单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 229 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
Therapeutic HNF4A mRNA attenuates liver fibrosis in a preclinical model
2021-12, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.08.011
PMID:34453962
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研究论文 | 本研究探讨了通过mRNA递送技术恢复肝细胞功能以治疗肝纤维化和肝硬化的效果，特别是评估了人肝细胞核因子α（HNF4A）mRNA在肝纤维化和肝硬化小鼠模型中的治疗效果。 | 首次提供了直接的临床前证据，证明HNF4A mRNA疗法适用于治疗肝脏纤维化。 | NA | 评估mRNA递送技术在治疗肝纤维化和肝硬化中的应用。 | 人肝细胞核因子α（HNF4A）mRNA在肝纤维化和肝硬化小鼠模型中的治疗效果。 | NA | 肝纤维化 | mRNA递送技术 | NA | 基因表达 | 多个小鼠模型，包括肝毒素和胆汁淤积诱导的肝纤维化模型。 |
| 202 | 2024-08-08 |
Microglial 'fat shaming' in development and disease
2021-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2021.07.007
PMID:34455405
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在脑发育和疾病中的作用，特别是它们在神经退行性疾病中对脂质处理和运输的影响。 | 利用单细胞RNA测序方法，深入研究了微胶质细胞的异质性和对环境变化的转录反应。 | NA | 探讨微胶质细胞在脑发育和神经退行性疾病中的分子机制。 | 微胶质细胞在神经退行性疾病中的脂质积累和代谢。 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 203 | 2024-08-08 |
Multiomic analysis reveals decidual-specific transcriptional programing of MAIT cells
2021-12, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13495
PMID:34411378
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了妊娠期子宫内膜MAIT细胞的转录程序 | 首次详细描述了妊娠期子宫内膜MAIT细胞的转录程序，并探讨了其在母胎界面组织修复机制中的潜在作用 | 实验仅限于体外激活和基因表达分析，未涉及体内功能验证 | 探究妊娠期子宫内膜MAIT细胞的转录程序及其功能 | 子宫内膜MAIT细胞及其转录因子表达 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括子宫内膜基底层和壁层的单核细胞以及对照的PBMCs |
| 204 | 2024-08-08 |
Author Corrections: Reconstruction of cell spatial organization from single-cell RNA sequencing data based on ligand-receptor mediated self-assembly
2021-Dec, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00550-5
PMID:34381185
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-08 |
Spatially Distinct Reprogramming of the Tumor Microenvironment Based On Tumor Invasion in Diffuse-Type Gastric Cancers
2021-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-0792
PMID:34385296
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了弥漫型胃癌肿瘤微环境的空间重编程，揭示了肿瘤侵袭性的潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了弥漫型胃癌肿瘤微环境中与肿瘤侵袭性相关的细胞成分和分子特征 | 研究样本仅来自五名患者，可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探究弥漫型胃癌肿瘤微环境中与肿瘤侵袭性相关的细胞和分子特征 | 弥漫型胃癌的肿瘤微环境及其与肿瘤侵袭性的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 五名弥漫型胃癌患者的新鲜采集的癌组织和配对正常组织 |
| 206 | 2024-08-08 |
A single-cell morpho-transcriptomic map of brassinosteroid action in the Arabidopsis root
2021-12-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2021.07.021
PMID:34358681
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研究论文 | 本研究结合数字三维单细胞形态分析和单细胞mRNA测序，探讨了油菜素内酯信号在拟南芥根中的作用 | 首次揭示了油菜素内酯信号对细胞分裂平面精确方向和细胞扩张程度及时间的影响，并发现了其通过非细胞自主功能对远距离细胞的正常化作用 | NA | 研究油菜素内酯信号在拟南芥根发育中的具体作用 | 拟南芥根的分生组织和成熟根段 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 图像 | 油菜素内酯信号缺失突变体和野生型拟南芥根的分生组织及成熟根段 |
| 207 | 2024-08-08 |
Farnesoid X Receptor Is Required for the Redifferentiation of Bipotential Progenitor Cells During Biliary-Mediated Zebrafish Liver Regeneration
2021-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32076
PMID:34320243
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研究论文 | 本研究探讨了法尼醇X受体（FXR）在胆管介导的斑马鱼肝脏再生中对双潜能祖细胞（BPPCs）再分化的调控作用 | 首次揭示了FXR通过ERK1和Notch分别调控BPPC向肝细胞和胆管上皮细胞的再分化 | NA | 研究FXR在胆管上皮细胞介导的肝脏再生中的作用及其机制 | 斑马鱼模型中的双潜能祖细胞（BPPCs）及其再分化过程 | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、定量实时PCR、荧光原位杂交、抗体染色 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 208 | 2024-08-08 |
FlowGrid enables fast clustering of very large single-cell RNA-seq data
2021-12-22, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab521
PMID:34289014
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研究论文 | 本文介绍了一个名为FlowGrid的开源Python包，用于对大规模单细胞RNA测序数据进行快速聚类 | FlowGrid采用了一种快速基于密度的聚类算法，并引入了新的自动参数调整过程，能够在保持高聚类准确性的同时显著减少运行时间 | NA | 开发可扩展的聚类算法以分析大规模单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于密度的聚类算法 | 基因表达数据 | 数百万个细胞 |
| 209 | 2024-08-08 |
HieRFIT: a hierarchical cell type classification tool for projections from complex single-cell atlas datasets
2021-12-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab499
PMID:34255817
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研究论文 | 本文介绍了一种新的细胞类型投影工具HieRFIT，基于层次随机森林，用于从复杂的单细胞图谱数据集中进行细胞类型分类 | HieRFIT利用先验的细胞类型关系信息提高分类准确性，采用集成方法结合多个随机森林模型，组织成层次决策树结构，以改善分类准确性和减少错误预测 | NA | 开发一种新的细胞类型分类工具，以提高单细胞RNA测序数据集的分类准确性 | 单细胞RNA测序数据集中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 210 | 2024-08-08 |
Ex vivo mass cytometry analysis reveals a profound myeloid proinflammatory signature in psoriatic arthritis synovial fluid
2021-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220280
PMID:34226188
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术（CyTOF）结合转录组分析，生成匹配的银屑病关节炎（PsA）滑液（SF）和血液白细胞的高维数据集，旨在识别未刺激淋巴细胞和髓系细胞中的细胞因子产生。 | 本研究首次通过多组学分析，生成了PsA滑液和血液的全面细胞图谱，揭示了PsA中潜在的致病性和治疗重要性的关键扩展髓系促炎模块。 | NA | 识别银屑病关节炎滑液中未刺激淋巴细胞和髓系细胞的细胞因子产生 | 银屑病关节炎（PsA）滑液（SF）和血液白细胞 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 高维数据集 | 新鲜滑液和配对血液样本 |
| 211 | 2024-08-08 |
Adult-repopulating lymphoid potential of yolk sac blood vessels is not confined to arterial endothelial cells
2021-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-1935-2
PMID:34181164
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研究论文 | 本研究通过综合分析多个单细胞RNA测序数据集，鉴定了中期妊娠期卵黄囊中六种分子上不同的内皮细胞群体，并探讨了这些内皮细胞的造血潜能及其在淋巴细胞生成中的作用。 | 首次揭示了卵黄囊内皮细胞在淋巴细胞生成中的潜能，并发现这种潜能不仅限于动脉内皮细胞，为理解哺乳动物发育过程中造血干细胞前体的来源提供了理论基础。 | NA | 探讨卵黄囊内皮细胞的造血潜能及其在淋巴细胞生成中的作用。 | 卵黄囊内皮细胞及其在造血干细胞前体生成中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 212 | 2024-08-08 |
Breaking the barrier: In vitro models to study choroid plexus development
2021-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2021.05.005
PMID:34182208
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研究论文 | 本文讨论了利用体外模型研究脉络丛发育及其在脑脊液分泌和屏障功能中的作用 | 介绍了利用新型技术如体内成像、单细胞转录组学和体外三维培养来研究脉络丛生物学的新突破 | 由于伦理和技术限制，人类脉络丛的具体机制仍了解较少 | 探讨体外模型在研究人类脑脊液分泌和屏障功能中的应用 | 脉络丛的发育及其在脑脊液分泌和屏障功能中的作用 | NA | NA | 体内成像、单细胞转录组学、体外三维培养 | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-08-08 |
TIPD: A Probability Distribution-Based Method for Trajectory Inference from Single-Cell RNA-Seq Data
2021-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00445-4
PMID:34109565
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研究论文 | 本文提出了一种基于概率分布的单细胞RNA测序数据轨迹推断方法TIPD | TIPD方法结合信号熵和基因表达谱的聚类结果来描述细胞群体的异质性概率分布，无需外部知识即可确定分化轨迹的方向 | NA | 开发一种新的轨迹推断方法，以更准确地描述细胞分化和发育过程中的生物异质性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最小生成树（MST） | 基因表达数据 | 四个已发表的单细胞RNA测序数据集 |
| 214 | 2024-08-08 |
Single-cell immune checkpoint landscape of PBMCs stimulated with Candida albicans
2021-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2021.1942228
PMID:34120578
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研究论文 | 本研究重新分析了单细胞RNA测序数据，探讨了在白色念珠菌感染后外周血单个核细胞中免疫检查点的表达模式 | 首次详细描述了在真菌感染中不同免疫细胞亚群的免疫检查点活动异质性 | NA | 探索在真菌感染后免疫检查点的表达模式及其在治疗中的潜在应用 | 外周血单个核细胞在白色念珠菌刺激后的免疫检查点表达 | 免疫学 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 215 | 2024-08-09 |
Fibroblasts positive for meflin have anti-fibrotic properties in pulmonary fibrosis
2021-12, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03397-2020
PMID:34049947
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研究论文 | 本研究探讨了表达meflin的成纤维细胞在特发性肺纤维化（IPF）中的抗纤维化作用 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了meflin阳性成纤维细胞在IPF中的作用，并利用bleomycin诱导的肺纤维化模型验证了其抗纤维化特性 | 研究仅限于meflin阳性成纤维细胞的作用，未探讨其他类型成纤维细胞在IPF中的作用 | 确定meflin阳性成纤维细胞在特发性肺纤维化发展中的作用 | meflin阳性成纤维细胞在特发性肺纤维化中的功能 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 243,472个细胞来自32个IPF肺和29个正常肺样本 |
| 216 | 2024-08-09 |
A New Hypothesis for Type 1 Diabetes Risk: The At-Risk Allele at rs3842753 Associates With Increased Beta-Cell INS Messenger RNA in a Meta-Analysis of Single-Cell RNA-Sequencing Data
2021-Dec, Canadian journal of diabetes
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jcjd.2021.03.007
PMID:34052132
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据的荟萃分析，探讨了rs3842753位点的遗传变异与1型糖尿病风险之间的关系及其分子机制 | 首次在大规模单细胞水平上研究了rs3842753位点的遗传变异对INS mRNA表达的影响 | 研究样本主要来自成年无糖尿病和2型糖尿病患者，可能无法完全代表所有1型糖尿病患者的情况 | 探究rs3842753位点的遗传变异与1型糖尿病风险之间的关系及其分子机制 | rs3842753位点的遗传变异对INS mRNA表达的影响 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共整合了2,315个β细胞和1,223个β样细胞，来自13名A/A保护型供体、23名A/C杂合子供体和35名C/C风险供体 |
| 217 | 2024-08-09 |
Updating the pathophysiology of arthritic bone destruction: identifying and visualizing pathological osteoclasts in pannus
2021-Dec, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2021.1913883
PMID:34010590
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和活体成像技术在关节炎骨破坏病理生理学中的应用 | 应用单细胞RNA测序技术揭示了炎症滑膜中成熟破骨细胞前体的异质性，并使用活体成像技术实时观察破骨细胞和免疫细胞的动态 | NA | 探讨破骨细胞在关节炎骨侵蚀中的作用及其前体细胞的异质性 | 破骨细胞及其前体细胞在不同组织环境中的起源和特性 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、多光子显微镜活体成像 | NA | RNA序列、图像 | NA |
| 218 | 2024-08-09 |
Cellsnp-lite: an efficient tool for genotyping single cells
2021-12-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab358
PMID:33963851
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研究论文 | 介绍了一种名为cellsnp-lite的软件工具，用于单细胞测序数据的基因分型 | cellsnp-lite在计算速度和内存效率方面相比现有方法有显著提升，同时保持高度一致的结果 | NA | 开发适用于单细胞测序数据的基因分型方法 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 219 | 2024-08-09 |
The diversity of adult lung epithelial stem cells and their niche in homeostasis and regeneration
2021-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1902-3
PMID:33948870
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综述 | 本文综述了成年肺部上皮干细胞及其微环境在稳态和再生中的多样性 | 利用单细胞测序、谱系追踪和活体组织成像技术，深入理解了干细胞异质性、过渡状态和特定细胞谱系标记 | NA | 探讨成年肺部上皮干细胞及其微环境在稳态和再生中的作用 | 成年肺部上皮干细胞及其微环境 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-08-09 |
Leveraging Single-Cell Sequencing for Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapies
2021-12, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2021.03.005
PMID:33832782
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研究论文 | 本文探讨了如何利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术来分析嵌合抗原受体（CAR）-T细胞疗法的基因表达特征，以优化CAR设计、生产条件、治疗组合及疾病结果 | 本文首次详细描述了单细胞RNA测序在CAR-T细胞疗法中的应用，为该疗法的发展和临床监测提供了新的工具 | NA | 提高CAR-T细胞疗法对癌症的治疗效果 | CAR-T细胞的基因表达特征及其在治疗中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |