单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
261	2024-08-08	Inferring cell developmental stage-specific lncRNA regulation in the developing human neocortex with CDSlncR 2022, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fnmol.2022.1037565 PMID:36710930	研究论文	本文提出了一种名为CDSlncR的新型计算方法，用于推断人类新皮质发育中特定细胞发育阶段的lncRNA调控	CDSlncR结合了潜在的lncRNA-目标结合信息与单细胞转录组数据，以推断特定细胞发育阶段的lncRNA调控	先前的批量数据驱动方法主要限于探索所有细胞的lncRNA调控，而不是特定于细胞发育阶段的lncRNA调控	研究特定细胞发育阶段的lncRNA调控	人类新皮质发育中的lncRNA调控	生物信息学	自闭症谱系障碍	单细胞测序	CDSlncR	转录组数据	涉及人类新皮质不同发育阶段的单细胞转录组数据
262	2024-08-08	A pan-cancer and single-cell sequencing analysis of CD161, a promising onco-immunological biomarker in tumor microenvironment and immunotherapy 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1040289 PMID:36660546	研究论文	本研究通过泛癌和单细胞测序分析，探讨了CD161作为肿瘤微环境和免疫治疗中的有前景的肿瘤免疫生物标志物的角色。	首次通过单细胞测序分析了CD161在多种肿瘤类型中的表达模式，并揭示了其在肿瘤进展和T细胞免疫中的关键作用。	研究主要集中在CD161的表达和功能分析，未涉及其在临床治疗中的具体应用效果。	探讨CD161在肿瘤微环境和免疫治疗中的作用，评估其作为肿瘤免疫治疗靶点的潜力。	CD161在多种癌症中的表达、突变图谱、CNVs和SNVs变异、通路富集、药物敏感性以及与T细胞和巨噬细胞的相互作用。	数字病理学	NA	单细胞测序	NA	图像	涉及多种肿瘤类型的癌细胞和T细胞
263	2024-08-08	Single-cell transcriptome reveals diversity of Müller cells with different metabolic-mitochondrial signatures in normal and degenerated macula 2022, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fnins.2022.1079498 PMID:36620436	研究论文	本研究通过整合早期年龄相关性黄斑变性（AMD）患者和健康捐赠者的单细胞转录组数据，揭示了具有不同代谢-线粒体特征的穆勒细胞亚群	本研究首次展示了早期AMD中穆勒细胞亚群的变化主要是亚群丰度的改变，而非新亚群的产生，并通过转录因子富集分析强调了代谢-线粒体状态的关键调节因子	NA	揭示早期年龄相关性黄斑变性中穆勒细胞的新特征及其与视网膜神经胶质化的关联	穆勒细胞在正常和退化黄斑中的多样性及其代谢-线粒体特征	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	单细胞转录组	NA	转录组数据	早期AMD患者和健康捐赠者的样本
264	2024-08-08	Single-cell RNA-Seq identifies factors necessary for the regenerative phenotype of prostate luminal epithelial progenitors 2022, American journal of clinical and experimental urology IF:1.5Q3 PMID:36636696	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，确认了激素完整和去势小鼠前列腺中管腔前体细胞群的身份，并识别了维持前列腺器官样再生表型所需的因素。	首次使用单细胞RNA测序技术确认前列腺管腔前体细胞群的身份，并识别了维持其再生表型所需的关键因素。	研究主要集中在小鼠和人类的前列腺器官样上，未来需进一步验证这些因素在体内环境中的作用。	定义正常的前列腺前体细胞表型，并发现可能导致可药物化靶点的因果网络，以对抗前列腺增生疾病。	前列腺管腔上皮前体细胞及其再生表型。	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	包括激素完整和去势的小鼠前列腺及人类前列腺器官样。
265	2024-08-08	Appropriate level of cuproptosis may be involved in alleviating pulmonary fibrosis 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1039510 PMID:36601107	研究论文	本研究探讨了铜死亡与肺纤维化之间的关系，并发现适当的铜死亡水平可能有助于抑制肺纤维化	首次揭示铜死亡与纤维化之间的负相关关系	NA	探索铜死亡与肺纤维化之间的关系	人类和小鼠的肺纤维化单细胞测序数据	数字病理学	肺纤维化	单细胞测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	人类和小鼠的肺纤维化样本
266	2024-08-08	Obeticholic acid and 5β-cholanic acid 3 exhibit anti-tumor effects on liver cancer through CXCL16/CXCR6 pathway 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1095915 PMID:36605219	研究论文	本研究通过分析人肝细胞癌单细胞RNA测序数据，验证了CXCL16/CXCR6通路在肝癌中的抗肿瘤作用，并探讨了obeticholic acid和5β-cholanic acid 3的联合使用在此过程中的作用	首次在人体中验证了CXCL16/CXCR6通路在肝癌中的抗肿瘤作用，并发现obeticholic acid和5β-cholanic acid 3的联合使用具有显著的肿瘤抑制效果	研究主要基于单细胞RNA测序数据和动物模型，尚未在临床试验中得到验证	探讨CXCL16/CXCR6通路在肝细胞癌中的作用及潜在的免疫治疗策略	肝细胞癌及其相关细胞和分子机制	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	涉及肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据
267	2024-08-08	Necroptosis-related lncRNAs: Combination of bulk and single-cell sequencing reveals immune landscape alteration and a novel prognosis stratification approach in lung adenocarcinoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1010976 PMID:36605426	研究论文	本研究通过结合批量和单细胞测序技术，构建了一种基于坏死相关长非编码RNA风险评分（NecroLRS）和临床病理参数的预测模型，用于肺腺癌的预后分层和免疫微环境改变的研究	首次揭示了坏死相关长非编码RNA在肺腺癌预后中的作用，并提出了一种新的基于K-means聚类的分层算法，用于从单细胞角度解析坏死在肺腺癌预后中的机制	NA	探索坏死相关长非编码RNA在肺腺癌预后中的作用及其对免疫微环境的影响	肺腺癌患者的预后分层和免疫微环境改变	数字病理学	肺腺癌	批量测序和单细胞测序	K-means聚类	RNA	4个人类肺腺癌细胞系
268	2024-08-08	Single-cell profiling reveals that SAA1+ epithelial cells promote distant metastasis of esophageal squamous cell carcinoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1099271 PMID:36605443	研究论文	本研究通过单细胞测序数据分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）中SAA1+上皮细胞的新亚群，该亚群与ESCC的远处转移密切相关。	发现了ESCC中一种新的SAA1+恶性细胞亚群，该亚群具有高度侵袭性并关联ESCC的远处转移。	NA	探索ESCC肿瘤组织的异质性及寻找具有特殊生物学功能的ESCC新亚群。	食管鳞状细胞癌（ESCC）中的SAA1+上皮细胞。	数字病理学	食管癌	单细胞测序	预测模型	基因表达数据	NA
269	2024-08-08	NR4A2 may be a potential diagnostic biomarker for myocardial infarction: A comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1061800 PMID:36618351	研究论文	本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了NR4A2作为心肌梗死潜在诊断生物标志物的可能性	首次通过免疫浸润分析和疾病本体富集分析，确定了NR4A2在心肌梗死诊断中的重要价值	仅使用了一个数据集进行模型准确性测试，可能需要更多数据集验证	旨在预测和验证心肌梗死诊断的关键基因	心肌梗死及其诊断生物标志物	生物信息学	心血管疾病	单细胞测序	NA	基因表达数据	使用了GSE66360数据集，包含335个差异表达基因
270	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing to dissect the immunological network of liver fibrosis in Schistosoma japonicum-infected mice 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.980872 PMID:36618421	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术探索日本血吸虫感染小鼠肝纤维化的免疫机制	首次应用单细胞测序技术解析日本血吸虫感染小鼠肝纤维化的免疫网络	样本量较小，仅包括一只感染小鼠和一只正常小鼠	深入理解日本血吸虫感染导致的肝纤维化机制	日本血吸虫感染小鼠的肝纤维化过程	数字病理学	肝纤维化	单细胞RNA测序	NA	RNA	1只感染小鼠和1只正常小鼠
271	2024-08-08	Neurogenesis potential of oligodendrocyte precursor cells from oligospheres and injured spinal cord 2022, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2 DOI:10.3389/fncel.2022.1049562 PMID:36619671	研究论文	本研究探讨了从寡球体和受损脊髓中提取的少突胶质前体细胞（OPCs）的神经发生潜力	首次发现OPCs参与寡球体的形成，并能进一步分化为类神经细胞，以及在寡球体分化过程中检测到少突胶质细胞和神经细胞的中间状态	NA	研究OPCs在受损髓鞘再生中的神经发生潜力及其机制	少突胶质前体细胞（OPCs）及其在脊髓损伤后的分化和神经发生潜力	NA	脊髓损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq），生物信息学分析，免疫荧光染色，分子实验	NA	RNA	幼年和成年小鼠的脊髓损伤模型
272	2024-08-08	Resolving the gene expression maps of human first-trimester chorionic villi with spatial transcriptome 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.1060298 PMID:36561369	研究论文	本研究使用改进的Stereo-seq方法，对两名孕妇早期绒毛膜绒毛的空间转录组进行了分析，揭示了绒毛膜绒毛中主要细胞类型的基因表达模式及其空间定位。	本研究首次使用PFA固定的人类绒毛膜绒毛样本进行空间转录组分析，显著改善了组织形态和RNA信号的特异性。	研究样本仅来自两名孕妇，可能限制了结果的普遍性。	旨在通过空间转录组技术解析人类早期绒毛膜绒毛的基因表达图谱，以深入理解胎盘的结构和功能。	人类早期绒毛膜绒毛的基因表达及其空间分布。	数字病理学	NA	空间转录组技术	NA	空间转录组数据	两名孕妇的绒毛膜绒毛样本
273	2024-08-08	Inflammatory role of microglia in brain injury caused by subarachnoid hemorrhage 2022, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2 DOI:10.3389/fncel.2022.956185 PMID:36561497	综述	本文综述了微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的炎症作用及其最新进展	探讨了微胶质细胞通过TLR4、CaSR和TREM-1等受体介导的信号通路在脑水肿、神经元凋亡和血脑屏障破坏中的双重作用	NA	探讨微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的病理机制	微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的作用	神经科学	脑血管疾病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
274	2024-08-08	Case report: Clinical and single-cell transcriptome sequencing analysis of a mixed gangliocytoma-adenoma presenting as acromegaly 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1088803 PMID:36568175	病例报告	本文报告了一例混合性神经节细胞瘤-腺瘤（MGA）表现为肢端肥大症的28岁男性患者的临床和单细胞转录组测序分析	本病例报告详细描述了MGA手术和放疗后的唯一临床和分子报告，并通过单细胞转录组测序分析揭示了肿瘤内异质性	NA	增强对MGA诊断和治疗的理解，并通过单细胞转录组测序分析提供对后续基础研究的支持	混合性神经节细胞瘤-腺瘤（MGA）	NA	神经节细胞瘤-腺瘤	单细胞转录组测序	NA	临床数据、病理学数据、超微结构数据、单细胞转录组数据	一例28岁男性患者
275	2024-08-08	Integrating single-cell RNA sequencing and prognostic model revealed the carcinogenicity and clinical significance of FAM83D in ovarian cancer 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1055648 PMID:36568230	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和预后模型，探讨了FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义	首次通过单细胞RNA测序和预后模型整合分析，揭示了FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义，并发现了miR-138-5p对FAM83D致癌作用的调控	NA	探讨FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义	FAM83D在卵巢癌中的作用及其与miR-138-5p的相互作用	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	Lasso-Cox回归分析	细胞	正常卵巢和高级别浆液性卵巢癌组织中的细胞
276	2024-08-08	Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses reveal a prognostic signature of cancer-associated fibroblasts in head and neck squamous cell carcinoma 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1028469 PMID:36568368	研究论文	本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示了头颈鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的预后标志	首次通过单细胞RNA测序技术识别出头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并构建了基于4个基因的预后标志	研究样本来源于公共数据库，可能存在一定的数据偏差；预后标志的临床应用需要进一步的临床试验验证	识别头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并探讨其在分子特征、免疫特征及免疫治疗和化疗中的潜在作用	头颈鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞	数字病理学	头颈鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	样本来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库，具体数量未详细说明
277	2024-08-08	TP53-related signature for predicting prognosis and tumor microenvironment characteristics in bladder cancer: A multi-omics study 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1057302 PMID:36568387	研究论文	本研究探讨了TP53基因突变在膀胱癌中的作用，构建了一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和肿瘤微环境特征。	本研究首次构建了基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应，并通过多种组学方法深入分析了TP53活性与肿瘤微环境的关系。	本研究主要基于多组学数据进行分析，未来需要更多的临床验证来证实该特征的可靠性和实用性。	探索TP53突变在膀胱癌中的作用，构建一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应。	膀胱癌患者，特别是TP53突变对肿瘤微环境和预后的影响。	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序、单细胞质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC）	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	具体样本数量未在摘要中明确提及
278	2024-08-08	Autologous cord blood mononuclear cell infusion for the prevention of bronchopulmonary dysplasia in very preterm monozygotic twins: A study protocol for a randomized, placebo-controlled, double-blinded multicenter trial 2022, Frontiers in pediatrics IF:2.1Q2 DOI:10.3389/fped.2022.884366 PMID:36568414	研究论文	本研究旨在评估自体脐带血单个核细胞输注预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良的效果，并探讨其保护机制	这是首个随机、安慰剂对照、双盲的多中心试验，用于评估自体脐带血单个核细胞输注在预防同卵双胞胎早产儿支气管肺发育不良中的疗效	遗传异质性可能降低对照组和干预组之间的可比性，尤其是在小样本试验中	研究自体脐带血单个核细胞输注在预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良中的效果及其保护机制	极早产（小于32周妊娠）的同卵双胞胎新生儿	NA	新生儿疾病	单细胞RNA测序	NA	细胞	60对同卵双胞胎早产新生儿
279	2024-08-08	Pyruvate: Ferredoxin oxidoreductase is involved in IgA-related microbiota dysbiosis and intestinal inflammation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1040774 PMID:36569858	研究论文	本研究探讨了乳酸脱氢酶：铁氧还蛋白氧化还原酶（PFOR）在免疫球蛋白A（IgA）相关微生物失调和肠道炎症中的作用	首次发现PFOR作为IgA结合抗原，可能参与宿主与微生物的相互作用	NA	研究PFOR在炎症性肠病（IBD）中的作用及其对宿主-微生物相互作用的影响	炎症性肠病患者、兔子模型以及PFOR蛋白	NA	炎症性肠病	16S rDNA测序、酶联免疫吸附试验（ELISA）、蛋白质印迹、质谱分析、单细胞测序	NA	微生物群落数据、免疫球蛋白A数据、蛋白质数据	炎症性肠病患者样本、兔子模型
280	2024-08-08	Identification of B cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic model and identify immune infiltration in osteosarcoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1026701 PMID:36569871	研究论文	本研究基于单细胞测序结果，识别B细胞标记基因，并建立预测骨肉瘤预后的模型，同时分析免疫浸润差异。	首次通过单细胞测序技术识别B细胞标记基因，并建立了一个具有良好预测性能的骨肉瘤预后模型。	NA	探讨B细胞在骨肉瘤预后和免疫浸润中的作用。	B细胞标记基因、骨肉瘤预后模型及免疫浸润差异。	数字病理学	骨肉瘤	单细胞测序	NA	基因数据	261个B细胞标记基因