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当前共找到 229 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-08 |
Molecular Profiling of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Autopsies Uncovers Novel Disease Mechanisms
2021-12, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2021.08.009
PMID:34506752
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研究论文 | 本研究利用多尺度下一代RNA测序方法（包括批量、单核和空间转录组学）评估COVID-19快速尸检组织，以提供前所未有的分子分辨率，揭示COVID-19诱导的损伤。 | 通过比较感染与未感染组织，发现了四个主要的调控通路，并提出了潜在的新治疗靶点。 | 研究样本量较小，需要扩展到更大的数据集以进一步理解COVID-19的病理生理机制。 | 旨在通过先进的分子技术评估COVID-19尸检组织，以识别通路和效应器，并在单细胞水平上绘制多样化的受体，从而帮助解析驱动个体患者临床过程差异的因素。 | COVID-19患者的快速尸检组织。 | 数字病理学 | COVID-19 | 下一代RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及不同症状的两名患者尸检组织 | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2024-08-08 |
Single-Cell Profiling Reveals Metabolic Reprogramming as a Resistance Mechanism in BRAF-Mutated Multiple Myeloma
2021-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-2040
PMID:34518309
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了BRAF突变的多发性骨髓瘤中，通过代谢重编程作为对精准医疗产生抗性的机制。 | 研究发现癌症细胞能够通过转录状态改变、表观遗传适应和代谢重塑快速适应精准治疗，从而暴露出新的脆弱性。 | NA | 研究BRAF突变的多发性骨髓瘤细胞是否能通过快速适应BRAF抑制剂治疗来确保其生存，以此作为精准医疗抗性的模型。 | BRAF突变的多发性骨髓瘤患者和细胞系 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA-seq、H3K27ac染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、代谢通量分析 | NA | RNA | 3名BRAF突变的多发性骨髓瘤患者和1名健康捐赠者的1,495个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the epithelial cell heterogeneity and invasive subpopulation in human bladder cancer
2021-12-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33794
PMID:34480339
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研究论文 | 本研究利用基于液滴的单细胞RNA测序技术，分析了来自七名膀胱癌患者的36,619个单细胞的转录组，揭示了膀胱癌中上皮细胞的异质性和侵袭性亚群 | 首次详细分析了膀胱肿瘤细胞的侵袭性和细胞间交流，特别是在T1和T3肿瘤中发现了与癌症干细胞标记物高表达相关的特征 | NA | 深入了解与膀胱癌进展相关的肿瘤细胞异质性 | 膀胱癌中的上皮细胞异质性和侵袭性亚群 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 36,619个单细胞来自七名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals invasive trajectory and determines cancer stem cell-related prognostic genes in pancreatic cancer
2021-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2021.1962484
PMID:34474642
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤样本和对照胰腺组织，揭示了癌症干细胞（CSC）样导管细胞向具有侵袭潜力的导管细胞的转化过程，并筛选出CSC相关基因（CRGs） | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示了胰腺癌中导管细胞的侵袭轨迹，并构建了基于CRGs的风险预测模型 | NA | 揭示胰腺癌中癌症干细胞的侵袭轨迹并确定相关的预后基因 | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤样本和对照胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了来自癌症基因组图谱（Cancer Genome Atlas）和基因表达综合（Gene Expression Omnibus）数据库的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-08 |
Therapeutic HNF4A mRNA attenuates liver fibrosis in a preclinical model
2021-12, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.08.011
PMID:34453962
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研究论文 | 本研究探讨了通过mRNA递送技术恢复肝细胞功能以治疗肝纤维化和肝硬化的效果，特别是评估了人肝细胞核因子α（HNF4A）mRNA在肝纤维化和肝硬化小鼠模型中的治疗效果。 | 首次提供了直接的临床前证据，证明HNF4A mRNA疗法适用于治疗肝脏纤维化。 | NA | 评估mRNA递送技术在治疗肝纤维化和肝硬化中的应用。 | 人肝细胞核因子α（HNF4A）mRNA在肝纤维化和肝硬化小鼠模型中的治疗效果。 | NA | 肝纤维化 | mRNA递送技术 | NA | 基因表达 | 多个小鼠模型，包括肝毒素和胆汁淤积诱导的肝纤维化模型。 | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2024-08-08 |
Microglial 'fat shaming' in development and disease
2021-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2021.07.007
PMID:34455405
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在脑发育和疾病中的作用，特别是它们在神经退行性疾病中对脂质处理和运输的影响。 | 利用单细胞RNA测序方法，深入研究了微胶质细胞的异质性和对环境变化的转录反应。 | NA | 探讨微胶质细胞在脑发育和神经退行性疾病中的分子机制。 | 微胶质细胞在神经退行性疾病中的脂质积累和代谢。 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2024-08-08 |
Author Corrections: Reconstruction of cell spatial organization from single-cell RNA sequencing data based on ligand-receptor mediated self-assembly
2021-Dec, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00550-5
PMID:34381185
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2024-08-08 |
Spatially Distinct Reprogramming of the Tumor Microenvironment Based On Tumor Invasion in Diffuse-Type Gastric Cancers
2021-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-0792
PMID:34385296
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了弥漫型胃癌肿瘤微环境的空间重编程，揭示了肿瘤侵袭性的潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了弥漫型胃癌肿瘤微环境中与肿瘤侵袭性相关的细胞成分和分子特征 | 研究样本仅来自五名患者，可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探究弥漫型胃癌肿瘤微环境中与肿瘤侵袭性相关的细胞和分子特征 | 弥漫型胃癌的肿瘤微环境及其与肿瘤侵袭性的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 五名弥漫型胃癌患者的新鲜采集的癌组织和配对正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-08-08 |
A single-cell morpho-transcriptomic map of brassinosteroid action in the Arabidopsis root
2021-12-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2021.07.021
PMID:34358681
|
研究论文 | 本研究结合数字三维单细胞形态分析和单细胞mRNA测序，探讨了油菜素内酯信号在拟南芥根中的作用 | 首次揭示了油菜素内酯信号对细胞分裂平面精确方向和细胞扩张程度及时间的影响，并发现了其通过非细胞自主功能对远距离细胞的正常化作用 | NA | 研究油菜素内酯信号在拟南芥根发育中的具体作用 | 拟南芥根的分生组织和成熟根段 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 图像 | 油菜素内酯信号缺失突变体和野生型拟南芥根的分生组织及成熟根段 | NA | NA | NA | NA |
| 210 | 2024-08-08 |
Farnesoid X Receptor Is Required for the Redifferentiation of Bipotential Progenitor Cells During Biliary-Mediated Zebrafish Liver Regeneration
2021-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32076
PMID:34320243
|
研究论文 | 本研究探讨了法尼醇X受体（FXR）在胆管介导的斑马鱼肝脏再生中对双潜能祖细胞（BPPCs）再分化的调控作用 | 首次揭示了FXR通过ERK1和Notch分别调控BPPC向肝细胞和胆管上皮细胞的再分化 | NA | 研究FXR在胆管上皮细胞介导的肝脏再生中的作用及其机制 | 斑马鱼模型中的双潜能祖细胞（BPPCs）及其再分化过程 | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、定量实时PCR、荧光原位杂交、抗体染色 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-08-08 |
FlowGrid enables fast clustering of very large single-cell RNA-seq data
2021-12-22, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab521
PMID:34289014
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为FlowGrid的开源Python包，用于对大规模单细胞RNA测序数据进行快速聚类 | FlowGrid采用了一种快速基于密度的聚类算法，并引入了新的自动参数调整过程，能够在保持高聚类准确性的同时显著减少运行时间 | NA | 开发可扩展的聚类算法以分析大规模单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于密度的聚类算法 | 基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-08-08 |
HieRFIT: a hierarchical cell type classification tool for projections from complex single-cell atlas datasets
2021-12-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab499
PMID:34255817
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的细胞类型投影工具HieRFIT，基于层次随机森林，用于从复杂的单细胞图谱数据集中进行细胞类型分类 | HieRFIT利用先验的细胞类型关系信息提高分类准确性，采用集成方法结合多个随机森林模型，组织成层次决策树结构，以改善分类准确性和减少错误预测 | NA | 开发一种新的细胞类型分类工具，以提高单细胞RNA测序数据集的分类准确性 | 单细胞RNA测序数据集中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-08-08 |
Adult-repopulating lymphoid potential of yolk sac blood vessels is not confined to arterial endothelial cells
2021-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-1935-2
PMID:34181164
|
研究论文 | 本研究通过综合分析多个单细胞RNA测序数据集，鉴定了中期妊娠期卵黄囊中六种分子上不同的内皮细胞群体，并探讨了这些内皮细胞的造血潜能及其在淋巴细胞生成中的作用。 | 首次揭示了卵黄囊内皮细胞在淋巴细胞生成中的潜能，并发现这种潜能不仅限于动脉内皮细胞，为理解哺乳动物发育过程中造血干细胞前体的来源提供了理论基础。 | NA | 探讨卵黄囊内皮细胞的造血潜能及其在淋巴细胞生成中的作用。 | 卵黄囊内皮细胞及其在造血干细胞前体生成中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-08-08 |
TIPD: A Probability Distribution-Based Method for Trajectory Inference from Single-Cell RNA-Seq Data
2021-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00445-4
PMID:34109565
|
研究论文 | 本文提出了一种基于概率分布的单细胞RNA测序数据轨迹推断方法TIPD | TIPD方法结合信号熵和基因表达谱的聚类结果来描述细胞群体的异质性概率分布，无需外部知识即可确定分化轨迹的方向 | NA | 开发一种新的轨迹推断方法，以更准确地描述细胞分化和发育过程中的生物异质性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最小生成树（MST） | 基因表达数据 | 四个已发表的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-08-08 |
Single-cell immune checkpoint landscape of PBMCs stimulated with Candida albicans
2021-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2021.1942228
PMID:34120578
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研究论文 | 本研究重新分析了单细胞RNA测序数据，探讨了在白色念珠菌感染后外周血单个核细胞中免疫检查点的表达模式 | 首次详细描述了在真菌感染中不同免疫细胞亚群的免疫检查点活动异质性 | NA | 探索在真菌感染后免疫检查点的表达模式及其在治疗中的潜在应用 | 外周血单个核细胞在白色念珠菌刺激后的免疫检查点表达 | 免疫学 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2024-08-09 |
Fibroblasts positive for meflin have anti-fibrotic properties in pulmonary fibrosis
2021-12, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03397-2020
PMID:34049947
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研究论文 | 本研究探讨了表达meflin的成纤维细胞在特发性肺纤维化（IPF）中的抗纤维化作用 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了meflin阳性成纤维细胞在IPF中的作用，并利用bleomycin诱导的肺纤维化模型验证了其抗纤维化特性 | 研究仅限于meflin阳性成纤维细胞的作用，未探讨其他类型成纤维细胞在IPF中的作用 | 确定meflin阳性成纤维细胞在特发性肺纤维化发展中的作用 | meflin阳性成纤维细胞在特发性肺纤维化中的功能 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 243,472个细胞来自32个IPF肺和29个正常肺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-08-09 |
A New Hypothesis for Type 1 Diabetes Risk: The At-Risk Allele at rs3842753 Associates With Increased Beta-Cell INS Messenger RNA in a Meta-Analysis of Single-Cell RNA-Sequencing Data
2021-Dec, Canadian journal of diabetes
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jcjd.2021.03.007
PMID:34052132
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据的荟萃分析，探讨了rs3842753位点的遗传变异与1型糖尿病风险之间的关系及其分子机制 | 首次在大规模单细胞水平上研究了rs3842753位点的遗传变异对INS mRNA表达的影响 | 研究样本主要来自成年无糖尿病和2型糖尿病患者，可能无法完全代表所有1型糖尿病患者的情况 | 探究rs3842753位点的遗传变异与1型糖尿病风险之间的关系及其分子机制 | rs3842753位点的遗传变异对INS mRNA表达的影响 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共整合了2,315个β细胞和1,223个β样细胞，来自13名A/A保护型供体、23名A/C杂合子供体和35名C/C风险供体 | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2024-08-09 |
Updating the pathophysiology of arthritic bone destruction: identifying and visualizing pathological osteoclasts in pannus
2021-Dec, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2021.1913883
PMID:34010590
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和活体成像技术在关节炎骨破坏病理生理学中的应用 | 应用单细胞RNA测序技术揭示了炎症滑膜中成熟破骨细胞前体的异质性，并使用活体成像技术实时观察破骨细胞和免疫细胞的动态 | NA | 探讨破骨细胞在关节炎骨侵蚀中的作用及其前体细胞的异质性 | 破骨细胞及其前体细胞在不同组织环境中的起源和特性 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、多光子显微镜活体成像 | NA | RNA序列、图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-08-09 |
Cellsnp-lite: an efficient tool for genotyping single cells
2021-12-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab358
PMID:33963851
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研究论文 | 介绍了一种名为cellsnp-lite的软件工具，用于单细胞测序数据的基因分型 | cellsnp-lite在计算速度和内存效率方面相比现有方法有显著提升，同时保持高度一致的结果 | NA | 开发适用于单细胞测序数据的基因分型方法 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-08-09 |
The diversity of adult lung epithelial stem cells and their niche in homeostasis and regeneration
2021-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1902-3
PMID:33948870
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综述 | 本文综述了成年肺部上皮干细胞及其微环境在稳态和再生中的多样性 | 利用单细胞测序、谱系追踪和活体组织成像技术，深入理解了干细胞异质性、过渡状态和特定细胞谱系标记 | NA | 探讨成年肺部上皮干细胞及其微环境在稳态和再生中的作用 | 成年肺部上皮干细胞及其微环境 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |