单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 229 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-07 |
Cobolt: integrative analysis of multimodal single-cell sequencing data
2021-12-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02556-z
PMID:34963480
|
研究论文 | 提出Cobolt方法用于整合分析多模态单细胞测序数据 | 不仅能分析联合模态平台的数据，还提供了整合不同模态测量的多个数据集的一致框架 | NA | 开发多模态单细胞测序数据的整合分析方法 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多组学单细胞测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-07 |
Ex vivo mass cytometry analysis reveals a profound myeloid proinflammatory signature in psoriatic arthritis synovial fluid
2021-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220280
PMID:34226188
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术和多组学分析揭示了银屑病关节炎滑液中髓系细胞的显著促炎特征 | 首次在无体外刺激条件下发现银屑病关节炎滑液中的经典单核细胞、中间单核细胞和巨噬细胞自发产生高水平骨桥蛋白和CCL2等促炎介质 | 研究样本量有限，且主要关注髓系细胞而T细胞自发细胞因子产生较少 | 识别银屑病关节炎滑液和血液中淋巴细胞和髓系细胞在无刺激条件下的细胞因子产生情况 | 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液白细胞 | 免疫学 | 银屑病关节炎 | 质谱流式细胞术, 转录组分析, 单细胞RNA测序, ELISA, LEGENDplex分析 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液样本 | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 基因芯片, 蛋白质检测 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-07 |
Costimulation of γδTCR and TLR7/8 promotes Vδ2 T-cell antitumor activity by modulating mTOR pathway and APC function
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003339
PMID:34937742
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过共刺激γδTCR和TLR7/8来扩增Vδ2 T细胞的新方法，并验证其抗肿瘤活性 | 首次发现γδTCR和TLR7/8共刺激可增强Vδ2 T细胞抗肿瘤功能，并揭示其通过调节mTOR通路和APC功能的作用机制 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 开发更有效的γδ T细胞癌症免疫治疗方法 | Vδ2 T细胞、抗原呈递细胞、肿瘤细胞 | 免疫学、癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞测序、反相蛋白阵列、体外共培养、动物模型 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞功能数据 | 人PBMCs、人脾细胞、人源化NSG小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-07 |
Isolation of myeloid cells from mouse brain tumors for single-cell RNA-seq analysis
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100957
PMID:34825218
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研究论文 | 开发从小鼠脑肿瘤中分离髓系细胞用于单细胞RNA测序分析的实验方案 | 无需细胞分选即可快速分离小鼠小脑肿瘤中的髓系细胞，最大限度减少细胞损伤 | 未提及样本量限制或技术局限性 | 建立优化的单细胞RNA测序样本制备流程 | 小鼠脑肿瘤中的髓系细胞 | 单细胞测序 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2024-10-17 |
Synthesis and application of POLYseq for profiling human liver organoids
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100976
PMID:34934958
|
研究论文 | 本文详细介绍了POLYseq的合成、表征及其在单细胞测序中的应用 | POLYseq通过商业化试剂合成，具有高度可定制性，并且在合成过程中仅需要一个能保持90°C的恒温浴 | 合成过程中需注意试剂的初始混合比例，因为最终产品对初始混合比例敏感 | 开发和应用POLYseq技术以进行单细胞测序 | 人类肝脏类器官细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-10-12 |
Syntaxin 4 Enrichment in β-Cells Prevents Conversion to Autoimmune Diabetes in Non-Obese Diabetic (NOD) Mice
2021-12, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db21-0170
PMID:34556496
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研究论文 | 研究探讨了Syntaxin 4在β细胞中的富集如何防止非肥胖糖尿病（NOD）小鼠向自身免疫性糖尿病的转化 | 首次通过诱导β细胞特异性表达Syntaxin 4，显著降低了NOD小鼠的糖尿病转化率，并揭示了Syntaxin 4在β细胞保护中的机制 | 研究仅在NOD小鼠模型中进行，尚未在人类中验证Syntaxin 4富集的策略 | 探讨Syntaxin 4在β细胞保护中的作用及其在预防或逆转1型糖尿病中的潜力 | Syntaxin 4在β细胞中的表达及其对NOD小鼠糖尿病转化的影响 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NOD-iβSTX4小鼠和NOD-Ctrl小鼠各一组，每组样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-10-05 |
Repurposable drugs for SARS-CoV-2 and influenza sepsis with scRNA-seq data targeting post-transcription modifications
2021-Dec, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbab022
PMID:34993416
|
研究论文 | 本文通过整合基因表达扰动数据和单细胞RNA测序数据，识别出可重新用于治疗SARS-CoV-2和流感脓毒症的药物 | 本文采用系统生物学方法，结合FDA批准药物和临床前小分子化合物的基因表达扰动数据，以及COVID-19患者的单细胞RNA测序数据，识别出281种可能有效对抗SARS-CoV-2感染的药物，并实验验证了其中两种药物对流感病毒复制和宿主细胞细胞因子及其调节因子转录和翻译的抑制作用 | 本文主要基于现有数据和已批准药物进行筛选，未涉及新药开发 | 识别可重新用于治疗SARS-CoV-2和流感脓毒症的药物 | SARS-CoV-2和流感病毒感染及其并发症 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 轻度和重度COVID-19患者的数据（GEO: GSE145926） | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-10-01 |
Single cell analysis of spondyloarthritis regulatory T cells identifies distinct synovial gene expression patterns and clonal fates
2021-12-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02931-3
PMID:34907325
|
研究论文 | 研究分析了强直性脊柱炎和银屑病关节炎患者的外周血和滑液中的调节性T细胞的单细胞转录组 | 首次详细描述了炎症部位调节性T细胞的亚群特征，并发现了具有细胞毒性标志物的CD8+调节性T细胞亚群和IL-10及LAG-3表达的Th17样调节性T细胞亚群 | 研究样本仅限于少数患者，可能影响结果的普适性 | 探讨炎症部位调节性T细胞的表型和功能特征 | 强直性脊柱炎和银屑病关节炎患者的调节性T细胞 | 免疫学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 16,000多个调节性T细胞样本，来自5名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-09-05 |
Coronary blood vessels from distinct origins converge to equivalent states during mouse and human development
2021-12-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.70246
PMID:34910626
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研究论文 | 本文通过结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术，研究了小鼠和人类心脏冠状血管在发育过程中的转录状态和功能差异 | 首次揭示了冠状血管内皮细胞在发育过程中转录异质性的变化，以及这种异质性如何受谱系和位置的影响 | 研究主要集中在小鼠和人类胚胎及成年心脏的冠状血管，未涉及其他物种或发育阶段 | 探讨冠状血管内皮细胞在发育过程中的转录状态和功能差异 | 小鼠和人类心脏冠状血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 胚胎和成年小鼠心脏以及人类发育中的冠状血管样本 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-09-05 |
Human and rat skeletal muscle single-nuclei multi-omic integrative analyses nominate causal cell types, regulatory elements, and SNPs for complex traits
2021-Dec, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.268482.120
PMID:34815310
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研究论文 | 本文优化了单核ATAC-seq和单核RNA-seq技术，对人和大鼠的骨骼肌细胞进行了多组学整合分析，识别了与复杂性状相关的细胞类型、调控元件和SNPs | 本文首次使用单核ATAC-seq和单核RNA-seq技术，成功捕获了I型和II型肌纤维特征，并进行了跨模态和跨物种的整合分析 | NA | 研究骨骼肌细胞的细胞特异性染色质可及性和转录组，以及与复杂性状相关的遗传变异 | 人和大鼠的骨骼肌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单核ATAC-seq, 单核RNA-seq | 回归模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 33,862个细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-21 |
MAB21L1 modulates gene expression and DNA metabolic processes in the lens placode
2021-12-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049251
PMID:34779479
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研究论文 | 本研究通过电子显微镜和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了Mab21l1基因敲除小鼠的晶状体外胚层早期单细胞水平表型 | 首次揭示了MAB21L1在晶状体基板形成过程中调节晶状体特异性基因表达和DNA/核苷酸代谢过程的作用 | NA | 探究MAB21L1在晶状体基板形成中的作用及其对基因表达和DNA代谢过程的调控 | Mab21l1基因敲除小鼠的晶状体外胚层 | NA | 先天性小脑、眼部、颅面和生殖系统（COFG）综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 131个基因下调，148个基因上调 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-20 |
Cellular heterogeneity of circulating CD4+CD8+ double-positive T cells characterized by single-cell RNA sequencing
2021-12-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-03013-4
PMID:34880348
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食蟹猴外周血中循环CD4+CD8+双阳性T细胞的组成和特性 | 研究发现循环中的CD4+CD8+双阳性T细胞不仅包含大量幼稚细胞，还包含多种具有潜在功能的异质性细胞群 | 尽管研究揭示了循环CD4+CD8+双阳性T细胞的更多亚型，但这一群体本身非常小 | 研究循环CD4+CD8+双阳性T细胞的组成和特性 | 食蟹猴外周血中的循环CD4+CD8+双阳性T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 食蟹猴的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-19 |
Thymus-Derived CD4+CD8+ Cells Reside in Mediastinal Adipose Tissue and the Aortic Arch
2021-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100208
PMID:34740961
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和三维全装图像技术，发现并证实了在胸腺、纵隔脂肪组织和主动脉外膜中存在双阳性CD4CD8αβ细胞（DP细胞），并探讨了这些细胞的转录特征及其在血管稳态中的潜在作用 | 发现了在健康和动脉粥样硬化小鼠模型中，除了胸腺外，纵隔脂肪组织和主动脉外膜中也存在双阳性CD4CD8αβ细胞，这些细胞具有独特的转录特征 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨双阳性CD4CD8αβ细胞在不同组织中的分布及其在血管稳态中的作用 | 双阳性CD4CD8αβ细胞在胸腺、纵隔脂肪组织和主动脉外膜中的分布及转录特征 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维全装图像技术 | NA | 细胞 | 健康和动脉粥样硬化小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-19 |
Stem/progenitor cells in normal physiology and disease of the pancreas
2021-12-01, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2021.111459
PMID:34543699
|
综述 | 本文综述了胚胎期和成年期胰腺干细胞/祖细胞在稳态和疾病中的研究进展 | 结合最新的测序技术、谱系追踪和类器官技术，探讨了成年胰腺中干细胞/祖细胞的存在及其在稳态和应激反应中的作用 | 由于实验结果的矛盾性，成年胰腺中干细胞/祖细胞的存在仍存在争议 | 探讨胰腺干细胞/祖细胞在正常生理和疾病中的作用 | 胚胎期和成年期的胰腺干细胞/祖细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-16 |
Cell-to-cell interaction analysis of prognostic ligand-receptor pairs in human pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2021.101126
PMID:34522794
|
研究论文 | 本文通过整合生存分析和单细胞细胞间相互作用预测，研究了人胰腺导管腺癌中与预后相关的配体-受体对 | 首次系统地分析了细胞间相互作用通过配体-受体对与胰腺导管腺癌预后的关联，并识别了潜在的治疗靶点 | 需要进一步确定这些配体-受体对的临床意义 | 识别与胰腺导管腺癌患者预后相关的配体-受体对，为治疗提供潜在靶点 | 胰腺导管腺癌中的细胞间相互作用及其与预后的关联 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个癌症队列的基因表达数据 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-10 |
A Comprehensive Survey of Statistical Approaches for Differential Expression Analysis in Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12121947
PMID:34946896
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序研究中差异表达分析的统计方法，并对19种常用方法在11个真实数据集上的表现进行了评估 | 本文首次全面评估了从批量RNA测序实践中改编的方法以及专门为单细胞RNA测序设计的方法，并提供了选择适当工具的指导 | 难以通过单一性能标准确定全局最佳表现的方法 | 为单细胞RNA测序中的差异表达分析选择合适的工具提供指导 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达分析方法 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-05 |
People critically ill with COVID-19 exhibit peripheral immune profiles predictive of mortality and reflective of SARS-CoV-2 lung viral burden
2021-12-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100476
PMID:34873589
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研究论文 | 本文研究了COVID-19重症患者的外周免疫状态与死亡率之间的关联 | 采用单细胞RNA测序对免疫状态进行高维剖析，揭示了与COVID-19死亡率相关的细胞分子特征 | 可能未能考虑所有潜在的免疫细胞状态和不同的临床变量 | 旨在阐明重症COVID-19患者的免疫细胞状态与死亡的关系 | 重症COVID-19患者的血液和呼吸样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 血液和呼吸样本 | 重症COVID-19患者的高维样本 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-05 |
An update on the phenotypic switching of vascular smooth muscle cells in the pathogenesis of atherosclerosis
2021-Dec-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04079-z
PMID:34936041
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综述 | 该文章综述了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的表型转变 | 文章强调了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化表型转变中的新发现，包括对转录标志物的下调及多种其他表型的采纳 | 文章未明确阐述血管平滑肌细胞转变的分子机制和过程 | 综述动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表型转变的挑战和需进一步研究的问题 | 血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化过程中的表型转变 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-05 |
Virally encoded connectivity transgenic overlay RNA sequencing (VECTORseq) defines projection neurons involved in sensorimotor integration
2021-12-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110131
PMID:34936877
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研究论文 | 本研究开发了一种新的RNA测序方法，用于定义参与感觉运动整合的投射神经元 | 提出了一种简便的、多重的RNA测序方法VECTORseq，能够高通量确定神经元亚型 | 现有的测序方法通量较低，操作复杂且成本高 | 定义不同脑区间连接的投射神经元的生理和行为角色 | 参与感觉运动整合的投射神经元 | 神经科学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of T and B cell repertoires following SARS-CoV-2 mRNA vaccine
2021-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153201
PMID:34935643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和功能性检测，比较了接种两剂SARS-CoV-2 mRNA疫苗后与无症状康复者之间的体液和细胞免疫反应 | 本研究发现接种疫苗后富集了针对刺突蛋白的B细胞、激活的CD4+ T细胞以及强大的抗原特异性多功能CD4+ T细胞反应 | 尽管观察到克隆扩增的CD8+ T细胞，但其反应相对较弱且变化较大 | 探究接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的转录和免疫谱变化 | T细胞和B细胞的免疫谱 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |