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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
CD161 expression and regulation defines rapidly responding effector CD4+ T cells associated with improved survival in HPV16-associated tumors
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003995
PMID:35039463
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研究论文 | 本研究探讨CD161在HPV16相关肿瘤中CD4+ T细胞上的表达调控机制及其与患者生存改善的关联 | 首次揭示CD161在肿瘤特异性CD4+ T细胞中的动态表达规律及其与TCR信号放大的功能关联,发现CD161+效应记忆T细胞与改善生存相关 | 研究主要聚焦HPV16+口咽鳞状细胞癌,结论在其他癌症类型中的普适性需进一步验证 | 阐明CD161在CD4+ T细胞中的表达调控机制及其在抗肿瘤免疫中的作用 | HPV16+口咽鳞状细胞癌患者、肿瘤浸润淋巴细胞、T细胞克隆 | 免疫学 | 口咽癌 | 单细胞转录组测序, 基因编辑, 抗体阻断实验 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | HPV16+ OPSCC患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Mechanistic target of rapamycin signaling in human nervous system development and disease
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1005631
PMID:36226315
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综述 | 探讨mTOR信号通路在人类神经系统发育和疾病中的关键作用 | 整合单细胞转录组学和脑类器官技术揭示mTOR信号在人类皮层发育中的特异性作用及其与灵长类进化差异的关联 | 作为小型综述未包含原始实验数据,主要基于已有研究进行总结 | 阐明mTOR信号通路在神经系统发育和疾病机制中的功能 | 人类神经系统发育过程及相关疾病(mTORopathies) | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学,脑类器官技术,超灵敏突变检测技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Comparative Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Genes Involved in Bivalve Embryonic Shell Formation and Questions Ontogenetic Homology of Molluscan Shell Types
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.883755
PMID:35813198
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研究论文 | 通过单细胞转录组比较分析揭示双壳类胚胎壳形成相关新基因,并对软体动物壳类型的个体发育同源性提出质疑 | 首次在双壳类中使用单细胞RNA测序分析胚胎和幼虫壳形成的遗传工具箱,发现胚胎壳和幼虫壳分泌过程中基因表达的显著差异 | 目前缺乏对胚胎壳或幼虫壳形成相关组织表达基因的详细注释 | 研究斑马纹贻贝胚胎和幼虫壳形成的遗传机制 | 斑马纹贻贝的胚胎和幼虫壳形成过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Long Intergenic Noncoding RNA MIAT as a Regulator of Human Th17 Cell Differentiation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.856762
PMID:35784351
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研究论文 | 本研究揭示了长链基因间非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化早期作为关键调节因子的作用机制 | 首次发现MIAT通过STAT3信号通路调控Th17分化关键基因表达,并可能通过改变染色质可及性发挥作用 | 研究主要关注早期分化阶段,对MIAT在其他免疫细胞类型或疾病阶段的作用尚未完全阐明 | 阐明长链非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化过程中的功能机制 | 人类Th17细胞及其分化过程 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | 类风湿关节炎患者滑膜组织中的T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Next-Generation and Single-Cell Sequencing Approaches to Study Atherosclerosis and Vascular Inflammation Pathophysiology: A Systematic Review
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.849675
PMID:35419441
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系统综述 | 本综述全面评估了利用单细胞和二代测序技术研究动脉粥样硬化及血管炎症病理生理学的研究现状 | 首次系统整合单细胞测序和二代测序在动脉粥样硬化研究中的应用,提供比传统方法更高分辨率的疾病解析 | 研究间存在显著异质性,对淋巴细胞和内皮细胞等其他细胞类型关注不足 | 评估单细胞和二代测序技术在阐明动脉粥样硬化病理生理机制中的应用价值 | 动脉粥样硬化相关细胞类型(平滑肌细胞、巨噬细胞、干细胞/祖细胞等)及血管组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 二代测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 34项符合条件的研究(16项单细胞测序,10项二代测序,8项组合方法) | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Role of synovial fibroblast subsets across synovial pathotypes in rheumatoid arthritis: a deconvolution analysis
2022-01, RMD open
IF:5.1Q1
DOI:10.1136/rmdopen-2021-001949
PMID:34987094
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据并进行反卷积分析,研究类风湿关节炎中滑膜成纤维细胞亚群在不同滑膜病理类型中的分布及其与临床特征的关系 | 首次揭示了不同滑膜病理类型与单细胞RNA测序定义的滑膜成纤维细胞亚型之间的关联 | 研究为计算机模拟分析,需要进一步实验验证 | 评估滑膜成纤维细胞亚群对滑膜病理类型和临床特征的贡献 | 87名未接受治疗的早期关节炎患者的滑膜组织 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 反卷积分析 | Seurat, Harmony, Liger, MuSiC | 基因表达数据 | 87名早期关节炎患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Decoding gene regulation in the fly brain
2022-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04262-z
PMID:34987221
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞染色质可及性和转录组数据,系统解析了果蝇大脑中细胞类型特异的基因调控网络 | 首次在果蝇大脑中结合单细胞染色质可及性分析和转录组数据,构建了细胞类型特异的增强子基因调控网络,并开发了DeepFlyBrain深度学习模型 | 研究仅针对果蝇大脑,结果在其他生物系统中的普适性有待验证 | 解析果蝇大脑中细胞类型水平的基因调控网络 | 果蝇大脑神经元和胶质细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞染色质可及性分析, 单细胞转录组测序, 深度学习 | 深度学习 | 单细胞基因组学数据 | 240,919个单细胞,涵盖9个发育时间点 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Comparative Proteome Signatures of Trace Samples by Multiplexed Data-Independent Acquisition
2022-01, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100177
PMID:34793982
|
研究论文 | 开发了一种结合DIA和TMT多重标记的新方法,用于从痕量样本中生成高重复性的定量蛋白质组特征 | 将两种对立分析策略DIA和TMT多重标记相结合,开发了不依赖识别的蛋白质组数据分析流程 | NA | 解决质谱单细胞蛋白质组学在比较数千个单细胞蛋白质表达谱时面临的重复性挑战 | 痕量输入样本和人类细胞系 | 蛋白质组学 | NA | 数据非依赖性采集(DIA)、串联质量标签(TMT)、质谱蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 数百个样本 | NA | 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Murine AGM single-cell profiling identifies a continuum of hemogenic endothelium differentiation marked by ACE
2022-01-20, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020007885
PMID:34517413
|
研究论文 | 通过小鼠AGM区域单细胞测序揭示造血内皮细胞分化连续过程及ACE标记作用 | 首次发现血管紧张素-I转换酶(ACE)特异性标记造血前体细胞向造血内皮细胞分化的连续过程 | 研究仅限于小鼠模型,人类相关性需进一步验证 | 解析胚胎期造血干细胞形成的分子和细胞通路 | 小鼠主动脉-性腺-中肾(AGM)区域的造血内皮细胞和背主动脉微环境细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 使用Runx1b和Gfi1/1b转基因报告小鼠模型分离的造血内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 全长单细胞RNA测序 |
| 30 | 2025-10-06 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis
2022-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01006-2
PMID:34489600
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和单细胞转录组数据,阐明了小鼠器官发育过程中的细胞类型和分化轨迹 | 开发了基于图像的空间单细胞转录组方法,首次将空间信息与单细胞转录组图谱整合,揭示了scRNA-seq数据中无法观察到的细胞分化轴 | 仅检测了387个目标基因,覆盖度有限;研究局限于小鼠胚胎8-12体节阶段 | 研究复杂组织中细胞命运决定的分子机制 | 小鼠胚胎组织切片 | 空间转录组学 | 发育生物学 | seqFISH, scRNA-seq | NA | 空间转录组数据,单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎8-12体节阶段组织切片 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | seqFISH | 顺序荧光原位杂交技术,检测387个目标基因 |
| 31 | 2025-10-06 |
Deciphering Mesenchymal Drivers of Human Dupuytren's Disease at Single-Cell Level
2022-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.05.030
PMID:34274346
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别人类掌腱膜挛缩症中致病性间充质细胞亚群及其关键分子通路 | 首次在单细胞水平鉴定出Dupuytren病特异性PDPN/FAP致病性间充质细胞群,并发现TNFRSF12A和SCX在成纤维细胞分化中的关键作用 | 样本量相对有限(35,250个细胞),功能验证仅通过体外细胞培养实验完成 | 解析Dupuytren病的细胞和分子驱动机制,为开发新疗法提供靶点 | 人类Dupuytren病变组织、非致病性筋膜和健康真皮组织 | 单细胞组学 | 掌腱膜挛缩症 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 35,250个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Simultaneous Analysis of Single-Cell Transcriptomes and Cell Surface Protein Expression of Human Hematopoietic Stem Cells and Progenitors Using the 10x Genomics Platform
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_13
PMID:34766273
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研究论文 | 本文介绍使用10x Genomics平台同时分析人类造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组与细胞表面蛋白表达的方法 | 将CITE-seq工作流程与10x Genomics平台结合,实现单细胞转录组和表面蛋白表达的同时分析 | NA | 开发同时表征蛋白质和RNA的单细胞分析方法 | 人类脐带血单核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 | 单细胞多组学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | 10x Genomics, BioLegend | 单细胞RNA-seq, 免疫表型分析 | 10x Chromium, TotalSeq | 基于液滴的单细胞RNA-seq商业平台, TotalSeq™寡核苷酸偶联抗体 |
| 33 | 2025-10-06 |
Delineating chromatin accessibility re-patterning at single cell level during early stage of direct cardiac reprogramming
2022-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.09.002
PMID:34509499
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC-seq技术揭示了心脏重编程早期阶段染色质可及性重塑的动态过程 | 首次在单细胞水平系统描绘心脏重编程早期的染色质可及性重编程模式,并发现Smad3在重编程过程中具有双重作用 | 研究聚焦于重编程早期阶段(第3天),未涵盖完整重编程过程 | 解析心脏成纤维细胞直接重编程为心肌细胞过程中染色质景观变化的驱动机制 | 由Mef2c、Gata4和Tbx5诱导的早期重编程心肌细胞(iCMs) | 表观基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 表观基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Identification of HSC/MPP expansion units in fetal liver by single-cell spatiotemporal transcriptomics
2022-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00540-7
PMID:34341490
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研究论文 | 通过单细胞时空转录组技术识别小鼠胎肝中造血干细胞/多能祖细胞扩张单元 | 首次构建小鼠胎肝时空转录组图谱,发现CD93富集的HSC/MPP亚群和由多种生态位细胞组成的HSC PLUS结构单元 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 解析造血干细胞和祖细胞在天然生态位中的扩张机制 | 小鼠胎肝中的造血干细胞/多能祖细胞及其生态位细胞 | 单细胞组学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Molecular Genetics of Kappa Opioids in Pain and Itch Sensations
2022, Handbook of experimental pharmacology
DOI:10.1007/164_2020_397
PMID:33145633
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综述 | 本文综述了κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽在调节瘙痒和疼痛感觉中的分子遗传学机制 | 整合了单细胞测序数据重新分析显示这些分子的表达谱,并基于解剖结构系统梳理了κ阿片系统在不同部位的作用 | 仅考虑强啡肽与KOR的相互作用,未深入探讨高剂量下其他肽类对KOR的潜在刺激作用 | 探讨κ阿片受体系统在疼痛和瘙痒感觉调节中的分子遗传机制 | κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽,以及受其影响的细胞和神经回路 | 神经科学 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Lysyl oxidase promotes anaplastic thyroid carcinoma cell proliferation and metastasis mediated via BMP1
2022-Jan, Gland surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.21037/gs-21-908
PMID:35242686
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研究论文 | 本研究探讨赖氨酰氧化酶(LOX)通过BMP1促进甲状腺未分化癌增殖和转移的机制 | 首次在单细胞水平揭示LOX/BMP1轴在甲状腺未分化癌恶性进展中的关键作用 | 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索甲状腺未分化癌的新型治疗靶点 | 甲状腺未分化癌细胞系(8505C) | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, qRT-PCR, Western blot, RNA干扰 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | GEO数据库中的ATC单细胞RNA测序数据和微阵列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-07 |
Mucosal Vaccination with Cyclic Dinucleotide Adjuvants Induces Effective T Cell Homing and IL-17-Dependent Protection against Mycobacterium tuberculosis Infection
2022-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100029
PMID:34965963
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研究论文 | 本研究揭示了环二核苷酸佐剂通过黏膜疫苗接种诱导T细胞归巢和IL-17依赖性保护机制抵抗结核分枝杆菌感染 | 首次阐明CDN佐剂疫苗通过诱导Th17细胞代谢状态改变和CD153表达实现保护作用的机制,并证明单纯诱导Th17细胞不足以提供保护 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证 | 探究环二核苷酸佐剂疫苗对抗结核感染的免疫保护机制 | 小鼠模型中的免疫细胞反应和结核分枝杆菌感染 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-07 |
Targeting the TREM1-positive myeloid microenvironment in glioblastoma
2022 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdac149
PMID:36249290
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研究论文 | 本研究探讨了胶质母细胞瘤中TREM1阳性髓系微环境的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现TREM1阳性髓系微环境促进胶质母细胞瘤异质性,并证明HuR二聚化抑制剂SRI42127可有效抑制该微环境 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 研究胶质母细胞瘤中髓系微环境的作用机制并探索其治疗靶向策略 | 胶质母细胞瘤患者样本、PDX细胞系、小鼠胶质母细胞瘤模型 | 肿瘤微环境研究 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、体外细胞融合实验、细胞迁移实验 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 转录组数据、单细胞数据、体内外实验数据 | 5个PDX细胞系、2个小鼠胶质母细胞瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2025-10-07 |
Transcriptional programming of immunoregulatory responses in human Langerhans cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.892254
PMID:36203560
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析研究人表皮朗格汉斯细胞在稳态和迁移过程中的转录编程及其免疫调节功能 | 首次揭示稳态朗格汉斯细胞存在于连续成熟状态,并发现迁移诱导的免疫调节基因组模块和关键转录因子网络 | NA | 研究人原代朗格汉斯细胞在稳态期间的转录编程和免疫调节功能 | 人表皮朗格汉斯细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC, Partial Information Decomposition in Context | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-07 |
Oncostatin M expression induced by bacterial triggers drives airway inflammatory and mucus secretion in severe asthma
2022-01-12, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abf8188
PMID:35020406
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研究论文 | 本研究揭示了细菌感染通过诱导OSM表达驱动严重哮喘气道炎症和黏液分泌的分子机制 | 首次发现细菌脂多糖通过诱导OSM表达驱动严重哮喘的病理特征,并确定巨噬细胞是OSM的主要来源 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,需要在人类患者中进行更直接的验证 | 阐明细菌感染加重严重哮喘症状的分子机制 | 严重哮喘患者的气道活检组织、原代人肺组织、人上皮细胞和间充质细胞、小鼠巨噬细胞 | 分子生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,抗体阻断实验 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | 人类气道活检组织和原代细胞,小鼠巨噬细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |