单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of the tumor ecosystem of adenoid cystic carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1063477
PMID:36465348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了腺样囊性癌（ACC）肿瘤生态系统的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ACC中不同类型上皮细胞的转录组特征，并识别出具有特殊拷贝数变异的癌前细胞 | 研究样本仅限于三位患者，可能影响结果的普遍性 | 探究腺样囊性癌的肿瘤生态系统及其生物学行为 | 腺样囊性癌的肿瘤组织和癌旁组织中的细胞 | 数字病理学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 49,948个细胞来自三位患者的癌旁组织和肿瘤组织 |
| 342 | 2024-08-08 |
SERPINB9 is commonly amplified and high expression in cancer cells correlates with poor immune checkpoint blockade response
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2139074
PMID:36465485
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研究论文 | 研究探讨了SERPINB9基因在癌症细胞中的高表达与免疫检查点阻断（ICB）反应不良之间的关系 | 首次揭示了SERPINB9基因在癌症细胞中的高表达与ICB反应不良的相关性，并探讨了其在免疫治疗抵抗中的潜在作用 | 研究主要集中在非小细胞肺癌（NSCLC）和黑色素瘤，可能不适用于所有癌症类型 | 探索SERPINB9基因在癌症细胞中的作用及其对免疫治疗反应的影响 | SERPINB9基因在癌症细胞中的表达及其对免疫检查点阻断反应的影响 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括NSCLC和黑色素瘤的多个细胞系 |
| 343 | 2024-08-08 |
A spatiotemporal steroidogenic regulatory network in human fetal adrenal glands and gonads
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.1036517
PMID:36465633
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research paper | 本研究通过10× Genomics单细胞转录组技术和空间转录组学技术，对7至14周孕周的人类胎儿肾上腺和性腺进行了测序，重建了它们的位置信息，并探讨了性激素合成过程中的细胞协调机制。 | 首次揭示了人类胎儿肾上腺和性腺中脱氢表雄酮（DHEA）合成的重要酶基因表达变化，以及这一变化在性别分化窗口期对DHEA和皮质醇合成的加速作用。 | NA | 探讨人类胎儿肾上腺和性腺中性激素合成的主要前体脱氢表雄酮（DHEA）的生物学机制。 | 人类胎儿肾上腺和性腺。 | NA | NA | 10× Genomics单细胞转录组技术，空间转录组学 | NA | 转录组 | 7至14周孕周的人类胎儿肾上腺和性腺样本 |
| 344 | 2024-08-08 |
An Oxidative Stress-Related Gene Signature in Granulosa Cells Is Associated with Ovarian Aging
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1070968
PMID:36466095
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研究论文 | 本文研究了颗粒细胞中与氧化应激相关的基因特征与卵巢衰老的关系 | 首次在非人灵长类和人类数据集中验证了与卵巢衰老相关的颗粒细胞氧化应激基因特征 | NA | 探讨颗粒细胞中氧化应激相关基因特征与卵巢衰老的关联 | 颗粒细胞中的氧化应激相关基因 | NA | 卵巢衰老 | 单细胞转录组测序, qPCR | NA | 转录组数据 | 非人灵长类和人类样本, 以及人卵巢颗粒细胞瘤细胞系KGN和小鼠颗粒细胞 |
| 345 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome sequencing revealing the difference in photosynthesis and carbohydrate metabolism between epidermal cells and non-epidermal cells of Gracilariopsis lemaneiformis (Rhodophyta)
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.968158
PMID:36466256
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了Gracilariopsis lemaneiformis（红藻）的表皮细胞和非表皮细胞在正常光照条件下的光合作用和碳水化合物代谢差异 | 首次揭示了表皮细胞和非表皮细胞在光合作用和碳水化合物代谢方面的差异，并发现了光合产物在细胞间的运输 | NA | 探究不同细胞类型在光合作用和碳水化合物代谢方面的差异及其碳分配机制 | Gracilariopsis lemaneiformis的表皮细胞和非表皮细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 3436个差异表达基因 |
| 346 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the landscape of the tumor microenvironment in a skeletal undifferentiated pleomorphic sarcoma patient
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1019870
PMID:36466840
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了一名骨骼未分化多形性肉瘤患者的肿瘤组织和癌旁组织，揭示了肿瘤微环境的细胞组成和相关标志基因 | 首次利用单细胞RNA测序技术详细解析了骨骼未分化多形性肉瘤的肿瘤微环境，并识别了潜在的治疗靶点 | 研究仅基于单一病例，结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 探讨骨骼未分化多形性肉瘤的肿瘤微环境及其潜在治疗策略 | 骨骼未分化多形性肉瘤患者的肿瘤组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单一病例 |
| 347 | 2024-08-08 |
Combined bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq identifies a necroptosis-related prognostic signature associated with inhibitory immune microenvironment in glioma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1013094
PMID:36466844
|
研究论文 | 本研究通过结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术，识别出与胶质瘤抑制性免疫微环境相关的坏死性凋亡相关预后标志物 | 首次构建了基于18个坏死性凋亡相关基因的预后标志物，并验证了其在不同数据集中的预测能力 | NA | 探讨坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的预后价值及其与免疫微环境的关系 | 胶质瘤患者的预后及免疫微环境 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 159个坏死性凋亡相关基因，TCGA数据集及两个外部CGGA数据集 |
| 348 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of neutrophils and inflammatory responses in patients with COVID-19 and healthy controls
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.970287
PMID:36466858
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者和健康对照者的外周血中性粒细胞，揭示了与疾病严重程度相关的不同成熟中性粒细胞亚群 | 首次详细分析了COVID-19患者中性粒细胞的异质性及其在炎症反应中的作用 | 由于技术挑战，对中性粒细胞的深入分析有限 | 探究COVID-19患者与健康对照者中性粒细胞反应的差异 | COVID-19患者和健康对照者的中性粒细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括轻度和重度COVID-19患者及健康对照者的外周血中性粒细胞 |
| 349 | 2024-08-08 |
Single cell sequencing revealed the mechanism of PD-1 resistance affected by the expression profile of peripheral blood immune cells in ESCC
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1004345
PMID:36466860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）患者外周血免疫细胞表达谱对PD-1抗体耐药性的影响机制 | 首次深入分析了ESCC患者外周血免疫细胞的转录组特征及其对PD-1单抗疗效的影响 | NA | 探讨食管鳞状细胞癌患者免疫微环境转录组特征对免疫抑制剂疗效的影响 | 食管鳞状细胞癌患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | PD-1单抗敏感和耐药的食管癌患者的外周血免疫细胞 |
| 350 | 2024-08-08 |
Rapid identification of CMV-specific TCRs via reverse TCR cloning system based on bulk TCR repertoire data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1021067
PMID:36466875
|
研究论文 | 本文开发了一种基于批量TCR组库数据的反向TCR克隆系统，用于快速鉴定CMV特异性TCR | 该系统无需单细胞水平即可有效克隆抗原特异性TCR，并能通过NGS直接获得功能性TCR | NA | 开发一种新的TCR克隆系统，用于从激活标志物阳性的CD8 T细胞中克隆抗原特异性TCR | CMV pp65特异性T细胞反应及其TCR | NA | NA | NGS | NA | TCR组库数据 | 从HLA-A*02:01、HLA-A*02:06、HLA-B*07:02和HLA-B*40:06限制的4-1BB阳性CD8 T细胞中成功扩增了15条TCRα和14条TCRβ链 |
| 351 | 2024-08-08 |
Integrated multi-omics analysis identifies CD73 as a prognostic biomarker and immunotherapy response predictor in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.969034
PMID:36466881
|
研究论文 | 本研究通过综合多组学分析，探讨了CD73在头颈鳞状细胞癌中的作用，发现CD73可作为预后标志物和免疫治疗反应预测因子 | 首次详细分析了CD73在头颈鳞状细胞癌中的表达及其与免疫治疗反应的关系 | 研究主要基于TCGA数据库和公共数据集，需要进一步的临床验证 | 探索CD73在头颈鳞状细胞癌中的功能及其作为预后标志物和免疫治疗反应预测因子的潜力 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 临床数据 | 数据来自TCGA-HNSC项目和多个公共数据库 |
| 352 | 2024-08-08 |
Transcriptome profiling of abdominal aortic tissues reveals alterations in mRNAs of Takayasu arteritis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1036233
PMID:36468014
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序分析了Takayasu动脉炎患者腹主动脉组织的转录组变化 | 首次对Takayasu动脉炎患者的腹主动脉组织进行批量RNA测序，揭示了该疾病中mRNA表达的显著变化 | 样本量相对较小，且仅包括手术获取的组织样本 | 探索Takayasu动脉炎中mRNA表达的改变 | Takayasu动脉炎患者的腹主动脉组织 | 数字病理学 | Takayasu动脉炎 | 批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14个腹主动脉组织，其中8个来自肾移植，6个来自Takayasu动脉炎患者 |
| 353 | 2024-08-08 |
Neurons and glial cells acquire a senescent signature after repeated mild traumatic brain injury in a sex-dependent manner
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.1027116
PMID:36408415
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研究论文 | 本研究探讨了反复轻度创伤性脑损伤（rmTBI）后神经元和胶质细胞的衰老特征及其性别依赖性 | 首次揭示了反复轻度创伤性脑损伤后神经元和胶质细胞的衰老特征，并发现了性别差异 | 研究仅限于小鼠模型，且治疗效果在性别间存在差异 | 探究反复轻度创伤性脑损伤后的神经病理机制及性别差异 | C57BL/6小鼠的神经元和胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57BL/6小鼠 |
| 354 | 2024-08-08 |
The integrated transcriptome bioinformatics analysis identifies key genes and cellular components for proliferative diabetic retinopathy
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0277952
PMID:36409751
|
研究论文 | 本研究通过综合转录组生物信息学分析，识别出与增生性糖尿病视网膜病变（PDR）相关的关键基因和细胞组分 | 本研究通过整合公共的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别出PDR的新基因标志物和潜在治疗靶点 | 本研究仅使用了有限数量的PDR患者样本进行分析，可能影响结果的普遍性 | 揭示增生性糖尿病视网膜病变的内在分子机制 | 增生性糖尿病视网膜病变的关键基因和细胞组分 | 数字病理学 | 糖尿病并发症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括11名PDR患者和7名对照的批量RNA测序数据，以及5名PDR患者的单细胞RNA测序数据 |
| 355 | 2024-08-08 |
Immune checkpoint inhibitors plus chemotherapy in patients with locally advanced or metastatic pulmonary sarcomatoid carcinoma: a multicentric real-world study
2022, Therapeutic advances in medical oncology
IF:4.3Q2
DOI:10.1177/17588359221136759
PMID:36419724
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研究论文 | 本研究评估了免疫检查点抑制剂（ICIs）联合化疗在局部晚期或转移性肺肉瘤样癌（PSC）患者中的疗效 | 首次在多中心真实世界研究中评估了ICIs联合化疗在PSC患者中的疗效，并通过单细胞RNA测序揭示了PSC的免疫细胞炎症肿瘤微环境 | NA | 评估ICIs联合化疗在PSC患者中的疗效 | 局部晚期或转移性肺肉瘤样癌患者 | 数字病理学 | 肺肉瘤样癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 42名PSC患者 |
| 356 | 2024-08-08 |
Molecular and subregion mechanisms of episodic memory phenotypes in temporal lobe epilepsy
2022, Brain communications
IF:4.1Q2
DOI:10.1093/braincomms/fcac285
PMID:36419965
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研究论文 | 本研究通过空间定量技术分析了颞叶癫痫患者在四个与情景记忆相关的大脑区域（齿状回、CA3、CA1、新皮质）中目标蛋白质和转录本的差异表达，以探讨情景记忆障碍的分子和亚区域机制。 | 本研究首次在颞叶癫痫患者中使用空间转录组学技术，揭示了不同大脑亚区域在情景记忆障碍中的独特分子特征，并发现BDNF在CA3相关网络中作为调节认知、记忆等过程的关键枢纽。 | 研究样本量较小，仅包括16名药物难治性颞叶癫痫患者，且仅限于与海马硬化相关的病例。 | 探讨颞叶癫痫中情景记忆障碍的分子和亚区域机制。 | 颞叶癫痫患者的情景记忆障碍及其相关大脑区域的分子变化。 | 神经科学 | 癫痫 | 空间定量技术 | NA | 蛋白质和转录本数据 | 16名成年颞叶癫痫患者 |
| 357 | 2024-08-08 |
The diversity of trophoblast cells and niches of placenta accreta spectrum disorders revealed by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1044198
PMID:36420138
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了胎盘植入谱系障碍中滋养层细胞和微环境的多样性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胎盘植入谱系障碍的病理景观，并揭示了滋养层细胞与母体基质细胞之间的增强互动 | 研究主要集中在胎盘植入谱系障碍的病理机制上，未来需要进一步探索针对性的转化研究 | 深入理解胎盘植入谱系障碍的病理机制 | 胎盘植入谱系障碍中的滋养层细胞和微环境 | 数字病理学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自同一胎盘植入谱系障碍胎盘的代表性侵袭部分和正常部分 |
| 358 | 2024-08-08 |
Evaluation of single-cell RNA-seq clustering algorithms on cancer tumor datasets
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.10.029
PMID:36420149
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研究论文 | 本文开发了一个框架，用于系统评估单细胞RNA测序（RNA-seq）聚类算法在癌症肿瘤数据集上的性能 | 使用一系列成熟的指标生成统一的质控得分和算法排名，并对15种不同的单细胞RNA-seq聚类算法在八个不同的癌症数据集上进行了性能评估 | NA | 评估单细胞RNA-seq聚类算法在癌症数据集上的性能 | 单细胞RNA-seq聚类算法在癌症数据集上的性能 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个不同的癌症数据集 |
| 359 | 2024-08-08 |
Integrative analysis deciphers the heterogeneity of cancer-associated fibroblast and implications on clinical outcomes in ovarian cancers
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.11.025
PMID:36420154
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研究论文 | 本研究通过分析卵巢癌样本的单细胞RNA测序数据，识别出两种不同的癌症相关成纤维细胞亚型，并探讨了它们对临床结果的影响 | 首次揭示了CAF_c1亚型的特征，可作为新的预后指标和免疫治疗预测标记 | NA | 探究癌症相关成纤维细胞的异质性及其对卵巢癌患者临床结果的影响 | 卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 360 | 2024-08-08 |
Genetic mutation and tumor microbiota determine heterogenicity of tumor immune signature: Evidence from gastric and colorectal synchronous cancers
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.947080
PMID:36420271
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研究论文 | 本文通过多组学分析，包括单细胞RNA测序、全外显子测序和微生物组测序，探讨了胃癌和结直肠癌同步原发肿瘤的肿瘤免疫特征的异质性及其决定因素。 | 首次揭示了遗传突变和肿瘤微生物组对胃癌和结直肠癌免疫微环境异质性的影响。 | NA | 阐明胃癌和结直肠癌预后和药物反应差异的决定因素。 | 胃癌和结直肠癌的同步原发肿瘤。 | 数字病理学 | 胃癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 微生物组测序 | NA | 基因组数据, 微生物组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |