单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
361 2024-08-08
Early renal structural changes and potential biomarkers in diabetic nephropathy
2022, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
综述 本文综述了糖尿病肾病早期肾小球和肾小管结构变化及相关生物标志物的研究进展 详细描述了肾小球损伤标志物SMAD1和Podocalyxin,以及肾小管损伤标志物NGAL、Netrin-1和L-FABP在糖尿病肾病中的作用 NA 探讨糖尿病肾病早期诊断的生物标志物,以改善肾功能和延缓疾病进展 糖尿病肾病中的早期肾结构变化和潜在生物标志物 NA 糖尿病肾病 蛋白质组学和单细胞RNA测序 NA 蛋白质和RNA NA
362 2024-08-08
Highly sensitive and specific responses of shrimp gill cells to high pH stress based on single cell RNA-seq analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了虾鳃细胞对高pH应激的高度敏感和特异性反应 首次揭示了虾鳃细胞在高pH应激下的细胞和分子机制,特别是柱状细胞中免疫相关基因的上调和新免疫细胞亚群的出现 NA 探究虾鳃细胞在高pH应激下的细胞和分子响应机制 虾鳃细胞在高pH应激下的反应 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 三种主要鳃细胞类型,包括柱状细胞、血细胞和隔膜细胞
363 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals a novel inhibitory effect of ApoA4 on NAFL mediated by liver-specific subsets of myeloid cells
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ApoA4通过肝脏特异性髓系细胞对NAFL的抑制作用 发现ApoA4通过调节特定免疫细胞亚群和相关基因表达,对NAFL具有抑制作用 NA 研究ApoA4对NAFL中肝脏免疫细胞的影响及其机制 ApoA4对NAFL中肝脏免疫细胞的影响及特定免疫细胞亚群的作用 数字病理学 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自WT和ApoA4缺陷小鼠的肝脏免疫细胞
364 2024-08-08
Signatures of EMT, immunosuppression, and inflammation in primary and recurrent human cutaneous squamous cell carcinoma at single-cell resolution
2022, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中上皮细胞、T细胞、髓系细胞和成纤维细胞的动态变化,并探讨了肿瘤微环境的异质性及其与疾病进展的关系 首次在单细胞分辨率下研究了原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中肿瘤微环境的动态变化,揭示了免疫抑制微环境和炎症特征的差异 NA 探究皮肤鳞状细胞癌进展的关键机制,为预防和治疗复发提供新策略 原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中的上皮细胞、T细胞、髓系细胞和成纤维细胞 数字病理学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
365 2024-08-08
Single-cell transcriptomics of peripheral blood reveals anti-tumor systemic immunity induced by oncolytic virotherapy
2022, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术分析了基于HSV-2的溶瘤病毒OH2治疗后小鼠外周血的免疫反应 首次全面描述了溶瘤病毒治疗对系统免疫的影响,揭示了OH2诱导的系统免疫重塑和激活机制 NA 探究溶瘤病毒治疗对系统免疫的影响及其抗肿瘤机制 溶瘤病毒OH2治疗后的小鼠外周血样本 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
366 2024-08-08
The landscape of cancer-associated fibroblasts in colorectal cancer liver metastases
2022, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析结直肠癌肝转移中的癌症相关成纤维细胞(CAFs),揭示了CAFs的不同亚群及其在肿瘤微环境中的作用 本研究首次在单细胞分辨率下分析了大量结直肠癌肝转移中的CAFs,并开发了针对LTBP2的全人源抗体,为靶向治疗提供了新策略 NA 探究结直肠癌肝转移中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤发展中的作用 结直肠癌肝转移中的癌症相关成纤维细胞和癌细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学 NA 转录组数据 4,397个来自六个结直肠癌肝转移样本的CAFs
367 2024-08-08
CommPath: An R package for inference and analysis of pathway-mediated cell-cell communication chain from single-cell transcriptomics
2022, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 介绍CommPath,一个用于分析和可视化单细胞转录组数据中配体-受体相互作用和通路介导的细胞间通信链的R包和网络服务器 CommPath能够优先考虑引发接收细胞特定生物学反应的功能性配体-受体关联,并识别对接收细胞下游细胞类型的影响 NA 开发工具以分析单细胞转录组数据中的细胞间通信链 配体-受体相互作用和细胞间通信链 生物信息学 肝细胞癌 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
368 2024-08-08
MLN2238 exerts its anti-tumor effects via regulating ROS/JNK/mitochondrial signaling pathways in intrahepatic cholangiocarcinoma
2022, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 研究探讨了MLN2238通过调控ROS/JNK/线粒体信号通路在肝内胆管癌中的抗肿瘤作用 使用单细胞RNA测序技术深入探索细胞多样性和分子复杂性,以及MLN2238作为新一代蛋白酶体抑制剂在肝内胆管癌中的作用机制 研究仅基于10个肝内胆管癌样本的4,239个合格单细胞RNA测序数据,样本量相对较小 探索MLN2238在肝内胆管癌中的作用及其机制,评估其作为治疗选择的潜力 肝内胆管癌细胞及其信号通路 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 10个肝内胆管癌样本,4,239个单细胞
369 2024-08-08
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Transcriptional Changes in the Cartilage of Subchondral Insufficiency Fracture of the Knee
2022, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了膝关节次髁不足骨折患者的软骨转录组变化 首次通过单细胞RNA测序技术阐明了膝关节次髁不足骨折和骨关节炎患者软骨中的转录组变化和独特的细胞类型亚群 NA 探究膝关节次髁不足骨折对软骨转录组的影响 膝关节次髁不足骨折和骨关节炎患者的软骨 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA
370 2024-08-08
Sympathectomy Ameliorates CFA-Induced Mechanical Allodynia via Modulating Phenotype of Macrophages in Sensory Ganglion in Mice
2022, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨了交感神经系统在诱发性炎症疼痛中的作用,特别是其对三叉神经节巨噬细胞表型的影响 首次研究了交感神经系统对三叉神经节巨噬细胞的调节作用,并探讨了其在诱发性炎症疼痛中的机制 研究仅限于小鼠模型,且未探讨交感神经系统在人类疼痛中的作用 研究交感神经系统在口腔面部炎症疼痛中的作用及其对三叉神经节巨噬细胞的影响 交感神经系统、三叉神经节巨噬细胞、诱发性炎症疼痛 NA NA 免疫组织化学、液相色谱、单细胞RNA测序 NA 细胞 雄性C57BL/6小鼠
371 2024-08-08
Macrophage-Specific Cathepsin as a Marker Correlated with Prognosis and Tumor Microenvironmental Characteristics of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本文研究了巨噬细胞特异性半胱氨酸蛋白酶Z(CTSZ)在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的表达模式及其与预后和肿瘤微环境特征的关系 首次揭示了巨噬细胞特异性CTSZ在ccRCC中的表达与肿瘤微环境特征及患者预后的关联 NA 探讨CTSZ在ccRCC中的表达及其与预后和肿瘤微环境特征的关系 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的CTSZ表达 数字病理学 肾细胞癌 免疫组织化学、双标记免疫荧光、单细胞测序、多组学数据分析 NA 组织样本、单细胞测序数据 两个独立的抗PD-1治疗临床试验的数据
372 2024-08-08
Influence of single-cell RNA sequencing data integration on the performance of differential gene expression analysis
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文评估了六种单细胞RNA测序数据整合方法对差异基因表达分析性能的影响 本文选择了仅返回完整表达矩阵的数据整合方法,并评估了它们在两个具有相同生物学研究设计的单细胞数据集上的表现 大多数测试的方法在整合后改变了数据分布,这对使用参数方法进行分析产生了负面影响 研究单细胞RNA测序数据整合方法对差异基因表达分析的影响 六种数据整合方法在两个单细胞RNA测序数据集上的表现 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两个单细胞RNA测序数据集
373 2024-08-08
The Mechanisms of Systemic Inflammatory and Immunosuppressive Acute-on-Chronic Liver Failure and Application Prospect of Single-Cell Sequencing
2022, Journal of immunology research IF:3.5Q2
研究论文 本文探讨了急性-慢性肝衰竭(ACLF)的系统性炎症和免疫抑制机制,并介绍了单细胞测序技术在该领域的应用前景 文章介绍了单细胞RNA测序技术在研究ACLF中的潜在应用,以深入理解ACLF的单细胞基因表达 NA 研究ACLF的炎症和免疫抑制机制,并探索单细胞测序技术的应用 ACLF患者的系统性炎症和免疫抑制过程,以及单细胞测序技术 NA 肝病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
374 2024-08-08
Integrated analysis of fibroblasts molecular features in papillary thyroid cancer combining single-cell and bulk RNA sequencing technology
2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过结合单细胞和批量RNA测序技术,对乳头状甲状腺癌中的成纤维细胞分子特征进行了综合分析 首次在甲状腺癌中对成纤维细胞进行了详细的研究,并建立了一个纤维化评分模型用于预测甲状腺癌患者的预后 研究主要基于TCGA数据集和单一的临床队列,可能需要更多样本和不同来源的数据以验证结果的普遍性 探索乳头状甲状腺癌中成纤维细胞的分子特征及其在癌症微环境中的作用 乳头状甲状腺癌中的成纤维细胞及其相关基因表达和预后价值 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序和批量RNA测序 NA RNA测序数据 使用了TCGA数据集和临床组织样本进行验证
375 2024-08-08
Single-cell RNA-seq reveals the communications between extracellular matrix-related components and Schwann cells contributing to the earlobe keloid formation
2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了耳垂瘢痕疙瘩形成过程中细胞外基质相关成分与施万细胞之间的相互作用 首次通过单细胞RNA测序构建了耳垂瘢痕疙瘩的细胞图谱,并发现了施万细胞与细胞外基质相关细胞群之间的强相互作用 研究主要集中在耳垂瘢痕疙瘩,其他部位瘢痕疙瘩的研究较少 探索耳垂瘢痕疙瘩形成的分子机制 耳垂瘢痕疙瘩样本及其邻近正常皮肤样本 数字病理学 皮肤纤维化疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 31,379个细胞
376 2024-08-08
A scoping review on the significance of programmed death-ligand 1-inhibiting microRNAs in non-small cell lung treatment: A single-cell RNA sequencing-based study
2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
综述 本研究旨在系统回顾PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌抑制中的重要性及其潜在机制 通过单细胞RNA测序技术,探讨了PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌中的作用及其对免疫反应的影响 需要进一步的研究将这一方法转化为临床实践 系统回顾PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌抑制中的重要性及其潜在机制 PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌中的作用 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及多种PD-L1抑制性微RNAs的表达
377 2024-08-08
Single-cell atlas of murine adrenal glands reveals immune-adrenal crosstalk during systemic Candida albicans infection
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了系统性白色念珠菌感染后小鼠肾上腺转录组的变化 首次报道了系统性白色念珠菌感染下肾上腺应激反应的详细变化,揭示了免疫细胞与肾上腺细胞之间的相互作用 NA 探讨系统性白色念珠菌感染下小鼠肾上腺微环境的改变及其对免疫-肾上腺细胞通讯的影响 小鼠肾上腺细胞及其在系统性白色念珠菌感染后的转录组变化 数字病理学 念珠菌病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 16021个细胞
378 2024-08-08
Identification of a novel sepsis prognosis model and analysis of possible drug application prospects: Based on scRNA-seq and RNA-seq data
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序(scRNA-seq)和转录组RNA-seq数据,识别出71个差异表达基因(DEGs),并构建了一个以CCL5、HBD、IFR2BP2、LTB和WFDC1为标志的预后模型,用于预测脓毒症的预后和指导临床药物使用 首次基于scRNA-seq和RNA-seq数据构建脓毒症预后模型,并通过多种分析方法验证了模型的稳定性和预测能力 NA 开发和验证一种新的脓毒症预后模型,并探索其在临床药物应用中的潜力 脓毒症的预后预测和药物应用 数字病理学 脓毒症 单细胞RNA测序(scRNA-seq),转录组RNA-seq LASSO回归分析,Cox回归分析 基因表达数据 71个差异表达基因
379 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals TCR+ macrophages in HPV-related head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了来自18名HPV阳性和8名HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的4,388个高质量巨噬细胞的单细胞图谱,揭示了HPV相关头颈鳞状细胞癌中TCR阳性巨噬细胞的存在 首次在HPV相关头颈鳞状细胞癌中发现具有TCR和CD3特异性标志的巨噬细胞亚群,这些巨噬细胞可能参与TCR信号通路和吞噬作用的调控 NA 探讨HPV感染对头颈鳞状细胞癌中巨噬细胞浸润率、功能和分化的影响,并揭示TCR阳性巨噬细胞在头颈鳞状细胞癌微环境中的作用 HPV阳性和HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的巨噬细胞 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA 4,388个高质量巨噬细胞来自18名HPV阳性和8名HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者
380 2024-08-08
Single-cell mechanistic studies of radiation-mediated bystander effects
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了辐射后不同时间点的肠道组织,揭示了辐射诱导的旁观者效应的细胞和分子机制 研究首次详细探讨了辐射特定免疫细胞在细胞间通信中的作用,特别是CD8+ T细胞在辐射后的持久性和其在铁死亡中的作用 研究主要集中在小鼠肠道组织,可能需要进一步在其他组织类型中验证结果 阐明放射治疗如何诱导旁观者效应 辐射后的肠道组织及其免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 辐射后不同时间点的肠道组织及健康肠道组织
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