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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-16 |
Mouse and human share conserved transcriptional programs for interneuron development
2021-Dec-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj6641
PMID:34882453
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类与小鼠在中间神经元发育过程中共享保守的转录调控程序 | 首次在人类胚胎脑组织中系统表征神经节隆起区域的细胞多样性,并发现与啮齿类动物相似的转录调控机制 | 研究仅关注胚胎发育阶段,未涉及成年期神经元功能验证 | 探究人类GABA能神经元发育的转录调控机制及其进化保守性 | 人类胚胎脑组织中的神经节隆起区域细胞 | 神经科学 | 自闭症、精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胚胎脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-05 |
Decoding molecular and cellular heterogeneity of mouse nucleus accumbens
2021-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00938-x
PMID:34663959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术,构建了小鼠伏隔核的细胞图谱,揭示了其细胞异质性 | 首次结合单细胞转录组和空间信息构建小鼠伏隔核的细胞分类系统,揭示了神经元亚型的转录和空间多样性 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证 | 解析小鼠伏隔核的分子、细胞和解剖异质性 | 小鼠伏隔核脑区 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
mDrop-Seq: Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq of Saccharomyces cerevisiae and Candida albicans
2021-Dec-27, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10010030
PMID:35062691
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研究论文 | 开发了一种名为mDrop-seq的高通量单细胞RNA测序技术,用于酵母菌的转录组分析 | 针对微生物物种开发了首个高通量单细胞RNA测序技术,解决了细胞壁坚硬和RNA量低的技术挑战 | 仅应用于两种酵母菌物种,尚未在其他微生物中验证 | 开发适用于微生物的高通量单细胞RNA测序技术并验证其应用价值 | 酿酒酵母和白色念珠菌 | 单细胞测序技术 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 酿酒酵母35,109个细胞,白色念珠菌39,705个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | mDrop-seq | 微生物Drop-seq技术,专门针对酵母菌优化 |
| 4 | 2025-10-06 |
Multiomic analysis reveals decidual-specific transcriptional programing of MAIT cells
2021-12, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13495
PMID:34411378
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了子宫蜕膜中MAIT细胞的独特转录编程特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了子宫蜕膜与匹配外周血MAIT细胞的转录组差异,并证实了蜕膜APCs表达MR1分子 | 样本来源仅限于子宫蜕膜组织,未涉及其他妊娠相关组织;功能验证主要基于体外刺激实验 | 探究妊娠期子宫蜕膜中MAIT细胞的转录编程特征和功能特性 | 子宫蜕膜基底層和壁層的单核细胞及匹配的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 多组学分析,流式细胞术,CITE-seq,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 子宫蜕膜组织和匹配的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq,表位测序 | NA | CITE-seq结合单细胞RNA测序基因表达分析 |
| 5 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals lasting changes in the lung cellular landscape into adulthood after neonatal hyperoxic exposure
2021-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2021.102091
PMID:34417156
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示新生期高氧暴露对成年后肺细胞景观的持久性改变 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统揭示新生期高氧暴露导致成年期肺细胞组成持续改变,特别是五类II型细胞状态的独特特征和功能变化 | 研究基于小鼠模型,人类样本验证有限;仅观察了两个时间点(pnd7和pnd60) | 探究早期高氧暴露对后期生命阶段肺细胞景观的长期影响及其与肺损伤的关系 | 新生小鼠肺组织细胞 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过10,000个细胞,45个细胞簇,32种细胞状态 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
CCR2 Signaling Restricts SARS-CoV-2 Infection
2021-12-21, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02749-21
PMID:34749524
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了CCR2信号通路在限制SARS-CoV-2感染中的保护作用机制 | 首次在小鼠模型中证明CCR2信号通过促进单核细胞肺内浸润限制SARS-CoV-2病毒载量 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明COVID-19先天免疫保护机制 | SARS-CoV-2感染小鼠模型 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活体抗体标记 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Cell-by-cell dissection of phloem development links a maturation gradient to cell specialization
2021-Dec-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba5531
PMID:34941412
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学解析植物韧皮部发育轨迹,揭示了成熟梯度与细胞特化的关联机制 | 首次在单细胞水平重建韧皮部发育全过程,发现PEAR转录因子通过激活GTPase信号介导谱系分叉,并揭示PLETHORA梯度抑制分化程序的机制 | 研究仅针对根尖分生组织的韧皮部发育,未涉及其他组织或环境条件下的发育过程 | 解析植物韧皮部细胞从祖细胞到终末分化的发育机制 | 拟南芥根尖分生组织的韧皮部细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 根尖分生组织韧皮部细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Identification and Characterization of Antigen-Specific CD8+ T Cells Using Surface-Trapped TNF-α and Single-Cell Sequencing
2021-12-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100535
PMID:34810222
|
研究论文 | 开发了一种基于表面捕获TNF-α和单细胞测序技术快速鉴定抗原特异性CD8+ T细胞的新方法 | 利用表面捕获的TNF-α进行活细胞分选,结合单细胞测序获得配对TCR全长序列,创建了可无限扩增的实验试剂 | 方法主要适用于原代细胞数量有限的样本,未明确说明技术应用的广泛性验证 | 建立快速鉴定和表征抗原特异性CD8+ T细胞的新策略 | 抗原特异性CD8+ T细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞测序,TCR测序,逆转录病毒转导 | NA | 单细胞序列数据 | 恒河猴CMV特异性CD8 T细胞和HIV感染供体样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
TNF plays a crucial role in inflammation by signaling via T cell TNFR2
2021-12-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2109972118
PMID:34873037
|
研究论文 | 本研究揭示了TNF通过T细胞TNFR2信号在炎症中发挥关键作用,不仅是效应分子还是炎症性Th细胞分化的启动因子 | 发现TNF通过TNFR2介导Th17和Th1细胞向炎症表型分化,且不依赖IL-6和STAT3信号通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究TNF在炎症性T细胞分化中的上游调控作用 | 小鼠CD4 T细胞、实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型、结肠炎模型 | 免疫学 | 多发性硬化症、自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
The onset of circulation triggers a metabolic switch required for endothelial to hematopoietic transition
2021-12-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110103
PMID:34910918
|
研究论文 | 本研究揭示了血液循环起始通过触发代谢转换促进造血干细胞生成的新机制 | 首次发现血液循环起始触发内皮细胞向造血细胞转变过程中的糖酵解向氧化磷酸化代谢转换 | 研究主要基于Ncx1缺陷小鼠模型,人类胚胎中的适用性需要进一步验证 | 探究血液循环起始对造血干细胞生成的影响机制 | 小鼠胚胎造血干细胞谱系 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Delayed antiretroviral therapy in HIV-infected individuals leads to irreversible depletion of skin- and mucosa-resident memory T cells
2021-12-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.10.021
PMID:34813775
|
研究论文 | 本研究揭示了延迟抗逆转录病毒治疗会导致HIV感染者皮肤和黏膜组织驻留记忆T细胞不可逆耗竭的机制 | 首次发现早期与延迟ART治疗对皮肤CD4 Trm细胞重建的不同影响,并揭示CXCR3 Trm细胞在HIV相关免疫缺陷中的关键作用 | 研究样本量有限,主要关注皮肤和黏膜组织,未涉及其他组织类型 | 探究HIV感染者接受延迟抗逆转录病毒治疗后组织特异性免疫缺陷的机制 | HIV感染者的皮肤和黏膜组织驻留记忆T细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序,TCR克隆分析 | NA | 基因表达数据,T细胞受体数据 | HIV感染者组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
CIDER: an interpretable meta-clustering framework for single-cell RNA-seq data integration and evaluation
2021-12-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02561-2
PMID:34903266
|
研究论文 | 提出一种基于组间相似性度量的可解释元聚类框架CIDER,用于单细胞RNA-seq数据整合与评估 | 无需假设样本间细胞群体组成完全相同,通过元聚类工作流程解决批次效应和生物变异等混杂因素 | NA | 开发单细胞RNA-seq数据整合与评估方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 元聚类框架 | 基因表达数据 | 模拟和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Delayed induction of type I and III interferons mediates nasal epithelial cell permissiveness to SARS-CoV-2
2021-12-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27318-0
PMID:34876592
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了SARS-CoV-2在鼻上皮细胞中的感染机制及I/III型干扰素应答的延迟特征 | 首次发现SARS-CoV-2在鼻上皮细胞中引发I/III型干扰素应答的延迟现象,并证明外源性干扰素可有效抑制病毒复制 | 研究基于体外细胞模型,与体内实际情况可能存在差异 | 探究SARS-CoV-2与鼻上皮细胞先天免疫系统的相互作用机制 | 人鼻上皮细胞气液界面分化模型 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Isolation of human fetal intestinal cells for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100890
PMID:34746860
|
研究论文 | 本文提出了一种从人类胎儿肠道样本中分离上皮和非上皮细胞用于单细胞RNA测序的方案 | 开发了能够从人类胎儿样本中高活性分离肠道细胞的方案,并用于构建人类发育过程中肠道细胞的全层图谱 | NA | 建立适用于单细胞RNA测序的肠道细胞分离方法 | 人类胎儿肠道细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
CARMN Is an Evolutionarily Conserved Smooth Muscle Cell-Specific LncRNA That Maintains Contractile Phenotype by Binding Myocardin
2021-12-07, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究鉴定了一个进化保守的平滑肌细胞特异性长链非编码RNA CARMN,并揭示其通过结合心肌素维持血管平滑肌细胞收缩表型的作用机制 | 首次发现CARMN是与心肌素相互作用的非编码RNA,揭示了其在维持血管平滑肌细胞收缩表型中的新功能 | 研究主要聚焦于血管疾病模型,在其他疾病模型中的作用仍需进一步验证 | 探索血管平滑肌细胞特异性长链非编码RNA的功能及其在血管稳态维持中的作用 | 血管平滑肌细胞、小鼠和大鼠血管损伤模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA测序、实时定量PCR、反义寡核苷酸敲低、腺病毒过表达、RNA pull-down、RNA免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测 | 基因敲除小鼠模型、大鼠颈动脉球囊损伤模型 | RNA测序数据、基因表达数据 | 多种组织和细胞类型的公共数据集、小鼠和大鼠血管损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Genome-wide analysis of common and rare variants via multiple knockoffs at biobank scale, with an application to Alzheimer disease genetics
2021-12-02, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2021.10.009
PMID:34767756
|
研究论文 | 提出一种可扩展的KnockoffScreen-AL方法,用于生物银行规模的全基因组常见和罕见变异分析,并应用于阿尔茨海默病遗传学研究 | 开发了首个适用于生物银行规模(数十万样本和数百万遗传变异)的Knockoff方法,解决了现有方法计算成本高的问题 | 方法主要针对生物银行规模数据,在较小样本量中的性能需要进一步验证 | 开发可扩展的Knockoff方法用于全基因组常见和罕见变异分析,并应用于阿尔茨海默病遗传学研究 | 英国生物银行的388,051个全基因组插补样本,以及独立临床诊断AD荟萃分析的94,437个样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | Knockoff方法,全基因组关联分析,单细胞RNA测序,蛋白质组学 | KnockoffScreen-AL | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | 388,051个WG插补样本 + 94,437个独立验证样本 + 143,793个单核转录组 + 735个蛋白质组样本 | NA | 全基因组测序,全基因组插补,单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Mesenchymal stem cell treatment improves outcome of COVID-19 patients via multiple immunomodulatory mechanisms
2021-12, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00573-y
PMID:34702946
|
研究论文 | 本研究通过临床试验和单细胞RNA测序分析,揭示间充质干细胞通过多种免疫调节机制改善COVID-19患者临床结局 | 首次发现MSC治疗可动员VNN2造血干/祖样细胞新亚群,并阐明其通过调节免疫细胞、抑制中性粒细胞胞外诱捕网和上调kindlin-3信号通路改善预后的新机制 | 样本量相对有限(每组29例),采用单盲设计而非双盲设计 | 验证MSC治疗COVID-19的有效性并探索其免疫调节机制 | COVID-19患者和实验小鼠 | 单细胞测序分析 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据、影像学数据 | 58例COVID-19患者(29例治疗组/29例对照组)加实验小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Breaking the barrier: In vitro models to study choroid plexus development
2021-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2021.05.005
PMID:34182208
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综述 | 本文探讨了利用体外模型研究脉络丛发育的最新进展 | 重点关注体外三维培养等新型技术在人类脉络丛研究中的应用突破 | 人类脉络丛研究存在伦理和技术限制 | 研究脉络丛发育和生理功能 | 脉络丛组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 体外三维培养, 活体成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Inter and intra-tumoral heterogeneity as a platform for personalized therapies in medulloblastoma
2021-12, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2021.107828
PMID:33662447
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综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的肿瘤间和肿瘤内异质性研究进展及其在个性化治疗中的应用前景 | 系统整合了从传统病理学到单细胞测序技术在不同层次上揭示髓母细胞瘤异质性的研究进展 | 作为罕见疾病研究,当前方法存在应用局限性 | 探讨髓母细胞瘤异质性特征及其对个性化治疗的指导意义 | 髓母细胞瘤患者及肿瘤样本 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | FISH, 免疫组织化学, 下一代测序, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 分子标志物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2024-08-08 |
Using advanced spatial and single-cell transcriptomics to characterize the human endometrium
2021-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00982-0
PMID:34857955
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |