单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 229 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of T and B cell repertoires following SARS-CoV-2 mRNA vaccine
2021-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153201
PMID:34935643
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和功能性检测，比较了接种两剂SARS-CoV-2 mRNA疫苗后与无症状康复者之间的体液和细胞免疫反应 | 本研究发现接种疫苗后富集了针对刺突蛋白的B细胞、激活的CD4+ T细胞以及强大的抗原特异性多功能CD4+ T细胞反应 | 尽管观察到克隆扩增的CD8+ T细胞，但其反应相对较弱且变化较大 | 探究接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的转录和免疫谱变化 | T细胞和B细胞的免疫谱 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22 | 2024-08-07 |
Volumetric compression develops noise-driven single-cell heterogeneity
2021-12-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2110550118
PMID:34916290
|
研究论文 | 本文研究了物理压缩对非小细胞肺癌细胞异质性的影响，并通过单细胞转录组测序和单分子荧光原位杂交技术进行了验证 | 首次揭示了物理微环境对单细胞异质性的贡献，并展示了机械刺激通过改变转录动力学影响细胞命运决定的机制 | NA | 探讨物理微环境对单细胞异质性的影响及其机制 | 非小细胞肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
CARMN Is an Evolutionarily Conserved Smooth Muscle Cell-Specific LncRNA That Maintains Contractile Phenotype by Binding Myocardin
2021-12-07, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文研究了一种名为CARMN的进化保守的平滑肌细胞特异性长非编码RNA，通过结合肌动蛋白来维持收缩表型 | CARMN是首个被发现与肌动蛋白相互作用的非编码RNA，其在维持血管平滑肌细胞收缩表型中起着先前未被重视的作用 | NA | 研究CARMN在维持血管平滑肌细胞分化表型中的作用及其分子机制 | CARMN在血管平滑肌细胞中的表达及其对收缩表型的影响 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和鼠类的血管疾病模型，以及CARMN敲入和敲除的小鼠模型 |
| 24 | 2024-08-07 |
Impact of chemotherapy and immunotherapy on the composition and function of immune cells in COVID-19 convalescent with gynecological tumors
2021-12-04, Aging
DOI:10.18632/aging.203739
PMID:34862879
|
研究论文 | 研究了化疗和免疫治疗对COVID-19康复者中妇科肿瘤患者免疫细胞组成和功能的影响 | 发现COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫细胞分子特征与无肿瘤的COVID-19患者相似，且抗PD-L1治疗能显著增强NK细胞和T细胞的细胞毒性评分及T细胞的克隆扩增 | 样本量较小，仅包括3名健康捐赠者、4名COVID-19患者和4名COVID-19合并妇科肿瘤患者 | 探讨COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫记忆及其对化疗和免疫治疗的响应 | COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫细胞 | NA | 妇科肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 3名健康捐赠者，4名COVID-19患者，4名COVID-19合并妇科肿瘤患者 |
| 25 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals lasting changes in the lung cellular landscape into adulthood after neonatal hyperoxic exposure
2021-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2021.102091
PMID:34417156
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了新生期暴露于高氧环境的小鼠在成年期的肺细胞景观变化 | 首次揭示了新生期高氧暴露对成年期肺细胞景观的持久影响，并发现了类型II细胞状态的独特特征和功能变化 | 研究仅在动物模型中进行，结果需要进一步在人类中验证 | 探究新生期高氧暴露对成年期肺细胞景观和功能的长远影响 | 新生期暴露于高氧环境的小鼠的肺细胞 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个细胞，分为45个集群和32个细胞状态 |
| 26 | 2024-08-07 |
Clinical and therapeutic relevance of cancer-associated fibroblasts
2021-12, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00546-5
PMID:34489603
|
综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤发展和治疗中的临床相关性和治疗意义 | 通过单细胞RNA测序和新型小鼠模型，增加了对CAF多样性的理解 | 不同CAF群体的上下文依赖角色及其可互换的可塑性仍大多未知 | 探讨CAFs在癌症进展中的作用及其作为预后因子和治疗靶点的价值 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的复杂相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals B cell-related molecular biomarkers for Alzheimer's disease
2021-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00714-8
PMID:34880454
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自4名阿尔茨海默病（AD）患者和2名正常对照的外周血单个核细胞（PBMCs），探索了AD患者PBMCs中的差异细胞亚群，并发现了B细胞的显著减少。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了与AD进展相关的B细胞分子标志物，并通过功能实验验证了B细胞在AD早期阶段的作用。 | 研究样本量较小，且仅限于AD患者和正常对照，未来研究需要扩大样本量并考虑更多疾病阶段和人群。 | 探索阿尔茨海默病中与B细胞相关的分子标志物，以促进AD进展的临床识别。 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和B细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名AD患者（早期2名，晚期2名）和2名正常对照，以及43名AD患者和41名正常受试者 |
| 28 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome atlas of human mesenchymal stem cells exploring cellular heterogeneity
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.650
PMID:34965030
|
研究论文 | 本研究利用大规模并行多重单细胞RNA测序技术，构建了超过13万个单个间充质干细胞的转录组图谱，以评估其异质性 | 首次构建了人类间充质干细胞的综合单细胞图谱，并发现了七个组织特异性和五个保守的MSC亚群，这些亚群具有不同的基因表达特征 | NA | 探索间充质干细胞的细胞异质性，以促进基于MSC的治疗效果的潜在改进 | 人类间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过13万个单个间充质干细胞转录组，来自多个组织和供体，包括正常骨髓（3个）、脂肪组织（3个）、脐带（2个）和真皮（3个） |
| 29 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Seq reveals cellular landscape-specific characteristics and potential etiologies for adolescent idiopathic scoliosis
2021-Dec, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.1184
PMID:35005449
|
研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序技术，比较了青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观，揭示了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断，并通过细胞通信分析提供了骨细胞和软骨细胞分化功能障碍的可能发病机制。 | 首次通过单细胞分析揭示了AIS患者与健康受试者在细胞状态上的差异，并发现了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断。 | NA | 探讨青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者在脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观差异及其潜在的病因。 | 青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者的脊椎松质骨组织。 | 数字病理学 | 青少年特发性脊柱侧弯 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | t-分布随机邻域嵌入（t-SNE） | 基因组范围的转录组数据 | AIS患者与健康受试者的脊椎松质骨组织样本 |
| 30 | 2024-08-07 |
External signals regulate continuous transcriptional states in hematopoietic stem cells
2021-12-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66512
PMID:34939923
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了在小鼠造血干细胞和LSK前体细胞中，外部信号干扰素、粒细胞集落刺激因子和前列腺素对细胞状态的影响 | 首次全面分析了造血干细胞对外部刺激的反应异质性和特异性，并揭示了细胞内在的染色质状态与对外部信号反应的关系 | NA | 探究外部信号如何调控造血干细胞的连续转录状态 | 造血干细胞及其前体细胞对外部刺激的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-Seq） | NA | 基因表达数据 | 功能验证的小鼠造血干细胞和LSK前体细胞样本 |
| 31 | 2024-08-07 |
Single Cell Sequencing of Induced Pluripotent Stem Cell Derived Retinal Ganglion Cells (iPSC-RGC) Reveals Distinct Molecular Signatures and RGC Subtypes
2021-12-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12122015
PMID:34946963
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了由诱导多能干细胞（iPSC）衍生的视网膜神经节细胞（RGC），以识别不同的分子特征和RGC亚型 | 首次通过单细胞测序技术揭示了iPSC衍生的RGC中的分子特征和亚型多样性 | 仅限于使用特定技术（Chromium Single Cell 3' V3协议和Illumina Novaseq）进行测序，可能限制了数据的多功能性 | 旨在识别由iPSC衍生的RGC中的差异表达基因（DEG）和RGC亚型 | 人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 4705个细胞 |
| 32 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a strong connection between Gadd45g upregulation and oncolytic HSV infection in tumor tissue
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.10.006
PMID:34786476
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肿瘤组织在接受基于单纯疱疹病毒2的溶瘤病毒治疗后的基因表达谱 | 揭示了溶瘤病毒感染肿瘤细胞后Gadd45g基因显著上调的现象，并探讨了其对病毒复制的影响 | NA | 研究溶瘤病毒在肿瘤组织中的感染效率及其对肿瘤细胞基因表达的影响 | 肿瘤组织在接受溶瘤病毒治疗后的基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 33 | 2024-08-07 |
Dissociation of intact adult mouse cortical projection neurons for single-cell RNA-seq
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100941
PMID:34877546
|
research paper | 本文提供了一种改进的流程，用于从成年小鼠皮质中分离完整的投射神经元，适用于液滴和板式单细胞RNA测序、qPCR、免疫细胞化学和长期细胞培养等应用 | 该协议使用现成的试剂，无需昂贵的分离试剂盒，通过独特的孵育步骤和FACS门控策略，实现了对成年大脑皮质神经元前所未有的富集 | NA | 开发一种稳健且可重复的分离流程，用于从成年小鼠皮质中分离完整的投射神经元 | 成年小鼠皮质中的投射神经元 | digital pathology | NA | single-cell RNA-seq | NA | RNA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Beyondcell: targeting cancer therapeutic heterogeneity in single-cell RNA-seq data
2021-12-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-01001-x
PMID:34911571
|
研究论文 | 本文介绍了Beyondcell方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别具有不同药物反应的肿瘤细胞亚群并提出癌症特异性治疗方案 | Beyondcell方法通过计算药物签名富集分数，界定治疗簇（TCs）在细胞群体中的分布，并确定细胞群体间的治疗差异，生成基于敏感性的优先级排名以指导药物选择 | NA | 开发一种计算方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别肿瘤细胞亚群并提出癌症特异性治疗方案 | 单细胞RNA测序数据中的肿瘤细胞亚群及其药物反应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 五个单细胞数据集 |
| 35 | 2024-08-07 |
Predicting heterogeneity in clone-specific therapeutic vulnerabilities using single-cell transcriptomic signatures
2021-12-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-01000-y
PMID:34915921
|
研究论文 | 本文通过大规模癌症组学数据分析，利用单细胞RNA测序和推荐系统CaDRReS-Sc，研究了肿瘤内转录组异质性对预测临床结果的重要性，并展示了异质基因表达特征在预测药物反应中的高准确性 | 本文首次利用单细胞RNA测序和推荐系统CaDRReS-Sc，展示了异质基因表达特征在预测药物反应中的高准确性，并验证了其在单药治疗和组合治疗中的有效性 | NA | 研究肿瘤内转录组异质性对预测临床结果的影响，并开发一种新的方法来加速药物再利用研究 | 肿瘤内转录组异质性和药物反应预测 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 推荐系统 | 转录组数据 | 大规模癌症组学数据集和患者近端细胞系 |
| 36 | 2024-08-07 |
Deciphering regulatory protein activity in human pancreatic islets via reverse engineering of single-cell sequencing data
2021-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154482
PMID:34907912
|
研究论文 | 本文通过逆向工程从单细胞RNA测序数据中解析了人类胰岛中调控蛋白的活性，并探讨了这些活性在2型糖尿病（T2D）中的独特模式 | 首次应用逆向工程方法从单细胞RNA测序数据中获取调控蛋白活性，并识别出与T2D相关的独特调控蛋白活性模式 | NA | 揭示2型糖尿病中胰岛功能障碍的分子机制 | 人类胰岛中的调控蛋白活性 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 非糖尿病和T2D患者的胰岛样本 |
| 37 | 2024-08-07 |
Single-cell characterization of monolayer cultured human dental pulp stem cells with enhanced differentiation capacity
2021-12-15, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-021-00140-6
PMID:34911932
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术研究了新鲜分离和单层培养的人牙髓干细胞的转录差异 | 首次揭示了单层培养的人牙髓干细胞与新鲜分离的细胞在细胞组成上的变化，并发现了一种具有增强分化潜能的亚群 | NA | 研究单层培养的人牙髓干细胞的转录差异及其在再生医学中的潜在价值 | 人牙髓干细胞及其在单层培养后的转录特征 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Benchmarking UMI-based single-cell RNA-seq preprocessing workflows
2021-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02552-3
PMID:34906205
|
研究论文 | 本文系统地比较了10种基于UMI的单细胞RNA测序预处理工作流程的性能 | 首次全面比较了多种单细胞RNA测序预处理工作流程，并评估了它们对下游分析的影响 | 未详细讨论每种工作流程的具体技术细节和潜在的改进空间 | 比较不同单细胞RNA测序预处理工作流程的性能，并评估它们对下游分析的影响 | 10种基于UMI的单细胞RNA测序预处理工作流程 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用不同生物复杂性水平的数据集 |
| 39 | 2024-08-07 |
CIDER: an interpretable meta-clustering framework for single-cell RNA-seq data integration and evaluation
2021-12-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02561-2
PMID:34903266
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CIDER的可解释元聚类框架，用于单细胞RNA测序数据的综合和评估 | CIDER在模拟和真实数据集上均优于其他单细胞RNA测序聚类方法和整合方法，并且可以评估真实数据集中整合的生物学正确性，而不需要先验的细胞注释 | NA | 开发一种新的方法来解决单细胞RNA测序数据聚类中的批次效应和生物学变异问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 元聚类框架 | RNA测序数据 | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
geneBasis: an iterative approach for unsupervised selection of targeted gene panels from scRNA-seq
2021-12-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02548-z
PMID:34872616
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为geneBasis的无监督迭代方法，用于从scRNA-seq数据集中选择最优基因面板 | geneBasis方法通过迭代选择能够最大化真实流形与当前选定基因面板构建流形之间距离的基因，从而优于现有策略 | NA | 旨在从scRNA-seq数据中选择适用于空间转录组学等技术的最优基因子集 | scRNA-seq数据集中的基因面板选择 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA |