单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 229 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell sequencing of 5-hydroxymethylcytosine and genomic DNA using scH&G-seq
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.101016
PMID:34950891
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研究论文 | 本文提供了一种单细胞5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA测序（scH&G-seq）的详细协议，用于同时量化单个细胞中的5hmC和基因组DNA，以在单细胞分裂分辨率下重建谱系树 | scH&G-seq技术能够同时量化单个细胞中的5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA，结合基因组变异数据，准确重建更大的谱系树 | NA | 开发一种新的单细胞测序技术，用于在单细胞分裂分辨率下重建细胞谱系 | 5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）和基因组DNA | 基因组学 | NA | scH&G-seq | NA | DNA | 单个细胞 |
| 82 | 2024-08-08 |
Profiling Glioblastoma Cases with an Expression of DCX, OLIG2 and NES
2021-Dec-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413217
PMID:34948016
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了17例胶质母细胞瘤中DCX、NES和OLIG2的表达模式 | 首次详细分析了DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用，并结合单细胞RNA测序数据进行了深入探讨 | 研究结果未能明确证明DCX参与胶质母细胞瘤细胞的迁移 | 探讨DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用 | 胶质母细胞瘤中的DCX、NES和OLIG2表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 17例胶质母细胞瘤样本 |
| 83 | 2024-08-08 |
Immunotherapy for Hepatocellular Carcinoma: New Prospects for the Cancer Therapy
2021-Dec-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11121355
PMID:34947886
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综述 | 本文综述了肝细胞癌（HCC）的免疫治疗新进展，包括免疫检查点抑制剂、树突状细胞疫苗、溶瘤病毒等方法 | 介绍了单细胞RNA测序技术在识别免疫细胞群及其相互作用中的应用，以提高HCC患者对免疫治疗反应的可能性 | 目前免疫治疗策略在临床上尚未普遍引发强烈的抗肿瘤反应 | 探讨肿瘤浸润免疫细胞的种类及其在HCC发展中的作用，并讨论免疫治疗策略的最新进展 | 肝细胞癌及其免疫治疗 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 84 | 2024-08-08 |
Therapeutic Effect of IL-38 on Experimental Autoimmune Uveitis: Reprogrammed Immune Cell Landscape and Reduced Th17 Cell Pathogenicity
2021-12-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.62.15.31
PMID:34967854
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素(IL)-38对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)的影响及其潜在机制 | 首次揭示了IL-38通过重编程免疫细胞景观和减少Th17细胞致病性来治疗EAU的效果 | NA | 阐明IL-38对EAU的影响及其机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型 | NA | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 正常小鼠、EAU小鼠及IL-38治疗的小鼠的颈淋巴结 |
| 85 | 2024-08-08 |
Metabolic detection and systems analyses of pancreatic ductal adenocarcinoma through machine learning, lipidomics, and multi-omics
2021-Dec-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh2724
PMID:34936449
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研究论文 | 本文介绍了一种利用机器学习和脂质组学进行胰腺导管腺癌（PDAC）检测的微创方法 | 通过贪婪算法和质谱特征选择优化了17种特征代谢物作为检测特征，并开发了一种基于液相色谱-质谱的靶向检测方法 | NA | 旨在开发一种用于胰腺导管腺癌早期检测的有效液体检测方法 | 胰腺导管腺癌（PDAC） | 机器学习 | 胰腺癌 | 液相色谱-质谱 | 机器学习（ML） | 代谢物 | 1033名不同阶段的PDAC患者 |
| 86 | 2024-08-08 |
Adult mouse and human organoids derived from thyroid follicular cells and modeling of Graves' hyperthyroidism
2021-12-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2117017118
PMID:34916298
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研究论文 | 本文报道了从成年小鼠和人类甲状腺滤泡细胞中建立的三维（3D）类器官，并展示了这些类器官模拟格雷夫斯病甲状腺功能亢进的能力。 | 首次成功从成年甲状腺组织中建立三维类器官，并展示了其模拟人类自身免疫疾病的能力。 | NA | 研究甲状腺滤泡细胞类器官的建立及其在模拟人类自身免疫疾病中的应用。 | 成年小鼠和人类的甲状腺滤泡细胞。 | 数字病理学 | 甲状腺疾病 | 单细胞RNA测序，透射电子显微镜 | NA | 细胞 | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the critical molecular pattern of UV-induced cutaneous squamous cell carcinoma
2021-12-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04477-y
PMID:34934042
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术分析了紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌（cSCC）的关键分子模式 | 首次在单细胞水平上揭示了紫外线诱导的cSCC的关键分子模式，并发现S100A9和FABP5可能作为未来cSCC治疗的新靶点 | NA | 揭示紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌的分子机制 | 紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌及其邻近皮肤样本和健康皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 350个细胞，来自6个紫外线诱导的cSCC样本、匹配的邻近皮肤样本和3个健康皮肤组织 |
| 88 | 2024-08-08 |
Author Correction: Cellular basis of omentum activation and expansion revealed by single-cell RNA sequencing using a parabiosis model
2021-Dec-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04282-9
PMID:34934142
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of zebrafish cranial neural crest reveals spatiotemporal regulation of lineage decisions during development
2021-12-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110140
PMID:34936864
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼头部神经嵴细胞在迁移过程中的时空调控，揭示了神经嵴细胞谱系决策的时空动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术结合计算分析，揭示了斑马鱼头部神经嵴细胞在迁移过程中谱系决策的时空调控机制 | NA | 探究神经嵴细胞在斑马鱼胚胎发育过程中的谱系决策及其时空调控机制 | 斑马鱼头部神经嵴细胞在迁移过程中的单细胞转录组 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个迁移阶段的斑马鱼头部神经嵴细胞 |
| 90 | 2024-08-08 |
MultiMAP: dimensionality reduction and integration of multimodal data
2021-12-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02565-y
PMID:34930412
|
研究论文 | 介绍了一种名为MultiMAP的新算法，用于多模态数据降维和整合 | MultiMAP能够整合任意数量的数据集，利用非所有数据集共有的特征，不限于线性映射，允许用户指定每个数据集的影响，并且对大型数据集具有极高的可扩展性 | NA | 开发和评估一种新的多模态数据降维和整合算法 | 单细胞转录组学、染色质可及性、甲基化和空间数据 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 多模态数据 | NA |
| 91 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Links Loss of Human Pancreatic β-Cell Identity to ER Stress
2021-12-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10123585
PMID:34944092
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研究论文 | 本文通过结合β细胞系追踪和单细胞转录组学技术，研究了人胰岛细胞中β细胞身份改变的机制 | 本文首次展示了内质网稳态与β细胞表型之间的紧密关系，并强化了β细胞身份改变作为功能性β细胞质量损失机制的概念 | NA | 探讨人胰岛细胞中β细胞身份改变的机制 | 人胰岛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 初级人胰岛细胞 |
| 92 | 2024-08-08 |
Influence of Estrogen Treatment on ESR1+ and ESR1- Cells in ER+ Breast Cancer: Insights from Single-Cell Analysis of Patient-Derived Xenograft Models
2021-Dec-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13246375
PMID:34944995
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了雌激素治疗对ER+乳腺癌中ESR1+和ESR1-细胞的影响 | 首次展示了雌激素对同一乳腺癌肿瘤中不同细胞类型的差异性影响 | NA | 探究雌激素治疗对ER+乳腺癌细胞的影响及其分子机制 | ER+乳腺癌中的ESR1+和ESR1-细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了雌激素刺激（SC31）和雌激素抑制（GS3）的患者来源异种移植（PDX）模型 |
| 93 | 2024-08-08 |
Heterologous prime-boost immunizations with chimpanzee adenoviral vectors elicit potent and protective immunity against SARS-CoV-2 infection
2021-Dec-18, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00360-4
PMID:34923570
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研究论文 | 本文描述了基于黑猩猩腺病毒血清型6和68（AdC6和AdC68）载体疫苗候选物的开发，并评估了其在小鼠中的免疫原性、保护效果和免疫细胞特征。 | 研究发现异源初免-加强免疫策略能诱导更高滴度的保护性抗体和更多的刺突特异性记忆CD8 T细胞。 | NA | 开发针对SARS-CoV-2的安全有效疫苗，以应对COVID-19全球大流行。 | 基于黑猩猩腺病毒载体的疫苗候选物在小鼠中的免疫反应和保护效果。 | 疫苗学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞特征 | 小鼠 |
| 94 | 2024-08-08 |
Investigating immune and non-immune cell interactions in head and neck tumors by single-cell RNA sequencing
2021-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27619-4
PMID:34921143
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中非免疫细胞和免疫细胞的异质性、细胞群体特征及细胞间相互作用 | 首次全面展示了HNSCC微环境中细胞内在机制和细胞间通讯的单细胞视图 | NA | 旨在开发更有效的治疗方法，通过研究HNSCC中非免疫和免疫细胞群体的异质性、细胞群体特征及细胞间相互作用 | 6例人乳头瘤病毒（HPV）阳性和12例HPV阴性的HNSCC患者肿瘤及匹配的外周血样本 | 数字病理学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 134,606个细胞 |
| 95 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2021-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27599-5
PMID:34921160
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了食管鳞状细胞癌（ESCC）微环境的异质性 | 揭示了ESCC微环境中大多数细胞类型的异质性，特别是成纤维细胞和免疫细胞亚群，并发现了具有预后价值和生物学意义的肿瘤特异性CST1肌成纤维细胞亚群 | NA | 研究食管鳞状细胞癌微环境的异质性及其对癌症生物学和治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）微环境中的细胞类型 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 62,161个细胞来自11名ESCC患者的血液、邻近非恶性组织和匹配的肿瘤样本 |
| 96 | 2024-08-08 |
Preparation of mouse pancreatic tumor for single-cell RNA sequencing and analysis of the data
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100989
PMID:34927097
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研究论文 | 本文描述了一种有效的鼠胰腺肿瘤分离协议，用于单细胞RNA测序分析细胞群体 | 提供了使用Common Workflow Language (CWL)管道在用户友好的科学数据分析平台中处理数据和聚类异质细胞群体的方法 | NA | 研究鼠胰腺肿瘤的细胞群体 | 鼠胰腺肿瘤的单细胞悬液 | 数字病理学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 97 | 2024-08-08 |
From nasal to basal: single-cell sequencing of the bursa of Fabricius highlights the IBDV infection mechanism in chickens
2021-Dec-16, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00728-9
PMID:34915931
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，详细阐述了传染性法氏囊病病毒（IBDV）在鸡体内的感染机制，特别是通过鼻腔进入并影响法氏囊细胞的过程 | 研究首次揭示了IBDV通过鼻腔后部感染鸡，并通过血液循环到达法氏囊，对不同类型的法氏囊细胞（如B细胞、上皮细胞、树突状细胞和成纤维细胞）的感染反应进行了详细分析 | NA | 旨在确定病毒通过鼻腔的入口点，并阐明为什么鸟类容易受到RNA病毒的感染 | 传染性法氏囊病病毒（IBDV）在鸡体内的感染机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 98 | 2024-08-08 |
Diet and Gut Microbiota Interaction-Derived Metabolites and Intrahepatic Immune Response in NAFLD Development and Treatment
2021-Dec-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9121893
PMID:34944709
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研究论文 | 本文综述了饮食与肠道微生物代谢物在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）发展及治疗中对肝内免疫反应的影响 | 首次总结了饮食-肠道微生物代谢物与肝内免疫激活在NAFLD发展和进展中的相互作用，并讨论了通过靶向肠道微生物和重要分子信号通路的潜在治疗选项 | NA | 探讨NAFLD的病理机制及潜在治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）及其发展过程中的肠道微生物代谢物和肝内免疫反应 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | 全球约25%的人口受影响 |
| 99 | 2024-08-08 |
YAP1 Is a Potential Predictive Molecular Biomarker for Response to SMO Inhibitor in Medulloblastoma Cells
2021-Dec-13, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13246249
PMID:34944872
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研究论文 | 本研究探讨了YAP1作为预测髓母细胞瘤对SMO抑制剂反应的分子生物标志物的潜力 | 发现YAP1在SHH alpha髓母细胞瘤中过度表达，并与SMO抑制剂的耐药性相关 | 研究基于回顾性队列微阵列数据和体外模型，需要进一步的临床前模型验证 | 评估YAP1作为髓母细胞瘤对SMO抑制剂反应的预测生物标志物的有效性 | 髓母细胞瘤细胞和患者样本 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 微阵列数据, 单细胞RNA测序数据 | 两个体外模型，五个患者样本 |
| 100 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing infers the role of malignant cells in drug-resistant multiple myeloma
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.653
PMID:34918874
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |