单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
381	2024-08-08	Construction of a B cell-related gene pairs signature for predicting prognosis and immunotherapeutic response in non-small cell lung cancer 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.989968 PMID:36389757	研究论文	本研究旨在探索B细胞标记基因的表达谱，并构建与非小细胞肺癌（NSCLC）患者预后和免疫治疗效率相关的B细胞相关基因对（BRGPs）签名	首次构建了B细胞相关基因对签名，用于预测非小细胞肺癌患者的预后和免疫治疗反应	NA	探索B细胞在抗肿瘤免疫和肿瘤发展中的作用，并构建相关的基因对签名	非小细胞肺癌患者	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	Lasso-Cox回归模型	基因表达数据	使用了TCGA和GEO数据库的数据
382	2024-08-08	Identify the immune characteristics and immunotherapy value of CD93 in the pan-cancer based on the public data sets 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.907182 PMID:36389798	研究论文	本研究系统分析了CD93在33种癌症中的肿瘤免疫治疗特性，利用公共数据库和多种免疫荧光染色技术检测CD93水平及其在癌细胞和基质细胞中的共表达情况	首次全面探讨了CD93在多种癌症中的免疫特性及其在肿瘤免疫治疗中的潜在价值	研究主要依赖公共数据库和现有数据，未涉及体内实验验证	探讨CD93在泛癌中的免疫特性及其在免疫治疗中的应用价值	CD93在33种癌症中的表达及其与免疫治疗的关系	数字病理学	泛癌	免疫荧光染色、单细胞测序	NA	mRNA、蛋白质	涉及33种癌症的样本
383	2024-08-08	Single-cell RNA-sequencing uncovers compound kushen injection synergistically improves the efficacy of chemotherapy by modulating the tumor environment of breast cancer 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.965342 PMID:36389835	研究论文	本研究探讨了复方苦参注射液（CKI）联合化疗对三阴性乳腺癌（TNBC）肿瘤微环境（TME）的调控作用	CKI联合化疗能显著增强化疗的抗癌活性，并通过激活抗肿瘤免疫反应提高治疗效果	NA	探索CKI联合化疗对TNBC肿瘤微环境的调控作用	三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	使用BALB/c小鼠建立的TNBC模型
384	2024-08-08	Identification of diagnostic genes for both Alzheimer's disease and Metabolic syndrome by the machine learning algorithm 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1037318 PMID:36405716	研究论文	本研究通过机器学习算法识别阿尔茨海默病和代谢综合征的共同诊断基因	首次使用机器学习方法识别在阿尔茨海默病和代谢综合征中具有共同诊断作用的基因，并探讨了这些基因与免疫细胞浸润的关系	NA	旨在识别对阿尔茨海默病和代谢综合征具有共同诊断作用的基因	阿尔茨海默病和代谢综合征的共同诊断基因	机器学习	阿尔茨海默病, 代谢综合征	WGCNA, RF, LASSO, XGBoost, CIBERSORT, scRNA-seq, ssGSEA	机器学习模型	微阵列数据, 单细胞RNA测序数据	阿尔茨海默病数据集（GSE63060和GSE63061合并），代谢综合征数据集（GSE98895），以及阿尔茨海默病患者和正常个体的外周血单个核细胞单细胞RNA测序数据
385	2024-08-08	Pan-cancer analysis identifies migrasome-related genes as a potential immunotherapeutic target: A bulk omics research and single cell sequencing validation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.994828 PMID:36405728	研究论文	本研究通过泛癌分析和单细胞测序验证，探讨了migrasome相关基因作为潜在免疫治疗靶点的可能性	首次进行了migrasome的泛癌分析，并发现其在肿瘤发展和免疫逃逸中的重要作用	NA	探究migrasome在肿瘤免疫和肿瘤微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力	migrasome相关基因在33种癌症类型中的表达、预后、遗传变异和药物敏感性	数字病理学	NA	免疫组织化学(IHC), 单细胞转录组测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据, 拷贝数变异原始数据, 甲基化数据	33种癌症类型的基因数据, 114例结直肠癌的免疫组织化学验证
386	2024-08-08	Identifying hub genes of calcific aortic valve disease and revealing the immune infiltration landscape based on multiple WGCNA and single-cell sequence analysis 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1035285 PMID:36405745	研究论文	本研究通过生物信息学分析，结合加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞测序技术，鉴定了钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键基因，并揭示了免疫细胞浸润的特征	本研究首次结合WGCNA和单细胞测序技术，鉴定了CAVD中的关键基因S100A8和S100A9，并分析了这些基因在不同表达水平下的免疫细胞浸润差异	NA	旨在确定关键基因和免疫细胞浸润在CAVD进展中的作用	钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键基因和免疫细胞浸润	数字病理学	心血管疾病	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	从GEO数据库获取454个差异表达基因，基于六种不同的人类主动脉瓣叶进行单细胞RNA测序
387	2024-08-08	Integrating bulk and single-cell sequencing reveals the phenotype-associated cell subpopulations in sepsis-induced acute lung injury 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.981784 PMID:36405762	研究论文	本研究通过整合批量和单细胞测序数据，揭示了败血症诱导的急性肺损伤中与表型相关的细胞亚群	首次提供了败血症肺损伤中单细胞水平的细胞变化视图，并通过Scissors方法整合批量和单细胞数据，识别了与败血症肺损伤表型最相关的细胞亚群	NA	系统阐明败血症损伤肺组织中主要构成细胞的转录组变化	败血症和对照小鼠的肺组织样本	数字病理学	急性肺损伤	单细胞RNA测序	NA	细胞数据	25044个细胞，包括11317个免疫细胞和13727个非免疫细胞
388	2024-08-08	Identification of Glucose Metabolism-Related Genes in the Progression from Nonalcoholic Fatty Liver Disease to Hepatocellular Carcinoma 2022, Genetics research IF:1.4Q4 DOI:10.1155/2022/8566342 PMID:36407083	研究论文	本研究通过加权基因共表达网络分析，基于多组学数据识别出两个共表达模块，用于区分非酒精性脂肪肝病亚型，并构建了肝细胞癌患者的预后模型	首次发现葡萄糖代谢途径在非酒精性脂肪肝病向肝细胞癌进展中的重要作用，并识别出三个可能的免疫治疗靶点	NA	探索非酒精性脂肪肝病与肝细胞癌之间的分子联系，并识别潜在的治疗靶点	非酒精性脂肪肝病患者的肝组织及肝细胞癌细胞	NA	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	19例非酒精性脂肪肝病患者肝组织
389	2024-08-08	Intercellular communication analysis of the human retinal pigment epithelial and choroidal cells predicts pathways associated with aging, cellular senescence and age-related macular degeneration 2022, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2 DOI:10.3389/fnagi.2022.1016293 PMID:36408112	研究论文	研究分析了人视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞间的细胞间通讯，预测了与衰老、细胞衰老及年龄相关性黄斑变性相关的通路	通过应用CellChat和scDiffCom分析公开的scRNA-seq数据集，识别了与衰老和细胞衰老相关的细胞间通讯通路，并发现这些通路的信号强度在具有高衰老评分的细胞亚群中增强	研究依赖于公开的scRNA-seq和微阵列数据集，可能存在数据质量和样本代表性的限制	探讨视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞间的细胞间通讯在衰老、细胞衰老及年龄相关性黄斑变性中的作用	人视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	scRNA-seq, 微阵列	CellChat, scDiffCom	scRNA-seq数据, 微阵列数据	三个健康人和三个AMD患者的样本
390	2024-08-08	Novel IKZF3 transcriptomic signature correlates with positive outcomes of skin cutaneous melanoma: A pan-cancer analysis 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1036402 PMID:36353107	研究论文	本研究通过多数据库分析，探讨了Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）之间的潜在关系，并评估了其在不同癌症类型中的转录特征和临床预后。	首次识别出Ikaros基因家族在不同癌症中的泛癌基因组特征，并发现其高表达与SKCM的良好免疫状态和有益临床结果相关。	NA	研究Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤的关系及其在不同癌症类型中的表达特征和临床预后。	Ikaros家族基因在皮肤皮肤黑色素瘤及其他癌症中的表达及其与临床预后的关系。	数字病理学	皮肤黑色素瘤	转录组分析	NA	转录组数据	10,327个转录组样本
391	2024-08-08	Identification of biomarkers for hepatocellular carcinoma based on single cell sequencing and machine learning algorithms 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.873218 PMID:36353113	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和机器学习算法，从八名肝细胞癌患者的肿瘤细胞和配对正常肝细胞中筛选出区分肝细胞癌和正常肝组织的核心生物标志物	采用单细胞RNA测序技术揭示肿瘤异质性，并结合机器学习算法筛选生物标志物	研究样本量较小，仅涉及八名患者	提高肝细胞癌患者的预后	肝细胞癌的生物标志物	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	机器学习算法	基因表达数据	八名肝细胞癌患者
392	2024-08-08	Single-cell transcriptomics of human gut T cells identifies cytotoxic CD4+CD8A+ T cells related to mouse CD4 cytotoxic T cells 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.977117 PMID:36353619	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，在人类肠道T细胞中鉴定出与小鼠CD4细胞毒性T细胞相关的细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞	首次在人类肠道中发现细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞，并与小鼠CD4细胞毒性T细胞进行比较分析	研究主要集中在肠道炎症疾病患者，未涉及其他疾病状态	鉴定人类肠道中的细胞毒性CD4 T细胞，并分析其在炎症性肠病（IBD）患者中的特征	人类肠道T细胞及炎症性肠病患者的细胞毒性CD4 T细胞	数字病理学	炎症性肠病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	具体样本数量未在摘要中提及
393	2024-08-08	Exploration the global single-cell ecological landscape of adenomyosis-related cell clusters by single-cell RNA sequencing 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1020757 PMID:36324511	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术构建了子宫内膜异位症（AM）的全球单细胞图谱，并探索了相关细胞簇的生物学功能及其在AM中的作用	首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了AM相关细胞簇的免疫生态特征，并分析了细胞簇中的染色体拷贝数变异（CNV）	NA	探索子宫内膜异位症（AM）相关细胞簇的单细胞生态景观	子宫内膜异位症（AM）患者的细胞簇及其免疫生态特征	数字病理学	妇科疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	42260个细胞，10个细胞簇
394	2024-08-08	Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immune Cell Profiling in IMQ Induced Psoriasis-Like Model 2022, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S379349 PMID:36330167	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了咪喹莫特诱导的银屑病样模型中的免疫细胞特征	首次系统地研究了咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型中皮肤免疫细胞的异质性，并识别了10个主要细胞群及其标记基因	NA	揭示银屑病小鼠模型中的免疫环境特征，并提供对银屑病小鼠免疫反应的系统性见解	咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型中的免疫细胞	数字病理学	皮肤疾病	单细胞RNA测序	NA	细胞	14,439个细胞
395	2024-08-08	EPSTI1 as an immune biomarker predicts the prognosis of patients with stage III colon cancer 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.987394 PMID:36330510	研究论文	本文探讨了肿瘤微环境中的免疫分子EPSTI1作为III期结肠癌的预后标志物的潜力	首次揭示了EPSTI1与III期结肠癌复发自由生存期的显著相关性，并验证了其作为保护因子的作用	研究样本量相对较小，需要更大规模的研究来验证结果	探索与III期结肠癌预后相关的新的免疫浸润相关分子	III期结肠癌患者及其肿瘤微环境中的免疫分子	数字病理学	结肠癌	TMEscore算法, 分子复合物检测算法, 免疫组化, 单细胞测序	NA	基因表达数据, 单细胞测序数据	547名III期结肠癌患者
396	2024-08-08	Toward a granular molecular-anatomic map of the blood vasculature - single-cell RNA sequencing makes the leap 2022, Upsala journal of medical sciences IF:1.5Q2 DOI:10.48101/ujms.v127.9051 PMID:36337278	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）在生理学和医学领域的新时代中的应用，特别是在血管生物学研究中的潜在影响	scRNAseq技术使得我们能够精确了解体内不同细胞类型和亚型的基因表达水平及其在发育、组织修复或疾病中的特定细胞状态	NA	探讨scRNAseq技术在血管生物学研究中的应用及其对生命科学各领域的影响	血管细胞的基因表达差异及其在器官特异性功能中的作用	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	基因表达数据	NA
397	2024-08-08	Fatty acid metabolism predicts prognosis and NK cell immunosurveillance of acute myeloid leukemia patients 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1018154 PMID:36338749	研究论文	本研究探讨了脂肪酸代谢（FAM）与急性髓系白血病（AML）患者预后及自然杀伤细胞免疫监视之间的关系	首次揭示了FAM在AML患者中的预后价值及其对TME免疫监视的影响，并开发了一种基于FAM相关基因的预后模型	NA	研究FAM与AML患者预后及免疫监视之间的关系	急性髓系白血病患者及其脂肪酸代谢	数字病理学	白血病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	转录组数据	来自TCGA和GEO数据库的AML患者数据
398	2024-08-08	Combining bulk RNA-sequencing and single-cell RNA-sequencing data to reveal the immune microenvironment and metabolic pattern of osteosarcoma 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.976990 PMID:36338972	研究论文	本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了骨肉瘤的免疫微环境和代谢模式	首次通过批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，结合四种代谢模型，分析了骨肉瘤的肿瘤间异质性和肿瘤内异质性	NA	探索骨肉瘤的肿瘤微环境异质性和代谢调控模式	骨肉瘤的肿瘤微环境和代谢模式	数字病理学	骨肉瘤	RNA测序	NA	RNA测序数据	28608个免疫细胞样本，其中7617个为恶性细胞
399	2024-08-08	Single-cell sequencing technologies in bladder cancer research: Applications and challenges 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1027909 PMID:36338973	综述	本文综述了单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用及其面临的挑战	单细胞测序技术提供了高吞吐量的测序工具，揭示了膀胱肿瘤的发生、进展和侵袭机制，并有助于发现新的治疗靶点和预后模型	缺乏针对膀胱癌的有效靶向治疗或免疫治疗的特定生物标志物	探讨单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用，以增进对膀胱肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境复杂生态系统的理解	膀胱癌及其治疗抵抗机制和尿液脱落肿瘤细胞的检测	数字病理学	膀胱癌	单细胞测序技术	NA	细胞	NA
400	2024-08-08	Characterization of the SARS-CoV-2 co-receptor NRP1 expression profiles in healthy people and cancer patients: Implication for susceptibility to COVID-19 disease and potential therapeutic strategy 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.995736 PMID:36338984	研究论文	研究分析了NRP1在健康人群、COVID-19患者和癌症患者中的表达情况，并探讨了其作为SARS-CoV-2感染易感性和治疗策略的潜在生物标志物的作用	首次全面分析NRP1在不同人群中的表达情况及其与SARS-CoV-2感染和肿瘤发生的关系	NA	预测健康人群和癌症患者对SARS-CoV-2的易感性和感染后的预后	NRP1在健康人群、COVID-19患者和癌症患者中的表达情况	数字病理学	COVID-19疾病	RNA测序	NA	RNA	涉及健康人群、COVID-19患者和癌症患者的样本