单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 241 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Regulation of intestinal immunity and tissue repair by enteric glia
2021-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04006-z
PMID:34671159
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研究论文 | 本文揭示了肠神经胶质细胞（EGCs）在肠道稳态、免疫和组织修复中的重要作用 | 首次阐明了IFNγ信号在肠神经胶质细胞中的中心作用，并揭示了IFNγ-EGC-CXCL10轴在免疫反应和组织修复中的关键角色 | NA | 研究肠神经胶质细胞在肠道稳态、免疫和组织修复中的作用 | 肠神经胶质细胞（EGCs）及其在肠道中的功能 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠和炎症性肠病患者 |
| 142 | 2024-08-08 |
Dynamic transcriptional reprogramming leads to immunotherapeutic vulnerabilities in myeloma
2021-11, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00766-y
PMID:34675390
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研究论文 | 本研究探讨了多发性骨髓瘤细胞如何通过动态转录重编程来适应治疗并逃避免疫疗法，揭示了治疗过程中产生的可利用的免疫治疗靶点。 | 本研究首次展示了多发性骨髓瘤细胞在治疗压力下如何通过转录重编程和增强子重连来适应并逃避免疫治疗，同时揭示了新的免疫治疗靶点CXCR4。 | NA | 揭示多发性骨髓瘤细胞如何通过转录重编程适应治疗并逃避免疫疗法，探索新的治疗策略。 | 多发性骨髓瘤细胞的转录重编程和增强子使用。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组和染色质可及性分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Human ALS/FTD brain organoid slice cultures display distinct early astrocyte and targetable neuronal pathology
2021-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00923-4
PMID:34675437
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研究论文 | 研究报道了从人诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的脑类器官切片模型，该模型再现了成熟皮层结构并显示C9ORF72 ALS/FTD的早期分子病理 | 开发了一种新的脑类器官切片模型，用于研究ALS/FTD的早期细胞病理，并探索了潜在的治疗方法 | NA | 阐明ALS/FTD的初始细胞病理，为治疗目标开发提供依据 | ALS/FTD的早期细胞病理和潜在治疗策略 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 单细胞RNA测序 | 脑类器官切片模型 | 细胞 | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Simpler and Faster Development of Tumor Phylogeny Pipelines
2021-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0271
PMID:34698531
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研究论文 | 本文开发了一种名为plastic的肿瘤系统发育管道，该管道整合了简化输入数据、推断肿瘤系统发育和比较系统发育三个步骤 | 引入了新的内存数据结构，便于工具间信息的透明共享，并扩展了简化输入数据的工具，集成了两种机器学习程序，显著减少了运行时间 | NA | 开发更先进和快速的工具来分析单细胞测序产生的大量数据 | 单细胞测序数据和肿瘤系统发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Identification and characterization of distinct cell cycle stages in cardiomyocytes using the FUCCI transgenic system
2021-11-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2021.112880
PMID:34655601
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研究论文 | 本研究利用FUCCI转基因系统在小鼠模型中识别和表征心肌细胞在不同细胞周期阶段的特征 | 首次使用FUCCI系统在单细胞分辨率下研究心肌细胞的细胞周期活动，并生成特定于细胞分裂和内复制的心肌细胞转录组图谱 | NA | 理解心肌细胞增殖向内复制和细胞周期停滞转变的调控机制，并开发再生疗法 | 心肌细胞在不同细胞周期阶段的特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | FUCCI转基因小鼠模型 | 转录组数据 | 新生小鼠的心肌细胞在出生后第0天和第7天 |
| 146 | 2024-08-08 |
KLF17 promotes human naïve pluripotency but is not required for its establishment
2021-11-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199378
PMID:34661235
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研究论文 | 研究探讨了锌指蛋白KLF17在人类原始多能性中的作用，发现KLF17在人类胚胎发育中与NANOG和SOX2共同表达，并通过增益和失能分析揭示KLF17在体外条件下对原始多能性的建立是充分的但非必需的。 | 首次揭示KLF17在人类原始多能性中的作用，表明其在体外条件下对原始多能性的建立是充分的但非必需的。 | 研究主要集中在体外条件下，可能无法完全反映KLF17在体内环境中的作用。 | 探讨KLF17在人类原始多能性中的作用及其在胚胎发育中的表达模式。 | 人类胚胎干细胞（hESCs）和人类胚胎发育过程中的KLF17表达。 | NA | NA | 单细胞转录组学分析，CRISPR-Cas9介导的基因敲除 | NA | 转录组数据 | 涉及人类胚胎干细胞和人类胚胎发育样本 |
| 147 | 2024-08-08 |
CD4+ T cells contribute to neurodegeneration in Lewy body dementia
2021-Nov-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf7266
PMID:34648304
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研究论文 | 本文研究了CD4+ T细胞在路易体痴呆（LBD）中的神经退行性作用及其机制 | 首次揭示了CD4+ T细胞在LBD中的神经退行性作用，并提出了CXCR4-CXCL12信号通路作为潜在的治疗靶点 | NA | 探讨适应性免疫系统在路易体痴呆中的作用及其机制 | CD4+ T细胞在路易体痴呆中的作用及其机制 | NA | 路易体痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 脑脊液 | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Human resident memory T cells exit the skin and mediate systemic Th2-driven inflammation
2021-11-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210417
PMID:34643646
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研究论文 | 本文通过基因分型、数学建模、单细胞转录组学和功能分析，研究了接受异基因造血干细胞移植患者皮肤中的组织驻留记忆T细胞（TRMs）在血液中的迁移及其在移植物抗宿主病（GVHD）中的作用。 | 首次在人类模型中检测到具有TRM表型的循环皮肤来源T细胞（cTRMs），并揭示了其在GVHD中的潜在作用。 | NA | 研究皮肤TRMs在血液中的迁移及其在系统性炎症中的作用。 | 接受异基因造血干细胞移植患者的皮肤和血液T细胞。 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 基因分型、数学建模、单细胞转录组学 | NA | 血液和皮肤T细胞 | 接受异基因造血干细胞移植的患者 |
| 149 | 2024-08-08 |
Obesity Impairs Embryonic Myogenesis by Enhancing BMP Signaling within the Dermomyotome
2021-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202102157
PMID:34647690
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析（scRNA-seq）探讨了母体肥胖（MO）对胚胎发育中肌肉生成过程的影响 | 首次详细研究了母体肥胖对胚胎器官生成初期的影响，并揭示了通过增强BMP信号通路导致肌肉分化障碍的机制 | 研究主要集中在胚胎发育的特定阶段（E9.5），可能需要进一步研究不同发育阶段的影响 | 探讨母体肥胖对胚胎肌肉生成的影响及其分子机制 | 母体肥胖对胚胎肌肉生成的影响 | NA | 肥胖 | 单细胞转录组分析（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 胚胎日9.5（E9.5）的小鼠胚胎 |
| 150 | 2024-08-08 |
Tumor-propagating side population cells are a dynamic subpopulation in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.148768
PMID:34618689
|
研究论文 | 本研究利用未分化多形性肉瘤（UPS）的小鼠模型，追踪了肉瘤侧群（SP）细胞与非SP细胞之间的谱系关系，并探讨了SP细胞的肿瘤传播潜力及其在肿瘤生长和自我更新中的作用。 | 首次证明了肉瘤中的肿瘤传播细胞（TPCs）的表型是动态的，非SP细胞可以转化为具有增强肿瘤传播潜力的SP细胞。 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类肉瘤中验证这些发现。 | 探讨肉瘤中肿瘤传播细胞的动态特性及其对肿瘤生长和自我更新的影响。 | 未分化多形性肉瘤（UPS）中的侧群（SP）细胞和非SP细胞。 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型中的SP细胞和非SP细胞 |
| 151 | 2024-08-08 |
Human nasal wash RNA-Seq reveals distinct cell-specific innate immune responses in influenza versus SARS-CoV-2
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.152288
PMID:34618691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人鼻洗液细胞在流感与SARS-CoV-2感染中的先天免疫反应差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了流感与SARS-CoV-2感染在鼻腔上皮细胞和免疫细胞中的不同反应 | 研究样本仅限于成人，且未涵盖所有可能的细胞类型和亚型 | 探讨流感与SARS-CoV-2感染在鼻腔上皮细胞和免疫细胞中的先天免疫反应差异 | 人鼻洗液细胞在流感与SARS-CoV-2感染中的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成人鼻洗液细胞样本 |
| 152 | 2024-08-08 |
Cell cycle heterogeneity directs spontaneous 2C state entry and exit in mouse embryonic stem cells
2021-11-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.09.003
PMID:34624246
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研究论文 | 本文研究了小鼠胚胎干细胞中自发进入和退出二细胞样状态的过程 | 揭示了细胞周期在调节核仁和核周异染色质组装中通过影响2C基因Dux表达，从而介导二细胞样状态与多能状态之间双向过渡的机制 | NA | 理解小鼠胚胎干细胞中二细胞样状态与多能状态之间的双向过渡机制 | 小鼠胚胎干细胞中的二细胞样细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 少量二细胞样细胞 |
| 153 | 2024-08-08 |
CTRP4 ablation impairs associative learning and memory
2021-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100733RR
PMID:34610176
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研究论文 | 本研究探讨了C1q/TNF相关蛋白4（CTRP4）在中枢神经系统中的功能，特别是其在海马依赖的联想学习和记忆中的作用。 | 首次揭示了CTRP4在海马依赖的联想学习和记忆中的作用，并发现这种作用具有性别依赖性。 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于其他物种。 | 揭示CTRP4在中枢神经系统中的额外功能，特别是其在联想学习和记忆中的作用。 | Ctrp4敲除（KO）小鼠的行为和基因表达。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Ctrp4 KO小鼠和野生型（WT）同窝小鼠 |
| 154 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals androgen receptor regulates the ER-to-Golgi trafficking pathway with CREB3L2 to drive prostate cancer progression
2021-11, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-02026-7
PMID:34611310
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析揭示了雄激素受体通过调节ER-to-Golgi运输途径中的CREB3L2基因，促进前列腺癌进展的机制 | 本研究首次揭示了雄激素受体在前列腺癌中通过调节ER-to-Golgi运输途径的关键作用，并发现小分子抑制剂增强抗雄激素治疗的效果 | NA | 探究雄激素受体在前列腺癌进展中的作用机制 | 前列腺癌中的雄激素受体及其调控的ER-to-Golgi运输途径 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Neutrophil extracellular traps impair regeneration
2021-11, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16896
PMID:34623736
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研究论文 | 研究探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）在伤口诱导的毛囊新生（WIHN）中的作用，发现成熟中性粒细胞及其产生的NETs抑制了WIHN过程 | 发现中性粒细胞外陷阱（NETs）释放的核剪接体U1双链RNA可能调节WIHN，但实际抑制了再生过程 | 研究未明确伤口相关双链RNA的来源 | 探究纤维化问题的解决方法，通过研究伤口诱导的毛囊新生（WIHN）作为非纤维化愈合模型 | 中性粒细胞外陷阱（NETs）在伤口愈合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及Tlr3-/-小鼠的伤口床 |
| 156 | 2024-08-08 |
Role of HRTPT in kidney proximal epithelial cell regeneration: Integrative differential expression and pathway analyses using microarray and scRNA-seq
2021-11, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16976
PMID:34626063
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研究论文 | 本研究通过微阵列和单细胞RNA测序分析，探讨了HRTPT细胞在肾近端上皮细胞再生中的作用及其基因表达差异 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了HRTPT细胞中与CD133相关的独特基因簇，并与其他人类肾源细胞系进行了比较 | NA | 进一步表征和理解HRTPT细胞中的全局基因表达差异、上调途径和基因相互作用 | HRTPT细胞和HREC24T细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了HRTPT和HREC24T细胞系进行分析 |
| 157 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: the technological revolution behind a new wave of multiomic studies in basic and cancer research
2021-11, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2021-0088
PMID:34636653
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research paper | 本文介绍了单细胞测序技术及其在多组学研究中的应用，特别是在基础研究和癌症研究领域的新进展 | 本文介绍了新的单细胞技术和多组学方法的应用，这些技术正在推动癌症研究的新领域 | NA | 推动癌症研究的新领域 | 单细胞技术和多组学方法 | digital pathology | cancer | single-cell sequencing | NA | multiomic data | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
CDC26 is a key factor in human oocyte aging
2021-11-18, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deab217
PMID:34590680
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研究论文 | 本研究探讨了CDC26在人类卵母细胞老化中的关键作用，发现CDC26的缺乏会扰乱卵母细胞成熟过程，导致卵母细胞老化，但这些缺陷可以通过CDC26蛋白的过度表达部分挽救 | 首次揭示了CDC26在人类卵母细胞老化中的关键作用，并证明了CDC26蛋白的过度表达可以部分挽救老化卵母细胞的缺陷 | 研究需要进一步探讨其他信号通路是否通过CDC26调节卵母细胞成熟，以及哪些基因是CDC26的直接分子靶点 | 探讨CDC26在人类卵母细胞老化中的作用 | 人类卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序技术，q-PCR，免疫细胞化学分析，转染技术 | NA | RNA | 年轻和老年女性的卵母细胞，KM雌性小鼠的卵母细胞，老年女性的卵母细胞 |
| 159 | 2024-08-08 |
NK and CD8+ T cell phenotypes predict onset and control of CMV viremia after kidney transplant
2021-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153175
PMID:34609965
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研究论文 | 本研究分析了31名肾移植受者在CMV病毒血症前后的NK和CD8+ T细胞表型变化 | 首次详细描述了肾移植受者在CMV病毒血症前后NK和CD8+ T细胞的表型变化及其与病毒控制的关系 | 样本量相对较小，且仅限于肾移植受者 | 深入了解免疫功能受损导致CMV再激活的机制，指导抗病毒治疗并评估CMV对实体器官移植结果的影响 | 肾移植受者的NK和CD8+ T细胞表型及其与CMV病毒血症的关系 | 免疫学 | 器官移植 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, Luminex | NA | 细胞, 蛋白质 | 31名肾移植受者 |
| 160 | 2024-08-08 |
Sciviewer enables interactive visual interrogation of single-cell RNA-Seq data from the Python programming environment
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab689
PMID:34601589
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Sciviewer的工具，该工具允许在Python编程环境中进行单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据的交互式可视化分析 | Sciviewer实现了一种新方法，用于识别嵌入中沿用户指定方向局部变化的基因，并支持在Python环境中快速灵活地迭代交互式和编程式scRNA-Seq探索模式 | 现有的交互式工具在实际应用中受限，因为它们不支持数据和结果在编程环境中的快速移动，打断了迭代过程 | 开发一种工具，以克服现有工具在scRNA-Seq数据分析中的局限性，提高分析效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 数据嵌入（如UMAP或tSNE） | NA |