中的作用及其对疾病进展的影响 | 肺腺癌的多组学数据，包括基因组、转录组和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 多个队列的肺腺癌样本 |
| 407 | 2024-08-08 |
Combining single-cell sequencing data to construct a prognostic signature to predict survival, immune microenvironment, and immunotherapy response in gastric cancer patients
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1018413
PMID:36300104
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据构建了一个预测胃癌患者生存、免疫微环境和免疫治疗反应的预后标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个免疫相关的遗传标志物，用于分类胃癌病例并预测患者的预后、免疫状态和治疗反应 | NA | 开发一个免疫相关的遗传标志物，用于分类胃癌病例并预测患者的预后、免疫状态和治疗反应 | 胃癌患者的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 多个胃癌患者的样本 |
| 408 | 2024-08-08 |
Advances in single-cell sequencing technology in the field of hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.996890
PMID:36303541
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肝细胞癌研究中的应用及其基本流程和发展 | 单细胞测序技术能够以单细胞分辨率解析人类肿瘤，精细描绘不同细胞类型，揭示肿瘤细胞的异质性 | NA | 探讨单细胞测序技术在肝细胞癌研究中的应用，以改善其临床诊断、治疗和预后判断 | 肝细胞癌的肿瘤细胞异质性、肿瘤免疫微环境及肿瘤细胞的克隆进化 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组或代谢组数据 | NA |
| 409 | 2024-08-08 |
TransCluster: A Cell-Type Identification Method for single-cell RNA-Seq data using deep learning based on transformer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1038919
PMID:36303549
|
研究论文 | 本文提出了一种名为TransCluster的混合网络结构，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别，该方法结合线性判别分析和改进的Transformer模型，提高了细胞类型识别的准确性和鲁棒性 | TransCluster是首个使用Transformer模型进行单细胞RNA测序数据细胞类型注释的方法，显著提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 开发一种新的细胞类型识别方法，以提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 转录组数据 | 多个不同人体组织的数据集 |
| 410 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of potential cellular communication networks in advanced osteosarcoma using single-cell RNA sequencing data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1013737
PMID:36303551
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据对高级骨肉瘤中的潜在细胞通信网络进行了综合分析 | 揭示了11种细胞类型和17种潜在的细胞通信网络，为骨肉瘤的分子机制提供了新的见解 | NA | 深入理解肿瘤微环境，以开发有效的骨肉瘤治疗方法 | 骨肉瘤中的细胞类型和细胞通信网络 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个骨肉瘤组织，包含25个细胞集群 |
| 411 | 2024-08-08 |
SingleCAnalyzer: Interactive Analysis of Single Cell RNA-Seq Data on the Cloud
2022, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2022.793309
PMID:36304292
|
研究论文 | 本文介绍了SingleCAnalyzer，一个云平台，用于通过易于使用的自探索网页界面进行单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据的完整分析 | 开发了SingleCAnalyzer平台，提供了一个完整的scRNA-Seq分析流程，并通过交互式图形界面增强了探索和分析功能 | 需要生物信息学专业知识以正确应用这些计算方法，否则难以获得可靠和可重复的结果 | 开发一个用户友好的云平台，用于单细胞RNA测序数据的交互式分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 文本 | NA |
| 412 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the cell map and transcriptional network of sporadic vestibular schwannoma
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.984529
PMID:36304995
|
研究论文 | 本研究基于来自散发性前庭神经鞘瘤患者的三个肿瘤样本，通过单细胞转录组测序获得32,011个细胞，质量控制和双细胞去除后得到22,309个高质量细胞。随后，通过聚类分析得到18个细胞簇，并将其注释为六种类型的细胞。基于这六种细胞簇进行了深入分析，包括描述每个细胞亚型的功能特征、细胞发育和分化途径、细胞间相互作用以及簇内的转录调控网络。 | 首次详细描述了散发性前庭神经鞘瘤肿瘤组织中各种类型细胞的单细胞图谱，揭示了不同细胞类型的功能状态和发展轨迹，并探索了Schwann细胞在周围神经系统中的功能状态，这在以往研究中未被报道。 | NA | 描述散发性前庭神经鞘瘤的单细胞图谱，揭示不同细胞类型的功能状态和发展轨迹。 | 散发性前庭神经鞘瘤患者的肿瘤样本中的细胞。 | 数字病理学 | 神经鞘瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 3个肿瘤样本，32,011个细胞，质量控制后22,309个高质量细胞 |
| 413 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct transcriptional features of the purinergic signaling in mouse trigeminal ganglion
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1038539
PMID:36311028
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠三叉神经节中嘌呤能信号传导的转录特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了三叉神经节中不同细胞类型的嘌呤能信号相关基因的表达模式 | NA | 深入理解嘌呤能信号在三叉神经节中的细胞特异性作用 | 小鼠三叉神经节中的细胞类型及其嘌呤能信号相关基因的转录特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 22,969个细胞 |
| 414 | 2024-08-08 |
Dysregulation of B7 family and its association with tumor microenvironment in uveal melanoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1026076
PMID:36311731
|
研究论文 | 本文研究了B7家族在葡萄膜黑色素瘤中的失调及其与肿瘤微环境的关系 | 首次揭示了B7家族在葡萄膜黑色素瘤中的失调及其对肿瘤微环境的影响，并发现了CABP4和RORB作为潜在的治疗靶点 | NA | 探讨B7家族在葡萄膜黑色素瘤中的失调及其与肿瘤微环境的关系 | 葡萄膜黑色素瘤中的B7家族及其与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库，具体样本数量未明确提及 |
| 415 | 2024-08-08 |
Immune-infiltrating signature-based classification reveals CD103+CD39+ T cells associate with colorectal cancer prognosis and response to immunotherapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011590
PMID:36311750
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研究论文 | 本文开发了一种基于免疫相关特征的评分系统，用于结直肠癌患者的预后预测和免疫治疗效果评估 | 构建了基于54个无复发生存期相关免疫特征的免疫相关特征评分（IRScore），并发现CD103+CD39+ T细胞在CRC患者中的富集与良好的预后和免疫检查点阻断治疗反应相关 | NA | 构建一个基于详细免疫特征的评分系统，以对结直肠癌患者进行分层 | 结直肠癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | CRC患者的CD45+细胞 |
| 416 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on T-cell marker genes to predict prognosis and therapeutic response in lung squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.992990
PMID:36311764
|
研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出基于T细胞标记基因的签名，用于预测肺鳞状细胞癌的预后和治疗反应 | 首次在肺鳞状细胞癌中利用T细胞标记基因构建预后签名，并验证其在不同队列中的有效性 | NA | 探索肺鳞状细胞癌中T细胞标记基因的预后价值和治疗反应 | 肺鳞状细胞癌患者的预后和治疗反应 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 训练队列、测试队列和GEO队列中的多个样本 |
| 417 | 2024-08-08 |
Significance of macrophage infiltration in the prognosis of lung adenocarcinoma patients evaluated by scRNA and bulkRNA analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1028440
PMID:36311801
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA分析技术，探讨巨噬细胞浸润对肺腺癌患者预后的影响 | 本研究首次通过单细胞测序技术识别肺腺癌组织中巨噬细胞亚型的标记基因，并构建了基于这些基因的风险评分模型 | NA | 探讨巨噬细胞浸润对肺腺癌患者预后的影响 | 肺腺癌患者的巨噬细胞浸润及其对预后的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, WGCNA (加权基因共表达网络分析) | 风险评分模型 | RNA | 多个数据队列（TCGA-LUAD, GSE11969, GSE31210, GSE50081, GSE72094, GSE8894, GSE19188, GSE26939, GSE42127）和临床样本 |
| 418 | 2024-08-08 |
Insights into the roles and driving forces of CCT3 in human tumors
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1005855
PMID:36313331
|
研究论文 | 本研究从泛癌角度探讨CCT3的特征及其在肿瘤中的驱动作用 | 首次构建了lncRNA/circRNA-miRNA-CCT3调控网络，并预测了CCT3的敏感药物 | NA | 探索CCT3在多种肿瘤中的作用及其驱动因素 | CCT3在肿瘤中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 多种肿瘤类型 | 生物信息学分析，单细胞测序 | NA | mRNA，蛋白质，单细胞测序数据 | 多种肿瘤类型的样本 |
| 419 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing reveals the difference in human normal and degenerative nucleus pulposus tissue profiles and cellular interactions
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1051707
PMID:36313561
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-08-08 |
Single-nuclei analysis reveals depot-specific transcriptional heterogeneity and depot-specific cell types in adipose tissue of dairy cows
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1025240
PMID:36313560
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序分析，揭示了奶牛内脏和皮下脂肪组织中细胞类型的差异性和特定亚型 | 首次在奶牛脂肪组织中展示了细胞类型和库特异性异质性，为针对脂肪组织的策略开发提供了新见解 | NA | 阐明奶牛内脏和皮下脂肪组织在单核水平上的细胞多样性差异 | 奶牛的内脏和皮下脂肪组织 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从三头奶牛收集的匹配的皮下和内脏脂肪组织样本 |