单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-07 |
HB-EGF Plays a Pivotal Role in Mucosal Hyperplasia During Otitis Media Induced by a Viral Analog
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2022.823714
PMID:35281434
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研究论文 | 研究HB-EGF在模拟病毒感染引起的中耳炎中黏膜增生中的作用 | 使用单细胞RNA测序识别表达HB-EGF及相关基因的中耳细胞，并通过特定抑制剂阻断HB-EGF效应 | NA | 探讨病毒感染引起的中耳炎中黏膜增生的机制及HB-EGF的作用 | 中耳黏膜细胞及其在病毒感染下的增生反应 | NA | 中耳炎 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 免疫染色 | NA | RNA | NA |
| 182 | 2024-08-07 |
Characterization of the microenvironment of diabetic foot ulcers and potential drug identification based on scRNA-seq
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.997880
PMID:36686438
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析糖尿病足溃疡（DFUs）的微环境，并通过机器学习算法和免疫荧光技术识别潜在的治疗药物。 | 首次通过单细胞RNA测序和机器学习算法详细分析了DFUs的微环境，并识别了新的潜在药物靶点。 | 研究主要基于已有的数据库数据，未涉及大规模的临床试验验证。 | 揭示糖尿病足溃疡的微环境特征并识别潜在的治疗药物。 | 糖尿病足溃疡的微环境和潜在药物靶点。 | 数字病理学 | 糖尿病 | scRNA-seq | 逻辑回归机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及两个数据集GSE165816和GSE199939，具体样本数量未详细说明。 |
| 183 | 2024-08-07 |
Development of a single-cell atlas for woodland strawberry (Fragaria vesca) leaves during early Botrytis cinerea infection using single cell RNA-seq
2022-Jan-19, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhab055
PMID:35043166
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，构建了林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的单细胞图谱，并分析了不同细胞类型的基因表达模式 | 首次报道了植物病原入侵过程中单细胞转录组景观，为宿主-病原体相互作用的全面动态提供了新见解 | NA | 研究植物在病原体入侵时的防御反应及信号转导过程 | 林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的细胞类型及基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过50,000个单细胞 |
| 184 | 2024-08-07 |
Cell Layers: uncovering clustering structure in unsupervised single-cell transcriptomic analysis
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac051
PMID:35967929
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研究论文 | 本文开发了一种名为Cell Layers的交互式Sankey工具，用于在不同聚类分辨率下定量研究基因表达、共表达、生物过程和聚类完整性 | Cell Layers工具通过链接分子数据和聚类评估指标，增强了单细胞聚类的可解释性，并提供了对细胞群体的新见解 | NA | 开发一种新的工具来提高单细胞转录组无监督聚类的解释性 | 单细胞转录组数据及其聚类结果 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 185 | 2024-08-07 |
An Overview on Single-Cell Technology for Hepatocellular Carcinoma Diagnosis
2022-01-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23031402
PMID:35163329
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综述 | 本文综述了单细胞技术在肝细胞癌诊断中的应用 | 单细胞技术能够分析肿瘤组织样本中的每个单细胞，从而深入了解癌症的遗传异质性，有助于识别和评估罕见的细胞群体 | 文章中提到的挑战包括单细胞技术的局限性和实施中的困难 | 促进肝细胞癌的个性化诊断和治疗 | 肝细胞癌的诊断、肿瘤微环境分析、单细胞基因组测序、单细胞转录组学、单细胞组学测序用于生物标志物开发、肝细胞癌的起源和进化 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞技术 | NA | 基因表达模式 | NA |
| 186 | 2024-08-07 |
Enhancing CDK4/6 inhibitor therapy for medulloblastoma using nanoparticle delivery and scRNA-seq-guided combination with sapanisertib
2022-Jan-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl5838
PMID:35080986
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研究论文 | 研究通过纳米颗粒递送和单细胞RNA测序指导的组合疗法，增强CDK4/6抑制剂对髓母细胞瘤的治疗效果 | 使用纳米颗粒封装减少药物毒性，改善中枢神经系统药代动力学，并通过单细胞RNA测序分析识别新的联合治疗策略 | 尽管延长了生存期，但复发问题仍未完全解决 | 探索提高CDK4/6抑制剂治疗髓母细胞瘤效果的新方法 | 髓母细胞瘤及其治疗 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用基因工程小鼠模型进行实验 |
| 187 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics defines keratinocyte differentiation in avian scutate scales
2022-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04082-1
PMID:34997067
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，探讨了鸟类鳞状鳞片中角质形成细胞的分化过程 | 首次通过单细胞转录组学技术揭示了鸟类鳞状鳞片中两种不同类型的分化角质形成细胞，并发现了与人类皮肤相似的角质形成细胞分化基因 | NA | 研究鸟类鳞状鳞片中角质形成细胞的分化过程 | 鸟类鳞状鳞片中的角质形成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | mRNA | 来自1日龄小鸡腿部的皮肤细胞 |
| 188 | 2024-08-07 |
Simultaneous Analysis of Single-Cell Transcriptomes and Cell Surface Protein Expression of Human Hematopoietic Stem Cells and Progenitors Using the 10x Genomics Platform
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_13
PMID:34766273
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研究论文 | 本文描述了使用10x Genomics平台同时分析人造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组和细胞表面蛋白表达的工作流程 | 结合传统的单细胞转录组分析和使用寡核苷酸偶联抗体的细胞表面蛋白表达同时分析，增加了免疫表型分析到mRNA数据中 | NA | 详细表征单细胞异质性，并有助于识别用于前瞻性分离转录定义的新细胞亚群的标记 | 人脐带血单个核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据和蛋白表达数据 | 人脐带血单个核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 |
| 189 | 2024-08-07 |
CD161 expression and regulation defines rapidly responding effector CD4+ T cells associated with improved survival in HPV16-associated tumors
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003995
PMID:35039463
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研究论文 | 本研究探讨了CD161表达及其调控在HPV16相关肿瘤中对效应CD4+ T细胞的影响，发现CD4+CD161+效应记忆T细胞与改善生存率相关。 | 首次揭示了CD161在肿瘤特异性CD4+ T细胞中的作用及其调控机制，并发现CD161与SOX4共同参与TCR信号的放大。 | 研究主要集中在HPV16+的OPSCC患者，可能需要进一步研究以验证在其他类型癌症中的普遍性。 | 研究CD161表达在HPV16相关肿瘤中对CD4+ T细胞的影响及其临床意义。 | HPV16+的OPSCC患者中的CD4+CD161+ T细胞。 | 免疫学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括治疗性疫苗接种患者和肿瘤浸润淋巴细胞的样本 |
| 190 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis Reveals Unexpected Cellular Changes and Transposon Expression Signatures in the Colonic Epithelium of Treatment-Naïve Adult Crohn's Disease Patients
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.005
PMID:35158099
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析，揭示了未经治疗的成年克罗恩病患者结肠上皮细胞中意外的细胞变化和转座子表达特征。 | 首次在单细胞分辨率下直接比较了未经治疗的成年克罗恩病患者与非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞和分子景观，并发现了新的细胞类型特异性表达模式和转座子元素标记。 | NA | 旨在通过单细胞分析，定义克罗恩病患者中每种肠上皮细胞类型的分子变化，以增进对发病机制的理解并识别细胞类型特异性的治疗靶点。 | 未经治疗的成年克罗恩病患者和非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 191 | 2024-08-07 |
Hyperpolarised 13C-MRI identifies the emergence of a glycolytic cell population within intermediate-risk human prostate cancer
2022-01-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28069-2
PMID:35075123
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研究论文 | 本文利用超极化13C磁共振成像（HP C-MRI）技术，通过检测前列腺癌中[1-C]乳酸的产生，区分临床显著性前列腺癌与惰性病变 | 本文首次通过HP C-MRI技术，结合免疫组化和空间转录组学，揭示了前列腺癌中上皮细胞和基质细胞的代谢差异 | NA | 区分临床显著性前列腺癌与惰性病变 | 低/中度风险人群中的前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 超极化磁共振成像（HP C-MRI） | NA | 图像 | 独立TCGA队列中的肿瘤样本 |
| 192 | 2024-08-07 |
Age-Dependent Changes in the Plasma and Brain Pharmacokinetics of Amyloid-β Peptides and Insulin
2022, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-215128
PMID:34924382
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研究论文 | 研究年龄对小鼠血浆和脑中Aβ肽和胰岛素药代动力学的影响 | 首次探讨了年龄对Aβ同工型和胰岛素在血浆药代动力学和脑内流入的差异性影响，以及这种影响如何潜在增加阿尔茨海默病风险 | NA | 识别年龄相关的小鼠血浆分布和血脑屏障（BBB）中Aβ肽和胰岛素的转运变化 | 野生型（WT）和阿尔茨海默病转基因（APP/PS1）小鼠 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 不同年龄的野生型（WT）和APP/PS1转基因小鼠 |
| 193 | 2024-08-07 |
Tipping the balance between erythroid cell differentiation and induction of anemia in response to the inflammatory pathology associated with chronic trypanosome infections
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1051647
PMID:36420267
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研究论文 | 本研究通过筛选10个不同毒力的野外分离株，建立了一个模拟慢性动物锥虫病的实验疾病模型，并深入分析了脾脏巨噬细胞在调节脾脏髓外造血中的作用。 | 本研究揭示了组织驻留巨噬细胞（TRMs）在调节脾脏髓外造血中的双重作用，并展示了在慢性感染过程中，巨噬细胞激活状态的复杂性。 | NA | 研究慢性锥虫感染引起的炎症病理与红细胞分化及贫血诱导之间的平衡。 | 慢性锥虫感染的实验模型及脾脏巨噬细胞在其中的作用。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10个不同毒力的野外分离株 |
| 194 | 2024-08-07 |
Development and Optimization of a Prognostic Model Associated with Stemness Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/9168441
PMID:36246969
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研究论文 | 本研究旨在开发一种基于干细胞相关基因的预测模型，用于评估肝细胞癌（HCC）患者的预后，以优化治疗方案 | 本研究通过单细胞测序数据筛选与干细胞相关的差异表达基因，并利用LASSO回归分析构建了一个包含18个干细胞相关基因的预测模型，该模型能有效预测HCC患者的总体生存率 | NA | 开发和优化与干细胞基因相关的肝细胞癌预后模型 | 肝细胞癌（HCC）患者的预后评估 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GSE14520两个队列的数据 |
| 195 | 2024-08-07 |
sciCNV: high-throughput paired profiling of transcriptomes and DNA copy number variations at single-cell resolution
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab413
PMID:34655292
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研究论文 | 本文介绍了一种高吞吐量的单细胞RNA测序分析流程，能够为单个细胞提供配对的CNV和转录组图谱，从而探索CNV对细胞程序的影响 | 提出了sciCNV工具，用于从单细胞RNA测序数据中推断单细胞CNV，提高了CNV检测的灵敏度和特异性 | NA | 研究CNV对细胞功能的影响，并开发新的工具用于单细胞RNA测序数据的分析 | 单细胞RNA测序数据和CNV | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 196 | 2024-08-07 |
Expression Profile of Inflammation Response Genes and Potential Regulatory Mechanisms in Dilated Cardiomyopathy
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1051652
PMID:36035223
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研究论文 | 本研究分析了扩张型心肌病（DCM）中的炎症反应基因表达谱及其潜在调控机制 | 首次详细描述了DCM中炎症反应基因的表达情况及其调控机制，包括转录因子和非编码RNA的调控网络 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨DCM中炎症反应基因的表达及其调控机制 | DCM患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 27,665个细胞样本，包括4个DCM样本和2个健康对照样本；166个DCM患者和166个健康对照的批量测序数据 |
| 197 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/7887782
PMID:36148412
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据挖掘，分析了肌腱组织中的细胞组成及其在肌腱修复中的作用 | 首次揭示了肌腱组织中M1巨噬细胞和T细胞的异质性，及其在肌腱损伤和修复中的不同生理过程 | NA | 探索肌腱组织的细胞组成及与肌腱修复相关的细胞群体和信号通路 | 肌腱组织的细胞组成及肌腱修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含七种细胞亚群的肌腱组织样本 |
| 198 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals Low-Level Tragus Stimulation Improves Sepsis-Induced Myocardial Dysfunction by Promoting M2 Macrophage Polarization
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/3327583
PMID:36285297
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了低水平耳屏刺激通过促进M2巨噬细胞极化改善脓毒症引起的心肌功能障碍 | 首次探讨了低水平耳屏刺激对脓毒症心肌功能障碍的影响及其机制，通过单细胞mRNA测序揭示了心脏细胞景观图 | NA | 探讨低水平耳屏刺激对脓毒症引起的心肌功能障碍的影响及其机制 | 脓毒症引起的心肌功能障碍及低水平耳屏刺激的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | NA |
| 199 | 2024-08-07 |
Functionalized Lineage Tracing for the Study and Manipulation of Heterogeneous Cell Populations
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1811-0_8
PMID:35094325
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研究论文 | 本文介绍了COLBERT方法，通过使用独特的单引导RNA（sgRNA）条形码作为功能标签来识别和召回特定的细胞谱系 | COLBERT方法利用sgRNA条形码稳定整合并主动转录，使得所有细胞后代都包含亲本条形码并产生功能性sgRNA，从而实现对异质细胞群中特定谱系的追踪和分离 | NA | 研究并操控异质细胞群 | 异质细胞群中的独特细胞谱系 | NA | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes and T cell receptors of vaccine-expanded apolipoprotein B-specific T cells
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.1076808
PMID:36684560
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接种ApoB肽P6疫苗的小鼠中ApoB特异性T细胞的转录组和T细胞受体 | 首次深入表征了疫苗扩增的ApoB特异性T细胞，并揭示了T细胞受体与ApoB肽P6:MHC-II相互作用的特异性 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探究疫苗接种对ApoB表位的诱导反应 | ApoB特异性T细胞的单细胞转录组和T细胞受体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6J小鼠接种ApoB肽P6疫苗后的T细胞 |