单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-08 |
Dupilumab improves clinical symptoms in children with Netherton syndrome by suppressing Th2-mediated inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1054422
PMID:36569942
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研究论文 | 本文评估了dupilumab（一种IL-4Rα拮抗剂）在Netherton综合征患儿中的临床反应，并研究了Th1/2/17通路活性和皮肤屏障缺陷蛋白LEKTI表达的变化。 | 首次评估了dupilumab在Netherton综合征患儿中的疗效，并详细分析了其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。 | 研究样本量较小，仅包括四名患儿，且未观察到LEKTI蛋白表达的显著变化。 | 评估dupilumab在Netherton综合征患儿中的临床效果，并探讨其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。 | 四名患有严重Netherton综合征的儿童。 | NA | Netherton综合征 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组化分析 | NA | 血液，皮肤组织 | 4名患儿 |
| 282 | 2024-08-08 |
The single-cell landscape of cystic echinococcosis in different stages provided insights into endothelial and immune cell heterogeneity
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1067338
PMID:36569953
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了不同阶段细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞，揭示了疾病进展中的免疫细胞和内皮细胞异质性 | 首次发现具有感染阶段特异性的SPP1+巨噬细胞，并深入探讨了其在晚期感染阶段与血管生成和免疫逃避机制的关系 | NA | 探究细粒棘球蚴病生态系统，特别是晚期感染阶段的血管生成和免疫逃避机制 | 细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 45,199个细胞，来自感染1、3、6个月及未感染的野生型小鼠肝脏样本（两份重复） |
| 283 | 2024-08-08 |
OPA1 supports mitochondrial dynamics and immune evasion to CD8+ T cell in lung adenocarcinoma
2022, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.14543
PMID:36573240
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研究论文 | 本研究探讨了OPA1在非小细胞肺癌细胞中线粒体融合和免疫逃逸中的作用 | 发现OPA1和MFN1的拷贝数扩增在肺癌组织中高度共现，并且OPA1的高表达与不良预后相关 | NA | 研究OPA1在非小细胞肺癌中的作用及其分子机制 | OPA1在非小细胞肺癌细胞中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 肺癌组织样本 |
| 284 | 2024-08-08 |
A high-efficiency PEG-Ca2+-mediated transient transformation system for broccoli protoplasts
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.1081321
PMID:36578340
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研究论文 | 本研究通过优化质粒浓度、PEG4000质量浓度和基因型选择等关键因素，建立了一种高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，并建立了高效通用的西兰花原生质体分离系统。 | 本研究建立了高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，能够可靠地获得高活性的原生质体，为国际前沿研究领域如单细胞测序、空间转录组学、植物体细胞杂交、基因功能分析和亚细胞定位提供了重要的技术支持。 | NA | 研究基因功能、亚细胞定位和植物形态发育。 | 西兰花原生质体。 | 植物学 | NA | 瞬时转化技术 | NA | 原生质体 | 使用三种不同基因型的西兰花子叶，原生质体产量超过5×10/mL/g，活性超过95%。 |
| 285 | 2024-08-08 |
Mechanisms of Panax Ginseng on Treating Sepsis by RNA-Seq Technology
2022, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S393654
PMID:36582454
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研究论文 | 本研究利用网络药理学和RNA-seq技术探讨人参治疗脓毒症的潜在活性靶点和机制 | 通过RNA-seq分析和网络药理学方法，首次揭示了人参中的特定成分如何通过调节关键基因的表达来影响脓毒症的治疗 | 研究主要基于数据库分析和RNA-seq数据，未来需要更多的临床试验来验证这些发现 | 探索人参在治疗脓毒症中的作用机制 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血 | NA | 脓毒症 | RNA-seq | NA | RNA | 4521个与脓毒症相关的基因，86个人参活性成分及其294个活性靶点 |
| 286 | 2024-08-08 |
Identification of PTPN22 as a potential genetic biomarker for abdominal aortic aneurysm
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.1061771
PMID:36588574
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研究论文 | 本文通过综合生物信息学和细胞模型验证，揭示了PTPN22基因作为腹主动脉瘤潜在的遗传生物标志物 | 首次发现PTPN22基因在腹主动脉瘤患者中的表达上调，并验证了其在细胞模型中的表达增加 | 研究仅限于临床样本和细胞模型，未涉及更大规模的人群验证 | 识别腹主动脉瘤的遗传生物标志物，以预测高风险人群 | PTPN22基因及其在腹主动脉瘤中的表达 | 遗传学 | 腹主动脉瘤 | 综合生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自腹主动脉瘤患者的主动脉组织和外周血单个核细胞 |
| 287 | 2024-08-08 |
Potential biomarkers and immune cell infiltration involved in aortic valve calcification identified through integrated bioinformatics analysis
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.944551
PMID:36589450
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研究论文 | 通过综合生物信息学分析，识别与主动脉瓣钙化相关的潜在生物标志物和免疫细胞浸润 | 识别了SCG2和CCL19作为主动脉瓣钙化的新型潜在生物标志物，并探讨了它们与免疫细胞类型的关系 | NA | 深入理解主动脉瓣钙化的发病机制，并为未来的诊断和免疫治疗提供有价值的信息 | 主动脉瓣钙化疾病及其潜在的生物标志物和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 机器学习算法（LASSO和SVM-RFE），CIBERSORT算法 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据，免疫组织化学染色数据 | 使用了三个公开的基因表达数据集（GSE12644，GSE51472，GSE77287）和一个外部数据集（GSE83453），以及单细胞测序数据集（SRP222100）和人类临床组织样本 |
| 288 | 2024-08-08 |
Cell Differentiation Trajectory Predicts Prognosis and Immunotherapeutic Response in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2022/8422339
PMID:36530957
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探索了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞的分化状态及其在预后和免疫治疗反应中的意义 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析鉴定了ccRCC细胞中的不同分化状态和分化相关基因（DRGs），并结合机器学习构建了预后风险模型 | NA | 研究ccRCC细胞的分化状态对预后和免疫治疗反应的影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA序列数据 | 涉及83种化合物或抑制剂的响应差异分析 |
| 289 | 2024-08-08 |
A mitochondria-related signature for predicting immune microenvironment and therapeutic response in osteosarcoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1085065
PMID:36531021
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研究论文 | 本文构建了一个与线粒体相关的特征，用于预测骨肉瘤中的免疫微环境和治疗反应 | 首次在骨肉瘤中建立了一个与线粒体相关的特征，用于综合评估线粒体在骨肉瘤中的致病和调节作用 | NA | 开发一个与线粒体相关的特征，以预测骨肉瘤中的免疫微环境、化疗药物和预后 | 骨肉瘤患者的线粒体相关特征及其在免疫微环境和治疗反应中的预测价值 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的骨肉瘤样本的转录组数据和临床信息 |
| 290 | 2024-08-08 |
The new ceRNA crosstalk between mRNAs and miRNAs in intervertebral disc degeneration
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1083983
PMID:36531954
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研究论文 | 本研究旨在从多维度转录组学角度揭示椎间盘退变的发病分子机制 | 本研究通过分析公共数据库中的转录组数据，发现了与椎间盘退变相关的新的竞争性内源RNA（ceRNA）网络，并识别了关键基因 | NA | 揭示椎间盘退变的发病分子机制，寻找有效的诊断生物标志物和新的治疗策略 | 椎间盘退变相关的mRNA和microRNA表达谱 | 数字病理学 | 脊椎疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及两个批量数据集（GSE67567和GSE167199）和一个单细胞RNA测序数据集（GSE199866） |
| 291 | 2024-08-08 |
Junctional adhesion molecule-A is dispensable for myeloid cell recruitment and diversification in the tumor microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1003975
PMID:36531986
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研究论文 | 研究探讨了连接粘附分子-A（JAM-A）在肿瘤微环境中对骨髓细胞招募和多样化的作用 | 发现肿瘤可以绕过JAM-A对骨髓细胞招募和重编程的需求 | NA | 探究JAM-A在肿瘤微环境中对骨髓细胞功能的影响 | 连接粘附分子-A（JAM-A）及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用骨髓特异性JAM-A缺陷小鼠进行研究 |
| 292 | 2024-08-08 |
Krebs von den lungen-6 as a clinical marker for hypersensitivity pneumonitis: A meta-analysis and bioinformatics analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1041098
PMID:36532009
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meta-analysis | 本研究通过meta分析和生物信息学分析探讨了Krebs von den lungen-6（KL-6）在不同类型超敏性肺炎（HP）中的浓度变化 | 本研究首次通过meta分析和生物信息学分析综合评估了KL-6在HP患者和健康对照中的表达差异 | NA | 阐明KL-6在不同类型超敏性肺炎中的浓度变化 | 超敏性肺炎患者和健康对照的KL-6浓度 | NA | 超敏性肺炎 | meta分析, 生物信息学分析 | NA | mRNA表达数据 | 20项研究 |
| 293 | 2024-08-08 |
Dysfunction of CCR1+ decidual macrophages is a potential risk factor in the occurrence of unexplained recurrent pregnancy loss
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1045532
PMID:36532057
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据和临床样本的功能实验，发现CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的作用 | 首次揭示了CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的关键作用，并阐明了其免疫抑制和迁移调控特性 | NA | 探讨不明原因反复流产的潜在风险因素 | CCR1+基质巨噬细胞及其在不明原因反复流产中的作用 | NA | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 涉及正常早期妊娠和不明原因反复流产患者的基质样本 |
| 294 | 2024-08-08 |
Aberrant metabolic processes promote the immunosuppressive microenvironment in multiple myeloma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1077768
PMID:36532059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性骨髓瘤骨髓中免疫细胞的动态特征，并探讨了异常代谢过程对免疫抑制微环境的影响。 | 发现异常代谢过程与多发性骨髓瘤患者免疫抑制微环境的关联，并提出PIM激酶作为潜在的免疫治疗策略。 | NA | 探讨多发性骨髓瘤中免疫细胞功能障碍的分子机制及其与异常代谢过程的关系。 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫细胞及其代谢特征。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 295 | 2024-08-08 |
SFRP4+IGFBP5hi NKT cells induced neural-like cell differentiation to contribute to adenomyosis pain
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.945504
PMID:36532077
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了有痛和无痛的子宫内膜异位症组织细胞样本，发现SFRP4+NKT细胞和大量未分化的多能干细胞在疼痛组中，并揭示了SFRP4+NKT细胞中IGFBP5高表达促进多能干细胞向神经样细胞分化的机制。 | 首次发现SFRP4+IGFBP5hi NKT细胞能够促进多能干细胞向神经样细胞分化，从而参与子宫内膜异位症疼痛的发生。 | NA | 探讨SFRP4+IGFBP5hi NKT细胞在子宫内膜异位症疼痛中的作用及其机制。 | 子宫内膜异位症患者的组织细胞样本。 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 有痛和无痛的子宫内膜异位症组织细胞样本 |
| 296 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the Müller subtypes and inner blood-retinal barrier regulatory network in early diabetic retinopathy
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1048634
PMID:36533134
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康和链脲佐菌素诱导的糖尿病大鼠视网膜中的35,910个细胞，重点关注糖尿病视网膜病变中构成大鼠血视网膜屏障的主要细胞的退化以及Müller细胞的两个亚群的新定义。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病视网膜病变早期血视网膜屏障的Müller亚型及其调控网络。 | 研究仅限于大鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 阐明糖尿病视网膜病变早期血视网膜屏障的细胞退化及其调控关系。 | 健康和糖尿病大鼠视网膜中的细胞。 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 35,910个细胞 |
| 297 | 2024-08-08 |
State-of-the-art analytical methods of viral infections in human lung organoids
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0276115
PMID:36538516
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研究论文 | 本文提供了一套详细的实验操作指南，用于研究SARS-CoV-2在人肺泡样类器官中的感染过程及其影响 | 本文介绍了多种先进的分析方法，包括蛋白质提取、RNA提取、单细胞RNA测序等，以评估病毒感染的影响和宿主因子的作用 | NA | 研究SARS-CoV-2在人肺泡样类器官中的感染特性和宿主反应 | 人肺泡样类器官和SARS-CoV-2病毒 | 数字病理学 | COVID-19 | qPCR, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 原位杂交 | NA | 蛋白质, RNA, 细胞 | 基于不同供体的人肺泡样类器官 |
| 298 | 2024-08-08 |
Sci-Seq of Human Fetal Salivary Tissue Introduces Human Transcriptional Paradigms and a Novel Cell Population
2022, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2022.887057
PMID:36540608
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研究论文 | 本研究通过分析人类胎儿唾液腺的单细胞测序数据，识别了发育分支点、新型干细胞样群体及关键信号通路 | 发现了先前未描述的来源于SD并表达高水平干细胞样功能基因的干细胞样细胞群体 | NA | 探索人类唾液腺发育的新型人类特异性发育范式，并为开发转化性人类疗法奠定基础 | 人类胎儿唾液腺的发育及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 299 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cell type-specific immune regulation associated with anti-NMDA receptor encephalitis in humans
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1075675
PMID:36544777
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了抗NMDA受体脑炎患者和健康个体的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型特异性的免疫调控机制 | 首次通过单细胞转录组测序技术，详细描述了抗NMDA受体脑炎患者外周免疫细胞的转录特征和免疫反应 | NA | 探究抗NMDA受体脑炎患者外周免疫细胞的特异性免疫调控机制 | 抗NMDA受体脑炎患者和健康个体的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 129,217个细胞 |
| 300 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of WGCNA and machine learning identified diagnostic biomarkers in dilated cardiomyopathy with heart failure
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1089915
PMID:36544902
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研究论文 | 本研究通过综合分析WGCNA和机器学习方法，识别出扩张型心肌病合并心力衰竭的诊断生物标志物 | 首次通过WGCNA和机器学习方法结合，从多个基因表达数据集中识别出与扩张型心肌病合并心力衰竭高度相关的驱动基因，并构建了有效的诊断模型 | 研究主要基于公共数据库中的基因表达数据，未涉及临床样本的直接验证 | 探索扩张型心肌病合并心力衰竭的特定诊断生物标志物及其机制 | 扩张型心肌病合并心力衰竭的诊断生物标志物和发病机制 | 机器学习 | 心血管疾病 | WGCNA, 单细胞RNA测序 | 随机森林, 梯度提升机, 神经网络, 极限梯度提升, 支持向量机 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 训练组包括GSE29819和GSE21610数据集，测试组为GSE17800数据集，单细胞RNA测序数据为GSE95140 |