单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-08 |
The diversity of trophoblast cells and niches of placenta accreta spectrum disorders revealed by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1044198
PMID:36420138
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了胎盘植入谱系障碍中滋养层细胞和微环境的多样性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胎盘植入谱系障碍的病理景观，并揭示了滋养层细胞与母体基质细胞之间的增强互动 | 研究主要集中在胎盘植入谱系障碍的病理机制上，未来需要进一步探索针对性的转化研究 | 深入理解胎盘植入谱系障碍的病理机制 | 胎盘植入谱系障碍中的滋养层细胞和微环境 | 数字病理学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自同一胎盘植入谱系障碍胎盘的代表性侵袭部分和正常部分 |
| 362 | 2024-08-08 |
Evaluation of single-cell RNA-seq clustering algorithms on cancer tumor datasets
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.10.029
PMID:36420149
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研究论文 | 本文开发了一个框架，用于系统评估单细胞RNA测序（RNA-seq）聚类算法在癌症肿瘤数据集上的性能 | 使用一系列成熟的指标生成统一的质控得分和算法排名，并对15种不同的单细胞RNA-seq聚类算法在八个不同的癌症数据集上进行了性能评估 | NA | 评估单细胞RNA-seq聚类算法在癌症数据集上的性能 | 单细胞RNA-seq聚类算法在癌症数据集上的性能 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个不同的癌症数据集 |
| 363 | 2024-08-08 |
Integrative analysis deciphers the heterogeneity of cancer-associated fibroblast and implications on clinical outcomes in ovarian cancers
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.11.025
PMID:36420154
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研究论文 | 本研究通过分析卵巢癌样本的单细胞RNA测序数据，识别出两种不同的癌症相关成纤维细胞亚型，并探讨了它们对临床结果的影响 | 首次揭示了CAF_c1亚型的特征，可作为新的预后指标和免疫治疗预测标记 | NA | 探究癌症相关成纤维细胞的异质性及其对卵巢癌患者临床结果的影响 | 卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 364 | 2024-08-08 |
Genetic mutation and tumor microbiota determine heterogenicity of tumor immune signature: Evidence from gastric and colorectal synchronous cancers
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.947080
PMID:36420271
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研究论文 | 本文通过多组学分析，包括单细胞RNA测序、全外显子测序和微生物组测序，探讨了胃癌和结直肠癌同步原发肿瘤的肿瘤免疫特征的异质性及其决定因素。 | 首次揭示了遗传突变和肿瘤微生物组对胃癌和结直肠癌免疫微环境异质性的影响。 | NA | 阐明胃癌和结直肠癌预后和药物反应差异的决定因素。 | 胃癌和结直肠癌的同步原发肿瘤。 | 数字病理学 | 胃癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 微生物组测序 | NA | 基因组数据, 微生物组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 365 | 2024-08-08 |
Early renal structural changes and potential biomarkers in diabetic nephropathy
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.1020443
PMID:36425298
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综述 | 本文综述了糖尿病肾病早期肾小球和肾小管结构变化及相关生物标志物的研究进展 | 详细描述了肾小球损伤标志物SMAD1和Podocalyxin，以及肾小管损伤标志物NGAL、Netrin-1和L-FABP在糖尿病肾病中的作用 | NA | 探讨糖尿病肾病早期诊断的生物标志物，以改善肾功能和延缓疾病进展 | 糖尿病肾病中的早期肾结构变化和潜在生物标志物 | NA | 糖尿病肾病 | 蛋白质组学和单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质和RNA | NA |
| 366 | 2024-08-08 |
Highly sensitive and specific responses of shrimp gill cells to high pH stress based on single cell RNA-seq analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1031828
PMID:36425531
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了虾鳃细胞对高pH应激的高度敏感和特异性反应 | 首次揭示了虾鳃细胞在高pH应激下的细胞和分子机制，特别是柱状细胞中免疫相关基因的上调和新免疫细胞亚群的出现 | NA | 探究虾鳃细胞在高pH应激下的细胞和分子响应机制 | 虾鳃细胞在高pH应激下的反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 三种主要鳃细胞类型，包括柱状细胞、血细胞和隔膜细胞 |
| 367 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals a novel inhibitory effect of ApoA4 on NAFL mediated by liver-specific subsets of myeloid cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1038401
PMID:36426356
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ApoA4通过肝脏特异性髓系细胞对NAFL的抑制作用 | 发现ApoA4通过调节特定免疫细胞亚群和相关基因表达，对NAFL具有抑制作用 | NA | 研究ApoA4对NAFL中肝脏免疫细胞的影响及其机制 | ApoA4对NAFL中肝脏免疫细胞的影响及特定免疫细胞亚群的作用 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自WT和ApoA4缺陷小鼠的肝脏免疫细胞 |
| 368 | 2024-08-08 |
Signatures of EMT, immunosuppression, and inflammation in primary and recurrent human cutaneous squamous cell carcinoma at single-cell resolution
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.77528
PMID:36438481
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中上皮细胞、T细胞、髓系细胞和成纤维细胞的动态变化，并探讨了肿瘤微环境的异质性及其与疾病进展的关系 | 首次在单细胞分辨率下研究了原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中肿瘤微环境的动态变化，揭示了免疫抑制微环境和炎症特征的差异 | NA | 探究皮肤鳞状细胞癌进展的关键机制，为预防和治疗复发提供新策略 | 原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中的上皮细胞、T细胞、髓系细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 369 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of peripheral blood reveals anti-tumor systemic immunity induced by oncolytic virotherapy
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.74075
PMID:36438484
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术分析了基于HSV-2的溶瘤病毒OH2治疗后小鼠外周血的免疫反应 | 首次全面描述了溶瘤病毒治疗对系统免疫的影响，揭示了OH2诱导的系统免疫重塑和激活机制 | NA | 探究溶瘤病毒治疗对系统免疫的影响及其抗肿瘤机制 | 溶瘤病毒OH2治疗后的小鼠外周血样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 370 | 2024-08-08 |
The landscape of cancer-associated fibroblasts in colorectal cancer liver metastases
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72853
PMID:36438498
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析结直肠癌肝转移中的癌症相关成纤维细胞（CAFs），揭示了CAFs的不同亚群及其在肿瘤微环境中的作用 | 本研究首次在单细胞分辨率下分析了大量结直肠癌肝转移中的CAFs，并开发了针对LTBP2的全人源抗体，为靶向治疗提供了新策略 | NA | 探究结直肠癌肝转移中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤发展中的作用 | 结直肠癌肝转移中的癌症相关成纤维细胞和癌细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 4,397个来自六个结直肠癌肝转移样本的CAFs |
| 371 | 2024-08-08 |
CommPath: An R package for inference and analysis of pathway-mediated cell-cell communication chain from single-cell transcriptomics
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.10.028
PMID:36382188
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研究论文 | 介绍CommPath，一个用于分析和可视化单细胞转录组数据中配体-受体相互作用和通路介导的细胞间通信链的R包和网络服务器 | CommPath能够优先考虑引发接收细胞特定生物学反应的功能性配体-受体关联，并识别对接收细胞下游细胞类型的影响 | NA | 开发工具以分析单细胞转录组数据中的细胞间通信链 | 配体-受体相互作用和细胞间通信链 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 372 | 2024-08-08 |
MLN2238 exerts its anti-tumor effects via regulating ROS/JNK/mitochondrial signaling pathways in intrahepatic cholangiocarcinoma
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1040847
PMID:36386204
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研究论文 | 研究探讨了MLN2238通过调控ROS/JNK/线粒体信号通路在肝内胆管癌中的抗肿瘤作用 | 使用单细胞RNA测序技术深入探索细胞多样性和分子复杂性，以及MLN2238作为新一代蛋白酶体抑制剂在肝内胆管癌中的作用机制 | 研究仅基于10个肝内胆管癌样本的4,239个合格单细胞RNA测序数据，样本量相对较小 | 探索MLN2238在肝内胆管癌中的作用及其机制，评估其作为治疗选择的潜力 | 肝内胆管癌细胞及其信号通路 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10个肝内胆管癌样本，4,239个单细胞 |
| 373 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Transcriptional Changes in the Cartilage of Subchondral Insufficiency Fracture of the Knee
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S385648
PMID:36386577
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了膝关节次髁不足骨折患者的软骨转录组变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术阐明了膝关节次髁不足骨折和骨关节炎患者软骨中的转录组变化和独特的细胞类型亚群 | NA | 探究膝关节次髁不足骨折对软骨转录组的影响 | 膝关节次髁不足骨折和骨关节炎患者的软骨 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 374 | 2024-08-08 |
Sympathectomy Ameliorates CFA-Induced Mechanical Allodynia via Modulating Phenotype of Macrophages in Sensory Ganglion in Mice
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S388322
PMID:36386581
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研究论文 | 本研究探讨了交感神经系统在诱发性炎症疼痛中的作用，特别是其对三叉神经节巨噬细胞表型的影响 | 首次研究了交感神经系统对三叉神经节巨噬细胞的调节作用，并探讨了其在诱发性炎症疼痛中的机制 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨交感神经系统在人类疼痛中的作用 | 研究交感神经系统在口腔面部炎症疼痛中的作用及其对三叉神经节巨噬细胞的影响 | 交感神经系统、三叉神经节巨噬细胞、诱发性炎症疼痛 | NA | NA | 免疫组织化学、液相色谱、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 雄性C57BL/6小鼠 |
| 375 | 2024-08-08 |
Macrophage-Specific Cathepsin as a Marker Correlated with Prognosis and Tumor Microenvironmental Characteristics of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S375250
PMID:36386587
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研究论文 | 本文研究了巨噬细胞特异性半胱氨酸蛋白酶Z（CTSZ）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的表达模式及其与预后和肿瘤微环境特征的关系 | 首次揭示了巨噬细胞特异性CTSZ在ccRCC中的表达与肿瘤微环境特征及患者预后的关联 | NA | 探讨CTSZ在ccRCC中的表达及其与预后和肿瘤微环境特征的关系 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的CTSZ表达 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 免疫组织化学、双标记免疫荧光、单细胞测序、多组学数据分析 | NA | 组织样本、单细胞测序数据 | 两个独立的抗PD-1治疗临床试验的数据 |
| 376 | 2024-08-08 |
Influence of single-cell RNA sequencing data integration on the performance of differential gene expression analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1009316
PMID:36386846
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研究论文 | 本文评估了六种单细胞RNA测序数据整合方法对差异基因表达分析性能的影响 | 本文选择了仅返回完整表达矩阵的数据整合方法，并评估了它们在两个具有相同生物学研究设计的单细胞数据集上的表现 | 大多数测试的方法在整合后改变了数据分布，这对使用参数方法进行分析产生了负面影响 | 研究单细胞RNA测序数据整合方法对差异基因表达分析的影响 | 六种数据整合方法在两个单细胞RNA测序数据集上的表现 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集 |
| 377 | 2024-08-08 |
The Mechanisms of Systemic Inflammatory and Immunosuppressive Acute-on-Chronic Liver Failure and Application Prospect of Single-Cell Sequencing
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/5091275
PMID:36387424
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研究论文 | 本文探讨了急性-慢性肝衰竭（ACLF）的系统性炎症和免疫抑制机制，并介绍了单细胞测序技术在该领域的应用前景 | 文章介绍了单细胞RNA测序技术在研究ACLF中的潜在应用，以深入理解ACLF的单细胞基因表达 | NA | 研究ACLF的炎症和免疫抑制机制，并探索单细胞测序技术的应用 | ACLF患者的系统性炎症和免疫抑制过程，以及单细胞测序技术 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 378 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of fibroblasts molecular features in papillary thyroid cancer combining single-cell and bulk RNA sequencing technology
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.1019072
PMID:36387901
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞和批量RNA测序技术，对乳头状甲状腺癌中的成纤维细胞分子特征进行了综合分析 | 首次在甲状腺癌中对成纤维细胞进行了详细的研究，并建立了一个纤维化评分模型用于预测甲状腺癌患者的预后 | 研究主要基于TCGA数据集和单一的临床队列，可能需要更多样本和不同来源的数据以验证结果的普遍性 | 探索乳头状甲状腺癌中成纤维细胞的分子特征及其在癌症微环境中的作用 | 乳头状甲状腺癌中的成纤维细胞及其相关基因表达和预后价值 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了TCGA数据集和临床组织样本进行验证 |
| 379 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals the communications between extracellular matrix-related components and Schwann cells contributing to the earlobe keloid formation
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1000324
PMID:36388926
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了耳垂瘢痕疙瘩形成过程中细胞外基质相关成分与施万细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序构建了耳垂瘢痕疙瘩的细胞图谱，并发现了施万细胞与细胞外基质相关细胞群之间的强相互作用 | 研究主要集中在耳垂瘢痕疙瘩，其他部位瘢痕疙瘩的研究较少 | 探索耳垂瘢痕疙瘩形成的分子机制 | 耳垂瘢痕疙瘩样本及其邻近正常皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 31,379个细胞 |
| 380 | 2024-08-08 |
A scoping review on the significance of programmed death-ligand 1-inhibiting microRNAs in non-small cell lung treatment: A single-cell RNA sequencing-based study
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1027758
PMID:36388933
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综述 | 本研究旨在系统回顾PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌抑制中的重要性及其潜在机制 | 通过单细胞RNA测序技术，探讨了PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌中的作用及其对免疫反应的影响 | 需要进一步的研究将这一方法转化为临床实践 | 系统回顾PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌抑制中的重要性及其潜在机制 | PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种PD-L1抑制性微RNAs的表达 |