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当前共找到 229 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 141 | 2024-08-08 |
Optimized protocol for isolation of high-quality single cells from the female mouse reproductive tract tissues for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100970
PMID:34841281
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研究论文 | 本文描述了一种优化的协议，用于从雌性小鼠生殖道组织中分离高质量的单细胞，以进行单细胞RNA测序 | 提出了针对雌性生殖道不同区域的独特单细胞制备方法，以生成完整的分子细胞图谱 | NA | 研究正常生理和疾病状态下的分子细胞图谱 | 雌性小鼠生殖道的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 不同雌性小鼠生殖道区域的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
Protocol for scChaRM-seq: Simultaneous profiling of gene expression, DNA methylation, and chromatin accessibility in single cells
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100972
PMID:34849489
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scChaRM-seq的单细胞多组学测序技术，该技术能够同时分析单细胞中的基因表达、DNA甲基化和染色质可及性 | scChaRM-seq技术结合了单细胞RNA测序、DNA甲基化和染色质可及性分析，提供了对单细胞功能和表观遗传调控的多模态理解 | NA | 开发和应用scChaRM-seq技术以研究单个人卵细胞中的DNA甲基化及其与转录和染色质可及性的关系 | 单个人卵细胞中的DNA甲基化、转录和染色质可及性 | 基因组学 | NA | scChaRM-seq | NA | 基因表达、DNA甲基化、染色质可及性数据 | 单个人卵细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Prognostic value of metabolic signature on 18F-FDGuptake in breast cancer patients after radiotherapy
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.10.008
PMID:34853812
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研究论文 | 本研究旨在通过利用公共数据集的mRNA表达谱，识别与放射治疗后乳腺癌患者葡萄糖摄取相关的预后基因特征 | 首次构建并验证了与放射治疗后乳腺癌患者葡萄糖摄取相关的预后基因特征 | NA | 研究放射治疗后乳腺癌患者的葡萄糖摄取特征的预后价值 | 放射治疗后的乳腺癌患者 | NA | 乳腺癌 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | mRNA表达谱 | 三个放射治疗后乳腺癌队列（GSE103744、NKI和FUSCC数据库）以及五个乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Systematic temporal analysis of peripheral blood transcriptomes using TrendCatcher identifies early and persistent neutrophil activation as a hallmark of severe COVID-19
2021-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.05.04.442617
PMID:34845446
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研究论文 | 本研究开发了一个开源R包TrendCatcher，用于识别和可视化纵向转录组数据中的动态转录基因特征和生物过程 | TrendCatcher应用平滑样条ANOVA模型和断点搜索策略，优化了时间序列转录组数据的分析方法 | NA | 研究COVID-19疾病进展中的基因表达变化，以识别早期生物标志物和潜在的治疗靶点 | COVID-19患者的外周血转录组 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA-seq | 平滑样条ANOVA模型 | 转录组数据 | 包括bulk RNA-seq和scRNA-seq的时间序列数据 | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Evolution of synapses and neurotransmitter systems: The divide-and-conquer model for early neural cell-type evolution
2021-12, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2021.11.002
PMID:34826676
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综述 | 本文综述了非两侧对称动物中神经分子进化的当前理解，并通过重新分析刺胞动物的单细胞测序数据，揭示了其与两侧对称动物神经元类型的同源性证据 | 提出了Unc13-RIM神经元可能存在于最早的真后生动物中，并在两侧对称动物的进化中占据主导地位的假设 | NA | 探讨神经系统和神经递质系统的进化，特别是早期神经细胞类型的进化 | 非两侧对称动物的神经分子进化及刺胞动物与两侧对称动物神经元的同源性 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling of sequentially generated septal neuron fates
2021-12-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.71545
PMID:34851821
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序、组织学和遗传模型研究了海马神经元多样性在神经发生过程中的建立机制 | 发现海马前体细胞的转录组特征随神经发生而变化，并与不同神经元类型的生成相吻合 | NA | 探究海马神经元多样性的建立机制 | 海马神经元及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及至少三种形态学类别的神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-08 |
Optimized workflow for human PBMC multiomic immunosurveillance studies
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100900
PMID:34806044
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研究论文 | 本文详细介绍了一种用于人类外周血单个核细胞多组学免疫监测研究的优化工作流程 | 该工作流程通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序技术，减少了批次效应，提高了数据的可重复性和处理通量 | NA | 深入了解人类免疫系统在健康和疾病中的功能 | 人类外周血单个核细胞 | 数字病理学 | NA | 高维流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Absence of ERAP1 in B Cells Increases Susceptibility to Central Nervous System Autoimmunity, Alters B Cell Biology, and Mechanistically Explains Genetic Associations between ERAP1 and Multiple Sclerosis
2021-12-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100813
PMID:34810226
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研究论文 | 研究探讨了ERAP1基因在B细胞中的缺失如何增加中枢神经系统自身免疫的易感性，并揭示了ERAP1与多发性硬化症之间的遗传关联机制 | 首次通过多种小鼠模型和单细胞光谱流式细胞术，结合人类单细胞RNA测序数据的综合分析，揭示了ERAP1在B细胞中的作用及其与多发性硬化症的关联机制 | NA | 探究ERAP1基因多态性与多发性硬化症易感性增加的机制 | ERAP1基因在B细胞中的作用及其对中枢神经系统自身免疫的影响 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36个个体 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
Epigenetically associated CCL20 upregulation correlates with esophageal cancer progression and immune disorder
2021-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2021.153683
PMID:34798484
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研究论文 | 本文研究了趋化因子CCL20在食管癌中的表达及其与肿瘤进展和免疫紊乱的关系 | 首次揭示了CCL20通过表观遗传学机制上调，促进食管癌进展和免疫失调 | NA | 探讨CCL20在食管癌中的作用及其机制 | 食管癌患者的趋化因子表达及免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 独立食管癌队列及模拟人类食管鳞状细胞癌发展的鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-08 |
Transfer learning compensates limited data, batch effects and technological heterogeneity in single-cell sequencing
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab104
PMID:34805988
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研究论文 | 本文提出了一种元迁移学习方法，用于在单细胞测序数据中补偿有限数据、批次效应和技术异质性 | 通过迁移分子模式识别模型从无关领域的大数据集中学习，克服了数据稀缺和数据异质性的问题 | NA | 探索小样本数据集中的迁移学习方法，以提高分子模式识别任务的性能 | 单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 下一代测序技术 | 元迁移学习模型 | 单细胞测序数据 | 小样本数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies master regulators of neurodegeneration in SOD1 ALS iPSC-derived motor neurons
2021-12-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.10.010
PMID:34767750
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，分析了来自SOD1 E100G ALS患者诱导多能干细胞（iPSCs）分化出的运动神经元的功能障碍途径 | 本研究首次揭示了SMAD2作为TGF-β信号通路的下游介质，在SOD1 iPSC衍生运动神经元退化中的关键作用，并指出TGFβ信号激活可能是多种ALS亚型共有的机制 | NA | 揭示ALS中运动神经元退化的分子机制 | SOD1 E100G ALS患者的iPSC衍生运动神经元及其同源对照 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
A non-classical monocyte-derived macrophage subset provides a splenic replication niche for intracellular Salmonella
2021-12-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.10.015
PMID:34788598
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研究论文 | 研究了单核吞噬细胞与胞内沙门氏菌在早期系统性感染中的相互作用，并描述了脾脏中细菌控制和复制的动态过程 | 首次描述了CD9阳性巨噬细胞在脾脏中为胞内沙门氏菌提供复制环境，并揭示了非经典单核细胞来源的巨噬细胞在感染中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨胞内沙门氏菌与单核吞噬细胞相互作用对感染结果的影响 | 胞内沙门氏菌、单核吞噬细胞、巨噬细胞亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of human non-small cell lung cancer lesions refines tumor classification and patient stratification
2021-12-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.10.009
PMID:34767762
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了35例早期非小细胞肺癌（NSCLC）病灶中的361,929个细胞，识别出一个由PDCD1CXCL13活化T细胞、IgG浆细胞和SPP1巨噬细胞组成的肺癌激活模块（LCAM），并探讨了其与肿瘤突变负荷（TMB）和免疫治疗反应的关系 | 首次识别并验证了肺癌激活模块（LCAM），并发现其与TMB、癌症睾丸抗原和TP53突变相关，可能作为免疫治疗反应的非冗余生物标志物 | NA | 探索非小细胞肺癌中免疫细胞组成与肿瘤基因型之间的关系，以及其对免疫治疗反应的影响 | 早期非小细胞肺癌病灶中的免疫细胞和基因型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 35例早期非小细胞肺癌病灶中的361,929个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-08 |
Dynamic regulatory networks of T cell trajectory dissect transcriptional control of T cell state transition
2021-Dec-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.10.011
PMID:34786214
|
研究论文 | 本研究基于非小细胞肺癌中的T细胞单细胞转录组数据，提出了一种构建动态调控网络的方法，以解析T细胞状态转换的过程 | 本研究揭示了T细胞状态转换过程中频繁的调控交互重连，并进一步细化了介导每个状态转换的关键调控因子 | NA | 探究T细胞状态转换的分子调控机制 | T细胞在非小细胞肺癌中的功能状态转换 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组 | 动态调控网络 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Comprehensive analyses of bioinformatics applications in the fight against COVID-19 pandemic
2021-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
review | 本文全面总结了基于现有报告的生物信息学技术在COVID-19相关研究中的重要方法和应用 | 利用生物信息学方法，如下一代测序(NGS)和第三代测序(TGS)技术，分子动力学模拟，分子对接和人工智能(AI)技术，加速了病毒检测、药物开发和疫苗研究 | NA | 深入理解新冠病毒的基因组和蛋白质特征，临床诊断，致病机制，以及抗病毒药物和疫苗的开发 | 新冠病毒的基因组和蛋白质特征，临床诊断，致病机制，抗病毒药物和疫苗 | bioinformatics | COVID-19 | NGS, TGS, molecular dynamics simulation, molecular docking, AI | NA | genome sequence, protein structure | 超过228 million COVID-19感染病例 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
Computational workflow for functional characterization of COVID-19 through secondary data analysis
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100873
PMID:34746856
|
研究论文 | 本文介绍了一种计算异构数据集成和挖掘协议，用于通过结合多个模型系统的转录组签名、蛋白质-蛋白质相互作用、单细胞RNA-seq标记和表型-基因型关联来识别功能特征复合体，以更好地理解疾病病理生理学和结果。 | 该研究提出了一种新的计算方法，通过整合多种数据类型来识别功能特征复合体，这种方法在标准转录组分析的基础上提供了更深入的分子机制洞察。 | NA | 旨在通过次级数据分析来功能性地表征COVID-19，并揭示其背后的分子机制。 | COVID-19的功能特征及其相关分子机制。 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Dissociation of human oral mucosal tissue for single-cell applications
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100908
PMID:34746866
|
研究论文 | 本文描述了一种用于制备和分离人类颊部和牙龈口腔黏膜组织的高存活率单细胞悬浮液的协议 | 提出了一种新的方法来分离口腔黏膜组织中的多种细胞类型，同时保持高细胞存活率 | NA | 开发一种有效的口腔黏膜组织单细胞分离方法 | 人类颊部和牙龈的口腔黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
Processing human lymph node samples for single-cell assays
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100914
PMID:34746869
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研究论文 | 本文描述了一种高效且温和的人体淋巴结样本处理方法，用于生成适合单细胞分析的单细胞悬浮液 | 该协议避免了酶促或机械应力，优化了生成适合单细胞RNA测序等精细分析的单细胞悬浮液 | NA | 为了更好地理解恶性与非恶性细胞之间的细胞异质性和复杂相互作用 | 人体淋巴结样本 | 数字病理学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞悬浮液 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptional Changes in Neurodegenerative Diseases
2021-12-15, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和单核RNA测序技术在神经退行性疾病分子变化研究中的最新进展和发现 | 利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术，提供了脑细胞在单细胞水平上的细胞和分子细节，增进了对中枢神经系统的理解 | NA | 探讨神经退行性疾病的分子变化及其机制 | 神经退行性疾病中的单细胞转录变化 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
A multi-omic single-cell landscape of human gynecologic malignancies
2021-12-02, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2021.10.013
PMID:34739872
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研究论文 | 本文通过单细胞分辨率下的转录组（scRNA-seq）和染色质可及性（scATAC-seq）分析，揭示了人类卵巢和子宫内膜肿瘤的复杂细胞异质性及其调控机制。 | 本文首次展示了恶性细胞通过获取先前未注释的调控元件来驱动癌症标志性通路，并强调了肿瘤内异质性的重要性。 | NA | 旨在解析驱动癌细胞转录程序的调控机制，以深入理解肿瘤生物学。 | 人类卵巢和子宫内膜肿瘤。 | 数字病理学 | 妇科恶性肿瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 立即手术切除的人类卵巢和子宫内膜肿瘤样本。 | NA | NA | NA | NA |