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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2024-08-07
Single-cell transcriptomics reveals striking heterogeneity and functional organization of dendritic and monocytic cells in the bovine mesenteric lymph node
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析了牛肠系膜淋巴结中树突状细胞和单核细胞的异质性和功能组织 揭示了树突状细胞和单核细胞的十个集群和七个集群,具有明显的转录组特征,并定义了淋巴结定居子集及其前体,以及高度激活的迁移树突状细胞子集 NA 研究树突状细胞和单核细胞在次级淋巴组织中启动和塑造适应性免疫反应的复杂系统 牛肠系膜淋巴结中的单核吞噬细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 三头成年牛的肠系膜淋巴结 NA NA NA NA
202 2024-08-07
Disordered T cell-B cell interactions in autoantibody-positive inflammatory arthritis
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究探讨了在幼年寡关节炎(oligo JIA)中,Tph细胞与B细胞的异常相互作用是否与自身抗体阳性相关 通过单细胞转录组学技术,进一步定义了Tph细胞的基因特征,并发现ANA阳性患者的Tph细胞上调了与B细胞帮助相关的基因 NA 确定在幼年寡关节炎中,T细胞与B细胞的异常相互作用是否与自身抗体阳性相关 Tph细胞在幼年寡关节炎患者中的分布及其与B细胞的相互作用 NA 幼年寡关节炎 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
203 2024-08-07
Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity and convergence of the tumor microenvironment in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序数据分析,揭示了结直肠癌肿瘤微环境的异质性和收敛性 本研究首次通过追踪分化轨迹,揭示了脂质代谢重塑和免疫功能抑制的关系,并构建了具有良好预后价值的免疫风险模型和临床风险模型 NA 探究结直肠癌肿瘤微环境的异质性和收敛性 结直肠癌的肿瘤微环境 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 从肿瘤、癌旁组织和外周血中鉴定出8种主要细胞类型和25个亚群 NA NA NA NA
204 2024-08-07
The relevance between hypoxia-dependent spatial transcriptomics and the prognosis and efficacy of immunotherapy in claudin-low breast cancer
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学(ST)与免疫荧光技术,探讨了人claudin-低乳腺癌MDA-MB-231移植瘤中与缺氧相关的空间异质性及其对免疫治疗预后和疗效的影响。 首次揭示了claudin-低乳腺癌中基于缺氧依赖的空间异质性,并探讨了其作为临床结果和免疫治疗反应预测生物标志物的潜力。 NA 探讨缺氧依赖的空间转录组学与claudin-低乳腺癌患者免疫治疗预后和疗效的相关性。 人claudin-低乳腺癌MDA-MB-231移植瘤。 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学(ST) NA 转录组数据 1904例乳腺癌样本 NA NA NA NA
205 2024-08-07
Dissecting the Single-Cell Transcriptome Network of Immune Environment Underlying Cervical Premalignant Lesion, Cervical Cancer and Metastatic Lymph Nodes
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了宫颈癌不同阶段的免疫细胞和间质细胞的组成、谱系和功能状态 首次使用单细胞RNA测序技术描绘了宫颈癌进展过程中免疫细胞的转录组图谱 NA 深入理解肿瘤微环境(TME)的复杂性,为宫颈癌提供新的治疗策略 正常宫颈组织、上皮内瘤变、原发性肿瘤和转移性淋巴结组织中的免疫细胞和间质细胞 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序 NA 转录组 共获得59913个单细胞,分为9个细胞集群 NA NA NA NA
206 2024-08-07
Single Cell Transcriptomes of In Vitro Bradyzoite Infected Cells Reveals Toxoplasma gondii Stage Dependent Host Cell Alterations
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了体外感染布氏锥虫的宿主细胞转录组变化 揭示了布氏锥虫感染阶段依赖的宿主细胞转录组变化,并发现了宿主细胞中c-Myc和NF-κB信号通路及能量代谢途径的上调 未提及 旨在理解宿主细胞与布氏锥虫在转录组层面的相互作用 体外感染布氏锥虫的宿主细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 转录组数据 未提及具体样本数量 NA NA NA NA
207 2024-08-07
Emerging concepts on Leydig cell development in fetal and adult testis
2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
综述 本文综述了睾丸间质细胞(Leydig细胞)在胎儿和成人阶段的发育过程及其细胞起源和功能意义 利用细胞/器官培养、全基因组分析、遗传操作小鼠模型、谱系追踪和单细胞RNA测序等技术,揭示了Leydig细胞的不同细胞起源及其转录组和类固醇生成输出的差异 NA 总结当前对胎儿和成人睾丸中Leydig细胞发育的理解,强调其在啮齿动物和灵长类动物中的共同或不同的细胞(祖细胞/干细胞)起源及其功能意义 Leydig细胞在胎儿和成人睾丸中的发育及其细胞起源和功能 NA NA 细胞/器官培养、全基因组分析、遗传操作小鼠模型、谱系追踪、单细胞RNA测序 NA NA NA NA NA NA NA
208 2024-08-07
Spatial proteogenomics reveals distinct and evolutionarily conserved hepatic macrophage niches
2022-01-20, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文通过结合单细胞CITE-seq、单核测序、空间转录组学和空间蛋白质组学,构建了健康和肥胖人类及小鼠肝脏的空间蛋白质组学图谱,以揭示肝脏细胞的特性和定位 首次整合多组学数据,提供了一种可靠的方法来区分和定位所有肝细胞,包括胆管周围的脂质相关巨噬细胞(LAMs),并揭示了跨物种的保守巨噬细胞程序 NA 揭示肝脏中巨噬细胞的特异性和进化保守的细胞微环境 健康和肥胖的人类及小鼠肝脏中的巨噬细胞及其微环境 数字病理学 NA 单细胞CITE-seq, 单核测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA 蛋白质组学, 转录组学 人类和小鼠的肝脏样本 NA NA NA NA
209 2024-08-07
Stable flow-induced expression of KLK10 inhibits endothelial inflammation and atherosclerosis
2022-01-11, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文研究了KLK10在稳定血流诱导下的表达对内皮炎症和动脉粥样硬化的抑制作用 首次揭示了KLK10在稳定血流条件下对内皮细胞的保护作用及其机制 NA 探讨KLK10在稳定血流条件下对内皮细胞炎症和动脉粥样硬化的影响 KLK10蛋白及其在稳定血流条件下的表达 心血管疾病 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序(scRNAseq)和单细胞ATAC测序(scATACseq) NA 基因表达数据 使用部分颈动脉结扎小鼠模型进行研究 NA NA NA NA
210 2024-08-07
HB-EGF Plays a Pivotal Role in Mucosal Hyperplasia During Otitis Media Induced by a Viral Analog
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 研究HB-EGF在模拟病毒感染引起的中耳炎中黏膜增生中的作用 使用单细胞RNA测序识别表达HB-EGF及相关基因的中耳细胞,并通过特定抑制剂阻断HB-EGF效应 NA 探讨病毒感染引起的中耳炎中黏膜增生的机制及HB-EGF的作用 中耳黏膜细胞及其在病毒感染下的增生反应 NA 中耳炎 单细胞RNA测序, Western blotting, 免疫染色 NA RNA NA NA NA NA NA
211 2024-08-07
Characterization of the microenvironment of diabetic foot ulcers and potential drug identification based on scRNA-seq
2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析糖尿病足溃疡(DFUs)的微环境,并通过机器学习算法和免疫荧光技术识别潜在的治疗药物。 首次通过单细胞RNA测序和机器学习算法详细分析了DFUs的微环境,并识别了新的潜在药物靶点。 研究主要基于已有的数据库数据,未涉及大规模的临床试验验证。 揭示糖尿病足溃疡的微环境特征并识别潜在的治疗药物。 糖尿病足溃疡的微环境和潜在药物靶点。 数字病理学 糖尿病 scRNA-seq 逻辑回归机器学习算法 单细胞RNA测序数据 涉及两个数据集GSE165816和GSE199939,具体样本数量未详细说明。 NA NA NA NA
212 2024-08-07
Development of a single-cell atlas for woodland strawberry (Fragaria vesca) leaves during early Botrytis cinerea infection using single cell RNA-seq
2022-Jan-19, Horticulture research IF:7.6Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,构建了林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的单细胞图谱,并分析了不同细胞类型的基因表达模式 首次报道了植物病原入侵过程中单细胞转录组景观,为宿主-病原体相互作用的全面动态提供了新见解 NA 研究植物在病原体入侵时的防御反应及信号转导过程 林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的细胞类型及基因表达 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 超过50,000个单细胞 NA NA NA NA
213 2024-08-07
Cell Layers: uncovering clustering structure in unsupervised single-cell transcriptomic analysis
2022, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文开发了一种名为Cell Layers的交互式Sankey工具,用于在不同聚类分辨率下定量研究基因表达、共表达、生物过程和聚类完整性 Cell Layers工具通过链接分子数据和聚类评估指标,增强了单细胞聚类的可解释性,并提供了对细胞群体的新见解 NA 开发一种新的工具来提高单细胞转录组无监督聚类的解释性 单细胞转录组数据及其聚类结果 生物信息学 NA 单细胞转录组分析 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
214 2024-08-07
An Overview on Single-Cell Technology for Hepatocellular Carcinoma Diagnosis
2022-01-26, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了单细胞技术在肝细胞癌诊断中的应用 单细胞技术能够分析肿瘤组织样本中的每个单细胞,从而深入了解癌症的遗传异质性,有助于识别和评估罕见的细胞群体 文章中提到的挑战包括单细胞技术的局限性和实施中的困难 促进肝细胞癌的个性化诊断和治疗 肝细胞癌的诊断、肿瘤微环境分析、单细胞基因组测序、单细胞转录组学、单细胞组学测序用于生物标志物开发、肝细胞癌的起源和进化 数字病理学 肝细胞癌 单细胞技术 NA 基因表达模式 NA NA NA NA NA
215 2024-08-07
Enhancing CDK4/6 inhibitor therapy for medulloblastoma using nanoparticle delivery and scRNA-seq-guided combination with sapanisertib
2022-Jan-28, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 研究通过纳米颗粒递送和单细胞RNA测序指导的组合疗法,增强CDK4/6抑制剂对髓母细胞瘤的治疗效果 使用纳米颗粒封装减少药物毒性,改善中枢神经系统药代动力学,并通过单细胞RNA测序分析识别新的联合治疗策略 尽管延长了生存期,但复发问题仍未完全解决 探索提高CDK4/6抑制剂治疗髓母细胞瘤效果的新方法 髓母细胞瘤及其治疗 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用基因工程小鼠模型进行实验 NA NA NA NA
216 2024-08-07
Single-Cell Analysis Reveals Unexpected Cellular Changes and Transposon Expression Signatures in the Colonic Epithelium of Treatment-Naïve Adult Crohn's Disease Patients
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析,揭示了未经治疗的成年克罗恩病患者结肠上皮细胞中意外的细胞变化和转座子表达特征。 首次在单细胞分辨率下直接比较了未经治疗的成年克罗恩病患者与非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞和分子景观,并发现了新的细胞类型特异性表达模式和转座子元素标记。 NA 旨在通过单细胞分析,定义克罗恩病患者中每种肠上皮细胞类型的分子变化,以增进对发病机制的理解并识别细胞类型特异性的治疗靶点。 未经治疗的成年克罗恩病患者和非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞。 数字病理学 克罗恩病 单细胞测序 NA 单细胞数据 NA NA NA NA NA
217 2024-08-07
Age-Dependent Changes in the Plasma and Brain Pharmacokinetics of Amyloid-β Peptides and Insulin
2022, Journal of Alzheimer's disease : JAD
研究论文 研究年龄对小鼠血浆和脑中Aβ肽和胰岛素药代动力学的影响 首次探讨了年龄对Aβ同工型和胰岛素在血浆药代动力学和脑内流入的差异性影响,以及这种影响如何潜在增加阿尔茨海默病风险 NA 识别年龄相关的小鼠血浆分布和血脑屏障(BBB)中Aβ肽和胰岛素的转运变化 野生型(WT)和阿尔茨海默病转基因(APP/PS1)小鼠 NA 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA RNA-Seq数据 不同年龄的野生型(WT)和APP/PS1转基因小鼠 NA NA NA NA
218 2024-08-07
Tipping the balance between erythroid cell differentiation and induction of anemia in response to the inflammatory pathology associated with chronic trypanosome infections
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过筛选10个不同毒力的野外分离株,建立了一个模拟慢性动物锥虫病的实验疾病模型,并深入分析了脾脏巨噬细胞在调节脾脏髓外造血中的作用。 本研究揭示了组织驻留巨噬细胞(TRMs)在调节脾脏髓外造血中的双重作用,并展示了在慢性感染过程中,巨噬细胞激活状态的复杂性。 NA 研究慢性锥虫感染引起的炎症病理与红细胞分化及贫血诱导之间的平衡。 慢性锥虫感染的实验模型及脾脏巨噬细胞在其中的作用。 数字病理学 NA scRNA-seq NA 单细胞RNA测序数据 10个不同毒力的野外分离株 NA NA NA NA
219 2024-08-07
Development and Optimization of a Prognostic Model Associated with Stemness Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, BioMed research international IF:2.6Q3
研究论文 本研究旨在开发一种基于干细胞相关基因的预测模型,用于评估肝细胞癌(HCC)患者的预后,以优化治疗方案 本研究通过单细胞测序数据筛选与干细胞相关的差异表达基因,并利用LASSO回归分析构建了一个包含18个干细胞相关基因的预测模型,该模型能有效预测HCC患者的总体生存率 NA 开发和优化与干细胞基因相关的肝细胞癌预后模型 肝细胞癌(HCC)患者的预后评估 数字病理学 肝癌 单细胞测序 LASSO回归 基因表达数据 使用了TCGA和GSE14520两个队列的数据 NA NA NA NA
220 2024-08-07
sciCNV: high-throughput paired profiling of transcriptomes and DNA copy number variations at single-cell resolution
2022-01-17, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种高吞吐量的单细胞RNA测序分析流程,能够为单个细胞提供配对的CNV和转录组图谱,从而探索CNV对细胞程序的影响 提出了sciCNV工具,用于从单细胞RNA测序数据中推断单细胞CNV,提高了CNV检测的灵敏度和特异性 NA 研究CNV对细胞功能的影响,并开发新的工具用于单细胞RNA测序数据的分析 单细胞RNA测序数据和CNV 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
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