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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
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病例报告 | 通过对一例重症COVID-19患者在接受恢复期血浆输注后完全康复的纵向分析，揭示了从重症到无病状态转换的关键生物学过程 | 首次通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，明确了恢复期血浆输注后血浆蛋白时序性变化及单核细胞亚群消失与COVID-19缓解的关联 | 基于单一病例报告，结果普适性有限，需更大规模队列验证 | 阐明COVID-19从重症到完全康复的生物学动态机制 | 一例重症COVID-19患者的外周血细胞和血浆 | 数字病理学 | 新型冠状病毒病 | NGS, RNA-seq | NA | 文本 | 1例患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于外周血单细胞转录组分析 |
| 2 | 2026-04-24 |
MOCA for Integrated Analysis of Gene Expression and Genetic Variation in Single Cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.831040
PMID:35432484
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研究论文 | 提出MOCA软件，用于联合分析单细胞RNA测序数据中的基因表达与遗传变异 | 首次实现单细胞层面基因表达与遗传变异的联合一致性分析，识别收敛和发散表达模式 | 未提及具体局限性 | 开发分析工具以探究体细胞变异对基因表达模式演化的影响 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达与遗传变异 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-04-19 |
Proteomic and Single-Cell Transcriptomic Dissection of Human Plasmacytoid Dendritic Cell Response to Influenza Virus
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.814627
PMID:35401570
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学和单细胞转录组学技术，全面解析了人类浆细胞样树突状细胞对流感病毒的反应 | 首次报告了pDC在生理刺激下的全面无偏分泌组分析，并结合单细胞RNA-seq揭示了pDC的异质性和激活后的功能特化 | 研究仅针对流感H1N1病毒，未涵盖其他病毒或刺激条件，且样本来源和数量可能有限 | 研究人类浆细胞样树突状细胞在基线和流感病毒刺激下的分子特征和功能异质性 | 人类浆细胞样树突状细胞 | 免疫学 | 流感 | LC-MS/MS, 单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-17 |
Molecular Computational Anatomy: Unifying the Particle to Tissue Continuum via Measure Representations of the Brain
2022, BME frontiers
IF:5.0Q1
DOI:10.34133/2022/9868673
PMID:37206893
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研究论文 | 本文提出了一种基于几何测度表示的分子计算解剖学理论，用于统一大脑映射中空间转录组学和细胞尺度组织学与组织尺度的计算解剖学 | 引入几何varifold测度和统计力学方法，首次将分子尺度的确定性粒子描述与组织尺度的统计集合统一起来，实现从分子到组织尺度的无缝过渡 | 未明确说明实验验证或具体应用案例，理论框架的实践可行性有待进一步探索 | 统一大脑映射中的分子尺度（如空间转录组学）和组织尺度（如计算解剖学）表示，以理解大脑的结构和功能特性 | 大脑的分子、细胞和组织尺度结构，包括蛋白质、转录组功能身份、电生理学、分子组织学等 | 计算解剖学 | NA | 空间转录组学、数字病理学、分子组织学、电生理学 | 几何varifold测度、统计力学模型 | 分子数据、图像数据、功能状态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-04-17 |
STtools: A Comprehensive Software Pipeline for Ultra-high Resolution Spatial Transcriptomics Data
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac061
PMID:36284674
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研究论文 | 本文介绍了STtools，一个用于处理超高清空间转录组数据的综合软件管道 | STtools能处理新兴技术生成的亚微米分辨率数据，计算可扩展性强，且不牺牲分辨率，相比现有方法提供数倍更高的分析分辨率 | NA | 开发一个能处理多种分辨率空间转录组数据的软件工具，以解决现有工具无法有效处理超高清数据的问题 | 空间转录组数据集，包括Seq-Scope、Slide-seq和VISIUM生成的数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Seq-Scope, Slide-seq, VISIUM | Seq-Scope（<1μm分辨率）, Slide-seq（10μm分辨率）, VISIUM（100μm分辨率） |
| 6 | 2026-03-14 |
Genetic and Transcriptional Contributions to Relapse in Normal Karyotype Acute Myeloid Leukemia
2022-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-21-0050
PMID:35019859
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研究论文 | 本研究通过增强全基因组测序和深度覆盖单细胞RNA测序，分析了六例正常核型急性髓系白血病患者的初诊和复发样本，以探究复发后的克隆和转录适应机制 | 首次在相同样本中结合增强全基因组测序和深度覆盖单细胞RNA测序，实现了在单个细胞中识别表达突变，揭示了遗传和转录异质性的共同演化，并发现了一种具有干细胞性、静止性和粘附性标记的复发富集白血病细胞状态 | 样本量较小（仅六例），可能限制结果的普遍性，且未明确说明技术平台的具体配置细节 | 探究急性髓系白血病复发过程中克隆和转录适应的机制，以理解基因组、转录组和免疫微环境的相互作用 | 六例正常核型急性髓系白血病患者的初诊和复发样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 增强全基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据，单细胞转录组数据 | 6例患者样本，共142,642个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-06 |
Allelic variation in class I HLA determines CD8+ T cell repertoire shape and cross-reactive memory responses to SARS-CoV-2
2022-01-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abk3070
PMID:34793243
|
研究论文 | 本研究应用单细胞多组学技术，分析了四种主要HLA I类等位基因下CD8 T细胞对SARS-CoV-2的应答特征 | 首次统一表征了不同HLA I类等位基因如何影响CD8 T细胞对SARS-CoV-2的表位特异性、TCR多样性和记忆T细胞库的利用 | 仅关注了四种主要HLA I类等位基因，可能未涵盖所有遗传变异的影响 | 探究HLA I类等位基因变异如何塑造CD8 T细胞对SARS-CoV-2的免疫应答和记忆反应 | SARS-CoV-2感染相关的CD8 T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞多组学技术 | NA | 单细胞转录组和TCR序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及四种HLA I类等位基因的CD8 T细胞分析 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-06 |
IL-17 Producing Lymphocytes Cause Dry Eye and Corneal Disease With Aging in RXRα Mutant Mouse
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.849990
PMID:35402439
|
研究论文 | 本研究探讨了RXRα突变小鼠中IL-17相关机制在干眼病发展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合流式细胞术和共聚焦显微镜，揭示了RXRα突变导致γδ T细胞中IL-17表达增加，从而促进干眼病发展的机制 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且未探讨其他免疫细胞类型在干眼病中的潜在作用 | 研究RXRα突变小鼠中IL-17相关机制如何导致干眼病和角膜疾病 | Pinkie小鼠（RXRα功能缺失突变）和野生型C57BL/6小鼠的角膜、结膜组织及免疫细胞 | 数字病理学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | Pinkie小鼠和野生型C57BL/6小鼠的角膜和结膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-02-25 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis
2022-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01006-2
PMID:34489600
|
研究论文 | 本研究通过整合空间和单细胞转录组数据，阐明了小鼠器官发生过程 | 应用基于图像的单细胞转录组学方法seqFISH，结合空间背景和多路转录测量，揭示了scRNA-seq数据中未显现的细胞分化轴 | 仅检测了387个目标基因的mRNA，可能未覆盖全部相关基因表达 | 研究复杂组织和发育中的细胞命运决定 | 小鼠胚胎组织切片（8-12体节阶段） | 数字病理学 | NA | seqFISH, scRNA-seq | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-02-17 |
Single-cell profiling reveals distinct subsets of CD14+ monocytes drive blood immune signatures of active tuberculosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087010
PMID:36713384
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了CD14+单核细胞的不同亚群在活动性结核病血液免疫特征中的独特作用 | 首次证明中间型和经典单核细胞各自贡献于活动性结核病的血液免疫特征，并识别了新的亚群和相关基因特征 | 样本量有限，仅包括活动性结核病患者和健康对照，未涵盖潜伏感染或其他疾病状态 | 探究单核细胞在活动性结核病血液免疫特征中的作用 | 活动性结核病患者在诊断和治疗中期的配对血液样本以及健康对照 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 活动性结核病患者和健康对照的配对血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-02-17 |
MAP4K3/GLK inhibits Treg differentiation by direct phosphorylating IKKβ and inducing IKKβ-mediated FoxO1 nuclear export and Foxp3 downregulation
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72148
PMID:35966593
|
研究论文 | 本文探讨了GLK（MAP4K3）通过直接磷酸化IKKβ并诱导FoxO1核输出，从而抑制Treg分化的分子机制 | 揭示了GLK在PKCθ非依赖方式下直接磷酸化IKKβ Ser733位点的新机制，并建立了GLK-IKKβ-FoxO1信号轴调控Foxp3转录的完整通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；单细胞RNA测序样本量有限 | 阐明GLK/IKKβ信号轴在调节性T细胞（Treg）分化和功能中的作用机制 | T细胞特异性GLK转基因小鼠和IKKβ条件性敲除小鼠的CD4 T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 染色质免疫沉淀、报告基因检测、激酶检测、蛋白质互作检测、质谱分析、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质互作数据、磷酸化数据 | 转基因小鼠和条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-12-20 |
Data-driven modeling predicts gene regulatory network dynamics during the differentiation of multipotential hematopoietic progenitors
2022-01, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009779
PMID:35030198
|
研究论文 | 本文通过数据驱动建模预测了多潜能造血祖细胞分化过程中的基因调控网络动态 | 利用瞬时基因表达模式推断基因调控网络的遗传结构和动态，揭示了PU.1上调的调控机制超出Gata1-PU.1双稳态开关 | 模型基于诱导细胞系数据，可能无法完全反映体内复杂环境 | 研究造血过程中细胞分化的基因调控网络动态 | 多潜能造血祖细胞分化为红细胞和中性粒细胞的过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因电路模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-05 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
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研究论文 | 本研究优化了分散人胰岛细胞的冷冻保存方法，并验证了冻存后细胞的功能特性 | 开发了迭代分级冷冻方法，首次系统评估了冻存后胰岛细胞的分子和功能表型完整性 | 研究仅针对分散的胰岛细胞，未评估完整胰岛组织的冷冻保存效果 | 优化胰岛细胞冷冻保存技术，为糖尿病研究和治疗提供细胞来源 | 分散的人胰岛细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，膜片钳电生理学 | NA | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Cisplatin Neurotoxicity Targets Specific Subpopulations and K+ Channels in Tyrosine-Hydroxylase Positive Dorsal Root Ganglia Neurons
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.853035
PMID:35586548
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研究论文 | 本研究揭示顺铂通过靶向酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元中的特定亚群和K+通道导致神经毒性 | 首次在单细胞水平揭示顺铂神经毒性的特异性细胞靶点，发现K2P18.1钾通道在其中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本验证；维生素E的保护作用有限 | 探究顺铂化疗引起的外周神经病变的细胞机制 | 小鼠酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 | 神经科学 | 化疗引起的周围神经病变 | 单细胞转录组测序,电生理分析 | NA | 转录组数据,电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Sox13 is a novel flow-sensitive transcription factor that prevents inflammation by repressing chemokine expression in endothelial cells
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.979745
PMID:36247423
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术发现SOX13是一种新型流动敏感转录因子，能够抑制内皮细胞中炎症趋化因子的表达 | 首次鉴定SOX13为流动敏感转录因子，并揭示其在稳定血流条件下抑制内皮细胞炎症反应的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养的人主动脉内皮细胞，需要在更复杂的体内环境中进一步验证 | 探索血流动力学调节内皮细胞炎症反应的分子机制，寻找新的动脉粥样硬化治疗靶点 | 小鼠颈动脉模型和培养的人主动脉内皮细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, RNA干扰, RNA测序, qPCR, ELISA | 小鼠部分颈动脉结扎模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Universal prediction of cell-cycle position using transfer learning
2022-01-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02581-y
PMID:35101061
|
研究论文 | 开发了一种名为tricycle的R/Bioconductor软件包，通过迁移学习实现细胞周期位置的通用预测 | 利用细胞周期生物学特性、周期性函数主成分分析的数学特性和迁移学习，克服了数据集依赖嵌入的学习限制 | NA | 从单细胞RNA-seq数据高分辨率推断细胞周期位置 | 细胞周期 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习，主成分分析 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Enhanced single-cell RNA-seq workflow reveals coronary artery disease cellular cross-talk and candidate drug targets
2022-01, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 开发了一个增强的单细胞RNA测序分析工作流程，用于研究冠状动脉疾病的细胞相互作用和潜在药物靶点 | 整合了自动化细胞标记、伪时序排序、配体-受体评估和药物-基因相互作用分析的用户友好型工作流程，并开发了交互式网络应用PlaqView | 基于已发表的单细胞数据集进行二次分析，需要进一步实验验证 | 开发单细胞RNA测序分析工作流程以研究动脉粥样硬化斑块微环境和发现潜在治疗方法 | 人类冠状动脉单细胞数据集中的细胞类型，特别是平滑肌细胞来源的成纤维样细胞 | 单细胞分析 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时序分析，配体-受体相互作用分析 | 单细胞RNA测序数据 | 基于Wirka等人先前发表的人类冠状动脉单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
MUC1-C integrates type II interferon and chromatin remodeling pathways in immunosuppression of prostate cancer
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2029298
PMID:35127252
|
研究论文 | 本研究揭示MUC1-C蛋白通过整合II型干扰素通路和染色质重塑机制促进前列腺癌免疫抑制 | 首次发现MUC1-C通过调控ARID1A/BAF和NuRD复合物协调II型干扰素通路与染色质重塑的机制关联 | 研究主要基于细胞模型和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 阐明MUC1-C在前列腺癌免疫抑制中的分子机制 | 去势抵抗性前列腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Deep learning tackles single-cell analysis-a survey of deep learning for scRNA-seq analysis
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab531
PMID:34929734
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综述 | 本文系统综述了深度学习在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 建立了变分自编码器、自编码器、生成对抗网络和监督深度学习模型的统一数学表示框架，并关联模型损失函数与数据处理步骤的具体目标 | 仅涵盖25种深度学习算法，未涉及所有现有方法 | 为单细胞RNA测序数据分析提供深度学习算法的系统综述和选择指南 | 单细胞RNA测序数据处理流程中的深度学习算法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 自编码器, 生成对抗网络, 监督深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Mechanotherapy Reprograms Aged Muscle Stromal Cells to Remodel the Extracellular Matrix during Recovery from Disuse
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqac015
PMID:35434632
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现机械疗法能够重编程衰老肌肉基质细胞，促进废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 首次揭示机械疗法通过调节衰老肌肉中基质细胞的基因表达模式，使其更接近年轻肌肉状态，从而促进细胞外基质重塑 | 研究主要基于大鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 探究机械疗法是否能够促进衰老肌肉在废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 成年和老年大鼠的腓肠肌单核细胞 | 单细胞转录组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序，同位素示踪，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学图像数据 | 成年和老年大鼠腓肠肌单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |