单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
321	2024-08-08	Single-cell RNA-sequencing in asthma research 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.988573 PMID:36524132	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在哮喘研究中的重要性及其近年来的研究成果	scRNA-seq技术有助于探索哮喘的异质性，识别稀有细胞类型和特定细胞亚群，阐明细胞分化的关键过程，并理解预测免疫功能的调控基因网络	NA	旨在为哮喘的发病机制、药物开发和治疗提供新思路	哮喘的免疫发病机制	digital pathology	哮喘	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
322	2024-08-08	Identification of Small Airway Epithelium-Related Hub Genes in Chronic Obstructive Pulmonary Disease 2022, International journal of chronic obstructive pulmonary disease IF:2.7Q2 DOI:10.2147/COPD.S377026 PMID:36475041	研究论文	本研究通过微阵列数据和单细胞RNA测序数据，识别与慢性阻塞性肺疾病（COPD）相关的小气道上皮细胞的关键基因	首次识别出可能在COPD过程中发挥抗氧化作用的关键基因，并通过单细胞转录组分析揭示了这些基因在COPD中的表达和分布	NA	识别与COPD进展相关的小气道上皮细胞的关键基因	小气道上皮细胞和COPD患者	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	微阵列分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序，实时定量PCR（RT-qPCR）	NA	基因表达数据	34名健康非吸烟者和33名COPD患者的小气道上皮细胞样本，以及单细胞RNA测序数据
323	2024-08-08	scAnalyzeR: A Comprehensive Software Package With Graphical User Interface for Single-Cell RNA Sequencing Analysis and its Application on Liver Cancer 2022 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment IF:2.7Q3 DOI:10.1177/15330338221142729 PMID:36476060	研究论文	开发了一个名为scAnalyzeR的单细胞RNA测序分析软件包，具有图形用户界面，用于分析和可视化单细胞RNA测序数据，并应用于肝癌研究	scAnalyzeR提供了一个交互式和用户友好的图形界面，简化了单细胞RNA测序数据分析的复杂性，并支持多种技术平台和模型生物的数据输入	NA	开发一个易于使用的单细胞RNA测序分析工具，并展示其在癌症研究中的应用	单细胞RNA测序数据和肝癌肿瘤细胞	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA
324	2024-08-08	Myeloid cell reprogramming alleviates immunosuppression and promotes clearance of metastatic lesions 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1039993 PMID:36479083	研究论文	研究通过静脉注射无药物的聚合物纳米颗粒（NPs）来重编程骨髓细胞，以减轻免疫抑制并促进清除转移性病变	使用无药物的聚合物纳米颗粒重编程骨髓细胞，改变其表型和功能，从而影响肿瘤微环境	研究仅在4T1小鼠模型中进行，需要进一步在其他模型和临床试验中验证	探索通过纳米颗粒重编程骨髓细胞以减轻免疫抑制并促进肿瘤清除的方法	骨髓细胞、纳米颗粒、转移性乳腺癌模型	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了4T1小鼠模型，具体样本数量未明确
325	2024-08-08	Identification of immune cell function in breast cancer by integrating multiple single-cell data 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1058239 PMID:36479102	研究论文	本研究通过整合两个公开的乳腺癌单细胞RNA测序数据集，探讨了肿瘤微环境中不同类型免疫细胞的功能	本研究利用单细胞RNA测序技术，全面评估了细胞间的异质性，并揭示了不同细胞类型的基因表达状态	由于样本大小和测序深度的影响，不同细胞类型在乳腺癌中的基因特异性无法完全揭示	旨在识别对乳腺癌免疫微环境至关重要的细胞类型特异性基因，以促进乳腺癌治疗	研究对象包括乳腺癌中的B细胞、T细胞和巨噬细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	整合了两个公开的乳腺癌scRNA-seq数据集
326	2024-08-08	Optimization of chondrocyte isolation from human articular cartilage to preserve the chondrocyte transcriptome 2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2022.1046127 PMID:36479429	研究论文	本文优化了从人类关节软骨中分离软骨细胞的程序，以最大限度地保留软骨细胞的转录组	研究引入了在低氧条件下立即处理软骨组织和使用不同浓度的胶原酶II以及Actinomycin D来稳定转录组的方法	NA	优化从人类关节软骨中分离软骨细胞的程序，以保留软骨细胞的转录组	人类关节软骨中的软骨细胞	NA	骨关节炎	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自骨关节炎患者的软骨组织
327	2024-08-08	Anesthesia and developing brain: What have we learned from recent studies 2022, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fnmol.2022.1017578 PMID:36479527	综述	本文综述了近年来关于麻醉对发育中大脑影响的研究进展，提供了保护不成熟大脑的有用建议和潜在治疗靶点	结合单细胞测序技术筛选非人灵长类动物中的差异基因表达，并在啮齿类动物中进行验证	啮齿类模型中的机制是否具有临床相关性仍不明确，且使用非人灵长类动物模型的研究机构较少	探讨麻醉对发育中大脑的神经毒性影响及其机制，并寻找新的解决方案	发育中的大脑	NA	NA	单细胞测序技术	NA	基因表达数据	NA
328	2024-08-08	Immune and non-immune cell subtypes identify novel targets for prognostic and therapeutic strategy: A study based on intratumoral heterogenicity analysis of multicenter scRNA-seq datasets in lung adenocarcinoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1046121 PMID:36483553	研究论文	本研究基于多中心单细胞RNA测序数据集，分析了肺腺癌中的肿瘤内异质性，识别了免疫和非免疫细胞亚型，并揭示了潜在的预后和治疗靶点	利用单细胞RNA测序技术，系统分析了肺腺癌的多中心数据集，识别了15种主要细胞类型和57个细胞亚群，并发现了多种潜在的生物标志物	NA	旨在通过分析肺腺癌的肿瘤内异质性，识别新的预后和治疗靶点，以改善临床治疗效果	肺腺癌中的免疫和非免疫细胞亚型	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	多中心数据集
329	2024-08-08	Single-cell RNA sequence presents atlas analysis for chondrocytes in the talus and reveals the potential mechanism in coping with mechanical stress 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.1047119 PMID:36438550	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术对健康距骨软骨细胞进行图谱分析，并揭示了软骨细胞应对机械应力的潜在机制	本研究首次对健康距骨软骨细胞进行了单细胞RNA测序图谱分析，并发现了两种新的软骨细胞亚群MirCs和SpCs	研究样本仅来自五名志愿者，可能影响结果的普遍性	旨在深入了解软骨细胞的功能，并为疾病治疗提供潜在的治疗靶点	距骨软骨细胞及其在机械应力下的功能	数字病理学	骨关节炎	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	五名健康志愿者的距骨软骨组织
330	2024-08-08	The single-cell expression profile of transposable elements and transcription factors in human early biparental and uniparental embryonic development 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.1020490 PMID:36438554	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据，综合分析了人类早期双亲和单亲胚胎发育中转座元件（TEs）和转录因子（TFs）的表达模式	首次系统地研究了正常和异常人类胚胎发育中TEs和TFs的相互作用	NA	探讨转座元件和转录因子在人类早期胚胎发育中的表达模式及其相互作用	人类早期双亲和单亲胚胎中的转座元件和转录因子	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	双亲和单亲胚胎样本
331	2024-08-08	Identification and validation of a signature based on macrophage cell marker genes to predict recurrent miscarriage by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1053819 PMID:36439123	研究论文	本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，鉴定并验证了基于巨噬细胞标记基因的特征，用于预测复发性流产	首次结合单细胞和批量RNA测序数据，识别出与复发性流产密切相关的七个核心基因，并构建了预测模型	样本量相对较小，需要进一步的大规模验证	寻找复发性流产的有效诊断标记和治疗靶点	复发性流产患者的蜕膜和绒毛组织	NA	复发性流产	RNA测序	LASSO, Random Forest, SVM-RFE	RNA	16个蜕膜和绒毛组织样本，包括5个正常患者和3个复发性流产患者
332	2024-08-08	Integrating RNA-seq and scRNA-seq to explore the biological significance of NAD + metabolism-related genes in the initial diagnosis and relapse of childhood B-cell acute lymphoblastic leukemia 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1043111 PMID:36439178	研究论文	本研究通过整合RNA-seq和scRNA-seq数据，探讨了NAD+代谢相关基因在儿童B细胞急性淋巴细胞白血病初诊和复发中的生物学意义	首次通过机器学习方法识别出NADSYN1、SIRT3和PARP6作为B-ALL的生物标志物，并揭示了这些标志物在单细胞水平上的作用机制	NA	探索NAD+代谢相关基因在儿童B细胞急性淋巴细胞白血病初诊和复发中的生物学意义及其作用机制	儿童B细胞急性淋巴细胞白血病患者的NAD+代谢相关基因	数字病理学	白血病	RNA-seq, scRNA-seq	随机森林算法	转录组数据, 单细胞测序数据	GSE3912和GSE130116数据集中的B-ALL患者样本
333	2024-08-08	Heparin binding epidermal growth factor-like growth factor is a prognostic marker correlated with levels of macrophages infiltrated in lung adenocarcinoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.963896 PMID:36439487	研究论文	本文探讨了肝素结合表皮生长因子样生长因子（HB-EGF）在肺腺癌中的表达及其与肿瘤微环境中免疫细胞浸润的关系	首次揭示了HB-EGF在肺腺癌中作为潜在的预后标志物和治疗靶点的作用	研究主要基于公共数据库和单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏倚	研究HB-EGF在肺腺癌中的表达及其与免疫细胞浸润的相关性	肺腺癌患者及肿瘤微环境中的免疫细胞	数字病理学	肺腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	使用TCGA数据库和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据，具体样本数量未详细说明
334	2024-08-08	A ferroptosis-related gene signature associated with immune landscape and therapeutic response in osteosarcoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1024915 PMID:36439512	研究论文	本研究探讨了铁死亡相关基因在骨肉瘤中的表达及其对患者预后和治疗策略的影响	构建了一个包含8个铁死亡调控因子的预后标志物，能有效预测骨肉瘤患者的免疫景观、预后及化疗放疗策略	NA	阐明铁死亡调控因子在骨肉瘤中的潜在价值，预测患者的预后和治疗策略	骨肉瘤患者的铁死亡调控因子表达及其预后价值	数字病理学	骨肉瘤	基因集变异分析（GSVA），单样本基因集富集分析（ssGSEA），ESTIMATE算法，单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
335	2024-08-08	Single-cell RNA-sequencing and microarray analyses to explore the pathological mechanisms of chronic thromboembolic pulmonary hypertension 2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2022.900353 PMID:36440052	研究论文	本研究利用基因芯片和单细胞RNA测序技术探索慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）的病理机制	首次通过基因芯片和单细胞RNA测序数据分析了CTEPH进展过程中的关键mRNAs、miRNAs和circRNAs及其可能的调控关系	NA	探索慢性血栓栓塞性肺动脉高压的病理机制	CTEPH患者的周围血样和肺动脉内膜切除组织	数字病理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因芯片	NA	mRNA表达谱、miRNA芯片、circRNA芯片	5名CTEPH患者和5名健康对照者的周围血样，以及5名CTEPH患者的肺动脉内膜切除组织
336	2024-08-08	Complex interaction and heterogeneity among cancer stem cells in head and neck squamous cell carcinoma revealed by single-cell sequencing 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1050951 PMID:36451812	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了头颈鳞状细胞癌中癌症干细胞的复杂相互作用和异质性及其对肿瘤微环境形成的影响	本研究首次详细描述了头颈鳞状细胞癌中癌症干细胞的转录组图谱，揭示了其功能多样性和在肿瘤进展中的关键作用	研究仅基于公共数据库中的20个头颈鳞状细胞癌组织样本，可能无法完全代表所有病例	确定头颈鳞状细胞癌中癌症干细胞的异质性及其对肿瘤微环境形成的影响	头颈鳞状细胞癌中的癌症干细胞	数字病理学	头颈鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	20个头颈鳞状细胞癌组织样本
337	2024-08-08	Construction of a novel choline metabolism-related signature to predict prognosis, immune landscape, and chemotherapy response in colon adenocarcinoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1038927 PMID:36451813	研究论文	本文构建了一种新的胆碱代谢相关特征，用于预测结肠腺癌的预后、免疫景观和化疗反应	首次构建了胆碱代谢相关特征，并验证了其在预测结肠腺癌患者预后、免疫微环境和化疗反应中的应用价值	NA	研究胆碱代谢相关特征在结肠腺癌中的预后预测、免疫微环境和化疗反应中的应用	结肠腺癌患者的预后、免疫微环境和化疗反应	数字病理学	结肠腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	训练集为TCGA-COAD，验证集为GSE17536
338	2024-08-08	Self-assembly of X-shaped antibody to combine the activity of IgG and IgA for enhanced tumor killing 2022, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.74903 PMID:36451853	研究论文	本文开发了一种基于分子自组装原理的X形抗体（X-body），结合了IgG和IgA的活性，有效招募和激活NK细胞、巨噬细胞和中性粒细胞以杀死肿瘤细胞	X-body结合了IgG和IgA的活性，能够有效招募和激活多种免疫细胞，提高肿瘤杀伤效果	NA	开发一种新的肿瘤靶向治疗策略	X形抗体（X-body）及其在肿瘤治疗中的应用	NA	肿瘤	表面等离子体共振、负染色透射电子显微镜、单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	细胞	多个同基因小鼠模型中的肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞
339	2024-08-08	Pueraria lobata Potentially Treating Prostate Cancer on Single-Cell Level by Network Pharmacology and AutoDock: Clinical Findings and Drug Targets 2022, Computational and mathematical methods in medicine DOI:10.1155/2022/3758219 PMID:36452480	研究论文	本研究通过网络药理学和AutoDock技术，探讨了葛根（Pueraria lobata）在单细胞水平上治疗前列腺癌（PCa）的潜在机制	构建了葛根在前列腺癌单细胞水平的药物-活性成分-靶点通路网络，揭示了其通过调节多个生物过程和相关信号通路来干预前列腺癌的发生和发展	NA	探索和改进前列腺癌的新治疗模式	前列腺癌的单细胞序列和葛根的活性成分及靶点	数字病理学	前列腺癌	分子对接	NA	基因表达数据	NA
340	2024-08-08	Corrigendum: Single-cell transcriptomics reveals the complexity of the tumor microenvironment of treatment-naive osteosarcoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1077067 PMID:36457508	correction	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA