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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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161 | 2024-08-08 |
Electromagnetized gold nanoparticles improve neurogenesis and cognition in the aged brain
2021-11, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 研究显示电磁化金纳米颗粒(AuNPs)能促进老年小鼠海马体中的神经发生,从而改善认知功能和记忆巩固 | 首次证明电磁化金纳米颗粒能显著增加神经干细胞和神经前体细胞的数量,并通过激活Kat2a促进组蛋白H3K9乙酰化,有效增加老年小鼠海马体的神经发生 | NA | 探索电磁化金纳米颗粒作为治疗与年龄相关脑疾病的新疗法 | 老年小鼠和Hutchinson-Gilford早衰症小鼠 | NA | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年小鼠和Hutchinson-Gilford早衰症小鼠 |
162 | 2024-08-08 |
Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107532
PMID:34549820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性,揭示了Smad4调控的成年期星形胶质细胞生成 | 首次揭示了成年期间脑星形胶质细胞的生成及其调控机制,并发现了Smad4在体内外星形胶质细胞增殖和神经球形成中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性及其调控机制 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7个基因表达簇的星形胶质细胞 |
163 | 2024-08-08 |
Developmental programming and lineage branching of early human telencephalon
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107277
PMID:34558085
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和严格验证,揭示了人类端脑神经元在早期发育过程中的发展路线图 | 首次详细描述了人类端脑背侧和腹侧的放射状胶质细胞(RGs)如何通过中间前体细胞(IPCs_div)和早期有丝分裂后神经元(eNBs)分化成不同类型的神经元 | NA | 阐明人类端脑神经元在早期发育过程中的生成机制 | 人类端脑的背侧和腹侧神经元及其亚型 | 神经科学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
164 | 2024-08-08 |
Deciphering mouse uterine receptivity for embryo implantation at single-cell resolution
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13128
PMID:34558134
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,解析了小鼠子宫对胚胎植入的接受性 | 首次在单细胞分辨率下解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性,揭示了不同细胞类型的基因表达变化 | NA | 旨在解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性 | 小鼠子宫的接受性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 预接受期和接受期的小鼠子宫样本 |
165 | 2024-08-08 |
A scoping review on the potentiality of PD-L1-inhibiting microRNAs in treating colorectal cancer: Toward single-cell sequencing-guided biocompatible-based delivery
2021-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112213
PMID:34560556
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综述 | 本文通过综述探讨了PD-L1抑制性微小RNA在治疗结直肠癌中的潜在治疗价值,并探讨了基于单细胞测序的生物相容性递送系统 | 提出基于单细胞测序的生物相容性递送系统,以提高微小RNA递送的特异性,减少传统纳米颗粒的毒性,并改善肿瘤微环境 | NA | 探讨PD-L1抑制性微小RNA在结直肠癌治疗中的潜在价值 | PD-L1抑制性微小RNA及其在结直肠癌细胞中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA |
166 | 2024-08-08 |
Systematic review on the current knowledge and use of single-cell RNA sequencing in head and neck cancer
2021-Nov, APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/apm.13173
PMID:34561896
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综述 | 本文系统回顾了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的应用和知识现状 | scRNA-seq技术能够在单细胞水平上对肿瘤组织进行遗传学特征分析 | 需要进一步的研究来继续发展和应用scRNA-seq技术 | 回顾scRNA-seq在HNSCC中的应用,并探讨其在临床研究中的潜力 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC) | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 共涉及20名患者 |
167 | 2024-08-08 |
Plant Cell Identity in the Era of Single-Cell Transcriptomics
2021-11-23, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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综述 | 本文综述了高通量单细胞转录组学方法在植物学中的应用,及其对理解植物细胞多样性、分化和功能的影响 | 提供了对植物细胞身份的新见解,包括细胞转换的全新视角和罕见及新型细胞类型的定义 | 指出了当前应用和分析单细胞转录组学在植物中的挑战 | 探讨单细胞转录组学在植物学中的应用及其对植物细胞身份理解的影响 | 植物器官和组织的单细胞转录组分析 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个植物器官和组织 |
168 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analyses Reveal Mechanisms of Cancer Stem Cell Maintenance and Epithelial-Mesenchymal Transition in Recurrent Bladder Cancer
2021-11-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4796
PMID:34526362
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术,分析了13名不同复发风险膀胱癌患者的肿瘤细胞,揭示了膀胱癌复发中癌症干细胞维持和上皮-间质转化的分子机制 | 研究首次在单细胞水平上揭示了EZH2通过H3K27me3介导的NCAM1基因抑制,维持癌症干细胞特性,并阐明了TCF7在膀胱癌上皮-间质转化中的作用 | NA | 揭示膀胱癌复发中癌症干细胞维持和上皮-间质转化的分子机制 | 膀胱癌患者的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 13名患者,共54,971个单细胞 |
169 | 2024-08-08 |
Functional coordination of non-myocytes plays a key role in adult zebrafish heart regeneration
2021-11-04, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202152901
PMID:34523214
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研究论文 | 本文通过LIGER算法分析了斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞(non-CMs)的单细胞RNA测序数据,揭示了non-CMs的多样性和功能状态的动态变化 | 首次构建了斑马鱼心脏再生过程中non-CMs的细胞状态图谱,并开发了Topologizer算法来分析功能状态之间的拓扑关系和动态转换 | NA | 探究斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞的分子和细胞基础 | 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | LIGER算法, Topologizer算法 | 单细胞RNA测序数据 | 61,977个非心肌细胞样本 |
170 | 2024-08-08 |
Visualization of individual cell division history in complex tissues using iCOUNT
2021-11-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.08.012
PMID:34525348
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研究论文 | 本文开发了一种诱导性细胞分裂计数器(iCOUNT),用于在体外和体内报告人类和小鼠组织的细胞分裂事件,并通过分析神经干细胞/祖细胞(NSPCs)的分裂历史,揭示了干细胞行为的新的见解。 | 开发了iCOUNT工具,能够报告细胞分裂事件,并通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)识别与细胞分裂历史相关的功能性分子途径。 | NA | 研究干细胞的分裂潜力及其连续增殖的分子后果。 | 神经干细胞/祖细胞(NSPCs)及其后代。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
171 | 2024-08-08 |
Single-cell analyses of human pancreas: characteristics of two populations of acinar cells in chronic pancreatitis
2021-11-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00482.2020
PMID:34523348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了慢性胰腺炎患者胰腺组织中的细胞特征,特别是两种独特的腺泡细胞群 | 首次在单细胞水平上研究了慢性胰腺炎患者胰腺腺泡细胞的生理特性,并探讨了这些细胞对激动剂刺激的响应 | 研究样本量较小,仅包括五名患者,可能影响结果的普遍性 | 探讨慢性胰腺炎患者胰腺组织中细胞的特征及其对特定刺激的响应 | 慢性胰腺炎患者的胰腺组织及其中的腺泡细胞 | 数字病理学 | 慢性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五名患者 |
172 | 2024-08-08 |
Cell-specific gene association network construction from single-cell RNA sequence
2021-11, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2021.1978265
PMID:34530677
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研究论文 | 本文利用网络扰动理论和显著性分析,开发了一种细胞特异性网络,该网络基于单细胞分辨率下的分子表达来揭示基因-基因关联 | 本文首次利用单细胞RNA测序数据构建细胞特异性基因关联网络,并通过网络度理论识别枢纽基因 | NA | 开发一种新的方法来构建细胞特异性基因关联网络,并探索其在个性化药物设计和治疗中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的基因关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络扰动理论 | 基因表达数据 | NA |
173 | 2024-08-08 |
Adipose tissue and adipose secretome in systemic sclerosis
2021-11-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000000838
PMID:34534166
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综述 | 本文综述了脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症(SSc)病理中的作用,特别关注了脂肪细胞在脂肪向间充质转分化(AMT)中的局部效应,脂肪间质血管部分对SSc发病机制的影响,以及脂肪组织分泌组的系统效应。 | 新发现的从脂肪组织演化而来的成纤维细胞群体,如从脂肪源性间质细胞分化而来的COL11+癌症相关成纤维细胞,以及使用非常规标记物描述的人类肺部脂成纤维细胞,这些发现有助于进一步阐明脂肪细胞在SSc中的作用。 | NA | 探讨脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症发病机制中的重要作用。 | 脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症中的作用。 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)和代谢组学 | NA | NA | NA |
174 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals defective decidua stromal niche attributes to recurrent spontaneous abortion
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13125
PMID:34546587
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了复发性自然流产中母体蜕膜基质微环境的缺陷特征 | 首次揭示了复发性自然流产中蜕膜基质细胞的异常分化和细胞间通讯障碍 | NA | 探讨复发性自然流产中母体蜕膜细胞异质性的作用 | 复发性自然流产患者和健康对照者的蜕膜样本 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 66,078个单细胞样本 |
175 | 2024-08-08 |
Transcription factor FOXF1 identifies compartmentally distinct mesenchymal cells with a role in lung allograft fibrogenesis
2021-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI147343
PMID:34546975
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研究论文 | 本研究展示了转录因子FOXF1在成人肺部特定解剖位置的间质基质细胞群中的保留,并识别出这些表达胶原蛋白的特定亚群细胞在肺同种异体移植重塑和纤维化中的关键作用 | 首次揭示了FOXF1+细胞在肺同种异体移植纤维化中的作用,并阐明了其与Sonic hedgehog信号通路的相互作用 | NA | 研究转录因子FOXF1在肺同种异体移植纤维化中的作用及其分子机制 | 肺部间质基质细胞及其在肺同种异体移植中的作用 | NA | 肺纤维化 | Bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Foxf1-tdTomato BAC和Foxf1-tdTomato Col1a1-GFP小鼠模型进行研究 |
176 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity of Infiltrating Immune Cell Profiles in the Hepatic Cystic Echinococcosis Microenvironment
2021-11-16, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/IAI.00297-21
PMID:34491790
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝包虫病病变微环境中浸润免疫细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上揭示了肝包虫病病变微环境中浸润免疫细胞的转录异质性,并提供了潜在的诊断和免疫治疗靶点 | 研究样本仅来自四名肝包虫病患者,可能影响结果的普遍性 | 探究肝包虫病病变微环境中浸润免疫细胞的组成和异质性 | 从四名肝包虫病患者中分离出的81,865个免疫细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 81,865个免疫细胞 |
177 | 2024-08-08 |
Overexpression of transposable elements is associated with immune evasion and poor outcome in colorectal cancer
2021-11, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2021.08.003
PMID:34492588
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研究论文 | 本研究探讨了转座子元素(TE)在结直肠癌(CRC)中的过度表达与免疫逃逸及不良预后的关联 | 揭示了TE驱动免疫逃逸的新机制,并强调TE表达作为CRC患者预后的重要因素 | NA | 探究结直肠癌中高免疫细胞浸润与不良预后之间的机制 | 结直肠癌肿瘤中的转座子元素表达及其对免疫逃逸和预后的影响 | NA | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用The Cancer Genome Atlas的RNA测序数据 |
178 | 2024-08-08 |
β-Agonist exposure preferentially impacts lung macrophage cyclic AMP-related gene expression in asthma and asthma COPD overlap syndrome
2021-11-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00260.2021
PMID:34494468
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研究论文 | 研究探讨了β-激动剂暴露对哮喘和哮喘-COPD重叠综合征中肺泡巨噬细胞cAMP相关基因表达的影响 | 通过单细胞RNA测序和大量RNA测序,验证了β-激动剂暴露后肺泡巨噬细胞中cAMP相关基因表达的抑制,并发现这种抑制在肺泡巨噬细胞中最为显著 | 研究主要集中在肺泡巨噬细胞,未全面探讨其他细胞类型对β-激动剂暴露的反应 | 验证β-激动剂暴露对哮喘和哮喘-COPD重叠综合征中肺泡巨噬细胞cAMP相关基因表达的影响 | 哮喘和哮喘-COPD重叠综合征患者的肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 哮喘, COPD | 单细胞RNA测序, 大量RNA测序 | NA | RNA | 包括来自严重哮喘研究计划(SARP)患者的肺泡灌洗样本、THP-1细胞培养样本、健康和疾病肺组织样本等 |
179 | 2024-08-08 |
EnTSSR: A Weighted Ensemble Learning Method to Impute Single-Cell RNA Sequencing Data
2021 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3110850
PMID:34495837
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研究论文 | 本文提出了一种名为EnTSSR的新型加权集成学习方法,用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 通过多视角双侧稀疏自表示框架,利用不同填补方法的共识相似性,并引入加权集成策略有效整合信息 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值填补 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习方法 | RNA测序数据 | NA |
180 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of mouse follicular somatic cells†
2021-11-15, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioab163
PMID:34467391
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了从小鼠次级到排卵阶段卵泡中的体细胞,揭示了细胞分化和信号传导机制 | 发现了6883个高变异基因,并将卵泡体细胞聚类为26个细胞群,包括18个颗粒细胞群和4个内分泌细胞群等 | NA | 系统揭示卵泡体细胞中的细胞分化和信号传导 | 小鼠卵泡体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4888个单细胞 |