单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 229 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
Besca, a single-cell transcriptomics analysis toolkit to accelerate translational research
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab102
PMID:34761219
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Besca的单细胞转录组分析工具包，旨在加速转化研究 | Besca工具包不仅提供标准的单细胞RNA测序分析流程，还包括两个互补模块，利用层次化细胞签名和监督机器学习自动进行细胞注释，并提供协调的命名法 | NA | 旨在通过高度标准化和稳健的软件工作流程，利用单细胞RNA测序技术加速转化研究 | 单细胞RNA测序数据及其在批量RNA测序数据中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 监督机器学习 | 转录组数据 | 多个多样化的单细胞RNA测序数据集，包括来自高度异质性肿瘤组织的样本 |
| 162 | 2024-08-08 |
Capturing tumour heterogeneity in pre- and post-chemotherapy colorectal cancer ascites-derived cells using single-cell RNA-sequencing
2021-12-22, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20212093
PMID:34708245
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了结直肠癌患者腹水来源细胞在化疗前后的肿瘤异质性 | 首次展示了单细胞分辨率下高度异质性的癌症亚群对特定化疗治疗的不同反应 | NA | 探索和表征结直肠癌患者腹水来源细胞的肿瘤异质性 | 结直肠癌患者腹水来源细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 19,653个细胞来自四个样本 |
| 163 | 2024-08-08 |
Transcriptional landscape associated with TNBC resistance to neoadjuvant chemotherapy revealed by single-cell RNA-seq
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.09.002
PMID:34703883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了超过5000个来自四名响应者和四名非响应者的单细胞转录组数据，揭示了三阴性乳腺癌（TNBC）对新辅助化疗（NAC）耐药的转录组图谱 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了TNBC对NAC耐药的转录组图谱，并通过多变量生存分析确定了预测无复发生存的三个基因特征 | 本研究仅基于公开的转录组数据进行分析，未来需要进一步的实验验证和临床研究来确认这些发现 | 揭示三阴性乳腺癌对新辅助化疗耐药的机制，并寻找潜在的治疗靶点和预后标志物 | 三阴性乳腺癌（TNBC）对新辅助化疗（NAC）的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过5000个单细胞，来自四名响应者和四名非响应者 |
| 164 | 2024-08-08 |
Monitoring CAR T cell generation with a CD8-targeted lentiviral vector by single-cell transcriptomics
2021-Dec-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.09.019
PMID:34729382
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研究论文 | 本研究设计了一种单细胞RNA测序方法，用于监测通过慢病毒载体递送CD19-CAR基因的过程 | 本研究揭示了三模态表达模式，并提出了一种基于分布的识别CAR T细胞和CD8+淋巴细胞的方法 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术监测CAR T细胞的生成过程 | 研究对象为通过慢病毒载体暴露的人类供体外周血单个核细胞 | 基因工程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 评估了400个与免疫反应相关的基因，包括特定于慢病毒载体的探针 |
| 165 | 2024-08-08 |
Mitochondrial metabolism coordinates stage-specific repair processes in macrophages during wound healing
2021-12-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.10.004
PMID:34715039
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研究论文 | 本文研究了在伤口愈合过程中，巨噬细胞在不同阶段的线粒体代谢变化及其对修复过程的影响 | 首次揭示了线粒体代谢在伤口愈合不同阶段对巨噬细胞功能的关键调控作用 | 研究仅在老鼠皮肤伤口模型中进行，可能需要进一步在其他物种或人体中验证 | 探讨线粒体代谢在伤口愈合过程中对巨噬细胞功能的调控机制 | 早期和晚期伤口愈合阶段的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序分析 | NA | 转录组数据 | 老鼠皮肤伤口模型中的巨噬细胞 |
| 166 | 2024-08-08 |
A novel approach to identify the mechanism of miR-145-5p toxicity to podocytes based on the essential genes targeting analysis
2021-Dec-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.09.005
PMID:34729245
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研究论文 | 本文探讨了miR-145-5p对足细胞的毒性机制，通过分析其对足细胞关键基因的影响 | 本研究提供了一种新的方法来研究miRNA如何影响特定细胞类型，不仅识别miRNA药物副作用的分子机制，还能预测miRNA药物对各种细胞类型的毒性 | NA | 探索miR-145-5p对足细胞的毒性机制 | miR-145-5p对足细胞的影响及其关键基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 正常控制小鼠 |
| 167 | 2024-08-08 |
Mesenchymal stem cell treatment improves outcome of COVID-19 patients via multiple immunomodulatory mechanisms
2021-12, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00573-y
PMID:34702946
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研究论文 | 本研究通过随机单盲安慰剂对照的II期临床试验，验证了间充质干细胞（MSCs）治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了MSCs治疗COVID-19患者时，能够调动一种新型VNN2造血干细胞/祖细胞样（HSPC-like）细胞，并调节多种免疫细胞的功能 | NA | 验证间充质干细胞治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | COVID-19患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液 | 每个组29名患者 |
| 168 | 2024-08-08 |
[Protective macrophages : New insights into the role of synovial macrophages in inflammatory joint diseases]
2021-Dec, Zeitschrift fur Rheumatologie
IF:0.9Q4
DOI:10.1007/s00393-021-01112-1
PMID:34705071
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研究论文 | 本文探讨了滑膜巨噬细胞在炎症性关节疾病中的保护作用和抗炎功能 | 利用单细胞测序和高级显微技术，揭示了巨噬细胞在组织稳态和组织再生中的多功能性，并发现了在滑膜组织中具有保护和抗炎作用的特殊上皮样巨噬细胞群体 | NA | 研究巨噬细胞在慢性炎症疾病中的作用，特别是其在类风湿性关节炎中的保护功能 | 巨噬细胞及其在炎症性关节疾病中的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing analysis of the ciliary epithelium and contiguous tissues in the mouse eye
2021-12, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2021.108811
PMID:34717927
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠眼中睫状上皮及其邻近组织的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了睫状上皮及其邻近组织的细胞类型和转录组特征 | 约一半的测序细胞来自邻近的视网膜，而非专门分离的睫状体 | 研究睫状上皮及其邻近组织的细胞类型和转录组特征 | 小鼠眼中的睫状上皮及其邻近组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 10,024个细胞 |
| 170 | 2024-08-08 |
Expression of chimeric antigen receptor therapy targets detected by single-cell sequencing of normal cells may contribute to off-tumor toxicity
2021-12-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.09.016
PMID:34678153
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-08 |
Diversity and convergence within peripheral glia development
2021-12, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2021.10.004
PMID:34689995
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了外周神经胶质细胞在发育过程中的多样性变化，并识别了成熟神经胶质细胞间的统一遗传特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了外周神经胶质细胞发育过程中的多样性和统一遗传特征 | NA | 探究外周神经胶质细胞的发育过程及其功能 | 外周神经胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 172 | 2024-08-08 |
Untimely TGFβ responses in COVID-19 limit antiviral functions of NK cells
2021-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04142-6
PMID:34695836
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研究论文 | 研究探讨了COVID-19中NK细胞功能受TGFβ反应影响的机制 | 揭示了TGFβ在严重COVID-19中异常产生，抑制NK细胞功能的现象 | NA | 探究COVID-19中NK细胞功能受限的原因 | COVID-19患者的NK细胞及TGFβ反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19患者的血清样本 |
| 173 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of the In Vivo Dynamics of Host Circulating Immune Cells Highlights the Importance of Myeloid Cells in Avian Flaviviral Infection
2021-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100116
PMID:34697228
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研究论文 | 本研究利用高通量单细胞转录组测序技术，构建了鸭循环免疫细胞的转录组图谱，并分析了鸭外周血白细胞（PBLks）在禽类登革病毒（TMUV）感染下的性别差异动态变化 | 首次揭示了鸭循环免疫细胞在TMUV感染下的性别差异反应，并发现了TMUV感染对鸭PBLks的性别特异性重编程 | NA | 研究鸭免疫系统与病毒的相互作用，特别是循环免疫细胞在病毒感染中的动态变化 | 鸭的循环免疫细胞及其在TMUV感染下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 14种外周血白细胞（PBLks）群体 |
| 174 | 2024-08-08 |
Cardiac Resident Macrophages Prevent Fibrosis and Stimulate Angiogenesis
2021-12-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.319737
PMID:34645281
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研究论文 | 本研究探讨了心脏常驻巨噬细胞在心脏压力超负荷早期肥大反应中的作用 | 首次证实心脏常驻免疫细胞在心脏压力超负荷早期肥大发展中的影响 | NA | 评估心脏免疫细胞在心脏压力超负荷引起的早期肥大反应中的作用 | 心脏常驻巨噬细胞在心脏压力超负荷早期肥大反应中的作用 | NA | 心血管疾病 | Cite-Seq单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4个假手术心脏和6个TAC心脏 |
| 175 | 2024-08-08 |
Tet2 deficiency in immune cells exacerbates tumor progression by increasing angiogenesis in a lung cancer model
2021-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15165
PMID:34657351
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研究论文 | 本文通过小鼠肺癌模型研究了Tet2缺陷免疫细胞在肿瘤组织中的活性，发现Tet2缺陷的髓系细胞通过增加S100a8/S100a9表达促进肿瘤血管生成，从而加剧肿瘤进展。 | 首次揭示了TET2突变通过增加S100a8/S100a9表达促进肺癌进展的机制，并提出Emmprin抗体可能作为肺癌治疗的新靶点。 | NA | 评估Tet2缺陷免疫细胞在肺癌模型中的活性及其对肿瘤进展的影响。 | 小鼠肺癌模型中的Tet2缺陷免疫细胞及其对肿瘤生长的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | 小鼠肺癌模型中的免疫细胞 |
| 176 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell genomics pipelines to discover mechanisms of stem cell differentiation
2021-12, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2021.09.006
PMID:34657800
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学方法在干细胞科学中的应用，重点讨论了通过多重单细胞分析扩大干细胞分化的策略，以及使用新的分析算法评估细胞分化的分子调控 | 本文介绍了集成和投影分析方法，用于分类和基准测试干细胞衍生物与体内细胞类型 | NA | 评估单细胞转录组学方法在干细胞科学中的应用，并讨论开发集成分析管道的策略 | 单细胞转录组学方法及其在干细胞分化研究中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 177 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironmental patterns in lung adenocarcinoma
2021-12, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-02054-3
PMID:34663877
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了十例人肺腺癌和十例正常对照组织的肿瘤微环境，揭示了两种不同的微环境模式及其与预后的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了肺腺癌的肿瘤微环境，并识别出两种具有不同预后意义的微环境模式 | 研究样本量较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 深入了解肺腺癌的肿瘤微环境特征，为精准医疗提供依据 | 肺腺癌及其正常对照组织的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十例肺腺癌和十例正常对照组织 |
| 178 | 2024-08-08 |
3D tumor angiogenesis models: recent advances and challenges
2021-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03814-0
PMID:34613483
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综述 | 本文综述了3D肿瘤血管生成模型的最新进展和面临的挑战 | 介绍了基于组织工程的肿瘤模型、血管类器官模型和器官芯片等新型3D肿瘤血管模型系统 | 现有模型多依赖于正常内皮细胞，与具有独特（表观）遗传和代谢特征的肿瘤内皮细胞有显著差异 | 旨在改进肿瘤血管模型系统，以促进个性化医疗的发展 | 肿瘤血管生成机制及其临床应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-08 |
Transcriptional and functional divergence in lateral hypothalamic glutamate neurons projecting to the lateral habenula and ventral tegmental area
2021-12-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.09.020
PMID:34624220
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研究论文 | 本研究通过病毒示踪、单细胞测序、电生理学和体内钙成像技术，系统比较了投射到外侧缰核和腹侧被盖区的外侧下丘脑谷氨酸能神经元的功能差异 | 揭示了外侧下丘脑神经元在投射到不同脑区的功能异质性，表明奖励和厌恶在不同的传出通路中被不同处理 | NA | 解析外侧下丘脑特定神经元群的功能 | 外侧下丘脑谷氨酸能神经元投射到外侧缰核和腹侧被盖区的功能差异 | 神经科学 | NA | 病毒示踪、单细胞测序、电生理学、体内钙成像 | NA | 神经元活动数据 | NA |
| 180 | 2024-08-08 |
Significance of intratumoral infiltration of B cells in cancer immunotherapy: From a single cell perspective
2021-12, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2021.188632
PMID:34626740
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综述 | 本文综述了肿瘤内浸润B细胞在癌症免疫治疗中的作用，特别是从单细胞RNA测序的角度探讨其亚群、分化轨迹及与肿瘤微环境中的其他细胞的相互作用 | 利用单细胞RNA测序技术，高分辨率动态监测肿瘤微环境在免疫治疗中的变化，揭示B细胞在抗肿瘤免疫中的独特功能 | NA | 探讨肿瘤内浸润B细胞在癌症免疫治疗中的潜在临床应用价值，作为生物标志物和治疗靶点 | 肿瘤内浸润B细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |