单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses reveal a prognostic signature of cancer-associated fibroblasts in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1028469
PMID:36568368
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示了头颈鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的预后标志 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并构建了基于4个基因的预后标志 | 研究样本来源于公共数据库，可能存在一定的数据偏差；预后标志的临床应用需要进一步的临床试验验证 | 识别头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并探讨其在分子特征、免疫特征及免疫治疗和化疗中的潜在作用 | 头颈鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 样本来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库，具体数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-08-08 |
TP53-related signature for predicting prognosis and tumor microenvironment characteristics in bladder cancer: A multi-omics study
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1057302
PMID:36568387
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研究论文 | 本研究探讨了TP53基因突变在膀胱癌中的作用，构建了一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和肿瘤微环境特征。 | 本研究首次构建了基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应，并通过多种组学方法深入分析了TP53活性与肿瘤微环境的关系。 | 本研究主要基于多组学数据进行分析，未来需要更多的临床验证来证实该特征的可靠性和实用性。 | 探索TP53突变在膀胱癌中的作用，构建一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应。 | 膀胱癌患者，特别是TP53突变对肿瘤微环境和预后的影响。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、单细胞质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-08-08 |
Autologous cord blood mononuclear cell infusion for the prevention of bronchopulmonary dysplasia in very preterm monozygotic twins: A study protocol for a randomized, placebo-controlled, double-blinded multicenter trial
2022, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2022.884366
PMID:36568414
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研究论文 | 本研究旨在评估自体脐带血单个核细胞输注预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良的效果，并探讨其保护机制 | 这是首个随机、安慰剂对照、双盲的多中心试验，用于评估自体脐带血单个核细胞输注在预防同卵双胞胎早产儿支气管肺发育不良中的疗效 | 遗传异质性可能降低对照组和干预组之间的可比性，尤其是在小样本试验中 | 研究自体脐带血单个核细胞输注在预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良中的效果及其保护机制 | 极早产（小于32周妊娠）的同卵双胞胎新生儿 | NA | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 60对同卵双胞胎早产新生儿 | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-08-08 |
Pyruvate: Ferredoxin oxidoreductase is involved in IgA-related microbiota dysbiosis and intestinal inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040774
PMID:36569858
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸脱氢酶：铁氧还蛋白氧化还原酶（PFOR）在免疫球蛋白A（IgA）相关微生物失调和肠道炎症中的作用 | 首次发现PFOR作为IgA结合抗原，可能参与宿主与微生物的相互作用 | NA | 研究PFOR在炎症性肠病（IBD）中的作用及其对宿主-微生物相互作用的影响 | 炎症性肠病患者、兔子模型以及PFOR蛋白 | NA | 炎症性肠病 | 16S rDNA测序、酶联免疫吸附试验（ELISA）、蛋白质印迹、质谱分析、单细胞测序 | NA | 微生物群落数据、免疫球蛋白A数据、蛋白质数据 | 炎症性肠病患者样本、兔子模型 | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-08-08 |
Identification of B cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic model and identify immune infiltration in osteosarcoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1026701
PMID:36569871
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序结果，识别B细胞标记基因，并建立预测骨肉瘤预后的模型，同时分析免疫浸润差异。 | 首次通过单细胞测序技术识别B细胞标记基因，并建立了一个具有良好预测性能的骨肉瘤预后模型。 | NA | 探讨B细胞在骨肉瘤预后和免疫浸润中的作用。 | B细胞标记基因、骨肉瘤预后模型及免疫浸润差异。 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 261个B细胞标记基因 | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptome analysis of the tumor ecosystems underlying cervical cancer metastasis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.966291
PMID:36569924
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的转录组特征，揭示了宫颈癌淋巴结转移的分子机制 | 首次详细描述了宫颈癌淋巴结转移中上皮细胞和肿瘤微环境的转录组变化，特别是细胞周期、免疫反应相关信号通路和癌症相关成纤维细胞的作用 | 研究仅限于转录组分析，未涉及更深层次的分子机制或其他类型的生物标志物 | 探究宫颈癌淋巴结转移的分子机制 | 宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的单细胞转录组 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 51,507个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-08-08 |
Dupilumab improves clinical symptoms in children with Netherton syndrome by suppressing Th2-mediated inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1054422
PMID:36569942
|
研究论文 | 本文评估了dupilumab（一种IL-4Rα拮抗剂）在Netherton综合征患儿中的临床反应，并研究了Th1/2/17通路活性和皮肤屏障缺陷蛋白LEKTI表达的变化。 | 首次评估了dupilumab在Netherton综合征患儿中的疗效，并详细分析了其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。 | 研究样本量较小，仅包括四名患儿，且未观察到LEKTI蛋白表达的显著变化。 | 评估dupilumab在Netherton综合征患儿中的临床效果，并探讨其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。 | 四名患有严重Netherton综合征的儿童。 | NA | Netherton综合征 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组化分析 | NA | 血液，皮肤组织 | 4名患儿 | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-08 |
The single-cell landscape of cystic echinococcosis in different stages provided insights into endothelial and immune cell heterogeneity
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1067338
PMID:36569953
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了不同阶段细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞，揭示了疾病进展中的免疫细胞和内皮细胞异质性 | 首次发现具有感染阶段特异性的SPP1+巨噬细胞，并深入探讨了其在晚期感染阶段与血管生成和免疫逃避机制的关系 | NA | 探究细粒棘球蚴病生态系统，特别是晚期感染阶段的血管生成和免疫逃避机制 | 细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 45,199个细胞，来自感染1、3、6个月及未感染的野生型小鼠肝脏样本（两份重复） | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-08-08 |
OPA1 supports mitochondrial dynamics and immune evasion to CD8+ T cell in lung adenocarcinoma
2022, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.14543
PMID:36573240
|
研究论文 | 本研究探讨了OPA1在非小细胞肺癌细胞中线粒体融合和免疫逃逸中的作用 | 发现OPA1和MFN1的拷贝数扩增在肺癌组织中高度共现，并且OPA1的高表达与不良预后相关 | NA | 研究OPA1在非小细胞肺癌中的作用及其分子机制 | OPA1在非小细胞肺癌细胞中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 肺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-08-08 |
A high-efficiency PEG-Ca2+-mediated transient transformation system for broccoli protoplasts
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.1081321
PMID:36578340
|
研究论文 | 本研究通过优化质粒浓度、PEG4000质量浓度和基因型选择等关键因素，建立了一种高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，并建立了高效通用的西兰花原生质体分离系统。 | 本研究建立了高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，能够可靠地获得高活性的原生质体，为国际前沿研究领域如单细胞测序、空间转录组学、植物体细胞杂交、基因功能分析和亚细胞定位提供了重要的技术支持。 | NA | 研究基因功能、亚细胞定位和植物形态发育。 | 西兰花原生质体。 | 植物学 | NA | 瞬时转化技术 | NA | 原生质体 | 使用三种不同基因型的西兰花子叶，原生质体产量超过5×10/mL/g，活性超过95%。 | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-08-08 |
Mechanisms of Panax Ginseng on Treating Sepsis by RNA-Seq Technology
2022, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S393654
PMID:36582454
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研究论文 | 本研究利用网络药理学和RNA-seq技术探讨人参治疗脓毒症的潜在活性靶点和机制 | 通过RNA-seq分析和网络药理学方法，首次揭示了人参中的特定成分如何通过调节关键基因的表达来影响脓毒症的治疗 | 研究主要基于数据库分析和RNA-seq数据，未来需要更多的临床试验来验证这些发现 | 探索人参在治疗脓毒症中的作用机制 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血 | NA | 脓毒症 | RNA-seq | NA | RNA | 4521个与脓毒症相关的基因，86个人参活性成分及其294个活性靶点 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-08-08 |
Identification of PTPN22 as a potential genetic biomarker for abdominal aortic aneurysm
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.1061771
PMID:36588574
|
研究论文 | 本文通过综合生物信息学和细胞模型验证，揭示了PTPN22基因作为腹主动脉瘤潜在的遗传生物标志物 | 首次发现PTPN22基因在腹主动脉瘤患者中的表达上调，并验证了其在细胞模型中的表达增加 | 研究仅限于临床样本和细胞模型，未涉及更大规模的人群验证 | 识别腹主动脉瘤的遗传生物标志物，以预测高风险人群 | PTPN22基因及其在腹主动脉瘤中的表达 | 遗传学 | 腹主动脉瘤 | 综合生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自腹主动脉瘤患者的主动脉组织和外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-08-08 |
Potential biomarkers and immune cell infiltration involved in aortic valve calcification identified through integrated bioinformatics analysis
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.944551
PMID:36589450
|
研究论文 | 通过综合生物信息学分析，识别与主动脉瓣钙化相关的潜在生物标志物和免疫细胞浸润 | 识别了SCG2和CCL19作为主动脉瓣钙化的新型潜在生物标志物，并探讨了它们与免疫细胞类型的关系 | NA | 深入理解主动脉瓣钙化的发病机制，并为未来的诊断和免疫治疗提供有价值的信息 | 主动脉瓣钙化疾病及其潜在的生物标志物和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 机器学习算法（LASSO和SVM-RFE），CIBERSORT算法 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据，免疫组织化学染色数据 | 使用了三个公开的基因表达数据集（GSE12644，GSE51472，GSE77287）和一个外部数据集（GSE83453），以及单细胞测序数据集（SRP222100）和人类临床组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-08-08 |
Cell Differentiation Trajectory Predicts Prognosis and Immunotherapeutic Response in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2022/8422339
PMID:36530957
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探索了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞的分化状态及其在预后和免疫治疗反应中的意义 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析鉴定了ccRCC细胞中的不同分化状态和分化相关基因（DRGs），并结合机器学习构建了预后风险模型 | NA | 研究ccRCC细胞的分化状态对预后和免疫治疗反应的影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA序列数据 | 涉及83种化合物或抑制剂的响应差异分析 | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-08-08 |
A mitochondria-related signature for predicting immune microenvironment and therapeutic response in osteosarcoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1085065
PMID:36531021
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研究论文 | 本文构建了一个与线粒体相关的特征，用于预测骨肉瘤中的免疫微环境和治疗反应 | 首次在骨肉瘤中建立了一个与线粒体相关的特征，用于综合评估线粒体在骨肉瘤中的致病和调节作用 | NA | 开发一个与线粒体相关的特征，以预测骨肉瘤中的免疫微环境、化疗药物和预后 | 骨肉瘤患者的线粒体相关特征及其在免疫微环境和治疗反应中的预测价值 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的骨肉瘤样本的转录组数据和临床信息 | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-08-08 |
The new ceRNA crosstalk between mRNAs and miRNAs in intervertebral disc degeneration
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1083983
PMID:36531954
|
研究论文 | 本研究旨在从多维度转录组学角度揭示椎间盘退变的发病分子机制 | 本研究通过分析公共数据库中的转录组数据，发现了与椎间盘退变相关的新的竞争性内源RNA（ceRNA）网络，并识别了关键基因 | NA | 揭示椎间盘退变的发病分子机制，寻找有效的诊断生物标志物和新的治疗策略 | 椎间盘退变相关的mRNA和microRNA表达谱 | 数字病理学 | 脊椎疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及两个批量数据集（GSE67567和GSE167199）和一个单细胞RNA测序数据集（GSE199866） | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-08 |
Junctional adhesion molecule-A is dispensable for myeloid cell recruitment and diversification in the tumor microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1003975
PMID:36531986
|
研究论文 | 研究探讨了连接粘附分子-A（JAM-A）在肿瘤微环境中对骨髓细胞招募和多样化的作用 | 发现肿瘤可以绕过JAM-A对骨髓细胞招募和重编程的需求 | NA | 探究JAM-A在肿瘤微环境中对骨髓细胞功能的影响 | 连接粘附分子-A（JAM-A）及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用骨髓特异性JAM-A缺陷小鼠进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-08-08 |
Krebs von den lungen-6 as a clinical marker for hypersensitivity pneumonitis: A meta-analysis and bioinformatics analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1041098
PMID:36532009
|
meta-analysis | 本研究通过meta分析和生物信息学分析探讨了Krebs von den lungen-6（KL-6）在不同类型超敏性肺炎（HP）中的浓度变化 | 本研究首次通过meta分析和生物信息学分析综合评估了KL-6在HP患者和健康对照中的表达差异 | NA | 阐明KL-6在不同类型超敏性肺炎中的浓度变化 | 超敏性肺炎患者和健康对照的KL-6浓度 | NA | 超敏性肺炎 | meta分析, 生物信息学分析 | NA | mRNA表达数据 | 20项研究 | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-08 |
Dysfunction of CCR1+ decidual macrophages is a potential risk factor in the occurrence of unexplained recurrent pregnancy loss
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1045532
PMID:36532057
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据和临床样本的功能实验，发现CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的作用 | 首次揭示了CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的关键作用，并阐明了其免疫抑制和迁移调控特性 | NA | 探讨不明原因反复流产的潜在风险因素 | CCR1+基质巨噬细胞及其在不明原因反复流产中的作用 | NA | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 涉及正常早期妊娠和不明原因反复流产患者的基质样本 | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-08 |
Aberrant metabolic processes promote the immunosuppressive microenvironment in multiple myeloma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1077768
PMID:36532059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性骨髓瘤骨髓中免疫细胞的动态特征，并探讨了异常代谢过程对免疫抑制微环境的影响。 | 发现异常代谢过程与多发性骨髓瘤患者免疫抑制微环境的关联，并提出PIM激酶作为潜在的免疫治疗策略。 | NA | 探讨多发性骨髓瘤中免疫细胞功能障碍的分子机制及其与异常代谢过程的关系。 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫细胞及其代谢特征。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |