单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 229 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
Delineation of colorectal cancer ligand-receptor interactions and their roles in the tumor microenvironment and prognosis
2021-12-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-021-03162-0
PMID:34876143
|
研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌中单细胞RNA测序数据，揭示了配体-受体相互作用的模式及其在肿瘤微环境和预后中的作用 | 本研究通过深入分析现有的配体-受体对，为结直肠癌亚型分类提供了新思路，为结直肠癌患者提供了一种新的风险筛查工具，并发现了潜在的配体-受体对目标和治疗途径 | NA | 研究配体-受体相互作用在结直肠癌中的模式及其对肿瘤微环境和临床价值的影响 | 结直肠癌中的配体-受体相互作用及其在肿瘤微环境和预后中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 55,539个单细胞RNA测序样本来自29名结直肠癌患者和1411名结直肠癌患者的三个批量RNA-seq数据集 |
| 122 | 2024-08-08 |
Traditional chinese medicine syndromes classification associates with tumor cell and microenvironment heterogeneity in colorectal cancer: a single cell RNA sequencing analysis
2021-Dec-07, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-021-00547-7
PMID:34876190
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结直肠癌中肿瘤细胞和微环境的异质性与中医证候分类的相关性 | 首次探讨了结直肠癌中肿瘤异质性与中医证候分类的关系，并揭示了不同证候分类下的肿瘤细胞特征基因和基因共表达网络 | 研究样本量较小，仅涉及11个原发性结直肠癌肿瘤，可能影响结果的普遍性 | 探讨结直肠癌中肿瘤异质性与中医证候分类的相关性和意义 | 结直肠癌中的肿瘤细胞和微环境异质性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11个原发性结直肠癌肿瘤，共662个细胞 |
| 123 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic identified HIF1A as a target for attenuating acute rejection after heart transplantation
2021-12-06, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-021-00904-5
PMID:34870762
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探索了心脏移植后急性排斥反应中免疫细胞的代谢变化，并发现HIF1A作为潜在的治疗靶点 | 首次揭示了心脏移植后急性排斥反应中免疫细胞代谢的变化，并确定了HIF1A作为调节免疫代谢的新治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证HIF1A抑制剂的效果 | 探索心脏移植后急性排斥反应的新治疗靶点 | 心脏移植后的急性排斥反应及免疫细胞代谢 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 共分析了46,040个细胞，包括20种免疫细胞亚型 |
| 124 | 2024-08-08 |
Single cell sequencing analysis identifies genetics-modulated ORMDL3+ cholangiocytes having higher metabolic effects on primary biliary cholangitis
2021-Dec-06, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-021-01154-2
PMID:34872583
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研究论文 | 本研究通过构建计算框架整合GWAS和scRNA-seq数据，揭示了遗传因素调控的胆管细胞亚群在原发性胆管炎中的作用 | 首次将遗传信息与单细胞测序数据整合，解析遗传因素对原发性胆管炎风险的影响 | NA | 研究遗传因素对原发性胆管炎中肝脏细胞及其免疫微环境的影响 | 原发性胆管炎中的胆管细胞 | 数字病理学 | 原发性胆管炎 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Azvudine is a thymus-homing anti-SARS-CoV-2 drug effective in treating COVID-19 patients
2021-12-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00835-6
PMID:34873151
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研究论文 | 本文研究了阿兹夫定（FNC）作为一种胸腺归巢抗SARS-CoV-2药物，对COVID-19患者的治疗效果 | 发现FNC不仅抑制HIV-1 RNA依赖的RNA聚合酶，还能有效抑制SARS-CoV-2和HCoV-OC43冠状病毒，并具有胸腺归巢特性 | 临床试验样本量较小，且为单臂试验，需要进一步的大规模双盲随机对照试验来验证其疗效和安全性 | 评估阿兹夫定作为COVID-19治疗药物的有效性和安全性 | COVID-19患者和SARS-CoV-2感染的猕猴 | NA | COVID-19 | NA | NA | NA | 临床试验涉及31名COVID-19患者 |
| 126 | 2024-08-08 |
Gene biomarker prediction in glioma by integrating scRNA-seq data and gene regulatory network
2021-12-04, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-01115-6
PMID:34863158
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和基因调控网络，探索胶质瘤的分子机制并预测基因生物标志物 | 提出了一种算法框架，通过整合单细胞基因表达谱和基因调控关系来探索胶质瘤的分子机制 | NA | 探索胶质瘤的分子机制并预测基因生物标志物 | 胶质瘤的分子机制和基因生物标志物 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个胶质瘤样本中的恶性细胞 |
| 127 | 2024-08-08 |
Ground tissue circuitry regulates organ complexity in maize and Setaria
2021-Dec-03, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj2327
PMID:34855479
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了玉米根部的细胞分辨率图谱，揭示了组织形成转录因子SHORT-ROOT (SHR)的替代配置及其在皮质层扩展中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细解析了玉米根部皮质层的形成机制 | 研究主要集中在玉米和Setaria两种植物上，可能不适用于其他植物种类 | 探讨植物根部皮质层的形成及其在生理功能中的作用 | 玉米和Setaria植物的根部皮质层 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及玉米和Setaria植物的多个皮质层细胞 |
| 128 | 2024-08-08 |
An adaptive method of defining negative mutation status for multi-sample comparison using next-generation sequencing
2021-12-02, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00880-8
PMID:34856988
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研究论文 | 本文提出了一种自适应方法，用于在多样本比较中通过下一代测序（NGS）定义负突变状态 | 本文提出的自适应突变特异性负（MSN）方法，能够更准确地区分负突变状态和未知状态，相较于传统的通用最小覆盖（UMC）方法，能产生更多的可用数据 | NA | 开发一种新的方法，用于在多样本比较的下一代测序数据中区分未知和负突变状态 | 癌症基因组学研究中的多样本比较 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | 测序数据 | 模拟数据集包含不同肿瘤细胞分数的样本，以及一个真实的双平台单细胞测序数据集 |
| 129 | 2024-08-08 |
Using advanced spatial and single-cell transcriptomics to characterize the human endometrium
2021-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00982-0
PMID:34857955
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of salt-induced hypertensive mouse aortae reveals cellular heterogeneity and state changes
2021-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00704-w
PMID:34862465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了高盐饮食诱导的高血压小鼠主动脉中的细胞异质性和状态变化 | 首次系统描述了高血压进展中血管细胞的组成和反应，并揭示了细胞组成和细胞间通讯在高血压进展中的显著变化 | NA | 研究高血压进展中血管细胞的组成和反应 | 高盐饮食诱导的高血压小鼠主动脉中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠的主动脉弓样本 |
| 131 | 2024-08-08 |
Isolation of dental pulp and periodontal cells from human teeth for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100953
PMID:34825216
|
研究论文 | 本文描述了一种从人类牙齿中分离牙髓和牙周细胞进行单细胞RNA测序分析的协议 | 提出了一个用于分离牙髓和牙周组织细胞的协议，以便进行单细胞RNA测序分析 | NA | 研究牙髓和牙周组织在多种病理影响下的细胞特性 | 人类牙髓和牙周组织细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
Isolation of myeloid cells from mouse brain tumors for single-cell RNA-seq analysis
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100957
PMID:34825218
|
研究论文 | 本文描述了一种从携带肿瘤的小鼠小脑中快速分离骨髓细胞用于单细胞RNA测序的协议 | 该协议无需细胞分选，以最小化细胞损伤，并使用CD11b+磁珠进一步富集骨髓细胞 | 目前的单细胞RNA测序协议受限于同时测序的细胞数量，限制了稀有细胞类型异质性的解析能力 | 开发一种新的方法来分离和分析肿瘤相关骨髓细胞的单细胞RNA序列 | 小鼠小脑中的骨髓细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 133 | 2024-08-08 |
Optimized protocol for isolation of high-quality single cells from the female mouse reproductive tract tissues for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100970
PMID:34841281
|
研究论文 | 本文描述了一种优化的协议，用于从雌性小鼠生殖道组织中分离高质量的单细胞，以进行单细胞RNA测序 | 提出了针对雌性生殖道不同区域的独特单细胞制备方法，以生成完整的分子细胞图谱 | NA | 研究正常生理和疾病状态下的分子细胞图谱 | 雌性小鼠生殖道的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 不同雌性小鼠生殖道区域的单细胞 |
| 134 | 2024-08-08 |
Protocol for scChaRM-seq: Simultaneous profiling of gene expression, DNA methylation, and chromatin accessibility in single cells
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100972
PMID:34849489
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scChaRM-seq的单细胞多组学测序技术，该技术能够同时分析单细胞中的基因表达、DNA甲基化和染色质可及性 | scChaRM-seq技术结合了单细胞RNA测序、DNA甲基化和染色质可及性分析，提供了对单细胞功能和表观遗传调控的多模态理解 | NA | 开发和应用scChaRM-seq技术以研究单个人卵细胞中的DNA甲基化及其与转录和染色质可及性的关系 | 单个人卵细胞中的DNA甲基化、转录和染色质可及性 | 基因组学 | NA | scChaRM-seq | NA | 基因表达、DNA甲基化、染色质可及性数据 | 单个人卵细胞 |
| 135 | 2024-08-08 |
Prognostic value of metabolic signature on 18F-FDGuptake in breast cancer patients after radiotherapy
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.10.008
PMID:34853812
|
研究论文 | 本研究旨在通过利用公共数据集的mRNA表达谱，识别与放射治疗后乳腺癌患者葡萄糖摄取相关的预后基因特征 | 首次构建并验证了与放射治疗后乳腺癌患者葡萄糖摄取相关的预后基因特征 | NA | 研究放射治疗后乳腺癌患者的葡萄糖摄取特征的预后价值 | 放射治疗后的乳腺癌患者 | NA | 乳腺癌 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | mRNA表达谱 | 三个放射治疗后乳腺癌队列（GSE103744、NKI和FUSCC数据库）以及五个乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据库 |
| 136 | 2024-08-08 |
Systematic temporal analysis of peripheral blood transcriptomes using TrendCatcher identifies early and persistent neutrophil activation as a hallmark of severe COVID-19
2021-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.05.04.442617
PMID:34845446
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研究论文 | 本研究开发了一个开源R包TrendCatcher，用于识别和可视化纵向转录组数据中的动态转录基因特征和生物过程 | TrendCatcher应用平滑样条ANOVA模型和断点搜索策略，优化了时间序列转录组数据的分析方法 | NA | 研究COVID-19疾病进展中的基因表达变化，以识别早期生物标志物和潜在的治疗靶点 | COVID-19患者的外周血转录组 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA-seq | 平滑样条ANOVA模型 | 转录组数据 | 包括bulk RNA-seq和scRNA-seq的时间序列数据 |
| 137 | 2024-08-08 |
Evolution of synapses and neurotransmitter systems: The divide-and-conquer model for early neural cell-type evolution
2021-12, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2021.11.002
PMID:34826676
|
综述 | 本文综述了非两侧对称动物中神经分子进化的当前理解，并通过重新分析刺胞动物的单细胞测序数据，揭示了其与两侧对称动物神经元类型的同源性证据 | 提出了Unc13-RIM神经元可能存在于最早的真后生动物中，并在两侧对称动物的进化中占据主导地位的假设 | NA | 探讨神经系统和神经递质系统的进化，特别是早期神经细胞类型的进化 | 非两侧对称动物的神经分子进化及刺胞动物与两侧对称动物神经元的同源性 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling of sequentially generated septal neuron fates
2021-12-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.71545
PMID:34851821
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序、组织学和遗传模型研究了海马神经元多样性在神经发生过程中的建立机制 | 发现海马前体细胞的转录组特征随神经发生而变化，并与不同神经元类型的生成相吻合 | NA | 探究海马神经元多样性的建立机制 | 海马神经元及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及至少三种形态学类别的神经元 |
| 139 | 2024-08-08 |
Optimized workflow for human PBMC multiomic immunosurveillance studies
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100900
PMID:34806044
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研究论文 | 本文详细介绍了一种用于人类外周血单个核细胞多组学免疫监测研究的优化工作流程 | 该工作流程通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序技术，减少了批次效应，提高了数据的可重复性和处理通量 | NA | 深入了解人类免疫系统在健康和疾病中的功能 | 人类外周血单个核细胞 | 数字病理学 | NA | 高维流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 140 | 2024-08-08 |
Absence of ERAP1 in B Cells Increases Susceptibility to Central Nervous System Autoimmunity, Alters B Cell Biology, and Mechanistically Explains Genetic Associations between ERAP1 and Multiple Sclerosis
2021-12-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100813
PMID:34810226
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研究论文 | 研究探讨了ERAP1基因在B细胞中的缺失如何增加中枢神经系统自身免疫的易感性，并揭示了ERAP1与多发性硬化症之间的遗传关联机制 | 首次通过多种小鼠模型和单细胞光谱流式细胞术，结合人类单细胞RNA测序数据的综合分析，揭示了ERAP1在B细胞中的作用及其与多发性硬化症的关联机制 | NA | 探究ERAP1基因多态性与多发性硬化症易感性增加的机制 | ERAP1基因在B细胞中的作用及其对中枢神经系统自身免疫的影响 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36个个体 |