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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
Human nasal wash RNA-Seq reveals distinct cell-specific innate immune responses in influenza versus SARS-CoV-2
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.152288
PMID:34618691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人鼻洗液细胞在流感与SARS-CoV-2感染中的先天免疫反应差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了流感与SARS-CoV-2感染在鼻腔上皮细胞和免疫细胞中的不同反应 | 研究样本仅限于成人,且未涵盖所有可能的细胞类型和亚型 | 探讨流感与SARS-CoV-2感染在鼻腔上皮细胞和免疫细胞中的先天免疫反应差异 | 人鼻洗液细胞在流感与SARS-CoV-2感染中的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成人鼻洗液细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-08 |
Cell cycle heterogeneity directs spontaneous 2C state entry and exit in mouse embryonic stem cells
2021-11-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.09.003
PMID:34624246
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研究论文 | 本文研究了小鼠胚胎干细胞中自发进入和退出二细胞样状态的过程 | 揭示了细胞周期在调节核仁和核周异染色质组装中通过影响2C基因Dux表达,从而介导二细胞样状态与多能状态之间双向过渡的机制 | NA | 理解小鼠胚胎干细胞中二细胞样状态与多能状态之间的双向过渡机制 | 小鼠胚胎干细胞中的二细胞样细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 少量二细胞样细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-08 |
CTRP4 ablation impairs associative learning and memory
2021-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100733RR
PMID:34610176
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研究论文 | 本研究探讨了C1q/TNF相关蛋白4(CTRP4)在中枢神经系统中的功能,特别是其在海马依赖的联想学习和记忆中的作用。 | 首次揭示了CTRP4在海马依赖的联想学习和记忆中的作用,并发现这种作用具有性别依赖性。 | 研究主要集中在小鼠模型上,未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于其他物种。 | 揭示CTRP4在中枢神经系统中的额外功能,特别是其在联想学习和记忆中的作用。 | Ctrp4敲除(KO)小鼠的行为和基因表达。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Ctrp4 KO小鼠和野生型(WT)同窝小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals androgen receptor regulates the ER-to-Golgi trafficking pathway with CREB3L2 to drive prostate cancer progression
2021-11, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-02026-7
PMID:34611310
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析揭示了雄激素受体通过调节ER-to-Golgi运输途径中的CREB3L2基因,促进前列腺癌进展的机制 | 本研究首次揭示了雄激素受体在前列腺癌中通过调节ER-to-Golgi运输途径的关键作用,并发现小分子抑制剂增强抗雄激素治疗的效果 | NA | 探究雄激素受体在前列腺癌进展中的作用机制 | 前列腺癌中的雄激素受体及其调控的ER-to-Golgi运输途径 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-08 |
Neutrophil extracellular traps impair regeneration
2021-11, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16896
PMID:34623736
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研究论文 | 研究探讨了中性粒细胞外陷阱(NETs)在伤口诱导的毛囊新生(WIHN)中的作用,发现成熟中性粒细胞及其产生的NETs抑制了WIHN过程 | 发现中性粒细胞外陷阱(NETs)释放的核剪接体U1双链RNA可能调节WIHN,但实际抑制了再生过程 | 研究未明确伤口相关双链RNA的来源 | 探究纤维化问题的解决方法,通过研究伤口诱导的毛囊新生(WIHN)作为非纤维化愈合模型 | 中性粒细胞外陷阱(NETs)在伤口愈合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及Tlr3-/-小鼠的伤口床 | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-08 |
Role of HRTPT in kidney proximal epithelial cell regeneration: Integrative differential expression and pathway analyses using microarray and scRNA-seq
2021-11, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16976
PMID:34626063
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研究论文 | 本研究通过微阵列和单细胞RNA测序分析,探讨了HRTPT细胞在肾近端上皮细胞再生中的作用及其基因表达差异 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别了HRTPT细胞中与CD133相关的独特基因簇,并与其他人类肾源细胞系进行了比较 | NA | 进一步表征和理解HRTPT细胞中的全局基因表达差异、上调途径和基因相互作用 | HRTPT细胞和HREC24T细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了HRTPT和HREC24T细胞系进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: the technological revolution behind a new wave of multiomic studies in basic and cancer research
2021-11, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2021-0088
PMID:34636653
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research paper | 本文介绍了单细胞测序技术及其在多组学研究中的应用,特别是在基础研究和癌症研究领域的新进展 | 本文介绍了新的单细胞技术和多组学方法的应用,这些技术正在推动癌症研究的新领域 | NA | 推动癌症研究的新领域 | 单细胞技术和多组学方法 | digital pathology | cancer | single-cell sequencing | NA | multiomic data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-08 |
CDC26 is a key factor in human oocyte aging
2021-11-18, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deab217
PMID:34590680
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研究论文 | 本研究探讨了CDC26在人类卵母细胞老化中的关键作用,发现CDC26的缺乏会扰乱卵母细胞成熟过程,导致卵母细胞老化,但这些缺陷可以通过CDC26蛋白的过度表达部分挽救 | 首次揭示了CDC26在人类卵母细胞老化中的关键作用,并证明了CDC26蛋白的过度表达可以部分挽救老化卵母细胞的缺陷 | 研究需要进一步探讨其他信号通路是否通过CDC26调节卵母细胞成熟,以及哪些基因是CDC26的直接分子靶点 | 探讨CDC26在人类卵母细胞老化中的作用 | 人类卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序技术,q-PCR,免疫细胞化学分析,转染技术 | NA | RNA | 年轻和老年女性的卵母细胞,KM雌性小鼠的卵母细胞,老年女性的卵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-08 |
Sciviewer enables interactive visual interrogation of single-cell RNA-Seq data from the Python programming environment
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab689
PMID:34601589
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Sciviewer的工具,该工具允许在Python编程环境中进行单细胞RNA测序(scRNA-Seq)数据的交互式可视化分析 | Sciviewer实现了一种新方法,用于识别嵌入中沿用户指定方向局部变化的基因,并支持在Python环境中快速灵活地迭代交互式和编程式scRNA-Seq探索模式 | 现有的交互式工具在实际应用中受限,因为它们不支持数据和结果在编程环境中的快速移动,打断了迭代过程 | 开发一种工具,以克服现有工具在scRNA-Seq数据分析中的局限性,提高分析效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 数据嵌入(如UMAP或tSNE) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-08 |
Electromagnetized gold nanoparticles improve neurogenesis and cognition in the aged brain
2021-11, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 研究显示电磁化金纳米颗粒(AuNPs)能促进老年小鼠海马体中的神经发生,从而改善认知功能和记忆巩固 | 首次证明电磁化金纳米颗粒能显著增加神经干细胞和神经前体细胞的数量,并通过激活Kat2a促进组蛋白H3K9乙酰化,有效增加老年小鼠海马体的神经发生 | NA | 探索电磁化金纳米颗粒作为治疗与年龄相关脑疾病的新疗法 | 老年小鼠和Hutchinson-Gilford早衰症小鼠 | NA | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年小鼠和Hutchinson-Gilford早衰症小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-08 |
Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107532
PMID:34549820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性,揭示了Smad4调控的成年期星形胶质细胞生成 | 首次揭示了成年期间脑星形胶质细胞的生成及其调控机制,并发现了Smad4在体内外星形胶质细胞增殖和神经球形成中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性及其调控机制 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7个基因表达簇的星形胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-08-08 |
Developmental programming and lineage branching of early human telencephalon
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107277
PMID:34558085
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和严格验证,揭示了人类端脑神经元在早期发育过程中的发展路线图 | 首次详细描述了人类端脑背侧和腹侧的放射状胶质细胞(RGs)如何通过中间前体细胞(IPCs_div)和早期有丝分裂后神经元(eNBs)分化成不同类型的神经元 | NA | 阐明人类端脑神经元在早期发育过程中的生成机制 | 人类端脑的背侧和腹侧神经元及其亚型 | 神经科学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-08 |
Deciphering mouse uterine receptivity for embryo implantation at single-cell resolution
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13128
PMID:34558134
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,解析了小鼠子宫对胚胎植入的接受性 | 首次在单细胞分辨率下解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性,揭示了不同细胞类型的基因表达变化 | NA | 旨在解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性 | 小鼠子宫的接受性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 预接受期和接受期的小鼠子宫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-08-08 |
Systematic review on the current knowledge and use of single-cell RNA sequencing in head and neck cancer
2021-Nov, APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/apm.13173
PMID:34561896
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综述 | 本文系统回顾了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的应用和知识现状 | scRNA-seq技术能够在单细胞水平上对肿瘤组织进行遗传学特征分析 | 需要进一步的研究来继续发展和应用scRNA-seq技术 | 回顾scRNA-seq在HNSCC中的应用,并探讨其在临床研究中的潜力 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC) | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 共涉及20名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-08 |
Plant Cell Identity in the Era of Single-Cell Transcriptomics
2021-11-23, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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综述 | 本文综述了高通量单细胞转录组学方法在植物学中的应用,及其对理解植物细胞多样性、分化和功能的影响 | 提供了对植物细胞身份的新见解,包括细胞转换的全新视角和罕见及新型细胞类型的定义 | 指出了当前应用和分析单细胞转录组学在植物中的挑战 | 探讨单细胞转录组学在植物学中的应用及其对植物细胞身份理解的影响 | 植物器官和组织的单细胞转录组分析 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个植物器官和组织 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analyses Reveal Mechanisms of Cancer Stem Cell Maintenance and Epithelial-Mesenchymal Transition in Recurrent Bladder Cancer
2021-11-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4796
PMID:34526362
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术,分析了13名不同复发风险膀胱癌患者的肿瘤细胞,揭示了膀胱癌复发中癌症干细胞维持和上皮-间质转化的分子机制 | 研究首次在单细胞水平上揭示了EZH2通过H3K27me3介导的NCAM1基因抑制,维持癌症干细胞特性,并阐明了TCF7在膀胱癌上皮-间质转化中的作用 | NA | 揭示膀胱癌复发中癌症干细胞维持和上皮-间质转化的分子机制 | 膀胱癌患者的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 13名患者,共54,971个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-08 |
Single-cell analyses of human pancreas: characteristics of two populations of acinar cells in chronic pancreatitis
2021-11-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00482.2020
PMID:34523348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了慢性胰腺炎患者胰腺组织中的细胞特征,特别是两种独特的腺泡细胞群 | 首次在单细胞水平上研究了慢性胰腺炎患者胰腺腺泡细胞的生理特性,并探讨了这些细胞对激动剂刺激的响应 | 研究样本量较小,仅包括五名患者,可能影响结果的普遍性 | 探讨慢性胰腺炎患者胰腺组织中细胞的特征及其对特定刺激的响应 | 慢性胰腺炎患者的胰腺组织及其中的腺泡细胞 | 数字病理学 | 慢性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-08 |
Cell-specific gene association network construction from single-cell RNA sequence
2021-11, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2021.1978265
PMID:34530677
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研究论文 | 本文利用网络扰动理论和显著性分析,开发了一种细胞特异性网络,该网络基于单细胞分辨率下的分子表达来揭示基因-基因关联 | 本文首次利用单细胞RNA测序数据构建细胞特异性基因关联网络,并通过网络度理论识别枢纽基因 | NA | 开发一种新的方法来构建细胞特异性基因关联网络,并探索其在个性化药物设计和治疗中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的基因关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络扰动理论 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-08 |
Adipose tissue and adipose secretome in systemic sclerosis
2021-11-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000000838
PMID:34534166
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综述 | 本文综述了脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症(SSc)病理中的作用,特别关注了脂肪细胞在脂肪向间充质转分化(AMT)中的局部效应,脂肪间质血管部分对SSc发病机制的影响,以及脂肪组织分泌组的系统效应。 | 新发现的从脂肪组织演化而来的成纤维细胞群体,如从脂肪源性间质细胞分化而来的COL11+癌症相关成纤维细胞,以及使用非常规标记物描述的人类肺部脂成纤维细胞,这些发现有助于进一步阐明脂肪细胞在SSc中的作用。 | NA | 探讨脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症发病机制中的重要作用。 | 脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症中的作用。 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)和代谢组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals defective decidua stromal niche attributes to recurrent spontaneous abortion
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13125
PMID:34546587
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了复发性自然流产中母体蜕膜基质微环境的缺陷特征 | 首次揭示了复发性自然流产中蜕膜基质细胞的异常分化和细胞间通讯障碍 | NA | 探讨复发性自然流产中母体蜕膜细胞异质性的作用 | 复发性自然流产患者和健康对照者的蜕膜样本 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 66,078个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |