单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 229 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
Neoadjuvant chemotherapy alters peripheral and tumour-infiltrating immune cells in breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.621
PMID:34919339
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-08 |
Spatial discordances between mRNAs and proteins in the intestinal epithelium
2021-12, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-021-00504-6
PMID:34931081
|
研究论文 | 本文研究了小肠上皮细胞中mRNA与蛋白质的空间不一致性 | 首次展示了小肠上皮细胞中mRNA与蛋白质在绒毛轴上的空间分布不一致性，并提出了空间无关的蛋白质合成延迟可以解释许多mRNA-蛋白质不一致现象 | 未提及 | 探讨小肠上皮细胞中mRNA与蛋白质的空间分布关系 | 小肠上皮细胞中的mRNA与蛋白质 | NA | NA | 空间排序与贝叶斯方法 | NA | 空间基因表达与蛋白质数据 | 未提及具体数量 |
| 103 | 2024-08-08 |
Construction and Validation of Prognostic Regulation Network Based on RNA-Binding Protein Genes in Lung Squamous Cell Carcinoma
2021-Dec, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1089/dna.2021.0145
PMID:34931870
|
研究论文 | 本研究基于RNA结合蛋白基因构建并验证了肺鳞状细胞癌的预后调控网络 | 首次在肺鳞状细胞癌中识别出具有预测肿瘤发生和预后价值的RNA结合蛋白基因，并构建了预测模型 | NA | 探讨RNA结合蛋白在肺鳞状细胞癌肿瘤发生和预后中的作用 | 肺鳞状细胞癌患者的RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 从TCGA数据库中获取的肺鳞状细胞癌患者数据 |
| 104 | 2024-08-08 |
Costimulation of γδTCR and TLR7/8 promotes Vδ2 T-cell antitumor activity by modulating mTOR pathway and APC function
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003339
PMID:34937742
|
研究论文 | 本文研究了通过共刺激γδTCR和TLR7/8来增强Vδ2 T细胞的抗肿瘤活性，并探讨了其机制。 | 开发了一种新的共刺激方法，通过激活γδTCR和TLR7/8来扩增Vδ2 T细胞，显著提高了其对肿瘤细胞的细胞毒性。 | 目前仅在体外和体内模型中进行了测试，临床应用效果有待进一步验证。 | 探索提高Vδ2 T细胞抗肿瘤活性的新方法，以增强基于γδ T细胞的癌症免疫疗法的疗效。 | Vδ2 T细胞及其在癌症免疫疗法中的应用。 | 癌症免疫疗法 | NA | 单细胞测序，反相蛋白阵列 | NA | 蛋白表达数据 | 涉及人源化NSG小鼠的PBMCs和脾细胞 |
| 105 | 2024-08-08 |
Constructing local cell-specific networks from single-cell data
2021-12-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2113178118
PMID:34903665
|
研究论文 | 本文开发了一种名为locCSN的方法，用于从单细胞RNA测序数据中构建细胞特异性基因共表达网络，该方法能够保留细胞异质性信息并检测非线性相关性 | locCSN方法能够检测非线性相关性，并且在处理分布挑战时更为稳健，此外，该方法还能识别在基因表达上无差异但在共表达网络上存在差异的基因 | 单个细胞特异性网络的估计存在较大噪声，尽管平均网络提供了稳定的估计 | 开发一种新的方法来构建准确的细胞特异性基因共表达网络，并利用这些网络进行下游分析以深入理解疾病 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达网络 | 生物信息学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 106 | 2024-08-08 |
splatPop: simulating population scale single-cell RNA sequencing data
2021-12-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02546-1
PMID:34911537
|
研究论文 | 本文介绍了splatPop模型，用于模拟具有已知表达数量性状位点的群体规模单细胞RNA测序数据 | splatPop模型能够灵活、可重复且有文档记录地模拟群体规模的scRNA-seq数据，并考虑了遗传效应 | NA | 开发和测试适用于群体规模单细胞RNA测序数据的方法 | 群体规模单细胞RNA测序数据的模拟 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 107 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics captures features of human midbrain development and dopamine neuron diversity in brain organoids
2021-12-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27464-5
PMID:34911939
|
研究论文 | 本研究建立了一种中脑类器官培养系统，通过单细胞RNA测序技术，研究了从多能干细胞到成熟多巴胺神经元的发育轨迹，并识别出三种分子特征不同的多巴胺神经元亚型。 | 设计了由重组蜘蛛丝微纤维支持的生物工程化腹侧中脑类器官，这些类器官在多巴胺神经发生的关键分子方面具有高相似性，并减少了类器官间的细胞类型组成和多巴胺神经元形成的变化。 | 尽管取得了显著进展，但脑类器官的使用仍受限于重复性和不完全成熟的问题。 | 研究人类中脑发育和多巴胺神经元多样性。 | 人类中脑发育和多巴胺神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及多种细胞类型和多巴胺神经元亚型 |
| 108 | 2024-08-08 |
The hidden genomic diversity of ciliated protists revealed by single-cell genome sequencing
2021-12-14, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01202-1
PMID:34903227
|
研究论文 | 本文通过单细胞基因组测序技术揭示了纤毛原生生物的隐藏基因组多样性 | 优化了单细胞测序方法和数据分析，有效去除了共生细菌的污染，生成了多个Euplotia物种的高质量基因组 | NA | 揭示纤毛原生生物的基因组多样性及其系统发育关系和代谢潜力 | 纤毛原生生物的基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 八个高质量的Euplotia基因组 |
| 109 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis identifies a unique tumor cell type producing multiple hormones in ectopic ACTH and CRH secreting pheochromocytoma
2021-12-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.68436
PMID:34905486
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别出一种独特的肿瘤细胞类型，该细胞类型在异位ACTH和CRH分泌的嗜铬细胞瘤中产生多种激素 | 发现了新的多功能嗜铬样细胞类型，该细胞高表达POMC和CRH，并提出了这种细胞类型导致库欣综合征的分子机制 | 研究基于一个罕见病例，可能需要更多样本验证结果的普遍性 | 探究异位ACTH和CRH分泌的嗜铬细胞瘤中是否存在独特的细胞类型负责多种激素分泌 | 异位ACTH和CRH分泌的嗜铬细胞瘤及其周边组织 | 数字病理学 | 嗜铬细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 三个不同解剖位置的肿瘤组织和一个肿瘤周边组织，以及三个常见的嗜铬细胞瘤和肾上腺皮质腺瘤样本 |
| 110 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals distinct immune cell subsets and signaling pathways in IgA nephropathy
2021-Dec-11, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00706-1
PMID:34895340
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了IgA肾病中免疫细胞亚群及其信号通路的早期转录变化 | 首次在单细胞水平上解析了IgA肾病中免疫细胞的动态变化，并发现了与疾病进展相关的特定细胞亚群和信号通路 | NA | 揭示IgA肾病中免疫细胞的早期转录变化及其与疾病进展的关系 | IgA肾病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 111 | 2024-08-08 |
Dissecting the single-cell transcriptomeunderlying chronic liver injury
2021-Dec-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.11.008
PMID:34900395
|
研究论文 | 本研究通过建立慢性肝损伤小鼠模型并进行单细胞RNA测序，揭示了慢性肝损伤过程中的单细胞转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下系统地描述了慢性肝损伤过程，并识别了潜在的肝损伤标志物和细胞间通信变化 | NA | 探究慢性肝损伤过程中的分子机制，并为有效干预慢性肝病提供临床策略 | 慢性肝损伤小鼠模型中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 总共捕获了16,389个高质量细胞 |
| 112 | 2024-08-08 |
Can single cell RNA sequencing reshape the clinical biochemistry of hematology: New clusters of circulating blood cells
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.671
PMID:34898038
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在血液学临床生物化学中的应用及其对循环血细胞分类的影响 | scRNA-seq有助于深入理解疾病，识别疾病特异性目标组，并提出新的治疗策略 | scRNA-seq的应用需要标准化和规范化，并在大量健康和疾病患者中进行验证 | 研究scRNA-seq在临床决策和分子医学指导中的作用 | 循环血细胞的分类和分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 大量健康和疾病患者 |
| 113 | 2024-08-08 |
Combinatorial immunotherapy induces tumor-infiltrating CD8+ T cells with distinct functional, migratory, and stem-like properties
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003614
PMID:34903555
|
研究论文 | 研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序分析了组合免疫疗法对肿瘤浸润性CD8+ T细胞功能和迁移特性的影响 | 发现OX40/4-1BB激动剂扩展了一种干细胞样PD-1loKLRG-1+Ki-67+CD8+ T细胞亚群，与PD-(L)1阻断协同作用，显著增强了干细胞样TIL的存在 | 对单一疗法作用机制的理解尚不完全，且不清楚组合疗法是否会导致协同作用、引发新的免疫机制或产生叠加效应 | 探讨组合免疫疗法中各成分之间的相互作用机制 | 肿瘤浸润性淋巴细胞（TILs）及其在不同治疗方案下的功能和迁移特性 | 免疫学 | NA | 高维流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自携带B16或MC38同基因肿瘤宿主的肿瘤浸润性淋巴细胞 |
| 114 | 2024-08-08 |
Statistical tests for intra-tumour clonal co-occurrence and exclusivity
2021-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009036
PMID:34910733
|
研究论文 | 本文开发了一种名为GeneAccord的新统计测试框架，用于识别在同一肿瘤的不同亚克隆中发生改变的基因对，这些基因对在患者样本中以共现或克隆排他性方式过度表达 | 提出了GeneAccord统计测试框架，用于检测肿瘤内克隆共现和排他性，并考虑了克隆间的进化依赖性 | NA | 开发和验证一种新的统计方法，用于识别影响肿瘤进化和治疗结果的基因对 | 急性髓系白血病患者的单细胞测序数据 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 123名急性髓系白血病患者 |
| 115 | 2024-08-08 |
Robotic high-throughput biomanufacturing and functional differentiation of human pluripotent stem cells
2021-12-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.11.004
PMID:34861164
|
研究论文 | 本文介绍了一种机器人平台，用于高效生产人类诱导多能干细胞（hiPSCs）并实现其功能性分化 | 开发了一种全自动的机器人平台，用于在化学定义条件下进行hiPSC的培养和分化，实现了高吞吐量和标准化生产 | NA | 建立一个集成平台，用于高效细胞制造，以支持疾病模型、药物筛选和细胞治疗 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）及其功能性分化 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组学、质谱流式细胞术、代谢分析、电生理学 | NA | 细胞 | 最多90种不同患者和疾病特异性细胞系 |
| 116 | 2024-08-08 |
Mouse and human share conserved transcriptional programs for interneuron development
2021-Dec-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj6641
PMID:34882453
|
research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类胎儿脑中纹状体和皮质γ-氨基丁酸能神经元的起源结构——神经节隆起的细胞多样性 | 发现人类和啮齿类动物在中间神经元发育过程中共享保守的转录程序 | NA | 探究遗传变异如何通过影响特定细胞类型的发育而导致神经发育障碍 | 人类和啮齿类动物的中间神经元发育 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 117 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis identifies a key role for Hhip in murine coronal suture development
2021-12-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27402-5
PMID:34880220
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析胚胎期野生型小鼠冠状缝合线，定义其细胞群体结构，并探讨Hhip在冠状缝合线发育中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了小鼠冠状缝合线的细胞群体结构，并揭示了Hhip在调控缝合线发育中的重要作用 | NA | 研究Hhip在小鼠冠状缝合线发育中的作用 | 小鼠冠状缝合线的细胞群体结构及Hhip的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 胚胎期E16.5和E18.5的野生型小鼠冠状缝合线样本 |
| 118 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the dynamic process and novel markers in porcine spermatogenesis
2021-Dec-07, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-021-00638-3
PMID:34872612
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了150天龄猪睾丸中约16,966个细胞的转录组，揭示了猪精子发生过程中的动态变化和新标记物。 | 首次通过单细胞RNA测序分析了猪睾丸中雄性生殖细胞和体细胞的转录组，并发现了四个精子细胞亚群及两个新的细胞表面标记物。 | NA | 研究猪精子发生过程中的转录组动态变化和新标记物。 | 猪睾丸中的生殖细胞和体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 约16,966个睾丸细胞 |
| 119 | 2024-08-08 |
Representation learning of RNA velocity reveals robust cell transitions
2021-12-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2105859118
PMID:34873054
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Velocity Autoencoder（VeloAE）的表示学习方法，用于学习RNA速度的低维表示，从而稳健地估计细胞过渡 | 提出了一种新的表示学习方法VeloAE，用于处理高维RNA速度数据中的不稳定和不准确问题 | NA | 旨在提高RNA速度技术在量化细胞过渡和揭示异质细胞群中瞬态细胞动力学的准确性和稳定性 | RNA速度数据和细胞过渡 | 生物信息学 | NA | RNA速度 | Autoencoder | 转录组数据 | 多个实验数据集 |
| 120 | 2024-08-08 |
An efficient scRNA-seq dropout imputation method using graph attention network
2021-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04493-x
PMID:34876032
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图注意力网络的自动编码器结构网络GNNImpute，用于单细胞RNA测序数据中的dropout事件插补 | GNNImpute利用图注意力卷积聚合多层次相似细胞信息，并在非欧几里得空间的scRNA-seq数据上进行卷积操作，能准确有效地插补dropout并减少dropout噪声 | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据dropout插补方法 | 单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 图注意力网络 | 基因表达数据 | 分析了四个真实数据集 |