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当前共找到 1167 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-14
Genetic and Transcriptional Contributions to Relapse in Normal Karyotype Acute Myeloid Leukemia
2022-01, Blood cancer discovery IF:11.5Q1
研究论文 本研究通过增强全基因组测序和深度覆盖单细胞RNA测序,分析了六例正常核型急性髓系白血病患者的初诊和复发样本,以探究复发后的克隆和转录适应机制 首次在相同样本中结合增强全基因组测序和深度覆盖单细胞RNA测序,实现了在单个细胞中识别表达突变,揭示了遗传和转录异质性的共同演化,并发现了一种具有干细胞性、静止性和粘附性标记的复发富集白血病细胞状态 样本量较小(仅六例),可能限制结果的普遍性,且未明确说明技术平台的具体配置细节 探究急性髓系白血病复发过程中克隆和转录适应的机制,以理解基因组、转录组和免疫微环境的相互作用 六例正常核型急性髓系白血病患者的初诊和复发样本 数字病理学 急性髓系白血病 增强全基因组测序,单细胞RNA测序 NA 基因组序列数据,单细胞转录组数据 6例患者样本,共142,642个高质量细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2026-03-06
Allelic variation in class I HLA determines CD8+ T cell repertoire shape and cross-reactive memory responses to SARS-CoV-2
2022-01-21, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究应用单细胞多组学技术,分析了四种主要HLA I类等位基因下CD8 T细胞对SARS-CoV-2的应答特征 首次统一表征了不同HLA I类等位基因如何影响CD8 T细胞对SARS-CoV-2的表位特异性、TCR多样性和记忆T细胞库的利用 仅关注了四种主要HLA I类等位基因,可能未涵盖所有遗传变异的影响 探究HLA I类等位基因变异如何塑造CD8 T细胞对SARS-CoV-2的免疫应答和记忆反应 SARS-CoV-2感染相关的CD8 T细胞 免疫学 COVID-19 单细胞多组学技术 NA 单细胞转录组和TCR序列数据 未明确指定样本数量,但涉及四种HLA I类等位基因的CD8 T细胞分析 NA 单细胞多组学 NA NA
3 2026-03-06
IL-17 Producing Lymphocytes Cause Dry Eye and Corneal Disease With Aging in RXRα Mutant Mouse
2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究探讨了RXRα突变小鼠中IL-17相关机制在干眼病发展中的作用 首次通过单细胞RNA测序结合流式细胞术和共聚焦显微镜,揭示了RXRα突变导致γδ T细胞中IL-17表达增加,从而促进干眼病发展的机制 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且未探讨其他免疫细胞类型在干眼病中的潜在作用 研究RXRα突变小鼠中IL-17相关机制如何导致干眼病和角膜疾病 Pinkie小鼠(RXRα功能缺失突变)和野生型C57BL/6小鼠的角膜、结膜组织及免疫细胞 数字病理学 干眼病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、共聚焦显微镜 NA 基因表达数据、细胞表型数据 Pinkie小鼠和野生型C57BL/6小鼠的角膜和结膜组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-02-25
Integration of spatial and single-cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis
2022-01, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本研究通过整合空间和单细胞转录组数据,阐明了小鼠器官发生过程 应用基于图像的单细胞转录组学方法seqFISH,结合空间背景和多路转录测量,揭示了scRNA-seq数据中未显现的细胞分化轴 仅检测了387个目标基因的mRNA,可能未覆盖全部相关基因表达 研究复杂组织和发育中的细胞命运决定 小鼠胚胎组织切片(8-12体节阶段) 数字病理学 NA seqFISH, scRNA-seq NA 图像, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
5 2026-02-17
Single-cell profiling reveals distinct subsets of CD14+ monocytes drive blood immune signatures of active tuberculosis
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了CD14+单核细胞的不同亚群在活动性结核病血液免疫特征中的独特作用 首次证明中间型和经典单核细胞各自贡献于活动性结核病的血液免疫特征,并识别了新的亚群和相关基因特征 样本量有限,仅包括活动性结核病患者和健康对照,未涵盖潜伏感染或其他疾病状态 探究单核细胞在活动性结核病血液免疫特征中的作用 活动性结核病患者在诊断和治疗中期的配对血液样本以及健康对照 单细胞转录组学 结核病 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA-seq数据 活动性结核病患者和健康对照的配对血液样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-02-17
MAP4K3/GLK inhibits Treg differentiation by direct phosphorylating IKKβ and inducing IKKβ-mediated FoxO1 nuclear export and Foxp3 downregulation
2022, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本文探讨了GLK(MAP4K3)通过直接磷酸化IKKβ并诱导FoxO1核输出,从而抑制Treg分化的分子机制 揭示了GLK在PKCθ非依赖方式下直接磷酸化IKKβ Ser733位点的新机制,并建立了GLK-IKKβ-FoxO1信号轴调控Foxp3转录的完整通路 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;单细胞RNA测序样本量有限 阐明GLK/IKKβ信号轴在调节性T细胞(Treg)分化和功能中的作用机制 T细胞特异性GLK转基因小鼠和IKKβ条件性敲除小鼠的CD4 T细胞 免疫学 自身免疫性疾病 染色质免疫沉淀、报告基因检测、激酶检测、蛋白质互作检测、质谱分析、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质互作数据、磷酸化数据 转基因小鼠和条件性敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2025-12-20
Data-driven modeling predicts gene regulatory network dynamics during the differentiation of multipotential hematopoietic progenitors
2022-01, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文通过数据驱动建模预测了多潜能造血祖细胞分化过程中的基因调控网络动态 利用瞬时基因表达模式推断基因调控网络的遗传结构和动态,揭示了PU.1上调的调控机制超出Gata1-PU.1双稳态开关 模型基于诱导细胞系数据,可能无法完全反映体内复杂环境 研究造血过程中细胞分化的基因调控网络动态 多潜能造血祖细胞分化为红细胞和中性粒细胞的过程 机器学习 NA 单细胞RNA测序 基因电路模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2025-10-05
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究优化了分散人胰岛细胞的冷冻保存方法,并验证了冻存后细胞的功能特性 开发了迭代分级冷冻方法,首次系统评估了冻存后胰岛细胞的分子和功能表型完整性 研究仅针对分散的胰岛细胞,未评估完整胰岛组织的冷冻保存效果 优化胰岛细胞冷冻保存技术,为糖尿病研究和治疗提供细胞来源 分散的人胰岛细胞 细胞生物学 糖尿病 单细胞RNA测序,膜片钳电生理学 NA 基因表达数据,电生理数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2025-10-06
Cisplatin Neurotoxicity Targets Specific Subpopulations and K+ Channels in Tyrosine-Hydroxylase Positive Dorsal Root Ganglia Neurons
2022, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2
研究论文 本研究揭示顺铂通过靶向酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元中的特定亚群和K+通道导致神经毒性 首次在单细胞水平揭示顺铂神经毒性的特异性细胞靶点,发现K2P18.1钾通道在其中的关键作用 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本验证;维生素E的保护作用有限 探究顺铂化疗引起的外周神经病变的细胞机制 小鼠酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 神经科学 化疗引起的周围神经病变 单细胞转录组测序,电生理分析 NA 转录组数据,电生理记录 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
10 2025-10-06
Sox13 is a novel flow-sensitive transcription factor that prevents inflammation by repressing chemokine expression in endothelial cells
2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序技术发现SOX13是一种新型流动敏感转录因子,能够抑制内皮细胞中炎症趋化因子的表达 首次鉴定SOX13为流动敏感转录因子,并揭示其在稳定血流条件下抑制内皮细胞炎症反应的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外培养的人主动脉内皮细胞,需要在更复杂的体内环境中进一步验证 探索血流动力学调节内皮细胞炎症反应的分子机制,寻找新的动脉粥样硬化治疗靶点 小鼠颈动脉模型和培养的人主动脉内皮细胞 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, RNA干扰, RNA测序, qPCR, ELISA 小鼠部分颈动脉结扎模型 基因表达数据, 染色质可及性数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
11 2025-10-06
Universal prediction of cell-cycle position using transfer learning
2022-01-31, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 开发了一种名为tricycle的R/Bioconductor软件包,通过迁移学习实现细胞周期位置的通用预测 利用细胞周期生物学特性、周期性函数主成分分析的数学特性和迁移学习,克服了数据集依赖嵌入的学习限制 NA 从单细胞RNA-seq数据高分辨率推断细胞周期位置 细胞周期 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 迁移学习,主成分分析 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2025-10-06
Enhanced single-cell RNA-seq workflow reveals coronary artery disease cellular cross-talk and candidate drug targets
2022-01, Atherosclerosis IF:4.9Q1
研究论文 开发了一个增强的单细胞RNA测序分析工作流程,用于研究冠状动脉疾病的细胞相互作用和潜在药物靶点 整合了自动化细胞标记、伪时序排序、配体-受体评估和药物-基因相互作用分析的用户友好型工作流程,并开发了交互式网络应用PlaqView 基于已发表的单细胞数据集进行二次分析,需要进一步实验验证 开发单细胞RNA测序分析工作流程以研究动脉粥样硬化斑块微环境和发现潜在治疗方法 人类冠状动脉单细胞数据集中的细胞类型,特别是平滑肌细胞来源的成纤维样细胞 单细胞分析 冠状动脉疾病 单细胞RNA测序 伪时序分析,配体-受体相互作用分析 单细胞RNA测序数据 基于Wirka等人先前发表的人类冠状动脉单细胞数据集 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
13 2025-10-06
MUC1-C integrates type II interferon and chromatin remodeling pathways in immunosuppression of prostate cancer
2022, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究揭示MUC1-C蛋白通过整合II型干扰素通路和染色质重塑机制促进前列腺癌免疫抑制 首次发现MUC1-C通过调控ARID1A/BAF和NuRD复合物协调II型干扰素通路与染色质重塑的机制关联 研究主要基于细胞模型和生物信息学分析,缺乏体内实验验证 阐明MUC1-C在前列腺癌免疫抑制中的分子机制 去势抵抗性前列腺癌细胞 肿瘤免疫学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2025-10-06
Deep learning tackles single-cell analysis-a survey of deep learning for scRNA-seq analysis
2022-01-17, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
综述 本文系统综述了深度学习在单细胞RNA测序数据分析中的应用 建立了变分自编码器、自编码器、生成对抗网络和监督深度学习模型的统一数学表示框架,并关联模型损失函数与数据处理步骤的具体目标 仅涵盖25种深度学习算法,未涉及所有现有方法 为单细胞RNA测序数据分析提供深度学习算法的系统综述和选择指南 单细胞RNA测序数据处理流程中的深度学习算法 机器学习 NA 单细胞RNA测序 变分自编码器, 自编码器, 生成对抗网络, 监督深度学习模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2025-10-06
Mechanotherapy Reprograms Aged Muscle Stromal Cells to Remodel the Extracellular Matrix during Recovery from Disuse
2022, Function (Oxford, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析发现机械疗法能够重编程衰老肌肉基质细胞,促进废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 首次揭示机械疗法通过调节衰老肌肉中基质细胞的基因表达模式,使其更接近年轻肌肉状态,从而促进细胞外基质重塑 研究主要基于大鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 探究机械疗法是否能够促进衰老肌肉在废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 成年和老年大鼠的腓肠肌单核细胞 单细胞转录组学 老年疾病 单细胞RNA测序,同位素示踪,组织学分析 NA 单细胞转录组数据,组织学图像数据 成年和老年大鼠腓肠肌单核细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2025-10-06
IFN-γ transforms the transcriptomic landscape and triggers myeloid cell hyperresponsiveness to cause lethal lung injury
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了流感诱导的IFN-γ通过触发髓系细胞过度反应导致MRSA共感染时致命性肺损伤的机制 首次证明IFN-γ受体信号驱动髓系细胞(特别是CD11c单核吞噬细胞)转录组重编程和过度反应,导致炎症因子风暴和肺组织损伤 研究基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 探究急性呼吸窘迫综合征(ARDS)发病机制中IFN-γ信号通路的作用 小鼠模型中的免疫细胞,特别是髓系细胞和单核吞噬细胞 免疫学 急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 小鼠疾病模型 基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2025-10-06
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
病例报告 通过一例重症COVID-19康复期血浆输注后完全缓解的病例,分析疾病消退的关键生物学动态 首次通过纵向蛋白质组学和单细胞转录组学联合分析,揭示康复期血浆输注后免疫稳态重建的生物学过程 单病例报告,结果需要更大规模研究验证 探索COVID-19疾病消退过程中的关键生物学相关因素 重症COVID-19患者 单细胞分析 COVID-19 无偏蛋白质组学分析,单细胞转录组学 NA 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 1例患者 NA 单细胞RNA-seq,蛋白质组分析 NA NA
18 2025-10-06
Human B Cells Mediate Innate Anti-Cancer Cytotoxicity Through Concurrent Engagement of Multiple TNF Superfamily Ligands
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究发现人类循环B细胞通过同时表达多种TNF超家族配体介导先天性抗癌细胞毒性 首次揭示B细胞作为适应性免疫介质也具有先天性抗癌细胞毒性功能,通过同时表达四种跨膜TNFSF配体协同作用 研究样本主要来自头颈鳞状细胞癌患者,需要验证在其他癌症类型中的普适性 探索B细胞在先天性抗癌免疫中的作用机制 人类外周血B细胞及多种白血病和实体瘤细胞 免疫学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 健康个体和头颈鳞状细胞癌患者的外周血B细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2025-10-06
BASiCS workflow: a step-by-step analysis of expression variability using single cell RNA sequencing data
2022, F1000Research
研究论文 介绍使用BASiCS Bioconductor包分析单细胞RNA测序数据中基因表达变异性的分步计算工作流程 提供集成框架同时进行数据标准化、技术噪音量化和下游分析,并在分析步骤间传播统计不确定性 依赖于公开可用数据集,需要用户具备一定的生物信息学分析能力 开发稳健量化单细胞基因表达变异性的计算方法 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 统计模型 基因表达数据 公开可用数据集(未指定具体样本数量) NA single-cell RNA-seq NA NA
20 2025-10-06
Oral cavity infection by the SARS-CoV-2: emphasizing the essence of masking and peptide therapeutics
2022, The Egyptian journal of medical human genetics
研究论文 本研究基于TMPRSS2与PAI-1的结合界面设计治疗性肽以抑制SARS-CoV-2感染,并强调佩戴口罩的预防作用 首次利用TMPRSS2与PAI-1的结合界面信息设计特异性抑制TMPRSS2的治疗性肽 NA 开发抑制SARS-CoV-2感染的治疗方法并强调预防措施 口腔黏膜上皮细胞及SARS-CoV-2病毒入侵机制 NA COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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