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当前共找到 1167 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-08 |
Cytokine and Nitric Oxide-Dependent Gene Regulation in Islet Endocrine and Nonendocrine Cells
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqab063
PMID:34927076
|
研究论文 | 本文探讨了细胞因子及一氧化氮在胰岛内分泌和非内分泌细胞中的基因调控作用 | 提出细胞因子信号在生理上有保护β细胞免受多种环境压力的作用，并通过单细胞RNA测序验证了这一假设 | NA | 研究细胞因子和一氧化氮在胰岛内分泌细胞中的保护作用及其机制 | 小鼠胰岛细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胰岛细胞在18小时细胞因子暴露后的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2026-08-25 |
IDEAS: individual level differential expression analysis for single-cell RNA-seq data
2022-01-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02605-1
PMID:35073995
|
研究论文 | 提出一种针对单细胞RNA测序数据的个体水平差异表达分析方法IDEAS，用于比较两组个体间的基因表达差异 | 首提个体水平差异表达分析方法，通过汇总每个个体的基因表达分布来比较组间差异，适用于多个体单细胞RNA测序数据 | 未提及具体局限性 | 开发一种统计方法，以识别两组个体之间差异表达的基因 | 自闭症患者与对照组、轻症与重症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 自闭症、COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-08-21 |
B7H3-dependent myeloid-derived suppressor cell recruitment and activation in pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.901349
PMID:36045668
|
研究论文 | 本研究探讨了B7H3依赖性髓源性抑制细胞在肺纤维化中的募集与激活作用 | 首次揭示B7H3通过促进MDSC的扩增和募集，进而激活肌成纤维细胞分化，加重肺纤维化的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本量有限，需进一步验证 | 探究MDSCs在特发性肺纤维化中的作用及其依赖B7H3的调控机制 | 特发性肺纤维化患者外周血样本及小鼠肺纤维化模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 特发性肺纤维化患者外周血样本和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 4 | 2026-08-18 |
STtools: A Comprehensive Software Pipeline for Ultra-high Resolution Spatial Transcriptomics Data
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac061
PMID:36284674
|
研究论文 | 开发了STtools软件管道，用于处理超高通量空间转录组数据，支持多种分辨率并自动进行下游分析。 | 提供可扩展的框架，能处理亚微米分辨率的超高通量空间转录组数据，且不降低分辨率。 | 未提及具体局限性。 | 满足对具有计算可扩展性且不损失分辨率的亚微米分辨率空间转录组数据分析工具的新需求。 | 空间转录组数据集，包括Seq-Scope、Slide-seq和VISIUM等平台产生的数据。 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据及原始FASTQ文件 | NA | NA | 空间转录组学 | Seq-Scope, Slide-seq, VISIUM | NA |
| 5 | 2026-08-17 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis
2022-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01006-2
PMID:34489600
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和单细胞转录组数据，揭示了小鼠器官发生过程中的细胞类型和分化模式 | 采用基于图像的单细胞转录组方法seqFISH，结合空间上下文和多路转录测量，实现了未能直接测序基因的空间表达推断，并发现了单细胞RNA测序无法揭示的细胞分化轴，如食管和气管祖细胞的早期背腹分离 | 摘要未提及局限性 | 通过空间和单细胞转录组数据整合，研究小鼠器官发生中的细胞命运决定 | 小鼠胚胎（8-12体节阶段）的组织切片 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 不适用 | seqFISH、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠胚胎组织切片，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | seqFISH检测387个目标基因的mRNA，并结合两个单细胞转录组图谱 |
| 6 | 2026-08-17 |
An immunodominant NP105-113-B*07:02 cytotoxic T cell response controls viral replication and is associated with less severe COVID-19 disease
2022-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-01084-z
PMID:34853448
|
研究论文 | 研究NP105-113-B*07:02特异性CD8 T细胞反应与COVID-19轻症关联，并揭示其抗病毒效应和持久性 | 首次将功能性亲和力、抗病毒效力和T细胞受体使用、转录组特征及疾病严重程度相关联，发现该T细胞反应与轻症相关，且对多个变异株保持抗病毒效力 | 未提及具体局限性 | 探究NP-B*07:02特异性CD8 T细胞反应在COVID-19疾病进展中的保护作用及其机制 | SARS-CoV-2感染者的NP-B*07:02特异性T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 急性期77例，恢复期52例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-08-03 |
Subsets of Tissue CD4 T Cells Display Different Susceptibilities to HIV Infection and Death: Analysis by CyTOF and Single Cell RNA-seq
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.883420
PMID:35784348
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了人扁桃体组织中不同CD4 T细胞亚群对HIV感染和细胞死亡的敏感性差异 | 首次通过整合质谱流式细胞术和单细胞RNA-seq技术，揭示了HIV优先杀伤的CD4 T细胞亚群与优先感染的亚群在表型和基因表达上的差异，并强调了无效感染和焦亡在CD4 T细胞耗竭中的重要作用 | 研究仅基于人扁桃体组织样本，可能无法完全代表其他组织或外周血中的CD4 T细胞亚群反应 | 明确不同CD4 T细胞亚群对HIV感染和死亡的敏感性，并探索其潜在机制 | 人扁桃体组织中的CD4 T淋巴细胞及其不同亚群 | 免疫学、单细胞组学 | HIV感染 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式细胞术数据 | 人扁桃体组织样本（具体数量未提供） | Fluidigm、10x Genomics | 质谱流式细胞术、单细胞RNA-seq | CyTOF、10x Chromium | 质谱流式细胞术（CyTOF）和10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 8 | 2026-06-02 |
BASiCS workflow: a step-by-step analysis of expression variability using single cell RNA sequencing data
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.74416.2
PMID:38779464
|
研究论文 | 提供使用BASiCS Bioconductor包对单细胞RNA测序数据进行表达变异分析的逐步计算流程 | 集成框架同时处理数据标准化、技术噪声量化和下游分析，并通过概率决策规则识别细胞群间表达变异的变化，避免技术噪声和整体丰度差异的混淆效应 | 需要用户熟悉R语言和Bioconductor生态，且依赖Docker镜像确保可重复性，可能对非计算背景用户存在门槛 | 开发并指导用户使用BASiCS方法稳健量化单细胞RNA测序数据中的表达变异性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率模型 | 基因表达数据 | 使用公开数据集作为示例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-06-01 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
|
研究论文 | 优化分散胰岛细胞的冻存方法，并通过单细胞转录组分析验证其功能完整性 | 提出了一种优化的梯度冷冻方法，能够维持冻存后分散胰岛细胞的膜完整性、分子和功能表型，为糖尿病研究和细胞治疗提供了可靠细胞来源 | 未提及冻存过程中可能存在的细胞亚群偏好性损伤或长期稳定性数据 | 优化分散胰岛细胞的冻存技术，获得可用于单细胞转录组研究的活性细胞 | 分散的人胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类胰岛细胞样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-05-28 |
The landscape of human tissue and cell type specific expression and co-regulation of senescence genes
2022-01-09, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00507-7
PMID:35000600
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研究论文 | 对人类组织及细胞类型中衰老基因的表达与共调控网络进行了系统分析 | 首次通过整合网络分析揭示健康人类组织中衰老基因的共表达模块和细胞类型特异性 | 主要依赖公开数据库，未进行实验验证；对衰老细胞在组织中的实际分布缺乏直接证据 | 阐明人类组织中衰老基因的共表达模式及其细胞类型特异性 | 健康人类组织中的衰老基因及其在不同细胞类型中的表达特征 | 机器学习和生物信息学 | 衰老相关疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 基因共表达网络分析 | 转录组数据 | 50个人体组织的GTEx队列数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-05-28 |
Caspases and therapeutic potential of caspase inhibitors in moderate-severe SARS-CoV-2 infection and long COVID
2022-01, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14907
PMID:33993490
|
研究论文 | 研究半胱天冬酶在中度至重症SARS-CoV-2感染及长新冠中的表达及其抑制剂的治疗潜力 | 首次在单细胞水平揭示COVID-19患者免疫细胞中半胱天冬酶的独特表达模式，并发现泛半胱天冬酶抑制剂可减轻长新冠患者CD4+ T细胞中caspase-1活性 | 初步结果需进一步临床相关性验证，样本量有限可能影响结论普适性 | 探索半胱天冬酶在COVID-19疾病谱中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | COVID-19急性期和恢复期患者血液细胞，以及伴有合并症的非COVID-19对照组 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | COVID-19患者及非COVID-19对照者血液样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于免疫细胞转录组分析 |
| 12 | 2026-05-17 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
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研究报告 | 通过纵向分析一名重症COVID-19患者的血浆蛋白质组和外周血单细胞转录组，揭示了从重症到康复过程中的关键生物学变化 | 首次结合无偏倚血浆蛋白质组学和单细胞转录组学纵向追踪COVID-19患者从重症到完全康复的生物学动态，特别是发现了一类具有高度干扰素应答和降低TNF-α信号的单核细胞亚群在康复后消失 | 仅基于单一个案报告，样本量有限，结果需要更大规模研究验证 | 阐明COVID-19患者从重症到完全康复过程中的关键生物学动态 | 一名接受恢复期血浆输注的重症COVID-19患者 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 蛋白质组学和转录组学数据 | 1例重症COVID-19患者 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于外周血单细胞转录组分析 |
| 13 | 2026-04-24 |
MOCA for Integrated Analysis of Gene Expression and Genetic Variation in Single Cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.831040
PMID:35432484
|
研究论文 | 提出MOCA软件，用于联合分析单细胞RNA测序数据中的基因表达与遗传变异 | 首次实现单细胞层面基因表达与遗传变异的联合一致性分析，识别收敛和发散表达模式 | 未提及具体局限性 | 开发分析工具以探究体细胞变异对基因表达模式演化的影响 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达与遗传变异 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-04-19 |
Proteomic and Single-Cell Transcriptomic Dissection of Human Plasmacytoid Dendritic Cell Response to Influenza Virus
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.814627
PMID:35401570
|
研究论文 | 本文通过蛋白质组学和单细胞转录组学技术，全面解析了人类浆细胞样树突状细胞对流感病毒的反应 | 首次报告了pDC在生理刺激下的全面无偏分泌组分析，并结合单细胞RNA-seq揭示了pDC的异质性和激活后的功能特化 | 研究仅针对流感H1N1病毒，未涵盖其他病毒或刺激条件，且样本来源和数量可能有限 | 研究人类浆细胞样树突状细胞在基线和流感病毒刺激下的分子特征和功能异质性 | 人类浆细胞样树突状细胞 | 免疫学 | 流感 | LC-MS/MS, 单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-04-17 |
Molecular Computational Anatomy: Unifying the Particle to Tissue Continuum via Measure Representations of the Brain
2022, BME frontiers
IF:5.0Q1
DOI:10.34133/2022/9868673
PMID:37206893
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研究论文 | 本文提出了一种基于几何测度表示的分子计算解剖学理论，用于统一大脑映射中空间转录组学和细胞尺度组织学与组织尺度的计算解剖学 | 引入几何varifold测度和统计力学方法，首次将分子尺度的确定性粒子描述与组织尺度的统计集合统一起来，实现从分子到组织尺度的无缝过渡 | 未明确说明实验验证或具体应用案例，理论框架的实践可行性有待进一步探索 | 统一大脑映射中的分子尺度（如空间转录组学）和组织尺度（如计算解剖学）表示，以理解大脑的结构和功能特性 | 大脑的分子、细胞和组织尺度结构，包括蛋白质、转录组功能身份、电生理学、分子组织学等 | 计算解剖学 | NA | 空间转录组学、数字病理学、分子组织学、电生理学 | 几何varifold测度、统计力学模型 | 分子数据、图像数据、功能状态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-03-14 |
Genetic and Transcriptional Contributions to Relapse in Normal Karyotype Acute Myeloid Leukemia
2022-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-21-0050
PMID:35019859
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研究论文 | 本研究通过增强全基因组测序和深度覆盖单细胞RNA测序，分析了六例正常核型急性髓系白血病患者的初诊和复发样本，以探究复发后的克隆和转录适应机制 | 首次在相同样本中结合增强全基因组测序和深度覆盖单细胞RNA测序，实现了在单个细胞中识别表达突变，揭示了遗传和转录异质性的共同演化，并发现了一种具有干细胞性、静止性和粘附性标记的复发富集白血病细胞状态 | 样本量较小（仅六例），可能限制结果的普遍性，且未明确说明技术平台的具体配置细节 | 探究急性髓系白血病复发过程中克隆和转录适应的机制，以理解基因组、转录组和免疫微环境的相互作用 | 六例正常核型急性髓系白血病患者的初诊和复发样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 增强全基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据，单细胞转录组数据 | 6例患者样本，共142,642个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-03-06 |
Allelic variation in class I HLA determines CD8+ T cell repertoire shape and cross-reactive memory responses to SARS-CoV-2
2022-01-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abk3070
PMID:34793243
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研究论文 | 本研究应用单细胞多组学技术，分析了四种主要HLA I类等位基因下CD8 T细胞对SARS-CoV-2的应答特征 | 首次统一表征了不同HLA I类等位基因如何影响CD8 T细胞对SARS-CoV-2的表位特异性、TCR多样性和记忆T细胞库的利用 | 仅关注了四种主要HLA I类等位基因，可能未涵盖所有遗传变异的影响 | 探究HLA I类等位基因变异如何塑造CD8 T细胞对SARS-CoV-2的免疫应答和记忆反应 | SARS-CoV-2感染相关的CD8 T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞多组学技术 | NA | 单细胞转录组和TCR序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及四种HLA I类等位基因的CD8 T细胞分析 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-03-06 |
IL-17 Producing Lymphocytes Cause Dry Eye and Corneal Disease With Aging in RXRα Mutant Mouse
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.849990
PMID:35402439
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研究论文 | 本研究探讨了RXRα突变小鼠中IL-17相关机制在干眼病发展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合流式细胞术和共聚焦显微镜，揭示了RXRα突变导致γδ T细胞中IL-17表达增加，从而促进干眼病发展的机制 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且未探讨其他免疫细胞类型在干眼病中的潜在作用 | 研究RXRα突变小鼠中IL-17相关机制如何导致干眼病和角膜疾病 | Pinkie小鼠（RXRα功能缺失突变）和野生型C57BL/6小鼠的角膜、结膜组织及免疫细胞 | 数字病理学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | Pinkie小鼠和野生型C57BL/6小鼠的角膜和结膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-02-17 |
Single-cell profiling reveals distinct subsets of CD14+ monocytes drive blood immune signatures of active tuberculosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087010
PMID:36713384
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了CD14+单核细胞的不同亚群在活动性结核病血液免疫特征中的独特作用 | 首次证明中间型和经典单核细胞各自贡献于活动性结核病的血液免疫特征，并识别了新的亚群和相关基因特征 | 样本量有限，仅包括活动性结核病患者和健康对照，未涵盖潜伏感染或其他疾病状态 | 探究单核细胞在活动性结核病血液免疫特征中的作用 | 活动性结核病患者在诊断和治疗中期的配对血液样本以及健康对照 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 活动性结核病患者和健康对照的配对血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-02-17 |
MAP4K3/GLK inhibits Treg differentiation by direct phosphorylating IKKβ and inducing IKKβ-mediated FoxO1 nuclear export and Foxp3 downregulation
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72148
PMID:35966593
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研究论文 | 本文探讨了GLK（MAP4K3）通过直接磷酸化IKKβ并诱导FoxO1核输出，从而抑制Treg分化的分子机制 | 揭示了GLK在PKCθ非依赖方式下直接磷酸化IKKβ Ser733位点的新机制，并建立了GLK-IKKβ-FoxO1信号轴调控Foxp3转录的完整通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；单细胞RNA测序样本量有限 | 阐明GLK/IKKβ信号轴在调节性T细胞（Treg）分化和功能中的作用机制 | T细胞特异性GLK转基因小鼠和IKKβ条件性敲除小鼠的CD4 T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 染色质免疫沉淀、报告基因检测、激酶检测、蛋白质互作检测、质谱分析、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质互作数据、磷酸化数据 | 转基因小鼠和条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |