单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 240 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq of out-of-thaw mesenchymal stromal cells shows tissue-of-origin differences and inter-donor cell-cycle variations
2021-11-04, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-021-02627-9
PMID:34736534
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自不同组织来源的人间充质基质细胞（hMSCs）在解冻后的转录组特征和组织特异性差异 | 首次揭示了解冻后人源间充质基质细胞的单细胞转录组景观及其组织特异性差异，并发现了与免疫调节和细胞周期状态相关的差异表达基因 | 研究仅限于从健康供体获得的hMSCs，且样本量相对较小 | 探讨解冻后人源间充质基质细胞的单细胞转录组特征及其组织特异性差异 | 来自骨髓和脐带组织的人源间充质基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13个hMSC样本来自10名健康供体 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
Construction and external validation of a 5-gene random forest model to diagnose non-obstructive azoospermia based on the single-cell RNA sequencing of testicular tissue
2021-11-04, Aging
DOI:10.18632/aging.203675
PMID:34738918
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研究论文 | 本文基于单细胞RNA测序数据构建并验证了一个用于诊断非阻塞性无精症的5基因随机森林模型 | 开发了一种新的基因标记，并基于单细胞RNA测序分析进行了外部验证，为揭示非阻塞性无精症的潜在机制提供了新的生物标志物 | NA | 开发和验证一种新的诊断非阻塞性无精症的基因模型 | 非阻塞性无精症和阻塞性无精症的诊断 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机森林 (RF) | 单细胞RNA测序数据 | 432个睾丸细胞样本，58个训练集样本，20个外部验证集样本，20个阻塞性无精症和20个非阻塞性无精症的精液和睾丸活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Single-cell spatial transcriptomics
2021-11, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00778-8
PMID:34750575
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Temporal controls over inter-areal cortical projection neuron fate diversity
2021-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04048-3
PMID:34754107
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研究论文 | 本文通过结合MAPseq和单细胞RNA测序技术，研究了小鼠新皮层中单个ICPN的连接组和转录组，揭示了不同类型ICPN在分子和功能分化上的时间差异 | 首次将连接组和转录组数据结合，揭示了ICPN在分子和功能分化上的时间差异，并发现SOX11转录因子在不同类型ICPN中的差异表达 | 仅限于小鼠新皮层中的ICPN研究，未涉及其他物种或其他脑区 | 探究新皮层中ICPN的分子和功能分化机制 | 小鼠新皮层中的ICPN | 神经科学 | NA | MAPseq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠新皮层中的单个ICPN | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
A conserved expression signature predicts growth rate and reveals cell & lineage-specific differences
2021-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009582
PMID:34762642
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研究论文 | 研究通过RNA测序分析快速和慢速增殖的同源细胞，发现了一种进化上保守的与增殖相关的转录组特征，并揭示了细胞类型和谱系特异性的差异 | 识别了一种在所有真核生物中保守的与增殖相关的转录组特征，并能准确预测酵母和癌细胞的生长速率 | 研究主要集中在小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞，可能需要进一步验证在其他细胞类型中的适用性 | 探究快速和慢速增殖细胞之间的差异，并识别与增殖相关的转录组特征 | 小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞的快速和慢速增殖亚群 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞的快速和慢速增殖亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-08 |
Miscell: An efficient self-supervised learning approach for dissecting single-cell transcriptome
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103200
PMID:34712916
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研究论文 | 本文开发了Miscell，一种使用深度神经网络作为潜在特征编码器的自监督学习方法，用于从单细胞转录组中挖掘信息 | Miscell在多种聚类指标上实现了至少可比或更好的性能，并能通过深度学习方法量化基因对细胞簇的影响，识别细胞类型特异性标记 | NA | 开发一种高效的自监督学习方法，用于解析单细胞转录组 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 深度神经网络 | 深度学习模型 | 转录组数据 | 三个异质性数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-08 |
Erratum to: Assessing heterogeneity in spatial data using the HTA index with applications to spatial transcriptomics and imaging
2021-Nov-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab692
PMID:34718412
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptome reveals the intra-tumoral heterogeneity and regulators underlying tumor progression in metastatic pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Nov-03, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00663-1
PMID:34732701
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和调控肿瘤进展的关键因素 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描绘了转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性及其分子机制 | NA | 旨在全面描绘转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和揭示其分子机制 | 转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和分子机制 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 6236个来自5个肝转移性胰腺导管腺癌病变的单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
NRG1/ErbB signalling controls the dialogue between macrophages and neural crest-derived cells during zebrafish fin regeneration
2021-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26422-5
PMID:34732706
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研究论文 | 本文通过结合三重转基因斑马鱼胚胎的活体成像和单细胞RNA测序，详细绘制了斑马鱼幼体再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了NRG1/ErbB信号通路在调控巨噬细胞与神经嵴来源细胞间对话中的关键作用 | 本文首次详细绘制了斑马鱼再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了foxd3阳性神经嵴来源细胞在再生过程中的作用及NRG1/ErbB信号通路的关键调控作用 | NA | 研究斑马鱼尾鳍再生过程中细胞多样性及特定细胞群的作用 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的细胞类型及其相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞图谱 | 三重转基因斑马鱼胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-08 |
Dissecting mammalian spermatogenesis using spatial transcriptomics
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109915
PMID:34731600
|
研究论文 | 使用空间转录组学技术Slide-seq，生成小鼠和人睾丸的空间基因表达图谱，揭示了精子发生过程中的细胞类型定位和基因表达模式 | 首次利用Slide-seq技术在近单细胞分辨率下捕捉小鼠和人睾丸的空间基因表达模式，并开发了一种计算框架来精确地定位睾丸细胞类型 | NA | 揭示哺乳动物精子发生过程中的空间基因表达模式及其在糖尿病诱导的男性不育中的潜在机制 | 小鼠和人的睾丸组织 | 空间转录组学 | 糖尿病 | Slide-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人的睾丸组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
Patch-seq of mouse DRG neurons reveals candidate genes for specific mechanosensory functions
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109914
PMID:34731626
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研究论文 | 本文通过结合机械敏感电流记录和单细胞RNA测序，研究了小鼠DRG神经元的机械感觉功能相关候选基因 | 本文首次将机械敏感电流记录与单细胞转录组测序相结合，实现了机械电特性与转录组定义的神经元群体之间的一一对应 | 本文的敲降实验排除了Tmem120a和Tmem150c作为感觉神经元中机械敏感电流的介导因子，但未进一步验证其他候选基因 | 揭示特定机械感觉功能的分子机制 | 小鼠DRG神经元的机械感觉功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种机械感觉神经元亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
Pancreatic beta cell neogenesis: Debates and updates
2021-11-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.10.007
PMID:34731654
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研究论文 | 本文探讨了成年胰腺中胰岛素产生β细胞的内源性再生来源 | Gribben等人（2021）通过谱系追踪和单细胞RNA测序方法，报告了Ngn3表达的导管细胞可以作为成年胰腺中新β细胞的前体 | NA | 寻找成年胰腺中胰岛素产生β细胞的内源性可再生来源 | 成年胰腺中的β细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Integrative analysis methods for spatial transcriptomics
2021-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01272-7
PMID:34711969
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-08 |
Skin inflammation activates intestinal stromal fibroblasts and promotes colitis
2021-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI147614
PMID:34720087
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了人类和小鼠的炎症性肠病（IBD）中的成纤维细胞，揭示了肠道炎症促进部分肠道基质成纤维细胞分化为具有先天抗菌宿主防御活性的前脂肪细胞，并且这一过程在皮肤炎症时加剧 | 首次揭示了皮肤炎症通过激活肠道基质成纤维细胞和改变粪便微生物组，促进过度的反应性脂肪生成和增加结肠炎症，这一发现为皮肤炎症与IBD之间的关联提供了新的机制解释 | NA | 探索皮肤炎症与炎症性肠病之间的关联机制 | 人类和小鼠的成纤维细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的成纤维细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Dynamic transcriptional reprogramming leads to immunotherapeutic vulnerabilities in myeloma
2021-11, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00766-y
PMID:34675390
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研究论文 | 本研究探讨了多发性骨髓瘤细胞如何通过动态转录重编程来适应治疗并逃避免疫疗法，揭示了治疗过程中产生的可利用的免疫治疗靶点。 | 本研究首次展示了多发性骨髓瘤细胞在治疗压力下如何通过转录重编程和增强子重连来适应并逃避免疫治疗，同时揭示了新的免疫治疗靶点CXCR4。 | NA | 揭示多发性骨髓瘤细胞如何通过转录重编程适应治疗并逃避免疫疗法，探索新的治疗策略。 | 多发性骨髓瘤细胞的转录重编程和增强子使用。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组和染色质可及性分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
Simpler and Faster Development of Tumor Phylogeny Pipelines
2021-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0271
PMID:34698531
|
研究论文 | 本文开发了一种名为plastic的肿瘤系统发育管道，该管道整合了简化输入数据、推断肿瘤系统发育和比较系统发育三个步骤 | 引入了新的内存数据结构，便于工具间信息的透明共享，并扩展了简化输入数据的工具，集成了两种机器学习程序，显著减少了运行时间 | NA | 开发更先进和快速的工具来分析单细胞测序产生的大量数据 | 单细胞测序数据和肿瘤系统发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Identification and characterization of distinct cell cycle stages in cardiomyocytes using the FUCCI transgenic system
2021-11-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2021.112880
PMID:34655601
|
研究论文 | 本研究利用FUCCI转基因系统在小鼠模型中识别和表征心肌细胞在不同细胞周期阶段的特征 | 首次使用FUCCI系统在单细胞分辨率下研究心肌细胞的细胞周期活动，并生成特定于细胞分裂和内复制的心肌细胞转录组图谱 | NA | 理解心肌细胞增殖向内复制和细胞周期停滞转变的调控机制，并开发再生疗法 | 心肌细胞在不同细胞周期阶段的特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | FUCCI转基因小鼠模型 | 转录组数据 | 新生小鼠的心肌细胞在出生后第0天和第7天 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
Human resident memory T cells exit the skin and mediate systemic Th2-driven inflammation
2021-11-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210417
PMID:34643646
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研究论文 | 本文通过基因分型、数学建模、单细胞转录组学和功能分析，研究了接受异基因造血干细胞移植患者皮肤中的组织驻留记忆T细胞（TRMs）在血液中的迁移及其在移植物抗宿主病（GVHD）中的作用。 | 首次在人类模型中检测到具有TRM表型的循环皮肤来源T细胞（cTRMs），并揭示了其在GVHD中的潜在作用。 | NA | 研究皮肤TRMs在血液中的迁移及其在系统性炎症中的作用。 | 接受异基因造血干细胞移植患者的皮肤和血液T细胞。 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 基因分型、数学建模、单细胞转录组学 | NA | 血液和皮肤T细胞 | 接受异基因造血干细胞移植的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
Obesity Impairs Embryonic Myogenesis by Enhancing BMP Signaling within the Dermomyotome
2021-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202102157
PMID:34647690
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析（scRNA-seq）探讨了母体肥胖（MO）对胚胎发育中肌肉生成过程的影响 | 首次详细研究了母体肥胖对胚胎器官生成初期的影响，并揭示了通过增强BMP信号通路导致肌肉分化障碍的机制 | 研究主要集中在胚胎发育的特定阶段（E9.5），可能需要进一步研究不同发育阶段的影响 | 探讨母体肥胖对胚胎肌肉生成的影响及其分子机制 | 母体肥胖对胚胎肌肉生成的影响 | NA | 肥胖 | 单细胞转录组分析（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 胚胎日9.5（E9.5）的小鼠胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
Tumor-propagating side population cells are a dynamic subpopulation in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.148768
PMID:34618689
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研究论文 | 本研究利用未分化多形性肉瘤（UPS）的小鼠模型，追踪了肉瘤侧群（SP）细胞与非SP细胞之间的谱系关系，并探讨了SP细胞的肿瘤传播潜力及其在肿瘤生长和自我更新中的作用。 | 首次证明了肉瘤中的肿瘤传播细胞（TPCs）的表型是动态的，非SP细胞可以转化为具有增强肿瘤传播潜力的SP细胞。 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类肉瘤中验证这些发现。 | 探讨肉瘤中肿瘤传播细胞的动态特性及其对肿瘤生长和自我更新的影响。 | 未分化多形性肉瘤（UPS）中的侧群（SP）细胞和非SP细胞。 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型中的SP细胞和非SP细胞 | NA | NA | NA | NA |