单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 229 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Volumetric compression develops noise-driven single-cell heterogeneity
2021-12-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2110550118
PMID:34916290
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研究论文 | 本文研究了物理压缩对非小细胞肺癌细胞异质性的影响，并通过单细胞转录组测序和单分子荧光原位杂交技术进行了验证 | 首次揭示了物理微环境对单细胞异质性的贡献，并展示了机械刺激通过改变转录动力学影响细胞命运决定的机制 | NA | 探讨物理微环境对单细胞异质性的影响及其机制 | 非小细胞肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Impact of chemotherapy and immunotherapy on the composition and function of immune cells in COVID-19 convalescent with gynecological tumors
2021-12-04, Aging
DOI:10.18632/aging.203739
PMID:34862879
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研究论文 | 研究了化疗和免疫治疗对COVID-19康复者中妇科肿瘤患者免疫细胞组成和功能的影响 | 发现COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫细胞分子特征与无肿瘤的COVID-19患者相似，且抗PD-L1治疗能显著增强NK细胞和T细胞的细胞毒性评分及T细胞的克隆扩增 | 样本量较小，仅包括3名健康捐赠者、4名COVID-19患者和4名COVID-19合并妇科肿瘤患者 | 探讨COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫记忆及其对化疗和免疫治疗的响应 | COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫细胞 | NA | 妇科肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 3名健康捐赠者，4名COVID-19患者，4名COVID-19合并妇科肿瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
Clinical and therapeutic relevance of cancer-associated fibroblasts
2021-12, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00546-5
PMID:34489603
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤发展和治疗中的临床相关性和治疗意义 | 通过单细胞RNA测序和新型小鼠模型，增加了对CAF多样性的理解 | 不同CAF群体的上下文依赖角色及其可互换的可塑性仍大多未知 | 探讨CAFs在癌症进展中的作用及其作为预后因子和治疗靶点的价值 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的复杂相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals B cell-related molecular biomarkers for Alzheimer's disease
2021-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00714-8
PMID:34880454
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自4名阿尔茨海默病（AD）患者和2名正常对照的外周血单个核细胞（PBMCs），探索了AD患者PBMCs中的差异细胞亚群，并发现了B细胞的显著减少。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了与AD进展相关的B细胞分子标志物，并通过功能实验验证了B细胞在AD早期阶段的作用。 | 研究样本量较小，且仅限于AD患者和正常对照，未来研究需要扩大样本量并考虑更多疾病阶段和人群。 | 探索阿尔茨海默病中与B细胞相关的分子标志物，以促进AD进展的临床识别。 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和B细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名AD患者（早期2名，晚期2名）和2名正常对照，以及43名AD患者和41名正常受试者 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome atlas of human mesenchymal stem cells exploring cellular heterogeneity
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.650
PMID:34965030
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研究论文 | 本研究利用大规模并行多重单细胞RNA测序技术，构建了超过13万个单个间充质干细胞的转录组图谱，以评估其异质性 | 首次构建了人类间充质干细胞的综合单细胞图谱，并发现了七个组织特异性和五个保守的MSC亚群，这些亚群具有不同的基因表达特征 | NA | 探索间充质干细胞的细胞异质性，以促进基于MSC的治疗效果的潜在改进 | 人类间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过13万个单个间充质干细胞转录组，来自多个组织和供体，包括正常骨髓（3个）、脂肪组织（3个）、脐带（2个）和真皮（3个） | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Seq reveals cellular landscape-specific characteristics and potential etiologies for adolescent idiopathic scoliosis
2021-Dec, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.1184
PMID:35005449
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研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序技术，比较了青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观，揭示了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断，并通过细胞通信分析提供了骨细胞和软骨细胞分化功能障碍的可能发病机制。 | 首次通过单细胞分析揭示了AIS患者与健康受试者在细胞状态上的差异，并发现了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断。 | NA | 探讨青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者在脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观差异及其潜在的病因。 | 青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者的脊椎松质骨组织。 | 数字病理学 | 青少年特发性脊柱侧弯 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | t-分布随机邻域嵌入（t-SNE） | 基因组范围的转录组数据 | AIS患者与健康受试者的脊椎松质骨组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
External signals regulate continuous transcriptional states in hematopoietic stem cells
2021-12-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66512
PMID:34939923
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了在小鼠造血干细胞和LSK前体细胞中，外部信号干扰素、粒细胞集落刺激因子和前列腺素对细胞状态的影响 | 首次全面分析了造血干细胞对外部刺激的反应异质性和特异性，并揭示了细胞内在的染色质状态与对外部信号反应的关系 | NA | 探究外部信号如何调控造血干细胞的连续转录状态 | 造血干细胞及其前体细胞对外部刺激的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-Seq） | NA | 基因表达数据 | 功能验证的小鼠造血干细胞和LSK前体细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-07 |
Single Cell Sequencing of Induced Pluripotent Stem Cell Derived Retinal Ganglion Cells (iPSC-RGC) Reveals Distinct Molecular Signatures and RGC Subtypes
2021-12-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12122015
PMID:34946963
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了由诱导多能干细胞（iPSC）衍生的视网膜神经节细胞（RGC），以识别不同的分子特征和RGC亚型 | 首次通过单细胞测序技术揭示了iPSC衍生的RGC中的分子特征和亚型多样性 | 仅限于使用特定技术（Chromium Single Cell 3' V3协议和Illumina Novaseq）进行测序，可能限制了数据的多功能性 | 旨在识别由iPSC衍生的RGC中的差异表达基因（DEG）和RGC亚型 | 人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 4705个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a strong connection between Gadd45g upregulation and oncolytic HSV infection in tumor tissue
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.10.006
PMID:34786476
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肿瘤组织在接受基于单纯疱疹病毒2的溶瘤病毒治疗后的基因表达谱 | 揭示了溶瘤病毒感染肿瘤细胞后Gadd45g基因显著上调的现象，并探讨了其对病毒复制的影响 | NA | 研究溶瘤病毒在肿瘤组织中的感染效率及其对肿瘤细胞基因表达的影响 | 肿瘤组织在接受溶瘤病毒治疗后的基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Dissociation of intact adult mouse cortical projection neurons for single-cell RNA-seq
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100941
PMID:34877546
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research paper | 本文提供了一种改进的流程，用于从成年小鼠皮质中分离完整的投射神经元，适用于液滴和板式单细胞RNA测序、qPCR、免疫细胞化学和长期细胞培养等应用 | 该协议使用现成的试剂，无需昂贵的分离试剂盒，通过独特的孵育步骤和FACS门控策略，实现了对成年大脑皮质神经元前所未有的富集 | NA | 开发一种稳健且可重复的分离流程，用于从成年小鼠皮质中分离完整的投射神经元 | 成年小鼠皮质中的投射神经元 | digital pathology | NA | single-cell RNA-seq | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
Beyondcell: targeting cancer therapeutic heterogeneity in single-cell RNA-seq data
2021-12-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-01001-x
PMID:34911571
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研究论文 | 本文介绍了Beyondcell方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别具有不同药物反应的肿瘤细胞亚群并提出癌症特异性治疗方案 | Beyondcell方法通过计算药物签名富集分数，界定治疗簇（TCs）在细胞群体中的分布，并确定细胞群体间的治疗差异，生成基于敏感性的优先级排名以指导药物选择 | NA | 开发一种计算方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别肿瘤细胞亚群并提出癌症特异性治疗方案 | 单细胞RNA测序数据中的肿瘤细胞亚群及其药物反应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 五个单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
Predicting heterogeneity in clone-specific therapeutic vulnerabilities using single-cell transcriptomic signatures
2021-12-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-01000-y
PMID:34915921
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研究论文 | 本文通过大规模癌症组学数据分析，利用单细胞RNA测序和推荐系统CaDRReS-Sc，研究了肿瘤内转录组异质性对预测临床结果的重要性，并展示了异质基因表达特征在预测药物反应中的高准确性 | 本文首次利用单细胞RNA测序和推荐系统CaDRReS-Sc，展示了异质基因表达特征在预测药物反应中的高准确性，并验证了其在单药治疗和组合治疗中的有效性 | NA | 研究肿瘤内转录组异质性对预测临床结果的影响，并开发一种新的方法来加速药物再利用研究 | 肿瘤内转录组异质性和药物反应预测 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 推荐系统 | 转录组数据 | 大规模癌症组学数据集和患者近端细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Deciphering regulatory protein activity in human pancreatic islets via reverse engineering of single-cell sequencing data
2021-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154482
PMID:34907912
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研究论文 | 本文通过逆向工程从单细胞RNA测序数据中解析了人类胰岛中调控蛋白的活性，并探讨了这些活性在2型糖尿病（T2D）中的独特模式 | 首次应用逆向工程方法从单细胞RNA测序数据中获取调控蛋白活性，并识别出与T2D相关的独特调控蛋白活性模式 | NA | 揭示2型糖尿病中胰岛功能障碍的分子机制 | 人类胰岛中的调控蛋白活性 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 非糖尿病和T2D患者的胰岛样本 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
Single-cell characterization of monolayer cultured human dental pulp stem cells with enhanced differentiation capacity
2021-12-15, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-021-00140-6
PMID:34911932
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术研究了新鲜分离和单层培养的人牙髓干细胞的转录差异 | 首次揭示了单层培养的人牙髓干细胞与新鲜分离的细胞在细胞组成上的变化，并发现了一种具有增强分化潜能的亚群 | NA | 研究单层培养的人牙髓干细胞的转录差异及其在再生医学中的潜在价值 | 人牙髓干细胞及其在单层培养后的转录特征 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-07 |
Benchmarking UMI-based single-cell RNA-seq preprocessing workflows
2021-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02552-3
PMID:34906205
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研究论文 | 本文系统地比较了10种基于UMI的单细胞RNA测序预处理工作流程的性能 | 首次全面比较了多种单细胞RNA测序预处理工作流程，并评估了它们对下游分析的影响 | 未详细讨论每种工作流程的具体技术细节和潜在的改进空间 | 比较不同单细胞RNA测序预处理工作流程的性能，并评估它们对下游分析的影响 | 10种基于UMI的单细胞RNA测序预处理工作流程 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用不同生物复杂性水平的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-07 |
geneBasis: an iterative approach for unsupervised selection of targeted gene panels from scRNA-seq
2021-12-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02548-z
PMID:34872616
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研究论文 | 本文介绍了一种名为geneBasis的无监督迭代方法，用于从scRNA-seq数据集中选择最优基因面板 | geneBasis方法通过迭代选择能够最大化真实流形与当前选定基因面板构建流形之间距离的基因，从而优于现有策略 | NA | 旨在从scRNA-seq数据中选择适用于空间转录组学等技术的最优基因子集 | scRNA-seq数据集中的基因面板选择 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
Transcriptomic Mapping of Neural Diversity, Differentiation and Functional Trajectory in iPSC-Derived 3D Brain Organoid Models
2021-12-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10123422
PMID:34943930
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研究论文 | 本研究结合并分析了8个脑类器官转录组数据库，研究分化协议与其在不同3D类器官和外来脑模型中产生的细胞功能之间的相关性 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）转录组数据集进行综合分析，探索晚期神经功能发育的转录组研究 | 类器官间的高变异性使得特定基因调控途径在3D类器官与原生大脑之间的比较变得困难 | 研究中枢神经系统（CNS）的发育和病理生理学，特别是神经多样性、分化和功能轨迹 | 诱导多能干细胞（iPSC）衍生的3D脑类器官模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | PCA（主成分分析）和UMAP（均匀流形近似投影） | 转录组数据 | 8个脑类器官转录组数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-07 |
DropletQC: improved identification of empty droplets and damaged cells in single-cell RNA-seq data
2021-12-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02547-0
PMID:34857027
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DropletQC的新方法，用于检测单细胞RNA测序数据中的空液滴、受损细胞和完整细胞，并准确区分它们 | DropletQC基于一种新的质量控制指标——核分数，该指标量化了每个液滴中来自未剪接的核前mRNA的RNA分数 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中空液滴和受损细胞的识别准确性 | 单细胞RNA测序数据中的空液滴、受损细胞和完整细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 通常涉及数万个细胞的单次实验 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Spatial Transcriptomics to define transcriptional patterns of zonation and structural components in the mouse liver
2021-12-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27354-w
PMID:34857782
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research paper | 本文应用空间转录组学技术对小鼠肝脏组织切片进行转录组分析，揭示了肝脏组织中的区域化和结构成分的转录模式 | 引入了新的计算方法来测量组织结构间的转录梯度，并发现了肝脏组织中先前未被转录表征的结构 | NA | 探索小鼠肝脏的空间转录组学特征，特别是区域化和结构成分的转录模式 | 小鼠肝脏组织的空间转录组学特征 | digital pathology | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-07 |
Testicular injury during SARS-CoV-2 infection may be neglected: An assessment from scRNA-seq profiling and protein detection of angiotensin-converting enzyme II
2021-Dec, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2021.10920
PMID:34765026
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化染色分析了SARS-CoV-2感染中睾丸组织中ACE2表达细胞的组成和比例，探讨了SARS-CoV-2对男性生殖系统的潜在损害 | 首次详细分析了SARS-CoV-2感染中睾丸组织中ACE2表达细胞的组成和比例，揭示了睾丸损伤可能被临床医生忽视的问题 | NA | 探讨SARS-CoV-2是否能损害男性生殖系统 | SARS-CoV-2感染患者的睾丸组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 成人睾丸细胞中ACE2 mRNA表达的细胞比例为5.45%、1.24%和0.423%，婴儿睾丸细胞中为5.00%、0.56%和0.73% | NA | NA | NA | NA |