单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-07 |
On the Origin of Pancreatic Cancer: Molecular Tumor Subtypes in Perspective of Exocrine Cell Plasticity
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.11.010
PMID:34875393
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综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌（PDAC）的起源，特别是外分泌细胞可塑性对分子肿瘤亚型的影响 | 探讨了外分泌细胞的不同分化状态与PDAC分子亚型之间的转录组和表观遗传学关系，提出了不同肿瘤亚型的不同起源 | NA | 旨在深入理解PDAC的生物学特性，特别是外分泌细胞在PDAC起源中的作用 | 胰腺导管腺癌及其细胞起源 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和表观遗传组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics to reveal the glioblastoma heterogeneity
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.126243.2
PMID:36875988
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review | 本文综述了通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示的胶质母细胞瘤异质性的当前知识 | 强调了未来研究方向，以填补关于患者性别对疾病结果影响的知识的空白 | 目前的研究主要集中在揭示胶质母细胞瘤异质性的总体情况，未进一步探讨性别差异的影响 | 总结当前关于胶质母细胞瘤异质性的知识，并强调未来研究方向 | 胶质母细胞瘤的遗传、免疫学和性别依赖差异 | digital pathology | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-08-07 |
Biwhitening Reveals the Rank of a Count Matrix
2022, SIAM journal on mathematics of data science
IF:1.9Q1
DOI:10.1137/21m1456807
PMID:37576699
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研究论文 | 本文提出了一种名为Biwhitening的简单方法，用于估计包含计数随机变量的数据矩阵的秩，特别是在泊松随机矩阵的情况下 | 该方法通过同时缩放数据矩阵的行和列，使得相应的噪声谱与标准的Marchenko-Pastur定律一致，从而无需任何先验知识即可估计信号矩阵的秩 | NA | 研究如何在没有先验知识的情况下估计受污染数据矩阵的秩 | 泊松随机矩阵及其扩展到满足均值和方差之间二次关系的分布族 | 机器学习 | NA | Sinkhorn-Knopp算法 | NA | 计数矩阵 | 涉及单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高通量染色体构象捕获(Hi-C)和文档主题建模等多个实际数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-08-08 |
Ushering in a new era of single-cell transcriptomics in bacteria
2022, microLife
DOI:10.1093/femsml/uqac020
PMID:37223351
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综述 | 本文综述了近期在细菌单细胞转录组学领域的新方法和技术突破 | 介绍了MATQ-seq、microSPLiT、PETRI-seq和par-seqFISH等新方法，这些方法使得细菌单细胞转录组学成为可能 | NA | 探讨新方法如何促进对细菌基因表达细胞间变异的理解，并推动微生物学领域的发展 | 细菌单细胞转录组学方法及其在复杂微生物群落中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-08-08 |
Alzheimer's disease modification mediated by bone marrow-derived macrophages via a TREM2-independent pathway in mouse model of amyloidosis
2022-01, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00149-w
PMID:37118355
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研究论文 | 本研究评估了在淀粉样变性小鼠模型中，单核细胞衍生的巨噬细胞（MDM）是否通过TREM2依赖性途径发挥作用，并探讨了PD-L1免疫检查点阻断对认知改善的影响。 | 发现MDM通过TREM2非依赖性途径在淀粉样变性小鼠模型中具有疾病修饰活性。 | NA | 评估单核细胞衍生的巨噬细胞在淀粉样变性小鼠模型中的作用机制。 | 淀粉样变性小鼠模型中的单核细胞衍生的巨噬细胞。 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Trem25xFAD小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics defines Dot1L interacting partners and downstream target genes in the mouse molar dental pulp
2022, The International journal of developmental biology
DOI:10.1387/ijdb.220141db
PMID:36942693
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠磨牙牙髓中Dot1L基因的表达谱及其在不同细胞群中的分布情况 | 首次揭示了Dot1L在小鼠磨牙牙髓中的表达模式及其与下游靶基因的关系，特别是在间充质基质细胞分化中的作用 | 研究仅限于小鼠磨牙牙髓，且未探讨Dot1L在其他组织或物种中的作用 | 探究Dot1L在牙髓组织中的表达及其对间充质基质细胞分化的影响 | 小鼠磨牙牙髓中的Dot1L基因及其在不同细胞群中的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠磨牙牙髓中的多种细胞群，包括间充质基质细胞、免疫细胞、周细胞、成釉细胞和内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-08-08 |
New perspective of skeletal stem cells
2022, Biomaterials translational
|
综述 | 本文综述了骨骼干细胞（SSCs）的空间和时间分布，以及近年来对SSCs多样性和可塑性的研究进展 | 利用荧光激活细胞分选、谱系追踪和单细胞测序技术，研究了具有不同时空分布的SSCs的谱系轨迹 | NA | 探讨骨骼干细胞的空间和时间分布，并总结近年来对SSCs多样性和可塑性的研究进展 | 骨骼干细胞（SSCs）及其在不同组织中的分布和功能 | 干细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选、谱系追踪、单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-08-08 |
Overexpression of PKMYT1 associated with poor prognosis and immune infiltration may serve as a target in triple-negative breast cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1002186
PMID:36793346
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法结合临床样本和实验，探讨了蛋白激酶PKMYT1在乳腺癌中的功能作用 | 首次研究了PKMYT1在乳腺癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | NA | 探索PKMYT1在乳腺癌中的表达及其对预后和免疫浸润的影响 | 乳腺癌组织，特别是三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 生物信息学分析，单细胞测序 | NA | RNA序列 | 涉及乳腺癌组织和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-08-08 |
Mapping the tumor microenvironment in bladder cancer and exploring the prognostic genes by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1105026
PMID:36741702
|
研究论文 | 本研究使用10X单细胞RNA测序技术分析了七份膀胱肿瘤组织及其对应的正常组织，构建了膀胱癌肿瘤微环境图谱，并探索了与预后相关的关键基因 | 首次构建了膀胱癌的完整肿瘤微环境图谱，并细分了膀胱癌上皮细胞的14个亚群，揭示了高度的肿瘤内异质性 | NA | 探索膀胱癌肿瘤微环境并识别与预后相关的关键基因 | 膀胱癌肿瘤组织及其对应的正常组织 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 10X单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七份膀胱肿瘤组织（三份非肌肉侵袭性膀胱癌和四份肌肉侵袭性膀胱癌）及七份对应的正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals intratumoral heterogeneity and potential mechanisms of malignant progression in prostate cancer with perineural invasion
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1073232
PMID:36712886
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了三名伴有神经周围侵犯的前列腺癌患者的肿瘤组织，揭示了肿瘤内异质性及其在恶性进展中的潜在机制 | 首次在单细胞水平上详细分析了伴有神经周围侵犯的前列腺癌的细胞异质性和相关基因表达模式 | 研究样本仅限于三名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解伴有神经周围侵犯的前列腺癌的细胞异质性和恶性进展机制 | 伴有神经周围侵犯的前列腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP | 基因表达数据 | 约17,000个单细胞转录组，来自三名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-08-08 |
Secondary myeloid neoplasms after CD19 CAR T therapy in patients with refractory/relapsed B-cell lymphoma: Case series and review of literature
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1063986
PMID:36713414
|
病例系列和文献综述 | 本文介绍了四例在接受CD19 CAR T细胞治疗后出现继发性骨髓肿瘤的难治/复发性B细胞淋巴瘤患者的病例，并进行了文献综述。 | 使用单细胞RNA测序技术比较了MDS患者和健康捐赠者的骨髓样本，并描述了CD34+细胞的转录改变。 | 样本量较小，仅包括四例患者，且均为来自东部中国的两家医院的病例。 | 研究CD19 CAR T细胞治疗后难治/复发性B细胞淋巴瘤患者中继发性骨髓肿瘤的发生和发展。 | 难治/复发性B细胞淋巴瘤患者在接受CD19 CAR T细胞治疗后出现的继发性骨髓肿瘤。 | NA | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 骨髓样本 | 4例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-08-08 |
Activated autophagy of innate immune cells during the early stages of major trauma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1090358
PMID:36713435
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了重大创伤早期固有免疫细胞中自噬的调控作用 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了重大创伤早期固有免疫细胞中自噬的关键作用 | 研究样本量有限，且仅限于重大创伤患者早期阶段 | 探究重大创伤早期固有免疫细胞中自噬的调控作用及其对免疫功能的影响 | 重大创伤患者的固有免疫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 167名重大创伤患者和3名对照参与者的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-08-08 |
Associative analysis of multi-omics data indicates that acetylation modification is widely involved in cigarette smoke-induced chronic obstructive pulmonary disease
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1030644
PMID:36714109
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据关联分析，探讨了蛋白乙酰化修饰在香烟烟雾诱导的慢性阻塞性肺疾病（COPD）中的作用 | 首次系统性地研究了蛋白乙酰化修饰在COPD中的作用，并通过多组学数据关联分析揭示了其在疾病发展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证结果 | 全面系统地研究香烟烟雾引起的慢性阻塞性肺疾病的分子机制，并探索蛋白乙酰化修饰在其中的作用 | 慢性阻塞性肺疾病（COPD）及其分子机制 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序（RNA-seq）、液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组学、蛋白质组学、乙酰组学数据 | C57BL/6J小鼠模型，COPD患者肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-08-08 |
Mass cytometry and single-cell RNA sequencing reveal immune cell characteristics of active and inactive phases of Crohn's disease
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1064106
PMID:36714133
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，揭示了克罗恩病活动期和非活动期患者的免疫细胞特征 | 首次综合运用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了克罗恩病不同阶段患者的免疫细胞特征，并通过KEGG通路富集分析和CellChat分析揭示了细胞间的相互作用网络 | NA | 旨在了解克罗恩病活动期和非活动期患者的免疫细胞特征 | 克罗恩病活动期和非活动期患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 包括活动期克罗恩病（CDa）、非活动期克罗恩病（CDin）和健康对照（HC）的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-08-08 |
Identification and validation of a muscle failure index to predict prognosis and immunotherapy in lung adenocarcinoma through integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1057088
PMID:36733390
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研究论文 | 本研究通过综合分析大量和单细胞RNA测序数据，识别并验证了一个肌肉衰竭指数（MFI），用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 提出了一种基于肌肉衰竭相关基因的新评分系统MFI，并验证了其在预测肺腺癌预后和免疫治疗敏感性中的作用 | NA | 研究肌肉衰竭相关基因在肺腺癌发生中的作用，并构建一个可靠的MFI模型以指导临床决策 | 肺腺癌组织和正常肺组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | RNA测序数据 | 包括早期、晚期和脑转移的肺腺癌组织及正常肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-08-08 |
High-fiber-diet-related metabolites improve neurodegenerative symptoms in patients with obesity with diabetes mellitus by modulating the hippocampal-hypothalamic endocrine axis
2022, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2022.1026904
PMID:36733447
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研究论文 | 本研究通过转录组和代谢组分析，探讨了高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 本研究首次通过分子对接分析，发现与高纤维饮食相关的代谢标志物醋酰氨基苯甲酸与SPEG蛋白具有最强的结合亲和力，可能通过靶向SPEG蛋白改善肥胖患者的糖尿病和神经退行性疾病 | NA | 探讨高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 高纤维饮食相关的代谢物、糖尿病前期痴呆的血液甲基化谱、阿尔茨海默病患者海马样本的单细胞测序数据 | NA | 糖尿病、神经退行性疾病 | 转录组分析、代谢组分析、单细胞测序、分子对接 | PCA、AutoDock | 基因表达矩阵、甲基化谱、单细胞测序数据 | 24个与高纤维饮食、T2DM和AD相关的标记基因 | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals cellular heterogeneity from deep fascia in patients with acute compartment syndrome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1062479
PMID:36741388
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了急性腔隙综合征患者深层筋膜中的特定高应力腔隙亚群和免疫细胞及成纤维细胞亚群的变化 | 样本量较小，仅包括6名患者 | 探究急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞异质性 | 急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞 | 数字病理学 | 急性腔隙综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名患者（高应力组3名，正常应力组3名） | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of myeloid cells in HPV+ tonsillar cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087843
PMID:36741389
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了HPV阳性扁桃体癌中的髓系细胞组成 | 揭示了HPV阳性扁桃体癌中髓系细胞的四种树突状细胞系和两种巨噬细胞极化过程，以及它们的成熟序列特征 | NA | 探究HPV阳性扁桃体癌中髓系细胞的起源和动态变化，并识别可用于评估患者预后的髓系生物标志物 | HPV阳性扁桃体癌中的髓系细胞 | 数字病理学 | 扁桃体癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用26重流式细胞术验证了大部分单细胞RNA-seq集群 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-08-08 |
Multimodal human thymic profiling reveals trajectories and cellular milieu for T agonist selection
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1092028
PMID:36741401
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研究论文 | 本文通过多模态人类胸腺分析，揭示了T细胞受体(TCRs)阳性选择过程中的细胞命运和细胞微环境 | 首次使用CITE-seq和空间转录组学技术对小儿人类胸腺进行分析，揭示了胸腺细胞在TCR信号传导标记物表达后的发育轨迹和时间诱导模式 | NA | 研究胸腺细胞发育、选择和谱系选择过程中的空间背景和细胞间相互作用 | 胸腺细胞和其发育过程中的细胞微环境 | 免疫学 | NA | CITE-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小儿人类胸腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-08-08 |
Exosomal miRNA-profiling of pleural effusion in lung adenocarcinoma and tuberculosis
2022, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2022.1050242
PMID:36684253
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研究论文 | 本文研究了肺腺癌和结核病引起的胸腔积液中的外泌体miRNA表达谱，以区分良性和恶性胸腔积液。 | 本研究首次鉴定了肺腺癌和结核病胸腔积液中的外泌体miRNA表达谱，并揭示了这些miRNA在胸腔积液形成中的分子机制。 | NA | 旨在通过分析外泌体miRNA表达谱来区分肺腺癌和结核病引起的胸腔积液，并阐明其在胸腔积液形成中的作用。 | 肺腺癌和结核病引起的胸腔积液中的外泌体miRNA。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 深度测序 | NA | miRNA | 99个上调和91个下调的miRNAs在恶性胸腔积液中，7个差异表达的miRNAs通过qRT-PCR验证。 | NA | NA | NA | NA |